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101. Cross-border epidemiological data integration and harmonization – Application to malaria in the cross-border area between French Guiana and Brazil

Author: Roux, Emmanuel, Saldanha, Raphael, Barcellos, Christovam, Mandon, Théophile, Do Socorro Mendonca Gomes, Margarete, Mosnier, Emilie, Guarmit, Basma, Desconnets, Jean-Christophe, UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement, Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM), Institute of Scientific and Technological Communication and Information in Health / Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde [Rio de Janeiro] (ICICT), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), SVS-AP, Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université des Antilles (UA)-Université de Guyane (UG)-Université de Montpellier (UM)-Université de La Réunion (UR)-Avignon Université (AU)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), LMI Sentinela, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Roux, Emmanuel, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA), and Fundação Oswaldo Cruz / Oswaldo Cruz Foundation (FIOCRUZ)
Subjects: [INFO.INFO-OH] Computer Science [cs]/Other [cs.OH], [INFO.INFO-DB]Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [INFO.INFO-IR]Computer Science [cs]/Information Retrieval [cs.IR], [SHS.INFO]Humanities and Social Sciences/Library and information sciences, [INFO.INFO-OH]Computer Science [cs]/Other [cs.OH], [INFO.INFO-DB] Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [INFO.INFO-IR] Computer Science [cs]/Information Retrieval [cs.IR], [SHS.INFO] Humanities and Social Sciences/Library and information sciences
Abstract: International audience; Context Ensure healthy lives and promote well-being for all at all ages Target: By 2030, end the epidemics of AIDS, tuberculosis, malaria and neglected tropical diseases and combat hepatitis, water-borne diseases and other communicable diseases • Malaria: 216 million cases and 445 thousand deaths worldwide in 2016 (WHO, 2017) • Between 2000 and 2015, 58% and 37% decreases of the mortality and incidence rates, respectively • Socio-demographical and environmental contexts that vulnerabilize local populations • High mobility of pathogen-carrying populations • Patient follow-up difficulties (situations of illegality, auto-medication, ...) • Different strategies and means of surveillance, prevention and control of diseases between countries • Lack of international cooperation: Few regular exchange of comparable data and information between countries ⇒ Heterogeneous data types and formats, nomenclatures and concepts How to ensure cross-border epidemiological data interoperability on an ongoing basis? FTP server Computation and display application (R/Shiny) Harmonized DB Rebuilt DB Rebuilt DB Automated processing chain Integration and harmonization Indicator computation and visualization CHAR/CDPS Cayenne, FG Objectives and challenges • Integrate and harmonize automatically and regularly malaria cross-border epidemiological data • Disseminate indicators and data in an interpretable way for specialists, health actors and population In fine, this should conduct to • Provide a unified vision of the epidemiological cross-border situations • Participate to define concerted, targeted and effective control actions for disease elimination Cross-border malaria considered as a "Major obstacle for malaria elimination" [Wangdi et al., 2015] Paris France Study Region Ethical considerations • Exploitation and dissemination of anonymized data • Temporal and spatial aggregation of the data for public user profile • Authorization of the Commission Nationale de l'Informatique et des Libertés (CNIL) for personal data automatic processing and data transmission to a foreign country (ongoing request No. 2135463) • Multi-platform Extract Transform Load (ETL) tools (TALEND®) Harmonization rules based on expert knowledge in epidemiology and parasitology • Web services for data online publication • Web application (R-Shiny) for online data visualization CDPS ... Funding LMI Sentinela GAPAM Sentinela GCE18-Investment ID OPP1171795 Wangdi K. et al. Cross-border malaria: A major obstacle for malaria elimination. Adv. Parasitol. 2015, 89, 79-107 Barcellos C. et al. An observatory to gather and disseminate information on the health-related effects of environmental and climate change. Pan American Journal of Public Health. 2016. 40(3): 167-73 Roux E. et al. Un "site sentinelle" à la frontière franco-brésilienne pour comprendre et suivre les relations entre climat et santé. In Proceedings of the ENVIBRAS (Environnement et géomatique-approches comparées France Brésil) conference. Rennes; 2014:1-8
Published: 2018

102. Incidence and predictive factors of transaminase elevation in patients consulting for dengue fever in Cayenne Hospital, French Guiana

Author: Emilie Mosnier, Mathieu Nacher, Narcisse Elenga, G. Walter, Félix Djossou, Guillaume Vesin, Severine Mattheus, Magalie Demar, Denis Malvy, Bastien Bidaud, Antoine Okandze, Philippe Abboud, Loïc Epelboin, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales [Cayenne, Guyanne Française], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins [Cayenne, Guyanne Française], Laboratoire Polyvalent [Cayenne, Guyanne Française], Centre National de Référence pour les Arbovirus - Laboratoire de Virologie [Cayenne, Guyane française] (CNR - laboratoire associé), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Service de Pédiatrie [Cayenne, Guyanne Française], Laboratoire de Parasitologie Mycologie [Cayenne, Guyanne Française], Unités maladies tropicales et du voyageur [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Saint-André - Bordeaux, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424
Subjects: Male, Hematocrit, Gastroenterology, Dengue fever, Dengue, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Longitudinal Studies, 030212 general & internal medicine, Referral and Consultation, biology, medicine.diagnostic_test, Incidence, Incidence (epidemiology), Alanine Transaminase, General Medicine, Middle Aged, Prognosis, French Guiana, 3. Good health, Paracetamol, Infectious Diseases, Predictive value of tests, Female, Hyponatremia, Adult, Transaminase elevation, medicine.medical_specialty, 030231 tropical medicine, Transaminase, 03 medical and health sciences, Predictive Value of Tests, Internal medicine, medicine, Humans, Aspartate Aminotransferases, Epidemics, Proportional Hazards Models, Predictors, business.industry, Public Health, Environmental and Occupational Health, medicine.disease, Surgery, Food intolerance, Alanine transaminase, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, biology.protein, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Parasitology, business, Biomarkers, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Background: The objective of the study was to determine the incidence of transaminase elevation during dengue, and its predictive factors. Methods: In 2013, a longitudinal study was performed using data from all cases of dengue seen in Cayenne Hospital. Cox proportional modeling was used. Signs of major transaminase elevation were defined as an increase in aspartate amino transferase (AST) or alanine amino transferase (ALT) concentration over 10 times the normal value (10N). Results: There were 1574 patients and 13 249 person-days of follow-up. The incidence rate for signs of trans-aminase elevation (10N) was 0.55 per 100 person-days. Six patients had major transaminase elevation with AST.1000 units (0.43 per 1000 patient-days), and 73 patients (4.6%) developed transaminase elevation with AST .10N. The variables independently associated with major transaminase elevation were hyponatremia, low platelets, dehydration, hematocrit increase, food intolerance, positive nonstructural protein 1 (NS1), age over 15 years and the notion of paracetamol intake. Conclusions: Although very frequent, the incidence of major transaminase elevation was lower than reported elsewhere perhaps because of good access to care, or of the particular serotype causing this epidemic. The patients with transaminase elevation tended to be older, more severe and taking paracetamol.
Published: 2016
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103. Spécificités épidémiologiques de la fièvre Q en Guyane

Author: Sophie Edouard, Jean-Lou Marié, Sébastien Briolant, Félix Djossou, Didier Raoult, Loïc Epelboin, Benoit de Thoisy, Vincent Pommier de Santi, Bernard Davoust, Aba Mahamat, Thierry Lamour, Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées, Service de Santé des Armées, Université de Guyane (UG), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses Tropicales Emergentes (URMITE), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche en Biologie et Epidémiologie Parasitaires, Institut de Médecine Tropicale du Service de Santé des Armées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Département des centres de santé, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Association Kwata (Kwata), Kwata, Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, and Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Coxiella burnetii, épidémiologie, Guyane, Fièvre Q, 0301 basic medicine, General Veterinary, biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, biology.organism_classification, 3. Good health, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, 0302 clinical medicine, Geography, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, epidemiology, Q fever, French Guiana, Humanities, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Q fever in French Guiana : a specific epidemiological context. During the last 15 years, several studies have been conducted to describe the epidemiology of animal and human Q fever in French Guiana. The main findings highlight disease specificity in this area associated with a unique and hypervirulent strain of Coxiella burnetii, suburban and close to forested area of transmission, pneumonia as primary manifestation of acute Q fever, wild animal reservoir and ticks as putative vector of the bacterium. Prevalence of the disease in French Guianese population remains unknown. A comprehensive health strategy is needed to prevent the disease. We present recent acquired knowledge and outstanding issues, in a “One Health” approach., Les études scientifiques menées sur la fièvre Q en Guyane au cours des quinze dernières années ont permis de répondre à de nombreuses interrogations sur l’épidémiologie humaine et animale de cette maladie. Les résultats observés démontrent une réelle spécificité locale de la fièvre Q, avec une souche de Coxiella burnetii unique et hypervirulente, une transmission suburbaine et en bordure de forêt, principalement sur la ville de Cayenne et ses alentours, des formes pulmonaires prédominantes, un réservoir sauvage de la bactérie et la possibilité d’une transmission vectorielle par les tiques. La prévalence réelle de la maladie dans la population guyanaise reste inconnue et conditionne la mise en oeuvre d’une stratégie de santé publique dédiée. Cette communication se propose de faire une synthèse sur l’ensemble des connaissances acquises et sur les questions qui demeurent, dans une approche One Health., Pommier de Santi Vincent, Marié Jean-Lou, Briolant Sébastien, Mahamat Aba, Djossou Félix, Epelboin Loïc, Lamour Thierry, Thoisy Benoît de, Raoult Didier, Edouard Sophie, Davoust Bernard. Spécificités épidémiologiques de la fièvre Q en Guyane. In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 169 n°2, 2016. pp. 148-154.
Published: 2016
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104. Incidence of new hepatitis C virus infection is still increasing in French MSM living with HIV

Author: André Cabié, Jacques Reynes, François Raffi, Bruno Hoen, Firouzé Bani-Sadr, Laurent Hustache-Mathieu, Pierre Delobel, Claudine Duvivier, T. Huleux, Laurent Cotte, Pascal Pugliese, Christine Jacomet, Antoine Cheret, David Rey, Isabelle Poizot-Martin, Marc-Antoine Valantin, Anne Frésard, Pierre Pradat, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Maladies infectieuses et tropicales, Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service des maladies infectieuses et tropicales [Toulouse], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies Infectieuses [Nice], Département Maladies Infectieuses et Tropicales, Hôpital Universitaire, Montpellier, France, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Service des maladies infectieuses, CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Virologie [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Clermont-Ferrand], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Service des maladies infectieuses et tropicales [HCL-Hôpital de la Croix Rousse], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), and Dupuis, Christine
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Hepatitis C virus, Immunology, Human immunodeficiency virus (HIV), HIV Infections, medicine.disease_cause, Serology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Internal medicine, HCV status, medicine, Immunology and Allergy, Humans, In patient, Serologic Tests, 030212 general & internal medicine, Homosexuality, Male, business.industry, Incidence (epidemiology), Incidence, virus diseases, Middle Aged, Hepatitis C, digestive system diseases, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Cohort, Hcv treatment, 030211 gastroenterology & hepatology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Female, France, business, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; OBJECTIVE:High hepatitis C virus (HCV) treatment uptake combined with effective direct-acting antiviral-based regimens resulted in a dramatic decline of HCV infection in French people living with HIV (PLWH). We assessed the yearly incidence of new HCV infection in PLWH enrolled in the large French Dat'AIDS cohort from 2012 to 2016 with a specific focus on MSM.METHODS:The incidence of new HCV infection was determined yearly in HCV-negative PLWH with serological follow-up during 2012-2016. The incidence of HCV reinfection was determined in patients who were cured of a previous infection.RESULTS:Among 40 714 PLWH, HCV status was available in 38 217 (94%). A total of 5557 PLWH (15%) were HCV infected at first time-point, 82% of whom were cured of HCV by the end of 2016. Among 21 519 HCV-negative PLWH with serological follow-up (63 449 patient-years), 219 first HCV infections occurred (MSM: 188, others: 31). Similarly, among 3406 patients who were cured of a previous infection (10 602 patient-years), 73 reinfections occurred (MSM: 51, others: 22). From 2012 to 2016, the incidence of a first infection in MSM rose from 0.5 to 0.92% patient-years, whereas the incidence or reinfection remained stable (2.52-2.90% patient-years).CONCLUSION:Despite a high HCV treatment uptake and cure rate, the incidence of first HCV infection regularly increased in French HIV-positive MSM between 2012 and 2016. The incidence of reinfection fluctuated but remained constantly higher than the incidence of first infection, suggesting that a subgroup of MSM pursued high-risk practices following cure of a first infection.
Published: 2018
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105. First established case of Angiostrongylus cantonensis meningomyelitis in French Guiana, 2017

Author: Defo, A, Lachaume, N, Cuadro-Alvarez, Emma, Maniassom, Chimène, Martin, M, Njuieyon, Falucar, Hennaf, F, Mrsic, Yajaira, Brunnelin, A, Epelboin, Loïc, Blanchet, D, Desbois-Nogard, Nicole, Qvarnstrom, Yvonne, Demar, Magalie Pierre, Dard, C, Elenga, Narcisse, Service de Pédiatrie [Cayenne, Guyanne Française], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Université de Guyane (UG), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie-Sérologies Bactériennes et Parasitaires [CHU de la Martinique], Centre Hospitalier Universitaire de la Martinique - CHU Martinique, Department of parasitic diseases, Centers for Disease Control, and Latour, Marie
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2018

106. Clinical Features and Complications of Coxiella burnetii Infections From the French National Reference Center for Q Fever

