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This document was prepared thanks to the collective expertappraisal, carried out by the Anses’expert group‘GECUCovid-19’(ANSES opinion 2020-SA-0037), chaired by Sophie Le Poder and whose members for the animal health component are cited in the authors.; International audience; In late December 2019, an outbreak of clustered cases of pneumonia associated with a novel coronavirus was reported by the Chinese authorities to the World Health Organization (WHO). Several initial confirmed cases were linked to a wetmarket selling live animals and seafood products in Wuhan(Hubei province), China (Huang et al.,2020). On 30 January 2020, the WHO declared the outbreak a Public Health Emergency of International Concern. On 11 February 2020, the causative pathogen was officially named Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), responsible for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) (DuToit, 2020). Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 is mainly transmitted from person to person, by direct or indirect contact, through infectious microdroplets emitted wheninfected individuals spit, sneeze or cough (Bernard Stoecklin et al.,2020). The massive circulation of this new pandemiccoronavirus with a probable zoonotic origin raised questions on its ability to spillover to animal species and on the potential consequences of such events on both animals and humans. This public health concern came to the attention of animal health authorities given the close contacts between humans and domestic animals. Therefore, in France, the French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety (ANSES) established an Emergency Collective Expert Appraisal Group (Groupe d’Expertise Collective d’Urgence, GECU‘Covid-19’). The GECU ‘Covid-19’ urgently convened on 4 March 2020 and 8 April 2020 to conduct an evaluation of the potential role of domestic animals in the ongoing COVID-19 pandemic.

International audience; In Europe, African swine fever virus (ASFV) is one of the most threatening infectious transboundary diseases of domestic pigs and wild boar. In September 2018, ASF was detected in wild boar in the South of Belgium. France, as a bordering country, is extremely concerned about the ASF situation in Belgium, and an active preparedness is ongoing in the country. One of the questions raised by this situation relates to disturbing activities that may affect wild boar movements and their possible impact on the spread of ASFV. Despite evidence of disturbance related to hunting practices, there is a paucity of information on the impact of forestry and human leisure activities. To assess this impact on wild boar movements, a systematic review was first conducted but very few useful data were obtained. For this reason, an expert elicitation was carried out by the French Agency for Food, Environmental and Occupational Health & Safety in order to deal with this knowledge gap. A total of 30 experts originating from France and adjacent neighbouring countries (Spain, Belgium and Switzerland) were elicited about the relative importance of six factors of spatial disturbance of wild boar (noise, smell, invasion of space, modification of the environment, duration and frequency of the activity). Then, for each factor of disturbance, they were asked about the impact of 16 different commercial forestry and human leisure activities. A global weighted score was estimated in order to capture the variability of a wide range of territorial conditions and the uncertainty of expert elicitation. This estimate permitted ranking all 16 activities and aggregating them in three groups according to their potential for disturbance of wild boar, using a regression tree analysis. The results of this expert elicitation provide a methodological approach that may be useful for French and other European decision makers and stakeholders involved in the crisis management of ASF.

