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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The introduction of non-native species is an event that can jeopardize the conservation of native species. The introduction of alien species is usually based on a few individuals and is linked to impacts related to the founder effect and the loss of genetic diversity, which is dependent on the initial effective population size, the population growth rate, and the characteristics of the new colonized environment, which may or may not provide adaptation to it. Invasive species can also favor hybridization with native species, when both species meet and manage to mate, which can be detrimental to biodiversity when one or both pure progenitor strains or species become extinct. The creation of contact zones between species that do not naturally co-occur can therefore pose a pressing threat to biological conservation. This is the case of a specific region of Serra da Tiririca State Park, located in the municipality of Niterói, Rio de Janeiro (RJ), where two pairs of the threatened species Leontopithecus chrysomelas (the golden headed lion tamarin, GHLT, endemic to the Atlantic Forest of Bahia) and a pair of Leontopithecus rosalia (the golden lion tamarin, GLT, endemic to the Atlantic Forest of Rio de Janeiro) were released in the 1990s. Due to the favourable conditions present in this area, these animals were able to adapt and reproduce successfully, generating a new population outside the natural range of L. chrysomelas. Over two decades, this population increased its density exponentially, and it was estimated that there were about 200 individuals, with phenotype of L. chrysomelas in that area in 2009, no individuals with the phenotype of L. rosalia were observed. In view of this event, and the fact that at that time there was only the suspicion of a possible illegal introduction of L. chrysomelas into the Niteroi region, an alternative measure to contain the growth and advance of this population to adjacent areas of natural occurrence of L. rosalia, was to carry out the translocation of individuals with phenotype similar of L. chrysomelas to a fragment of Atlantic Forest, located on the RPPN (Private Natural Heritage Reserve) Veracel Celulose in Belmonte, Bahia. In 2015, however, the illegal introduction of L. chrysomelas and also L. rosalia was confirmed. Although these individuals had the phenotype of L. chrysomelas, it is known that hybrids, besides having phenotypes intermediate to the inter-crossing species, can be more similar to only one of the parental species. Considering that both L. rosalia and L. chrysomelas are species classified by the IUCN as "endangered", investigating the existence of hybrids in this population and characterizing their genetic diversity and structure is relevant for appropriate management measures in regions where currently there are descendants of this population. In this context, the main objective of this study was to carry out genomic and genetic analyses to investigate the occurrence of hybridization and to characterize the genetic diversity and structure of this population. The data showed no signs of hybridization in the Niteroi population, confirming that the individuals are from the species L. chrysomelas. Additionally, genetic diversity values were comparable to those observed for other Leontopithecus populations, showing the absence of negative founder effect consequences and the excellent capacity of the species to re-establish its diversity in the Niteroi region. These findings are relevant to adequately manage individuals from the invasive population and for the conservation programs of both pure species. A introdução de espécies não nativas é um evento que pode pôr em risco a conservação das espécies nativas. A introdução de espécies alóctones geralmente se baseia em poucos indivíduos, e está atrelada aos impactos relacionados ao efeito fundador e à perda da diversidade genética, a qual é dependente do tamanho populacional efetivo inicial, da taxa de crescimento populacional e das características do novo ambiente colonizado, as quais podem propiciar ou não a adaptação ao mesmo. Espécies invasoras podem também favorecer a hibridação com espécies nativas, quando ambas as espécies se encontram e conseguem se acasalar, podendo ser prejudicial para biodiversidade quando uma ou ambas as linhagens ou espécies puras progenitoras é extinta. A criação de zonas de contato entre espécies que naturalmente não co-ocorrem pode, portanto, se constituir em uma ameaça premente à conservação biológica. Esse é o caso de uma região específica no Parque Estadual da Serra da Tiririca, localizada no município de Niterói, no estado do Rio de Janeiro (RJ), na qual foram liberados na década de 90 dois casais da espécie ameaçada Leontopithecus chrysomelas (o mico leão-de-cara-dourada, MLCD, endêmico da Mata Atântica da Bahia), e um casal de Leontopithecus rosalia (o mico-leão-dourado, MLD, endêmico da Mata Atlântica do Rio de Janeiro). Devido às condições favoráveis presentes nesta área, estes animais conseguiram se adaptar e se reproduzir com sucesso, gerando uma nova população fora da área de ocorrência natural de L. chrysomelas. Ao longo de duas décadas, essa população aumentou sua densidade de forma exponencial, sendo estimada a existência de cerca de 200 indivíduos com fenótipo de L. chrysomelas naquela área em 2009, nenhum indivíduo com fenótipo de L. rosalia foi observado. Em vista deste evento, e do fato de que na época só se tinha a suspeita sobre a possível introdução ilegal de L. chrysomelas na região de Niteroi, uma medida alternativa para conter o crescimento e avanço dessa população para áreas adjacentes de ocorrência natural de L. rosalia foi translocar indivíduos com fenótipo de L. chrysomelas para um fragmento de Mata Atlântica, localizado na RPPN (Reserva Particular do Património Natural) Veracel Celulose, em Belmonte, Bahia. Em 2015, porém, foi confirmada a introdução ilegal de L. chrysomelas e de L. rosalia. Assim, apesar dos indivíduos da população de Niteroi terem fenótipo de L. chrysomelas, sabe-se que híbridos, além de possuírem fenótipos intermediários às espécies inter-cruzantes, podem se assemelhar mais a apenas uma das espécies parentais. Considerando que ambas as espécies são classificadas pela IUCN como "em perigo", investigar a existência de híbridos nesta população e caracterizar sua diversidade e estrutura genética é de fundamental relevância para que medidas adequadas de manejo sejam tomadas nas regiões onde atualmente existem descendentes desta população. Dentro deste contexto, o presente trabalho teve como objetivo principal realizar análises genômicas e genéticas para investigar a ocorrência de hibridização e para caracterizar a diversidade e estrutura genética desta população. Os dados mostraram ausência de sinais de hibridização na população de Niteroi, confirmando que os indivíduos são da espécie L. chrysomelas. Adicionalmente, os valores de diversidade genética mostraram-se comparáveis ao que vem sendo observado para outras populações de Leontopithecus, evidenciando ausência das consequências negativas de efeito fundador e excelente capacidade da espécie para restabelecer sua diversidade na região de Niteroi. Estes achados são relevantes para que os programas de conservação de ambas as espécies possam continuar manejando adequadamente as populações envolvidas nesse estudo. 88887.500899/2020-00

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Citrus canker, which is caused by the bacteria Xanthomonas citri and Xanthomonas fuscans, is one of the main diseases that affect the citrus industry in Brazil. Disease control methods are available, but new methods are necessary. A possible way to combat citrus canker is biocontrol using bacteriophages, also called phages, which are viruses that infect bacteria and which have been proposed as an alternative to the use of other antibacterial methods for agriculture and human health. The objectives of this doctoral project were the isolation, sequencing and characterization of one or more phages capable of infecting Xanthomonas citri, as well as to assess their potential for biocontrol of citrus canker. From a soil sample collected in a citrus grove affected by citrus canker, we could isolate a phage capable of infecting X. citri, strain 306, also known as Xac 306. The phage has a 305,651-bp, dsDNA genome, with a GC content of 54.92% and three hundred ninety-four ORFs, for one hundred eighty-one of which it was possible to assign functions while two hundred and thirteen remained as hypothetical. Phylogenetic and microscopy analysis allowed the classification of the phage in the Myoviridae family and it was named vB_XciM_LucasX. LucasX infected twenty-one of the twenty-three strains of X. citri and X. fuscans against which it was tested. A pangenomic analysis with the strains whose genome is available indicated that a 40-kbp region is present in all susceptible strains, but absent in the resistant strain, and which must contain genes essential for phage infection. LucasX can be propagated in NB medium but not in LB medium, probably because it is not tolerant to NaCl. LucasX is stable up to 45oC, has a latent period of 90 min and a burst size of 40 PFU/infected cell, its optimal pH is 7 and it can be inactivated with 40% ethanol or by being exposed to UV light from a germicidal lamp. The phage yield in liquid medium was studied in three strains of Xanthomonas sp. and it was one order of magnitude higher in one of them relative to the strain used for isolation. Finally, an experiment with citrus trees kept in a greenhouse showed that LucasX is able to reduce the number of lesions caused by Xac 306 by up to 89%%, a reduction similar to that of a commercial bactericide used as a control, thus indicating its potential as a biocontrol agent for citrus canker. O cancro cítrico, causado pelas bactérias Xanthomonas citri e Xanthomonas fuscans, é uma das principais doenças que afetam a citricultura brasileira e mundial. Métodos de controle da doença estão disponíveis, mas novos métodos são necessários. Uma possível forma de combate ao cancro cítrico seria o controle biológico usando bacteriófagos, também chamados de fagos, que são vírus que infectam bactérias e que têm sido propostos como uma alternativa ao uso de outros métodos antibacterianos na agropecuária e na saúde humana. Os objetivos desse trabalho de doutorado eram isolar, sequenciar e caracterizar um ou mais fagos capazes de infectar Xanthomonas citri, bem como avaliar seu potencial para controle biológico do cancro cítrico. A partir de uma amostra de terra coletada em um laranjal acometido pelo cancro cítrico foi possível isolar um fago capaz de infectar X. citri, linhagem 306, também chamada de Xac 306. O fago tem um genoma de dsDNA de 305.651 pb, possui um conteúdo de GC de 54,92% e trezentas e noventa e quatro ORFs, para cento e oitenta e uma das quais foi possível atribuir funções enquanto duzentas e treze permaneceram como ORFs hipotéticas. As análises filogenética e de microscopia permitiram classificar o fago na família Myoviridae e ele foi denominado vB_XciM_LucasX. LucasX infectou vinte e uma das vinte e três linhagens de X. citri e X. fuscans contra as quais foi testado. Uma análise de pangenômica com as linhagens cujos genomas já foram sequenciados indicou que uma região de 40 kpb está presente em todas as linhagens suscetíveis, mas ausente na linhagem resistente, o qual deve conter genes essenciais à infecção pelo fago. LucasX pode ser propagado em meio NB mas não em meio LB, provavelmente por não ser resistente a NaCl. LucasX é estável até a 45oC, possui um tempo de latência de 90 min e um burst size de 40 UFP/célula infectada, seu pH ótimo é 7 e ele pode ser inativado em concentrações de etanol a partir de 40% ou ao ser exposto à luz UV de uma lâmpada germicida. O rendimento do fago ao ser propagado em meio líquido foi estudado em três linhagens de Xanthomonas sp. e foi uma ordem de grandeza maior em uma delas do que na linhagem usada no isolamento. Por fim, um experimento com mudas de laranjeira mantidas em estufa mostrou que LucasX é capaz de reduzir o número de lesões causadas pela infecção por Xac 306 em até 89%, valor equivalente ao de um bactericida comercial usado como controle, indicando seu potencial como agente de controle biológico do cancro cítrico. 88882.426704/2019-01

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Brazilian Atlantic Forest (BAF) is considered one of the five main hotspots on the planet. It extends in coastal regions of eastern Brazil, Paraguay and Argentina, displaying a sizeable geographic extension and a wide gradient of altitude, latitude, and climate conditions. Although BAF landscapes are predominantly composed of evergreen rainforests, there are also areas with xerophytic or open shrubby vegetation in the sandy coastal plains and rocky outcrops. These abiotic features promote a considerable heterogeneity of habitats in the BAF, allowing the formation of different physiognomies and plant communities. Most of the hypotheses proposed to explain the origins of the high diversity and endemism in this area are based on allopatric speciation models, such as those built on Pleistocene Refuge Hypothesis (PRH) and riverine hypothesis. Here, we employed molecular data, species distribution modeling (SDM), and tests of niche equivalency and similarity (NES) using Pilosocereus arrabidae complex (P. arrabidae, P. ulei, P. brasiliensis subsp. brasiliensis, and P. brasiliensis subsp. ruschianus) as a biological model to address questions related to evolutionary history, dispersal barriers, and refuges of the dry areas within the BAF. We sequenced four molecular markers (1,514 bp) for 97 individuals. However, we failed to solve the shallow relationships between species and individuals, as well as to conduct population genetic analyses, due to the high level of saturation among the aligned loci. The NES and SDM analyses showed distinct niches for the P. brasiliensis subsp., despite the presence of a contact area between Rio de Janeiro and Espírito Santos states, while P. arrabidae and P. ulei displayed low niche overlap during the last 130 ka. The climatic oscillation events imposed a central-south distribution to this species in the present time. Here, we also observed a break in the region of Jequitinhonha and Contas river basins, a region that may work as an ecological barrier, affecting the species distribution. Overall, the P. arrabidae complex seems to be an important biological model for understanding the demography and diversification of taxa from dry areas of the BAF. The prospecting and use of Next Generation Sequencing (NGS) approaches, may be a promising strategy to evaluate biogeographic hypotheses in this study model. A Mata Atlântica Brasileira (BAF) é considerada um dos cinco principais hotspots do planeta. Ela estende-se pelas regiões litorâneas do leste do Brasil, do Paraguai e da Argentina, apresentando grande extensão geográfica, amplo gradiente de altitude, latitude e condições climáticas. Embora as suas paisagens sejam predominantemente compostas por florestas tropicais perenes, também existem áreas com vegetação xerofítica ou arbustiva aberta nas planícies costeiras arenosas e em afloramentos rochosos. Estas características abióticas promovem uma grande heterogeneidade de habitats, permitindo a formação de diferentes fisionomias e comunidades vegetais. As principais hipóteses propostas para explicar a origem da alta diversidade e endemismo nesta área baseiam-se principalmente em modelos de especiação alopátrica, como os Refúgios do Pleistoceno e modelos de diversificação de barreiras fluviais. Aqui, empregamos dados moleculares, modelagem de distribuição de espécies (SDM) e testes de equivalência e similaridade de nicho (NES) usando o complexo Pilosocereus arrabidae (P. arrabidae, P. ulei, P. brasiliensis subsp. brasiliensis e P. brasiliensis subsp. ruschianus) como modelo biológico para abordar questões relacionadas à história evolutiva, barreiras de dispersão e refúgios das áreas secas dentro da BAF. Sequenciamos quatro marcadores nucleares (1.514 pb) para 97 indivíduos. No entanto, a baixa variação observada nesses marcadores não foi suficiente para resolver as relações mais estreitas entre espécies e indivíduos, bem como realizar análises genéticas populacionais. As análises de NES e SDM mostraram que as subespécies de P. brasiliensis ocupam nichos distintos, enquanto P. arrabidae e P. ulei apresentaram baixa sobreposição de nicho durante os últimos 130 ka. Os eventos de oscilação climática impuseram uma distribuição centro-sul a este grupo na atualidade. Os modelos de SDM também mostraram uma quebra na região das bacias dos rios Jequitinhonha e Contas, região que pode funcionar como barreira ecológica, afetando a distribuição das espécies. No geral, o complexo P. arrabidae parece ser um importante modelo biológico para entender a demografia e diversificação de táxons de áreas secas do BAF. A prospecção e utilização de abordagens de Sequenciamento de Nova Geração (NGS) pode ser uma estratégia promissora para avaliar hipóteses biogeográficas neste modelo. CAPES: código de financiamento - 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Breast cancer is the major disease that affects women, especially the triple negative phenotype, which has the worst prognosis and metastatic potential. Included, metastasis is still the main cause of death in cancer patients and its development involves several stages and characters that play important roles, such as the tumor microenvironment and the extracellular matrix (ECM). Integrins also contribute to metastasis, especially the αvβ3 integrin whose overexpression is associated with every step in tumor progression. Among the molecules that interact with integrins, there are disintegrins, which are small proteins derived from snake venom metalloproteases. DisBa-01 (Disintegrin of Bothrops alternatus-01) is a recombinant protein derived from the Bothrops alternatus venom (urutu-cruzeiro) snake, which has a high affinity for this integrin. Thus, this work aimed to study the effects of silencing the β3 subunit in tumor cells of the triple negative breast adenocarcinoma cell line (MDA-MB-231). Therefore, the methods adopted involved the cell culture of human kidney embryonic (293FT) and wild and modified triple negative breast adenocarcinoma (MDA-MB-231) cell lines; production of ITGB3 shRNA lentivirus as well as target cell transduction and the validation of silencing by RTqPCR and immunofluorescence. We also verified possible alterations in the expression of other integrin subunits; functional assays (inhibition of adhesion, migration by wound healing and transwell), and the identification of metalloproteases (MMP) (MMP-2 and MMP-9). We compared the cellular responses of the silenced lineage with the action of DisBa-01 (1000 nM). The silencing took to a 69% reduction in ITGB3 mRNA and a 49% reduction in FN rich microenvironment, with an increase in β1, α1 and α5 subunits; increased adherence to FN (58%) and COL I (83%) proteins; decreased transwell migration (69% inhibition) and MMP-9, responses different from those obtained with DisBa-01. The generation of this new cell line opens perspectives for its use as a tool in future studies of the basic biology of breast cancer. O câncer de mama é a principal doença a acometer mulheres, especialmente o fenótipo triplo negativo, o qual apresenta o pior prognóstico por seu elevado potencial metastático. A metástase ainda consiste na principal causa de mortes de pacientes com câncer e seu desenvolvimento envolve várias etapas e personagens que desempenham papéis importantes, como o microambiente tumoral e a matriz extracelular (MEC). As integrinas, receptores de superfície celular que conectam as células à MEC, também contribuem para as metástases, destacando-se a integrina αvβ3 cuja superexpressão está associada a diversas etapas da progressão tumoral. Dentre as moléculas que interagem com integrinas, tem-se as desintegrinas que são pequenas proteínas derivadas de metaloproteases de peçonhas de serpentes. A DisBa-01 (Disintegrin of Bothrops alternatus-01) é uma proteína recombinante derivada da peçonha da serpente Bothrops alternatus (urutu-cruzeiro), que possui uma alta afinidade a integrina αvβ3. Assim, este trabalho teve como objetivo estudar os efeitos do silenciamento da subunidade β3 em células tumorais da linhagem celular de adenocarcinoma triplo negativo de mama (MDA-MB-231). Portanto, os métodos adotados envolveram o cultivo de linhagens de células embrionárias de rim humano (293FT) e de adenocarcinoma triplo negativo de mama (MDA-MB-231) selvagem e modificadas; produção de lentivírus shRNA ITGB3 bem como a transdução da célula alvo e a validação do silenciamento por RTqPCR e imunofluorescência. Também verificamos possíveis alterações na expressão de outras subunidades de integrinas; ensaios funcionais (inibição da adesão, migração por wound healing e transwell), e a identificação de metaloproteases de matriz (MMP) (MMP-2 e MMP-9). Confrontamos as respostas celulares da linhagem silenciada com a ação de DisBa-01 (1000 nM). O silenciamento levou a redução de 69% do mRNA ITGB3 e 49% da proteína em FN, com aumento das subunidades β1, α1 e α5; aumento da adesão a FN (58%) e COL I (83%); diminuição da migração transwell (69% de inibição) e da MMP-9, respostas essas, diferentes daquelas obtidas com a DisBa-01. A geração dessa nova linhagem celular abre perspectivas de seu uso como ferramenta em estudos futuros da biologia básica do câncer de mama. 88887.485864/2020-00

Em 13 de setembro de 1987 ocorreu em Goiânia, Goiás (Brasil) o maior acidente radiológico em área urbana, tendo como consequência a exposição humana, animal, vegetal e ambiental pelo Césio-137. Os efeitos mutagênicos sobre a linhagem germinativa de pessoas expostas à radiação ionizante são particularmente preocupantes, pois o risco de distúrbios hereditários pode ser aumentado. As Variantes de Nucleotídeo Único são a forma mais comum de variação genética humana e ocorrem em maior abundância em região não codificadora e nos últimos anos diversas tecnologias estão sendo desenvolvidas para identificar essas variantes. Uma destas tecnologias é o Sequenciamento de Nova Geração que oferecem maiores quantidades de dados, tempos de sequenciamento mais curtos e custos reduzidos. O objetivo deste trabalho é estabelecer espectro e frequência de substituições de base de novo de origem germinativa a partir de dados de sequenciamento de nova geração do trio, correspondendo a uma criança da geração F1 e seus pais biológicos, expostos acidentalmente à altas e baixas doses de RI de césio-137, contribuindo com o conhecimento sobre os efeitos biológicos de exposição à radiação ionizante. Considerando caso e controle foram incluídos os resultados de 38 progenitores, e uma prole de 14 filhos (as) nascidos do grupo exposto e 5 filhos da população não exposta. Os indivíduos expostos tiveram ~39% de incremento de média global de DMs comparado ao controle. As mães expostas tiveram ~44% de incremento de média global de DMs comparado ao controle. A mutação do tipo A:T>C:G foi a que demonstrou um maior aumento estatisticamente significativo de acontecer na prole dos indivíduos expostos. As frequências de substituição de transições foram mais altas do que as transversões nos filhos de casos e controles, porém a diferença não é estatisticamente significativa. Em conclusão, com a metodologia e os biomarcadores usados foi possível identificar a origem de mutação dos progenitores, como também o tipo de substituição e informar qual a variante que sofreu a mutação, foi possível ainda detectar a frequência da mutação de linhagem germinativa em DM o que possibilitou estudar retrospectivamente esta população exposta à RI. On September 13th, 1987, the largest radiological accident in urban areas occurred in Goiânia, Goiás (Brazil), resulting in human, animal, plant and environmental exposure by Cesium-137. The mutagenic effects on the germline of people exposed to ionizing radiation are of particular concern, as the risk of inherited disorders can be increased. Single Nucleotide Variants are the most common form of human genetic variation and occur in greater abundance in a non-coding region and in recent years, several technologies have been developed to identify these variants. One of these technologies is Next-Generation Sequencing, which offers greater amounts of data, shorter sequencing times and reduced costs. The objective of this work is to establish the spectrum and frequency / rate of base de novo substitutions of germ origin from the trio's new generation sequencing data, corresponding to an F1 generation child and his biological parents, accidentally exposed to high and low doses of IR of cesium-137, contributing to knowledge about the biological effects of exposure to ionizing radiation. Considering case and control, the results of 38 parents, and an offspring of 14 children born from the exposed group and 5 children from the unexposed population were included. Exposed individuals had ~39% increase in global mean DMs compared to controls. Exposed mothers had ~44% increase in global mean DMs compared to controls. The A:T>C:G mutation was the one that showed the greatest statistically significant increase in occurrence in the offspring of exposed individuals. Transition replacement rates were higher than transversions in the offspring of cases and controls, but the difference is not statistically significant. In conclusion, with the methodology and biomarkers used, it was possible to identify the origin of mutation in the parents, as well as the type of substitution and to inform which variant was mutated, it was also possible to detect the frequency of the germline mutation in DM which made it possible to retrospectively study this population exposed to IR. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Fundação Araucária de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do Paraná (FAADCT/PR) Loricariidae includes species vulgarly known as armored catfishes. Cytogenetic data revealed wide chromosomal diversity in this family, resulted from both diploid number (2n) variation, because of centric fusion events, and structural chromosomal rearrangements, such as inversions, centromeric repositioning and translocations. The chromosomal rearrangements found in Loricariidae are associated with double strand DNA breaks at sites rich in repetitive sequences. The instability present in these regions is described as “evolutionary breakpoint regions” (EBRs), which are considered hotspots for chromosomal rearrangements, and would be involved with the 2n reduction in the group. However, there are still few studies that sought to characterize the unstable chromosomal sites that generate karyotypic evolution in Loricariidae. Previous studies with Rineloricaria showed that these sites were located in rDNAs clusters, or at adjacent areas. Thus, this work aimed to identify and characterize the DNA sequences present in sites prone to chromosomal breaks, aiming to understand the molecular mechanism of chromosomal rearrangements and karyotypic diversity present in Loricariidae specimens. In the present study, we analyzed 95 specimens belonging to two subfamilies: Hypostominae (Ancistrus aguaboensis 2n = 50; Ancistrus cf. multispinis 2n = 52) and Loricariinae (Rineloricaria latirostris 2n = 46 and 48; Rineloricaria pentamaculata 2n = 54, 55 and 56), collected in different hydrographic basins in the South, Southeast and Central west of Brazil. Classical and molecular cytogenetic techniques were used, such as comparative in situ hybridization of 5S and 18S ribosomal genes (rDNA), telomeric sequence (TTAGGG)n, single repeat sequences ((A)30, (CA)15, (GA)15, (CAT)10 and (CGG)10), in addition to the analysis of genomic data provided by Next-Generation Sequencing (NGS). The results obtained revealed that Ancistrus cf. multispinis (2n = 52 chromosomes) presents a karyotype considered basal for Ancistrini, while A. aguaboensis has 2n = 50 (first karyotypic description), resulting from Robertsonian fusion (Rb) events, triggered by double strand breaks and rearrangements at sites of rDNA 5S, corroborating previously data found in other species of the group. For R. latirostris, we obtained the repetitive fraction for the recognition of microsatellite sequences present in regions previously described as chromosomal fusion points. It was found that repetitive sequences such as rDNAs, hAT transposon, and microsatellite units are present in flanking regions of chromosome breakage sites in R. latirostris, and because they contain sites of paralogous sequences present in non-homologous chromosomes, these sequences may have acted as facilitators of Rb fusion events present in this group. Furthermore, the involvement of acrocentric chromosomes in Rb fusion events was discussed, with the participation of 5S rDNA and microsatellites, which culminated in the emergence of a numerical chromosomal polymorphism observed in specimens of R. pentamaculata from the Barra Grande River (2n = 54 to 56). The data presented for Rineloricaria corroborate studies that suggested that the 2n reduction is resulted from Rb fusion, with the decrease of subtelo/acrocentric chromosomes and the consequent formation of metacentric chromosomes, with or without ITS vestiges. In summary, it was demonstrated the accumulation of repetitive DNAs present in regions of chromosomal breaks and their potential involvement with the extensive chromosomes observed in Loricariidae, impacting the diversity and karyotypic evolution of the group. Loricariidae abrange espécies de peixes conhecidos popularmente como cascudos. Dados citogenéticos da família revelam ampla diversidade cromossômica, decorrente tanto da variação do número diploide (2n), resultante de eventos de fusão cêntrica, quanto de rearranjos cromossômicos estruturais, tais como inversões, reposicionamento centromérico e translocações. Os rearranjos cromossômicos encontrados em Loricariidae estão associados a quebras do DNA em sítios ricos em sequências repetitivas. A instabilidade de tais regiões é descrita como “pontos de quebra evolutiva” (do inglês, evolutionary breakpoint regions - EBRs), os quais são considerados hotspots para rearranjos cromossômicos, e estariam envolvidos com a redução do 2n no grupo. Porém, ainda são poucos os estudos que buscaram caracterizar os sítios cromossômicos instáveis geradores da evolução cariotípica em Loricariidae. Estudos prévios com Rineloricaria evidenciaram que estes sítios estão localizados em clusters de rDNAs, ou adjacentes a eles. Assim, este trabalho teve como objetivos a identificação e a caracterização das sequências de DNA presentes em sítios propensos a quebras cromossômicas, visando o entendimento do mecanismo molecular dos rearranjos cromossômicos e da diversidade cariotípica em espécimes de Loricariidae. No presente estudo, foram analisados 103 exemplares pertencentes a duas subfamílias: Hypostominae (Ancistrus aguaboensis 2n = 50; Ancistrus cf. multispinis 2n = 52) e Loricariinae (Rineloricaria latirostris 2n = 46 e 48; Rineloricaria pentamaculata 2n = 54, 55 e 56), coletadas em diferentes bacias hidrográficas da região sul, sudeste e centro oeste do Brasil. Foram utilizadas técnicas de citogenética clássica e molecular, como a hibridização in situ comparativa dos genes ribossomais (DNAr) 5S e 18S, sequência telomérica (TTAGGG)n, sequências de repetição simples ((A)30, (CA)15, (GA)15, (CAT)10 e (CGG)10), além da análise de dados genômicos fornecidos por sequenciamento de Next-generation (NGS). Os resultados obtidos revelaram que Ancistrus cf. multispinis (2n = 52 cromossomos) apresenta cariótipo tido como basal para Ancistrini, enquanto A. aguaboensis possui 2n = 50 (primeira descrição cariotípica), decorrente de eventos de fusão Robertsoniana (Rb), desencadeada por quebras na dupla fita e rearranjos em sítios de rDNA 5S, corroborando com dados encontrados previamente em outras espécies do grupo. Para R. latirostris, obtivemos a fração repetitiva para o reconhecimento das sequências de microssatélites presentes em regiões previamente descritas como pontos de fusão cromossômica. Foi constatado que as sequências repetitivas tais como os rDNAs, transposon hAT, e unidades de microsatélites flanqueiam as regiões de quebras cromossômicas em R. latirostris, e por conterem sítios de sequências parálogas em cromossomos não homólogos, estas podem ter atuado como facilitadores dos eventos de fusão Rb presente neste grupo. Ainda, foi discutido o envolvimento de cromossomos acrocêntricos em eventos de fusão Rb, com a participação de rDNA 5S e microssatélites, que culminaram no surgimento de um polimorfismo cromossômico numérico observado em exemplares de R. pentamaculata do rio Barra Grande (2n = 54 a 56). Os dados apresentados para Rineloricaria corroboram com estudos que sugerem que a redução do 2n se daria por fusão Rb, quando são observadas a diminuição de cromossomos subtelo/acrocêntricos e consequente formação de cromossomos metacêntricos, com ou sem vestígios de ITS. Em resumo, foi demonstrado o acúmulo de DNAs repetitivos presentes em regiões de quebras cromossômicas e seu potencial envolvimento com os extensos cromossômicos observados em Loricariidae, impactando na diversidade e evolução cariotípica do grupo. Processo n° 001- CAPES Processo n° 2017/24695-9, FAPESP

