1. Multiclass HCV resistance to direct-acting antiviral failure in real-life patients advocates for tailored second-line therapies
- Author
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Di Maio, Velia C., Cento, Valeria, Lenci, Ilaria, Aragri, Marianna, Rossi, Piera, Barbaliscia, Silvia, Melis, Michela, Verucchi, Gabriella, Magni, Carlo F., Teti, Elisabetta, Bertoli, Ada, Antonucci, Francescopaolo, Bellocchi, Maria C., Micheli, Valeria, Masetti, Chiara, Landonio, Simona, Francioso, Simona, Santopaolo, Francesco, Pellicelli, Adriano M., Calvaruso, Vincenza, Gianserra, Laura, Siciliano, Massimo, Romagnoli, Dante, Cozzolongo, Raffaele, Grieco, Antonio, Vecchiet, Jacopo, Morisco, Filomena, Merli, Manuela, Brancaccio, Giuseppina, Di Biagio, Antonio, Loggi, Elisabetta, Mastroianni, Claudio Maria, Pace Palitti, Valeria, Tarquini, Pierluigi, Puoti, Massimo, Taliani, Gloria, Sarmati, Loredana, Picciotto, Antonino, Vullo, Vincenzo, Caporaso, Nicola, Paoloni, Maurizio, Pasquazzi, Caterina, Rizzardini, Giuliano, Parruti, Giustino, Craxì, Antonio, Babudieri, Sergio, Andreoni, Massimo, Angelico, Mario, Perno, Carlo F., Ceccherini Silberstein, Francesca, Mariani, R., Iapadre, N., Grimaldi, A., Cozzolongo, R., Andreone, P., Verucchi, G., Menzaghi, B., Quirino, T., Pisani, V., Torti, MARIA CHIARA, Vecchiet, J., Bruzzone, B., De Maria, A., Marenco, S., Nicolini, L. A., Viscoli, C., Casinelli, K., Delle Monache, M., Lichtner, Miriam, Aghemo, A., Boccaccio, V., Bruno, S., Cerrone, M., Colombo, M., D'Arminio Monforte, A., Danieli, E., Donato, F., Gubertini, G., Lleo, A., Magni, C. F., Mancon, A., Monico, S., Niero, F., Russo, M. L., Gnocchi, M., Orro, A., Milanesi, L., Baldelli, E., Bertolotti, M., Borghi, V., Mussini, C., Brancaccio, G., Gaeta, G. B., Lembo, V., Sangiovanni, V., Di Marco, V., Mazzola, A., Petta, S., D'Amico, E., Cacciatore, P., Consorte, A., Pieri, A., Polilli, E., Sozio, F., Antenucci, F., Aragri, M., Baiocchi, L., Barbaliscia, S., Biliotti, Elisa, Biolato, M., Carioti, L., Ceccherini Silberstein, F., Cerasari, G., Cerva, C., Ciotti, M., D'Ambrosio, C., D'Ettorre, G., De Leonardis, F., De Sanctis, A., Di Maio, V. C., Di Paolo, D., Furlan, Caterina, Gallo, P., Gasbarrini, A., Giannelli, V., Grieco, S., Lambiase, L., Lattanzi, B., Lenci, I., Lula, R., Malagnino, V., Manuelli, M., Miglioresi, L., Milana, M., Moretti, A., Nosotti, L., Palazzo, Donatella, Pellicelli, A., Romano, M., Sarrecchia, C., Sforza, D., Sorbo, M. C., Spaziante, M., Svicher, V., Tisone, G., Vespasiani Gentilucci, U., D'Adamo, G., Mangia, A., Maida, I., Mura, M. S., Falconi, L., Di Giammartino, D., Di Maio, V., Cento, V., Lenci, I., Aragri, M., Rossi, P., Barbaliscia, S., Melis, M., Verucchi, G., Magni, C., Teti, E., Bertoli, A., Antonucci, F., Bellocchi, M., Micheli, V., Masetti, C., Landonio, S., Francioso, S., Santopaolo, F., Pellicelli, A., Calvaruso, V., Gianserra, L., Siciliano, M., Romagnoli, D., Cozzolongo, R., Grieco, A., Vecchiet, J., Morisco, F., Merli, M., Brancaccio, G., Di Biagio, A., Loggi, E., Mastroianni, C., Pace Palitti, V., Tarquini, P., Puoti, M., Taliani, G., Sarmati, L., Picciotto, A., Vullo, V., Caporaso, N., Paoloni, M., Pasquazzi, C., Rizzardini, G., Parruti, G., Craxã¬, A., Babudieri, S., Andreoni, M., Angelico, M., Perno, C., Ceccherini-Silberstein, F., Mariani, R., Iapadre, N., Grimaldi, A., Andreone, P., Menzaghi, B., Quirino, T., Pisani, V., Torti, C., Bruzzone, B., De Maria, A., Marenco, S., Nicolini, L., Viscoli, C., Casinelli, K., Delle Monache, M., Lichtner, M., Aghemo, A., Boccaccio, V., Bruno, S., Cerrone, M., Colombo, M., D'Arminio