Suite aux premiers cas d’infection de visons par le SARS-CoV-2 aux Pays-Bas, fin avril 2020, une surveillance clinique renforcée des quatre élevages français de visons a été mise en place par les DDcsPP dès le mois de mai. Une instruction technique DGAL/SDSPA/2020-342 du 08 juin 2020 est ensuite venue préciser les mesures de prévention et de surveillance de l’infection par le virus SARS-CoV-2 dans les élevages de visons et de furets en France. Dans le même temps, les services du ministère de la santé et des solidarités ont été alertés et les Agences régionales de santé (ARS) se sont rapprochées des exploitants de ces sites pourproposer des précautions sanitaires vis-à-vis du travail auprès de ces élevages.La surveillance évènementielle renforcée (basée sur la surveillance des signes cliniques) mise en place dans les élevages courant mai n’avait pas montré de signe de contamination des animaux par le SARS-CoV-2.L’Anses a été saisie une première fois le 24 juin 2020 par la DGAL sur les modalités de surveillance des élevages de visons français. Un premier avis du 1er juillet 2020 a été complété le 21 septembre 2020 , suite à l’information par la DGAL de l’impossibilité pratique de réaliser certains prélèvements sur visons vigiles.Dans le cadre d’un programme scientifique conduit par le laboratoire de l’Anses « Rage et faune sauvage » basé à Nancy, des analyses sérologiques et virologiques ont été réalisées mi-novembre 2020, à l’occasion des abattages d’animaux pour la production de fourrure. Le plan de prélèvement a été réalisé sur la base des préconisations de l’avis de l’Anses 2020-SA-0080, en vue d’établir le statut sanitaire des visons des quatre élevages. Le 20 novembre2020, l’un de ces quatre élevages, situé dans le département de l’Eure-et-Loir, s’est alors révélé infecté. Les résultats étaient positifs en sérologie et en RT-qPCR (reverse-transcription quantitative real-time polymerase chain reaction) témoignant d’une circulation virale en cours au sein du cheptel. L’ensemble des animaux de l’exploitation a été abattu en novembre 2020. Suite à la mise en œuvre de cette surveillance sérologique et virologique, les trois autresélevages français ont été trouvés indemnes de SARS-CoV-2 en novembre et décembre 2020. Les mesures de biosécurité renforcées et la surveillance évènementielle sont cependant maintenues dans ces trois élevages . Par ailleurs, l’analyse de séquençage du virus découvert dans l’élevage infecté a permis d’exclure un lien direct avec les variants du SARSCoV-2 identifiés aux Pays-Bas avant l’été 2020 et fin 2020 au Danemark, dans des élevagesde visons. Cette analyse de séquençage est compatible avec une transmission locale à partir d’humains infectés par le SARS-CoV-2 en France. Trois des 12 séquences obtenues montrent la cooccurrence d’une mutation synonyme dans l’ORF1ab et d’une substitution N501T dans la protéine spike, ces changements faisant partie de mutations dites récurrentes chez le vison.Dans ce contexte, l’Anses a été saisie par la DGAL et la DGS sur les questions suivantes :Question 1 : Dans le contexte sanitaire actuel, avec une circulation active du virus dans la population humaine, et vu la découverte récente d’un élevage positif sans aucune expression clinique, quelle surveillance faut-il mettre en œuvre dans les élevages de visons pour les mois à venir ? Des compléments aux recommandations du précédent avis rendu sur la surveillance des visons sont nécessaires au regard des nouvelles connaissances acquises liées à la surveillance en cours (éléments épidémiologiques et modalités de prélèvements). En fonction du dispositif de surveillance recommandé, le plan d’échantillonnage (unité épidémiologique, taille de l’échantillon, type de prélèvement, …) et le rythme de la surveillance devront être précisés. Les contraintes relatives à la manipulation des animaux pendant les prélèvements devront être prises en compte.Question 2 : Dans le cas où un élevage serait positif en sérologie mais sans mise en évidence de circulation virale (virologie négative), quel serait le risque sanitaire pour les compartiments humain et animal lié au fait de ne pas abattre les animaux ? Ces animaux peuvent-ils constituer un réservoir significatif du virus ?Question 3 : Quelles sont les conditions sanitaires de santé animale à mettre en place à l’introduction de visons extérieurs à l’élevage considéré dans les deux situations suivantes :- dans le cadre du fonctionnement normal d’un élevage non infecté ;- outre un nettoyage/désinfection standard qui semble suffisant dans ce cadre7 (à commenter ou moduler par l’Anses en tant que de besoin), même question dans le cadre du repeuplement d’un élevage après un abattage lié à la détection du virus SARS-Cov-2?Question 4 : En raison des mesures de biosécurité renforcées mises en place dans les élevages de visons, la principale source d’exposition des animaux au SARS-Cov-2 est liée au portage et activité de l’homme (nourrissage, soins, entretien des litières…) : de ce fait, quelle articulation mettre en place entre surveillances humaine et animale? L’existence de variations génétiques et leur portée de santé publique pourraient-elles être de nature à moduler la surveillance ? Quelle conduite tenir en cas de positivité (RT-PCR et/ou sérologie) vis-à-vis du SARS-Cov-2 dans un des « compartiment » humain ou animal et quelles en seraient les conséquences sur la surveillance de l’autre compartiment ?