Author: Pierre-Edouard Fournier, Matthieu Million, Cléa Melenotte, M. Patrizia Carrieri, Carole Eldin, Félix Djossou, Emmanouil Angelakis, Camelia Protopopescu, Sophie Edouard, Didier Raoult, Jean-Louis Mège, Nathalie Bardin, COMBE, Isabelle, Instituts Hospitalo-Universitaires - I.H.U. Méditerranée Infection - - Méditerranée Infection2010 - ANR-10-IAHU-0003 - IAHU - VALID, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Observatoire régional de la santé Provence-Alpes-Côte d'Azur [Marseille] (ORS PACA), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Médecine interne et immunologie clinique [Hôpital de la Conception - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Immunologie [Hôpital de la Conception - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by the French Government under the contract Méditerranée Infection 10-IAHU-03 from the Investissements d’Avenir program managed by the Agence Nationale de la Recherche. This work was also supported by Région Provence Alpes Côte d’Azur and European funding FEDER PRIMMI (Fonds Européen de Développement Régional - Plateformes de Recherche et d'Innovation Mutualisées Méditerranée Infection)., ANR-10-IAHU-0003,Méditerranée Infection,I.H.U. Méditerranée Infection(2010), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION ), Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition (C2VN), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-10-IAHU-0003/10-IAHU-0003,Méditerranée Infection,Méditerranée Infection(2010), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Service de médecine interne et maladies tropicales, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Saint-André, Vascular research center of Marseille (VRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), and Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, medicine.medical_specialty, Cardiovascular infection, 030106 microbiology, Q fever, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Internal medicine, medicine, Endocarditis, Humans, 030212 general & internal medicine, Prospective Studies, Prospective cohort study, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Original Investigation, Hemophagocytic lymphohistiocytosis, biology, business.industry, Research, valvular heart disease, Hazard ratio, General Medicine, Middle Aged, Coxiella burnetii, biology.organism_classification, medicine.disease, 3. Good health, Online Only, Infectious Diseases, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Female, France, business, Q Fever
Abstract: Key Points Question What are the characteristics and clinical presentations of Coxiella burnetii infection using 21st-century–clarified definitions? Finding In a cohort study of 2434 patients with Q fever, the following new critical Q fever foci were identified: acute endocarditis, lymphadenitis, and bone marrow involvement in hemophagocytic syndrome. Lymphadenitis is a risk factor for lymphoma, and the elevation of IgG anticardiolipin antibody titers in acute Q fever is associated with complications. Meaning Screening for anticardiolipin antibodies may help prevent acute Q fever complications; the use of transthoracic echocardiography in acute Q fever and positron emission tomographic scanning in suspected persistent focalized infection is justified to improve the care of patients with Q fever., This cohort study describes the clinical characteristics and identifies risk factors for complications and death among a large sample of French patients with Q fever., Importance Q fever remains widespread throughout the world; the disease is serious and causes outbreaks and deaths when complications are not detected. The diagnosis of Q fever requires the demonstration of the presence of Coxiella burnetii and the identification of an organic lesion. Objective To describe the hitherto neglected clinical characteristics of Q fever and identifying risk factors for complications and death. Design, Setting, and Participants This prospective cohort study conducted from January 1, 1991, through December 31, 2016, included patients treated at the French National Reference Center for Q fever with serologic findings positive for C burnetii and clinical data consistent with C burnetii infection. Clinical data were prospectively collected by telephone. Patients with unavailable clinical data or an unidentified infectious focus were excluded. Main Outcomes and Measures Q fever complications and mortality. Results Of the 180 483 patients undergoing testing, 2918 had positive findings for C burnetii and 2434 (68.8% men) presented with clinical data consistent with a C burnetii infection. Mean (SD) age was 51.8 (17.4) years, and the ratio of men to women was 2.2. At the time of inclusion, 1806 patients presented with acute Q fever, including 138 with acute Q fever that progressed to persistent C burnetii infection, and 766 had persistent focalized C burnetii infection. Rare and hitherto neglected foci of infections included lymphadenitis (97 [4.0%]), acute Q fever endocarditis (50 [2.1%]), hemophagocytic syndrome (9 [0.4%]), and alithiasic cholecystitis (11 [0.4%]). Vascular infection (hazard ratio [HR], 3.1; 95% CI, 1.7-5.7; P
Published: 2018
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107. Clinical characteristics and predictive score of dengue vs. chikungunya virus infections

Author: Bonifay, Timothée, Bonnefoy, C, Blanchet, D, Dueymes, M., Nacher, Mathieu, Djossou, Félix, Epelboin, Loïc, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Université de Guyane (UG)
Subjects: [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2018

108. Angiostrongyliasis due to A. cantonensis: first evidence in French Territories of America& an up-date in all French Overseas Territories

Author: Dard, C., Nguyen, D., Miossec, C., Tessier, E., de Meuron, K., Harrois, D., Mattera, D., Epelboin, Loïc, Demar, Magalie Pierre, Blanchet, Denis, Elenga, N., Defo, A., Nicolas, M., Desprez, P., Rulquin, L., Tournier, S., Aubert, L., Traversier, N., Jaffar Bandjee, M.C., Belmonte, O., Miltgen, G., Collet, L., Blondé, R., Chamouine, Abdourahim, Benoit-Cattin, T., Olivier, C., Giard, M., Guerin, A., Ghawche, F., Darteyre, S., Larre, P., Sookhareea, C., Pasche, J., Oehler, E., Delvallez, G., Gourinat, A.C., Lastère, S., Desbois-Nogard, N., Matillon, Mirlène, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Laboratoire Hospitalier et Universitaire Parasitologie Mycologie, and Centre Hospitalier de Mayotte
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

109. Coxiella burnetii: A Hidden Pathogen in Interstitial Lung Disease?

Author: Didier Raoult, Hubert Lepidi, Marion Lacoste, Jean-Louis Mege, Cléa Melenotte, Noelle Bernard, Félix Djossou, Jalal-Jean Izaaryene, Eric Huchot, Marion Delord, Oleg Mediannikov, Fabienne Brégeon, Carine Gomez, Alexandre Mania, Elsa Prudent, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de recherche sur les mécanismes moléculaires et pharmacologiques de l’obstruction bronchique (LOBIP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Service de médecine interne, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Saint-André, Département de Médecine Interne et Pneumologie [Brest] (DMIP - Brest), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), and Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Pathology, medicine.medical_specialty, Coxiella burnetii Infection, Q fever, Lung biopsy, Computed tomographic, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Medicine, Pathogen, Aged, Aged, 80 and over, interstitial lung disease, biology, interstitial lung fibrosis, business.industry, Interstitial lung disease, C. burnetii, Middle Aged, respiratory system, medicine.disease, Coxiella burnetii, biology.organism_classification, bacterial infections and mycoses, 3. Good health, respiratory tract diseases, 030104 developmental biology, Infectious Diseases, 030228 respiratory system, bacteria, Female, Lung Diseases, Interstitial, Q Fever, business
Abstract: International audience; We report 7 patients with interstitial lung disease seen at computed tomographic scan review. Coxiella burnetii infection was diagnosed in situ in 1 lung biopsy specimen. Q fever may be a cofactor of interstitial lung disease, especially in endemic areas.
Published: 2018
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110. Q fever epidemic in Cayenne, French Guiana, epidemiologically linked to three-toed sloth

Author: Denis Blanchet, Didier Raoult, Benoit de Thoisy, Jean-Lou Marié, Aba Mahamat, Sophie Edouard, Vincent Pommier de Santi, Carole Ilcinkas, Sébastien Briolant, Georges Hyvert, Bernard Davoust, Yann Reynaud, Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Équipe opérationnelle d’hygiène hospitalière, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Direction Interarmées du Service de Santé [Cayenne, Guyane française], Institut Pasteur de la Guadeloupe, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Direction Interarmées du Service de Santé en Guyane, Direction Régionale du Service de Santé des Armées (DRSSA - Toulon), Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, Veterinary medicine, Adolescent, 030231 tropical medicine, 030106 microbiology, Immunology, Attack rate, Three-toed sloth, Animals, Wild, Q fever, Biology, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Microbiology, Serology, Young Adult, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Zoonoses, medicine, Animals, Humans, Immunology and Allergy, Child, Epidemics, Feces, Disease Reservoirs, Retrospective Studies, General Veterinary, Infant, Outbreak, General Medicine, Middle Aged, biology.organism_classification, Coxiella burnetii, medicine.disease, Sloths, French Guiana, 3. Good health, Infectious Diseases, Child, Preschool, Female, Q Fever, Pneumonia (non-human)
Abstract: International audience; A Q fever epidemic occurred in 2013 in a small military residential area in Cayenne, French Guiana. A retrospective cohort study was conducted to identify Q fever risk factors. Confirmed acute Q fever case was defined as positive serology (IgM >= 50 and phase II IgG >= 200) and/or positive qPCR on serum or blood. In addition, wild mammals were captured at the study site and tested by serology and real-time PCR performed on blood, vaginal swabs and ticks. The attack rate was 20 percent (11/54). All the cases were symptomatic with fever > 38.5 degrees C and community-acquired pneumonia for four cases. Log binomial multivariate models identified two independent risk factors associated with Q fever: to clean the house (RRa = 7.5 CI95% [1.03-55.3]) and to carry a three-toed sloth in arms (RRa = 2.6 CI95% [1.1-5.8]). Eighteen marsupial individuals were captured, all PCRs were negative but 17% (3/18) had a positive serology. Another study conducted after the epidemic found only one (1/4) three-tooth sloth (Bradypus tridactylus) with feces highly infectious for C. burnetii MST17. The same strain C. burnetii genotype 17 has been laboratory-confirmed in this mammal and in human cases. These results support the implication of three-toed-sloth in this epidemic. Human contamination mainly occurs through inhalation of infectious aerosols as suggested by high relative risk associated with house cleaning activities and pulmonary forms of the disease, and through direct contact with three- toed-sloth. Positive serological results among marsupials confirm wildlife exposure and suggest a more complex sylvatic transmission cycle among wild mammals.
Published: 2018
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111. Cryptosporidiosis outbreak on children in Amazonia

Author: Mosnier, Emilie, Martin, N, Razakandrainibe, Romy, Dalle, F, Roux, G, Buteux, Arnaud, Favennec, L, Brousse, P, Guarmit, P, Blanchet, D, Epelboin, Loïc, Girouin, C, Martin, E, Djossou, Félix, Nacher, Mathieu, Demar, Magalie Pierre, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA), Latour, Marie, and Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2018

112. Influence of geographic origin on AIDS and serious non-AIDS morbidity/mortality during cART among heterosexual HIV-infected men and women in France

Author: Laure-Amélie, de Monteynard, Sophie, Matheron, Sophie, Grabar, Pierre, de Truchis, Jacques, Gilquin, Juliette, Pavie, Odile, Launay, Jean-Luc, Meynard, Marie-Aude, Khuong-Josses, David, Rey, Aba, Mahamat, Rosemarie, Dray-Spira, Anne, Simon, Dominique, Costagliola, Sophie, Abgrall, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Delafontaine, Centre Hospitalier de Saint-Denis [Ile-de-France], Le Trait d'Union, centre de soins de l'infection par le VIH [CHU Strasbourg], CHU Strasbourg, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Service de médecine interne [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Antoine Béclère, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), and Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, Risk, Bacterial Diseases, European People, Databases, Factual, West Indies, HIV Infections, Cardiovascular Medicine, Severity of Illness Index, Geographical locations, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Medicine and Health Sciences, Cardiovascular Diseases in Women, Humans, Ethnicities, Heterosexuals, Poisson Distribution, European Union, French People, Heterosexuality, Africa South of the Sahara, Acquired Immunodeficiency Syndrome, Incidence, Middle Aged, Europe, Health Care, Infectious Diseases, Anti-Retroviral Agents, Cardiovascular Diseases, People and Places, Africa, Women's Health, Drug Therapy, Combination, Female, Population Groupings, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, France, Morbidity, Health Statistics, Research Article, Sexuality Groupings
Abstract: International audience; Background: The influence of geographic origin on the risk of severe illness and death on cART has not been explored in European countries.Method: We studied antiretroviral-naïve heterosexual HIV-1-infected individuals enrolled in the FHDH-ANRS CO4 cohort in France who started cART between 2006 and 2011. Individuals originating from France (French natives), sub-Saharan Africa (SSA) and non-French West-Indies (NFW) were studied until 2012. Crude and adjusted rate ratios (aRR) of severe morbid events/deaths (AIDS-related and non-AIDS-related) were calculated using Poisson regression models stratified by sex, comparing each group of migrants to French natives.Results: Among 2334 eligible men, 1379 (59.1%) originated from France, 838 (35.9%) from SSA and 117 (5.0%) from NFW. SSA male migrants had a higher aRR for non-AIDS infections, particularly bacterial infections (aRR 1.56 (95% CI 1.07-2.29), p = 0.0477), than French natives. Among 2596 eligible women, 1347 (51.9%) originated from France, 1131 (43.6%) from SSA, and 118 (4.5%) from NFW. SSA and NFW female migrants had a higher aRR for non-AIDS infections, particularly non-bacterial infections (respectively, 2.04 (1.18-3.53) and 7.87 (2.54-24.4), p = 0.0010), than French natives. We observed no other significant differences related to geographic origin as concerns the aRRs for AIDS-related infections or malignancies, or for other non-AIDS events/deaths such as cardiovascular disease, neurological/psychiatric disorders, non-AIDS malignancies and iatrogenic disorders, in either gender.Conclusion: Heterosexual migrants from SSA or NFW living in France have a higher risk of non-AIDS-defining infections than their French native counterparts. Special efforts are needed to prevent infectious diseases among HIV-infected migrants.
Published: 2018
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113. Acute Amazon toxoplasmosis in immunocompetent patients: a descriptive study of 42 cas in French Guiana

Author: Labaudinière, Aude, Demar, Magalie Pierre, Davy, Damien, Epelboin, Loïc, Carod, Jean-François, Brousse, Paul, Mosnier, Emilie, Matillon, Mirlène, Laboratoire Hospitalier et Universitaire Parasitologie Mycologie, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Laboratoire Ecologie, Evolution, Interactions des Systèmes amazoniens (LEEISA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Institut Pasteur de Madagascar, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, and Université de Guyane (UG)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2018

114. Modeling HIV-HCV coinfection epidemiology in the direct-acting antiviral era: the road to elimination

Author: Victor Virlogeux, Fabien Zoulim, Pascal Pugliese, Isabelle Poizot-Martin, Marc-Antoine Valantin, Lise Cuzin, Jacques Reynes, Eric Billaud, Thomas Huleux, Firouze Bani-Sadr, David Rey, Anne Frésard, Christine Jacomet, Claudine Duvivier, Antoine Cheret, Laurent Hustache-Mathieu, Bruno Hoen, André Cabié, Laurent Cotte, the Dat’AIDS Study Group, Service d'Hépatologie [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses [Nice], Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Coordination régionale de la lutte contre le virus de l’immunodéficience humaine ( COREVIH [Toulouse]), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service des maladies infectieuses [Nantes], Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), CHU Clermont-Ferrand, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Point-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA)-CHU de la Martinique [Fort de France], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris]
Subjects: Male, Direct-acting antiviral agent, Human immunodeficiency virus (HIV), lcsh:Medicine, HIV Infections, medicine.disease_cause, Immunotherapy, Adoptive, Men who have sex with men, Cohort Studies, 0302 clinical medicine, Risk Factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Epidemiology, Prevalence, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, education.field_of_study, Coinfection, Incidence, virus diseases, General Medicine, Hepatitis C, 3. Good health, HCV elimination, Cohort, HCV, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, France, Direct acting, Research Article, medicine.medical_specialty, Anti-HIV Agents, Population, Antiviral Agents, Models, Biological, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Treatment uptake, medicine, Humans, education, Models, Statistical, business.industry, lcsh:R, HIV, medicine.disease, Compartmental model, Hiv hcv coinfection, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Mathematical modeling, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Epidemiologic Methods, business
Abstract: Background HCV treatment uptake has drastically increased in HIV-HCV coinfected patients in France since direct-acting antiviral (DAA) treatment approval, resulting in HCV cure in 63% of all HIV-HCV patients by the end of 2015. We investigated the impact of scaling-up DAA on HCV prevalence in the whole HIV population and in various risk groups over the next 10 years in France using a transmission dynamic compartmental model. Methods The model was based on epidemiological data from the French Dat’AIDS cohort. Eight risk groups were considered, including high-risk (HR) and low-risk (LR) men who have sex with men (MSM) and male/female heterosexuals, intra-venous drug users, or patients from other risk groups. The model was calibrated on prevalence and incidence data observed in the cohort between 2012 and 2015. Results On January 1, 2016, 156,811 patients were registered as infected with HIV in France (24,900 undiagnosed patients) of whom 7938 (5.1%) had detectable HCV-RNA (722 undiagnosed patients). Assuming a treatment coverage (TC) rate of 30%/year (i.e., the observed rate in 2015), model projections showed that HCV prevalence among HIV patients is expected to drop to 0.81% in 2026. Sub-analyses showed a similar decrease of HIV-HCV prevalence in most risk groups, including LR MSM. Due to higher infection and reinfection rates, predicted prevalence in HR MSM remained stable from 6.96% in 2016 to 6.34% in 2026. Increasing annual TC rate in HR MSM to 50/70% would decrease HCV prevalence in this group to 2.35/1.25% in 2026. With a 30% TC rate, undiagnosed patients would account for 34% of HCV infections in 2026. Conclusions Our model suggests that DAA could nearly eliminate coinfection in France within 10 years for most risk groups, including LR MSM. Elimination in HR MSM will require increased TC. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s12916-017-0979-1) contains supplementary material, which is available to authorized users.
Published: 2017
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115. Impact of baseline plasma HIV-1 RNA and time to virological suppression on virological rebound according to first-line antiretroviral regimen