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Pesquisa do Estado do Amazonas CAPES - Coordena????o de Aperfei??oamento de Pessoal de N??vel Superior CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient??fico e Tecnol??gico Introduction: Genetic strategies have been used for decades, improving bacterial bioprocesses aimed at simplifying and costing the production of recombinant proteins. Such strategies include the design of efficient expression vectors and the improvement of bacterial strains, in this context, the promoters are elements of an expression vector that determine the strength and duration of the transcription, and consequently, the yield of the hertoiseprotein to be produced. Bacterial promoters are recognized by sigmas factors, which are proteins that engage rna polymerase to perform transcription. Sigma s factors are connected to the promoters that respond to various environmental conditions that the cell faces, among them the best known are the sigmas factors 70 and 38, which recognize exponential and stationary phase promoters of the cell. Goal: Design, cloning and analysis of synthetic promoters recognized by sigmas factors ??70 and ??38 in Escherichia coli. Material and Methods: From the knowledge of the consensual elements of the promoters, recognized by the sigma factors 70 and 38 of Escherichia coli, an oligonucleotide was planned where the most important consensual regions of the two types of promoters were maintained and the sequences of adjacent regions that could influence the strength and specificity of the promoters were degenerated. A partially degenerated oligonucleotide of 95 nucleotides was synthesized by chemical synthesis, amplified with a pair of primers located on its edges. The resulting amplicon was digested with the restriction enzymes SpeI and NdeI, purified by electrophoresis in 2% agarose gel, eluided and cloned between the SpeI and NdeI sites of the pCDM plasmid, thus used as a hunting vector that contains the GFP gene as a reporter. The recombinant colonies were chosen according to the production intensity of PFM, initially with the naked eye, later by fluorimetry to quantify the production. The synthetic promoters of the clones chosen at this stage were sequenced and analyzed. Results and Discussion: A library with 1,741,824 sequence possibilities constructed by chemical synthesis was produced in E. coli. From a cloning, about 1200 recombinant clones containing different promoters were obtained, at an initial screening 66 gfp-producing clones were chosen, and after confirmation of containing synthetic promoters, the expression of PFM was performed in liquid medium. 16 clones were elected: 5 that express low levels of PFM, 5 medium levels and 6 high levels; some of them are capable of acting in the exponential phase of growth, others in the stationary phase and some in both phases. The new promoters of the 16 clones chosen were sequenced and analyzed to identify the consensus regions ??? 10, -10 extended and -35. We also analyzed the non-consensual regions that were degenerated, as well as the intensity of PFM expression. Some promoters were modified in the spacing between position -10 and -35 and in one of the clones the region -35 was modified. Clones J8, J13 and J14 produced high levels of PFM with more than 900,000 fluorescence units, and clones J1, J2 and J3 produced less PFM of all clones analyzed. Through this strategy it was possible to obtain promoters of different forces and express themselves in different phases of cell growth, and some have surprisingly high levels of expression with possible applications in gene expression for industrial purposes. Introdu????o: Estrat??gias gen??ticas t??m sido utilizadas por d??cadas, melhorando os bioprocessos bacterianos visando a simplifica????o e custo da produ????o de prote??nas recombinantes. Tais estrat??gias incluem o desenho de vetores de express??o eficientes e a melhoria das linhagens bacteriana, neste contexto, os promotores s??o elementos de um vetor de express??o que determinam for??a e dura????o da transcri????o, e consequentemente, o rendimento da prote??na heter??loga a ser produzida. Os promotores bacterianos s??o reconhecidos pelos fatores sigmas, que s??o prote??nas que se acoplam a RNA polimerase para realizar a transcri????o. Os fatores sigmas se ligam aos promotores que respondem a diversas condi????es ambientais que a c??lula enfrenta, dentre eles os mais conhecidos s??o os fatores sigmas 70 e 38, que reconhecem promotores de fase exponencial e estacion??ria da c??lula. Objetivo: Design, clonagem e an??lise de promotores sint??ticos reconhecidos pelos fatores sigmas ??70 e ??38 em Escherichia coli. Material e M??todos: A partir do conhecimento dos elementos consensuais dos promotores, reconhecidos pelos fatores sigma 70 e 38 de Escherichia coli, planejou-se um oligonucleot??deo onde mantinham-se as regi??es consensuais mais importantes dos dois tipos de promotores e foram degeneradas as sequ??ncias de regi??es adjacentes que poderiam influenciar na for??a e especificidade dos promotores. Um oligonucleot??deo parcialmente degenerado de 95 nucleot??deos foi sintetizado por s??ntese qu??mica, amplificado com um par de primers localizados em suas bordas. O amplicon resultante foi digerido com as enzimas de restri????o SpeI e NdeI, purificado por eletroforese em gel de agarose 2%, eluido e clonado entre os s??tios de SpeI e NdeI do plasm??deo pCDM, dessa forma utilizado como um vetor ca??a promotor que cont??m o gene da GFP como rep??rter. As col??nias recombinantes foram escolhidas de acordo com a intensidade de produ????o da GFP, inicialmente a olho nu, posteriormente por fluorimetria para quantificar a produ????o. Os promotores sint??ticos dos clones escolhidos nessa etapa foram sequenciados e analisados. Resultados e Discuss??o: Produziu-se em E. coli, uma biblioteca com 1.741.824 possibilidades de sequ??ncias constru??das por s??ntese qu??mica. A partir de uma clonagem, foram obtidos cerca de 1200 clones recombinantes contendo diferentes promotores, em uma triagem inicial foram escolhidos 66 clones produtores de GFP, e ap??s a confirma????o de conterem promotores sint??ticos foi feita a an??lise da express??o de GFP em meio l??quido. Foram eleitos 16 clones: 5 que expressam baixos n??veis de GFP, 5 n??veis m??dios e 6 altos n??veis; sendo alguns deles capazes de atuar na fase exponencial de crescimento, outros na fase estacion??ria e alguns em ambas as fases. Os novos promotores dos 16 clones escolhidos foram sequenciados e analisados para identificar as regi??es consenso ??? 10, -10 estendidas e -35. Analisou-se tamb??m as regi??es n??o consensuais que foram degeneradas, bem como a intensidade de express??o de GFP. Alguns promotores foram modificados no espa??amento entre a posi????o -10 e a -35 e em um dos clones foimodificada a regi??o -35. Os clones J8, J13 e J14 produziram altos n??veis de GFP com mais de 900.000 unidades de fluoresc??ncia, e os clones J1, J2 e J3 foram os que produziram menos GFP de todos os clones analisados. Por essa estrat??gia foi poss??vel obter promotores de diferentes for??as e que se expressam em diferentes fases do crescimento celular, sendo que alguns apresentam n??veis de express??o surpreendentemente altos com poss??veis aplica????es na express??o g??nica para fins industriais.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) As consequence of the recent occurrence of the disease known as Olive Quick Decline Syndrome (OQDS), caused by Xylella fastidiosa subsp. pauca (Xf-p), in olive trees (Olea europaea) there is a lack of scientific information about the biology of this pathogen in olive trees that can help to understand this pathogen and support discussions about management strategies. From these numerous gaps in the practical knowledge of this pathogen, this work has as objectives: 1. to evaluate the occurrence of vertical transmission of the bacterium; 2. to determine the distribution of Xf-p in plants with different degrees of severity; and 3. to establish a low-cost diagnostic method with the possibility of execution "in farm". Olive branches taken from an asymptomatic plant, but infected with Xf-p, were propagated in a greenhouse and the resulting seedlings were analyzed for the presence of the pathogen by real-time quantitative PCR (q-PCR). The estimated vertical transmission rate at 32 months was 57.74% (41 of 71 nursery plants) and only one plant of the 28 Xf-p-infected (0.014%) showed symptoms of OQDS. To achieve the second objective, samples from 3 plants of the cultivar 'Grapollo' showing low OQDS severity (only one branch with symptoms) and one with symptoms generalized throughout the canopy (high severity) were collected at different positions in the canopy and root system and analyzed for the presence of Xf-p by qPCR. Even under conditions of low ORDS severity positive diagnoses for Xf-p were obtained between 30% and 57% of the samples collected on asymptomatic branches, while on symptomatic branches 77% of the samples were positive. On the other hand, in plants with high incidence of OQDS 82 to 100% of samples were positive. Finally, the diagnostic method based on printing of branch extracts on nitrocellulose membranes and identification of Xf-p by serology (Tissue-Print: TP - objective 3) showed promise, but with needs for improvement since the agreement of the results between TP and qPCR techniques was only slightly partial (K = 0.01 to 0.20) according to the Cohen-Kappa index. Face a recente ocorrência da doença conhecida como Dessecamento Foliar das Oliveiras (DFO), causada por Xylella fastidiosa subsp. pauca (Xf-p), em oliveiras (Olea europaea) existe uma carência de informações científicas quanto a biologia deste patógeno em oliveira e que possam auxiliar no entendimento desse patossistema em suporte as discussões sobre estratégias de manejo. A partir dessas inúmeras lacunas sobre o conhecimento de ordem prática desse patossistema, este trabalho tem como objetivos; 1. avaliar a ocorrência de transmissão vertical da bactéria; 2. determinar a distribuição da Xf-p em plantas com diferentes graus de severidade; e 3. estabelecer um método de diagnóstico de baixo custo e com a possibilidade de execução "in farm". Ramos de oliveira retirados de uma planta assintomática, porém infectada com Xf-p, foram propagados em casa- de-vegetação e as mudas oriundas analisadas para presença do patógeno através de PCR quantitativo em tempo real (q-PCR). A taxa de transmissão vertical estimada aos 32 meses foi de 57,74% (41 de 71 mudas) e somente em uma planta das 28 positivas (0,014%) foi observado sintomas da DFO. Para se atingir o segundo objetivo, amostras de 3 plantas da cultivar “Grapollo” apresentando baixa severidade da DFO (apenas um ramo com sintomas) e uma com sintomas generalizados por toda a copa (alta severidade) foram coletadas em diferentes posições da copa e do sistema radicular e analisadas para a presença de Xf-p através de qPCR. Mesmo em condições de baixa severidade da DFO diagnósticos positivos para Xf-p foram obtidos entre 30 a 57% das amostras coletadas em ramos assintomáticos, enquanto que nos ramos sintomáticos 77% das amostras foram positivas. Por outro lado, em plantas com alta incidência da DFO 82 a 100% das amostras foram positivas. Finalmente, o método de diagnóstico baseado em impressões de estratificação de ramos em membranas de nitrocelulose e identificação de Xf-p por meio de serologia (Tissue-Print: TP - objetivo 3) mostrou-se promissor, porém com necessidades de aprimoramento uma vez que a concordância dos resultados entre as técnicas de TP e qPCR foi apenas levemente parcial (K = 0,01 a 0,20) segundo o índice de Cohen-Kappa.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Harttia genus comprises a fish group widely distributed in hydrographic basins of South America. In the cytogenetic point of view, present large karyotypic variation, including an extensive variation in position of ribosomal DNA, B chromosome presence and diversified sex chromosome systems. It is proposed the occurrence of chromosomal instability sites present on the genome of this species could lead the DNA double strand breaks, which trigger these chromosomal rearrangements. Thus, this work aimed to analyze rearrangements and the chromosome involved on karyotypic differentiation in Harttia species, as well the accumulation of repetitive sequence in these regions. Ten species were collected in different hydrographic basins of south, southeast and middlewest regions, including two new not described species. Firstly, classical, and molecular cytogenetic tools were used, including in situ hybridization of ribosomal genes and telomeric sequences, in addition to comparative genomic hybridization essays. The results reveal two new cases occurrence of multiple sex chromosome XX/XY1Y2, besides of new not described species with the highest diploid number founded in the genus. In the investigation of chromosomal rearrangements, was used the microdissection and whole chromosome painting techniques. Were isolated six different chromosomes: 25 (X1) and 26 (X2) from H. punctata, 9 and X (pair 1) chromosome from H. carvalhoi, X chromosome (pair 1) from H. intermontana and chromosome 1 from H. torrenticola. The chromosome painting results using the X1 and X2 probes indicated several chromosomal rearrangements occurred during the diversification of Harttia species from south and southeast regions. With these results, was possible detect that chromosomal breakpoint regions are located inside or surrounding the ribosomal DNA sites in Harttia genome, and these sites triggered several events of chromosomal remodeling. The chromosome painting results obtained with X chromosome probes and chromosome 9 of H. carvalhoi showed that fusion centric events were responsible for the origin of these chromosomes and for decrease in diploid number variation in this lineage. The chromosome 1 of H. torrenticola demonstrated high homeology to chromosome X of H. carvalhoi. Although with similar morphology, the X chromosome of H. intermontana arise from a translocation event between X and autosome (chromosome 9 of H. carvalhoi) besides the identification of other chromosomal rearrangements that triggered the repositioning of homeology blocks on the karyotype of this species. Furthermore, demonstrated two different types of multiple sex chromosome systems founded in the genus, had independent evolutive origin. About the investigation of repetitive sequences associated with this instability regions, were mapped microsatellite sequences and analyzed regarding to the accumulation in chromosomal rearrangements occurred regions. It was observed an enrichment of different sequences in double strand break region. Although a genomic characterization can be necessary to identify the instable sites, the results obtained point to double strand breakpoints in Harttia genome and reaffirm the high karyotypic plasticity in the genus. O gênero Harttia (Siluriformes: Loricariidae) compreende um grupo de peixes amplamente distribuído em bacias hidrográficas da América do Sul. Do ponto de vista citogenético, apresenta ampla variação cariotípica, incluindo uma extensa variação na posição dos sítios de DNAs ribossômicos, a presença de cromossomos supranumerários e de sistemas de cromossomos sexuais diversificados. Acredita-se que a ocorrência de sítios de instabilidade cromossômica presentes no genoma destas espécies tem levado a quebras de dupla fita de DNA, as quais desencadearam esses rearranjos cromossômicos. Assim, este trabalho teve como objetivo analisar os rearranjos e os cromossomos envolvidos na diferenciação cariotípica de espécies de Harttia, bem como a organização de sequências repetitivas próximas a essas regiões. Para isso, foram utilizadas dez espécies coletadas em diferentes bacias hidrográficas da região sul, sudeste e centro oeste do Brasil, incluindo duas novas espécies ainda não descritas na literatura. Na etapa inicial foram utilizadas ferramentas de citogenética clássica e molecular incluindo hibridização in situ de genes ribossômicos e sequência telomérica, além de ensaios de hibridização genômica comparativa. Os resultados revelaram a ocorrência de dois novos casos do sistema de cromossomos sexuais múltiplos XX/XY1Y2, além de uma espécie não descrita com o número diploide mais alto já encontrado para o gênero. Na investigação dos rearranjos cromossômicos foi utilizada a técnica de microdissecção e pintura cromossômica total. Foram isolados seis cromossomos diferentes: 25 (X1) e 26 (X2) de H. punctata, 9 e X (par 1) de H. carvalhoi, cromossomo X (par 1) de H. intermontana e cromossomo 1 de H. torrenticola. Os dados de pintura cromossômica utilizando as sondas X1 e X2 indicaram uma série de rearranjos cromossômicos ocorridos durante a diversificação de Harttia da região sul e sudeste. Com esses resultados foi possível detectar que pontos de quebras cromossômicas podem estar localizados dentro ou adjacentes aos sítios de DNAs ribossômicos nos genomas de Harttia, e que esses sítios desencadearam inúmeros eventos de remodelação cromossômica. Já os resultados de pintura cromossômica comparativa obtidos com as sondas do cromossomo X e do cromossomo 9 de H. carvalhoi mostraram que eventos de fusão cêntrica foram responsáveis pela origem desses cromossomos e pela diminuição do número diploide nessa linhagem. O cromossomo 1 de H. torrenticola demonstrou alta homeologia ao cromossomo X de H. carvalhoi. Por sua vez, embora com morfologia similar, o cromossomo X de H. intermontana foi oriundo de uma translocação entre X e autossomo (cromossomo 9 de H. carvalhoi), além da identificação de outros rearranjos cromossômicos que desencadearam o reposicionamento de blocos homeólogos no cariótipo dessa espécie. Além disso, demonstrou-se também que os dois diferentes sistemas de cromossomos sexuais múltiplos encontrados no gênero tiveram origem evolutiva independente. A respeito da investigação de sequências repetitivas associadas a essas regiões de instabilidade, foram mapeadas sequências microssatélites e analisadas quanto ao acúmulo em regiões onde ocorreram rearranjos cromossômicos. Foi observado um enriquecimento de sequências em regiões de quebra de dupla fita. Embora uma caracterização genômica em Harttia possa ser necessária para identificar os sítios instáveis, os resultados obtidos indicam para pontos de quebra de dupla fita no genoma de Harttia e reafirmam a ampla diversidade cariotípica no gênero. CAPES: Código de Financiamento 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Brazilian wine production has been standing out with high quality awarded wines around the world. However, major changes are still needed so that our country can compete with other wineries in the world. Among them, we can highlight the use of selected yeasts adapted to grapes planted in Brazilian soil. So that they can, in addition to metabolizing the sugars present in the grapes, produce primary and secondary metabolic compounds crucial for the elaboration of a typical premium quality wine. In the Brazilian market there are only commercial yeast strains acquired from international suppliers, due to Brazil does not have this resource. The use of these commercial yeasts in the winemaking process does not provide the wine with its own organoleptic characteristics, since these strains, because they are not selected on Brazilian soil, do not have the adapted metabolic pathways necessary to increase the typicality of local wines. Observing this scenario, the present project followed the dynamics of microorganisms during 3 harvests/production both in the vines and during the fermentation process, in a winery in the region of Amparo-SP, aiming at the selection of native yeasts to act as initiators (starters) in the fermentation process. A similar process was carried out on a laboratory scale in January 2019 using the must grape that was being vinified at the winery in order to compare both fermentation processes. Through this monitoring, we isolated 406 yeasts from both processes, being 347 non-Saccharomyces yeasts that, after sequencing the ITS region, we identified that they were distributed in 23 different species and 65 Saccharomyces. When performing genotyping analyzes on these isolated Saccharomyces strains, 5 they were shown to be different from each other and also different from the commercial strains commonly used for wine production in Brazil. Therefore, they are new isolated strains. The other strains showed the same amplification profile of the commercial strains and the 5 new identified strains. The analyses also verified that the isolated Saccharomyces strains isolated in the winery environment actively participated in the fermentation process. These new strains were submitted to physiological analyzes to verify their capacity and performance in wine production. In all analyzes realized, they showed performance equal to or superior to that of commercial strains. These strains would already be naturally more adapted to the fermentation process and could bring peculiar characteristics to the production of wines, contributing to the elaboration of a distinct drink. In addition, an understanding of the yeast microbiota present both in the winery and in the fermentation process can help to better understand the succession dynamics of these microorganisms, being an important element in the characterization of the national wine’s terroir, thus preserving its historical identity, quality and geographical origin. A produção de vinho no Brasil vem se destacando com vinhos de alta qualidade premiados ao redor do mundo. No entanto, ainda são necessárias grandes mudanças para que nosso país possa competir com outras vinícolas no mundo. Dentre elas, pode-se destacar o uso de leveduras selecionadas e adaptadas às uvas plantadas em solo brasileiro. De modo que possam, além de metabolizar os açúcares presentes nas uvas, também produzirem compostos metabólicos primários e secundários cruciais para a elaboração de um vinho típico de qualidade premium. No mercado brasileiro encontra-se apenas cepas de leveduras comerciais adquiridas de fornecedores internacionais, já que o Brasil não dispõe deste recurso. O uso destas leveduras comerciais no processo de vinificação não proporciona ao vinho característica organoléptica próprias, uma vez que essas cepas, por não serem selecionadas em solo brasileiro, não possuem as vias metabólicas adaptadas e necessárias para aumentar a tipicidade dos vinhos locais. Observando este cenário o presente projeto acompanhou a dinâmica de microrganismos, durante 3 colheitas/produção tanto nas videiras como durante o processo fermentativo, em uma vinícola da região de Amparo-SP, visando a seleção de leveduras nativas para atuar como iniciadoras (starters) no processo fermentativo. Um processo similar foi realizado em escala laboratorial em janeiro de 2019 utilizando o mosto que estava sendo vinificado na vinícola com o intuito de comparar ambos processos fermentativos. Através deste monitoramento isolamos 406 leveduras, sendo, 347 leveduras não-Saccharomyces que após sequenciamento da região ITS identificamos que estavam distribuídas em 23 diferentes espécies e 65 Saccharomyces. Ao realizar as análises de genotipagem nestas linhagens de Saccharomyces isoladas, 5 demonstraram serem diferentes entre si e também diferentes das linhagens comerciais comumente utilizadas para a produção de vinhos no Brasil. Sendo, portanto, novas linhagens isoladas. As demais linhagens apresentaram o mesmo perfil de amplificação das cepas comerciais e das 5 novas cepas identificadas. Partindo dessas análises verificamos também que as linhagens de Saccharomyces isoladas no ambiente vitivinícola participavam ativamente do processo fermentativo. Estas novas linhagens, foram submetidas a análises fisiológicas para verificar sua capacidade e desempenho na produção de vinhos. Em todas as análises realizadas elas demonstraram desempenho igual e em alguns casos superior ao das cepas comerciais. Essas linhagens já seriam naturalmente mais adaptadas ao processo fermentativo e poderiam trazer características peculiares para a produção de vinhos, contribuindo para a elaboração de uma bebida distinta. Além disso, um entendimento da microbiota de leveduras presente tanto na vinícola quanto no processo fermentativo pode auxiliar em um melhor entendimento da dinâmica de sucessão destes microrganismos, sendo um elemento importante na caracterização do terroir do vinho nacional, preservando-se assim sua identidade histórica, qualidade e procedência geográfica. Processo nº 88882.426729/2019-01 (Migrado - SACPAIS) - CAPES

Submitted by Concluinte Mestrado (concluinte.mestrado@setor.uepb.edu.br) on 2022-04-07T00:34:01Z No. of bitstreams: 2 PDF - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 1860269 bytes, checksum: 3c2e7f1b2eb85f517fcf172b50af8544 (MD5) Termos BDTD - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 302893 bytes, checksum: b3d1628ce59931b582002bb1f3109e0e (MD5) Approved for entry into archive by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2022-04-07T19:03:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 PDF - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 1860269 bytes, checksum: 3c2e7f1b2eb85f517fcf172b50af8544 (MD5) Termos BDTD - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 302893 bytes, checksum: b3d1628ce59931b582002bb1f3109e0e (MD5) Made available in DSpace on 2022-04-11T11:29:46Z (GMT). No. of bitstreams: 2 PDF - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 1860269 bytes, checksum: 3c2e7f1b2eb85f517fcf172b50af8544 (MD5) Termos BDTD - Clarissa Maria Cardoso Guimarães.pdf: 302893 bytes, checksum: b3d1628ce59931b582002bb1f3109e0e (MD5) Previous issue date: 2022-02-25 Breast cancer (BC) is considered as a set of diseases that, at the molecular and cellular level, differ as a neoplasm of world disease and mortality between the world and Brazilian female population. In Brazil, it is estimated for the triennium 2020-2022, according to the National Cancer Institute (INCA), about 61.61 cases per 100,000 women, while in Paraíba there are 52.93 new cases per 100,000 women. The molecular classification characterizes the molecular subtypes of BC by the presence or absence of hormone receptors for estrogen (ER) and progesterone (PR), human epidermal growth factor (HER-2) and proliferative marker Ki-67. The present control study aimed to identify MC risk factors in a population of 313 cases and 321 controls and the differential association of risk factors with Triple Negative MC (TN) and other molecular subtypes. This is a study with an analytical approach and epidemiological evaluation carried out at the Hospital da Fundação Assistencial da Paraíba (FAP) in February 2020, December and March 2021, with data from users diagnosed with breast cancer and undergoing local treatment. A specific one was used for the evaluation of graphic, socioeconomic variables; family and clinical history, life habits and the practice of physical activity. A statistical analysis, using Fisher's exact test and Pearson's chi-square (χ2) to evaluate as categorical variables, and Wilcoxon's Nonparametric Student's T test on continuous variables. To quantify the associations between risk factors for BC, multinomial logistic regression analysis was applied. Control data served as a reference group. Results were presented as odds ratios (ORs), 95% confidence intervals (CIs) and p-values of likelihood ratio tests. Altogether, 145 (51.2%) of the 283 patients had advanced stage (III and IV) of the disease. Ki67 expression was detected on average in 60.80% of the triple negative (TN) tumor cells and 25 (61.0%) of them were grade III tumors (p