Par courrier du 26 juillet 2018, l’Anses a été saisie d’une « demande d’évaluation du rôle épidémiologique du renard dans la transmission de la tuberculose bovine (TB) ».Cette saisine s’inscrit dans le contexte de la TB chez les bovins et dans la faune sauvage, notamment chez les blaireaux, objets de la saisine 2016-SA-0200. Cette problématique implique différents acteurs, en particulier éleveurs, chasseurs, piégeurs et associations de protection de la faune sauvage. Suite à la découverte de quatre renards infectés en Dordogne en 2015, une étude a été conduite autour de ces cas sur « l’épidémiologie et la pathologie de la TB chez le renard ». Cette étude a mis en évidence, pour 2017, un taux d’infection de l’ordre de 6 % sur un échantillon de 189 renards prélevés en zone infectée de Dordogne, par détection par PCR sur des pools de broyats de nœuds lymphatiques (NL), des expectorations, des fèces et des urines.A la date de réception de la saisine, la partie de cette étude portant sur les voies d’excrétion de Mycobacterium bovis par les renards était en cours. La mise en place de deux études complémentaires, une étude épidémiologique élargie à d’autres zones de Dordogne et d’autres départements infectés de TB, et une infection expérimentale de renards en captivité, avaient également été initiées. Selon la saisine, les résultats de ces études devaient être disponibles enseptembre et décembre 2018.En pratique, les résultats des études n’étant pas disponibles dans les délais indiqués, le traitement de la saisine a été suspendu jusqu’à leur obtention en février 2020.Selon les termes de la saisine, un avis de l’Anses est sollicité sur les questions suivantes :• « Quel est le risque de transmission de la TB aux élevages de bovins par des renards compte tenu des éléments actuellement connus ? Quel est le risque de création d’un réservoir de la maladie dans la faune sauvage en intégrant le rôle joué par cette espèce ?• Quelles mesures de gestion (contrôle des densités de renard par la chasse, ramassage des cadavres, etc.) seraient susceptibles de faire diminuer ce risque ?En sus d’une revue bibliographique sur le sujet, nous souhaiterions que votre avis prenne en compte les résultats de l’étude en cours en Dordogne et des investigations complémentaires qui auront pu être menées et dont les résultats seraient disponibles en décembre 2018 ».L’audition de la DGAL a permis de confirmer que la surveillance des renards faisait partie de la gestion et était donc à envisager dans la deuxième question

La filière équine regroupe les activités d’élevage, de loisirs, de sports, de courses, de travail, ou de production de viande.A ce jour, la protection et le bien-être des équidés est encadré par un arrêté ministériel relatif aux espèces d’élevage, mais sans que les spécificités des équidés soient prises en compte. Dans ce contexte, prenant en considération l’évolution des préoccupations sociétales, les professionnels de la filière ont souhaité s’engager sur la question du bien-être équin via une charte, signée par le Ministère de l’agriculture en février 2017. Cette charte a été complétée par un guide de bonnes pratiques que les professionnels souhaitent désormais voir reconnu par le Ministère de l’agriculture.L’Anses a été saisie le 30 octobre 2018 par la Direction générale de l’alimentation pour la réalisation de l’expertise suivante : Demande d’avis scientifique relatif au projet de guide de bonnes pratiques pour l’application des engagements de la Charte pour le bien-être équin.

