Author: "Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 )" - Searchworks@Jio Institute Digital Library Search Results

Your search keyword '"Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 )"' showing total 38 results

Start Over Author "Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 )"

38 results on '"Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 )"'

1. Mutational analysis of anal cancers demonstrates frequent PIK3CA mutations associated with poor outcome after salvage abdominoperineal resection

Author: Sophie Richon, Marie-Christine Falcou, Emmanuel Mitry, Xavier Sastre-Garau, Adrien Briaux, Julien Lazartigues, Wulfran Cacheux, Fereshteh Farkhondeh, Etienne Rouleau, Petros Tsantoulis, Arnaud Roth, Emmanuelle Jeannot, Virginie Dangles-Marie, Bruno Buecher, Anne de la Rochefordière, Pascale Mariani, Sergio Roman-Roman, Ivan Bièche, Marion Richard-Molard, D. Stevens, Astrid Lièvre, A. Labib, Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin, Institut Curie [Paris], Département de chirurgie, Service de Génétique Oncologique, Département de Recherche Translationnelle, Centre de Recherche, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité-Institut Curie [Paris], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Compartimentation et dynamique cellulaires (CDC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service de Biostatistique, Facultés des sciences pharmaceutiques et biologiques, Service des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], CEST (Comite d'Evaluation et de Suivi des projets de recherche de Transfert) from the Institut Curie, Institut Curie, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie-PRES Sorbonne Paris Cité, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-PRES Sorbonne Paris Cité, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des Maladies de l'Appareil Digestif [CHU Rennes], INSTITUT CURIE, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -PRES Sorbonne Paris Cité-INSTITUT CURIE, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Compartimentation et dynamique cellulaires ( CDC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -INSTITUT CURIE-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), and Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes]
Subjects: 0301 basic medicine, Neuroblastoma RAS viral oncogene homolog, Oncology, Male, Cancer Research, medicine.medical_treatment, DNA Mutational Analysis, growth-factor-receptor, medicine.disease_cause, human-papillomavirus, chemoradiotherapy, Phosphatidylinositol 3-Kinases, 0302 clinical medicine, anal squamous cell carcinoma, prognostic factor, abdominoperineal resection, Cervical cancer, Aged, 80 and over, Abdominoperineal resection, epidermoid carcinoma, therapeutic target, Middle Aged, Anus Neoplasms, 3. Good health, Epidermoid carcinoma, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, KRAS, Adult, medicine.medical_specialty, Class I Phosphatidylinositol 3-Kinases, chemoradiation therapy, mutation status, survival, 03 medical and health sciences, Internal medicine, expression, medicine, Humans, HRAS, neoplasms, Molecular Diagnostics, Aged, Retrospective Studies, cervical-cancer, Salvage Therapy, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, business.industry, squamous-cell carcinoma, PIK3CA, medicine.disease, Radiation therapy, 030104 developmental biology, comprehensive molecular characterization, Mutation, Neoplasm Recurrence, Local, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics, business, Chemoradiotherapy
Abstract: International audience; Background: A better understanding of the molecular profile of anal squamous cell carcinomas (ASCCs) is necessary to consider new therapeutic approaches, and the identification of prognostic and predictive factors for response to treatment. Methods: We retrospectively analysed tumours from ASCC patients for mutational analysis of KRAS, NRAS, HRAS, BRAF, PIK3CA, MET, TP53 and FBXW7 genes by HRM and Sanger sequencing analysis. Results: Specimens from 148 patients were analysed: 96 treatment-naive tumours and 52 recurrences after initial radiotherapy (RT) or chemoradiotherapy (CRT). Mutations of KRAS, PIK3CA, FBXW7 and TP53 genes were present in 3 (2.0%), 30 (20.3%), 9 (6.1%) and 7 tumours (4.7%), respectively. The distribution of the mutations was similar between treatment-naive tumours and recurrences, except for TP53 mutations being more frequent in recurrences (P = 0.0005). In patients treated with abdominoperineal resection (APR) after relapse (n = 38, median follow-up of 18.2 years), overall survival (OS) was significantly correlated with HPV16 status (P = 0.048), gender (P = 0.045) and PIK3CA mutation (P = 0.037). The PIK3CA status retained its prognostic significance in Cox multivariate regression analysis (P = 0.025). Conclusions: Our study identified PIK3CA mutation as an independent prognostic factor in patients who underwent APR for ASCC recurrence, suggesting a potential benefit from adjuvant treatment and the evaluation of targeted therapies with PI3K/Akt/mTor inhibitors in PIK3CA-mutated patients.
Published: 2016