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) The biodiversity of the Neotropics remains poorly understood, and although allopatry is one of the main factors that promote speciation, chromosomal rearrangements and the evolution of sex chromosomes can also play important roles. Chromosomal rearrangements involving sex chromosomes have the potential to reduce introgression events and facilitate reproductive isolation. Thus, the objective of this work was to analyze the influence of allopatry, chromosomal rearrangements and the presence of multiple sex chromosome systems on the genetic diversification of the Neotropical fish species Hoplias malabaricus and Erythrinus erythrinus through cytogenetic and genomic analyses. We analyzed sympatric and allopatric populations that differ by i) chromosomal characteristics (named karyomorphs), ii) sympatric versus allopatric distributions, and iii) presence and absence of heteromorphic sex chromosomes. Altogether, 10 localities of H. malabaricus were analyzed that presented six distinct karyomorphs and three localities of E. erythrinus with two distinct karyomorphs. The different karyomorphs showed variations both in the number of chromosomes and in the presence or absence of multiple sex chromosome systems. The results indicated that although karyomorphs represent genetically divergent groups, they can be better understood when analyzed in conjunction with their geographic distribution and environmental conditions. The multiple X1X2Y sex chromosome system, present in one of the karyomorphs of both species, was associated with greater interpopulation genetic differentiation compared to the effect of allopatry. For H. malabaricus, the presence of such a multiple system may have contributed to levels of genetic differentiation between karyomorphs A and D in syntopy equivalent to the levels of differentiation of allopatric populations of karyomorph A. In general, the results for both species suggest that the presence of neo sex chromosome systems may have contributed to the emergence and fixation of interpopulational differences, which may have contributed significantly to the emergence and fixation of reproductive isolation. Thus, one of the hypotheses is that the occurrence of chromosomal rearrangements, especially those related to sex chromosomes, may have accelerated the speciation process for these species and amplified the differentiation resulting from allopatry. A biodiversidade da região Neotropical ainda permanece pouco compreendida, e, embora a alopatria seja um dos principais fatores que favorecem a especiação, os rearranjos cromossômicos e a presença de cromossomos sexuais heteromórficos também podem desempenhar papéis importantes. Os rearranjos cromossômicos envolvendo cromossomos sexuais tem o potencial de reduzir eventos de introgressão e facilitar o isolamento reprodutivo. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a influência da alopatria, dos rearranjos cromossômicos e da presença de sistemas de cromossomos sexuais múltiplos na diversificação genética das espécies de peixes Neotropicais Hoplias malabaricus e Erythrinus erythrinus por meio de análises citogenéticas e genômicas. Analisamos populações simpátricas e alopátricas que diferem por suas i) características cromossômicas (denominadas cariomorfos), ii) distribuições simpátricas versus alopátricas e iii) presença e ausência de cromossomos sexuais heteromórficos. Ao todo, foram analisadas 10 localidades de H. malabaricus que apresentaram 6 cariomorfos distintos e 3 localidades de E. erythrinus com 2 cariomorfos distintos. Os diferentes cariomorfos apresentaram variações tanto em número de cromossomos, quanto em presença ou ausência de sistemas de cromossomos sexuais simples e múltiplos. Os resultados indicaram que apesar dos cariomorfos representarem grupos geneticamente divergentes, eles podem ser melhor compreendidos quando analisados em conjunto com sua distribuição geográfica e condições ambientais. O sistema de cromossomos sexuais múltiplos X1X2Y, presente em um dos cariomorfos de ambas as espécies, se mostrou associado a uma maior diferenciação genética interpopulacional. Para H. malabaricus, a presença de tal sistema sexual pode ter contribuído para níveis de diferenciação genética entre os cariomorfos A e D em sintopia equivalentes aos níveis de diferenciação de populações alopátricas do cariomorfo A. De maneira geral, os resultados de ambas as espécies sugerem que a presença de sistemas de cromossomos neo-sexuais pode ter contribuído para o surgimento e fixação de diferenças interpopulacionais, que podem ter contribuído de forma relevante para o surgimento e manutenção do isolamento reprodutivo. Desta forma, uma das hipóteses é de que a ocorrência de rearranjos cromossômicas, especialmente os relacionados aos cromossomos sexuais, podem ter contribuído para o processo de especiação para estas espécies e amplificado a diferenciação advinda da alopatria Processo n 2019/25009-7, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) The filamentous and saprophytic fungus Aspergillus fumigatus is the main causative pathogen of invasive pulmonary aspergillosis (API) in immunocompromised individuals. One of its most important determinants of virulence is the thermotolerance. Faced with high temperature stress, opportunistic fungal pathogens implement an adaptive mechanism known as heat shock response controlled by heat shock transcription factors (HSFs), such as Hsf1. In eukaryotes, HSFs regulate the expression of heat shock proteins, such as the chaperone Hsp90, which are part of the cellular program for heat adaptation. Recently, it was observed that the disturbance in cell wall integrity (CWI) of A. fumigatus also causes susceptibility to elevated temperatures. Furthermore, it is known that, in response to temperature shock, fungi adapt the composition and fluidity of their cell membranes towards homeostasis. In this work, the hsfAHSF1 gene from A. fumigatus was studied, through the construction of a conditional mutant. hsfA was essential for the viability, virulence, thermotolerance and CWI of A. fumigatus. Temperature shock and cell wall stress modified the cell wall ultrastructure and triggered the coordinated expression of HsfA and Hsp90, which was shown to be regulated by the components of the CWI pathway PkcA and MpkA. RNA-Seq analyzes confirmed that HsfA regulates the expression of genes related to heat shock response, cell wall biosynthesis and remodeling, and lipid homeostasis. Furthermore, HsfA had a role in the synthesis of sphingolipids and phospholipids. For this reason, the function of the sdeAOLE1 gene, which encodes a fatty acid desaturase, and its relationship with hsfA was also investigated here. sdeA was shown to be essential, necessary for the synthesis of fatty acids and important for the phospholipids metabolism. It was also observed that HsfA regulates the expression of sdeA and the pseudogene sdeB. Finally, Western blot analysis proved that SdeA physically interacts with Hsp90 and regulates the expression of this chaperone. Collectively, these results demonstrate the connections between heat shock response and the CWI pathway and plasma membrane homeostasis, with HsfA playing a crucial role in the regulation of these pathways. Such conclusions may be important to bring new information about potential therapeutic targets in the treatment of API, and can also be applied to other pathogenic or relevant filamentous fungi. O fungo filamentoso e saprofítico Aspergillus fumigatus é o principal agente causador da aspergilose pulmonar invasiva (API) em indivíduos imunocomprometidos. Um dos seus mais importantes determinantes de virulência é a termotolerância. Diante do estresse por alta temperatura, os fungos oportunistas patogênicos implantam um mecanismo adaptativo conhecido como resposta ao choque térmico controlado por fatores de transcrição de choque térmico (HSFs), como Hsf1. Em eucariotos, os HSFs regulam a expressão de proteínas de choque térmico, como a chaperona Hsp90, que fazem parte do programa celular de adaptação ao calor. Recentemente, foi observado que a perturbação na integridade da parede celular (CWI) de A. fumigatus causa também suscetibilidade a temperaturas elevadas. Além disso, sabe-se que em resposta ao choque de temperatura, os fungos adaptam a composição e fluidez de suas membranas celulares em busca de homeostase. Neste trabalho, o gene hsfAHSF1 de A. fumigatus foi estudado, por meio da construção de um mutante condicional. hsfA se mostrou essencial para a viabilidade, virulência, termotolerância e CWI de A. fumigatus. O choque de temperatura e o estresse de parede celular modificaram a ultraestrutura da parede celular e desencadearam a expressão coordenada de HsfA e Hsp90, a qual se mostrou regulada pelos componentes da via CWI PkcA e MpkA. Análises de RNA-Seq confirmaram que HsfA regula a expressão de genes relacionados à resposta ao choque térmico, à biossíntese e remodelamento da parede celular e à homeostase lipídica. Ademais, HsfA apresentou função na síntese de esfingolipídios e fosfolipídios. Por essa razão, também foi investigada aqui a função do gene sdeAOLE1, que codifica uma dessaturase de ácidos graxos, e sua relação com hsfA. sdeA se mostrou essencial, necessário para a síntese de ácidos graxos e importante para o metabolismo de fosfolipídios. Foi observado também que HsfA regula a expressão de sdeA e do pseudogene sdeB. Por fim, análises de Western blot provaram que SdeA interage fisicamente com Hsp90 e regula a expressão dessa chaperona. Coletivamente, estes resultados demonstraram as conexões entre a resposta ao choque térmico e a via CWI e a homeostase da membrana plasmática, com HsfA desempenhando um papel crucial na regulação dessas vias. Tais conclusões podem ser importantes para trazer novas informações sobre potenciais alvos terapêuticos no tratamento da API, podendo também ser aplicadas a outros fungos patogênicos ou fungos filamentosos relevantes. Processo nº 2017/13363-5

A paracoccidioidomicose é uma das mais importantes micoses sistêmicas na América latina. Ela ocorre a partir da inalação de propágulos dos fungos do gênero Paracoccidioides presentes nos solos, estando geralmente associada à contaminação de trabalhadores rurais, os quais são constantemente expostos a manipulação deste material potencialmente contaminado. Mesmo mais de um século após o seu descobrimento, o tratamento dessa infecção com o arsenal antifúngico atualmente disponível ainda representa um desafio, devido ao longo tempo de tratamento necessário, bem como à alta toxicidade dos medicamentos utilizados. Essas questões evidenciam a necessidade de pesquisas de desenvolvimento e caracterização de novos compostos com potencial para inibir o crescimento desses microrganismos. Nesse sentido, uma classe de moléculas denominadas chalconas, tem apresentado grande versatilidade por demonstrarem amplas propriedades biológicas, incluindo entre elas a atividade antifúngica. Através de uma metodologia de triagem virtual, um derivado chalcona nomeado de composto 3 foi identificado pelo nosso grupo como uma promissora molécula inibidora de Paracoccidioides spp. Dessa forma, com o objetivo de compreender o modo de ação do composto 3, utilizamos uma abordagem proteômica afim de identificar as proteínas induzidas e reprimidas de P. brasiliensis na presença do composto 3. Em adição, foram realizados ensaios de validação dos resultados encontrados. As análises indicaram que o composto 3 pode provocar um desequilíbrio na homeostase energética do fungo pela redução da atividade da via glicolítica, da beta-oxidação e do ciclo do ácido cítrico. As validações in vitro também demonstraram que espécies reativas de oxigênio se acumulam dentro das células durante a exposição ao composto 3, o que pode desestabilizar componentes celulares como a membrana plasmática. Em última análise, o ensaio de ancoragem molecular entre o composto 3 e a enzima diidropteroato sintase, que teve sua expressão induzida após o tratamento, sugere que o composto 3 possa atuar como um inibidor dessa proteína, prejudicando a síntese de folato que participa como cofator na biossíntese de nucleotídeos e alguns aminoácidos. Portanto, os dados suportam a eficiência do composto 3 em produzir desequilíbrios em vias chave para a manutenção metabólica do organismo, contribuindo para o seu papel antifúngico. Paracoccidioidomycosis is one of the most important systemic mycoses in Latin America. The infection occurs through the inhalation of fungal propagules belonging to Paracoccidioides genus that are present in soils, being largely associated with the contamination of rural workers, who are constantly exposed to this potentially contaminated material. Even more than a century after its discovery, the treatment of this infection with the currently available antifungal arsenal still represents a challenge, due to the long treatment time required, as well as the high toxicity of the drugs used. These questions highlight the need for research to develop and characterize new compounds with the potential to inhibit the growth of these microorganisms. In this sense, a class of molecules called chalcones has shown great versatility for demonstrating broad biological properties, including antifungal activity among them. Through a virtual screening methodology, a chalcone derivative named compound 3 was identified by our group as a promising inhibitor of Paracoccidioides spp. Thus, in order to understand the mode of action of compound 3, we applied a proteomic approach to identify the induced and repressed proteins of P. brasiliensis in the presence of compound 3. In addition, validation assays were performed on the results found. The analysis indicated that the compound can cause an imbalance in the fungal energy homeostasis by reducing the activity of the glycolytic pathway, beta-oxidation and citric acid cycle. In vitro validations also demonstrated that reactive oxygen species accumulate within the cells during exposure to compound 3, which can destabilize cellular components such as the plasma membrane. The molecular docking assay between compound 3 and the enzyme dihydropteroate synthase, which had its expression induced after the treatment, suggest that compound 3 may act as an inhibitor of this protein, impairing the folate biosynthesis that participates as a cofactor in synthesis of nucleotides and some amino acids. Therefore, these data support the efficiency of compound 3 in producing imbalances in key pathways for the P. brasiliensis' metabolic maintenance, contributing to its antifungal role. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Submitted by Renata Aline Souza Silva (rassilva@uefs.br) on 2022-08-31T16:02:49Z No. of bitstreams: 1 Disserta??o_Andressa Mirelle Santos Louren?o_2021.pdf: 3511670 bytes, checksum: 0d5319a84d0fbe7de60d1590611ce415 (MD5) Made available in DSpace on 2022-08-31T16:02:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Disserta??o_Andressa Mirelle Santos Louren?o_2021.pdf: 3511670 bytes, checksum: 0d5319a84d0fbe7de60d1590611ce415 (MD5) Previous issue date: 2021-09-27 Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES Guava is an important fruit species due to its nutritional quality and favorable cultivation conditions throughout the Brazilian territory. One of its main problems is the disease caused by the root-knot nematode, which has caused severe damage to guava-growing areas in several regions of Brazil. The present study aimed to estimate graft compatibility and characterize guava accessions grafted on the nematode-resistant BRS Guara?? rootstock in order to guide the choice of parents for breeding and to develop and obtain new cultivars. The experiment was conducted with accessions from the Active Germplasm Bank of Psidium,Petrolina, PE. Compatibility assessments were performed for plant height, the ratio of stem diameter at 15 cm and 40 cm from the ground, and canopy diameterlongitudinally and transversely to the planting row. Fruits were analyzed for their total number, mean weight, seed weight, pulp weight, fruit diameter, and fruit length. Bioactive and physicochemical compounds were characterized by analyzing peel and pulp color, fruit firmness, soluble solids, titratable acidity, vitamin C, ?-carotene, and lycopene. The data were subjected to analysis of variance, with within-plot data, and histograms were constructed based on data dispersion. None of the accessions studied showed incompatibility symptoms such as cracks, exudations, and stem diameter differences in the graft region. The accessions resulted in vigorous plants in the second production cycle, with a mean canopy diameter of 2.3 m, a mean plant height of 2.2 m, and no incompatibilities. Accessions Gua64BA, Gua181ES, Gua06MA, Pedro Sato, and Gua99AM showed the highest pulp/fruit weight values, around 160 g, whereas accessions Gua96AM, Gua70RO, Gua192ES, Gua01MA, and Gua183ES showed the highest fruit production, around 20 kg/plant. These genotypes are recommended for grafting with the BRS Guara?? rootstock. Results were significant for all physicochemical variables, demonstrating phenotypic variability. Accessions GUA33PE and GUA135RR showed high fruit firmness and are recommended for breeding and to develop new cultivars. Accessions GUA46PE, 1,335 mg/100g-1and GUA03MA, 1,232.15 mg/100g-1, showed high vitamin C values and are recommended for breeding and developing cultivars with high contents of bioactive compounds. A goiabeira ? uma frut?fera importante, devido ? sua qualidade nutricional e por apresentar condi??es de cultivo em todo territ?rio brasileiro. Um dos principais problemas da goiabeira ? a doen?a causada pelo ataque do nematoide-das-galhas, que tem causado v?rios preju?zos em cultivos da goiabeira em varias regi?es do Brasil. O objetivo do estudo foi estimar a compatibilidade de enxertia e caracteriza??o de acessos de goiabeira, enxertados no BRS Guara??, porta-enxerto resitente ao nematoide, visando orientar na escolha de parentais para cruzamentos e no desenvolvimento e obten??o de novas cultivares. O experimento foi conduzido com acessos do Banco Ativo de Germoplasma de Psidium, Petrolina, PE. As avalia??es de compatibilidade foram para: altura da planta, rela??o do di?metro de caule a 15cm e 40cm de altura do solo, di?metro da copa no sentido longitudinal e transversal ? linha de plantio. Para os frutos foram analisados: n?mero total de frutos, peso m?dio de frutos, peso total de frutos, peso de sementes, peso de polpa, di?metro e comprimento do fruto. Para caracteriza??o de compostos bioativos e f?sico-qui?micos foram realizadas an?lises de colora??o de casca e polpa, firmeza, s?lidos sol?veis, acidez titul?vel, vitamina C, ?-caroteno e licopeno. Os dados foram submetidos ? an?lise de vari?ncia, com informa??es dentro de parcelas, sendo constru?dos histogramas com dispers?o dos dados. N?o foram observados sintomas de incompatibilidade, como rachaduras, exsuda??es e diferen?as no di?metro do caule na regi?o de enxertia, para todos acessos avaliados. Os acessos apresentaram plantas vigorosas no segundo ciclo de produ??o, com di?metro m?dio de copa com 2,3 m, altura m?dia da planta com 2,2 m, indicando aus?ncias de incompatibilidades. Os acessos Gua64BA, Gua181ES, Gua06MA, Pedro Sato e Gua99AM apresentaram os maiores pesos de polpa/fruto, em torno de 160 g, enquanto os acessos Gua96AM, Gua70RO, Gua192ES, Gua01MA e Gua183ES, a maior produ??o de frutos, em torno de 20 kg/planta, sendo indicados para enxertia com o BRS Guara??. Os resultados foram significativos para todas as vari?veis f?sico-qu?micas, demostrando variabilidade fenot?pica. Os acessos GUA33PE e GUA135RR apresentaram valores elevados para firmeza de fruto, sendo indicados para cruzamentos e desenvolvimento de cultivares. Os acessos GUA46PE, 1.335 mg/100g-1e GUA03MA, 1.232,15 mg/100g-1 apresentaram valores elevados para teor de vitamina C, sendo indicados para cruzamentos e desenvolvimento de cultivares com maiores teores de compostos bioativos.

Submitted by Vandete Santos (vandetess@yahoo.com.br) on 2022-02-16T01:45:05Z No. of bitstreams: 4 DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4718089 bytes, checksum: b86547065fd9accb8b6d1cd6cfb9ccf0 (MD5) Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Approved for entry into archive by PPGECIM Ensino de Ci??ncias e Matem??tica (ppgecim@ufam.edu.br) on 2022-02-16T18:51:37Z (GMT) No. of bitstreams: 4 DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4718089 bytes, checksum: b86547065fd9accb8b6d1cd6cfb9ccf0 (MD5) Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Rejected by Divis??o de Documenta????o/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: Submiss??o duplicada. Somente uma deve ser conclu??da! Esta pode ser exclu??da! on 2022-02-17T13:55:42Z (GMT) Submitted by Vandete Santos (vandetess@yahoo.com.br) on 2022-02-18T00:06:05Z No. of bitstreams: 4 DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4718089 bytes, checksum: b86547065fd9accb8b6d1cd6cfb9ccf0 (MD5) Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Approved for entry into archive by PPGECIM Ensino de Ci??ncias e Matem??tica (ppgecim@ufam.edu.br) on 2022-02-18T16:02:31Z (GMT) No. of bitstreams: 4 DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4718089 bytes, checksum: b86547065fd9accb8b6d1cd6cfb9ccf0 (MD5) Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Rejected by Divis??o de Documenta????o/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: A Disserta????o submetida n??o possui ficha catalogr??fica. Instru????es e sistema de emiss??o dispon??vel em: https://biblioteca.ufam.edu.br/elaboracao-de-ficha-catalografica.html on 2022-02-18T19:30:08Z (GMT) Submitted by Vandete Santos (vandetess@yahoo.com.br) on 2022-02-24T01:54:03Z No. of bitstreams: 4 Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4719702 bytes, checksum: b1cf313278b354f89a73452c44ed27a2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Approved for entry into archive by PPGECIM Ensino de Ci??ncias e Matem??tica (ppgecim@ufam.edu.br) on 2022-02-25T15:38:44Z (GMT) No. of bitstreams: 4 Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4719702 bytes, checksum: b1cf313278b354f89a73452c44ed27a2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Approved for entry into archive by Divis??o de Documenta????o/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2022-03-03T13:55:53Z (GMT) No. of bitstreams: 4 Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4719702 bytes, checksum: b1cf313278b354f89a73452c44ed27a2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Made available in DSpace on 2022-03-03T13:55:53Z (GMT). No. of bitstreams: 4 Ata Vandete Soares.pdf: 299885 bytes, checksum: a94f8828217a5d81065feb8150c58742 (MD5) Carta de Encaminhamento.pdf: 197944 bytes, checksum: 33cbd9d1d7df8b17002aef3dd7b018e7 (MD5) DISSERTA????O DE MESTRADO_VANDETE SOARES DOS SANTOS_2021.pdf: 4719702 bytes, checksum: b1cf313278b354f89a73452c44ed27a2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2021-09-24 In order to contribute to the improvement of the assimilation of basic contents of Genetics, mainly, the understanding of the abstract in the relationship between Genotype and Phenotype, as well as its adequate appropriation by the students, a study was carried out on the process of abstraction by constructivist didactic transposition and, including the evaluation of the abstractive situation of the research students. Therefore, some objectives were established, such as: to investigate the basic concepts of Genetics relating to the constructivist approach, to develop a pedagogical abstraction test to assess the abstraction level of students in relation to these basic concepts of Genetics and, finally, to explain the process of transposing the abstract - concrete of basic concepts of Genetics through constructivist teaching. The research was carried out in a public school in the city of Manaus with students from the third grade of High School, in the discipline of Biology, divided into groups A and B, with classes on alternate days, due to the norms of social removal established to enable a teaching insurance against the challenges of the Covid19 pandemic, being mainly qualitative, field and action research. The Pedagogical Abstraction Test was based on the Hologrammatic, Recursive and Dialogical principles of Edgard Morin's Complexity Theory and the intervention instrument "Genetic Face", which aimed to stimulate abstraction by playing inquiring cards (memory game) and the tool abstract image of human face construction (whole-parts). The effectiveness of knowledge construction through constructivist didactic transposition tools for the teaching of Genetics enabled students to internalize knowledge and the interrelation between abstract and concrete with constructed activities. The realization of this work made possible participatory, interesting and reality-associated classes, bringing the student closer to the content, and protecting their privacy in the approach of hereditary inheritance and its social relations. It is demonstrated through personification, the relationship between paternal and maternal genes, the hereditary formation enabling the experience in meaningful and contextualized learning, built on the theories of Morin's Complexity and Leontiev's Activity Theory, in an integrative, viable way. and collective, and can be used by Biology teachers in the technological and recreational aspects. Therefore, the importance of the project lies in the approximation of scientific thinking to the teachable, bringing the abstract to the concrete through the activity mediated by the teacher and the evaluation of the abstraction condition of the student. Com o intuito de contribuir para a melhoria da assimila????o de conte??dos b??sicos de Gen??tica, principalmente, a compreens??o do abstrato na rela????o entre Gen??tipo e Fen??tipo, bem como, sua apropria????o adequada por parte dos alunos, ?? que se realizou um estudo sobre o processo de abstra????o por transposi????o did??tica construtivista e, inclusive a avalia????o da situa????o abstrativa dos estudantes da pesquisa. Sendo assim, alguns objetivos foram estabelecidos, tais como: investigar os conceitos b??sicos de Gen??tica relacionando com a abordagem construtivista, desenvolver um teste pedag??gico de abstra????o para aferir o n??vel abstrativo dos estudantes em rela????o a esses conceitos b??sicos de Gen??tica e, por fim explicar o processo de transposi????o do abstrato ??? concreto de conceitos b??sicos de Gen??tica por meio do ensino construtivista. A pesquisa desenvolveu-se numa escola p??blica do munic??pio de Manaus com estudantes da terceira s??rie do Ensino M??dio, na disciplina de Biologia, divididos em grupo A e B, com aulas em dias alternados, devido ??s normas de afastamento social estabelecidas para possibilitar um ensino seguro frente aos desafios da pandemia do Covid19, sendo principalmente qualitativa, de campo e pesquisa a????o. O Teste Pedag??gico de Abstra????o foi baseado nos princ??pios Hologram??tico, Recursivo e Dial??gico, da Teoria da Complexidade de Edgard Morin e o instrumento de interven????o ???Face Gen??tica???, que visou estimular a abstra????o por jogo de cartas indagadoras (jogo da mem??ria) e a ferramenta abstrata de constru????o da face humana (todo-partes). A efic??cia da constru????o do conhecimento por meio de ferramentas de transposi????o did??tica construtivista para o ensino da Gen??tica possibilitou aos estudantes a internaliza????o dos conhecimentos e a interrela????o entre abstrato e concreto com atividades constru??das. A realiza????o deste trabalho possibilitou aulas participativas, interessantes e associadas ?? realidade, aproximando o estudante do conte??do, e resguardando sua privacidade na abordagem da heran??a heredit??ria e suas rela????es sociais. Demonstra-se por meio da personifica????o, a rela????o entre os genes paternos e maternos, a forma????o heredit??ria possibilitando a viv??ncia no aprender significativo e contextualizado, constru??do sobre as teorias da Complexidade de Morin e a Teoria da Atividade de Leontiev, de forma integradora, vi??vel e coletiva, podendo ser utilizada por professores de Biologia nos aspectos tecnol??gico e l??dico. Portanto, a import??ncia do projeto est?? na aproxima????o do pensamento cient??fico ao ensin??vel, trazendo o abstrato para o concreto por meio da atividade mediada pelo professor e a avalia????o da condi????o abstrativa do estudante. O link foi para o spam, um alerta sobre essa situa????o pode ajudar. A tabela da Cnpq ?? um pouco confusa porque o Curso de Mestrado est?? relacionado ao Ensino de Ci??ncias e Matem??tica. O Teste Pedag??gico de Abstra????o possibilitou an??lise superficial da situa????o de abstra????o dos estudantes. A montagem da face humana relacionando o fen??tipo e gen??tipo possibilita ao estudante observar as caracter??sticas trazidas pelos genes.