Author: Clotilde Allavena, Jacques Reynes, Pierre Delobel, Isabelle Poizot-Martin, Tristan Ferry, Pascal Pugliese, Bruno Hoen, Isabelle Ravaux, Marine Morrier, L. Khatchatourian, Firouzé Bani-Sadr, Amandine Gagneux-Brunon, Olivier Robineau, Matthieu Hanf, Véronique Joly, Christine Katlama, Catherine Chirouze, André Cabié, Thierry May, Christine Jacomet, François Raffi, David Rey, Claudine Duvivier, Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Biostatistique, Biomathématique, Pharmacoépidémiologie et Maladies Infectieuses (B2PHI), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies Infectieuses [Nice], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Services des maladies infectieuses [Tourcoing], Centre Hospitalier de Tourcoing, Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Service des maladies infectieuses [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] (SMIT), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service des maladies infectieuses [Saint-Etienne], Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Le Trait d'Union, centre de soins de l'infection par le VIH [CHU Strasbourg], CHU Strasbourg, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Point-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Service des maladies infectieuses [La Roche sur Yon], Centre hospitalier universitaire de Tlemcen (Algérie) (CHU de Tlemcen), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Centre d’Investigation Clinique de Nantes ( CIC Nantes ), Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Biostatistique, Biomathématique, Pharmacoépidémiologie et Maladies Infectieuses ( B2PHI ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique ( iPLESP ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Service des maladies infectieuses et tropicales[Toulouse], Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Centre de physiopathologie de Toulouse Purpan ( CPTP ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] ( Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Conception] ( SMIT ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Hôpital de la Conception [CHU - APHM] ( LA CONCEPTION ), Centre d'infectiologie Necker-Pasteur, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) ( EA 7327 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), CHU Saint-Etienne, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses ( TransVIHMI ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Cheikh Anta Diop ( UCAD ) -Universtié Yaoundé 1 (Cameroun)-Université de Montpellier ( UM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane ( CIC - Antilles Guyane ), Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre hospitalier universitaire de Tlemcen (Algérie) ( CHU de Tlemcen ), CHU de la Martinique-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Service des maladies infectieuses et tropicales [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), and CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Time Factors, Sustained Virologic Response, [SDV]Life Sciences [q-bio], medicine.medical_treatment, Integrase inhibitor, HIV Infections, Plasma, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Recurrence, immune system diseases, Antiretroviral Therapy, Highly Active, Medicine, Pharmacology (medical), Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, Aged, 80 and over, virus diseases, [ SDV.SPEE ] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Middle Aged, Viral Load, 3. Good health, Infectious Diseases, RNA, Viral, Female, Viral load, Adult, Microbiology (medical), Efavirenz, Adolescent, Anti-HIV Agents, 030106 microbiology, Young Adult, 03 medical and health sciences, Humans, Protease inhibitor (pharmacology), Aged, Pharmacology, Protease, business.industry, Virology, Reverse transcriptase, Regimen, chemistry, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, HIV-1, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, Follow-Up Studies
Abstract: Objectives: We investigated the risk of virological rebound in HIV-1-infected patients achieving virological suppression on first-line combined ART (cART) according to baseline HIV-1 RNA, time to virological suppression and type of regimen. Patients and methods: Subjects were 10836 adults who initiated first-line cART (two nucleoside or nucleotide reverse transcriptase inhibitors!efavirenz, a ritonavir-boosted protease inhibitor or an integrase inhibitor) from 1 January 2007 to 31 December 2014. Cox proportional hazards models with multiple adjustment and propensity score matching were used to investigate the effect of baseline HIV-1 RNA and time to virological suppression on the occurrence of virological rebound. Results: During 411436 patient-months of follow-up, risk of virological rebound was higher in patients with baseline HIV-1 RNA 100000 copies/mL versus ,100000 copies/mL, in those achieving virological suppression in.6months versus ,6months, and lower with efavirenz or integrase inhibitors than with ritonavir-boosted protease inhibitors. Baseline HIV-1 RNA .100000 copies/mL was associated with virological rebound for ritonavir-boosted protease inhibitors but not for efavirenz or integrase inhibitors. Time to virological suppression .6months was strongly associated with virological rebound for all regimens. Conclusions: In HIV-1-infected patients starting cART, risk of virological rebound was lower with efavirenz or integrase inhibitors than with ritonavir-boosted protease inhibitors. These data, from a very large observational cohort, in addition to the more rapid initial virological suppression obtained with integrase inhibitors, reinforce the positioning of this class as the preferred one for first-line therapy.
Published: 2017
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116. Encephalitis in a traveller with typhoid fever: efficacy of corticosteroids

Author: Guillaume Mellon, Benjamin Rohaut, Florence Brossier, Eric Caumes, Anne-Line Eme, Loïc Epelboin, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Neurologie [CHU Pitié-Salpêtrière], IFR70-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Service de neurologie 1 [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Male, Pediatrics, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, Salmonella typhi, complex mixtures, Typhoid fever, Diagnosis, Differential, 03 medical and health sciences, Young Adult, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, medicine, Humans, In patient, 030212 general & internal medicine, Typhoid Fever, Glucocorticoids, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Travel, business.industry, ADRENAL CORTICOSTEROIDS, Electroencephalography, General Medicine, medicine.disease, 3. Good health, Salmonella paratyphi A, Encephalitis, Prednisone, business, Complication, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Typhoid fever is a bacterial infection caused by Salmonella typhi or S. paratyphi, recognized as a classical cause of fever in returning travellers. However, neuropsychiatric presentations are rarely reported in travellers diagnosed in western countries, whereas they are more commonly described in patients treated in endemic areas. We describe such a case and discuss the pathophysiologic mechanisms of this complication.
Published: 2017
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117. Leptospirosis in French Guiana and the Guiana shield: Current knowledge in 2016

Author: Alain Berlioz-Arthaud, P. Le Turnier, F. Djossou, M. Demar, Pascale Bourhy, Mathieu Picardeau, Yann Reynaud, Emilie Mosnier, Loïc Epelboin, Cécile Richard-Hansen, Mathieu Nacher, Gabriel Carles, Roxane Schaub, B. de Thoisy, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Université de Guyane (UG), Centre National de Référence de la Leptospirose - National Reference Center Leptospirosis (CNR), Institut Pasteur [Paris], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Unité de la Tuberculose et des Mycobactéries - WHO Supranational TB Reference Laboratory, Institut Pasteur de la Guadeloupe, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), Laboratoire des Interactions Virus-Hôtes [Cayenne, Guyane Française], Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Service de gynécologie-obstétrique, Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais, Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicale, Centre Hospitalier de Cayenne, Institut Pasteur [Paris] (IP), and Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, Latin Americans, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, 030106 microbiology, Q fever, Pathology and Forensic Medicine, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Leptospira, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, parasitic diseases, medicine, biology, Amazon rainforest, Public health, Zoonosis, medicine.disease, biology.organism_classification, Leptospirosis, 3. Good health, Geography, Ethnology, Malaria, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Leptospirosis is a cosmopolitan zoonosis caused by bacteria of the genus Leptospira. Whether the distribution is worldwide, the hot and humid climate of the tropics is particularly conducive to its expansion. In most French overseas departments and territories, leptospirosis is considered as a public health problem. In French Guiana, a French department located in the northeastern part of the Amazon rainforest, it is supposed to be rare. The objective of this review was to make an inventory of the knowledge on human and animal leptospirosis in French Guiana and neighboring countries. A comprehensive search was conducted through the indexed and informal medical literature in English, French, Spanish and Portuguese. Thus, respectively ten and four publications were identified on human and animal leptospirosis in French Guiana, published between 1940 and 1995 in the form of case reports or case series. The publications concerning this disease in the other countries of the Guiana Shield, eastern Venezuela, Guyana, Suriname, and Brazilian state of Amapá, also scarce or nonexistent. However recent data from the French National Centre of leptospirosis showed a recent and sudden increase in the number of cases in the department, probably partly due to the development of diagnostic tools such as Elisa IgM serology. It is likely that leptospirosis is a neglected disease in the region, due to the lack of diagnostic tools readily available, the lack of knowledge of the local clinicians on this disease and the existence of many other pathogens with similar clinical presentation such as malaria, arboviruses and Q fever and Amazonian toxoplasmosis. The establishment of more large-scale studies on animal and human leptospirosis is necessary and urgent to know the true burden of this disease in our region.
Published: 2017
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118. Efficacy and safety of direct-acting antiviral regimens in HIV/HCV-co-infected patients – French ANRS CO13 HEPAVIH cohort

Author: Philippe Sogni, Anne Simon, Lionel Piroth, Karine Lacombe, Camille Gilbert, Elina Teicher, Patrick Miailhes, David Zucman, Marc-Antoine Valantin, Caroline Lascoux-Combe, Philippe Morlat, Daniel Vittecoq, Firouzé Bani-Sadr, Dominique Salmon, Claudine Duvivier, François Dabis, Hugues Aumaitre, Laure Esterle, Laurent Alric, Isabelle Poizot-Martin, Linda Wittkop, Stéphanie Dominguez, Anne Gervais, Olivier Bouchaud, François Boué, Patrizia Carrieri, Julie Chas, Eric Rosenthal, Didier Neau, Eric Billaud, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CIC-EC - Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Santé Publique, d'Epidémiologie et de Développement (ISPED), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Aix Marseille Université (AMU), CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux (CHU de Bordeaux), Hôpital Foch [Suresnes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Hôpital Avicenne [AP-HP], AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Hôpital Cochin [AP-HP], Université de Bourgogne (UB), Team MORPH3EUS (INSERM U1219 - UB - ISPED), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d’information Médicale [CHU de Bordeaux] (Pôle de Santé Publique), CHU Bordeaux [Bordeaux], Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Hôpital Archet 2 [Nice] (CHU), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Maladies infectieuses et tropicales [CHU Tenon], Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Service des maladies infectieuses et tropicales, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service d'immunologie clinique [Créteil], Service des Maladies Infectieuses et Tropicales A [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de maladies infectieuses et tropicales [Nantes], Université de Nantes (UN)-Hôtel-Dieu-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de médecine interne et maladies infectieuses [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Saint-André, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint Louis], Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Département de médecine interne et immunologie clinique [CHU Pitié-Salpêtrière] (DMIIC), Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Service de Médecine Interne et Immunologie clinique [AP-HP Hôpital Bicêtre], Hôpital Bicêtre, Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] (CHB), Hôpital Paul Brousse-Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CHU Toulouse [Toulouse], UMR 152, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Necker], Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Dynamiques des Réponses immunes - Dynamics of Immune Responses, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Maladies infectieuses et tropicales [AP-HP Hôpital Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Hepatitis C virus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Integrase inhibitor, HIV Infections, medicine.disease_cause, Antiviral Agents, HIV/HCV co-infection, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Internal medicine, parasitic diseases, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Adverse effect, Hepatology, Reverse-transcriptase inhibitor, business.industry, Coinfection, Ribavirin, virus diseases, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 3. Good health, Regimen, Sustained virological response, Logistic Models, chemistry, Immunology, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, All-oral DAA, business, Cohort study, medicine.drug
Abstract: International audience; Background & aims: There is little data available on the use of new oral direct-acting antiviral (DAA) regimens to treat human immunodeficiency virus and hepatitis C virus (HIV/HCV) co-infected patients in real-life settings. Here, the efficacy and safety of all-oral DAA-based regimens in HIV/HCV-co-infected patients enrolled in the French nationwide ANRS CO13 HEPAVIH observational cohort are reported.Methods: HIV/HCV-co-infected patients enrolled in the ANRS CO13 HEPAVIH observational cohort were included if they began an all-oral DAA-based regimen before 1st May 2015 (12-week regimens) or 1st February 2015 (24-week regimens). Treatment success (SVR12) was defined by undetectable HCV-RNA 12weeks after treatment cessation. Exact logistic regression analysis was used to identify factors associated with SVR12.Results: A total of 323 patients (74% men) with a median age of 53years were included, 99% of whom were on combination antiretroviral therapy (cART). HIV RNA load was
Published: 2017
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119. Sévérité des grippes saisonnières post-pandémiques en milieu tropical de 2012 à 2015

Author: Mahamat, A, Enfessi, A., Dueymes, M., Elenga, N., Egmann, Gérald, Epelboin, Loïc, Moreau, B., Djossou, Félix, Rousseau, D., Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier de Mayotte, Université de Guyane (UG), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), and Matillon, Mirlène
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

120. Efficacité thérapeutique de la chloroquine dans le traitement des accès palustres simples à Plasmodium vivax en Guyane

Author: Epelboin, Loïc, Musset, L., Heugas, C., Naldjinan, R., Blanchet, D, Houze, P., Abboud, Philippe, Ringwald, P., Legrand, Eric, Demar, Magalie Pierre, Felix, D., Centre Hospitalier de Mayotte, Université de Guyane (UG), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), and Matillon, Mirlène
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

121. La fièvre Q chronique en Guyane française: une entité méconnue

Author: Sanderink, D, Melenotte, C., Walter, G, Bidaud, B, Jauréguiberry, S., Mahamat, A., Demar, Magalie Pierre, Abboud, P., Djossou, Félix, Epelboin, Loïc, Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Lab-STICC_UBO_CID_SFIIS, Laboratoire des sciences et techniques de l'information, de la communication et de la connaissance (Lab-STICC), Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Lebanese Univ, EC2M, Fac Sci 2, Campus Pierre Gemayel, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-Télécom Bretagne-Institut Brestois du Numérique et des Mathématiques (IBNM), Université de Brest (UBO)-Université européenne de Bretagne - European University of Brittany (UEB)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Matillon, Mirlène
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

122. Primaquine 30 mg/j vs 15 mg/j pendant 14 j pour la prévention des reviviscences de Plasmodium vivax de l’adulte dans une région d’Amérique : où en sommes-nous ?