2. The early pregnancy placenta foreshadows dna methylation alterations of solid tumors

Author: David Klatzmann, Djamel Nehar-Belaid, Dominique Bellet, Thierry Fournier, Virginie Dangles-Marie, Martin J. Aryee, Akpeli V. Nordor, Sophie Richon, Unité de Technologies Chimiques et Biologiques pour la Santé (UTCBS - UM 4 (UMR 8258 / U1022)), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Immunologie - Immunopathologie - Immunothérapie [CHU Pitié Salpêtrière] (I3), CHU Charles Foix [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biothérapies [CHU Pitié-Salpétrière], Departement Hospitalo- Universitaire - Inflammation, Immunopathologie, Biothérapie [Paris] (DHU - I2B), Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Département de Recherche Translationnelle, Institut Curie [Paris], Université Paris Descartes - Faculté de Pharmacie de Paris (UPD5 Pharmacie), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Physiopathologie et Pharmacotoxicologie Placentaire Humaine (U1139), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Massachusetts General Hospital [Boston], Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], KLATZMANN, DAVID, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Laboratoire de génétique moléculaire, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), INSTITUT CURIE, La grossesse normale et pathologique: développement et fonctions du placenta et de l'utérus ( UMR_S 767 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, medicine.disease_cause, Epigenesis, Genetic, Pregnancy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Epigenomics, DNA methylation, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, CANCER, 3. Good health, Gene Expression Regulation, Neoplastic, medicine.anatomical_structure, Pregnancy Trimester, Second, embryonic structures, Chorionic villi, GROWTH, Female, Research Paper, GENES, placenta, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, 03 medical and health sciences, TROPHOBLAST, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, INFLAMMATION, [ SDV.MHEP ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Placenta, medicine, Humans, Neoplastic transformation, 5-METHYLCYTOSINE, Epigenetics, REGULATORY T-CELLS, Molecular Biology, PURIFICATION, epigenetics, Carcinoma, Placentation, Pregnancy Trimester, First, 030104 developmental biology, Immunology, epigenomics, Cancer research, HYPOMETHYLATED BLOCKS, IMPLANTATION, Carcinogenesis, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, hypomethylation
Abstract: International audience; The placenta relies on phenotypes that are characteristic of cancer to successfully implant the embryo in the uterus during early pregnancy. Notably, it has to invade its host tissues, promote angiogenesis—while surviving hypoxia—, and escape the immune system. Similarities in DNA methylation patterns between the placenta and cancers suggest that common epigenetic mechanisms may be involved in regulating these behaviors. We show here that megabase-scale patterns of hypomethylation distinguish first from third trimester chorionic villi in the placenta, and that these patterns mirror those that distinguish many tumors from corresponding normal tissues. We confirmed these findings in villous cytotrophoblasts isolated from the placenta and identified a time window at the end of the first trimester, when these cells come into contact with maternal blood, as the likely time period for the methylome alterations. Furthermore, the large genomic regions affected by these patterns of hypomethylation encompass genes involved in pathways related to epithelial-mesenchymal transition, immune response, and inflammation. Analyses of expression profiles corresponding to genes in these hypomethylated regions in colon adenocarcinoma tumors point to networks of differentially expressed genes previously implicated in carcinogenesis and placentogenesis, where nuclear factor kappa B is a key hub. Taken together, our results suggest the existence of epigenetic switches involving large-scale changes of methylation in the placenta during pregnancy and in tumors during neoplastic transformation. The characterization of such epigenetic switches might lead to the identification of biomarkers and drug targets in oncology as well as in obstetrics and gynecology.
Published: 2017

3. Likely effect of the 2014 Ebola epidemic on HIV care in Liberia

Author: Pierre Mendiharat, Yazdan Yazdanpanah, Nathalie Cartier, Hawa Jusu, Masietta E. Taylor, Jean-Marc Chapplain, Pierre Tattevin, Cecilia Nuta, Maima Baysah, Harry Weeks, Gilles Raguin, Anne Ingels, Paul Loubet, Guillaume Mabileau, Marion Perennec-Olivier, Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution ( IAME ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de chirurgie thoracique cardiaque et vasculaire [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Fonction, structure et inactivation d'ARN bactériens, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service des maladies infectieuses et tropicales, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de chirurgie thoracique cardiaque et vasculaire [Rennes] = Thoracic and Cardiovascular Surgery [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Service des maladies infectieuses et réanimation médicale [Rennes] = Infectious Disease and Intensive Care [Rennes], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Adult, Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Program activities, Human immunodeficiency virus (HIV), HIV Infections, hiv, medicine.disease_cause, epidemic, medicine, Humans, Immunology and Allergy, Epidemics, Health Services Administration, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Potential effect, Outbreak, Hemorrhagic Fever, Ebola, Liberia, 3. Good health, Infectious Diseases, Ebola, Female, Electronic database, business, Demography
Abstract: WOS:000368457600001; International audience; Objective: Liberia's health system has been severely struck by the 2014 Ebola epidemic. We aimed to assess the potential effect of this epidemic on the care of HIV patient in two clinics [John F. Kennedy (JFK) and Redemption Hospitals] in Monrovia, which stayed open throughout the epidemic.Design and methods: A preexisting electronic database of HIV patient's follow-up visits was used to estimate three weekly parameters from January 2012 to October 2014: number of visits, number of new patient, and proportion of patients with follow-up delay. We used segmented negative binomial regressions to assess trends before and after the week of the Ebola outbreak defined in June 2014 by WHO.Results: The cumulative number of patients in care comprised 5948 patients with a total of 56287 visits between January 2012 and October 2014. From June 2014, the number of visit per week, stable since 2012, abruptly decreased (59%) in Redemption (P\textless0.001) and progressively decreased by 3% per week in JFK (P\textless0.001). In both the clinics, the weekly proportion of patient with follow-up delay sharply increased after the point break from June 2014 (P value \textless 0.001). From June 2014, a significant decrease in new patients per week occurred in both the clinics: by 57% (P value \textless 0.001) in Redemption and by 4.6% per week (P value \textless 0.001) in JFK.Conclusion: The Ebola epidemic had a significant effect on HIV care in Monrovia. Given the particular impact on the rate of patients with follow-up delay, a long-term impact is feared
Published: 2015