Selon les termes de la saisine, « cette zone qui s’étend à 20km autour des foyers d’influenza aviaire (IA) déclarés dans ces départements a été mise en place suite à votre avis rendu sur la saisine n° 2020-AST-0179 : Demande d’avis scientifique et technique de l’Anses relative aux mesures de maitrise de l’épizootie d’influenza aviaire dans la région du Sud-Ouest(département 40 et départements mitoyens) », Question n°2. Dans cet avis l’Anses a indiqué “Compte tenu des délais de levée des zones réglementées autour des foyers d’IAHP, le Gecurecommande de lever les restrictions de mises en place d’oiseaux et d’entrées/sorties de la zone tampon à une date au moins égale à celle de la levée de l’APDI du dernier foyer de l’ensemble des zones réglementées qu’encercle la zone tampon (cf. annexe 2 : levée des zones règlementées)".Toutefois nous souhaitons examiner l’opportunité d’une éventuelle levée progressive : il apparaît en effet que certaines zones ne connaissent plus de foyers depuis plusieurs semaines et leur situation épidémiologique pourrait être différenciée d'autres zones qui ont connu des foyers plus récemment. Par ailleurs, alors que dans certaines zones des foyers sont apparus entre 10 et 20km autour des foyers, cela n’est pas le cas, par exemple dans les Pyrénées Atlantiques et le Gers. Du fait des nombreux abattages à titre préventif qui ont été effectués autour des foyers, la densité d'animaux a fortement chuté dans certains territoires, il resterait 35000 canards dans les Landes et 200 000 dans la zone tous départements compris. Cet examen s’intéresse également aux conditions dans lesquelles, après la levée de la zone tampon, des remises en place sont possibles.Aussi les questions que je souhaite vous poser sont les suivantes : - Quelles sont les conditions requises pour envisager la levée de certaines zones stabilisées de la grande zone tampon du sud-ouest ? - Sous quelles modalités peut-il être envisagé cette levée partielle ? - Quelles seraient les conditions pour envisager un repeuplement des élevages dans ces zones ? »

The work of ML was supported by the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program under Grant No. 734548-ZIKAlliance. Besides, this research received no specific grant from any funding agency, commercial or non-for-profit section.; International audience; The ongoing coronavirus disease 19s pandemic has yet again demonstrated the importance of the human-animal interface in the emergence of zoonotic diseases, and in particular the role of wildlife and livestock species as potential hosts and virus reservoirs. As most diseases emerge out of the human-animal interface, a better understanding of the specific drivers and mechanisms involved is crucial to prepare for future disease outbreaks. Interactions between wildlife and livestock systems contribute to the emergence of zoonotic diseases, especially in the face of globalization, habitat fragmentation and destruction and climate change. As several groups of viruses and bacteria are more likely to emerge, we focus on pathogenic viruses of the Bunyavirales, Coronaviridae, Flaviviridae, Orthomyxoviridae, and Paramyxoviridae, as well as bacterial species including Mycobacterium sp., Brucella sp., Bacillus anthracis and Coxiella burnetii. Noteworthy, it was difficult to predict the drivers of disease emergence in the past, even for well-known pathogens. Thus, an improved surveillance in hotspot areas and the availability of fast, effective, and adaptable control measures would definitely contribute to preparedness. We here propose strategies to mitigate the risk of emergence and/or re-emergence of prioritized pathogens to prevent future epidemics.