Author: Valdes, A, Epelboin, Loïc, Mosnier, E., Walter, G, Vesin, G, Abboud, P., Blanchet, D., Blaise, N, Demar, Magalie Pierre, Djossou, Félix, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Université de Guyane (UG), Lebanese Univ, EC2M, Fac Sci 2, Campus Pierre Gemayel, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Matillon, Mirlène
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

123. Zika virus and reproduction: facts, questions and current management

Author: Emmanuel Dulioust, Alexandra Benachi, Catherine Patrat, Loïc Epelboin, Sylvie Epelboin, Françoise Merlet, Service de Gynécologie - Obstétrique [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Histologie-Embryologie, Biologie de la Reproduction (CECOS Paris Cochin), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Service de gynécologie-obstétrique, médecine de la reproduction [Béclère], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Agence de la biomédecine [Saint-Denis la Plaine], Epigenèse et développement des mammifères, Génétique et Biologie du Développement, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dpt gynécologie [CHU Bichat], Hôpital Cochin [AP-HP], AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Sexual transmission, media_common.quotation_subject, Population, Zoology, Fertility, Orchitis, Biology, Zika virus, 03 medical and health sciences, Mice, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Pregnancy, Semen, Pandemic, medicine, Animals, Humans, Sex organ, 030212 general & internal medicine, Pregnancy Complications, Infectious, education, media_common, education.field_of_study, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Transmission (medicine), Zika Virus Infection, Reproduction, Obstetrics and Gynecology, Sexually Transmitted Diseases, Viral, Zika Virus, medicine.disease, biology.organism_classification, Infectious Disease Transmission, Vertical, 3. Good health, 030104 developmental biology, Reproductive Medicine, Vagina, Microcephaly, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Female
Abstract: Background Zika virus (ZIKV) is an arthropod-borne virus of the family Flaviviridae, genus Flavivirus. ZIKV is currently the focus of an ongoing pandemic and worldwide public health emergency. Although originally isolated in 1947, its pathogenesis was poorly known and very few documented infections were published until recently. Its route of transmission and its impact on reproduction and pregnancy have only recently begun to be disclosed. Objective and rationale This review summarizes the most recent knowledge about ZIKV infection and pathogenesis and focuses on its impacts on male and female genital tracts, including the risks of sexual transmission and to pregnancy. The consequences of ZIKV infection for pregnancy planning and ART are also discussed. Search methods The PubMed and EMBASE databases were inter-rogated using specific terms, such as 'ZIKV', 'transmission', 'male', 'female', fertility', 'pregnancy, 'semen', 'testis', 'ovary' and 'genital tract', up to 17 March 2017. Outcomes ZIKV has long been considered a harmless virus, but increasing evidence suggests that it has adverse effects on the neurological system and on pregnancy outcomes. In mice, ZIKV slows foetal growth and damages the foetal brain. In humans, the virus is able to cross the placental barrier and to induce foetal death and major anomalies, such as microcephaly, brain defects and long-term neurologic sequelae, i.e. the 'congenital Zika syndrome'. In addition to its transmission by mosquitoes, ZIKV may be transmitted sexually. Currently available data indicate that ZIKV RNA can remain detectable in semen for several months, whereas shedding in the female genital tract appears to be rare and of short duration. Current guidance on preventing the sexual transmission of ZIKV is based on the assumption that transmission occurs from a male partner to a receptive partner. Furthermore, in mouse models, the virus can actively replicate in male genital organs and induce severe orchitis, which raises concerns about its possible impact on human male fertility. Wider implications These new and relevant findings have led many countries and institutions to release updated and regular guidance for preconception counselling and ART to prevent the sexual transmission of ZIKV. Progress in understanding the sexual transmission of ZIKV and its dissemination to genital systems would also help to better anticipate and control outbreaks of potentially sexually transmissible infectious agents.
Published: 2017
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124. Etude de la sévérité des épidémies de dengue en Guyane

Author: Camille Fritzell, Claude Flamand, Christelle Prince, Vanessa Ardillon, PHILIPPE QUENEL, Félix Djossou, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Cellule interrégionale d'épidémiologie Antilles-Guyane [CIRE], and École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)
Subjects: Dengue, Epidémiologie hospitalière, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Epidémie, Sévérité, Guyane
Abstract: International audience; Contexte et objectifs : La dengue est l’arbovirose la plus répandue dans le monde et sévit dans les zones tropicales et sub-tropicales du globe. Au cours des dernières années, l’épidémiologie de la dengue a fortement évolué dans les Amériques tendant vers une situation d’hyper-endémicité caractérisée par la co-circulation des quatre sérotypes du virus responsable et des épidémies plus fréquentes et plus intenses. Dans ce contexte, une surveillance hospitalière a été mise en place en Guyane afin d’étudier la sévérité des épidémies de dengue et les caractéristiques cliniques des patients hospitalisés.Méthode : De 2008 à 2013, un recueil quotidien des données cliniques et biologiques a été mis en place pour tous les cas de dengue hospitalisés. La classification établie par l’Organisation mondiale de la santé en 2009 a été appliquée de manière rétrospective, puis prospective à l’ensemble des cas. Le taux de sévérité a été calculé en rapportant le nombre de formes sévères au nombre de cas cliniquement évocateurs estimé par le dispositif de surveillance épidémiologique.Présentation des résultats : Sur les 1356 cas de dengue hospitalisés, 216 (16%) présentaient une dengue sans signes d’alerte, 926 (68%) présentaient une dengue avec des signes d’alerte et 214 (16%) présentaient une dengue classée sévère. Les taux de sévérité étaient similaires au cours des trois épidémies survenues durant la période d’étude (2009, 2010 et 2013) bien que le taux d’hospitalisation ait été plus élevé en 2013. La présence d’un épanchement pleural, d’un taux d’aminotransférases supérieur à 193UI/L et d’un taux de plaquettes inférieur à 75000 cellules/mm3 étaient associés à la sévérité de la dengue.Conclusion et interprétation des résultats : Cette étude a permis de fournir une description épidémiologique récente de la sévérité des épidémies de dengue en Guyane et a montré la pertinence de la nouvelle classification sur l’activité hospitalière.
Published: 2017

125. Human leptospirosis in French Guiana: current knowledge and perspectives

Author: Epelboin, Loïc, Le Turnier, Paul, Picardeau, Mathieu, Schaub, Roxane, Petit-Sinturel, Marion, Villemant, Nicolas, Trombert-Paolantoni, Sabine, Berlioz-Arthaud, Alain, Bisser, Sylvie, Mosnier, Emilie, Ardillon, Vanessa, Jolivet, Anne, Demar, Magalie, Nacher, Mathieu, Bourhy, Pascale, Djossou , Felix, Université de Guyane (UG), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre National de Référence de la Leptospirose - National Reference Center Leptospirosis (CNR), Institut Pasteur [Paris] (IP), Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Cellule Inter Régionale d'Epidémiologie des Antilles - Guyane, Institut de Veille Sanitaire (INVS), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne - UFR Géographie (UP1 UFR08), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1), Laboratoire CERBA [Saint Ouen l'Aumône], Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais, Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA), Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH Guyane), Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Institut Pasteur [Paris], and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]
Subjects: Leptospira, Epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Neglected tropical disease, Leptospirose, Maladie tropicale négligée, French Guiana, Épidémiologie, Zoonosis, Guyane française // Keywords: Leptospirosis, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Guyane française, Zoonose, Leptospirosis, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: Leptospirosis is a cosmopolitan zoonosis caused by the bacteria of the genus Leptospira. The warm and wet climate of the intertropical zone is particularly favorable with its expansion. In French Guiana, a French territory located at the North-East of the South American continent in Amazonian area, it seems to be rare. The objective of this article is to make the inventory of current knowledge on the epidemiology of human leptospirosis in French Guiana, and to discuss the prospects concerning this disease and improve its surveillance. Publications on leptospirosis in French Guiana are rare and old, and date from 1940 to 1995. The annual reports of the National Reference Centre of Leptospirosis (NRC, Pasteur Institute) show a quite stable annual number of cases, varying from 6 to 18 between 1996 and 2012, depending on the year, with a significant increase from 2013 to 2015, respectively 36, 92 and 67 cases a year. A retrospective study conducted recently on the cases which occurred between 2007 and 2014 with very strict inclusion criteria, identified 72 cases on the territory, among whom 12 (16.7%) severe cases and 3 (4.2%) deaths. The disease affects mainly men (86.1%) aged between 20 and 49 years (63.9%). It is probable that leptospirosis is a neglected disease in the region, due to the absence of quickly available diagnostic tools, the lack of awareness of clinicians on this pathology, and the existence of many other infectious agents with similar clinical presentations during acute episodes (such as malarias, arboviruses, Q fever and Amazonian toxoplasmosis). The implementation of larger studies is necessary to know the true burden of this disease in French Guiana., La leptospirose est une zoonose cosmopolite causée par les bactéries du genre Leptospira. Le climat chaud et humide de la zone intertropicale est particulièrement propice à son expansion. En Guyane, département français situé au nord-est du continent sud-américain, en région amazonienne, elle semble rare. L’objectif de cet article est de récapituler l’état des connaissances actuelles sur l’épidémiologie de leptospirose humaine en Guyane et de discuter les perspectives pour en améliorer la surveillance.Les publications sur la leptospirose en Guyane sont rares et anciennes, datant des années 1940-1995. Les rapports annuels du Centre national de référence de la leptospirose (CNR, Institut Pasteur de Paris) montrent un nombre annuel de cas assez stable entre 1996 et 2012, variant de 6 à 18 selon les années, avec une augmentation importante de 2013 à 2015 : respectivement 36, 92 et 67 cas par an. Une étude rétrospective menée récemment sur les cas survenus entre 2007 et 2014, identifiés avec des critères diagnostiques très stricts, a comptabilisé 72 cas sur le département, parmi lesquels 12 (16,7%) cas graves et 3 (4,2%) décès. La maladie touchait principalement des hommes (86,1%) âgés de 20 à 49 ans (63,9%).Il est probable que la leptospirose soit une maladie négligée dans la région, du fait de l’absence d’outils diagnostiques rapidement disponibles, de la méconnaissance des cliniciens de cette pathologie et de la présence de nombreuses autres pathologies à symptômes cliniques similaires en phase aiguë (paludismes, arboviroses, fièvre Q, toxoplasmose amazonienne). La mise en place d’études de plus grande ampleur est nécessaire pour connaître le véritable impact de cette maladie en Guyane.
Published: 2017

126. A Large Outbreak of Thiamine Deficiency among Illegal Gold Miners in French Guiana

Author: Emilie Mosnier, J. Stroot, Mathieu Nacher, Paul Brousse, Pommier de Santi, B. Guarmit, F. Djossou, Niemetzky F, Muriel Ville, D. Blanchet, P. Abboud, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales [Cayenne, Guyanne Française], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Direction Interarmées du Service de Santé en Guyane, Centre d'épidémiologie et de santé publique des armées, Service de Santé des Armées, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH Guyane), and Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424
Subjects: Vitamin, Adult, Male, Pediatrics, medicine.medical_specialty, 030231 tropical medicine, Thiamine intake, Miners, Beriberi, Disease Outbreaks, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Virology, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Thiamine, Thiamine deficiency, Aged, Retrospective Studies, business.industry, Malnutrition, Outbreak, Articles, Middle Aged, Tropical forest, medicine.disease, 3. Good health, Surgery, French Guiana, Malaria, Infectious Diseases, chemistry, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Criminal Behavior, Parasitology, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Gold, business
Abstract: International audience; From September 2013 to July 2014, several gold miners working in the tropical forest consulted the Maripasoula Health Center in French Guiana for edema and findings consistent with right cardiac failure. Of the 42 cases of beriberi that were diagnosed, one patient died. The laboratory and clinical investigation demonstrated vitamin B1 deficiency in most of the patients tested. Furthermore, 30 of 42 patients responded favorably to 500 mg of intravenous or intramuscular thiamine supplementation. In addition, dietary investigation showed insufficient thiamine intake in these patients. We concluded that patients had acquired beriberi because of diet restrictions, hard labor, and infectious diseases, notably malaria. In 2016, cases were still being reported. We recommend screening for compatible symptoms in gold miners, thiamine supplementation, and nutritional intervention
Published: 2017
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127. Paludisme et orpaillage illégal en Guyane : un enjeu majeur de santé publique

Author: Maylis Douine, Lise Musset, Florine Corlin, Stéphane Pelleau, Yassamine Lazrek, Louise Mutricy, Antoine Adenis, Emilie Mosnier, Félix Djossou, Magalie Pierre Demar, Mathieu Nacher, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales [Cayenne, Guyanne Française], Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH), L’étude a bénéficié d’un Financement européen pour le développement régional (Feder, n° Présage 32078) et du fondsSanté publique France dans le cadre du mandat CNR pour la réalisation des génotypages K13 et le financement du tempstechnique et scientifique dédié à ce projet., Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA)
Subjects: [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: National audience; Introduction – Le nombre d’accès palustres diminue globalement en Guyane, alors que les orpailleurs travaillantsur les sites illégaux semblent particulièrement touchés par cette pathologie. Les objectifs de cette étudeétaient de déterminer la prévalence du paludisme dans cette population, les comportements associés ainsi quele niveau de résistance des parasites vis-à-vis des dérivés de l’artémisinine.Matériel et méthodes – Les inclusions ont eu lieu sur les sites de repli fréquentés par les orpailleurs le long dufleuve Maroni. Ont été effectués : un test de diagnostic rapide du paludisme, un questionnaire, un prélèvementsanguin pour PCR et un génotypage du gène pfK13 pour les PCR positives à Plasmodium falciparum.Résultats – De janvier à juin 2015, 421 orpailleurs ont été inclus, majoritairement des hommes (70,6%) brésiliens(93,8%). La prévalence du portage de plasmodies déterminée par PCR était en moyenne de 22,3%(IC95%: [18,3-26,3]), à 84% asymptomatiques. Les espèces identifiées étaient principalement P. falciparum(47,9%) puis P. vivax (37,2%), plus 10,6% de co-infections. Lors du dernier accès palustre, 52,4% des orpailleursavaient eu recours à l’automédication, majoritairement avec des dérivés de l’artémisinine (93,8%) avecune mauvaise observance (37,8%). L’analyse du gène pfK13 n’a pas mis en évidence de mutations associéesà la résistance à P. falciparumDiscussion – La prévalence élevée de porteurs asymptomatiques de plasmodies constitue un réservoir importantde transmission dans la région. L’utilisation massive de dérivés de l’artémisinine associée à une mauvaise observancedes traitements sont des facteurs de risque d’émergence de résistance imposant des mesures rapides
Published: 2017

128. Two Clusters of Ciguatera Fish Poisoning in Paris, France, Related to Tropical Fish Imported From the French Caribbean by Travelers

Author: Sophie Krys, Virginie Hossen, Alice Pérignon, Loïc Epelboin, Renaud Vincent, Eric Caumes, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Environmental Health Sciences and Research Bureau (HECSB), Health Canada, and Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)
Subjects: Adult, Male, Paris, Pathology, medicine.medical_specialty, Restaurants, Ciguatoxin, Coral reef fish, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, Poison control, Food Contamination, Diversity of fish, Ciguatoxins, Foodborne Diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Barracuda, Animals, Humans, Medicine, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, biology, business.industry, Lutjanus griseus, Ciguatera Poisoning, Tropical disease, General Medicine, Middle Aged, biology.organism_classification, medicine.disease, 3. Good health, Fishery, Caribbean Region, Acute Disease, Female, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Fishes, Poisonous
Abstract: BACKGROUND: Ciguatera fish poisoning (CFP) is a food-borne illness due to the consumption of reef fish containing pathogenic toxins. CFP is endemic to tropical areas and may be described in travelers in non-endemic areas. METHODS: We describe two clusters of autochthonous cases of CFP in Paris, France. They were related to two fish caught in Guadeloupe (French West Indies) and consumed in Paris after being air-transported in a cooler. In both cases, fish flesh was analyzed and the presence of ciguatoxins by mouse bioassay (MBA) was confirmed. RESULTS: The first cluster involved eight individuals among whom five presented gastrointestinal symptoms and four presented neurological symptoms after consuming barracuda flesh (Sphyraena barracuda). The second cluster involved a couple who consumed a grey snapper (Lutjanus griseus). Most of them consulted at different emergency departments in the region of Paris. CONCLUSIONS: CFP may be seen in non-traveler patients outside endemic countries resulting from imported species of fish. Thus, CFP may be undiagnosed as physicians are not aware of this tropical disease outside endemic countries. The detection of ciguatoxins by MBA in the French National Reference Laboratory is useful in the confirmation of the diagnosis. Language: en
Published: 2014
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129. Erratum to 'Predominance of healthcare-associated cases among episodes of community-onset bacteraemia due to extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae' [International Journal of Antimicrobial Agents 49/1 67-73]