4. CYP46A1 inhibition, brain cholesterol accumulation and neurodegeneration pave the way for Alzheimer’s disease

Author: Dominique Langui, Michel Vidaud, Eloise Hudry, Nathalie Cartier, Ivan Bièche, Marc Dhenain, Sandro Alves, Olivier Laprévote, Patrick Aubourg, Sophie Ayciriex, Charles Duyckaerts, Jérôme Braudeau, Catherine Marquer, Nicolas Auzeil, Farah Chali, Marie-Claude Potier, Richard B. Miles, Fathia Djelti, Jennifer Varin, Faculté de Pharmacie de Paris - Université Paris Descartes (UPD5 Pharmacie), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG), Max-Planck-Gesellschaft, Institut des Sciences Analytiques (ISA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon, Mécanismes adaptatifs : des organismes aux communautés, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Thérapie génique, Génomique et Epigénomique (U 1169), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 (LMN), Service MIRCEN (MIRCEN), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique, physiopathologie et approches thérapeutiques des maladies héréditaires du système nerveux (EA 7331), Facultés des sciences pharmaceutiques et biologiques, Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière (CRICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toxicité environnementale, cibles thérapeutiques, signalisation cellulaire (T3S - UMR_S 1124), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Chimie et Toxicologie Analytique et Cellulaire (EA 4463), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Neuropathologie Raymond Escourolle [CHU Pitié-Salpétriêre], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Inserm U986, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Paris Descartes - Faculté de Pharmacie de Paris (UPD5 Pharmacie), Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Faculté de Pharmacie de Paris ( UPD5 Pharmacie ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Max Planck Institute for Cell Biology and Genetics, Max-Planck-Institut, Institut des Sciences Analytiques ( ISA ), École normale supérieure - Lyon ( ENS Lyon ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Mécanismes adaptatifs : des organismes aux communautés ( MECADEV ), Muséum National d'Histoire Naturelle ( MNHN ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Thérapie génique, Génomique et Epigénomique ( U 1169 ), Université Paris-Saclay-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Laboratoire des Maladies Neurodégénératives - UMR 9199 ( LMN ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Génétique, physiopathologie et approches thérapeutiques des maladies héréditaires du système nerveux ( EA 7331 ), Centre de Recherche de l'Institut du Cerveau et de la Moelle épinière ( CRICM ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Toxicologie, Pharmacologie et Signalisation Cellulaire ( U1124 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Chimie et Toxicologie Analytique et Cellulaire ( EA 4463 ), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute ( ICM ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Institut de Chimie des Substances Naturelles ( ICSN ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratoire de Neuropathologie Raymond Escourolle, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Service MIRCEN ( MIRCEN ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie François JACOB (JACOB), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay
Subjects: [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, Hippocampus, Hippocampal formation, Small hairpin RNA, chemistry.chemical_compound, Amyloid beta-Protein Precursor, 0302 clinical medicine, [ SDV.BBM.BC ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], RNA interference, Homeostasis, Enzyme Inhibitors, [ SDV.BIBS ] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Lipid raft, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Neurons, 0303 health sciences, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Neurodegeneration, Brain, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], 3. Good health, Cholesterol, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [ SDV.NEU.NB ] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, Female, medicine.medical_specialty, Mice, Transgenic, Biology, 03 medical and health sciences, Alzheimer Disease, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Internal medicine, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Cholesterol 24-Hydroxylase, Animals, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Liver X receptor, 030304 developmental biology, Amyloid beta-Peptides, medicine.disease, Mice, Inbred C57BL, Endocrinology, chemistry, Steroid Hydroxylases, [ CHIM.ANAL ] Chemical Sciences/Analytical chemistry, Neurology (clinical), Neuroscience, 030217 neurology & neurosurgery, [ SDV.BBM.BS ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM]
Abstract: Abnormalities in neuronal cholesterol homeostasis have been suspected or observed in several neurodegenerative disorders including Alzheimer's disease, Parkinson's disease and Huntington's disease. However, it has not been demonstrated whether an increased abundance of cholesterol in neurons in vivo contributes to neurodegeneration. To address this issue, we used RNA interference methodology to inhibit the expression of cholesterol 24-hydroxylase, encoded by the Cyp46a1 gene, in the hippocampus of normal mice. Cholesterol 24-hydroxylase controls cholesterol efflux from the brain and thereby plays a major role in regulating brain cholesterol homeostasis. We used an adeno-associated virus vector encoding short hairpin RNA directed against the mouse Cyp46a1 mRNA to decrease the expression of the Cyp46a1 gene in hippocampal neurons of normal mice. This increased the cholesterol concentration in neurons, followed by cognitive deficits and hippocampal atrophy due to apoptotic neuronal death. Prior to neuronal death, the recruitment of the amyloid protein precursor to lipid rafts was enhanced leading to the production of β-C-terminal fragment and amyloid-β peptides. Abnormal phosphorylation of tau and endoplasmic reticulum stress were also observed. In the APP23 mouse model of Alzheimer's disease, the abundance of amyloid-β peptides increased following inhibition of Cyp46a1 expression, and neuronal death was more widespread than in normal mice. Altogether, these results suggest that increased amounts of neuronal cholesterol within the brain may contribute to inducing and/or aggravating Alzheimer's disease.
Published: 2015

5. IFI35, mir-99a and HCV Genotype to Predict Sustained Virological Response to Pegylated-Interferon Plus Ribavirin in Chronic Hepatitis C

Author: Estrabaud, Emilie, Appourchaux, Kevin, Bieche, Ivan, Carrat, Fabrice, Lapalus, Martine, Lada, Olivier, Martinot-Peignoux, Michelle, Boyer, Nathalie, Marcellin, Patrick, Vidaud, Michel, Asselah, Tarik, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Bichat - Claude Bernard, Service d'hépatologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), LabEx Inflamex, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation (ESIM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), HAL UPMC, Gestionnaire, Centre de recherche sur l'Inflammation ( CRI ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Epidémiologie des maladies infectieuses et modélisation ( ESIM ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Unité de Santé Publique, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris - AP-HP (FRANCE)-CHU Saint-Antoine [APHP]
Subjects: [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, virus diseases, [ SDV.MP.VIR ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology
Abstract: International audience; Although, the treatment of chronic hepatitis C (CHC) greatly improved with the use of direct antiviral agents, pegylated-interferon (PEG-IFN) plus ribavirin remains an option for many patients, worldwide. The intra-hepatic level of expression of interferon stimulated genes (ISGs) and the rs12979860 CC genotype located within IFNL3 have been associated with sustained virological response (SVR), in patients with CHC. The aim of the study was to identify micro-RNAs associated with SVR and to build an accurate signature to predict SVR. Pre-treatment liver biopsies from 111 patients, treated with PEG-IFN plus ribavirin, were studied. Fifty-seven patients had SVR, 36 non-response (NR) and 18 relapse (RR). The expression of 851 human miRNAs and 30 selected mRNAs, including ISGs, was assessed by RT-qPCR. In the first group of patients (screen), 20 miRNAs out of the 851 studied were deregulated between NRs and SVRs. From the 4 miRNAs validated (mir-23a, mir-181a*, mir-217 and mir-99a), in the second group of patients (validation), 3 (mir-23a, mir-181a* and mir-99a) were down-regulated in NRs as compared to SVRs. The ISGs, studied, were accumulated in SVRs and IFNL3 rs12979860 CT/TT carriers compared respectively to NRs and CC carriers. Combining, clinical data together with the expression of selected genes and micro-RNAs, we identified a signature (IFI35, mir-99a and HCV genotype) to predict SVR (AUC:0.876) with a positive predictive value of 86.54% with high sensibility (80%) and specificity (80.4%). This signature may help to characterize patients with low chance to respond to PEG-IFN/ribavirin and to elucidate mechanisms of NR.
Published: 2015