Par courrier du 26 juillet 2018, l’Anses a été saisie d’une « demande d’évaluation du rôle épidémiologique du renard dans la transmission de la tuberculose bovine (TB) ».Cette saisine s’inscrit dans le contexte de la TB chez les bovins et dans la faune sauvage, notamment chez les blaireaux, objets de la saisine 2016-SA-0200. Cette problématique implique différents acteurs, en particulier éleveurs, chasseurs, piégeurs et associations de protection de la faune sauvage. Suite à la découverte de quatre renards infectés en Dordogne en 2015, une étude a été conduite autour de ces cas sur « l’épidémiologie et la pathologie de la TB chez le renard ». Cette étude a mis en évidence, pour 2017, un taux d’infection de l’ordre de 6 % sur un échantillon de 189 renards prélevés en zone infectée de Dordogne, par détection par PCR sur des pools de broyats de nœuds lymphatiques (NL), des expectorations, des fèces et des urines.A la date de réception de la saisine, la partie de cette étude portant sur les voies d’excrétion de Mycobacterium bovis par les renards était en cours. La mise en place de deux études complémentaires, une étude épidémiologique élargie à d’autres zones de Dordogne et d’autres départements infectés de TB, et une infection expérimentale de renards en captivité, avaient également été initiées. Selon la saisine, les résultats de ces études devaient être disponibles enseptembre et décembre 2018.En pratique, les résultats des études n’étant pas disponibles dans les délais indiqués, le traitement de la saisine a été suspendu jusqu’à leur obtention en février 2020.Selon les termes de la saisine, un avis de l’Anses est sollicité sur les questions suivantes :• « Quel est le risque de transmission de la TB aux élevages de bovins par des renards compte tenu des éléments actuellement connus ? Quel est le risque de création d’un réservoir de la maladie dans la faune sauvage en intégrant le rôle joué par cette espèce ?• Quelles mesures de gestion (contrôle des densités de renard par la chasse, ramassage des cadavres, etc.) seraient susceptibles de faire diminuer ce risque ?En sus d’une revue bibliographique sur le sujet, nous souhaiterions que votre avis prenne en compte les résultats de l’étude en cours en Dordogne et des investigations complémentaires qui auront pu être menées et dont les résultats seraient disponibles en décembre 2018 ».L’audition de la DGAL a permis de confirmer que la surveillance des renards faisait partie de la gestion et était donc à envisager dans la deuxième question

Suite à la confirmation de plusieurs cas de PPA sur des sangliers en Belgique, à proximité de la frontière française, la DGAL a saisi plusieurs fois l’Anses en urgence pour répondre à des questions sur : les risques d’introduction du virus responsable de cette maladie enFrance, les mesures de gestion à la frontière Franco-Belge, tant dans la faune sauvage que dans les élevages de suidés.Lors des travaux du GECU PPA, les experts se sont également interrogés sur les méthodes et produits disponibles pour inactiver le virus de la PPA, que ce soit au niveau des laboratoires qui reçoivent des prélèvements ou des cadavres d’animaux, au niveau des camions qui sont/seront utilisés pour le transport des cadavres ou des animaux vivants potentiellement contaminés, au niveau des locaux et matériaux d’élevage ou des matériaux utilisés au clos d’équarrissage, etc.De plus, les laboratoires d’analyse vétérinaires et le Laboratoire National de Référence (LNR) pour la PPA, reçoivent des questions des parties prenantes sur les produits biocides pouvant être utilisés pour décontaminer des matériaux entrés en contact avec des matières potentiellement contaminées par le virus de la PPA. Des interrogations émanent également des entreprises spécialisées dans le développement et la commercialisation de produits biocides (confrontés entre-autres à la réglementation française concernant la manipulation du virus de la PPA).Les réponses à ces interrogations