Author: Jean-Ralph Zahar, Philippe Lesprit, Stephane Ruckly, Aurelia Eden, Hitoto Hikombo, Louis Bernard, Stephan Harbarth, Jean-Francois Timsit, Christian Brun-Buisson, Jean Carlet, Pierre Dellamonica, Remy Gauzit, Christian Rabaud, Serge Alfandari, Robert Cohen, Bruno Coignard, Celine Pulcini, Jerome Robert, Nejla Aissa, Alain Losniewski, Sandrine Henard, Cecile Janssen, Leonardo Pagani, Stephane Bland, Jacques Gaillat, Jean Pierre Bru, Pierre Bonnin, Gaelle Clavere, Virginie Vitrat, Laurence Maulin, Luc Quarsaet, Helene Roger, Jean-Baptiste Euzen, Eric Denes, Elodie Couve-Daecon, Catherine Lechiche, Jean-Philippe Lavigne, Veronique Mondain, Veronique Garnier, Dorothee Lambert, Maxime Hentzien, Yohan Nguyen, Jean Paul Talarmin, Pascaline Rameau, Francoise Geffroy, Arnaud Salmon-Rousseau, Vincent Cattoir, Antoine Froissart, Said Aberrane, Laurence Legout, France Roblot, Guillaume Beraud, Patricia Pavese, Olivier Belmonte, Nicolas Traversier, Laurent Bellec, Marie Lagrange-Xelot, Marie-Pierre Moiton, Barbara Kuli, Pascal Longuet, Agnes Scanvic, Lea Colombain, Milagros Ferreyra, Maxime Jean, Etienne Laurens, Matthieu Saada, Hugues Aumaitre, Martine Malet, Frederique Roustant, Vincent LeMoing, Jean-Pierre Helene, Jonathan Theodore, Caroline Garandeau, Jocelyne Caillon, Benjamin Olivero, David Boutoille, Didier Lepelletier, Lucia Grandiere-Perez, Aurelie Beaudron, Celine Ramanantsoa, Catherine Varache, Nicolas Varache, Nicolas Crochette, Hikombo Hitoto, Sophie Blanchi, Pascale Penn, Bernard Louis, Dominique Vanjak, Marie-Christine Escande, Rene-Gilles Patrigeon, Stephanie Honore, Audrey Barrelet, Marlene Amara, Jean-Marc Galempoix, Jean-Claude Reveil, Patricia Bucchiotty, Carine Couzigou, Alban LeMonnier, Emilie Boidin, Stephane Sire, Nelly Luizy, Caroline Bronstain, Carolina Fankhauser, Caroline Brossier, Elodie von Dach, Colette Sauve, Marie-Noelle Adam, Laurent Hocqueloux, Laurent Bret, Marie-Helene Andre, Regine Barruet, Marion Challier, Andre Cabie, Benoit Roze, Patrick Plesiat, Katy Jeanot, Isabelle Patry, Josephine Moreau, Catherine Chirouze, Aaron Laurent, Marie-Nadege Bachelier, Guillaume Kac, Nicolas Farthouat, Nicolas Feuillebois, Thomas Guimard, Sandra Bourdon, Sophie Nguyen, Houcine Bentayeb, Mari-Therese Albertini, Bruno Marchou, Noemie Gaudre, Damien Dubois, Christelle Guillet-Caruba, Florence Doucet Populaire, Nicolas Fortineau, Leila Escaut, Vincent Fihman, Josette Raymond, Solene Kerneis, Veronique Leflon-Guibout, Agnes Lefort, Aurelien Dinh, Anne-Laure Roux, Sophie Abgrall, Francoise Jaureguy, Jean-Christophe Lucet, Nathalie Soismier, Amanda Lopes, Emmanuelle Cambau, Veronique Manceron, Guilene Barnaud, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Foch [Suresnes], Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Service d'Infectiologie et des maladies infectieuses et tropicales [CH Le Mans] | Infectious and tropical disease department [Le Mans hospital], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Prévention et contrôle des infections (PCI ), Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service des maladies infectieuses, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-University Hospital, Hôpital Cochin [AP-HP], Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Réseau Antibiolor, Stress, Immunité, Pathogènes (SIMPA), Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Tourcoing, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Bactériologie [CHU Nancy], Institute for Computational Modeling in Civil Engineering, Technische Universität Braunschweig = Technical University of Braunschweig [Braunschweig], Imperial College London, Service des Maladies Infectieuses, Centre Hospitalier de la Région d'Annecy (Pringy), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], CHU Limoges, Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CH Cornouaille, Plateforme imagerie et cytométrie (PFIC), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service NEUROSPIN (NEUROSPIN), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694 (METRICS), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institute of New Imaging Technologies (INIT), Universitat Jaume I, Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion), Unité des maladies infectieuses, Hôpital Bichat - Claude Bernard, CHU Pontchaillou [Rennes], Laboratoire Cliniques Pathologique et Interculturelle (LCPI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), SAD Paysage (SAD Paysage), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Service des maladies infectieuses CHU Perpignan, Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Département de Chimie Moléculaire (DCM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Thérapeutiques cliniques et expérimentales des infections (EA 3826) (EA 3826), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre de Recherche en Ingénierie financière et finance Publique (CRIFP), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de bactériologie et hygiène hospitalière [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie (CRO2), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier de Charleville-Mezières, Université de Bordeaux (UB), Institut de Recherche Dupuy de Lôme (IRDL), École Nationale d'Ingénieurs de Brest (ENIB)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Cell Biology, Sciences III, Université de Genève = University of Geneva (UNIGE), Université Laval [Québec] (ULaval), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], CHU Fort de France-CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France], Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) (API), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Institut de l'élevage (IDELE), Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Service des maladies infectieuses et tropicales, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire d'Informatique de l'Université du Mans (LIUM), Le Mans Université (UM), Physiopathologie de l'Endothelium, Vascular research center of Marseille (VRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Université de Sherbrooke (UdeS), Centre hospitalier universitaire de Tourcoing, Homéostasie Cellulaire et Pathologies (HCP), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Laboratoire Montpelliérain d'Économie Théorique et Appliquée (LAMETA), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Faculty of Mathematics, Informatics, and Mechanics [Warsaw] (MIMUW), University of Warsaw (UW), Service de Microbiologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Services des maladies infectieuses, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Raymond Poincaré [AP-HP], Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble (IPAG), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Département de Médecine interne [Lariboisière], Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Emergence de la résistance bactérienne in vivo (EA3964), AP-HP Groupe Hospitalier Lariboisière, Laboratoire d'ethnologie et de sociologie comparative (LESC), Université Paris Nanterre (UPN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Equipe mobile d'infectiologie, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service Microbiologie-Hygiène Hospitalière, Institut franco-allemand de recherche de Saint-Louis, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Unité d’Otologie, implants auditifs et chirurgie de la base du crâne [CHU Pitié-Salpêtrière], Service d'Oto-Rhino-Laryngologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), CHU Toulouse [Toulouse], Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Epidémiologie pronostique des cancers et affections graves, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Infection Control Programme and WHO Collaborating Centre on Patient Safety, CHU Cochin [AP-HP], Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA), Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Technische Universität Braunschweig [Braunschweig], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Génie Informatique et Ingénierie de Production (LGI2P), IMT - MINES ALES (IMT - MINES ALES), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Service d'Otologie, Implants auditifs et Chirurgie de la base du crâne [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Santé publique : épidémiologie et qualité des soins-EA 2694 (CERIM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Université de Bretagne Sud (UBS)-Université de Brest (UBO)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Geneva [Switzerland], Université Laval, Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon), Institut de l'Elevage, Laboratoire Chrono-environnement - UFC (UMR 6249) (LCE), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Saint-Jacques, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Université de Sherbrooke [Sherbrooke], Hôpital Purpan [Toulouse], Université Montpellier 1 (UM1)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Faculty of Mathematics, Informatics, and Mechanics [Warsaw], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Avicenne-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris 13 (UP13), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Lariboisière, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université, Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Aix Marseille Université (AMU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Brest (UBO)-Université de Bretagne Sud (UBS), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), CHU Fort de France-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU de la Martinique [Fort de France], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes], Hôpital Beaujon [AP-HP], Cholley, Pascal, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure de Techniques Avancées Bretagne (ENSTA Bretagne)-Université de Bretagne Sud (UBS), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Nice-University Hospital, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Laboratoire de Physiologie des Invertébrés ( LPI ), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ), Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) ( LEMAR ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer ( IFREMER ) -Université de Brest ( UBO ) -Institut Universitaire Européen de la Mer ( IUEM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université de Brest ( UBO ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale ( SESSTIM ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -ORS PACA-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie ( IMPMC ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de recherche en astrophysique et planétologie ( IRAP ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Observatoire Midi-Pyrénées ( OMP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Equipe Poitevine de Recherche et d'Encadrement Doctoral en sciences criminelles de Poitiers ( EPRED ), Université de Poitiers, Laboratoire de Génie Informatique et Ingénierie de Production ( LGI2P ), IMT - Mines Alès Ecole Mines - Télécom ( IMT - MINES ALES ), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand ( LPC ), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS ( IN2P3 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU de Reims ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Plateforme imagerie et cytométrie ( PFIC ), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse ( AMMICa ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service NEUROSPIN ( NEUROSPIN ), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) ( DRF (CEA) ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, CHU de Poitiers, Santé publique : épidémiologie et qualité des soins-EA 2694 ( CERIM ), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Institute of New Imaging Technologies ( INIT ), Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion ( CHU La Réunion ), Laboratoire Cliniques Pathologique et Interculturelle ( LCPI ), Université Toulouse - Jean Jaurès ( UT2J ), SAD Paysage ( SAD Paysage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, VIH/SIDA et maladies associées, Université Montpellier 1 ( UM1 ), Département de Chimie Moléculaire ( DCM ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Thérapeutiques Cliniques et Expérimentales des Infections, Université de Nantes ( UN ), Centre de Recherche en Ingénierie financière et finance Publique ( CRIFP ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Centre de Recherches en Oncologie biologique et Oncopharmacologie ( CRO2 ), Aix Marseille Université ( AMU ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Bordeaux ( UB ), Laboratoire Environnement Géomécanique et Ouvrages ( LAEGO ), Institut National Polytechnique de Lorraine ( INPL ), Institut de Recherche Dupuy de Lôme ( IRDL ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -ENSTA Bretagne-Université de Brest ( UBO ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens ( SYSTEM ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), CHU de la Martinique-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], CHU Fort de France-CHU de la Martinique-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique, Agents pathogènes et inflammation - UFC (EA 4266) ( API ), Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Saint-Jacques, Laboratoire d'Informatique de l'Université du Mans ( LIUM ), Le Mans Université ( UM ), Vascular research center of Marseille ( VRCM ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou, Homéostasie Cellulaire et Pathologies ( HCP ), Université de Limoges ( UNILIM ) -CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ), Hôpital Purpan - Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Toulouse, Laboratoire Montpelliérain d'Économie Théorique et Appliquée ( LAMETA ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), University of Warsaw ( UW ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP Hôpital Raymond Poincaré [Garches], Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble ( IPAG ), Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble ( OSUG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut national des sciences de l'Univers ( INSU - CNRS ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Avicenne-Université Paris 13 ( UP13 ), Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Lariboisière, Emergence de la résistance bactérienne in vivo ( EA3964 ), Laboratoire d'ethnologie et de sociologie comparative ( LESC ), Université Paris Nanterre ( UPN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ), Hopital Necker-Enfants Malades, Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Université de Limoges (UNILIM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-CHU Limoges, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)
Subjects: Microbiology (medical), 0303 health sciences, medicine.medical_specialty, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, biology, 030306 microbiology, business.industry, General Medicine, biology.organism_classification, Antimicrobial, Enterobacteriaceae, 3. Good health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, Healthcare associated, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Intensive care medicine, business, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Community onset
Abstract: International audience
Published: 2017
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130. Predictors of complications of snake envenomation in Cayenne, French Guiana, 2007-2015

Author: Maylis Douine, Mathieu Nacher, Gérald Egmann, R. Mutricy, Stéphanie Houcke, Loïc Epelboin, Antoine Adenis, Christian Marty, Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Service d’Accueil des Urgences/SAMU/SMUR [Cayenne, Guyane Fraçaise], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Croix-rouge française [Cayenne, Guyane Fraçaise], Unité de Soins Intensifs [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), and Funding was provided by Ministère des Affaires Sociales et de la Santé (Grant No. Bourse année recherche 2015/2016).
Subjects: medicine.medical_specialty, Cayenne, Pain medicine, 030231 tropical medicine, Snake Bites, Critical Care and Intensive Care Medicine, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Anesthesiology, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, computer.programming_language, Snake envenomation, business.industry, Anatomy, medicine.disease, Snake bites, French Guiana, 3. Good health, Emergency medicine, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, business, computer
Abstract: International audience
Published: 2017
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131. Hépatites virales B - Delta et C dans les centres délocalisés de prévention et de soins (CPDS) de Guyane française

Author: Gaillet, M, Brousse, P, Guarmit, B, Adriouch, L, Schaub, Roxane, Naldjinan-Kodbaye, R, Carrera, C, Lormée, N, Simon, T, Aubry, Y, Epelboin, Loïc, Martin, E, Bidaud, B, Niemetzky, F, Djossou, Félix, Mosnier, Emilie, Latour, Marie, Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), and Université de Guyane (UG)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

132. Poverty and arbovirus outbreaks: when chikungunya virus hits more precarious populations than dengue virus in French Guiana

Author: Maylis Douine, Félix Djossou, Mathieu Nacher, Loïc Epelboin, Timothée Bonifay, Clémence Bonnefoy, Benoit Hurpeau, Latour, Marie, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Département Etudes Diffusion [Cayenne], Institut National de la Statistique et Etudes Economiques de Guyanne (INSEE Guyane ), Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU de la Martinique [Fort de France]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Service de médecine interne et maladies tropicales, and CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Saint-André
Subjects: chikungunya, poverty, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, Population, Dengue virus, medicine.disease_cause, Arbovirus, Dengue fever, Zika virus, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, parasitic diseases, Major Article, Medicine, 030212 general & internal medicine, Chikungunya, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, education.field_of_study, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, biology, business.industry, 1. No poverty, Outbreak, virus diseases, Odds ratio, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, medicine.disease, biology.organism_classification, Virology, dengue, 3. Good health, French Guiana, precarity, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Oncology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Background Since 2013, 3 successive arbovirus outbreaks, dengue (DENV), chikungunya (CHIKV), and Zika virus, have occurred in French Guiana (FG). The primary objective of this study was to describe the socioeconomic indicators of the first patients infected with CHIKV during the outbreak of 2014. The secondary objective was to compare those patients with patient infected by DENV and with the local population. Methods A monocentric, retrospective, case-control study was conducted in Cayenne hospital in FG comparing a group of patients infected with CHIKV in 2014 with a group infected with DENV in 2013. Children aged less than 15 years and pregnant women were excluded. Results A total of 168 CHIKV patients were compared with 168 DENV patients. Factors associated with CHIKV were living in poor neighborhoods (82% vs 44%; odds ratio [OR], 5.81; 95% confidence interval [CI], 3.35–10.2), having a precarious status (54% vs 33%; OR, 2.37; 95% CI, 1.49–3.78), and being born abroad (70% vs 35%; OR, 4.35; 95% CI, 2.69–7.06). Conclusions The present results suggest that early in the epidemic, the populations most at risk for CHIKV infection were the most socially vulnerable populations in the poorest neighborhoods, whereas DENV appeared to have affected a richer population and richer areas.
Published: 2017
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133. Zika virus: An updated review of competent or naturally infected mosquitoes