6. Adult-onset genetic leukoencephalopathies: a MRI pattern-based approach in a comprehensive study of 154 patients

Author: Gilles Edan, Nicolas Collongues, Frédéric Blanc, Eloi Magnin, Marc Bataillard, Mickael Cohen, Thierry Levade, David Brassat, Jean-Philippe Neau, Patrizia Amati-Bonneau, Xavier Ayrignac, Maurice Giroud, Patrick Vermersch, Eric Berger, Cyril Goizet, Celine Bellesme, Clarisse Carra-Dalliere, Jean Louis Devoize, Christophe Verny, Anne Marie Guennoc, Pierre Labauge, Marc Debouverie, Pierre Clavelou, Thibault Moreau, Jean Pelletier, Laurent Magy, Bruno Brochet, Christian Denier, Jean-Philippe Camdessanché, Sandrine Wiertlewski, Nicolas Menjot de Champfleur, Jean-Christophe Ouallet, Gilles Defer, Frédérique Taithe, Elsa Kaphan, Nathalie Derache, Françoise Durand-Dubief, Michel Clanet, Sandra Vukusic, Christine Lebrun-Frenay, Stéphane Mathis, Olivier Outteryck, Bertrand Audoin, Lucie Guyant-Maréchal, Odile Boespflug Tanguy, Elisabeth Tournier-Lasserve, Didier Hannequin, Hélène Zéphir, Jean-Baptiste Chanson, Emmanuelle Le Page, Patrick Aubourg, Sophie Pittion, Jérôme De Seze, Imen Dorboz, Véronique Deburghgraeve, Giovanni Castelnovo, Dominique Bonneau, Julien Masliah-Planchon, David-Axel Laplaud, CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université Montpellier 1 (UM1), Institut des Neurosciences de Montpellier - Déficits sensoriels et moteurs (INM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Department of Neuroradiology, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Bicêtre, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), CHU Marseille, Centre de résonance magnétique biologique et médicale (CRMBM), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de neurologie [Strasbourg], CHU Strasbourg, Laboratoire d'imagerie et de neurosciences cognitives (Strasbourg), Laboratoire d'Imagerie et de Neurosciences Cognitives (LINC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), RMN et optique : De la mesure au biomarqueur, Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé (CREATIS), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Etienne, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Pôle neurosciences [Hôpital de Purpan - Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Laboratoire d'Immunologie (EA 2686), Université de Lille, Droit et Santé, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre d'investigation clinique [Nancy] (CIC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service de neurologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Service de Neurologie [Rennes] = Neurology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Gérontologie (BICETRE - Géronto), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale Intégrée (BNMI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université d'Angers (UA), Mitochondrie : Régulations et Pathologie, Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique médicale et fonctionnelle du cancer et des maladies neuropsychiatriques, Service de Neurologie [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Clermont-Ferrand, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Service de Neurologie [CHU Limoges], CHU Limoges, Centre Hospitalier d'Angoulême (CH Angoulême), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neuroprotection du Cerveau en Développement / Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies (PROTECT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Université de Montpellier (UM), Institut des Neurosciences de Montpellier (INM), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Pôle Neurosciences [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Université Montpellier 1 ( UM1 ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Centre de résonance magnétique biologique et médicale ( CRMBM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Imagerie et de Neurosciences Cognitives ( LINC ), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Louis Pasteur - Strasbourg I-IFR37-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image pour la Santé ( CREATIS ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Nice, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Laboratoire d'Immunologie ( EA 2686 ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CIC-Nancy, Institut Lorrain du Coeur et des Vaisseaux Louis Mathieu [Nancy]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé ( VisAGeS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE ( IRISA-D5 ), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires ( IRISA ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Bretagne Sud ( UBS ) -École normale supérieure - Rennes ( ENS Rennes ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Neurologie [Rennes], Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Gérontologie ( BICETRE - Géronto ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale Intégrée, Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université d'Angers ( UA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Angers, Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Neurologie [Caen], CHU Caen-Université de Caen Normandie ( UNICAEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations ( CESP ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), CHRU Tours, Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Centre Hospitalier d'Angoulême, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies ( PROTECT ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, Male, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Pathology, leukodystrophy, Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], White matter, Leukoencephalopathy, Young Adult, metabolic, Leukoencephalopathies, medicine, Humans, Age of Onset, 10. No inequality, CADASIL, Aged, Retrospective Studies, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], medicine.diagnostic_test, business.industry, Leukodystrophy, Retrospective cohort study, Magnetic resonance imaging, Middle Aged, medicine.disease, Magnetic Resonance Imaging, White Matter, 3. Good health, Cerebrovascular Disorders, medicine.anatomical_structure, Cohort, Female, Neurology (clinical), France, Age of onset, genetic, business, MRI
Abstract: International audience; Inherited white matter diseases are rare and heterogeneous disorders usually encountered in infancy. Adult-onset forms are increasingly recognized. Our objectives were to determine relative frequencies of genetic leukoencephalopathies in a cohort of adult-onset patients and to evaluate the effectiveness of a systematic diagnostic approach. Inclusion criteria of this retrospective study were: (i) symmetrical involvement of white matter on the first available brain MRI; (ii) age of onset above 16 years. Patients with acquired diseases were excluded. Magnetic resonance imaging analysis identified three groups (vascular, cavitary and non-vascular/non-cavitary) in which distinct genetic and/or biochemical testing were realized. One hundred and fifty-four patients (male/female = 60/94) with adult-onset leukoencephalopathies were identified. Mean age of onset was 38.6 years. In the vascular group, 41/55 patients (75%) finally had a diagnosis [including CADASIL (cerebral autosomal-dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy, n = 32) and COL4A1 mutation, n = 7]. In the cavitary group, 13/17 (76%) patients had a diagnosis of EIF2B-related disorder. In the third group (n = 82), a systematic biological screening allowed a diagnosis in 23 patients (28%) and oriented direct genetic screening identified 21 additional diseases (25.6%). Adult-onset genetic leukoencephalopathies are a rare but probably underestimated entity. Our study confirms the use of a magnetic resonance imaging-based classification with a final diagnosis rate of 64% (98/154) cases.
Published: 2014