Monforte, A., Danieli, E., Donato, F., Gubertini, G., Lleo, A., Mancon, A., Monico, S., Niero, F., Russo, M., Gnocchi, M., Orro, A., Milanesi, L., Baldelli, E., Bertolotti, M., Borghi, V., Mussini, C., Gaeta, G., Lembo, V., Sangiovanni, V., DI MARCO, V., Mazzola, A., Petta, S., D'Amico, E., Cacciatore, P., Consorte, A., Pieri, A., Polilli, E., Sozio, F., Antenucci, F., Baiocchi, L., Biliotti, E., Biolato, M., Carioti, L., Cerasari, G., Cerva, C., Ciotti, M., D'Ambrosio, C., D'Ettorre, G., De Leonardis, F., De Sanctis, A., Di Paolo, D., Furlan, C., Gallo, P., Gasbarrini, A., Giannelli, V., Grieco, S., Lambiase, L., Lattanzi, B., Lula, R., Malagnino, V., Manuelli, M., Miglioresi, L., Milana, M., Moretti, A., Nosotti, L., Palazzo, D., Romano, M., Sarrecchia, C., Sforza, D., Sorbo, M., Spaziante, M., Svicher, V., Tisone, G., Vespasiani-Gentilucci, U., D'Adamo, G., Mangia, A., Maida, I., Mura, M., Falconi, L., Di Giammartino, D., Di Maio, V, Cento, V, Lenci, I, Aragri, M, Rossi, P, Barbaliscia, S, Melis, M, Verucchi, G, Magni, C, Teti, E, Bertoli, A, Antonucci, F, Bellocchi, M, Micheli, V, Masetti, C, Landonio, S, Francioso, S, Santopaolo, F, Pellicelli, A, Calvaruso, V, Gianserra, L, Siciliano, M, Romagnoli, D, Cozzolongo, R, Grieco, A, Morisco, F, Merli, M, Brancaccio, G, Di Biagio, A, Loggi, E, Mastroianni, C, Pace Palitti, V, Tarquini, P, Puoti, M, Taliani, G, Sarmati, L, Picciotto, A, Vullo, V, Caporaso, N, Paoloni, M, Pasquazzi, C, Rizzardini, G, Parruti, G, Craxì, A, Babudieri, S, Andreoni, M, Angelico, M, Perno, C, Ceccherini-Silberstein, F, Velia C. Di Maio, Valeria Cento, Ilaria Lenci, Marianna Aragri, Piera Rossi, Silvia Barbaliscia, Michela Meli, Gabriella Verucchi, Carlo F. Magni, Elisabetta Teti, Ada Bertoli, Francesco Paolo Antonucci, Maria C. Bellocchi, Valeria Micheli, Chiara Masetti, Simona Landonio, Simona Francioso, Francesco Santopaolo, Adriano M. Pellicelli, Vincenza Calvaruso, Laura Gianserra, Massimo Siciliano, Dante Romagnoli, Raffaele Cozzolongo, Antonio Grieco, Jacopo Vecchiet, Filomena Morisco, Manuela Merli, Giuseppina Brancaccio, Antonio Di Biagio, Elisabetta Loggi, Claudio M. Mastroianni, Valeria Pace Palitti, Pierluigi Tarquini, Massimo Puoti, Gloria Taliani, Loredana Sarmati, Antonino Picciotto, Vincenzo Vullo, Nicola Caporaso, Maurizio Paoloni, Caterina Pasquazzi, Giuliano Rizzardini, Giustino Parruti, Antonio Craxì, Sergio Babudieri, Massimo Andreoni, Mario Angelico, Carlo F. Perno, Francesca Ceccherini-Silberstein, for the HCV Italian Resistance Network Study Group: [.., P. Andreone, E. Loggi, G. Verucchi, ], Di Maio, Velia C., Cento, Valeria, Lenci, Ilaria, Aragri, Marianna, Rossi, Piera, Barbaliscia, Silvia, Melis, Michela, Verucchi, Gabriella, Magni, Carlo F., Teti, Elisabetta, Bertoli, Ada, Antonucci, Francescopaolo, Bellocchi, Maria C., Micheli, Valeria, Masetti, Chiara, Landonio, Simona, Francioso, Simona, Santopaolo, Francesco, Pellicelli, Adriano M., Calvaruso, Vincenza, Gianserra, Laura, Siciliano, Massimo, Romagnoli, Dante, Cozzolongo, Raffaele, Grieco, Antonio, Vecchiet, Jacopo, Morisco, Filomena, Merli, Manuela, Brancaccio, Giuseppina, Di Biagio, Antonio, Loggi, Elisabetta, Mastroianni, Claudio M., Pace Palitti, Valeria, Tarquini, Pierluigi, Puoti, Massimo, Taliani, Gloria, Sarmati, Loredana, Picciotto, Antonino, Vullo, Vincenzo, Caporaso, Nicola, Paoloni, Maurizio, Pasquazzi, Caterina, Rizzardini, Giuliano, Parruti, Giustino, Craxã¬, Antonio, Babudieri, Sergio, Andreoni, Massimo, Angelico, Mario, Perno, Carlo F., Ceccherini-Silberstein, Francesca, Nicolini, L. A., Magni, C. F., Russo, M. L., Gaeta, G. B., Di Marco, V., Di Maio, V. C., Sorbo, M. C., Mura, M. S., Di Maio, Velia C, Magni, Carlo F, Bellocchi, Maria C, Pellicelli, Adriano M, Mastroianni, Claudio M, Craxì, Antonio, Perno, Carlo F, and Ceccherini Silberstein, Francesca