Author: Yanouk Epelboin, Stanislas Talaga, Loïc Epelboin, Isabelle Dusfour, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Université de Guyane (UG)
Subjects: RNA viruses, 0301 basic medicine, Viral Diseases, Physiology, Anopheles Gambiae, Anopheles gambiae, ved/biology.organism_classification_rank.species, Review, Disease Vectors, Pathology and Laboratory Medicine, Mosquitoes, Disease Outbreaks, Zika virus, 0302 clinical medicine, Aedes, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Medicine and Health Sciences, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, biology, Zika Virus Infection, lcsh:Public aspects of medicine, Eukaryota, Body Fluids, 3. Good health, Insects, Culex, Blood, Infectious Diseases, Medical Microbiology, Arboviral Infections, Viral Pathogens, Viruses, Microcephaly, Mansonia uniformis, Pathogens, Viral Vectors, Anatomy, Aedes albopictus, lcsh:Arctic medicine. Tropical medicine, Arthropoda, lcsh:RC955-962, 030231 tropical medicine, education, Lutzia, Mosquito Vectors, Aedes aegypti, Aedes Aegypti, Microbiology, Arbovirus, 03 medical and health sciences, Virology, Anopheles, parasitic diseases, medicine, Animals, Humans, Saliva, Microbial Pathogens, Flaviviruses, ved/biology, fungi, Organisms, Public Health, Environmental and Occupational Health, Biology and Life Sciences, lcsh:RA1-1270, Zika Virus, medicine.disease, biology.organism_classification, Invertebrates, Culex quinquefasciatus, Insect Vectors, Vector-Borne Diseases, Species Interactions, 030104 developmental biology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Americas, Viral Transmission and Infection
Abstract: Zika virus (ZIKV) is an arthropod-borne virus (arbovirus) that recently caused outbreaks in the Americas. Over the past 60 years, this virus has been observed circulating among African, Asian, and Pacific Island populations, but little attention has been paid by the scientific community until the discovery that large-scale urban ZIKV outbreaks were associated with neurological complications such as microcephaly and several other neurological malformations in fetuses and newborns. This paper is a systematic review intended to list all mosquito species studied for ZIKV infection or for their vector competence. We discuss whether studies on ZIKV vectors have brought enough evidence to formally exclude other mosquitoes than Aedes species (and particularly Aedes aegypti) to be ZIKV vectors. From 1952 to August 15, 2017, ZIKV has been studied in 53 mosquito species, including 6 Anopheles, 26 Aedes, 11 Culex, 2 Lutzia, 3 Coquillettidia, 2 Mansonia, 2 Eretmapodites, and 1 Uranotaenia. Among those, ZIKV was isolated from 16 different Aedes species. The only species other than Aedes genus for which ZIKV was isolated were Anopheles coustani, Anopheles gambiae, Culex perfuscus, and Mansonia uniformis. Vector competence assays were performed on 22 different mosquito species, including 13 Aedes, 7 Culex, and 2 Anopheles species with, as a result, the discovery that A. aegypti and Aedes albopictus were competent for ZIKV, as well as some other Aedes species, and that there was a controversy surrounding Culex quinquefasciatus competence. Although Culex, Anopheles, and most of Aedes species were generally observed to be refractory to ZIKV infection, other potential vectors transmitting ZIKV should be explored., Author summary The first isolation of Zika virus (ZIKV) in mosquitoes was made in 1948 in Aedes africanus. Over the next years, knowledge about ZIKV increased, with detection of the virus in primates, including humans and several other mosquito species. Most of these species were collected in Africa during arbovirus surveillance studies and belong to the genus Aedes, and today, 20 mosquito species have been identified that can be naturally infected by ZIKV. Although field studies are essential to have an overview of potential mosquito vectors of ZIKV during outbreaks or involved in the maintenance of the sylvatic cycle, laboratory studies are needed to assess the capacity of a species to transmit the virus to a new host. Since 2015, corresponding to the beginning of the outbreak in Brazil, vector competence studies have multiplied and confirmed that the mosquito A. aegypti, known to transmit dengue fever and chikungunya viruses, was also the main vector of ZIKV. This review aims to highlight the studies conducted from several laboratories about mosquito species naturally infected or tested for their vector competence for ZIKV.
Published: 2017
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134. Draft genome sequence of a human-associated isolate of Haloferax alexandrinus strain Arc-hr, an extremely halophilic archaea

Author: Didier Raoult, Saber Khelaifia, Aurelia Caputo, Félix Djossou, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicale, Centre Hospitalier de Cayenne, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), and Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Haloferax alexandrinus, genome sequence, Genomics, halophilic archaea, Microbiology, Genome, Halocin, lcsh:Infectious and parasitic diseases, 03 medical and health sciences, Nonribosomal peptide, genomics, lcsh:RC109-216, Gene, Whole genome sequencing, chemistry.chemical_classification, Genetics, Culturomics, 030102 biochemistry & molecular biology, biology, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, Infectious Diseases, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, chemistry, GC-content, Archaea
Abstract: International audience; We report the draft genome sequence of Haloferax alexandrinus strain Arc-hr (CSUR P798), isolated from the human gut of a 10-year-old Amazonian individual. Its 3 893 626 bp genome exhibits a 66.00% GC content. The genome of the strain Arc-hr contains 37 genes identified as ORFans, seven genes associated to halocin and 11 genes associated with polyketide synthases or nonribosomal peptide synthetases.
Published: 2017
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135. Predictors of antimalarial self-medication in illegal gold miners in French Guiana: a pathway towards artemisinin resistance

Author: Mathieu Nacher, Félix Djossou, Louise Hureau, Maylis Douine, Yassamine Lazrek, Stéphane Pelleau, R Chanlin, Magalie Demar, Lise Musset, Florine Corlin, S. Vreden, Helene Hiwat, Béatrice Volney, D. Blanchet, Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Laboratoires d'excellence - CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia - - CEBA2010 - ANR-10-LABX-0025 - LABX - VALID, European Funds for Regional Development (Feder), N° Presage 32078 - OrPal - 32078 - INCOMING, Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Malaria Program, Paramaribo, Suriname, Ministry of Health [Mozambique], Foundation for the Advancement of Scientific Research in Suriname [Paramaribo] (SWOS), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicale, Centre Hospitalier de Cayenne, Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH Guyane), This study was funded by European Funds for Regional Development (Feder), N° Presage 32078, benefited from funding from Santé Publique France (French Ministry of Health) and was supported by an 'Investissement d'Avenir' grant managed by Agence Nationale de la Recherche (CEBA, ref. ANR-10-LABX-25-01)., ANR-10-LABX-0025,CEBA,CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia(2010), European Project: 32078,OrPal, and Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR - laboratoire associé)
Subjects: Male, Cross-sectional study, Psychological intervention, Drug Resistance, Drug resistance, Self Medication, 0302 clinical medicine, Surveys and Questionnaires, Medicine, Mass Screening, Pharmacology (medical), 030212 general & internal medicine, Artemisinin, Malaria, Falciparum, Suriname, Traditional medicine, biology, Middle Aged, Artemisinins, 3. Good health, French Guiana, Infectious Diseases, Criminal Behavior, Female, medicine.drug, Self-medication, Microbiology (medical), Adult, Adolescent, 030231 tropical medicine, Plasmodium falciparum, Miners, 03 medical and health sciences, Antimalarials, Young Adult, Environmental health, parasitic diseases, Humans, Mass screening, Pharmacology, business.industry, biology.organism_classification, medicine.disease, Treatment Adherence and Compliance, Cross-Sectional Studies, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Gold, business, Malaria
Abstract: International audience; Background:Malaria is endemic in French Guiana (FG), South America. Despite the decrease in cases in the local population, illegal gold miners are very affected by malaria (22.3% of them carried Plasmodium spp.). Self-medication seems to be very common, but its modalities and associated factors have not been studied. The aim of this study was to evaluate parasite susceptibility to drugs and to document behaviours that could contribute to resistance selection in illegal gold miners.Methods:This multicentric cross-sectional study was conducted in resting sites along the FG-Surinamese border. Participating gold miners working in FG completed a questionnaire and provided a blood sample.Results:From January to June 2015, 421 illegal gold miners were included. Most were Brazilian (93.8%) and 70.5% were male. During the most recent malaria attack, 45.5% reported having been tested for malaria and 52.4% self-medicated, mainly with artemisinin derivatives (90%). Being in FG during the last malaria attack was the main factor associated with self-medication (adjusted OR = 22.1). This suggests that access to malaria diagnosis in FG is particularly difficult for Brazilian illegal gold miners. Treatment adherence was better for persons who reported being tested. None of the 32 samples with Plasmodium falciparum presented any mutation on the pfK13 gene, but one isolate showed a resistance profile to artemisinin derivatives in vitro.Conclusions:The risk factors for the selection of resistance are well known and this study showed that they are present in FG with persons who self-medicated with poor adherence. Interventions should be implemented among this specific population to avoid the emergence of artemisinin resistance.
Published: 2017
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136. Fatal case of chikungunya and concomitant thrombotic thrombocytopenic purpura in French Guiana during air flight medical evacuation

Author: Philippe Abboud, Paul Le Turnier, Bastien Bidaud, G. Walter, Félix Djossou, Loïc Epelboin, Stéphanie Houcke, Maïa Forgues, Guillaume Vesin, Emilie Mosnier, Gérald Egmann, Alain Stepanian, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de médecine interne et maladies tropicales, and CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Saint-André
Subjects: Adult, Thrombotic microangiopathy, Aircraft, viruses, 030231 tropical medicine, Thrombotic thrombocytopenic purpura, macromolecular substances, medicine.disease_cause, Arbovirus, Dengue fever, Diagnosis, Differential, 03 medical and health sciences, Fatal Outcome, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, hemic and lymphatic diseases, Humans, Medicine, 030212 general & internal medicine, Chikungunya, thrombotic thrombocytopenic purpura, Travel, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, Purpura, Thrombotic Thrombocytopenic, business.industry, Congo-Crimean Hemorrhagic Fever, virus diseases, General Medicine, medicine.disease, ADAMTS13, 3. Good health, thrombotic microangiopathy, French Guiana, arbovirus, Concomitant, Immunology, medical evacuation, Chikungunya Fever, in-flight medical emergency, Female, business, Chikungunya virus
Abstract: International audience; Thrombotic thrombocytopenic purpura (TTP) is a thrombotic microangiopathy associated to severe ADAMTS13 deficiency. It has been linked to various viral infections. Among arboviruses, only Crimean-Congo haemorrhagic fever and dengue fever have been linked to this severe disease. We report the first documented case of TTP concomitant to Chikungunya virus infection.
Published: 2017
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137. Clinico-biological characteristics of an emerging arbovirus: the Mayaro virus. A retrospective study in French Guiana 2003–2016

Author: Mutricy, R., Epelboin, Loïc, Mosnier, Emilie, Matheus, S, Djossou, Félix, Rousset, D, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Guyane (UG), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2017

138. In Vitro Sensitivity of Cutaneous Leishmania Promastigote Isolates Circulating in French Guiana to a Set of Drugs

Author: Simon, Stéphane, Nacher, Mathieu, Demar, Magalie, Carme, Bernard, Couppié, Pierre, Scotto, Camille Inès, Burger, Pauline, Khodjet el Khil, Mehdi, Ginouves, Marine, Prévôt, Ghislaine, Blanchet, Denis, Delprete, Piero, Fernandez, Xavier, Groupement de Recherche Eau, Sol, Environnement (GRESE), Université de Limoges (UNILIM), Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Epidémiologie des parasitoses et mycoses tropicales, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Institut de Chimie de Nice (ICN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Tissus animaux, nutrition, digestion, écosystème et métabolisme (TANDEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-INP. Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de Référence Leishmania [Cayenne, Guyanne Française] (Laboratoire Associé), Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Guyanais de Dermatologie Tropicale, E.A. 2188, This work was supported by the University of French Guiana and the Ministère Français de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique, the Conseil Régional de la Guyane and the European Union (FEDER-Presage N° 31454), and the 'Investissement d’Avenir' grant managed by Agence Nationale de la Recherche (CEBA, ref. ANR-10-LABX-25-01)., ANR-10-LABX-0025,CEBA,CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia(2010), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT], Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, Laboratoires d'excellence - CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia - - CEBA2010 - ANR-10-LABX-0025 - LABX - VALID, Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA)-Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière]
Subjects: 0301 basic medicine, Meglumine antimoniate, 030231 tropical medicine, 030106 microbiology, Paromomycin, Drug resistance, Pharmacology, Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Virology, Amphotericin B, parasitic diseases, medicine, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Miltefosine, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], Leishmaniasis, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, medicine.disease, biology.organism_classification, Leishmania braziliensis, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Parasitology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, medicine.drug, Pentamidine
Abstract: International audience; Anti-leishmaniasis drug resistance is a common problem worldwide. The aim of this study was to inventory the general in vitro level of sensitivity of Leishmania isolates circulating in French Guiana and to highlight potential in vitro pentamidine-resistant isolates. This sensitivity study was conducted on 36 patient-promastigote isolates for seven drugs (amphotericin B, azithromycin, fluconazole, meglumine antimoniate, miltefosine, paromomycin, and pentamidine) using the Cell Counting Kit-8 viability test. The IC50 values obtained were heterogeneous. One isolate exhibited high IC50 values for almost all drugs tested. Pentamidine, which is the first-line treatment in French Guiana, showed efficacy at very low doses (mean of 0.0038 μg/mL). The concordance of the in vitro pentamidine results with the patients' clinical outcomes was 94% (K = 0.82).
Published: 2016
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139. Culture of previously uncultured members of the human gut microbiota by culturomics

Author: Félix Djossou, Ndeye Mery Dia Badiane, M. Mailhe, Sory Ibrahima Traore, Donia Mouelhi, Sara Bellali, Camille Valles, Muhammad Yasir, Didier Raoult, Aurelia Caputo, Bernard La Scola, Frédéric Cadoret, Jean-Marc Rolain, Matthieu Million, Jônatas Santos Abrahão, Esam I. Azhar, Dipankar Bachar, Grégory Dubourg, El hadji Seck, Jeremy Delerce, Khoudia Diop, Aldiouma Diallo, Fehmida Bibi, E. Guilhot, Guillaume André Durand, Cheikh Sokhna, S. Ndongo, Melhem Bilen, Amadou Hamidou Togo, Perrine Hugon, D. Ricaboni, Fadi Bittar, Véronique Vitton, Catherine Robert, Anthony Levasseur, Jean-Christophe Lagier, Saber Khelaifia, Didier Musso, Niokhor Dione, Gaël Mourembou, Nadim Cassir, Maryam Tidjani Alou, Pierre-Edouard Fournier, Nicole Prisca Makaya Dangui Nieko, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Centre de recherche en éducation de Nantes (CREN), Le Mans Université (UM)-Université de Nantes - UFR Lettres et Langages (UFRLL), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Ecole Doctorale Régionale d’Afrique Centrale, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses Tropicales Emergentes (URMITE), Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille (CRN2M), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Gastroentérologie, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital Nord [CHU - APHM], INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Université de Nantes - UFR Lettres et Langages (UFRLL), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Le Mans Université (UM)
Subjects: 0301 basic medicine, Microbiology (medical), DNA, Bacterial, Microbiological Techniques, 030106 microbiology, Immunology, Computational biology, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, DNA, Ribosomal, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, RNA, Ribosomal, 16S, Genetics, Humans, Microbiome, biology, Bacteria, Microbiota, Gastrointestinal Microbiome, Human microbiome, Cell Biology, Sequence Analysis, DNA, Ribosomal RNA, biology.organism_classification, Archaea, Gastrointestinal Tract, DNA, Archaeal, Culturomics, Metagenomics, Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Proteobacteria
Abstract: Metagenomics revolutionized the understanding of the relations among the human microbiome, health and diseases, but generated a countless number of sequences that have not been assigned to a known microorganism1. The pure culture of prokaryotes, neglected in recent decades, remains essential to elucidating the role of these organisms2. We recently introduced microbial culturomics, a culturing approach that uses multiple culture conditions and matrix-assisted laser desorption/ionization–time of flight and 16S rRNA for identification2. Here, we have selected the best culture conditions to increase the number of studied samples and have applied new protocols (fresh-sample inoculation; detection of microcolonies and specific cultures of Proteobacteria and microaerophilic and halophilic prokaryotes) to address the weaknesses of the previous studies3–5. We identified 1,057 prokaryotic species, thereby adding 531 species to the human gut repertoire: 146 bacteria known in humans but not in the gut, 187 bacteria and 1 archaea not previously isolated in humans, and 197 potentially new species. Genome sequencing was performed on the new species. By comparing the results of the metagenomic and culturomic analyses, we show that the use of culturomics allows the culture of organisms corresponding to sequences previously not assigned. Altogether, culturomics doubles the number of species isolated at least once from the human gut. Optimization of culturing techniques has allowed the identification of 1,057 prokaryotic species within the human gut microbiome repertoire, doubling the previous number of isolated species from the human gut.
Published: 2016
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140. Bon usage des antibiotiques : quoi de neuf ?