7. Vasculature analysis of patient derived tumor xenografts using species-specific PCR assays: evidence of tumor endothelial cells and atypical VEGFA-VEGFR1/2 signalings

Author: Virginie Dangles-Marie, Eric Angevin, Sophie Vacher, Elisabetta Marangoni, Ludmilla de Plater, Fariba Nemati, Sergio Roman-Roman, Rana Hatem, Ivan Bièche, Ahmed Dahmani, Didier Decaudin, Sophie Richon, David Vallerand, Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin-Institut Curie [Paris], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Recherche Translationnelle, Institut Curie [Paris], Service d'Oncologie, Roche SAS, Compartimentation et dynamique cellulaires (CDC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Département d’Innovation Thérapeutique et essais précoces [Gustave Roussy] (DITEP), Institut Gustave Roussy (IGR), Département d'Oncologie Médicale, Centre de Recherche, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-PRES Sorbonne Paris Cité-Institut Curie [Paris], This work was supported by the Comité départemental des Hauts-de-Seine de la Ligue Nationale Contre le Cancer , the Conseil régional d'Ile-de-France , the Cancéropôle Ile-de-France and the Association pour la recherche en cancérologie de Saint-Cloud (ARCS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-PRES Sorbonne Paris Cité, BMC, Ed., CRLCC René Huguenin-INSTITUT CURIE, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), INSTITUT CURIE, Compartimentation et dynamique cellulaires ( CDC ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -INSTITUT CURIE-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Département d’Innovation Thérapeutique et essais précoces [Gustave Roussy] ( DITEP ), Institut Gustave Roussy ( IGR ), and Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -PRES Sorbonne Paris Cité-INSTITUT CURIE
Subjects: Vascular Endothelial Growth Factor A, CD31, Cancer Research, Pathology, medicine.medical_specialty, Stromal cell, Species-specific PCR assays, Cell, Angiogenesis Inhibitors, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Antibodies, Monoclonal, Humanized, [ SDV.CAN ] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Mice, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Tumor vasculature, Biomarkers, Tumor, Genetics, medicine, Animals, Humans, Autocrine signalling, Patient-deriv ed xenografts, Endothelial markers, business.industry, VEGFA-VEGFR1/2 signalings, Gene Expression Profiling, Endothelial Cells, Cancer, Neoplasms, Experimental, Endoglin, medicine.disease, Xenograft Model Antitumor Assays, 3. Good health, Bevacizumab, Gene Expression Regulation, Neoplastic, Patient-derived xenografts, Vascular endothelial growth factor A, Receptors, Vascular Endothelial Growth Factor, medicine.anatomical_structure, Oncology, Cancer cell, cardiovascular system, Female, business, Signal Transduction, Research Article
Abstract: International audience; BACKGROUND: Tumor endothelial transdifferentiation and VEGFR1/2 expression by cancer cells have been reported in glioblastoma but remain poorly documented for many other cancer types. METHODS: To characterize vasculature of patient-derived tumor xenografts (PDXs), largely used in preclinical anti-angiogenic assays, we designed here species-specific real-time quantitative RT-PCR assays. Human and mouse PECAM1/CD31, ENG/CD105, FLT1/VEGFR1, KDR/VEGFR2 and VEGFA transcripts were analyzed in a large series of 150 PDXs established from 8 different tumor types (53 colorectal, 14 ovarian, 39 breast and 15 renal cell cancers, 6 small cell and 5 non small cell lung carcinomas, 13 cutaneous melanomas and 5 glioblastomas) and in two bevacizumab-treated non small cell lung carcinomas xenografts. RESULTS: As expected, mouse cell proportion in PDXs -evaluated by quantifying expression of the housekeeping gene TBP- correlated with all mouse endothelial markers and human VEGFA RNA levels. More interestingly, we observed human PECAM1/CD31 and ENG/CD105 expression in all tumor types, with higher rate in glioblastoma and renal cancer xenografts. Human VEGFR expression profile varied widely depending on tumor types with particularly high levels of human FLT1/VEGFR1 transcripts in colon cancers and non small cell lung carcinomas, and upper levels of human KDR/VEGFR2 transcripts in non small cell lung carcinomas. Bevacizumab treatment induced significant low expression of mouse Pecam1/Cd31, Eng/Cd105, Flt1/Vegfr1 and Kdr/Vefr2 while the human PECAM1/CD31 and VEGFA were upregulated. CONCLUSIONS: Taken together, our results strongly suggest existence of human tumor endothelial cells in all tumor types tested and of both stromal and tumoral autocrine VEGFA-VEGFR1/2 signalings. These findings should be considered when evaluating molecular mechanisms of preclinical response and resistance to tumor anti-angiogenic strategies.
Published: 2014