n’étant pas immédiatement et facilement disponibles, dans ce contexte, il apparait opportun d’agir par anticipation et de se saisir de la question de l’inactivation du virus de la PPA, des méthodes de décontamination pouvant être mises en oeuvre ainsi que des produits utilisables et efficaces dans l’éventualité de foyers de PPA en France dans la faune sauvage ou dans la faune domestique.Les questions de l’autosaisine sont les suivantes :« Effectuer une mise à jour des connaissances sur les méthodes et procédés d’inactivation du virus de la PPA et sur la résistance de ce virus dans les différentes matrices potentiellement contaminées.Cette mise à jour portera également sur les produits biocides utilisables pour la décontamination, tant au laboratoire que dans le cas de dépeuplement en élevage de suidés, ou au clos d’équarrissage (tant pour les porcs d’élevage que pour des cadavres de sangliers potentiellement contaminés si ceux-ci devaient y être amenés). »

In Europe, the African swine fever (ASF) virus represents the most threatening transboundary infectious pathogen of domestic pigs and wild boars, with serious consequences for these populations and the economy. Since its detection in Belgium in September 2018, France has established containment measures, while questioning their impact on wild boar movements and the associated risk of spreading the ASF virus. To address this issue, Anses conducted the first known elicitation of experts on this subject. The relative importance of wild boar disturbance factors and the possible impact of human activities on wild boar movements were estimated using a deterministic approach followed by a stochastic one. The resulting weighted stochastic model was developed to capture the variability of a wide range of territorial conditions and the uncertainty associated with expert elicitation. A regression tree analysis was used to group activities according to the disturbance affecting wild boars. Changes to the wild boar environment and territory intrusion appear as the most disturbing factors to them. Consequently, related leisure and forestry activities should be of interest: thinning of parcels with machinery, logging (felling of large trees), skidding and mushroom or deer antler picking. The results of this experts’elicitation are particularly important for managers and stakeholders involved in the ASF crisis in Europe.; En Europe, le virus de la peste porcine africaine (PPA) est à l’origine d’une des maladies infectieuses transfrontalières les plus menaçantes pour les porcs domestiques et les sangliers, avec de sérieuses conséquences pour leurs populations et l’économie. Depuis sa détection en Belgique, en septembre 2018, la France a mis en place des mesures de gestion tout en s’interrogeant sur leur impact sur les mouvements de sangliers et le risque lié de propagation du virus de la PPA. Pour répondre à cette problématique, l’Anses a conduit la première élicitation connue d’experts sur le sujet. L'importance relative de facteurs de dérangement des sangliers a été évaluée. L'impact possible d’activités humaines sur les mouvements de sangliers a été estimé selon une approche stochastique, afin de saisir la variabilité d'un large éventail de conditions territoriales et l'incertitude liée à l’élicitation d’experts.Une analyse par arbre de régression a permis de regrouper les activités selon le dérangement qu’elles engendraient chez les sangliers. La modification de l'environnement du sanglier et l’envahissement de l'espace apparaissent comme les facteurs les plus dérangeants pour les sangliers et par conséquent les activités humaines ou forestières agissant sur ces facteurs : éclaircissement de parcelles par engins, coupe de bois (abattage de gros arbres), débardage et ramasseurs de champignons/bois de cerf. Les résultats de cette élicitation d’experts sont particulièrement importants pour les gestionnaires et les parties prenantes impliqués dans la crise de la PPA en Europe.