Outra The Leontopithecus chrysopygus species, popularly known as the black lion tamarin (MLP), has been suffering from the fragmentation of its natural habitat, which limits gene flow and results in a decrease in genetic variability and an increase in inbreeding within populations. The genetic-population study and the establishment of genetic diversity parameters, based on molecular data from mitochondrial DNA, allow the characterization of the structure and historical genetic diversity within and between populations, and this information is important to help manage the species and maintain genetic variation both in free-living and captive populations. In this work, the matrilineal structure of ex situ and in situ groups was evaluated with the aim of generating insights to support decisions on long-term management and conservation of the species. Additionally, pedigree data were analyzed to establish kinship relationships among captive animals. The control region (D-loop) of the mitochondrial genome was evaluated in 43 MLPs from five free-living populations and 32 captive individuals kept at the Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP, SP); 19 individuals at the Rio de Janeiro Primate Center and 20 at the Durrell Wildlife Conservation Trust (DWCT, Jersey). The generated sequences were analyzed using different computational tools to characterize the haplotype diversity and genetic structure of the evaluated groups. Pedigree analysis showed lower relatedness values ​​in FPZSP than in CPRJ and DWCT. The analysis of mitochondrial data showed a total of seven haplotypes, only three of them (H1, H2 and H3) being shared between free-living and captive individuals. The mean value of haplotypic diversity (Hd) was higher in free-living (0.752) than in captivity (0.589). The existence of unique haplotypes in FPZSP, in addition to the low haplotype diversity observed in DWCT and its absence in CPRJ, highlights the urgent need for a metapopulation management that aims to preserve a broader base of matrilineal genetic diversity in these two institutions. The presence of a unique haplotype in FPZSP also indicates the need to expand the analyzes in in situ populations. On the other hand, unique haplotypes were found in in situ populations, indicating that contemporary ex situ populations do not retain historical matrilineal diversity representative of the free-living populations evaluated so far. This study brings important data that can help future integrated metapopulation management plans that target genetic-based translocation and reintroduction actions. A espécie Leontopithecus chrysopygus, conhecida popularmente como mico-leão-preto (MLP), vem sofrendo com a fragmentação de seu habitat natural, o que limita o fluxo gênico e resulta na diminuição da variabilidade genética e no aumento da endogamia dentro das populações. O estudo genético-populacional e o estabelecimento de parâmetros de diversidade genética, baseados em dados moleculares do DNA mitocondrial permitem a caracterização da estrutura e diversidade genética histórica dentro e entre populações, sendo estas informações importantes para auxiliar o manejo da espécie e manutenção da variação genética tanto em populações de vida-livre quanto de cativeiro. Neste trabalho a estrutura matrilinear de grupos ex situ e in situ foi avaliada com o objetivo de gerar insights para auxiliar as decisões de manejo e conservação da espécie em longo termo. Adicionalmente, dados de pedigree foram analisados para estabelecimento das relações de parentesco entre os animais de cativeiro. A região controle (D-loop) do genoma mitocondrial foi avaliada em 43 MLPs provenientes de cinco populações de vida livre e 32 indivíduos cativos mantidos na Fundação Parque Zoológico de São Paulo (FPZSP, SP); 19 indivíduos no Centro de Primatologia do Rio de Janeiro e 20 no Durrell Wildlife Conservation Trust (DWCT, Jersey). As sequências geradas foram analisadas utilizando-se diferentes ferramentas computacionais para caracterização da diversidade haplotípica e estrutura genética dos grupos avaliados. A análise de pedigree evidenciou valores de parentesco menores na FPZSP que no CPRJ e em DWCT. A análise dos dados mitocondriais evidenciou um total de sete haplótipos, sendo apenas três deles (H1, H2 e H3) compartilhados entre indivíduos de vida-livre e de cativeiro. O valor médio de diversidade haplotípica (Hd) foi maior em vida-livre (0,752) que em cativeiro (0,589). A existência de haplótipos exclusivos na FPZSP, além da baixa diversidade haplotípica observada em DWCT e ausência desta no CPRJ, destaca a urgente necessidade de um manejo metapopulacional que objetive preservar uma base mais ampla da diversidade genética matrilinear nestas duas instituições. A presença de um haplótipo exclusivo na FPZSP indica também a necessidade de ampliar as análises nas populações in situ. Por outro lado, haplótipos exclusivos foram encontrados em populações in situ, indicando que as populações contemporâneas ex situ não retêm diversidade matrilinear histórica representativa das populações de vida-livre até o momento avaliadas. Este estudo traz dados importantes que podem auxiliar futuros planos de manejo metapopulacional integrado que visem ações de translocações e reintroduções baseados em genética.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Introduction: Honduras is the second poorest country in Central America. The country's total population in 2019 was 9,181,487; the child population, including children under the age of five, represented about 14.8% of the total population. In 2018, the birth rate was 22 births/1,000 inhabitants, the infant mortality rate was 15.1 deaths/1,000 live births, with congenital anomalies being the second cause of infant mortality. Congenital defect comprises all structural or functional anomalies, including metabolic defects, resulting from factors originating before birth, even if the defect is not apparent or identified in the newborn, being recognized later. Birth defects are a public health problem worldwide, seriously affecting children's health and can produce disabilities. In Latin America and the Caribbean, birth defects are estimated to be responsible for about 21% of mortality among children under five years of age. Aim: This study evaluated the impact of birth defects on the morbidity and mortality of Honduran children and the development and implementation of neonatal screening in Honduras. Methodology: This is a quantitative, descriptive, retrospective, and cross-sectional study. The research was developed in two parts: (1) information on the prevalence of structural birth defects in the first year of life and in infant mortality, during the years 2014 to 2018; and (2) information about neonatal screening and functional birth defects in 2018 and 2019. Results: Over the five years studied, the prevalence of birth defects in children under 1 year of age was 256.32: 10,000. Twelve birth defects reached a frequency greater than 5: 10,000, enough to be considered non-rare. The infant mortality rate due to birth defects was 33.81: 10,000. The proportional infant mortality rate due to congenital defects was 23.83%. Concerning the neonatal screening, in 2018 and 2019, 19,911 newborns were tested for five functional birth defects: hypothyroidism, cystic fibrosis, galactosemia, phenylketonuria, and adrenal hyperplasia. Abnormalities were identified in 18 newborns, corresponding to a prevalence of 9.04:10,000. Considering all births in Honduras, the estimated coverage of screening ranged between 4.39% and 5.74%. Conclusions: Birth defects have a great impact on the morbidity and mortality of Honduran children. The surveillance system for structural birth defects in Honduras can be improved. For this, it is suggested: expansion of monitoring for all health units in the public and private systems; development of a notification method that can consider the child's place of residence and prevents repeated registration of the same child; and training of the human resources involved in the notification and care of children with birth defects. The results also reinforce the need to expand and consolidate neonatal screening in Honduras. For this, it is recommended: expansion of screening for health units in the Honduran public system, in all Departments of the country; a collection of samples in the first week of live births; conducting more studies to confirm the prevalence of galactosemia; inclusion of screening for hemoglobinopathies; organization of a national program that guarantees comprehensive treatment of patients; and organization of an accessible information system on neonatal screening. Introdução: Honduras é o segundo país mais pobre da América Central. A população total do país em 2019 era de 9.181.487; a população infantil, incluindo crianças menores de cinco anos, representava cerca de 14,8% da população total. Em 2018, a taxa de natalidade foi de 22 nascimentos/1.000 habitantes, a taxa de mortalidade infantil foi de 15,1 mortes/1.000 nascidos vivos, sendo as anomalias congênitas a segunda causa de mortalidade infantil. Defeito congênito compreende todas as anomalias estruturais ou funcionais, incluindo os defeitos metabólicos, decorrentes de fatores originados antes do nascimento, mesmo que o defeito não seja aparente ou identificado no recém-nascido, sendo reconhecido mais tarde. Os defeitos congênitos são um problema de saúde pública no mundo inteiro, afetando seriamente a saúde infantil e podendo produzir deficiência. Na América Latina e no Caribe, estima-se que os defeitos congênitos sejam responsáveis por cerca de 21% da mortalidade entre crianças menores de cinco anos. Objetivo: Este estudo avaliou o impacto dos defeitos congênitos na morbimortalidade de crianças hondurenhas e o desenvolvimento e implantação da triagem neonatal em Honduras. Metodologia: Trata-se de estudo quantitativo, descritivo, retrospectivo e transversal. A pesquisa foi desenvolvida em duas partes: (1) informações sobre prevalência de defeitos congênitos estruturais no primeiro ano de vida e no óbito infantil, durante os anos de 2014 a 2018; e (2) informações sobre a triagem neonatal e os defeitos congênitos funcionais rastreados nos anos 2018 e 2019. Resultados: Ao longo dos cinco anos estudados, a prevalência de defeitos congênitos estruturais em menores de 1 ano de vida foi 256,32:10.000. Doze defeitos congênitos alcançaram frequência superior a 5:10.000, suficiente para serem considerados não raros. A taxa de mortalidade infantil por defeitos congênitos foi 33,81:10.000. Já a taxa de mortalidade infantil proporcional por defeito congênito foi 23,83%. Com relação à triagem neonatal, em 2018 e 2019, 19.911 recém-nascidos, vinculados ao Instituto Hondurenho Seguridade Social, foram testados para cinco defeitos congênitos funcionais: hipotireoidismo, fibrose cística, galactosemia, fenilcetonúria e hiperplasia adrenal. Alterações foram identificadas em 18 lactentes, correspondendo a prevalência de 9,04:10.000. Considerando-se todos os nascimentos no país, a cobertura estimada da triagem variou entre 4,39 e 5,74%. Conclusões: Os defeitos congênitos têm grande impacto sobre a morbimortalidade de crianças hondurenhas. O sistema de vigilância de defeitos congênitos estruturais em Honduras pode ser aperfeiçoado. Para isso, sugere-se: ampliação do monitoramento para todas as unidades de saúde do sistema público e do privado; desenvolvimento de um método de notificação que considere o local de residência da criança e que impeça o registro repetido de uma mesma criança; e capacitação do recurso humano envolvido com a notificação e com o cuidado de crianças com defeitos congênitos. Os resultados também reforçam a necessidade de expandir e consolidar a triagem neonatal em Honduras. Para isso, recomenda-se: expansão da triagem para as unidades de saúde do sistema público hondurenho, em todos os Departamentos do país; coleta de amostras na primeira semana dos nascidos vivos; realização de mais estudos para confirmar a prevalência de galactosemia; inclusão do rastreio de hemoglobinopatias; organização de um programa nacional que garanta tratamento integral dos doentes; e organização de um sistema de informação acessível sobre a triagem neonatal. CAPES – Código de Financiamento 001

A aplicação da técnica de DNA barcoding tem se mostrado bem-sucedida em estudos de levantamento da biodiversidade, biomonitoramento de espécies invasoras, análises forenses para avaliação de seguridade alimentar e de medicamentos à base de plantas medicinais, monitoramento do comércio ilegal de espécies ameaçadas, estudos sobre ecologia alimentar, iniciativas de conservação etc. O presente estudo teve como objetivo principal levantar e sistematizar a produção científica sobre o uso de DNA barcoding em plantas. Para tanto, foi realizada uma busca na base de dados Web of Science, utilizando como palavras-chave combinadas as regiões anotadas no genoma plastidial e nuclear de Arabidopsis thaliana (espécie modelo), que são utilizadas como marcadores de DNA barcoding, associadas às expressões: “DNA barcoding” OR “barcoding” OR “DNA barcode” OR “barcode” OR “metabarcoding”. A busca foi realizada abrangendo o período completo de publicação da base de dados até 2020. Os arquivos recuperados passaram por filtragem, sendo considerados apenas artigos originais, excluindo-se artigos de revisão, bem como os que não correspondiam ao escopo do estudo. Um total de 1.897 artigos foram recuperados, dos quais 1.073 estavam dentro dos critérios de inclusão. Como o primeiro artigo foi publicado em 2005, a análise abrangeu o período entre 2005 e 2020. Os estudos foram publicados em um total de 309 periódicos, com uma média geral de publicação por ano igual a 5,21. A produção científica variou ao longo do período, mas sempre com uma tendência crescente. A média de autores por documento foi de 3,49 visto que, cada artigo apresenta em sua grande maioria mais de um autor, o que explica a média de coautores por documento (5,34). No entanto, de um total de 3.747 autores registrados, o número de artigos por autor foi baixo, com uma média igual a 0,29. A China se destaca como principal país, de acordo com a origem dos autores, que tem contribuído com trabalhos envolvendo a aplicação da técnica de DNA barcoding no estudo de plantas, sendo também o país mais citado. Os autores mais relevantes, com base no número de publicações foram os chineses: Chen SL, Song J, Yao H, sendo o artigo de Chen et al. (2010) o segundo mais citado globalmente. Os periódicos que apresentaram maior destaque em relação ao número de artigos publicados, considerando o assunto, foram respectivamente: Plos One, Molecular Ecology Resources e Scientific Reports. Foi possível caracterizar quatro grupos de documentos quanto ao uso/aplicação da técnica, respectivamente: Descrição/delimitação de espécies (545), Genética Forense (275), Desenvolvimento/metodologia (163), Ecologia (90) e 75 artigos foram categorizados em até dois grupos diferentes. Os estudos agrupados na categoria de maior destaque (Descrição/delimitação de espécies), abordam desde delimitação de espécies de grupos complexos, até a validação de espécies com propriedades de interesse econômico e de espécies já catalogadas em herbários. As possibilidades de aplicação vêm sendo ampliadas graças ao desenvolvimento das tecnologias de Sequenciamento de Alto Rendimento, abrindo portas para estudos em Ecologia, Evolução e Genética Forense e que utilizam além de DNA barcoding, o metabarcoding. The application of the DNA barcoding has been shown to be successful in studies of biodiversity surveys, biomonitoring of invasive species, forensic analysis to assess food security and medicinal products based on medicinal plants, monitoring the illegal trade in threatened species, studies about food ecology, conservation initiatives, etc. The present study had as main objective to raise and systematize the scientific production on the use of DNA barcoding in plants. For this purpose, a search was carried out in the Web of Science database, using as keywords combined the regions annotated in the chloroplast and nuclear genome of Arabidopsis thaliana (model species), which are used as DNA barcoding markers, associated with the expressions: “DNA barcoding” OR “barcoding” OR “DNA barcode” OR “barcode” OR “metabarcoding”. The search was carried out covering the complete period of publication of the database until 2020. The recovered files were filtered, being considered only original articles, excluding review articles, as well as those that did not correspond to the scope of the study. A total of 1,897 articles were retrieved, of which 1,073 were within the criteria’s inclusion. As the first article was published in 2005, the analysis covered the period between 2005 and 2020. The studies were published in a total of 309 sources, with a general average of publication per year equal to 5.21. Scientific production varied over the period, but always with an increasing trend. The average number of authors per document was 3.49, since each article mostly has more than one author, which explains the average number of coauthors per document (5.34). However, out of a total of 3,747 registered authors, the number of articles per author was low, with an average equal to 0.29. China stands out as the main country, according to the origin of the authors, who has contributed with works involving the application of the DNA barcoding technique in the study of plants, being also the most cited country. The most relevant authors, based on the number of publications, were the Chinese: Chen SL, Song J, Yao H, with the article by Chen et al. (2010) the second most cited globally. The journals that showed greater prominence in relation to the number of articles published, considering the subject, were respectively: Plos One, Molecular Ecology Resources and Scientific Reports. It was possible to characterize four groups of documents regarding the use / application of the technique, respectively: Description/delimitation of species (545), Forensic Genetics (275), Development/methodology (163), Ecology (90) and 75 articles were categorized in up to two different groups. The studies grouped in the most prominent category (Description/delimitation of species), range from delimiting species from complex groups to the validation of species with properties of economic interest and species already cataloged in herbariums. The application possibilities have been expanded due to the development of High Throughput Sequencing technologies, opening doors for studies applied to Ecology, Evolution and Forensic Genetics and which use in addition to DNA barcoding, the metabarcoding.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Indirect somatic embryogenesis (ISE) is one of the most used regeneration pathways to obtain sugarcane genetically modified plants. ISE regulatory genes have been widely studied in monocotyledonous and dicotyledonous plants, and act as activators of the expression of gene cascades or promoting cell growth and differentiation. In contrast, in sugarcane, there are few reports in the literature with these genes involved in ISE. Thus, the present study aimed to i) search for putative homologous genes responsible for the regulation of ISE (families: BABYBOOM, WUSCHEL, LEAFY COTYLEDON, VIVIPAROUS1, and AGAMOUS-LIKE) in sugarcane (SP80-3280 and Saccharum spontaneum); ii) analyze the phylogeny between the sugarcane amino acid sequences and their homologous in Arabidopsis thaliana and Poaceae species; iii) design ideal primers for studying the expression of sugarcane ISE-related genes. BLAST and BLASTp searches were carried out in the Phytozome, NCBI, UniProt, and Gramene databases to obtain homologous sequences of the five gene families in corn, sorghum, rice, and A. thaliana. Thus, phylogenetic analyzes of amino acid sequences were performed with the aid of the software CLUSTALW and MEGAX, which showed evolutionary proximity between the proteins of Zea mays, Sorghum bicolor, S. spontaneum, and SP80-3280 in all the studied genes. In silico analyzes indicated that they may have more than one gene from the BABYBOOM, WUSCHEL, and VIVIPAROUS1 families regulating the pathways of ISE in sugarcane. In addition, with the aid of the PRIMER3 software, 8 pairs of primers with ideal parameters were obtained to be used in future analyzes of gene expression to understand more deeply the mechanisms of ISE. A embriogênese somática indireta (ESI) é uma das vias de regeneração mais utilizadas na obtenção de plantas geneticamente modificadas em cana-de-açúcar. Genes reguladores da ESI vem sendo amplamente estudados em plantas monocotiledôneas e dicotiledôneas, e agem como ativadores da expressão de cascatas gênicas ou promotores de crescimento e diferenciação celular do explante. Em contrapartida, em cana-de-açúcar há poucos relatos na literatura com esses genes envolvidos na ESI. Assim, o presente estudo visou: i) buscar genes homólogos putativos responsáveis pela regulação da ESI (famílias: BABYBOOM, WUSCHEL, LEAFY COTYLEDON, VIVIPAROUS1 e AGAMOUS-LIKE) em canade-açúcar (SP80-3280 e Saccharum spontaneum); ii) analisar a filogenia entre as sequências de aminoácidos de cana-de-açúcar e seus homólogos em Arabidopsis thaliana e espécies de Poaceae; iii) desenhar primers ideais para estudo de expressão gênica de genes relacionados à ESI de cana-de-açúcar. Foram realizadas pesquisas BLAST e BLASTp nos bancos de dados do Phytozome, NCBI, UniProt e Gramene para a obtenção de sequências homólogas das cinco famílias gênicas em milho, sorgo, arroz e A. thaliana. Desse modo, análises filogenéticas de sequências de aminoácidos foram realizadas com o auxílio dos softwares CLUSTALW e MEGAX, que apontaram proximidade evolutiva entre as proteínas de Zea mays, Sorghum bicolor, S. spontaneum e SP80-3280 em todos os genes estudados. As análises in silico indicaram que podem ter mais de um gene das famílias BABYBOOM, WUSCHEL E VIVIPAROUS1 regulando as vias da ESI em cana-de-açúcar. Além disso, com auxílio do software PRIMER3, foram obtidos 8 pares de primers com parâmetros ideais para serem utilizados em futuras análises de expressão gênica para compreender mais profundamente os mecanismos da ESI. CAPES: 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Among the various types of malignant neoplasms, those originating in the bladder can be considered highly impactful due to their prevalence and high recurrence rates, demonstrating the importance of studies involving new therapeutic possibilities. The MB49 cell line is one of the most used for the study of bladder cancer, through its urinary bladder implantation in murine models of tumor induction. Studies have shown that heat shock proteins, such as mortalin, are vital for resistance to the treatment of neoplasms and are present in all processes associated with carcinogenesis. However, there are still not many studies focused on the use of mortalin as a therapeutic target in urothelial bladder carcinoma. Heat shock proteins are also known to play an important role as mediators of immunogenicity. Activating the immune system for therapeutic benefit has long been a goal in immunology, especially in cancer treatment. Antitumor immunotherapy is a promising treatment against several types of cancer, however the low immunogenicity of vaccines remains a limiting factor in this area. Thus, research involving the investigation of the association of these vaccines with immunogenic adjuvants, such as chitosan, is of great relevance for the study of cancer. This thesis aims to: evaluate the pattern of protein expression of mortalin in tumor bladder tissues, using a western blot assay; the investigation of its inhibition effects with MKT-077 on the viability, apoptosis and necrosis of MB49 cells, through viability tests with resazurin and fluorescence; the establishment of a new murine model for the induction of urothelial bladder carcinoma using a thermoreversible polymeric gel (TPG), composed of chitosan and poloxamer; and the identification of the induction of systemic anti-tumor immune response, through a splenocyte cytotoxicity assay, after intravesical inoculation of TPG and MB49 cells. Female mice of the C57BL/6 strain were obtained and used in intravesical tumor cell inoculation procedures. It was observed that mortalin is overexpressed in tumor bladder samples. After the inhibition of mortalin, there was an irreversible reduction in the viability of MB49 cells, promoting an increase in the rates of apoptosis and necrosis in these cells. Antitumor immunotherapy using MB49 cells embedded in a TPG matrix was able to stimulate systemic immune response and affect the development of bladder urothelial carcinoma in an orthotopic and syngeneic murine model. Dentre os diversos tipos de neoplasias malignas, as que se originam na bexiga podem ser consideradas altamente impactantes em função da sua prevalência e dos altos índices de recorrência, demonstrando a importância dos estudos envolvendo novas possibilidades terapêuticas. A linhagem celular MB49 é uma das mais utilizadas para o estudo do câncer de bexiga, por meio de sua implantação vesical em modelos murinos de indução tumoral. Estudos têm demonstrado que as proteínas de choque térmico, como a mortalina, são vitais para a resistência ao tratamento de neoplasias e estão presentes em todos os processos associados com a carcinogênese. No entanto, ainda não existem muitos estudos voltados para a utilização da mortalina como alvo terapêutico no carcinoma urotelial de bexiga. As proteínas do choque térmico também são conhecidas por desempenharem um importante papel como mediadoras da imunogenicidade. A ativação do sistema imunológico para benefício terapêutico é uma meta na imunologia há muito tempo, especialmente no tratamento do câncer. A imunoterapia antitumoral é um tratamento promissor contra diversos tipos de cânceres, porém a baixa imunogenicidade das vacinas continua a ser um fator limitante nesta área. Assim, pesquisas envolvendo a investigação da associação dessas vacinas com adjuvantes imunogênicos, como a quitosana, são de grande relevância para o estudo do câncer. Esta tese tem por objetivos: a avaliação do padrão de expressão proteica da mortalina em tecidos vesicais tumorais, por meio de ensaio de western blot; a investigação dos efeitos de sua inibição com MKT-077 nos índices de viabilidade, apoptose e necrose de células MB49, através de ensaios de viabilidade com resazurina e fluorescência; o estabelecimento de um novo modelo murino para a indução do carcinoma urotelial de bexiga utilizando um gel polimérico termorreversível (TPG), composto por quitosana e poloxamer; e a identificação da indução de resposta imune sistêmica antitumoral, por meio de ensaio de citotoxicidade de esplenócitos, após inoculação intravesical do TPG e células MB49. Camundongos fêmeas da linhagem C57BL/6 foram obtidos e utilizados nos procedimentos de inoculação intravesical de células tumorais. Observou-se que a mortalina encontra-se superexpressa nas amostras de bexigas tumorais. Após a inibição da mortalina, houve uma redução irreversível na viabilidade das células MB49, promovendo o aumento nos índices de apoptose e necrose nestas células. A imunoterapia antitumoral utilizando células MB49 embebidas em matriz de TPG foi capaz de estimular resposta imune sistêmica e afetar o desenvolvimento do carcinoma urotelial de bexiga em modelo murino ortotópico e singênico. CAPES: Código de Financiamento 001

Não recebi financiamento Astyanax is a fish genus of Characiformes and currently is classified as incertae sedis. Astyanax scabripinnis, one of these species, is recognized as a species complex, which is composed of 33 species. This study propose to investigate karyotypic constitution of species of this complex, throughout classical and molecular analyzes: conventional Giemsa staining, C-banding, impregnation with silver nitrate and fluorescence in situ hybridization (FISH) with different repetitive DNA probes (rDNA 5S, rDNA 18S, As51, snRNA U2, H3, H4, Rex1, Rex3, telomeric sequence and microsatellites in three species from different rivers basins: 1) Astyanax aff. scabripinnis (Alto rio Paraná); 2) Astyanax cf. intermedius (Paraíba do Sul); 3) Astyanax cf. goyanensis (Tocantins). For the latter, two units were observed occurring in sympatry, and then the presence of two karyomorphs (A and B) was considered. The analyzes showed that the species have some conserved chromosomal characteristics, such as 2n=50 chromosomes, telomeric sites and chromosomal distribution pattern of repetitive elements Rex1 and Rex3. However, the presence of variable chromosomal characters stands out among the species, showing diversity regarding chromosomal morphology, C-banding pattern, number of sites and location of AgNORs, chromosomal distribution of repetitive DNAs (rDNA 18S and 5S, As51, snRNA U2, H3, H4 and microsatellites). These results demonstrate great diversification of the karyotypic microstructure of species of Astyanax scabripinnis complex and reinforce the biodiversity of the group. In addition, the data obtained has an important role in assisting the taxonomy and evolutionary biology of the group, since they reveal the presence of different units within the complex, which can be delimited with cytogenetic assistance, showing the occurrence of exclusive chromosomal characteristics of each species Astyanax é um gênero de peixes pertencente à Characiformes, sendo atualmente classificado como incertae sedis. Dentre suas espécies encontra-se Astyanax scabripinnis, que é reconhecida como um complexo de espécies, o qual é composto por 33 espécies. Este estudo propôs-se a investigar a constituição cariotípica clássica e molecular de espécies desse complexo, através de análises de citogenética clássica e molecular: coloração convencional por Giemsa, bandamento C, impregnação por Nitrato de Prata e hibridizações in situ fluorescente (FISH) com diferentes sondas de DNA repetitivos (DNAr 5S, DNAr 18S, As51, snRNA U2, H3, H4, Rex1, Rex3, sequência telomérica e microssatélites) em três espécies de diferentes bacias hidrográficas: 1) Astyanax aff. scabripinnis (Alto rio Paraná); 2) Astyanax cf. intermedius (Paraíba do Sul); 3) Astyanax cf. goyanensis (Tocantins). Para esta última observou-se duas unidades ocorrendo em simpatria, sendo então considerada a presença de dois cariomorfos (A e B). As análises mostraram que as espécies possuem algumas características cromossômicas conservadas, como 2n=50 cromossomos, sítios teloméricos e padrão de distribuição cromossômica dos elementos repetitivos Rex1 e Rex3. Entretanto, a presença de caracteres cromossômicos variáveis se sobressai entre as espécies, mostrando diversidade no que se refere à morfologia cromossômica, padrão de bandamento C, número de sítios e localização de AgRONs, distribuição cromossômica de DNAs respetitivos (DNAr 18S e 5S, As51, snRNA U2, H3, H4 e microssatélites). Estes resultados demonstram grande diversificação da microestrutura cariotípica de espécies do complexo Astyanax scabripinnis e reforçam a biodiversidade existente no grupo. Além disso, os dados obtidos tem um importante papel no auxilio à taxonomia e biologia evolutiva do grupo, uma vez que revelam a presença de diferentes unidades dentro do complexo, as quais podem ser delimitadas com o auxílio citogenético, mostrando a ocorrência de características cromossômicas exclusivas de cada espécie