8. Targeting VEGFR1 on endothelial progenitors modulates their differentiation potential

Author: Peter Carmeliet, Alexis Yon, Michel Vidal, David M. Smadja, Ivan Bièche, Catherine Boisson-Vidal, Marie Reille-Serroussi, Blandine Dizier, Clément d’Audigier, Skerdi Haviari, Florent Huguenot, Coralie L. Guerin, Anne Godier, Benoit Gautier, Carmen Roncal, Nicolas Inguimbert, Jean-Meidi Alili, Solène Evrard, Delphine Borgel, Pascale Gaussem, Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ), Thrombose : Épidémiologie, Physiopathologie et Thérapeutiques Innovantes ( UMR_S 765 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d’hématologie biologique, Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ), Chimie Organique, Médicinale et Extractive et Toxicologie Expérimentale ( COMETE - UMR 8638 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service d`anesthésie et réanimation, CHU Cochin [AP-HP], Laboratoire de Chimie des Biomolécules et de l'Environnement ( LCBE ), Université de Perpignan Via Domitia ( UPVD ), Faculté de Pharmacie, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Laboratory of Angiogenesis and Neurovascular Link, Vesalius Research Center, Risque Thrombotique et Mecanismes de l'Hemostase ( U765 ), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Thrombose : Épidémiologie, Physiopathologie et Thérapeutiques Innovantes (UMR_S 765), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Chimie Organique, Médicinale et Extractive et Toxicologie Expérimentale (COMETE - UMR 8638), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire de Chimie des Biomolécules et de l'Environnement (LCBE), Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Risque Thrombotique et Mecanismes de l'Hemostase (U765), Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Université Montpellier 1 (UM1), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Vascular Endothelial Growth Factor A, Placental growth factor, Cancer Research, Physiology, Angiogenesis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Neovascularization, Physiologic, Coronary Artery Disease, Colony-Forming Units Assay, Neovascularization, Vasculogenesis, Ischemia, In vivo, medicine, Animals, Humans, Cardiac Surgical Procedures, Phosphorylation, RNA, Small Interfering, Progenitor cell, Endothelial progenitor cells, Cell Proliferation, Endothelial-colony-forming cells, Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-1, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], business.industry, Stem Cells, Endothelial Cells, Membrane Proteins, Cell Differentiation, Biomarker, Recombinant Proteins, Hindlimb, 3. Good health, Mice, Inbred C57BL, Vascular endothelial growth factor B, Drug Combinations, Vascular endothelial growth factor C, VEGFR1, Immunology, Cancer research, Proteoglycans, Collagen, Laminin, medicine.symptom, Cell Migration Assays, business
Abstract: International audience; ObjectivesWe studied whether plasma levels of angiogenic factors VEGF and placental growth factor (PlGF) in coronary artery disease patients or undergoing cardiac surgery are modified, and whether those factors modulate endothelial progenitor’s angiogenic potential.Methods and resultsA total of 143 patients’ plasmas from two different studies were analyzed (30 coronary artery disease patients, 30 patients with stable angina, coupled with 30 age and sex-matched controls; 53 patients underwent cardiac surgery). Among factors screened, only PlGF was found significantly increased in these pathological populations. PlGF-1 and PlGF-2 were then tested on human endothelial-colony-forming cells (ECFCs). We found that PlGF-1 and PlGF-2 induce VEGFR1 phosphorylation and potentiate ECFCs tubulogenesis in vitro. ECFCs VEGFR1 was further inhibited using a specific small interfering RNA (siRNA) and the chemical compound 4321. We then observed that the VEGFR1-siRNA and the compound 4321 decrease ECFCs tubulogenesis potential in vitro. Finally, we tested the compound 4321 in the preclinical Matrigel®-plug model with C57Bl/6J mice as well as in the murine hindlimb ischemia model. We found that 4321 inhibited the plug vascularization, attested by the hemoglobin content and the VE-Cadherin expression level and that 4321 inhibited the post-ischemic revascularization.ConclusionPlGF plasma levels were found increased in cardiovascular patients. Disrupting PlGF/VEGFR1 pathway could modulate ECFC-induced tubulogenesis, the cell type responsible for newly formed vessels in vivo.
Published: 2014