« Dans le cadre de la planification, les services de la DGAL se préparent, aux différents échelons, à la mise en œuvre des mesures de lutte contre la peste porcine africaine (PPA) en identifiant les ressources humaines et matérielles nécessaires. Pour la question du dépeuplement en élevage, il est prévu un prestataire national pour la réalisation des chantiers de dépeuplement de gros effectifs porcins en élevage, le reste des chantiers étant et devant être piloté et organisé par les directions départementales en charge de la protection des populations DDecPP avec des moyens locaux. Pour autant, selon la dynamique de diffusion de la maladie, ces dispositifs pourraients’avérer insuffisants et une option pourrait être de transférer des animaux issus de cheptels infectés pour une mise à mort à l'abattoir. Par ailleurs, une stratégie de dépeuplement préemptive à l'image de ce qui a été mis en place lors de l’épisode influenza aviaire 2016-2017 pourrait être également mise en place et nécessiterait également une mobilisation importante des moyens de dépeuplement.Il s'agirait donc plus précisément d'évaluer le risque de diffusion de la PPA, à la fois par le transport et par la persistance du virus au sein des sites d’abattage, lors de la mobilisation d'abattoirs pour dépeupler des foyers. Cette même question est posée pour du dépeuplementpréemptif d'animaux a priori non suspects en périphérie de foyer. Ces cas de figure pourraient se présenter en cas de dépassement des capacités d'intervention sur site Des questions complémentaires liées aux opérations de dépeuplement d'animaux infectés sontégalement posées.- Parmi les méthodes d’euthanasie individuelle, un dispositif à tige perforante suivi d'un jonchage ou une injection létale peuvent être utilisés pour les porcs ainsi que le tir à balle pour les sangliers. Ces méthodes qui peuvent entraîner des effusions de sang sont-elles denature à engendrer un risque supplémentaire de diffusion du virus ?- Les intervenants dans un foyer sont équipés de protections individuelles (EPI) et passent par un sas sanitaire pour sortir de l'exploitation en vue de limiter les risques de diffusion de la maladie. La procédure recommandée pour l'entrée et la sortie d'un élevage infecté estjointe ; quel serait le délai de carence à respecter entre l'intervention dans un foyer et l'intervention dans un élevage sain afin de prévenir tout risque de diffusion de la maladie ? Le délai historiquement préconisé est de 72h et demande à être documenté. »

Risk and animal welfare, the role of the anses As part of the new animal welfare governance, Anses was asked to organize the risk assessment expertise. Its new Working Group for Animal Welfare is responsible for providing available scientific elements on various animal welfare issues to risk managers, for decision making. The organization of collective expertise at Anses is presented here, emphasizing the qualities of independence and transparency of the collegial and multidisciplinary work of expertise. The Working Group for Animal Welfare, created at the end of 2012, gave himself a double mandate : build his own fundamental basis for expertise about animal welfare, and address the different questions, today mainly received from the authorities. Questions may also arise from stakeholders represented on its board or self-mandate from the Agency itself. In terms of animal welfare, Anses can also use the results of research conducted within some of its laboratories., Dans le cadre de la nouvelle gouvernance mise en place dans le domaine de la protection animale, l’Anses s’est vu confier l’activité d’évaluation des risques. Son nouveau Groupe de Travail Bien-être des animaux est chargé de fournir aux gestionnaires des risques les éléments scientifiques disponibles sur différentes questions de protection animale, en amont de leurs décisions. L’organisation de l’expertise collective à l’Anses est ici présentée, en soulignant le caractère collégial, multidisciplinaire, indépendant et transparent qui préside aux travaux d’expertise. Le Groupe de Travail Bien-être des animaux, constitué fin 2012, mène de front la construction de ses propres fondamentaux et la réponse aux différentes saisines, principalement reçues aujourd’hui des autorités. Des questions peuvent également provenir de parties prenantes représentées à son conseil d’administration ou d’auto-saisines de l’Agence elle-même. En matière de bien-être des animaux, l’Anses bénéficie également des fruits des activités de recherche menée au sein de certains de ses laboratoires., Dunoyer Charlotte. Risque et protection des animaux. Rôle de l’Anses . In: Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France tome 167 n°2, 2014. pp. 149-152.

International audience; During 2005-2010, we investigated Echinococcus multilocularis within fox populations in a large area in France. The parasite is much more widely distributed than hitherto thought, spreading west, with a much higher prevalence than previously reported. The parasite also is present in the large conurbation of Paris.