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Brazil Nut (Bertholletia excelsa) is an arboreal species, native to the Amazon forest, by which there’s a concern referring to its ecological sustainability. Therefore, sequencing and assembling the genome might contribute to the conservation of genetic diversity and maintenance of natural populations, besides assisting the comprehension of the success of future populations. Therefore, the objectives are to assemble the genome of Bertholletia excelsa, compare different assembly methodologies, and define the methodology that results in the best quality. The methodology consisted in sequencing DNA samples from an adult individual of Bertholletia excelsa with Pacific Biosciences is Single Molecule Real Time. This step resulted in a genomic coverage of 187× and a N50 of raw reads of 14,02 kb. Following up, the haploid genome size was estimated from k-mer distribution (k=22), resulting in ~596Mpb. Subsequently, there were tested five assemblers (wtdbg2, MECAT2, SMARTdenovo, Flye and Canu) with six genomic coverages (47×, 63×, 97×, 126×, 187× and 60× with corrected reads by Canu). QUAST was used to compare the efficiency of these methods through the following parameters: contig N50, number of contigs, L50 and assembly size in relation to genome size estimative. BUSCO was used to determine the genomic completeness. The LAI score validated its quality, considering the contiguity and integrity of repetitive sequences. In conclusion, the best assembly was SMARTdenovo with genomic coverage of 187×, resulting in a contig N50 of ~2,6 Mb, genic completeness of 95,1% and LAI score of 10,53; totaling an assembly of 649.349.366 pb. A Castanheira-do-Brasil (Bertholletia excelsa) é uma espécie arbórea nativa da Amazônia pela qual existe preocupação referente à sua sustentabilidade ecológica. Desse modo, sequenciar e montar seu genoma pode contribuir para definição de estratégias para a conservação da diversidade genética, manutenção das populações naturais, além de auxiliar na compreensão do sucesso de populações futuras. Portanto, os objetivos do projeto consistem em montar o genoma de Bertholletia excelsa, comparar diferentes metodologias de montagem, e definir a metodologia que obtenha a melhor qualidade. A metodologia consistiu em sequenciar amostras de DNA de um indivíduo adulto de Bertholletia excelsa com a tecnologia Single Molecule Real Time da Pacific Biosciences. Essa etapa, resultou em uma cobertura genômica de 187× e um N50 de reads brutas de 14,02 kb. Em seguida, procedeu-se com a estimativa do tamanho do genoma haploide a partir da distribuição k-mer, resultando em ~596 Mpb. Posteriormente, foram testados cinco assemblers (wtdbg2, MECAT2, SMARTdenovo, Flye e Canu) com seis coberturas genômicas (47×, 63×, 97×, 126×, 187× e 60× com reads corrigidas por Canu). QUAST foi utilizado para comparar a eficiência desses métodos através dos parâmetros: contig N50, número de contigs, L50 e tamanho da montagem em relação a estimativa do tamanho do genoma. BUSCO foi usado para determinar a completude gênica. LAI score validou a qualidade considerando a contiguidade e a integridade de sequências repetitivas. Dessa forma, conclui-se que a montagem com a melhor qualidade foi SMARTdenovo com cobertura genômica de 187×, resultando em um contig N50 de ~2,6 Mb, completude gênica de 95,1%, LAI score igual a 10,53; totalizando a montagem em 649.349.366 pb. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Erythrocytes are anucleated cells that play an extremely important role, since they participate in the transport of oxygen (O2) to tissues. Changes in the structure or functioning of the erythrocyte can lead to several deficiencies, such as hemolytic anemias, as the main clinical causes that can lead to an increase in the production of Reactive Oxygen Species (ROS), aggravating the patient's clinical condition. Several compounds have been studied as complementary therapy in hemolytic anemias to end the oxidative effects caused by these diseases, but no success has been allowed until then. Melatonin is a hormone that participates as a regulator of the sleep cycle, and more recently a role as an antioxidant has also been given to this compound. In this context, the present study aimed to evaluate the direct and indirect antioxidant effects of melatonin on erythrocyte cells, using K562 erythroid cells as a biological model. Therefore, a genetic expression and protein content of different antioxidant enzymes is available in K562 cells, differentiated or not by the addition of hydroxyurea and hemin in the face of melatonin treatment (1nM and 1mM) when induced or without oxidative stress (100μM H2O2). Viability, differentiation and level of lipid peroxidation are also available in these cells. Our results show that the administration of 1nM melatonin leads to an increase in the amount of undifferentiated K562 cells when exposed to oxidative stress induced by H2O2, in addition to decreasing the levels of lipid peroxidation in these cells. mRNA expression of the antioxidant enzymes PRDX1 and PRDX2 was increased when 1mM melatonin was administered in the presence of H2O2 in differentiated cells (PRDX1 mRNA - 50% on day 2 and 50% on day 4; PRDX2 mRNA - 100% on day 2 and 66% on day 4). An analysis of the protein content also showed important effects of melatonin, whose administration of 1mM increased the expression of NRF2 (290% without H2O2, and 437% with H2O2) and of the antioxidant enzymes PRDX2 (20% without H2O2 and 57% with H2O2) and CAT (170% without H2O2 and 200% with H2O2) in differentiated cells on day 4. In this context, a melatonin has shown a promising therapeutic agent in this type of cell, modifying an expression of important biomarkers related to erythrocyte redox metabolism and showing itself potentially important for new antioxidant therapies. Os eritrócitos são células anucleadas que desempenham um papel extremamente importante, já que participam do transporte de oxigênio (O2) para os tecidos. Alterações na estrutura ou funcionamento do eritrócito podem levar a diversas deficiências, como as anemias hemolíticas, as quais causam manifestações clinicas que podem levar ao aumento de produção de Espécies Reativas de Oxigênio (ERO) agravando o quadro clinico do paciente. Diversos compostos vêm sendo estudados como terapia complementar em anemias hemolíticas a fim de minimizar os efeitos oxidativos causados por essas doenças, entretanto nenhum sucesso foi obtido até então. A melatonina é um hormônio que participa como regulador do ciclo do sono, e mais recentemente um papel como antioxidante vem sendo conferido também a este composto. Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo avaliar possíveis efeitos antioxidantes diretos e indiretos da melatonina em células eritrocitárias, utilizando células eritróides K562 como um modelo biológico. Para tanto, avaliamos a expressão gênica e conteúdo proteico de diferentes enzimas antioxidantes em células K562 diferenciadas ou não pela adição de Hidroxiureia e Hemina frente o tratamento de melatonina (1nM e 1mM) quando induzidas ou não a estresse oxidativo (100μM de H2O2). Avaliamos também a viabilidade, diferenciação e nível de peroxidação lipídica nestas células. Nossos resultados mostraram que a administração da melatonina a 1nM levou ao aumento da sobrevivência das células K562 não diferenciadas quando expostas ao estresse oxidativo induzido por H2O2, juntamente com a diminuição dos níveis de peroxidação lipídica nessas células. A expressão de RNAm das enzimas antioxidantes PRDX1 e PRDX2 foi aumentada quando administrada melatonina a 1mM na presença de H2O2 em células diferenciadas (RNAm de PRDX1 - 50% no dia 2 e 50% no dia 4; RNAm de PRDX2 – 100% no dia 2 e 66% no dia 4). A análise de conteúdo proteico também mostrou importantes efeitos da melatonina, cuja administração de 1mM aumentou a expressão de NRF2 (290% sem H2O2, e 437% com H2O2) e das enzimas antioxidantes PRDX2 (20% sem H2O2, e 57% com H2O2) e CAT (170% sem H2O2, e 200% com H2O2) em células diferenciadas no dia 4. Neste contexto, a melatonina vem se mostrando um promissor agente terapêutico nesse tipo celular, modificando a expressão de importantes biomarcadores relacionados ao metabolismo redox eritrocitário e se mostrando potencialmente importante para novas terapias antioxidantes. CAPES: código de financiamento - 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Termites (Isoptera) are eusocial insects that stand out for their hierarchical and structural organization, demonstrating complex social behaviors, numerous symbiotic interactions, and a great potential for bioprospecting enzymes of industrial interest. In addition, they are also frequent pests of Brazilian agricultural monocultures. Despite the importance of this species, molecular studies on termites have not yet been sufficient so that the mechanisms that control phenotypic plasticity in these insects have been completely elucidated. In this exploratory study, we performed a comparative inter and intraspecific analysis between termite transcriptomes of the Brazilian species Heterotermes tenuis, Cornitermes cumulans and Velocitermes heteropterus, as well as a biodiversity survey of their endosymbiotic microbiota and prospecting of genes with biotechnological potential. Important differences were found between the lower and the higher species when compared in terms of their taxonomic diversity, including the surprising detection of flagellate symbionts in the higher species, with emphasis on the great presence of the phylum Amoebozoa. Our analysis of differential expression showed that the majority of the annotated genes were unique to a certain caste or species, and their functional annotation showed differences in biological processes, especially among the castes of higher species. Among the most differentially expressed genes of each species, we found genes with potential for use in the management of termites as pests and for industrial applications, e.g., hexamerins, cytochrome P450 and many cellulases. Together, these results enhance the knowledge about the plasticity observed through the castes and open new perspectives for future biotechnological applications. Cupins (Isoptera) são insetos eusociais que se destacam por sua organização hierárquica e estrutural, demonstrando comportamentos sociais complexos, numerosas interações simbióticas, e um grande potencial para bioprospecção de enzimas de interesse industrial. Além disso, também são frequentes pragas de monoculturas agrícolas brasileiras. Apesar da importância desta espécie, estudos moleculares sobre os cupins até o momento ainda não foram suficientes para que os mecanismos que governam a plasticidade fenotípica nesses insetos tenham sido completamente elucidados. Neste estudo exploratório, realizamos uma análise comparativa inter e intraespecífica entre transcriptomas de cupins das espécies brasileiras Heterotermes tenuis, Cornitermes cumulans e Velocitermes heteropterus, assim como um levantamento da biodiversidade de suas microbiotas endossimbiontes e prospecção de genes com potencial biotecnológico. Foram encontradas importantes diferenças entre a espécie basal e as superiores quando comparadas quanto a sua diversidade taxonômica, incluindo a surpreendente detecção de simbiontes flagelados nas espécies superiores, com destaque para a grande presença do filo Amoebozoa. Nossa análise de expressão diferencial mostrou que a maioria dos genes anotados eram únicos de uma determinada casta ou espécie, e sua anotação funcional evidenciou diferenças nos processos biológicos, principalmente entre as castas das espécies superiores. Entre os genes mais diferencialmente expressos de cada espécie, encontramos genes com potencial para uso no manejo de cupins como pragas e para aplicações industriais, e.g., hexamerinas, citocromo P450 e celulases diversas. Os resultados gerados e analisados neste estudo avançam os conhecimentos sobre a plasticidade observada nas castas e abrem perspectivas para possíveis aplicações biotecnológicas. CAPES: 88882.426720/2019-01 (Migrado - SACPAIS)

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) Brazil is a significant exporter of beef, so the improvement of Nelore, a breed mostly present in the Brazilian herd, directly impact this sector. Genomic tools can identify SNPs associated with interesting livestock phenotypes, but the selection efficiency depends on the expression of the selected alleles in the animals. Previous studies have identified 820 SNPs presenting allelespecific expression (ASE) in Nelore’s Longissimus thoracis muscle, for which we searched for regulatory SNPs associated with this allelic expression pattern, or aseQTLs (allele-specific expression quantitative trait loci). To this end, scans were performed within 1Mb windows from the SNP with ASE (ASE SNP), and subsequently, the candidate genotypes of that window were related to the allelic imbalance in the ASE SNP. For obtaining the methylation profile of aseQTLs, the candidate positions were overlapped with RRBS (Reduced Representation Bisulfite Sequencing) methylation data from 12 animals of the same population. The flanking sequences of aseQTLs were used to predict the allele-specific presence of transcription factor binding sites (TFBSs) and miRNAs. We identified 1,134 aseQTLs associated with 126 ASE SNPs. Sixteen aseQTLs were methylated in our population, 215 affected TFBSs expressed in bovine muscle, and 162 aseQTLs affected miRNA binding sites. The integration of aseQTLs with previous association studies performed in the same population showed enrichment for meat quality traits, such as tenderness, rib eye area, and intramuscular fat. AseQTLs associated with the CMYA5 gene showed high linkage disequilibrium (LD), multiple overlaps with meat quality phenotypes and prediction of binding sites for miRNAs, thus indicating potential regulatory sites for this gene. In general, the results indicate that ASE may be the result of regulation exercised by multiple aseQTLs and undergo modulation by epigenetic and cisregulatory mechanisms. The aseQTLs described had a significant influence of LD. These variants may impact the expression of genes functionally important for phenotypes that affect, among others, meat sensory characteristics, factors that are essential for consumer acceptance. O Brasil é um grande exportador de carne, o que faz o melhoramento da raça Nelore, majoritariamente presente no rebanho brasileiro, impactar diretamente nesse setor. Ferramentas genômicas podem identificar genes e SNPs associados a fenótipos de interesse agropecuário, mas a eficiência da seleção depende da expressão dos alelos selecionados nos animais. Estudos prévios identificaram 820 SNPs apresentando expressão alelo-específica (ASE, do inglês allelespecific expression) no músculo Longissimus thoracis de Nelore, para os quais o presente estudo realizou a busca de SNPs reguladores associados ao padrão de expressão alélica, ou aseQTLs (do inglês allele-specific expression quantitative trait loci). Para isso, foram realizadas varreduras dentro de janelas de 1Mb em relação ao SNP com ASE (SNP ASE) e, posteriormente, os genótipos candidatos dessa janela foram relacionados ao desequilíbrio alélico no SNP ASE. Para obter o perfil de metilação dos aseQTLs, as posições candidatas foram sobrepostas a dados de metilação obtidos por RRBS (Do inglês Reduced Representation Bisulfite Sequencing) de 12 animais da mesma população. As sequências flanqueadoras dos aseQTLs foram utilizadas na predição da presença alelo-específica de sítios de ligação de fatores de transcrição (SLFTs) e de miRNAs. Foram identificados 1.134 aseQTLs, associados a 126 SNPs ASE. Dezesseis aseQTLs correspondiam a regiões sujeitas à metilação na nossa população, 215 potencialmente afetavam os sítios de ligação de fatores de transcrição expressos em músculo bovino e 162 afetavam sítios de ligação de miRNA expressos em músculo da nossa população. A integração dos aseQTLs a estudos de associação obtidos previamente na mesma população mostrou um enriquecimento para características de qualidade de carne, tais como maciez, área de olho de lombo e gordura intramuscular. AseQTLs associados ao gene CMYA5 apresentaram intenso desequilíbrio de ligação (DL), múltiplas sobreposições a fenótipos de qualidade de carne e predição de sítios de ligação para miRNAs, indicando potenciais sítios reguladores da expressão desse gene. No geral, os resultados indicam que a ASE pode ser resultante da regulação exercida por múltiplos aseQTLs e sofrer modulação por mecanismos epigenéticos e cis-reguladores. Os aseQTLs descritos apresentaram grande influência do DL. Essas variantes podem interferir na expressão de genes importantes para fenótipos que afetam, entre outros, características sensoriais da carne, fatores imprescindíveis para a aceitação do consumidor. CNPq: 456191/2014-3 CAPES: Código de Financiamento 001 FAPESP: 2012/23638-8 FAPESP: 2019/04089

Outra Titanium dioxide nanoparticles (TiO2 NP) are included as one of the most used nanomaterials by industries in general; it is applied in coatings, pigments, and paints for its ability to offer opacity and brightness, in sunscreens blocking ultraviolet rays (UV) and in the manufacture of photovoltaic cells. In addition, nanoparticles are highly used by the petrochemical industry to improve oil extraction. This scenario culminated in the growing use of nanoparticles and in the concern about their harmful effects on the environment and living beings. Thus, it became important to assess the toxic effects of nanomaterials after exposure to biological models (cells and tissues) to understand their risks to those who produce and manipulate them. Our work aimed to evaluate the cytotoxicity and genotoxicity of a new TiO2 NP and its immune response to in vitro models. The MTT cytotoxicity assay was used to assess the cell viability following exposure to TiO2 NP (2000, 1000, 100, 10 and 0.1 µg / mL) at 24, 48, 72 and 96 h in mouse fibroblasts LA-9 and at 24, 48 and 72 h in macrophages J774A.1. The comet assay (pH alkaline) was used to evaluate the genotoxicity of TiO2 NP (100, 10 and 1 µg / mL) after exposure to fibroblasts during 24 h. Cytokines IL-10, TNF-α, and IL-12 were measured in macrophage cell supernatant after exposure to TiO2 NP (1000, 100 and 10 µg / mL) at 24, 48 and 72 h by ELISA, and evaluated the expression of genes Nos2, Stat6 and Nfkb by qRT-PCR. In fibroblasts, TiO2 NP promoted cytotoxic effects at 96 h in the concentrations of 2000 and 1000 µg / mL and was genotoxic in all concentrations tested at 24 h compared to negative control. In macrophages, there was a decrease in cell viability after 48 h of exposure at concentrations of 2000 and 1000 µg/mL. Cytokine dosage and gene expression analysis in macrophages suggest that TiO2 NP uptake in high concentrations (≥ 1000 µg / mL) at 72 h may have generated an intracellular activation process, reflected in the high levels of IL-12, which possibly induced the production of IL-10 as a regulatory factor, in addition to being in agreement with the increased expression of the Stat6 and NF-kB genes that participate in cellular polarization in these cells. The high Nos2 expression after exposure to TiO2 NP (1000 µg / mL) demonstrates the activation of the inflammatory process in this experimental condition. The main toxicity mechanism suggested is the photocatalytic potential of TiO2 NP due to its mineral composition (anatase) and the possible generation of reactive oxygen species. Thus, TiO2 NP was cytotoxic to both cell lines in high concentrations and genotoxic to fibroblast at 24 h. Nanopartículas de titânio (NPs TiO2) estão listadas como um dos nanomateriais mais utilizados pelas indústrias em geral sendo empregadas em revestimentos, pigmentos e tintas pela sua capacidade em oferecer opacidade e brilho, em bloqueadores solares por filtrar os raios ultravioleta (UV) e na confecção de células fotovoltaicas. Além disso, nanopartículas são altamente utilizadas pela indústria petroquímica na extração melhorada de petróleo. Esse cenário culminou no crescimento do uso de nanopartículas e na preocupação acerca de seus efeitos nocivos ao meio ambiente e os seres vivos. Assim, tornou-se importante avaliar os efeitos tóxicos de nanomateriais após exposição à modelos biológicos (células e tecidos) para a compreensão de seus riscos a quem os produzissem e os manipularia. Dessa forma, o presente trabalho buscou avaliar a citotoxicidade e genotoxicidade de uma nova NP TiO2 de interesse da indústria petroquímica e sua resposta imune frente à modelos in vitro. O ensaio de citotoxicidade com MTT foi utilizado para avaliar a viabilidade celular de fibroblastos LA-9 após exposição à NP TiO2 (2000, 1000, 100, 10 e 0,1 µg/mL) nos períodos de 24, 48, 72 e 96 h e de macrófagos J774A.1 nos períodos de 24, 48 e 72 h. O Ensaio Cometa (em pH alcalino) foi utilizado para avaliar a genotoxicidade da NP TiO2 (100, 10 e 1 µg/mL) sobre os fibroblastos após o período de exposição de 24 h. Foi realizada a dosagem das citocinas IL-10, TNF-α e IL-12 no sobrenadante celular de macrófagos após exposição à NP TiO2 (1000, 100 e 10 µg/mL) nos períodos de 24, 48 e 72 h via ELISA e avaliada a expressão dos genes iNOS, Stat6 e NF-kB via qRT-PCR. Em fibroblastos a NP TiO2 promoveu efeitos citotóxicos apenas no período de 96 h de exposição nas concentrações de 2000 e 1000 µg/mL e foi genotóxica em todas as concentrações testadas no período de 24 h em relação ao controle negativo. Em macrófagos houve redução de viabilidade celular a partir do período de 48 h de exposição nas concentrações de 2000 e 1000 µg/mL. A dosagem de citocinas e análise de expressão gênica em macrófagos sugerem que a internalização da NP TiO2 em altas concentrações (≥ 1000 µg/mL) no período de 72 h pode ter gerado um processo de ativação intracelular, refletido nos altos níveis de produção de IL-12, e que possivelmente induziu para a produção de IL-10 como um fator regulatório, além de ser concordante com o aumento da expressão dos genes Stat6 e NF-kB que participam da polarização celular em macrófagos. A expressão gênica elevada de iNOS após exposição à NP TiO2 (1000 µg/mL) representa um dos componentes da resposta inflamatória nessa condição experimental. O principal mecanismo de toxicidade sugerido é o potencial fotocatalítico da NP TiO2 devido a sua composição mineral (anatase) e a possível geração de espécies reativas de oxigênio. Assim, a NP TiO2 foi citotóxica em altas concentrações (≥ 1000 µg/mL) em ambas as linhagens celulares avaliadas e genotóxica no período de 24 h para a linhagem de fibroblastos. ANP/Petrobras (Nº do processo 2017/00010-7)

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The Lebiasinidae family is composed by seven genus of small freshwater fishes that can be found in small rivers of Central and South America. Members of this family presents a great diversity in form and body color, but their evolutionary relationships are still unclear. Our objective was to realize the first cytogenetical analysis in two species of Lebiasina genus, aiming to clarify their karyotypic characteristics and their chromosomal evolution. For this, Lebiasina bimaculata and L. melanoguttata presents 2n = 36 as their diploid number, exclusively composed by bi-armed chromosomes. The C-positive heterochromatin was located in centromeric and telomeric regions of several chromosomes in both species. But, in L. melanoguttata there is a remarkable interstitial series of c-positive heterochromatin, absent in L. bimaculata. The rDNA 5S is located in the interstitial region on q-arm of the first chromosomic pair in both species, with an additional site on telomeric region of 13 chromosome of L. melanoguttata. The 18S rDNA can be found in telomeric region of the third pair in L. bimaculata, while L. melanoguttata presents multiple marks located in telomeric region on long arm of pairs 1 and 3, in telomeric region on short arm of 7 and 9 pairs and in both regions of the second chromosomic pair. The whole chromosome painting with a probe from the first chromosomic pair showed a share of genomic content between the two Lebiasina species and Boulengerella (Ctenoluciidae), evidencing the close relationship between this two families. Additionally, the comparative genomic hybridization among the two Lebiasina species reveals a high level of genomic differentiation amid them. Another experiment of comparative genomic hybridization reveals a telomeric sex-specific region on the third chromosomic pair of L. bimaculata females. This result with the differential pattern of c-banding, CMA3+ differential stain and the fluorescent in situ hybridization with the microsatellite probe (CGG)n indicates two possibilities (i) the presence of a copy number variation process, generating differences between the homologous pair, or (ii) a nascent sex chromosome system of ZZ/ZW type. Besides that, two chromosomal evolutionary pathways were recognized in Lebiasinidae family, being the first responsible for a probable diploid number conservation in Lebiasininae and, in contrast, an acrocentrization tendency in Pyrrhulininae. A família Lebiasinidae é composta por sete gêneros de pequenos peixes de água doce, sendo encontrados em pequenos riachos da América Central e do Sul. Os membros desta família apresentam uma grande diversidade de formas corpóreas e coloração, mas suas relações evolutivas se mantêm inexplicadas. Nosso objetivo é realizar as primeiras análises citogenéticas em duas espécies do gênero Lebiasina, permitindo investigações acerca das características cariotípicas e de sua evolução cromossômica. Para isso, Lebiasina bimaculata e L. melanoguttata apresentaram 2n = 36 cromossomos em seu cariótipo, exclusivamente composto por cromossomos meta/submetacêntricos. A heterocromatina C-positiva se localizou nas regiões centroméricas e teloméricas de diversos cromossomos em ambas as espécies. Em L. melanoguttata, uma série intersticial de heterocromatina C-positiva é obervada, sendo ausente em L. bimaculata. O rDNA 5S se encontra na região intersticial do braço q do primeiro par cromossômico em ambas as espécies, com um sítio adicional na região telomérica do cromossomo 13 em L. melanoguttata. O rDNA 18S está localizado na região telomérica do terceiro par em L. bimaculata, enquanto L. melanoguttata apresenta múltiplas marcações localizadas na região telomérica dos braços longos dos pares 1 e 3, na região telomérica do braço curto dos pares 7 e 9 e em ambos os telômeros do segundo par cromossômico. A pintura cromossômica total com sonda do primeiro par cromossômico revelou o compartilhamento total do conteúdo genômico deste par entre ambas as espécies de Lebiasina e Boulengerella (Ctenoluciidae), evidenciando o relacionamento próximo destas famílias. Adicionalmente, a hibridização genômica comparativa entre as duas espécies de Lebiasina revelou um alto grau de diferenciação genômica entre elas. Outro experimento de hibridização genômica comparativa revelou uma região telomérica sexo-específica no terceiro par cromossômico de fêmeas de L. bimaculata. Este resultado, assim como o padrão diferencial de bandas C-positivas, coloração diferencial CMA3+ e a hibridização fluorescente com o microssatélite (CGG)n indica duas possibilidades i) a presença de uma variação de número de cópias, gerando diferenças entre os pares homólogos, ou ii) um sistema cromossômico sexual nascente do tipo ZZ/ZW. Além disso, é possível observar duas tendências na evolução cromossômica da família Lebiasinidae, sendo a primeira responsável por uma provável conservação do número diploide em Lebiasininae e, contrariamente, a tendência de acrocentrização em Pyrrhulininae. CAPES: 88882.426716/2019-01

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Colorectal cancer is the third most diagnosed malignant disease and the fourth leading cause of cancer-related deaths in the world. Cancer treatments are not fully effective and low selectivity to tumor tissue has marked side effects, so there is a high importance of studies that seek new alternatives for the treatment of this disease. In this work we use an attenuated strain of Salmonella as a live bacterial vector, which prefers to invade the tumor microenvironment and can produce heterologous proteins with immunotherapeutic potential. The objectives were to develop plasmids and insert them into the attenuated Salmonella SL3261, containing the genes that encode tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand (TRAIL) and Interleukin 2 (IL-2); and evaluate, in vitro and in vivo, the antitumor potential of these strains in colorectal tumor (HCT-8 strain). Confirmation of protein construction and expression was done by electrophoresis, Western Blot and ELISA, with anti-TRAIL and anti-IL-2 monoclonal antibodies. The effect on HCT-8 was determined by the cytotoxicity test (MTT), Griess reaction and apoptosis assay (Annexin V). To analyze tumor progression in vivo, mice received tumor cells and, after tumor implantation, were treated with the constructed strains. Tumor size was calculated every three days and tumor weight was determined after euthanasia. The results demonstrated that the expression vector construction was effective and the proteins were expressed by SL3261. In vitro tests showed decreased viability and increased cell death in groups treated with SL3261_TRAIL and SL3261_IL-2 when compared to control groups, and nitric oxide production. Regarding the in vivo tests, the SL3261, SL3261_TRAIL and SL3261_MIX (TRAIL + IL-2) treatments showed antitumor effect in this model, since they presented decreased tumors compared to the untreated control 14 days after treatment. Thus, it is suggested that TRAIL and IL-2, expressed by SL3261, have antitumor effect in the colorectal cancer model, proposing a possible immunotherapy against this type of tumor. O câncer colorretal é a terceira doença maligna mais diagnosticada e a quarta principal causa de mortes relacionadas ao câncer no mundo. Os tratamentos contra o câncer não se mostram totalmente eficazes e a baixa seletividade ao tecido tumoral traz efeitos colaterais marcantes, por isso a importância de estudos que buscam novas alternativas para o tratamento dessa doença. Neste trabalho foi utilizada uma linhagem atenuada de Salmonella como vetor bacteriano vivo, a qual apresenta preferência por invadir o microambiente tumoral e nele produzir as proteínas heterólogas com potencial imunoterapêutico. Os objetivos se pautaram em desenvolver plasmídeos e inseri-los na Salmonella atenuada SL3261, contendo os genes que codificam o ligante indutor de apoptose relacionado ao fator de necrose tumoral (TRAIL) e a Interleucina 2 (IL-2); e avaliar, in vitro e in vivo, o potencial antitumoral dessas linhagens em tumor colorretal (linhagem HCT-8). A confirmação da construção e expressão das proteínas foi realizada em eletroforese, Western Blot e ELISA, com anticorpos monoclonais anti-TRAIL e anti-IL-2. O efeito em HCT-8 foi determinado pelo teste de citotoxicidade (MTT), reação de Griess e ensaio de apoptose (Anexina V). Para analisar a progressão tumoral in vivo, camundongos receberam células tumorais e, após a implantação do tumor, foram tratados com as linhagens construídas. O tamanho dos tumores foi calculado a cada três dias e o peso dos tumores foi determinado após a eutanásia. Os resultados demonstraram que a construção do vetor de expressão se mostrou eficaz e as proteínas foram expressas pela SL3261. Os testes in vitro mostraram diminuição da viabilidade e aumento da morte celular nos grupos tratados com as linhagens SL3261_TRAIL e SL3261_IL-2 quando comparados aos grupos controles, e houve produção de óxido nítrico. Em relação aos testes in vivo, os tratamentos com SL3261, SL3261_TRAIL e SL3261_MIX (TRAIL + IL-2) apresentaram efeito antitumoral neste modelo, uma vez que apresentaram tumores diminuídos em relação ao controle não tratado, 14 dias após o tratamento. Assim, sugere-se que TRAIL e IL-2, expressas por SL3261, apresentam efeito antitumoral no modelo de câncer colorretal, propondo uma possível imunoterapia contra esse tipo de tumor. Código de Financiamento 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) The mineral concentration of the bovine muscle does not only depend on the balance between the ingestion and excretion of minerals, but also the environment, breed and genetic factors. In addition, mineral content can affect biological processes related to meat quality, acting in chemical reactions related to tenderness in postmortem as well as in the maintanance of muscular cells throught its action in methabolism, as enzimatic co-factors and in the regulation of cell replication and differentiation. Since detecting genetic elements involved with mineral homeostasis is of interest to the meat industry, we present analyzes performed for this purpose. Differential gene expression tests were performed in muscle Longissiumus thoracis of groups of Nelore steers contrasting separately to the concentration of the minerals calcium, copper, potassium, magnesium, sodium, phosphorus, sulfur, selenium and zinc. The iron mineral was not included in these analyses because the differentially expressed genes related to iron concentration in the same population in study were already published by our research group. A functional enrichment of the differentially expressed genes was made, also verifying protein-protein interactions known among them, in search of biological processes related to each mineral. Then, also including iron concentration data, two new approaches were developed to use the PCIT (Partial Correlation Coefficient with Information Theory) and RIF algorithms (Regulatory Impact Factor). The new applications for using these algorithms allowed the direct identification of genetic elements correlated to the mineral concentration continuously in our population and the quantification of the regulatory impact of the genes and miRNAs correlated to a mineral on the concentration of this mineral. The regulation of the pathways related to adipogenesis was significant and the genes indicated here may explain the antagonistic effect known between Cu and Zn in the biosynthesis of fatty acids. With the new applications to use the PCIT and RIF algorithms, genes known to be linked to mineral homeostasis with high regulatory impact were identified and previously indicated as regulatory in our population for being transcription factors, eQTLs or miRNAs. The PLCB2 gene is correlated with Fe and S, the latter correlates to the other minerals. The NOX1 gene possessed significant RIF and is correlated to Se. In humans, the concentration of zinc regulates NOX1. We conclude that the core of genetic regulation for all minerals studied seems to be in the interactions between the components of the extracellular matrix. We can infer that the integration of the proposed techniques in our work may include a new level of information about the regulatory elements involved in mineral homeostasis. A concentração mineral do músculo bovino não depende somente do equilíbrio entre a ingestão e a excreção de minerais, mas também do ambiente, da raça, do estado fisológico e de fatores genéticos. Além disso, o conteúdo mineral pode afetar processos biológicos relacionados à qualidade da carne, atuando em reações químicas relacionadas à maciez no post mortem e, na manutenção das células musculares, através de sua ação no metabolismo, como co-fatores enzimáticos e na regulação da replicação e diferenciação celular. Visto que detectar elementos genéticos envolvidos com a homeostase mineral é de interesse da indústria de produção da carne, apresentamos análises executadas para este fim. Testes de expressão gênica diferencial foram realizados em músculo Longissimus thoracis de grupos de novilhos Nelore contrastantes separadamente para a concentração dos minerais cálcio, cobre, potássio, magnésio, sódio, fósforo, enxofre, selênio e zinco. O mineral ferro não foi incluído nessas análises pois os genes diferencialmente expressos relacionados à concentração de ferro na mesma população em estudo já foram previamente publicados por nosso grupo de pesquisa. Um enriquecimento funcional dos genes diferencialmente expressos foi feito, verificando também interações proteína-proteína conhecidas entre eles, em busca de processos biológicos relacionados a cada mineral. Em seguida, incluindo-se também dados de concentração de ferro, desenvolveram-se duas novas abordagens de utilização dos algoritmos PCIT (Partial Correlation Coefficient with Information Theory) e RIF (Regulatory Impact Factor). Essas abordagens permitiram a identificação direta de elementos genéticos correlacionados à concentração de minerais, de forma contínua, em nossa população e a quantificação do impacto regulatório dos genes e miRNAs correlacionados a um mineral sobre a concentração deste mineral. A regulação das vias relacionadas à adipogênese foi significativa e genes apontados aqui podem explicar o efeito antagônico conhecido entre Cu e Zn na biossíntese de ácidos graxos. Com as novas abordagens de utilização dos algoritmos PCIT e RIF, foram identificados genes sabidamente ligados à homeostase mineral, com alto impacto regulatório e previamente apontados como regulatórios em nossa população por serem fatores de transcrição, eQTLs ou miRNAs. O gene PLCB2 é correlacionado com Fe e S, sendo esse gene a provável conexão entre Fe e os demais minerais. O gene NOX1 possuiu impacto regulatório significativo sobre a concentração de Se e Zn. Em humanos, a concentração de zinco regula NOX1. Concluímos que o cerne da regulação genética da concentração tecidual para todos os minerais estudados parece estar nas interações entre os componentes da matriz extracelular. Podemos inferir que a integração das técnicas realizadas em nosso trabalho pode incluir um novo nível de informação acerca dos elementos regulatórios envolvidos na homeostase mineral. CAPES: Código de Financiamento 001