Author: Castan, B., Lesprit, P., Alfandari, S., Bonnet, E., Diamantis, S., Gauzit, R., Kernéis, S., Leroy, J., Lescure, F. X., Mondain, V., Pavese, P., Rabaud, C., Stahl, J. P., Tattevin, P., Roblot, F., Pulcini, C., Centre hospitalier de Castelluccio (Ajaccio) (CHD Castelluccio), Hôpital Foch [Suresnes], Centre Hospitalier de Tourcoing, Hôpital Joseph Ducuing, Centre Hospitalier de Melun, Service de réanimation médicale polyvalente [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biostatistique, Biomathématique, Pharmacoépidémiologie et Maladies Infectieuses (B2PHI), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpitaux Universitaires de Besançon, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Unité des Maladies Infectieuses [CHU Grenoble-Alpes], Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Fédération française d'infectiologie, Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Fonction, structure et inactivation d'ARN bactériens, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Médecine interne [ Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Pharmacologie des anti-infectieux (PHAR), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Maladies chroniques, santé perçue, et processus d'adaptation (APEMAC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université de Lorraine (UL), Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy], and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)
Subjects: Antimicrobial Stewardship, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, International Cooperation, Practice Guidelines as Topic, France, Societies, Medical
Abstract: National audience; À l’occasion de la journée européenne des antibiotiques et de la semaine mondiale sur les antibiotiques, la SPILF a publié, en 2015 un point sur les nouveautés en matière de programmes de bon usage des antibiotiques. Ce nouvel éditorial publié à l’occasion de la journée 2016 veut s’inscrire dans cette même tradition.
Published: 2016
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141. Direct-acting antiviral treatment against hepatitis C virus infection in HIV-Infected patients - 'En route for eradication'?

Author: P. Geneau de Lamarlière, F. Daoud, C. Etienne, Pascal Pugliese, Thomas Huleux, N. Oran, C. Guglielminotti, V. Le Moing, L. Larmet, J.M. Jacquet, P. Delobel, D. Lebrun, Olivier Lortholary, S. Gallie, Elisabeth Botelho-Nevers, E. de Mautort, T. Jovelin, A.S. Ritleng, S. Ferrando, G. Dos Santos, V. Corbin, C. Lions, S. Bouchez, C. Jacomet, V. Guéripel, A. Foltzer, T.H. Huleux, J. Cottalorda, M. Besnier, O. Baud, E. Puntis, Martine Valette, D. Lebeaux, I. Poizot-Martin, M. Ouka, M.J. Soavi, G. Cessot, C. Duvivier, M. Priester, D. Rey, I. Kmiec, B. Henry, Marc-Antoine Valantin, Florence Ader, M.L. Casanova, M. Marcel, F. Touam, David Rey, H. Hüe, S. Degroodt, B. Riff, N. Atoui, D. Garipuy, C. Brochier, Christine Jacomet, Ch. Allienne, C. Aumeran, Nathalie B. Viget, Pierre Pradat, R. Ouissa, M.A. Valantin, S. Brégigeon, S. Pineau, I. Jacquet, Y. N'Guyen, B. Rozé, A. Joulie, L. Hustache-Mathieu, P. Morineau, O. Aubry, Sylvie Pillet, J. Reynes, E. Rosenthal, C. Psomas, Claudine Duvivier, M. Mularczyk, Thomas Perpoint, A. Montoya-Ferrer, V. Baclet, V. Faucherre, Amandine Gagneux-Brunon, F. Ajana, E. Billaud, J. Durant, C. Cheneau, A. Rodallec, Christine Katlama, M. Porte, Bruno Hoen, Olivier Lesens, A. Debard, F. Bani-Sadr, Ph. Choisy, Jacques Reynes, S. Casanova, L. Fagour, S. Pierre-François, S. Sausse, Clotilde Allavena, C. Blanco-Betancourt, I. Schlienger, O. Faucher, C. Bernaud, André Boibieux, C. Migault, H. Laurichesse, C. Merle De Boever, Laurent Cotte, Eric Billaud, Caroline Charlier, E. Cua, Christian Chidiac, M.C. Thiebaut-Drobacheff, J. Lippmann, V. Gendrin, Catherine Chirouze, E. Ressiot, E. Demonchy, K. Risso, V. Rio, Isabelle Poizot-Martin, Patrick Miailhes, H. Laroche, François Raffi, I. Lamaury, M. Pircher, A. Gergely, C. Brunet, I. Perbost, Lise Cuzin, H. Melliez, M.F. Lutz, C. Debreux, C. Augustin-Normand, Antoine Cheret, Guillaume Martin-Blondel, N. Hall, M.L. Batard, Th. Huleux, A. Galinier, J.L. Berger, B. Marchou, C. Fourcade, Frédéric Lucht, Firouzé Bani-Sadr, B. Bonnet, E. Aissi, I. Lepain, D. Boutoille, M. Partisani, P. Fischer, André Cabié, C. Ceppi, Céline Cazorla, M.J. Ducassou, R. Césaire, M. Carta, C. Bernard-Henry, Rodolphe Garraffo, A. Cabié, L. Cuzin, N. Mrozek, Evelyne Braun, F. Bozon, A. De Monte, I. Alcaraz, C. Biron, C. Louisin, Claire Aguilar, C. Delpierre, A. Ivanova, V. Mondain, M. Hentzien, Paul-Henri Consigny, P. Point, K. Saune, C. Rouger, J.G. Fuzibet, J. Koffi, Anne Frésard, C. Longuet, E. André-Garnier, S. Wehrlen-Pugliese, M. Alvarez, M Orticoni, B. Hoen, N. Biezunski, A. Naqvi, Tristan Ferry, B. Prouvost-Keller, A. Frésard, V. Reliquet, P.M. Roger, J. Courjon, F. Biron, R. Agher, M. Vidal, C. Rouzaud, F. Najioullah, A. Meybeck, D. Lambert, L. Cotte, Fanny Lanternier, Alain Makinson, S. Vandame, Laurent Hustache-Mathieu, D. Coban, S. Abel, P. Dellamonica, V. Obry-Roguet, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing], Centre Hospitalier Tourcoing, Service de Maladies Infectieuses [Nice], Service d'immuno-hématologie clinique (CISIH), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques er émergentes (TransVIHMI), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service des maladies infectieuses [Nantes], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U912 INSERM - Aix Marseille Univ - IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Coordination régionale de la lutte contre le virus de l’immunodéficience humaine ( COREVIH [Toulouse]), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses (TransVIHMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Universtié Yaoundé 1 [Cameroun]-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), CHU Clermont-Ferrand, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Infection à VIH, réservoirs, diversité génétique et résistance aux antirétroviraux (ARV) (EA 7327), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), service de maladies infectieuses CHU J Minjoz Besancon, Hôpital Jean Minjoz, Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [Point-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de la Martinique [Fort de France]-Université des Antilles (UA), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Maladies infectieuses et tropicales dans la Caraïbe (MAITC EA 4537), roussel, pascale, Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut Pasteur [Paris], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Université des Antilles (UA)-CHU de la Martinique [Fort de France], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Subjects: Male, Epidemiology, Hepacivirus, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, 030212 general & internal medicine, Chronic, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, biology, Coinfection, Incidence (epidemiology), virus diseases, Hepatitis C, Middle Aged, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Treatment Outcome, Cohort, HCV, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, France, Antibody, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, Genotype, Hepatitis C virus, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Treatment uptake, medicine, Humans, Direct acting antiviral agent, DAA, business.industry, HIV, Hepatitis C Antibodies, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, biology.organism_classification, digestive system diseases, Immunology, biology.protein, business
Abstract: International audience; Direct-Acting Antivirals (DAAs) opened a new era in HCV treatment. We report the impact of HCV treatment in French HIV-HCV coinfected patients. METHODS: All HIV-HCV patients from the Dat'AIDS cohort followed between 2012 and 2015 were included. HCV status was defined yearly as naive, spontaneous cure, sustained virological response (SVR12), failure or reinfection. RESULTS: Among 32,945 HIV-infected patients, 15.2% were positive for anti-HCV antibodies. From 2012 to 2015, HCV incidence rate increased from 0.35%PY to 0.69%PY in MSM, while median incidence was 0.08%PY in other patients. Median reinfection rate was 2.56%PY in MSM and 0.22%PY in other patients. HCV treatment initiation rate rose from 8.2% in 2012 to 29.6% (48.0% in pre-treated patients vs 22.6% in naïve patients). SVR12 rate increased from 68.7% to 95.2%. By the end of 2015, 62.7% of the patients were cured either spontaneously or following SVR. CONCLUSIONS: HCV treatment dramatically increased in HIV-HCV patients in France from 2012 to 2015 resulting in HCV cure in nearly two-thirds of the patients in this cohort. Combined with a declining HCV prevalence, the prevalence of active HCV infection among HIV patients will drastically decrease in the forthcoming years.
Published: 2016
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142. LES PERIPHERIES DE L’EPIDEMIE DE VIH EN GUYANE : PARTICULARITES DES ZONES ISOLEES

Author: Mosnier, Emilie, Epelboin, Loïc, Guiraud, Noé, Jacoud, E, Guarmit, B, Auz, M, Fereira, C, Rhodes, S, Huber, F, Nacher, Mathieu, Adriouch, L, Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Groupement de Recherche en Économie Quantitative d'Aix-Marseille (GREQAM), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Développement Accompagnement Animation Coopération Guyane, Hôpital de Jour [Cayenne], Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine [Cayenne] (COREVIH), Le Corum Montpellier, Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, and École Centrale de Marseille (ECM)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU)
Subjects: [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: National audience; Introduction-objectifsBien que la prise en charge de personnes vivant avec le VIH (PVVIH) s’améliore globalement en Guyane, les disparités régionales et communautaires restent importantes. L’objectif est ici de décrire pour la première fois les caractéristiques épidémiologiques, spatiales et cliniques des PVVIH suivies en zones isolées. Matériels et MéthodesLes données présentées sont issues du suivi clinique réalisé en Centres Délocalisés de Prévention et de Soins (CDPS) de janvier 2014 à novembre 2015. Ces données ont été analysées et comparées aux données des PVVIH suivis dans les 3 centres hospitaliers de Guyane issues du logiciel Nadis®.Résultats 174 PVVIH ont étés pris en charge en CDPS et comparés à 2143 patients suivis sur le littoral. L’évolution du taux annuel de découvertes de séropositivité VIH montre une arrivée plus tardive mais particulièrement active en zones isolées par rapport au littoral, notamment chez les patients d’origine brésilienne (p
Published: 2016

143. HIV-1 Pol Gene Polymorphism and Antiretroviral Resistance Mutations in Treatment-Naive Adult Patients in French Guiana Between 2006 and 2012

Author: Anne Lavergne, Leila Adriouch, Félix Djossou, Myriam El Guedj, Mathieu Nacher, Vincent Lacoste, Alain Berlioz-Arthaud, Edith Darcissac, Pierre Couppié, Rachida Boukhari, Edouard Tanguy, Emmanuelle Papot, Vincent Vantilcke, Damien Donato, Jean-François Pouliquen, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais Franck Joly (Saint-Laurent-du-Maroni), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales [Cayenne, Guyanne Française], This work was funded by the Institut Pasteur de la Guyane. It has also benefited from a European commission REGPOT-CT-2011-285837-STRonGer grant within the FP7, The authors thank Nathalie Jolly from the Institut Pasteur Clinical Research Department (PIRC, Pôle Intégré de Recherche Clinique) for her help in the ethical aspects of the project. They also thank Ketty Bienvenu, Lidia Saint Louis, Sergine Soyon, and Karine Verin for their invaluable assistance., European Project: 285837,EC:FP7:REGPOT,FP7-REGPOT-2011-1,STRONGER(2011), Lacoste, Vincent, Strengthening transdisciplinary research on infectious and emerging diseases in French Guiana: linking fieldwork, benchside and bedside - STRONGER - - EC:FP7:REGPOT2011-11-01 - 2015-04-30 - 285837 - VALID, and CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, Drug resistance, MESH: Genotype, 0302 clinical medicine, MESH: HIV Protease/genetics, HIV Protease, MESH: HIV-1/growth & development, Polymorphism (computer science), Genotype, 030212 general & internal medicine, Genetics, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, MESH: Aged, MESH: HIV Infections/epidemiology, Molecular Epidemiology, MESH: Middle Aged, Incidence (epidemiology), MESH: HIV Infections/drug therapy, Middle Aged, Viral Load, MESH: HIV Infections/virology, MESH: HIV-1/genetics, HIV Reverse Transcriptase, 3. Good health, French Guiana, [SDV] Life Sciences [q-bio], MESH: HIV Protease Inhibitors/therapeutic use, Infectious Diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Reverse Transcriptase Inhibitors, Female, Viral load, Adult, MESH: French Guiana/epidemiology, Immunology, Biology, MESH: Reverse Transcriptase Inhibitors/therapeutic use, MESH: Drug Resistance, Viral/genetics, 03 medical and health sciences, MESH: Polymorphism, Genetic, MESH: Viral Load/drug effects, Acquired immunodeficiency syndrome (AIDS), Virology, Drug Resistance, Viral, medicine, Humans, MESH: Molecular Epidemiology, MESH: HIV Reverse Transcriptase/genetics, Aged, Retrospective Studies, Genetic diversity, Polymorphism, Genetic, MESH: Humans, Molecular epidemiology, MESH: Adult, MESH: Retrospective Studies, HIV Protease Inhibitors, medicine.disease, MESH: Male, 030104 developmental biology, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Mutation, HIV-1, MESH: Mutation, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, MESH: Female, MESH: HIV-1/drug effects
Abstract: International audience; Little information is available on the molecular epidemiologic profile of HIV-1 in French Guiana, the French department with the highest HIV/AIDS incidence. To follow the evolution of HIV-1 diversity, we carried out a molecular analysis of HIV-1 isolates from 305 treatment-naive patients between 2006 and 2012. Protease and reverse-transcriptase sequences were obtained for subtype characterization, polymorphism analysis, and identification of drug resistance mutations. Of 305 HIV-1 strains, 95.1% were subtype B viruses. The overall prevalence of transmitted drug-resistance mutations (TDRMs) was 4.6% (14/305), ranging from 1.9% to 7.1% depending on the year. This study shows a low level of HIV-1 genetic diversity and a moderate prevalence of TDRMs with no evidence of an increasing trend over the study period. Nevertheless, the strong genetic polymorphism observed on both genes may be of concern for long-term treatment of people living with HIV-1 and thus deserves continuous monitoring.
Published: 2016
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144. Zika emergence in the French Territories of America and description of first confirmed cases of Zika virus infection on Martinique, November 2015 to February 2016