9. Mutations in SETD2 cause a novel overgrowth condition

Author: Valérie Malan, Armelle Luscan, Didier Lacombe, Renaud Touraine, Christine Francannet, Valérie Cormier-Daire, Eric Pasmant, Fabienne Giuliano, Sylvie Odent, Ingrid Laurendeau, Michel Vidaud, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie et de génétique moléculaire [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Médicale, CHU Clermont-Ferrand-CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Service de génétique médicale, Hôpital l'Archet, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme (MRGM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Hôpital Pellegrin-Service de Génétique Médicale du CHU de Bordeaux, Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire, CHU Saint-Etienne-Hôpital Nord - Saint-Etienne, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], CHU Clermont-Ferrand-Hôpital d'Estaing, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud, and Maladies Rares - Génétique et Métabolisme ( MRGM )
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, DNA Mutational Analysis, Biology, medicine.disease_cause, Craniofacial Abnormalities, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Congenital Hypothyroidism, Genetics, medicine, Humans, Missense mutation, Abnormalities, Multiple, Epigenetics, Genetics (clinical), 030304 developmental biology, Weaver syndrome, 0303 health sciences, Mutation, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Sotos Syndrome, EZH2, Macrocephaly, Histone-Lysine N-Methyltransferase, medicine.disease, 3. Good health, Speech delay, Medical genetics, Female, medicine.symptom, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Hand Deformities, Congenital, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; BACKGROUND: Overgrowth conditions are a heterogeneous group of disorders characterised by increased growth and variable features, including macrocephaly, distinctive facial appearance and various degrees of learning difficulties and intellectual disability. Among them, Sotos and Weaver syndromes are clinically well defined and due to heterozygous mutations in NSD1 and EZH2, respectively. NSD1 and EZH2 are both histone-modifying enzymes. These two epigenetic writers catalyse two specific post-translational modifications of histones: methylation of histone 3 lysine 36 (H3K36) and lysine 27 (H3K27). We postulated that mutations in writers of these two chromatin marks could cause overgrowth conditions, resembling Sotos or Weaver syndromes, in patients with no NSD1 or EZH2 abnormalities. METHODS: We analysed the coding sequences of 14 H3K27 methylation-related genes and eight H3K36 methylation-related genes using a targeted next-generation sequencing approach in three Sotos, 11 'Sotos-like' and two Weaver syndrome patients. RESULTS: We identified two heterozygous mutations in the SETD2 gene in two patients with 'Sotos-like' syndrome: one missense p.Leu1815Trp de novo mutation in a boy and one nonsense p.Gln274* mutation in an adopted girl. SETD2 is non-redundantly responsible for H3K36 trimethylation. The two probands shared similar clinical features, including postnatal overgrowth, macrocephaly, obesity, speech delay and advanced carpal ossification. CONCLUSIONS: Our results illustrate the power of targeted next-generation sequencing to identify rare disease-causing variants. We provide a compelling argument for Sotos and Sotos-like syndromes as epigenetic diseases caused by loss-of-function mutations of epigenetic writers of the H3K36 histone mark.
Published: 2014

10. Higher risk of death among MEN1 patients with mutations in the JunD interacting domain: a Groupe d'etude des Tumeurs Endocrines (GTE) cohort study

Author: Bruno Vergès, Albert Beckers, Brigitte Delemer, Vincent Rohmer, Arnaud Murat, Jean-Marc Kuhn, Philippe Ruszniewski, Christine Binquet, Julien Thevenon, Philippe Caron, Georges Weryha, Michel Rodier, Sophie Giraud, F. Archambeaud, I. Guilhem, Morgane Le Bras, Philippe Chanson, Béatrice Parfait, Jean-Louis Sadoul, Lionel Groussin, Patricia Niccoli, Catherine Cardot-Bauters, Philippe Bouchard, Eric Baudin, Françoise Duron, Michel Renard, Hélène Bihan, Véronique Kerlan, P. Lecomte, Catherine Lombard-Bohas, Abderrahmane Bourredjem, Anne Barlier, Emilie Castermans, Françoise Borson-Chazot, Bernard Goichot, Olivier Chabre, Antoine Tabarin, Alain Calender, Laurence Faivre, Hélène Du Boullay, Pierre Goudet, Eric Clauser, Alfred Penfornis, Marie-Françoise Odou, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ), Immunovirologie et polymorphisme génétique, Université de Nantes ( UN ), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques ( CIC-EC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Unité Mixte de Génétique Constitutionnelle des Cancers Fréquents, Centre Léon Bérard [Lyon]-Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon ( CRCL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de médecine nucléaire, Fédération d'endocrinologie-Groupement hospitalier Lyon-Est, Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille ( CRN2M ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Service d'Endocrinologie ( BORDEAUX - Endocrino ), CHU Bordeaux [Bordeaux], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Biologie du Cancer et de l'Infection ( BCI - UMR S1036 ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Service d'Endocrinologie ( LIEGE - Endocrino ), Université de Liège, Department of Gastroenterology, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Beaujon, Pathologie et virologie moléculaire ( PVM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service d'Endocrinologie - Diabète - Nutrition [Reims], Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement ( LMGE ), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Service d'Endocrinologie ( ANGERS - Endocrino ), CHU Angers, Département de Médecine Interne et Nutrition, CHU Strasbourg, Service d'Endocrinologie ( TOULOUSE - Endocrino ), CHU Toulouse [Toulouse], Récepteurs stéroïdiens : physiopathologie endocrinienne et métabolique, Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -IFR93-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut Gustave Roussy ( IGR ), Médecine nucléaire, Département d'imagerie médicale [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy ( IGR ) -Institut Gustave Roussy ( IGR ), Service d'Endocrinologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Service d'Endocrinologie ( TOURS - Endocrino ), CHRU Tours, Service de diabétologie - endocrinologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz, Marqueurs pronostiques et facteurs de régulations des pathologies cardiaques et vasculaires - UFC ( PCVP / CARDIO ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Conservatoire National des Arts et Métiers - Paris ( CNAM Paris ), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ), Unité de Recherche en Epidémiologie Nutritionnelle ( UREN ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] ( CNAM ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Médecine interne B, Endocrinologie, Diabète, Maladies métaboliques [CHU Limoges], CHU Limoges, Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale ( GETBO ), Université de Brest ( UBO ), Service d'Endocrinologie ( CHRU - Endocrino ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Service de Diabétologie, Service des maladies métaboliques et endocriniennes, Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes], Service d'Endocrinologie ( NICE - Endocrino ), CHU Nice, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ), Marqueurs pronostiques et facteurs de régulations des pathologies cardiaques et vasculaires - UFC ( EA 3920) ( PCVP / CARDIO ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Université de Franche-Comté ( UFC ) -Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] ( UBFC ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre Léon Bérard [Lyon]-Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche en neurobiologie - neurophysiologie de Marseille (CRN2M), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service d'Endocrinologie (BORDEAUX - Endocrino), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie du Cancer et de l'Infection (BCI ), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Endocrinologie (LIEGE - Endocrino), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pathologie et virologie moléculaire (PVM (UMR_7151)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement (LMGE), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Service d'Endocrinologie (ANGERS - Endocrino), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service d'Endocrinologie (TOULOUSE - Endocrino), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR93-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut Gustave Roussy (IGR), Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut Gustave Roussy (IGR), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service d'Endocrinologie (TOURS - Endocrino), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Service de Diabétologie - Endocrinologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Marqueurs pronostiques et facteurs de régulations des pathologies cardiaques et vasculaires - UFC ( EA 3920) (PCVP / CARDIO), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Groupe d'Etude de la Thrombose de Bretagne Occidentale (GETBO), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO), Service d'Endocrinologie (CHRU - Endocrino), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service d'Endocrinologie, Diabétologie et Maladies Métaboliques (CHU de Dijon), Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] (CHU Nîmes), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes)-Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Service d'Endocrinologie (NICE - Endocrino), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Université de Nantes (UN), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Beaujon, Pathologie et virologie moléculaire (PVM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-IFR93-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Hôpital Jean Minjoz, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université de Brest (UBO), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupement Hospitalier Lyon-Est (GHE), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Fédération d'endocrinologie, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Endocrinologie, maladies métaboliques et nutrition [CHU Toulouse], Pôle Cardiovasculaire et Métabolique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Marqueurs pronostiques et facteurs de régulations des pathologies cardiaques et vasculaires - UFC ( UR 3920) (PCVP / CARDIO), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), and Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)
Subjects: Oncology, Male, endocrine system diseases, Proto-Oncogene Proteins c-jun, [SDV]Life Sciences [q-bio], Disease, medicine.disease_cause, MESH: Protein Structure, Tertiary, 0302 clinical medicine, Risk Factors, MESH: Risk Factors, MESH : Female, Genetics (clinical), Mutation, General Medicine, MESH: Follow-Up Studies, MESH : Risk Factors, 3. Good health, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, MESH : Proto-Oncogene Proteins, Female, MESH : Mutation, MESH : Protein Structure, Tertiary, MESH : Proto-Oncogene Proteins c-jun, MESH : Multiple Endocrine Neoplasia Type 1, Cohort study, medicine.medical_specialty, endocrine system, MESH: Mutation, Genetic counseling, MESH : Male, MESH: Multiple Endocrine Neoplasia Type 1, 030209 endocrinology & metabolism, Biology, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Proto-Oncogene Proteins, Genetics, medicine, Multiple Endocrine Neoplasia Type 1, Humans, MEN1, Family, Molecular Biology, MESH: Family, MESH: Humans, MESH: Proto-Oncogene Proteins c-jun, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Proportional hazards model, MESH : Humans, Cancer, MESH : Follow-Up Studies, medicine.disease, MESH: Male, Protein Structure, Tertiary, MESH: Proto-Oncogene Proteins, Cancer research, MESH : Family, MESH: Female, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Multiple endocrine neoplasia syndrome type 1 (MEN1), which is secondary to mutation of the MEN1 gene, is a rare autosomal-dominant disease that predisposes mutation carriers to endocrine tumors. Although genotype-phenotype studies have so far failed to identify any statistical correlations, some families harbor recurrent tumor patterns. The function of MENIN is unclear, but has been described through the discovery of its interacting partners. Mutations in the interacting domains of MENIN functional partners have been shown to directly alter its regulation abilities. We report on a cohort of MEN1 patients from the Groupe d'étude des Tumeurs Endocrines. Patients with a molecular diagnosis and a clinical follow-up, totaling 262 families and 806 patients, were included. Associations between mutation type, location or interacting factors of the MENIN protein and death as well as the occurrence of MEN1-related tumors were tested using a frailty Cox model to adjust for potential heterogeneity across families. Accounting for the heterogeneity across families, the overall risk of death was significantly higher when mutations affected the JunD interacting domain (adjusted HR = 1.88: 95%-CI = 1.15-3.07). Patients had a higher risk of death from cancers of the MEN1 spectrum (HR = 2.34; 95%-CI = 1.23-4.43). This genotype-phenotype correlation study confirmed the lack of direct genotype-phenotype correlations. However, patients with mutations affecting the JunD interacting domain had a higher risk of death secondary to a MEN1 tumor and should thus be considered for surgical indications, genetic counseling and follow-up.
Published: 2013