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Dendropsophus minutus is a widely distributed hyilid in the Neotropical Region that have significant morphological variation along its area of occurrence. Recent molecular studies revealed high diversity of clades under the name Dendropsophus minutus. By this reason, we sought to identify patterns of polymorphisms in Dendropsophus minutus along the species distribution through the different Brazilian phytophysiognomies: Amazon, Caatinga, Cerrado, Atlantic Forest and Pampa. We studied the morphological variation in Dendropsophus minutus by analyzing the morphometry and dorsal color pattern of males housed in Brazilian herpetological collections. Additionally, we amplified the 16S mitochondrial gene fragment to allocate morphometrically analyzed specimens into the phylogenetic tree from the literature. Even though there are sympatrics morphotypes in Dendropsophus minutus, we observe the absence of the dorsal pattern “bivittata” form in Northern Brazil, while the “minuta” pattern was not recorded in the South of the country. This study did not distinguish morphometrically the species through its distribution in Brazil; however, significant molecular differentiation in Amazonian specimens currently identified as Dendropsophus minutus was described, that are strongly related to samples of the taxon Dendropsophus goughi. Dendropsophus minutus é um hilídeo amplamente distribuído na Região Neotropical que apresenta variação morfológica considerável ao longo de sua área de ocorrência. Estudos moleculares recentes revelaram alta diversidade de clados sob o nome Dendropsophus minutus. Assim sendo, buscamos identificar padrões de polimorfismos em Dendropsophus minutus ao longo da distribuição da espécie em diferentes fitofisionomias brasileiras: Amazônia, Caatinga, Cerrado, Mata Atlântica e Pampa. Estudamos a variação morfológica em Dendropsophus minutus, analisando a morfometria e o padrão de colorido dorsal de machos depositados em coleções herpetológicas brasileiras. Adicionalmente, amplificamos o fragmento de gene mitocondrial 16S para alocar espécimes analisados morfometricamente à árvore filogenética da literatura. Apesar de haver morfotipos simpátricos em Dendropsophus minutus, nós observamos a ausência do padrão dorsal da forma “bivittata” no Norte do Brasil, enquanto o padrão “minuta” não foi registrado no Sul do país. Esse estudo não diferenciou morfometricamente a espécie em sua distribuição no Brasil; porém, diferenciação molecular significativa em espécimes amazônicos atualmente identificados como D. minutus foi descrita, os quais se relacionaram fortemente às amostras do táxon Dendropsophus goughi. CAPES: código de financiamento - 01

Os medicamentos prednisona (PD) e azatioprina (AZA) são amplamente utilizados na terapia imunossupressora de pacientes transplantados ou com doenças autoimunes. O uso crônico de imunossupressores já tem sido correlacionado com a ocorrência de diversos efeitos adversos e também com o desenvolvimento de neoplasias nesses pacientes. Considerando que a atividade genotóxica está associada ao aumento do risco de ocorrência de câncer, este estudo avaliou as atividades mutagênica, genotóxica e citotóxica de PD e AZA utilizando testes in vitro e in vivo. A atividade mutagênica foi avaliada pelo teste de mutagenicidade de Ames, em cepa TA100 de Salmonella typhimurium. A avaliação da genotoxicidade e citotoxicidade foi realizada por meio do teste do micronúcleo e do ensaio cometa, utilizando células de medula óssea de camundongos. Além disso, foi avaliada a ação tóxica em órgãos (fígado e rins) de camundongos tratados com PD e AZA. Os resultados do teste de Ames demonstraram que a PD não apresentou diferença significativa quando comparada com o controle negativo em todas as doses testadas (p > 0,05). A AZA, por sua vez, apresentou aumento significativo em relação ao controle negativo (p < 0,05) nas duas maiores doses testadas (20 e 40 μg/placa). No teste do micronúcleo a PD demonstrou atividade genotóxica em todas as doses e tempos testados e foi citotóxica em dois tratamentos (1,0 mg/kg em 48 horas, e 0,5 mg/kg em 120 horas). No ensaio cometa a PD demonstrou elevada porcentagem de dano ao DNA em todas as doses e tempos testados, tendo o tratamento de 120 horas apresentado maior atividade genotóxica (p < 0,05). No mesmo ensaio a AZA apresentou um aumento significativo em todas as doses e tempos de tratamentos quando comparados ao controle negativo (p < 0,05). Na análise histopatológica foi observada de moderada a acentuada congestão em fígado de camundongos tratados com PD e discreta hiperemia em fígado de camundongos tratados com AZA. Deste modo, a PD não apresentou atividade mutagênica no teste de Ames, porém foi genotóxica e citotóxica nos ensaios in vivo, apresentando moderado efeito tóxico na análise histopatológica. A AZA apresentou atividade mutagênica e genotóxica nos diversos ensaios toxicogenéticos realizados, porém não provocou alterações tóxicas relevantes em tecidos. Prednisone (PD) and azathioprine (AZA) are widely used in the immunossupressive therapy of transplanted and autoimmune disease patients. The chronic use of immunossupressants has been correlated with the occurrence of several side effects and also with the increase of neoplasia in those patients. Considering that genotoxic activity is associated to the increase of risk of cancer development, this study evaluated mutagenic, genotoxic and cytotoxic activities PD and AZA using in vitro and in vivo assays. The mutagenic activity was evaluated using mutagenicity Ames test in Salmonella typhimurium TA100 strain. The evaluation of genotoxicity and cytotoxicity was performed using micronucleus and comet assays in mouse bone marrow cells. Moreover, it was evaluated the toxic effects of PD and AZA in organs (liver and kidneys) of mice. In the mutagenic Ames test PD didn’t showed significant difference compared to the negative control in all tested doses (p > 0,05). In contrast, AZA exhibited significant increase compared to negative control in the two higher doses (20 and 40 μg/plate) (p < 0,05). In the micronucleus test, PD showed genotoxic activity in all tested doses and times and was cytotoxic in two of the tested doses (1,0 mg/kg in 48 hours and 0,5 mg/kg in 120 hours). In the comet assay, PD showed high porcentage of DNA damage in all tested doses and times. Furthermore, the 120 hours treatment presented the highest genotoxic activity when compared to the other PD tested groups (p < 0,05). In the same assay, AZA showed significant increase in all doses and times of treatment when compared with negative control (p < 0,05). In the histopathological analyzes, it was observed a moderate to accentuated congestion in mice liver treated with PD and a discrete hyperemia in mice liver when treated with AZA. Therefore, PD did not showed mutagenic activity in Ames test, however it was genotoxic and cytotoxic in the in vivo assays, and presented moderated toxic effect in the histopatological analyses. AZA exhibited mutagenic and genotoxic activity in several genotoxicological assays performed, however it did not cause relevant toxicity in mice tissues. Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq

Submitted by Diana Toro (dianamota.t@gmail.com) on 2022-06-28T21:28:08Z No. of bitstreams: 3 Defesa_Mestrado_Diana Mota_16.julho.2019_FINAL 3_artigo.pdf: 6824018 bytes, checksum: 7dfd8bff3f0ca7b4381da26c87d99cc7 (MD5) ATA DE DEFESA.pdf: 1599808 bytes, checksum: 70c12a7cadd91bb5c1a095d5a8a583b6 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodep??sito.pdf: 36543 bytes, checksum: 307c074e2bf5848fc8a4a5c9d850aa5e (MD5) Rejected by PPGIBA Imunologia B??sica e Aplicada (ppgimunologia@ufam.edu.br), reason: Carta de encaminhamento desatualizada e sem o nome da orientadora na descri????o do dep??sito. on 2022-09-23T19:41:19Z (GMT) Submitted by Diana Toro (dianamota.t@gmail.com) on 2022-10-05T15:08:25Z No. of bitstreams: 3 Defesa_Mestrado_Diana Mota_16.julho.2019_FINAL 3_artigo.pdf: 6824018 bytes, checksum: 7dfd8bff3f0ca7b4381da26c87d99cc7 (MD5) ATA DE DEFESA.pdf: 1599808 bytes, checksum: 70c12a7cadd91bb5c1a095d5a8a583b6 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodep??sito Diana Mota.pdf: 43524 bytes, checksum: b99716042bab07411f893fc9b3136d9f (MD5) Approved for entry into archive by PPGIBA Imunologia B??sica e Aplicada (ppgimunologia@ufam.edu.br) on 2022-10-05T17:30:51Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Defesa_Mestrado_Diana Mota_16.julho.2019_FINAL 3_artigo.pdf: 6824018 bytes, checksum: 7dfd8bff3f0ca7b4381da26c87d99cc7 (MD5) ATA DE DEFESA.pdf: 1599808 bytes, checksum: 70c12a7cadd91bb5c1a095d5a8a583b6 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodep??sito Diana Mota.pdf: 43524 bytes, checksum: b99716042bab07411f893fc9b3136d9f (MD5) Approved for entry into archive by Divis??o de Documenta????o/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2022-10-07T18:08:01Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Defesa_Mestrado_Diana Mota_16.julho.2019_FINAL 3_artigo.pdf: 6824018 bytes, checksum: 7dfd8bff3f0ca7b4381da26c87d99cc7 (MD5) ATA DE DEFESA.pdf: 1599808 bytes, checksum: 70c12a7cadd91bb5c1a095d5a8a583b6 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodep??sito Diana Mota.pdf: 43524 bytes, checksum: b99716042bab07411f893fc9b3136d9f (MD5) Made available in DSpace on 2022-10-07T18:08:01Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Defesa_Mestrado_Diana Mota_16.julho.2019_FINAL 3_artigo.pdf: 6824018 bytes, checksum: 7dfd8bff3f0ca7b4381da26c87d99cc7 (MD5) ATA DE DEFESA.pdf: 1599808 bytes, checksum: 70c12a7cadd91bb5c1a095d5a8a583b6 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodep??sito Diana Mota.pdf: 43524 bytes, checksum: b99716042bab07411f893fc9b3136d9f (MD5) Previous issue date: 2019-07-16 FAPEAM - Funda????o de Amparo ?? Pesquisa do Estado do Amazonas CAPES - Coordena????o de Aperfei??oamento de Pessoal de N??vel Superior CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient??fico e Tecnol??gico Hepatitis C is an inflammatory disease of the liver caused by the hepatitis C virus (HCV). Differences in the prognosis of infected individuals are observed, among which, in turn, 70% present chronic hepatitis C and may develop hepatic fibrosis, cirrhosis and hepatocellular carcinoma. The clinical manifestations and the evolution of the disease are related to the way the immune system interacts and responds against HCV. A successful immune response is essential for virus elimination, however, host genetic characteristics may result in immune responses with gain or loss of function changes, which may be associated with chronic inflammation and persistent infection. Viral infections are known to induce production of IL-1?? through the signaling pathway of inflammasomes. The IL-1?? cytokine would act on the antiviral response by inducing proinflammatory genes via activation of NF-??B by recruiting leukocytes to the site of infection and modulating the action of infiltrated cells. On the other hand, IL-1?? could also promote the production of pro-fibrogenic molecules, contributing to the development of diseases related to HCV. Objective: To evaluate the polymorphisms in the IL-1?? and IL-18 cytokine genes and the inflammasomes NLRP3, CARD8, CTSB and AIM2 in the development of hepatic fibrosis in patients with hepatitis C, attended at a reference unit in the Brazilian Amazon. Polymorphisms in the IL-1?? and IL-18 genes were genotyped by PCR-RFLP, while NLRP3, CARD8, CTSB and AIM2 by Real-Time PCR. Serum quantification of IL-1?? cytokine was performed by the ELISA technique. Results: In the present study we analyzed 151 samples from patients with chronic hepatitis C and 206 samples from the control group. Among the patients, 84 presented mild fibrosis (

Não recebi financiamento The present work had as objective the isolation, biochemical characterization, identification and analysis of the genetic diversity of the endophytic bacterial community associated with Coffea arabica L. culture from conventional and organic cultivation. The endophyte isolates were evaluated in vitro for the potential to promote direct plant growth (phosphate solubilization, biological nitrogen fixation and indole acetic acid production) and indirect (antagonism to phytopathogenic fungi) and enzymatic activity (amylolytic, cellulolytic, esterolytic, lipolytic, pectinolytic and proteolytic). Identification was performed by bacterial cell analysis by Matrix Assisted Laser Desorption / Ionization-Time-Of-Fligh (MALDI-TOF) of 59 endophytic isolates. Forty isolates were also identified by partial sequencing of the 16S rDNA gene for evaluation and comparing the diversity of endophytic bacterial communities associated with conventional and organic coffee. The analysis of diversity indicated that the endophytic bacterial community of coffee from the organic growing area is more diverse. A total of ten bacterial strains with potential for plant growth promotion were selected for in vivo inoculation in Coffea arabica L. seedlings and in vitro plant growth promotion indicators as well as macro and micronutrient content in leaf tissue were evaluated after 180 days of the first inoculation. Metagenomic analysis of the 16S rDNA gene was also performed on samples of rhizospheric soil from Coffea arabica L. from the same areas. From the analyzes it was possible to identify sequences of 1 phylum, 6 orders and 27 families among all the samples. Among them, the family Planctomycetaceae was the most abundant in the two areas analyzed, whereas the orders Xanthomonadales and Sphingomonadales were the ones that presented smaller relative abundance in the area ofconventional and organic cultivation, respectively. A total of 21 bacterial groups presented relative abundance with significant difference (p ≤ 0.05) between the rhizosphere samples of conventional and organic coffee, indicating the influence of the management on the bacterial diversity of the rhizospheric soil. O presente trabalho teve como objetivo o isolamento, caracterização bioquímica, identificação e análise da diversidade genética da comunidade bacteriana endofitica associada a cultura de Coffea arabica L. provenientes de cultivo convencional e orgânico. As bactérias cultiváveis isoladas endofiticamente foram avaliadas in vitro quanto ao potencial para promoção de crescimento vegetal direto (solubilização de fosfato, fixação biológica de nitrogênio e produção de ácido indol acético) e indireto (antagonismo a fungos fitopatogênicos) e atividade enzimática (amilolítica, celulolítica, esterolítica, lipolítica, pectinolítica e proteolítica). Realizou-se a identificação por meio da análise proteica das células bacterianas por Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization – Time-Of-Fligh (MALDI-TOF) de 59 isolados endofíticos. Também foram identificados 40 isolados por sequenciamento parcial do gene 16S rDNA para avaliação e comparação da diversidade das comunidades bacterianas endofíticas associadas ao café de cultivo convencional e orgânico. A análise da diversidade indicou que a comunidade bacteriana endofítica do café proveniente da área de cultivo orgânico é mais diversa. Um total de dez linhagens bacterianas com potencial para promoção de crescimento vegetal foram selecionadas para inoculação in vivo em plântulas de Coffea arabica L. e os parâmetros indicadores de promoção de crescimento vegetal in vivo, bem como o teor de macro e micronutrientes no tecido foliar foram avaliados após 180 dias da primeira inoculação. Também foi realizada a análise metagenômica do gene 16S rDNA em amostras de solo rizosférico de Coffea arabica L. proveniente das mesmas áreas. A partir das análises foi possível identificar sequências de 1 filo, 6 ordens e 27 famílias entre todas as amostras. Dentre elas, a família Planctomycetaceae foi a mais abundante nas duas áreas analisadas, enquanto as ordens Xanthomonadales e Sphingomonadales foram as que apresentaram menor abundância relativa na área de cultivo convencional e orgânico, respectivamente. Um total de 21 grupos bacterianos apresentou abundância relativa com diferença significativa (p ≤ 0,05) entre as amostras de rizosfera de café convencional e orgânico, o que indica a influência do manejo na diversidade bacteriana do solo rizosférico.

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-09-12T17:57:26Z No. of bitstreams: 1 Lilian Castilho de Araújo Gianotti.pdf: 1557954 bytes, checksum: 478643507943e34ee169e442907aecd7 (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-12T17:57:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lilian Castilho de Araújo Gianotti.pdf: 1557954 bytes, checksum: 478643507943e34ee169e442907aecd7 (MD5) Previous issue date: 2019-06-18 Cardiovascular diseases, especially atherosclerosis, are the noncommunicable diseases with the highest mortality rates worldwide, even in countries where people have low and middle income. They may be worldwide, even in countries where people have low inactivity, frequente use of tobacco, ingestion of high fat foods, high blood pressure, high levels of low density cholesterol (LDLc), diabetes mellitus, obesity. Unmodifiable of genetic factors are age, family history, and gender. Atherosclerotic plaque formation occurs slowly, due to on inflammatory and immunological process where there are vascular alterations of endotelial cells, from cells, accumulation of modified lipids, calcifications, thrombus formation, presence of inflammatory markers, genetic componentes such as ApoE and several types of polymorphisms such as the estrogen receptor gene. In general, the development of atherosclerosis begins in early childhood, but symptoms begin to appear from middle age. The estrogen receptor is expressed in various tissus and is associated to the development of hypertension and ventricular wall thickening in women who are hypertensive, and with male and female infertility. Is has two polymorphisms, alpha and beta, where the malfunctioning or reduced copy number of this second is directly linked to the development of atherosclerosis. Although the presence of polymorphism (G1082A) does not alter its protein, it can alter mRNA and influence its expression. This study aimed to analyze the estrogen receptor beta (REß) polymorphism in patientes with atherosclerosis and to verify if the presence of this type of polymorphism is related to its development. Whole blood from 55 atherosclerosis patients who were diagnosed by imaging (case group) and 46 patients without the disease (control group) from patients at Angiogyn Clinic and the Clinical Analysis Laboratory (LAC) of PUC Goiás, in the municipality of Goiânia. The samples were submitted to PCR to verify the presence of the polymorphism. It was observed that the presence of AG/AA polymorphism was 9,5 times higher than the GG genotype (p

Deficiência intelectual (DI) é reconhecida como um transtorno do desenvolvimento neurológico, caracterizado por diminuição significativa em ambas funções cognitivas e adaptativas, originada antes dos 18 anos de idade. Estima-se que em torno de 1–3% das crianças ao redor do mundo são afetadas pela DI e que no Brasil acomete aproximadamente 0,8% da população. As variações no número de cópias (CNVs) são responsáveis por cerca de 15–20% dos casos de DI, que podem comprometer o funcionamento de diversos genes. O objetivo do estudo foi avaliar a ocorrência de CNVs, identificadas pelo CMA com filtro de tamanho < 100 kb, que abrigassem genes funcionalmente associados à DI em pacientes do SUS com diagnóstico clínico de DI. Durante o período de janeiro 2013 a dezembro de 2016, foi realizado o cariótipo por bandeamento GTG em 325 pacientes com indicação clínica de DI, chegando ao diagnóstico genético em 57,2% dos pacientes, demonstrando ser uma importante metodologia de triagem para os pacientes com DI. No entanto, 42,8% dos pacientes apresentaram o cariótipo sem alterações estruturais ou numéricas. Foi realizado nestes pacientes o CMA com filtro de tamanho ≥ 100 kb, onde foi possível elucidar o diagnóstico genético em 29,8% dos casos, apresentando um incremento na taxa de diagnóstico de 7,1%. Os casos que permaneceram sem elucidação, foram submetidos ao CMA com filtro de tamanho < 100 kb, no qual foram identificadas CNVs de perda em regiões que continham os genes CNTNAP2, FGF13, MID1, MID2, SHANK3, IL1RAPL1, DMD e PAK3. A redução do filtro de tamanho demonstrou um incremento na taxa de diagnóstico em 12%, ampliando o espectro de identificação de CNVs presentes em regiões que abrigam genes implicados à manifestação clínica da DI. A aplicação em conjunto das metodologias cariótipo por bandeamento GTG e CMA com filtro de tamanho ≥ 100 kb e posteriormente filtro de tamanho < 100 kb, permitiu um aumento no diagnóstico genético da DI e outras comorbidades, promovendo uma compreensão mais ampla dos aspectos genéticos relacionados à essas afecções e possibilitando um manejo adequado das famílias. Finalmente, o acesso ao aconselhamento genético proporciona uma melhor compreensão das causas genéticas da DI, as implicações familiares da contribuição genética e a chance de recorrência. Intellectual disability (ID) is characterized by significant impairment in both cognitive and adaptive functions, originating before the age of 18 years. In addition, it is a common phenotype sign in a cluster of heterogeneous syndromic or non-syndromic disorders, associated with some comorbidities such as autism and congenital malformations. In the worldwide, ID affects around 1–3% of the general population and in Brazil ID affects approximately 0.8% of the population. The Copy number variations account for about 15– 20% of children with unexplained ID, compromising the functioning of several genes, with more than 1,416 genes described as causative of this phenotype sign. The aim of the study was to evaluate the occurrence of CNVs, identified by CMA with the size filter of < 100 kb, harboring genes functionally associated with ID in patients from SUS with a clinical diagnosis of ID referred for the genetic diagnosis. During January 2013 to December 2016, GTG banding karyotype was performed in 325 patients with ID, achieve the genetic diagnostic in 57.2%, demonstrating to be an important screening approach for patients with DI. However, 42,8% of the patients showed the karyotype with no visible numerical or structural alterations. The CMA analysis with the size filter of ≥ 100 kb was performed in these patients, where it was possible to elucidate the genetic diagnose in 29.8% of the patients, demonstrating 7,1 % of the increment on the diagnostic. All the cases remained without a diagnosis were submitted to the CMA analysis with size filter of < 100 kb, where it was identified loss CNVs in regions harboring CNTNAP2, FGF13, MID1, MID2, SHANK3, IL1RAPL1, DMD, and PAK3 genes. The reduction of the size filter demonstrated an increase of 12% in the ratio of diagnosis, expanding the spectrum of CNVs identification in regions which harboring genes related to the clinical manifestation of ID. The application of both GTG banding and CMA with the size filter of ≥ 100 kb and later the size filter of < 100 kb allowed an increase in the genetic diagnosis of ID and comorbidities, giving a broad understanding of the genetic aspects related to these conditions and allowing the adequate management of families. Finally, the genetic counseling provides a better understanding of the genetic causes of ID, the familial implications of the genetic contribution and the chance of recurrence. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Feeding accounts for most of the costs in beef cattle production. To reduce it, as well as the environmental impact, greenhouse gas emission, and land occupation have been mandatory to improve the animal feed efficiency. Multifactorial, feed efficiency (FE) has been evaluated by different indexes and approaches. Among them, genomic studies from animals genetically divergent for FE pointed out candidate genes and pathways such as energy metabolism, inflammatory and oxidative stress. However, these studies did not take into account the continuous variation of the gene expression within the population. Thereby, from a previous differential approach carried out in divergent Nelore steers for FE, we selected six hepatic candidate genes (COL1A1, CTGF, CYP2B6, EGR1, PRUNE2, and the PRUNE2_isoform) based on their biological role on pathways related to feed efficiency. We carried out a realtime quantitative PCR (RT-qPCR) assay in 52 Nelore steers to evaluate the hepatic expression profile of the overmentioned genes and their association with FE related-traits such as average daily gain (ADG), body weight (BW), dry matter intake (DMI), feed conversion ratio (FCR), feed efficiency ratio (FE), Kleiber index (KI), metabolic body weight (MBW), residual feed intake (RFI), and relative growth rate (RGR). Based on a linear mixed model, we identified that the total expression of PRUNE2 has an unfavorable effect on feed efficiency related-traits, likely related to mitochondrial dysfunction. However, when taking only the PRUNE2_isoform, we observed a favorable effect on the evaluated trait. Still, to shed light on the genetic mechanisms affecting feed efficiency in Nelore, we applied a coexpression approach using muscle RNAseq data from 180 animals. Based on the weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) software, we identified 391 potential biomarkers (hub genes) related to feed efficiency variation. These hub genes partook in protein synthesis, muscle growth, and immune response pathways. Among the hub genes, we highlighted CCDC80, FBLN5, SERPINF1, and OGN genes, which were associated to ADG, FCR, FE, KI, and RGR traits, and were related to glucose homeostasis, oxidative stress, and osteogenesis. Furthermore, we found 13 transcription factors among the hub genes described for bovine and six of them are putative regulators for the others hub genes identified in this study. Among them, the TCF4 may have a role in muscle growth metabolism and regulator of DE genes for divergent RFI in muscle previously identified by our research group. Finally, we identified potential regulatory regions and functional variants related to the potential biomarkers identified in this study. Os custos com alimentação podem representar mais da metade do custo total de produção. A eficiência alimentar é uma característica complexa, que pode contribuir com a redução de gastos com alimentação dos animais, podendo ainda estar associada à redução dos impactos ambientais relacionados com a ocupação territorial e com a emissão de gases poluentes, como o metano. Apesar do perfil de expressão em grupos contrastantes para eficiência alimentar ter sido investigado em diferentes tecidos, resultando na identificação de vias e processos biológicos relacionados a esse fenótipo, a relação da expressão gênica com a variação contínua de características de eficiência alimentar é pouco explorada na literatura. Assim, dentre os genes previamente identificados como sendo diferencialmente expressos (DE) em tecido hepático de grupos extremos de consumo alimentar residual (CAR) de bovinos da raça Nelore, selecionou-se genes em vias biológicas importantes para eficiência alimentar. Com base nessa seleção, verificou-se a influência da expressão dos genes COL1A1, CTGF, CYP2B6, EGR1, PRUNE2 e de uma isoforma deste último (PRUNE2_isoform) na variação de características relacionadas à eficiência alimentar, a saber: consumo de matéria seca (CMS), consumo alimentar residual (CAR), conversão alimentar (CA), eficiência alimentar (EA), ganho de peso diário (GPD), índice de Kleiber (IK), peso médio (PM), peso médio metabólico (PMM) e taxa relativa de crescimento (TRC). Para isso, realizou-se ensaios de PCR quantitativa em tempo real (RT-qPCR) dos genes e isoforma selecionados em 52 amostras do tecido hepático de bovinos Nelore, seguido pela análise de associação por meio de um modelo linear misto. Esse estudou revelou que o padrão de expressão do gene PRUNE2 desfavorece a eficiência alimentar, e esse fato pode estar relacionado indiretamente à disfunção mitocondrial. No entanto, o padrão de expressão da sua isoforma (PRUNE2_isoform) aparentemente atua de forma contrária à expressão total do gene, favorecendo a eficiência alimentar. Além disso, para melhor entendimento dos mecanismos genéticos envolvidos com a eficiência alimentar, nós realizamos análise de rede de coexpressão gênica, construída pela metodologia weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) a partir de 180 amostras de tecido muscular (Longissimus thoracis) de bovinos Nelore, identificou-se 391 potenciais biomarcadores (hub genes) relacionados com a variação da eficiência alimentar. Tais hub genes participam de vias relacionadas com síntese de proteínas, crescimento muscular e resposta imune. Entre esses hub genes nós destacamos os CCDC80, FBLN5, SERPINF1 e OGN associados com as características CA, EA, GPD, IK e TRC. Esses genes estão relacionados com a homeostase da glicose, estresse oxidativo e formação óssea. Entre os hubs genes, identificou-se que 13 fatores de transcrição descritos para bovinos, e seis desses revelaram potenciais reguladores de outros hub genes identificados nesse estudo. Entre eles, o fator de transcrição TCF4 pode desempenhar uma função importante no crescimento muscular e é um potencial regulador de genes previamente identificados por nosso grupo de pesquisa como DE no tecido muscular em grupos extremos de consumo alimentar residual (CAR). Finalmente, identificou-se potenciais regiões regulatórias e variantes funcionais relacionadas aos potenciais biomarcadores identificados nesse estudo. CAPES: Código de Financiamento 001