- Subjects
Male ,0301 basic medicine ,hepatitis C virus ,Sustained Virologic Response ,Sofosbuvir ,Hepacivirus ,Drug Resistance ,resistance-associated substitutions ,Viral Nonstructural Proteins ,VARIANTS ,NS5A ,medicine.disease_cause ,Gastroenterology ,chemistry.chemical_compound ,0302 clinical medicine ,Recurrence ,INFECTION ,antiviral therapy ,Medicine ,hepatitis C viru ,Viral ,Treatment Failure ,Chronic ,direct-acting antivirals ,resistance test ,hepatology ,biology ,GENOTYPE 1 ,virus diseases ,Middle Aged ,Settore MED/07 - Microbiologia e Microbiologia Clinica ,Hepatitis C ,Italy ,Combination ,Interferon ,Drug Therapy, Combination ,Female ,030211 gastroenterology & hepatology ,Author Keywords:antiviral therapy ,RIBAVIRIN ,Sequence Analysis ,Human ,medicine.drug ,medicine.medical_specialty ,Daclatasvir ,Genotype ,Hepatitis C virus ,Antiviral Agents ,LONG-TERM PERSISTENCE ,DACLATASVIR ,03 medical and health sciences ,Drug Therapy ,Aged ,Drug Resistance, Viral ,Hepatitis C, Chronic ,Humans ,Interferons ,Mutation ,Ribavirin ,Sequence Analysis, DNA ,Hepatology ,TREATMENT-NAIVE ,Internal medicine ,Antiviral Agent ,resistance-associated substitution ,direct-acting antiviral ,Hepaciviru ,resistance test KeyWords Plus:HEPATITIS-C VIRUS ,business.industry ,Viral Nonstructural Protein ,DNA ,biology.organism_classification ,Clinical trial ,030104 developmental biology ,SOFOSBUVIR ,chemistry ,Sequence Analysi ,Immunology ,business - Abstract
Background & Aims: Despite the excellent efficacy of direct-acting antivirals (DAA) reported in clinical trials, virological failures can occur, often associated with the development of resistance-associated substitutions (RASs). This study aimed to characterize the presence of clinically relevant RASs to all classes in real-life DAA failures. Methods: Of the 200 virological failures that were analyzed in 197 DAA-treated patients, 89 with pegylated-interferon+ribavirin (PegIFN+RBV) and 111 without (HCV-1a/1b/1g/2/3/4=58/83/1/6/24/25; 56.8% treatment experienced; 65.5% cirrhotic) were observed. Sanger sequencing of NS3/NS5A/NS5B was performed by home-made protocols, at failure (N= 200) and whenever possible at baseline (N= 70). Results: The majority of the virological failures were relapsers (57.0%), 22.5% breakthroughs, 20.5% non-responders. RAS prevalence varied according to IFN/RBV use, DAA class, failure type and HCV genotype/subtype. It was 73.0% in IFN group vs 49.5% in IFN free, with the highest prevalence of NS5A-RASs (96.1%), compared to NS3-RASs (75.9% with IFN, 70.5% without) and NS5B-RASs (66.6% with IFN, 20.4% without, in sofosbuvir failures). In the IFN-free group, RASs were higher in breakthrough/non-responders than in relapsers (90.5% vs 40.0%, P= 2 DAA classes showed multiclass resistance, including 11/11 NS3+NS5A failures. Furthermore, 20.0% of patients had baseline-RASs, which were always confirmed at failure. Conclusions: In our failure setting, RAS prevalence was remarkably high in all genes, with a partial exception for NS5B, whose limited resistance is still higher than previously reported. This multiclass resistance advocates for HCV resistance testing at failure, in all three genes for the best second-line therapeutic tailoring.
- Published
- 2017