Author: Elise, Daudens-Vaysse, Martine, Ledrans, Noellie, Gay, Vanessa, Ardillon, Sylvie, Cassadou, Fatiha, Najioullah, Isabelle, Leparc-Goffart, Dominique, Rousset, Cécile, Herrmann, Raymond, Cesaire, Marianne, Maquart, Olivier, Flusin, Séverine, Matheus, Patricia, Huc-Anaïs, Josiane, Jaubert, Anne, Criquet-Hayot, Bruno, Hoen, Felix, Djossou, Corinne, Locatelli-Jouans, Alain, Blateau, Anne-Marie, McKenzie, Mathilde, Melin, Patrick, Saint-Martin, Frédérique, Dorléans, Claudine, Suivant, Luisiane, Carvalho, Marion, Petit-Sinturel, Audrey, Andrieu, Harold, Noël, Alexandra, Septfons, Anne, Gallay, Marie-Claire, Paty, Laurent, Filleul, André, Cabié, Agence régionale de santé (ARS) de Martinique (ARS Martinique), Cellule Inter Régionale d'Epidémiologie des Antilles - Guyane, Institut de Veille Sanitaire (INVS), Laboratoire de Virologie-Immunologie, Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], French National Reference Centre for Arboviruses, Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Laboratoire d'Analyses Médicales, Clinique Saint Paul, URML Martinique, Dermatologie et Maladies infectieuses [Pointe-à-Pitre], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Centre de Gestion du Risque Infectieux Nosocomial [Pointe-à-Pitre] (CGRIN), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Agence Régionale de Santé Guyane (ARS Guyane), Agence Régionale de la Santé (ARS), Agence régionale de santé Guadeloupe (ARS), Cellule Inter Régionale d'Epidémiologie Océan Indien, the Zika Surveillance Working Group, ADENIS, ANTOINE, IRBA Armed Forces Biomedical Research Institute, Agence Régionale de Santé de Guyane, Institut National de Veille Sanitaire, Institut national de veille sanitaire, Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (UMR ASTRE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Cellule interrégionale d'épidémiologie Antilles-Guyane [CIRE], CIRE Antilles-Guyane - Gourbeyre, CHU de la Martinique [Fort de France], Unité de Virologie, Institut de Médecine Tropicale du Service de Santé des Armées, Institut pluridisciplinaire de recherche appliquée dans le domaine du génie pétrolier (IPRADDGP), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [Fort-de-France, Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique], Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Émergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Université de La Réunion (UR), Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Antenne Marseille] (IRBA), Université Henri Poincaré - Nancy 1 (UHP), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Cellule Interrégionale d'Epidémiologie Antilles-Guyane, Service de santé publique et d'épidémiologie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bicêtre, Cellule Interrégionale d'Epidémiologie, and CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)
Subjects: 0301 basic medicine, Pediatrics, Pathology, Epidemiology, vector-borne infections, location.country, medicine.disease_cause, Communicable Diseases, Emerging, Disease Outbreaks, Zika virus, Dengue fever, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Maculopapular rash, Medicine, 030212 general & internal medicine, Chikungunya, Guadeloupe, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, biology, Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction, Zika Virus Infection, Rash, French Guiana, 3. Good health, Population Surveillance, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, RNA, Viral, medicine.symptom, Martinique, medicine.medical_specialty, 030106 microbiology, 03 medical and health sciences, location, Zika, Virology, Humans, business.industry, Public Health, Environmental and Occupational Health, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Sequence Analysis, DNA, Zika Virus, biology.organism_classification, medicine.disease, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Martinique island, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business
Abstract: International audience; Following of the emergence of Zika virus in Brazil in 2015, an epidemiological surveillance system was quickly implemented in the French overseas Territories of America (FTA) according to previous experience with dengue and chikungunya and has detected first cases of Zika. General practitioners and medical microbiologists were invited to report all clinically suspectedcases of Zika, laboratory investigations were systematically conducted (RT-PCR). On 18 December, the first autochthonous case of Zika virus infection was confirmed by RT-PCR on French Guiana and Martinique, indicating introduction of Zika virus inFTA. The viral circulation of Zika virus was then also confirmed on Guadeloupe and Saint-Martin. We report here early findings on 203 confirmed cases of Zika virus infection identified by RT-PCR or seroneutralisation on Martinique Island between 24 November 2015 and 20 January 2016. All cases were investigated. Common clinical signs were observed (maculopapularrash, arthralgia, fever, myalgia and conjunctival hyperaemia) among these patients, but the rash, the foundation of our case definition, may be absent in a significant proportion of patients (16%). These results are important for the implementation of a suspected case definition, the main tool for epidemiological surveillance, in territories that may be affected by ZIKV emergence, including Europe.
Published: 2016
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145. Prevalence of Plasmodium spp. in illegal gold miners in French Guiana in 2015: a hidden but critical malaria reservoir

Author: Helene Hiwat, Frédérique Perotti, Antoine Adenis, Félix Djossou, Mathieu Nacher, Stephen Vreden, Magalie Demar, Florine Corlin, Paul Brousse, Maylis Douine, Stéphane Pelleau, Jérémie Pasquier, Louise Mutricy, Lise Musset, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR - laboratoire associé), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Stem cell and microenvironment laboratory, Weill Cornell Medicine [Qatar], Department Genetic Medicine, Corneil University-Weill Medical College of Cornell University [New York], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Direction Interarmées du Service de Santé en Guyane, Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Pharmacy, Centre Hospitalier de l’Ouest Guyanais, Saint Laurent du Maroni, France, Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais Franck Joly (Saint-Laurent-du-Maroni), Medical Mission, Academisch Ziekenhuis, Paramaribo Hospital, Medicine Department, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), funded by European Funds for Regional Development (Feder), N° Presage 32078 and the Institut Veille Sanitaire (French Ministry of Health), European Project: 32078,OrPal, CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Service d'Immunologie [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), ADENIS, ANTOINE, and European Funds for Regional Development (Feder), N° Presage 32078 - OrPal - 32078 - INCOMING
Subjects: Male, Plasmodium, Cross-sectional study, artemisinin resistance, Polymerase Chain Reaction, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Health care, Prevalence, 030212 general & internal medicine, Immunoassay, Microscopy, Rapid diagnostic test, education.field_of_study, Malaria reservoir, Ecology, Transmission (medicine), Illegal gold mining, Middle Aged, French Guiana, 3. Good health, Infectious Diseases, Geography, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Female, Adult, medicine.medical_specialty, 030231 tropical medicine, Population, Miners, 03 medical and health sciences, Environmental health, parasitic diseases, medicine, Humans, education, Diagnostic Tests, Routine, business.industry, Research, Public health, medicine.disease, Malaria, Cross-Sectional Studies, Guiana Shield, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Asymptomatic Diseases, Tropical medicine, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Parasitology, Gold, business
Abstract: International audience; BackgroundMalaria is endemic in French Guiana, an overseas territory of France on the Guiana Shield. Since 2005, notified malaria cases are decreasing. However, new data show that malaria affects many Brazilian gold miners working illegally in French Guiana, the majority of whom are not counted in official data. In addition, one major concern is the usual practice of improper self-treatment in this mining population, raising fear of the development of antimalarial resistance. This prospective study, conducted in 2015, aimed to estimate the prevalence of Plasmodium spp. in illegal gold miners working in French Guiana. MethodsThe recruitment of gold miners was carried out in resting sites along the French Guiana-Suriname border, where they go for supplies, medical care or leisure. After recording agreement, three malaria diagnostic methods were performed: rapid diagnostic test, microscopy and PCR,ResultsAmong 421 persons recruited in the study, malaria prevalence, detected by nested-PCR, was 22.3% (CI=[18.3-26.3], n=94/421) of which 84% were asymptomatic. ConclusionThis significant malaria reservoir in a mobile and illegal population with difficult access to a health care system raises the threat of artemisinin resistance and puts the population of the Guiana Shield at risk of new transmission foci while countries of the region aim at malaria elimination. Even though French legislation may hamper dealing with this population, France must face the reality of malaria in illegal gold miners in order to meet its commitment to malaria elimination.
Published: 2016
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146. TROP-15 - Importance du portage asymptomatique de plasmodies dans un quartier à transmission autochtone du paludisme en Guyane : enjeux pour une stratégie d’élimination

Author: Emilie Mosnier, R. Mutricy, B. Guarmit, C. Simonnet, S. Gauduchon, Paul Brousse, Lise Musset, F. Djossou, Maylis Douine, Stéphane Pelleau, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and ADENIS, ANTOINE
Subjects: 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, 030306 microbiology, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 030212 general & internal medicine
Abstract: National audience; Introduction Une fois le contrôle du paludisme atteint, les stratégies d’élimination s’imposent ciblant tout particulièrement les porteurs asymptomatiques de plasmodies. Ces parasitémies asymptomatiques posent des questions scientifiques,éthiques et opérationnelles complexes en terme de détection et de traitement tant sur le plan individuel que collectif. Afin de préciser la part de ces porteurs asymptomatiques en Guyane, nous avons réalisé une étude transversale, en période interépidémique, en population globale, dans un quartier à transmission régulière de paludisme dit autochtone afin d’en connaître la prévalence.
Published: 2016

147. PADS 2-07 - La leptospirose en Guyane française : 1re étude transversale multicentrique 2007-2014

Author: F. Djossou, Emilie Mosnier, Alain Berlioz-Arthaud, P. Le Turnier, Loïc Epelboin, Rachida Boukhari, Pascale Bourhy, Roxane Schaub, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG), Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais (CHOG), CHOG-Centre Hospitalier de l'Ouest Guyanais, Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Biologie des Spirochètes / Biology of Spirochetes, Institut Pasteur [Paris], ADENIS, ANTOINE, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], and Institut Pasteur [Paris] (IP)
Subjects: 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, 030306 microbiology, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 030212 general & internal medicine
Abstract: National audience; Introduction La leptospirose est une zoonose de répartition mondiale avec une incidence en augmentation. Elle représente un problème de santé publique en zone tropicale. L’objectif de notre étude était de faire un état des lieux de la leptospirose en Guyane Française afin d’en améliorer la prise en charge.
Published: 2016

148. TROP-14 - Attitudes et pratiques vis à vis du paludisme dans une communauté amérindienne de Guyane

Author: P. Pieter, Loïc Epelboin, Emilie Mosnier, S. Rhodes, O. Gaudin, R. Mutricy, Damien Davy, F. Djossou, Maylis Douine, Lise Musset, Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Développement Accompagnement Animation Coopération Guyane, Observatoire Hommes/Milieux 'Oyapock', Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), ADENIS, ANTOINE, Laboratoire Ecologie, Evolution, Interactions des Systèmes amazoniens (LEEISA), and Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 030306 microbiology, 030231 tropical medicine, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: National audience; Introduction Bien que le nombre de cas de paludisme soit en recul en Guyane des foyers touchant les populations autochtones persistent, particulièrement dans certaines zones isolées et frontalières. Afin d’améliorer les stratégies de contrôledu paludisme dans ces zones, nous avons chercher à mieux connaître les attitudes et pratiques vis à vis du paludisme auprès d’une de ces populations-clés.
Published: 2016

149. L’angiostrongylose humaine : une maladie tropicale négligée

Author: Louis Collet, Loïc Epelboin, Maxime Raz, Renaud Blondé, Nicolas Villemant, Denis Malvy, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Université de Guyane (UG), Laboratory of the Hospital Centre of Mayotte (CHM), Laboratory of the Hospital Centre of Mayotte, Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne - UFR Géographie (UP1 UFR08), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1), Epidémiologie et Biostatistique [Bordeaux], and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: biology, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030231 tropical medicine, Biochemistry (medical), biology.organism_classification, medicine.disease, Analytical Chemistry, Angiostrongylus cantonensis, 03 medical and health sciences, Medical Laboratory Technology, 0302 clinical medicine, Angiostrongyliasis, medicine, 030212 general & internal medicine, Humanities, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Resume L’angiostrongylose humaine ou angiostrongylose nerveuse est une maladie parasitaire rare liee a un nematode, Angiostrongylus cantonensis. L’homme est un hote accidentel et developpe une pathologie neurologique a type de meningite et/ou encephalite a eosinophiles d’evolution souvent favorable chez l’adulte mais parfois tres severe chez l‘enfant. Le diagnostic repose sur l’association de signes neurologiques avec une hypereosinophilie dans le LCR chez un individu vivant ou revenant d’une zone d’endemie. Le diagnostic microbiologique n’est pas toujours possible, et repose sur la serologie dans le sang voire dans le LCR, ou la sensibilite est meilleure, mais aussi sur la PCR dans le LCR disponible depuis quelques annees. Le traitement est mal codifie, et les formes severes justifient l’association d’une corticotherapie et d’albendazole. Si la maladie est cosmopolite dans les regions intertropicales, elle est particulierement frequente en Chine, a Taiwan, en Thailande et dans les iles du Pacifique. On l’a retrouve egalement de facon eparse dans des iles de l’Ocean Indien, mais aussi en Jamaique et au Bresil. Le mode de transmission est variable d’un lieu a l’autre. En Chine, en Thailande et dans l’Ocean Pacifique, la contamination se fait souvent via la consommation de crustaces mal cuits. Dans l’Ocean Indien, a Taiwan, au Bresil et a Hawai, le principal mode de contamination est l’ingestion par contact direct ou indirect de bave de l’escargot geant africain (Achatina fulica) : cette espece consideree comme invasive, est presente dans la plupart des regions intertropicales du globe. Les cliniciens et parasitologues doivent evoquer systematiquement cette etiologie devant un tableau de meningite a eosinophiles chez un patient retournant ou vivant en zone tropicale.
Published: 2016
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150. Spacial dynamics and social risk factor for AIDS in isolated area in French Guiana

Author: Mosnier, Emilie, Guiraud, Noé, Epelboin, Loïc, Huber, Florence, Adriouch, Leila, Guarmit, Basma, Djossou, Félix, Brousse, Paul, Terraz, Anne, Ville, Muriel, Adenis, Antoine, Nacher, Mathieu, Unité des Maladies Infectieuses et Tropicales (UMIT), Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Département des Centres Délocalisés de Prévention et de Soins, Ecosystemes Amazoniens et Pathologie Tropicale (EPat), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Guyane (UG), Groupement de Recherche en Économie Quantitative d'Aix-Marseille (GREQAM), École Centrale de Marseille (ECM)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Hôpital de Jour [Cayenne], Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH), Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane), Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] -CHU de Fort de France-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française], Centre d'Investigation Clinique Antilles Guyane, Inserm CIC1424, and École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Aix Marseille Université (AMU)-École Centrale de Marseille (ECM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, parasitic diseases, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: International audience; French Guiana, a French overseas department in South America, has been classified epidemic for HIV. The dynamics of the spread of the AIDS epidemic ranges according to the characteristics of each geographical region in different population groups. Isolated area in French Guiana have a vast diversity of population including maroon population, amerindians and migrants in particulary from Brazil, Surinam and Guyana. Isolated area in French Guiana is defined by all rural areas compared to urban area: Cayenne, Kourou and Saint Laurent du Maroni (Map 1). The aim of this study was to evaluate spacial and temporal trend of the AIDS epidemic among type of population on isolated area of French Guiana.
Published: 2016

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