Citation suggérée : Anses (2021). Clostridium botulinum : mise à jour des connaissances sur les différentes formes des types C, D, mosaïque C/D et D/C et E. (saisines 2019-SA-0112 à 2019-SA-0115). Maisons-Alfort : Anses, 170 p; Le botulisme est une maladie neurologique humaine et animale, le plus souvent d’origine alimentaire, provoquée par l’action de neurotoxines bactériennes (toxines botuliques) produites par des bactéries du genre Clostridium et qui se manifeste par des paralysies flasques pouvant aller jusqu’à la paralysie respiratoire et l’arrêt cardiaque. Il existe neuf types de toxines botuliques. Les différents types se répartissent en une quarantaine de sous-types.Chez l’être humain, en France, le botulisme est à déclaration obligatoire depuis 1986. Les cas de botulisme sont majoritairement associés aux types B et A et de manière plus exceptionnelle aux types F et E. Il s’agit d’une maladie rare, avec une incidence en France de 11 à 22 cas/an (période 2013-2016, source Santé Publique France - SPF).Le botulisme animal en France concerne essentiellement les oiseaux (sauvages et domestiques) et les bovins. Les cas chez les bovins sont dus aux types mosaïque D/C (majoritaire), C, mosaïque C/D et rarement D. Au niveau national, l’incidence sur les 10 dernières années est en moyenne d’une dizaine de foyers par an. Chez les oiseaux, les types toxiniques en cause sont C, D, mosaïques C/D et D/C et exceptionnellement le type E. Au niveau national, l’incidence est d’environ 25 foyers par an (volailles et avifaune confondues), avec cependant des variations annuelles parfois notables, comme en 2007 (121 foyers décelés) et 2008 (102 foyers).Une sous-estimation est probable, quelle que soit l’espèce animale envisagée, mais surtout pour l’avifaune3 (sauvage et non captive) où la détection des cadavres d’oiseaux est plus difficile.Bien qu’il s’agisse d’un danger sanitaire de première catégorie en santé animale, il n’y a pas à l’heure actuelle de mesures de police sanitaire établies par la règlementation, lors de la confirmation d’un foyer de botulisme animal, ce qui conduit à une gestion au cas par cas par les directions départementales de la protection des populations (DDPP) et la Mission des Urgences Sanitaires (MUS) de la Direction générale de l’Alimentation. Ces services peuvent s’appuyer sur deux documents émis par l’AFSSA : le rapport sur le botulisme animal établi en 2002 et l’avis rendu en janvier 2009 sur un projet d’arrêté fixant des mesures techniques et administratives relatives à la lutte contre le botulisme aviaire. Ce projet d’arrêté n’a pas été finalisé par le ministère. Les rapports et avis cités étant relativement anciens, la Direction générale de l’Alimentation a saisi l’Anses à la fin du mois de juin 2019 via 4 saisines (saisines 2019-SA-0112 à 2019-SA-0115), dont l’objet est une demande d’actualisation des connaissances et des évaluations de risque pour la santé humaine et/ou animale.

Pre-print on MedRxiv : https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.26.20114025v1; International audience; Temperature and relative humidity are major factors determining virus inactivation in the environment. This article reviews inactivation data of coronaviruses on surfaces and in liquids from published studies and develops secondary models to predict coronaviruses inactivation as a function of temperature and relative humidity. A total of 102 D-values (time to obtain a log10 reduction of virus infectivity), including values for SARS-CoV-2, were collected from 26 published studies. The values obtained from the different coronaviruses and studies were found to be generally consistent. Five different models were fitted to the global dataset of D-values. The most appropriate model considered temperature and relative humidity. A spreadsheet predicting the inactivation of coronaviruses and the associated uncertainty is presented and can be used to predict virus inactivation for untested temperatures, time points or any coronavirus strains belonging to Alphacoronavirus and Betacoronavirus genera.Importance: The prediction of the persistence of SARS-CoV-2 on fomites is essential to investigate the importance of contact transmission. This study collects available information on inactivation kinetics of coronaviruses in both solid and liquid fomites and creates a mathematical model for the impact of temperature and relative humidity on virus persistence. The predictions of the model can support more robust decision-making and could be useful in various public health contexts. Having a calculator for the natural clearance of SARS-CoV-2 depending on temperature and relative humidity could be a valuable operational tool for public authorities.