O câncer de mama é o tipo prevalente entre as mulheres e compreende um grupo heterogêneo de tumores com diferentes prognósticos e respostas ao tratamento, incluindo os tumores receptor de estrógeno positivo (ER+), os que apresentam superexpressão do receptor para o fator de crescimento epidérmico humano 2 (HER2+) e os triplo-negativos. A cisplatina é um agente quimioterápico utilizado na prática clínica para o tratamento de vários tipos tumorais, entretanto, os efeitos tóxicos adversos desse medicamento, limitam seu uso. Assim, a prospecção de novos compostos com atividade antitumoral é importante para aumentar a eficiência do tratamento do câncer de mama. Este é o caso dos complexos de paládio(II). O presente trabalho avaliou a atividade citotóxica do ligante (C1) e de complexos de paládio(II), derivados deste (C2 – C7), frente as linhagens celulares MCF-7, de tumor de mama ER+ e MDA-MB-435, de tumor de mama triplo-negativo. As células foram cultivadas em meio RPMI, contendo 20% de soro fetal bovino e antibióticos, a 37o C, em atmosfera umidificada com 5% de CO2. Foram realizados os ensaios: de sulforrodamina B para avaliação da viabilidade celular, clonogênico, de migração, de adesão, morfológico, morfométrico, de fragmentação do DNA genômico e de ligação ao DNA plasmidial. Os resultados demonstraram que houve redução da viabilidade celular após tratamento com os complexos de paládio(II) e estes inibiram completamente a sobrevivência celular, avaliada pelo ensaio clonogênico. O tratamento alterou a morfologia e induziu a morte celular. Assim, os complexos de paládio(II) podem ser considerados antitumorais. Além disso, os complexos inibiram a migração e adesão das células à matriz extracelular, o que indica atividade antimetastática. Também apresentaram capacidade de ligação ao DNA plasmidial induzindo a quebra tanto do DNA plasmidial como do DNA genômico das células, com formação de padrão escada do DNA, indicando apoptose. Assim, os complexos analisados apresentaram atividade antitumoral e antimetastática, podendo ser considerados supressores tumorais e seu mecanismo de ação inclui a indução de apoptose. Os resultados deste trabalho indicaram que os complexos C5 e C7 foram ativos, em todos os testes realizados, tanto para células MCF-7 como para MDA-MB-435, sendo bons candidatos para o desenvolvimento de novos fármacos para o tratamento do câncer de mama. Breast cancer is the prevalent cancer type among women and comprises a heterogeneous group of tumors with different prognoses and responses to treatment, including estrogen receptor positive tumors (ER+), those with overexpression of the receptor to the human epidermal growth factor 2 (HER2+) and triple-negatives. Cisplatin is a chemotherapeutic agent used in clinical practice for the treatment of various tumor types, however, the adverse effects of this compound, limit its use. Thus, the search for new compounds with antitumor activity is important to increase the efficiency of breast cancer treatment. This is the case of palladium(II) complexes. The present study evaluated the cytotoxic activity of the ligand (C1) and palladium(II) complexes(C2-C7), derived from the ligand, to the cell lines MCF-7, breast tumor ER+ and MDA-MB-435, triple-negative breast tumor. The cells were cultured in RPMI medium containing 20% fetal bovine serum and antibiotics, and maintained at 37 oC in humidified atmosphere, with 5% CO2. The following tests were carried out: sulforhodamine (B) for the evaluation of cell viability, clonogenic, migration and adhesion assays, morphological and morphometric studies, genomic DNA fragmentation analysis and plasmidial DNA binding test. The results showed that there was a reduction of cell viability after treatment with palladium(II) complexes and these inhibited completely the cell survival in the clonogenic assay. The treatment induced cell morphological alterations and cell death. Thus the palladium(II) complexes can be considered antitumor compounds. In addition, the complexes inhibited migration and adhesion of the cells to the extracellular matrix, which indicates antimetastatic activity. The complexes showed plasmidial DNA binding capacity and induced break of both plasmidial and genomic DNA, with DNA ladder pattern formation, indicating apoptosis. Thus, the complexes analyzed showed antitumor and antimetastatic activities, can be considered tumor suppressors and their mechanism of action includes the induction of apoptosis. The results of this work indicated that the complexes C5 and C7 were active in all tests, both for MCF-7 and MDA-MB-435 being good candidates for the development of new drugs for the treatment of breast cancer.

Submitted by Verena Pereira (verenagoncalves@uefs.br) on 2019-09-16T20:14:02Z No. of bitstreams: 1 Tese_GilmaraMoreira.pdf: 4482943 bytes, checksum: 86f1e6f15423bca285d95dbeb1bb1622 (MD5) Made available in DSpace on 2019-09-16T20:14:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_GilmaraMoreira.pdf: 4482943 bytes, checksum: 86f1e6f15423bca285d95dbeb1bb1622 (MD5) Previous issue date: 2019-03-28 Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES Myracrodruon urundeuva Allem?o is an arboreal species popularly known as aroeira-do-sert?o. It is considered one of the native species with economic importance due to its wood and medicinal characteristics.The objective was to obtain thermal and osmotic limits, based on the thermal time, water time and hydrothermal time models, in order to test the efficiency of these models and describe the germination behavior of M. urundeuva seeds in adverse conditions and in future climate change scenarios. In addition, the relationship between climatic factors and the germination of different havestsM. urundeuva seed was determined, as well as the prediction of these seeds germination in future climate change scenarios. Reducing weeks with minimal rainfall will directly affect seed germination and recruitment of seedlings. The temperature of 30 ?C promoted a higher germination percentage for seeds in solutions prepared with PEG. As osmotic potential of medium was reduced, there was also a reduction in seedling values. It is concluded that M. urundeuvaseeds are tolerant to a wide range of temperature and osmotic potentials. Climate models allow us to identify the germination responses of M. urundeuva in the future climate change scenarios. Temperature interfered with the germination response of M. urundeuva seeds under different osmotic potentials. Germination and formation of M. urundeuva seedlings were negatively affected by reduced osmotic potential prepared with PEG and NaCl. The germination M. urundeuva seeds can be evaluated by means models based on the concept water and hydrothermal time. The seeds quality produced from M. urundeuva is linked to the maximum, average and minimum temperatures, average and minimum humidity and precipitation. And in future climate change scenarios, there will be a reduction in the physiological quality of M. urundeuva seeds caused by fluctuations in climate variables Myracrodruon urundeuva Allem?o ?uma esp?cie arb?rea conhecida popularmente como aroeira-do-sert?o. ? considerada como uma das esp?cies nativas com import?ncia econ?mica devido as suas caracter?sticas madeireira e medicinal. Objetivou-seobter os limites t?rmicos e osm?ticos, com base nos modelos de tempo t?rmico, tempo h?drico e tempo hidrot?rmico, com a finalidade de testar a efici?ncia desses modelos e descrever o comportamento germinativo das sementes de M. urundeuva em condi??es adversas e em cen?rios futurosde mudan?as clim?ticas.Al?m disso, foi determinado a rela??o entre os fatores clim?ticos e a germina??o de diferentes safras de sementes de M. urundeuva, assim como predi??oda germina??o dessas sementes em cen?rios futuros de mudan?as clim?ticas.A redu??o de semanas com precipita??o m?nima afetar? diretamente a germina??o de sementes e o recrutamento de pl?ntulas.A temperatura de 30 ?C inferiu uma maior porcentagem de germina??o para as sementes em solu??es preparadas com PEG. ? medida que reduziu do potencial osm?tico do meio, houve tamb?m uma redu??o nos valores de pl?ntulas normais.As sementes de M. urundeuva s?o tolerantes ? ampla faixa de temperatura e potenciais osm?ticos. Modelos clim?ticos permitem identificar as respostas germinativas de M. urundeuva em cen?rios futuros de mudan?as clim?ticas. A temperatura interferiu na resposta germinativa das sementes de M. urundeuva sob diferentes potenciais osm?ticos. A germina??o e a forma??o pl?ntulas de M. urundeuva foram afetadas negativamente pela redu??o do potencial osm?tico preparados com PEG e NaCl. A germina??o de sementes de M. urundeuva pode ser avaliada por meio de modelos baseados no conceito de tempo h?drico e tempo hidrot?rmico.A qualidade das sementes produzidas de M. urundeuvaest? relacionada com as temperaturas m?xima, m?dia e m?nima, umidades m?dia e m?nima, e com a precipita??o. Cen?rios futuros de mudan?as clim?ticas, ocorrer? uma redu??o da qualidade fisiol?gica das sementes de M. urundeuva ocasionada por flutua??es das vari?veis de clima

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-06-26T12:05:48Z No. of bitstreams: 1 Iury Rodrigues de Almeida.pdf: 2067767 bytes, checksum: a2b5c568e6d8f479b72d81cd40a73d90 (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-26T12:05:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Iury Rodrigues de Almeida.pdf: 2067767 bytes, checksum: a2b5c568e6d8f479b72d81cd40a73d90 (MD5) Previous issue date: 2019-03-28 Cytogenetics arises to study the nature of chromosomes, divided into two areas, the classical based on chromosomal bundles and the molecular-based fluorescence probes. Cytogenetics in dogs has made great strides in recent years due to research interests in the investigation of hereditary diseases mainly in the area of oncology. The objective of this dissertation was to evaluate the trend of scientific publications on cytogenetics of canids using the Web of Science database by means of cienciométrica analysis. Data were obtained through the ISI Web of Science platform from 1974 to 2018 using the words "canids", "cytogenetics" and "chromosomes" as search terms. The selected atlases were collected data and made quantitative analyzes and fisher exact tests and Spearman correlation. Data were tabulated and analyzed using descriptive statistics. 210 articles were selected from 1974 to 2018, with 2011 being the year with the most publications. The United States followed by Poland were the countries with the highest number of authorships accounting for 35% of the publications. The number of authors per article varied from 1 to 20 and Switonski M. was the author with more publications. Looking at the co-authorships and authorships, we have Pozan University as the largest collaborator in this area and England the country with the most publications. About 1384 keywords were used and of these the word Dog was used in 8.2% of the articles. Among the canids studied, domestic dogs were more expressive used as methodology in 79% of the articles. Of these 42% were SRD and among the dogs of race the highlight was for the Beagle breed in 5.9% articles. Among the cytogenetic methods used by the authors, the FISH technique was the most used in 40.2% of the works followed by karyotyping technique (28.4%) and banding (24.5%). 21.4% of the articles dealt with problems in the area of canine oncology being the most expressive area observed. The number of studies in the area of cytogenetics in dogs is still small, but the similarity between these animals and humans, makes more and more research to find answers to human cancers using the model dogs. A citogenética surge para estudar a natureza dos cromossomos, dividida em duas áreas, a clássica baseada em bandeamentos cromossômicos e a molecular baseada em sondas fluorescência. A citogenética em canídeos teve grandes avanços nos últimos anos devido aos interesses em pesquisas na investigação de doenças hereditárias principalmente na área da oncologia. O objetivo da presente dissertação foi avaliar a tendência das publicações científicas cobre citogenética de canídeos usando a base de dados Web of Science por meio de análise cienciométrica. Os dados foram obtidos atravez da plataforma ISI Web of Science entre dos anos de 1974 a 2018 utilizando as palavras “canídeos”, “citogenética” e “cromossomos” como termos de pesquisa. Os atigos selecionados foram coletados os dados e feitas analises quantitativas e testes de exato de fisher e correlação de Spearman. Os dados foram tabulados e analisados por meio de estatistica descritiva. Foram selecionados 210 artigos entre os anos de 1974 a 2018 sendo que 2011 foi o ano com mais publicações. Os Estados Unidos seguido da Polônia foram os países com maior número de autorias somando 35% das publicações. O número de autores por artigo variou de 1 a 20 e Switonski M. foi o autor com mais publicações. Observando as coautorias e autorias, temos Pozan University como a maior colaboradora nessa área e a Inglaterra o país com mais publicações. Cerca de 1384 palavras chave foram utilizadas e destas a palavra Dog foi utilizada em 8,2% dos artigos. Entre os canídeos estudados, os cães domésticos foram mais expressivos usado como metodologia em 79% dos artigos. Destes 42% eram SRD e entre os cães de raça o destaque foi para a raça Beagle em 5,9% artigos. Entre as metologias citogenéticas utilizadas pelos autores, a técnica FISH foi a mais utilizada em 40,2% dos trabalhos seguida da técnica de cariotipagem (28,4%) e bandeamento (24,5%). 21,4% dos artigos trataram problemas na área da oncologia canina sendo a área observada mais expressiva. A quantidade de estudos na área da citogenética em cães ainda é pequena, mas a semelhança entre esses animais com os seres humanos, fazem surgir cada vez mais pesquisas para achar respostas para cânceres humanos utilizando como modelo os cães.

Podocnemis expansa (tartaruga-da-amazônia) pertencente à ordem Testudines, subordem Pleurodira e família Podocnemididae, é considerada o maior quelônio de água doce na América do Sul, dentro do gênero Podocnemis. Atualmente a espécie está classificada pela International Union for Conservation of Nature (IUCN) como pouco preocupante, porém, dependente de programas de conservação. Diante deste cenário, o ICMBio e o IBAMA são responsáveis pelo Programa Quelônios da Amazônia (PQA). No estado de Goiás, o monitoramento de suas populações ocorre nos rios Araguaia e Crixás-Açu, onde localizam-se as principais praias de desova no estado. Neste contexto, o presente estudo teve por objetivo avaliar a diversidade genética e o fluxo gênico nas populações de Podocnemis expansa dos rios Crixás-Açu e Araguaia. Para tanto, foram avaliados um total de 191 indivíduos, sendo 96 do Rio Crixás-Açu e 95 do Rio Araguaia. A partir das amostras de DNA, foram padronizados dez marcadores microssatélites, para a obtenção dos genótipos por eletroforese capilar. Em seguida, os genótipos foram utilizados para análises estatísticas considerando machos e fêmeas. Assim, foi possível verificar que o painel de marcadores é informativo, apresentando uma média igual a 7,1 alelos nos locos, com alto valor de probabilidade de exclusão de paternidade (Q = 0,998) e baixo valor de probabilidade de identidade (I = 7,00x10 -09 ). Não foi verificado desvios significativos entre os pares de locos em relação ao desequilíbrio de ligação (p > 0,05). A diversidade genética foi moderada para os indivíduos nas duas localidades, com a heterozigosidade esperada média (He) variando entre 0,611 a 0,632. A heterozigosidade observada média (Ho) variou entre 0,527 a 0,583. Os valores de diversidade genética foram estatisticamente semelhantes entre machos e fêmeas. A endogamia foi positiva e significativa (p < 0,05) para machos no Rio Crixás-açu (f = 0,082). Por outro lado, para o Rio Araguaia, os valores de endogamia foram maiores e significativos para machos (f = 0,191) e fêmeas (f = 0,139). A estrutura genética foi relativamente baixa e significativa (F ST = 0,038; p ≤ 0,05). A taxa de migração (M) foi maior considerando os indivíduos se deslocando do Rio Crixás-Açu para o Rio Araguaia (M 1→2 = 24,156), quando comparado com a taxa de migração dos indivíduos que se deslocam do Rio Araguaia para o Rio Crixás-Açu (M 2→1 = 4,814). Essas informações são importantes para a elaboração de estratégias de conservação e manejo da espécie. Podocnemis expansa (Turtle-da-Amazônia) belonging to the order Testudines, suborder Pleurodira and family Podocnemididae, is considered the largest freshwater chelonium in South America, within the genus Podocnemis. Currently the species is classified by the International Union for Conservation of Nature (IUCN) as of little concern, but dependent on conservation programs. In view of this scenario, ICMBio and IBAMA are responsible for the Programa Quelônios da Amazônia (PQA). In the state of Goiás, the monitoring of its populations occurs in the rivers Araguaia and Crixás-Açu, where the main spawning beaches in the state are located. In this context, the present study aimed to evaluate the genetic diversity and the gene flow in the Podocnemis expansa populations of the Crixás-Açu and Araguaia rivers. For that, a total of 191 individuals were evaluated, being 96 of the Crixás-Açu River and 95 of the Araguaia River. From the DNA samples, ten microsatellite markers were standardized to obtain the genotypes by capillary electrophoresis. Then, the genotypes were used for statistical analysis considering males and females. Thus, it was possible to verify that the panel of markers is informative, presenting an average of 7.1 alleles in the loci, with high paternity exclusion probability (Q = 0.998) and low identity probability value (I = 7.00 x 10 -09 ). No significant deviations between the pairs of loci were observed in relation to the linkage disequilibrium (p > 0.05). Genetic diversity was moderate for individuals at both sites, with the expected mean heterozygosity (He) ranging from 0.611 to 0.632. The observed mean heterozygosity (Ho) ranged from 0.527 to 0.583. The values of genetic diversity were statistically similar between males and females. The inbreeding was positive and significant (p ≤ 0.05) for males in the Crixás-açu River (f = 0.082). On the other hand, for the Araguaia River, inbreeding values were higher and significant for males (f = 0.191) and females (f = 0.139). The genetic structure was relatively low and significant (FST = 0.038; p ≤ 0.05). The migration rate (M) was higher considering the individuals moving from the Crixás-Açu River to the Araguaia River (M1 → 2 = 24,156), when compared to the migration rate of individuals moving from the Araguaia River to the Rio Crixás -Açu (M2 → 1 = 4.814). This information is important for the elaboration of strategies of conservation and management of the species. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-07-23T17:50:43Z No. of bitstreams: 1 Mayara Oliveira Diogo.pdf: 1053778 bytes, checksum: 8936e5a8d9f42d3e7d75d3d83dba30d7 (MD5) Made available in DSpace on 2019-07-23T17:50:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Mayara Oliveira Diogo.pdf: 1053778 bytes, checksum: 8936e5a8d9f42d3e7d75d3d83dba30d7 (MD5) Previous issue date: 2019-03-27 Myelodysplastic syndromes (MDS) morphologically comprise distinct disorders characterized by a dysplastic and ineffective hematopoiesis. The ineffective hematopoiesis is apparently due to an abnormal medullary microenvironment that induces early death of hematopoietic progenitor cells (MHC) by apoptosis. In addition, 25% to 40% of MDS patients develop Acute Myeloid Leukemia (AML). Diagnosis of MDS is confirmed by laboratory tests that indicate a reduction in major blood cells, an abundance of cells in the bone marrow and abnormal cell morphology. Chromosomal abnormalities in bone marrow cells are found in 40 to 60% of patients with myelodysplastic syndrome, and to elucidate the diagnosis, the karyotype method is used, and later, if necessary, FISH, CMA among others can be used. The objective of this study is to report the case of 2 patients, one with mosaic trisomy of chromosome 17 and 21, and the other with monosomy and trisomy 15, reporting some techniques used to diagnose MDS, with emphasis on karyotype and FISH. The results were 20% of trisomy of chromosome 17, 26% of trisomy of chromosome 21, 35% of monosomy and 1.5% of trisomy of the chromosome 15 confirmed by FISH. The results are in agreement with the literature highlighting the importance of the detection of chromosomal alterations in hematological malignancies that provide essential information for diagnosis and prognosis for physicians As síndromes mielodisplásicas (SMDs) compreendem morfologicamente distúrbios distintos caracterizados por hematopoiese displásica e ineficaz. A hematopoese ineficaz deve-se, aparentemente, a um microambiente medular anormal que induz à morte precoce das células progenitoras hematopoiéticas (CPH) por apoptose. Além disso, 25% a 40% dos pacientes com SMD desenvolvem Leucemia Mielóide Aguda (LMA). O Diagnóstico da SMD é confirmado por testes laboratoriais que indicam uma redução nas principais células sanguíneas, uma abundância de células na medula óssea e morfologia celular anormal. Anormalidades cromossômicas nas células da medula óssea são encontrados em 40 a 60% dos pacientes com síndrome mielodisplásica, e para a elucidação do diagnóstico é utilizado o metodo de cariótipo, e posteriormente se necessário, pode ser usado FISH,CMA dentre outros. O objetivo desse trabalho é relatar o caso de 2 pacientes, um com trissomia em mosaico do cromossomo 17 e 21, e o outro com monossomia e trissomia do 15, relatando algumas técnicas utilizadas para diagnóstico da SMD, dando ênfase em ensaios cariotípicos e FISH. Os resultados encontrados foram 20% de trissomia do cromossomo 17, 26% de trissomia do cromossomo 21, 35% de monossomia e 1,5% de trissomia do cromossomo 15 confirmados por FISH. Os resultados encontrados estão em concordância com a literatura destacando a importância da detecção de alterações cromossômicas em malignidades hematológicas que fornecem informações essenciais para o diagnóstico e prognóstico para os médicos

Não recebi financiamento The fragmentation of the habitat mainly through anthropic causes may infer the genetic variability of species, specially over isolated populations in small fragments, leading to the reduction in population size, and spreading potential. Parque Estadual das Fontes do Ipiranga (PEFI) is the largest fragment of Atlantic Forest inserted in the Metropolitan Region of São Paulo. For being an isolated area in urban environment, it takes the insular effect and it is under anthropogenic pressure that generates negative impact to the local biodiversity. Within wild species, the red howler monkeys (Alouatta guariba clamitans) is the only autochthone primate. Starting from the hypothesis that the isolated population of red howlers of PEFI is endogamic and it presents low genetic diversity, 10 loci heterological microsatellite indicators have been used in order to assess the genetic diversity, endogamy coefficient, population bottleneck, and initial information over the population structure, and familyhood. Thus, the DNA extraction and genotyping of the blood samples were performed in 30 animals captured. As a result, 49 alleles were found with an average of 4,9 alleles per loco, being 2,95 the effective number of alleles, a richness allelic average of 4,73, average Ho of 0,49, and average He = 0,58. It was observed a deficit in heterozygotes and Fis endogamic coefficient being 0,16, pointing the occurrence of inbreeding. The Pearson correlation test and the analysis of variance (ANOVA) were used in order to analyze the relation between the geographic distance of the captured animals and the genetic distance obtained through the analysis of familyhood and, based on the results obtained, it has been observed a greater proximity of male adults family-related than non-related male adults. The populational reduction test has not detected recent population bottlenecks. Nevertheless, in spite of the absence of bottlenecks and the moderate genetic diversity found, the population of brown howlers of PEFI has presented a considerable average of endogamic coefficient, and genetic diversity inferior to other isolated populations. A fragmentação do habitat, principalmente quando por causas antrópicas, pode influenciar na variabilidade genética das espécies, em especial sobre as populações isoladas em pequenos fragmentos, resultando na redução do tamanho populacional e da capacidade de dispersão. O Parque Estadual das Fontes do Ipiranga (PEFI) é o maior fragmento de Floresta Atlântica inserida na Região Metropolitana de São Paulo. Por ser uma área isolada em ambiente urbano, sofre efeito insular e está sob pressão antropogênica que gera impactos negativos para a biodiversidade local. Dentre as espécies silvestres, o bugio-ruivo (Alouatta guariba clamitans) é o único primata autóctone. Partindo da hipótese de que a população isolada de bugios do PEFI é endogâmica e apresenta baixa diversidade genética, foram utilizados 10 loci de marcadores microssatélites heterólogos para avaliar a diversidade genética, coeficiente de endogamia, gargalo populacional e informações iniciais sobre a estrutura populacional e parentesco. Para isso, foi efetuado a extração de DNA e genotipagem de amostras de sangue de 30 animais capturados. Como resultados foram encontrados 49 alelos com média de 4,9 alelos por loco, sendo 2,95 o número efetivo de alelos, riqueza alélica média de 4,73, Ho média de 0,49 e He média = 0,58. Foi observado défciti de heterozigotos e o coeficiente de endogamia Fis foi 0,16, indicando a ocorrência de endocruzamento. O teste de correlação de Pearson e a análise de variância (ANOVA) foram utilizados para analisar a relação entre a distância geográfica dos animais capturados e a distância genética obtida através na análise de parentesco e, com base nos resultados obtidos, observou-se uma maior proximidade de machos adultos aparentados do que de machos adultos não relacionados. O teste de redução populacional não detectou gargalos populacionais recentes. Entretanto, apesar da ausência de gargalos e da moderada diversidade genética encontrada, a população de bugios do PEFI apresentou média considerável de coeficiente de endogamia e diversidade genética inferior a outras populações isoladas.

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-06-25T12:26:19Z No. of bitstreams: 1 Larissa Arantes Matos.pdf: 1169534 bytes, checksum: 214fa0750043d728d629ff5d14be17fe (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-25T12:26:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Larissa Arantes Matos.pdf: 1169534 bytes, checksum: 214fa0750043d728d629ff5d14be17fe (MD5) Previous issue date: 2019-03-20 Advances in genetics have increased the concern about teaching about the themes associated with genetics, which encompasses several interfaces with other areas of knowledge and that has a lot of implication in society. In this context, the objective of the present study was to understand the formation of collaborative networks of scientific production between authors and countries that produce on genetic teaching in articles present in the Web of Science database between 1947 and 2018. The words "genetic" or "genetics" were combined with the words "teaching", "course", "class", "lectures" or "education" to compose the search terms. Tabulated data were analyzed in the Bibliometrix package of the R platform. A total of 626 articles on genetics teaching were collected during the study period. It was possible to observe a significant growth in the production of articles during the years. These articles are published in 139 journals. The United States has had the largest amount of publication on genetics teaching and is the second most cited country. Brazil ranks fourth in the number of publications. A total of 1604 authors published articles discussing the teaching of genetics. Only 145 articles have a single author. Among the authors who stand out in publication are Knight Jk, Hawley S, Morris J, Pokrywka N and Smith Mk. The top five countries with the most cited articles on genetics teaching are: Australia, United States of America, Israel, United Kingdom and Spain. The results allowed to understand and to get an overview of where the discussions in the area of genetic teaching are being held, revealing where the several fronts of research in this area are being carried out in the world. Os avanços na genética têm aumentado a preocupação com relação ao ensino sobre os temas associados à genética, que engloba diversas interfaces com outras áreas do saber e que tem muita implicação na sociedade. Nesse contexto, o objetivo do presente estudo foi compreender a formação de redes colaborativas de produção científica entre autores e países que produzem sobre ensino de genética em artigos presentes na base de dados da Web of Science nos períodos entre 1947 até 2018. As palavras “genetic” ou “genetics” foram combinadas com as palavras “teaching”, “course”, “class”, “lectures” ou “education” para compor os termos de busca. Os dados tabulados foram analisados no pacote Bibliometrix da plataforma R. Um total de 626 artigos sobre ensino de genética foram levantados no período estudado. Foi possível observar um crescimento importante na produção de artigos no decorrer desses anos. Esses artigos estão publicados em 139 periódicos. Os Estados Unidos apresentaram a maior quantidade de publicação sobre ensino de genética e é o segundo país mais citado. O Brasil se encontra em quarto lugar no número de publicações. Um total de 1604 autores publicaram artigos que discutem sobre o ensino de genética. Apenas 145 artigos apresentam um único autor. Dentre os autores que se destacam em publicação estão Knight Jk, Hawley S, Morris J, Pokrywka N e Smith Mk. Os cinco primeiros países que apresentam artigos mais citados sobre ensino de genética são: Austrália, Estados Unidos, Israel, Reino Unido e Espanha. Os resultados permitiram compreender e levantar um panorama sobre onde estão sendo realizadas as discussões na área de ensino de genética, revelando onde as diversas frentes de pesquisas nessa área estão sendo realizadas no mundo.

A agropecuária é um dos setores mais responsável pelo PIB brasileiro, sendo 7,5% provenientes da pecuária. Diante da importância da pecuária para a economia brasileira, é de grande importância estudar doenças que acometem os rebanhos nacionais e seus fatores extrínsecos e intrínsecos. O objetivo nesse trabalho foi verificar se havia associação da mastite clínica e posteriormente da mastite subclínica com alelos, genótipos e haplótipos encontrados em seis sítios polimórficos da região promotora do gene CXCL8. Os animais deste estudo foram provenientes de dois rebanhos do estado de Goiás, totalizando 98 animais e posteriormente as sequências genômicas de interesse nesses animais foram identificadas por qPCR utilizando o kit KASP® (LGC Limited ®). Em todos os sítios polimórficos foram encontrados três genótipos diferentes e como na distribuição nos alelos e genótipos, foram identificados quatro haplótipos diferentes. Os alelos se encontravam Equilíbrio de Hardy-Weinberg e os loci estavam em desequilíbrio de ligação. A distribuição dos animais dos animais nos grupos positivo e negativo para mastite clínica foi diferente da distribuição encontrada quando foi levado em consideração a contagem de células somáticas (CCS) do leite para separar os animais nos grupos de mastite subclínica. Não foram encontradas associações estatisticamente significativas entre os alelos, genótipos e haplótipos com a ocorrência da mastite clínica. No entanto, houve relação significativa entre o genótipo GG do sítio polimórfico “KASP 4” (c-687) e a presença da mastite subclínica, e o haplótipo IL8-h2 apresentou um efeito protetor em relação à mastite subclínica. Agriculture is one of the sectors most responsible for Brazilian GDP, with 7.5% coming from livestock. Given the importance of livestock for the Brazilian economy, it is of great importance to study diseases that affect the national herds and their extrinsic and intrinsic factors. The objective of this study was to verify if there was association of clinical mastitis and subsequently of subclinical mastitis with alleles, genotypes and haplotypes found in six polymorphic sites of the promoter region of the CXCL8 gene. The animals from this study came from two herds of Goiás state, totalizing 98 animals and later the genomic sequences of interest in these animals were identified by qPCR using the KASP® kit (LGC Limited ®). In all the polymorphic sites three different genotypes were found and as in the distribution in the alleles and genotypes, four different haplotypes were identified. The alleles were found to be Hardy-Weinberg equilibrium and the loci were in linkage disequilibrium. The distribution of the animals of the animals in the positive and negative groups for clinical mastitis was different from the distribution found when the somatic cell count (SCC) of the milk was taken into account to separate the animals in the subclinical mastitis groups. No statistically significant associations were found between alleles, genotypes and haplotypes with the occurrence of clinical mastitis. However, there was a significant relationship between the GG genotype of the polymorphic site "KASP 4" (c-687) and the presence of subclinical mastitis, and the haplotype IL8-h2 had a protective effect against subclinical mastitis. Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-06-24T14:16:15Z No. of bitstreams: 1 Fábio Oliveira de Souza.pdf: 840319 bytes, checksum: 5a5207f8f01546d49307f332e4e47427 (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-24T14:16:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fábio Oliveira de Souza.pdf: 840319 bytes, checksum: 5a5207f8f01546d49307f332e4e47427 (MD5) Previous issue date: 2019-03-11 Cardiovascular diseases are ranked as one of the diseases that most kill the Brazilian population and of other countries as well, one of them, being atherosclerosis. It is a chronic inflammatory disease that occurs by the accumulation of lipids in the inner layer of the arteries. There are numerous risk factors for the genesis of this disease, divided into modifiable ones such as hypertension, smoking, high levels of low density cholesterol, sedentary lifestyle and others. Non-modifiable ones are: genetic factors, premature family history for heart disease, sex, age and others. About 400 genes may be involved in this pathology, both mutations, deletions and / or polymorphisms are implicated in atherosclerosis, related to regulation of endothelial function, coagulation, inflammation and lipid metabolism. Genetic association with atherosclerosis is increasingly expanding, being the object of studies, mainly with polymorphisms of the cytochrome P450 genes. The CYP3A5 gene encodes monooxygenase proteins that are part of drug metabolism, cholesterol synthesis, steroids, and other lipids; (A6986G), produces a truncated / inactive protein due to a splicing error, and there may be a relation of the polymorphism altering the enzymatic/protein activity contributing to the development of atherosclerosis. This study aimed to analyze the CYP3A5*3 gene polymorphism in the groups of individuals with the diagnosis of atherosclerosis and in the control group. Peripheral blood samples were collected from 200 patients with a diagnosis of atherosclerotic disease based on clinical exams and confirmed with imaging exams and 100 patients for the control group, without atherosclerotic disease. A significant difference was observed in both groups (case vs. control) in relation to the CYP3A5*3 gene polymorphism, where the highest frequency of the genotype was CYP3A5*1/*3 (p= 0.0394). The mutant homozygous genotype (CYP3A5*3/*3) was 6 times higher in patients with atherosclerosis than in the control group, and was also statistically significant. According to the male gender group, a 6,5-fold risk of CYP3A5*3/*3 genotype was observed in patients with atherosclerosis (p= 0.0185), already in relation to females, a relation (p= 0.5928). Observing hypertensive patients, there was also no relation between them and atherosclerosis (p= 0.9240). Our population showed a heterozygosity in relation to other populations, mainly in relation to the mutant homozygous genotype. In most cardiovascular diseases, it affects men, and can be explained by the hormonal factor, in which the CYP3A5 gene is involved not only in lipid metabolism but also in hormonal synthesis, especially testosterone, where men with the CYP3A5*3/*3 are 6,5 times more likely to develop atherosclerosis, different from the female sex. There was no association of the mutant homozygous genotype in atherosclerotic patients with arterial hypertension, even though it was a major risk factor for cardiovascular disease. In view of this, the studied population is heterozygous, being a characteristic of this population studied and that the CYP3A5*3/*3 genotype identifies a strong association with atherosclerosis in men. As doenças cardiovasculares estão no ranking das doenças que apresenta a maior taxa de mortalidade na população brasileira e de outros países, uma delas, sendo a aterosclerose. É uma doença inflamatória de caráter crônico que ocorre pelo acúmulo de lipídios na camada interna das artérias. Há inúmeros fatores de risco para a gênese dessa doença, divididos em modificáveis, como a hipertensão arterial, tabagismo, níveis elevados de colesterol de baixa densidade, sedentarismo e outros. Já os não modificáveis são: fatores genéticos, história familiar prematura para doenças cardíacas, sexo, idade e outros. Cerca de 400 genes podem estar envolvidos nesta patologia. Tanto mutações, deleções e/ou polimorfismos estão implicados na aterosclerose, relacionados à regulação da função endotelial, coagulação, inflamação e metabolismo lipídico. A associação genética com a aterosclerose está cada vez mais em expansão, sendo objeto de estudos, principalmente com os polimorfismos dos genes do citocromo P450. O gene CYP3A5 codifica proteínas monoxigenases que fazem parte da metabolização de drogas, síntese de colesterol, esteroides e outros lipídios; possuindo vários polimorfismos do mesmo. O polimorfismo CYP3A5*3 (A6986G), produz uma proteína truncada/inativa por um erro de splicing, podendo existir uma relação do polimorfismo alterando a atividade enzimática/proteica contribuindo para o desenvolvimento da aterosclerose. Este estudo teve como objetivo analisar o polimorfismo do gene CYP3A5*3 nos grupos de indivíduos com o diagnóstico de aterosclerose e no grupo controle. Foram coletadas amostras de sangue periférico de 200 pacientes com o diagnóstico da doença aterosclerótica baseado em exames clínicos e confirmados com os exames de imagens e 100 pacientes para o grupo controle, sem a doença aterosclerótica. Foi notado uma diferença significativa em ambos os grupos estudados (caso x controle) em relação a presença do polimorfismo do gene CYP3A5*3, onde a maior frequência do genótipo, foi o CYP3A5*1/*3 (p= 0,0394). Já o genótipo homozigoto mutante (CYP3A5*3/*3) foi 6 vezes maior em pacientes com aterosclerose em relação ao grupo controle, sendo também estatisticamente significativo. De acordo com o sexo masculino, foi observado um risco de 6,5 vezes maior para a presença do genótipo CYP3A5*3/*3 em indivíduos do sexo masculino com aterosclerose (p= 0,0185), já em relação ao sexo feminino, não foi encontrado uma relação (p=0,5928). Observando os pacientes hipertensos, também não houve relação dos mesmos com a aterosclerose (p=0,9240). A nossa população apresentou uma heterozigosidade em relação a outras populações, principalmente em relação ao genótipo homozigoto mutante. A maior parte das doenças cardiovasculares acomete homens, podendo ser explicado pelo o fator hormonal, no qual o gene CYP3A5 está envolvido não somente no metabolismo de lipídios, mas também na síntese hormonal, principalmente a testosterona, onde os homens com o genótipo CYP3A5*3/*3 estão 6,5 vezes mais propensos a desenvolver a aterosclerose, diferente do sexo feminino. Não houve associação do genótipo homozigoto mutante em pacientes ateroscleróticos com a hipertensão arterial, mesmo sendo um grande fator de risco de doença cardiovascular. Em vista disso, a população estudada é heterozigota, sendo uma característica desta população estudada e que o genótipo CYP3A5*3/*3 identifica uma forte associação com a aterosclerose em indivíduos do sexo masculino.

Submitted by admin tede (tede@pucgoias.edu.br) on 2019-06-25T13:21:39Z No. of bitstreams: 1 Grasielly de Oliveira Lázaro e Arão.pdf: 3109273 bytes, checksum: 0baee89bf21683c7ab4682240492e10c (MD5) Made available in DSpace on 2019-06-25T13:21:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grasielly de Oliveira Lázaro e Arão.pdf: 3109273 bytes, checksum: 0baee89bf21683c7ab4682240492e10c (MD5) Previous issue date: 2019-03-11 Given that the vast majority of sex crimes involve men as crime perpetrators, molecular markers Y-STR can be valuable in the criminal investigation process. The Y chromosome has been promising when the objective is to identify the male DNA source in the analyzed sample, especially when it is presented in small quantities or mixed with genetic material from female origin, which are rather typical in samples of vaginal smears from rape. In addition to the fact that sexual assaults have a recurrent pattern, constituting serial crimes, the present work proposes the creation of an in-house Database of Genetic Profiles Trace for YSTR markers (BVPG-YSTR), in order to elucidate sex crimes occurred in the state of Goiás (Central Brazil). The study documented 2,109 cases of sexual violence with a positive result for cytological spermatozoa research, registered in the Scientific Police of Goiás State, comprising the period of 2004 to July 2018. DNA extraction was given with differential lysis by organic method or with the use of PrepFiler Express ™ (Applied Biosystems®), DNA quantification was performed by Real-time PCR and amplification with AmpFlSTR®Yfiler ™ multiplex kits (Applied Biosystems®) or PowerPlex® Y23 (Promega) or Yfiler ™ Plus (Applied Biosystems®). The amplification products were separated by capillary electrophoresis in the ABI 3500® Genetic Analyzer (Applied Biosystems®). Of the total of 2,109 analyzed cases, 54.7% were perpetrated in the circumscribed surroundings of Goiânia. The highest number of records occurred in 2009. And in 55.7% of the cases, the samples collected came from the victim's vaginal duct. Samples related to 271 cases were submitted to DNA exams. Considering the results of the DNA tests, in 252 cases of sexual assault were obtained the haplotypic profiles of the rapist, and 168 came from occurrences in which there were no suspects. The insertion of 252 haplotypic profiles in the BVPG-YSTR resulted in 85 matches between traces of crimes of sexual violence, involving 17 aggressors and 55 victims, resulting in a coincidence rate of 33.7%. In 18.1% of the cases, coincidences were reported exclusively by the BVPG-YSTR. Among the serial crimes identified by the BVPG-YSTR, in most cases the perpetrator raped on two different occasions. The temporal distance between intermittent cases ranged from 0 to 2151 days. The analysis of the geographical distribution of serial crimes showed that, as a general rule, there is no displacement of the sex offender. In the analysis of the 252 cases of sexual assault, 82 were perpetrated against vulnerable victims. The discrimination capacity (CD) of the set of 17 Y-STR markers for the population of Goiás was 0.9819. The panels with 23 and 27 Y-STR markers showed CD equal to 1. Five false matches were observed among in 277 samples which were submitted for analysis using 17 YSTR markers. Thus, the usage of BVPG-YSTR looked promising as far as aiding criminal investigations is concerned. Considerando que a grande maioria dos casos de crimes sexuais envolvem homens como perpetradores do crime, os marcadores moleculares Y-STR tem se mostrado valiosos no processo de investigação criminal. O cromossomo Y tem sido promissor quando o objetivo é a identificação da fonte masculina de DNA da amostra analisada, especialmente quando esta apresenta-se com ínfima quantidade ou em mistura com material genético de origem feminina, exemplos típicos de esfregaços vaginais provenientes de estupro. Sabendo ainda que crimes de violência sexual têm como característica a reincidência, constituindo crimes em série, o presente trabalho propôs a criação de um Banco in house de Vestígios de Perfis Genéticos para os marcadores STR do cromossomo Y (BVPG-YSTR), com aplicação na elucidação de crimes sexuais ocorridos no estado de Goiás. No estudo foi feito a análise documental de 2.109 casos de violência sexual com resultado positivo para a pesquisa citológica de espermatozoide, registrados na Superintendência da Polícia Técnico-Científica do Estado de Goiás, compreendendo o período de 2004 a julho de 2018. Submeteu-se a exames de DNA amostras relacionados a 271 casos. A extração de DNA foi dada com lise diferencial por método orgânico ou com o uso de PrepFiler Express™ (Applied Biosystems®), a quantificação de DNA foi realizada por PCR em Tempo Real e a amplificação com kits comerciais multiplex AmpFlSTR®Yfiler™ (Applied Biosystems®) ou PowerPlex® Y23 (Promega) ou Yfiler™ Plus (Applied Biosystems®). Os produtos da amplificação foram separados por eletroforese capilar no analisador genético ABI 3500® (Applied Biosystems®). Do total de 2109 casos analisados, 54,7% foram perpetrados na área circunscricional da regional de Goiânia. O maior número de registros ocorreu no ano de 2009. E em 55,7% dos casos, as amostras coletadas foram oriundas do canal vaginal da vítima. Considerando os resultados dos exames de DNA, em 252 casos obteve-se perfil haplotípico do agressor, e 168 eram provenientes de ocorrências em que não havia suspeitos. A inserção de 252 perfis haplotípicos no BVPG-YSTR retornou com 85 matches entre vestígios de crimes de violência sexual, envolvendo 17 agressores e 55 vítimas, perfazendo uma taxa de coincidência de 33,7%. Em 18,1% dos casos, as coincidências foram reportadas exclusivamente pelo BVPG-YSTR. Dentre os crimes em série identificados pelo BVPGYSTR, na maioria dos casos o autor cometeu duas vezes o delito de estupro. A distância temporal entre casos reincidentes variou entre 0 e 2151 dias. A análise da distribuição geográfica dos crimes em série mostrou que, em regra geral, não há deslocamento intermunicipal do autor. Na análise dos 252 casos de agressão sexual, 82 foram perpetradas contra vítimas vulneráveis. A capacidade de discriminação (CD) do conjunto de 17 marcadores Y-STR para a população do estado de Goiás foi 0,9819. Os painéis com 23 e 27 marcadores Y-STR apresentaram CD igual a 1. Observou-se 5 falsos matches em um total de 277 amostras tipadas com 17 marcadores Y-STR. Dessa forma, o estudo demonstrou que o uso do BVPG-YSTR mostrou promissor no auxílio das investigações criminais.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Fish are animals present in a wide variety of habitats and are distributed all over the world. The diversity of forms, behaviors and niches associated with the evolutionary characteristics of these animals make them important to the studies associated sex determination and sexual differentiation. Among the freshwater fish of the Neotropical region, the tetras of the genus Astyanax are one of most representatives. The A. scabripinnis species complex has been well studied about the origin, distribution and frequency of B chromosomes, being considered a model organism for evolutionary studies. Several studies with population inferences about the occurrence and frequency of B chromosomes show a seasonal variation between the sexes associated with the presence of supernumerary elements in A. scabripinnis. The hypothesis is that B chromosomes could have a possible influence on the reproductive processes of this species. Thus, the present study aimed to infer if there are differences in the levels of gene expression between specimens carrying and not carrying B chromosomes concerning some candidate genes for sex determination. The results obtained showed an over expression of the dmrt1 gene in maturing male gonads of animals with B chromosomes. For amh and foxl2 genes occurred an atypical expression in females carrying B chromosomes, where their expression patterns were more similar to those of males and the reverse to those of females that do not carry Bs. The male gonads were more conservative in relation to the expression of the amh and foxl2 genes, regardless of the maturation stage and the occurrence of the B chromosomes. These results indicate that B chromosomes are changing the profiles of the sex related genes, suggesting a possible adaptive role in extending the reproductive cycle. Os peixes são animais presentes em uma grande variedade de hábitats e estão distribuídos pelo mundo todo. A diversidade de formas, comportamentos e nichos, associados às características evolutivas destes animais os tornam importantes ao estudo associados à evolução da determinação e diferenciação sexual. Entre os peixes de água doce mais representativos da região Neotropical, os lambaris do gênero Astyanax ocupam destaque. O complexo de espécies A. scabripinnis é um dos mais estudados quanto à origem, distribuição e frequência de cromossomos B, sendo considerado um organismo modelo para estudos evolutivos. Vários estudos com inferências populacionais acerca da ocorrência e frequência de cromossomos B mostram haver variação sazonal entre os sexos, associada com a presença destes elementos supranumerários em A. scabripinnis. A hipótese aqui postulada é de que os cromossomos B possam ter alguma influência em relação aos processos reprodutivos dessa espécie. Assim sendo, o presente trabalho objetivou inferir se há diferenças entre os níveis de expressão gênica dos principais genes candidatos à determinação sexual, conhecidos para outros vertebrados, frente a ocorrência de cromossomos B em A. scabripinnis. Os resultados obtidos mostram superexpressão do gene dmrt1 em gônadas masculinas em maturação de animais com cromossomos B. Já para os genes amh e foxl2 os resultados mostram expressão atípica para as fêmeas que são portadoras de cromossomos B. Estas fêmeas apresentam padrões de expressão destes genes mais semelhantes ao dos machos e inverso ao das fêmeas que não carregam os cromossomos adicionais. As gônadas masculinas foram mais conservadoras em relação a expressão dos genes amh e foxl2, independente do estádio de maturação e da ocorrência de cromossomo B. A partir destes resultados conclui-se que a presença de cromossomos B, de alguma maneira, está alterando os perfis de expressão dos principais genes relacionados ao sexo, sugerindo-se um possível papel adaptativo nos animais portadores dos cromossomos B na extensão do ciclo reprodutivo. CAPES: Código de financiamento 001

A esquizofrenia é um transtorno neurocognitiva que atinge cerca de 1% da população. Evidências apontam que os aumentos dos riscos do surgimento da esquizofrenia (EQZ) e de outras doenças neuropsiquiátricas são fruto do desequilíbrio dos agentes pro e anti-inflamatórios associados aos componentes ambientais e genéticos. As citocinas são os principais reguladores das reações imunes inflamatórias e do desenvolvimento cerebral e emergem como uma via de estudo comum para a elucidação da doença. Este estudo teve como objetivo avaliar se há associação dos polimorfismos rs1800871 e rs1800872 do gene IL-10 com a susceptibilidade ao desenvolvimento da esquizofrenia pela detecção de polimorfismos (SNPs) pela técnica de sequenciamento Sanger, em indivíduos diagnosticados com EQZ, do município de Goiânia, Goiás. Foram coletadas amostras de 156 indivíduos, sendo 95 indivíduos diagnosticados com EQZ (grupo caso) e 61 indivíduos saudáveis, sem histórico de psicose (grupo controle). Não há associação entre os SNPs rs1800871 (p=0,97) e rs1800872 (p=0,83) e a susceptibilidade ao desenvolvimento da esquizofrenia. Há prevalência quanto ao tabagismo, uso de álcool e dependência química no grupo caso (p

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) Parasitism by gastrointestinal nematodes, mainly by Haemonchus contortus, is the major obstacle to sheep production. Anthelmintic treatment is the main method used by farmers to control worms. However, parasites acquire resistance and, currently, monepantel is the most effective available anthelmintic to control parasites in small ruminant flocks. This study investigated the epigenetic events in H. contortus involved on its development as well as in the establishment of monepantel resistance. Since epigenetics, such as DNA methylation and histone modifications, contribute to phenotypic variation, its importance for parasite physiology and development of resistance still needs to be clarified. In silico analyses suggested that DNA methylation does not occur in H. contortus, but we detected tRNA methylation and post-translational histone modifications, which were confirmed by ELISA in infective larvae (L3). By reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) assays, changes in gene expression were detected for dnmt, hmt and tfjmj, which are genes potentially related to the epigenetic machinery, during the life cycle of H. contortus (eggs, L3 larvae and adults). An increase in transcript abundance for dnmt and hmt genes in adult females compared to males was also observed. In addition, the expression of these genes was not affected by the resistance status to monepantel, in L3 larvae. In the comparison between monepantel susceptible and resistant H. contortus isolates, no changes in mptl1 gene expression nor the presence of two mutations described in literature (intron 15 retention and loss of exon 12 in mptl1) were detected. The results obtained here are relevant to gain knowledge related to epigenetic events in parasites. In addition, since the transcription levels of genes from the epigenetic machinery were changed during the life cycle of H. contortus, they appear to be determinant for worm development and adaptation to environmental conditions (inside and outside the host), and can be further investigated as potential new drug targets for nematode control. O parasitismo por nematoides gastrintestinais, principalmente por Haemonchus contortus, é o maior obstáculo à produção de ovinos. O modo de controle mais utilizado pelos produtores é com o uso de anti-helmínticos, aos quais os parasitas acabam adquirindo resistência. Atualmente, o anti-helmíntico mais efetivo no controle de verminose na maioria dos rebanhos de pequenos ruminantes é o monepantel. Este trabalho investigou os eventos epigenéticos em H. contortus envolvidos no seu desenvolvimento assim como no estabelecimento da resistência anti-helmíntica ao monepantel. Uma vez que a epigenética, como a metilação do DNA e as modificações de histonas, contribui para a variação fenotípica, sua importância para a fisiologia de parasitas e para o desenvolvimento da resistência ainda precisa ser esclarecida. Investigações in silico sugeriram que não ocorre metilação de DNA em H. contortus, mas foram detectados indícios da ocorrência de metilação de tRNA e de modificações pós-traducionais de histonas, confirmadas por ELISA para larvas infectantes (L3). Em ensaios de PCR quantitativo (RT-qPCR), verificou-se alteração da expressão dos genes dnmt, hmt e tfjmj, potencialmente relacionados à maquinaria epigenética, durante o ciclo de vida de H. contortus (ovos, larvas L3 e adultos) e aumento da abundância de transcritos para os genes dnmt e hmt em fêmeas em comparação a machos adultos. Além disso, observou-se, em larvas L3, que a expressão desses genes não foi afetada pelo estado de resistência ao monepantel. Na comparação entre isolados de H. contortus sensíveis e resistentes ao monepantel, não foram detectadas alterações na expressão do gene mptl1 e nem a presença de duas mutações nesse gene (retenção do íntron 15 e exclusão do éxon 12) previamente associadas à resistência na literatura. Os resultados obtidos neste trabalho são relevantes para o ganho de conhecimento sobre os eventos epigenéticos em parasitas. Além disso, uma vez que os níveis de transcrição dos genes da maquinaria epigenética sofreram alterações durante o ciclo de vida de H. contortus e, assim, parecem ser determinante para seu desenvolvimento e adaptação às alterações ambientais (dentro e fora do hospedeiro), tais genes podem ser investigados como potencias alvos de novas drogas para o controle desse nematoide.