11. MicroRNAome profiling in benign and malignant neurofibromatosis type 1-associated nerve sheath tumors: evidences of PTEN pathway alterations in early NF1 tumorigenesis

Author: Jennifer Varin, Pierre Wolkenstein, Dominique Vidaud, Mikael Hivelin, Ingrid Laurendeau, Eric Pasmant, Valérie Dumaine, Julien Masliah-Planchon, Laurent Lantieri, Béatrice Parfait, Nicolas Ortonne, Karen Leroy, Laurence Valeyrie-Allanore, Ivan Bièche, Michel Vidaud, Armelle Luscan, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie et de génétique moléculaire [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département de pathologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de Chirurgie plastique, reconstructrice et esthétique [Pompidou], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service de chirurgie plastique et reconstructive [Mondor], Laboratoire d'Investigation Clinique (LIC), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de dermatologie [Mondor], Service d'orthopédie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut Curie [Paris], This work was supported in part by grants from Association Neurofibromatoses et Recklinghausen, and Ligue Française Contre les Neurofibromatoses., BMC, Ed., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Laboratoire d'Investigation Clinique ( LIC ), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), and CRLCC René Huguenin-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-INSTITUT CURIE
Subjects: Ribonuclease III, PTEN, Neurofibromatosis 1, Time Factors, Tumor suppressor gene, Biology, medicine.disease_cause, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, MPNST, Plexiform neurofibroma, Cell Line, Tumor, Sequence Homology, Nucleic Acid, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], microRNA, Genetics, medicine, Cluster Analysis, Humans, Neurofibroma, Neurofibromatosis, 030304 developmental biology, Neurofibroma, Plexiform, 0303 health sciences, Gene Expression Profiling, PTEN Phosphohydrolase, Proteins, RNA-Binding Proteins, medicine.disease, Gene expression profiling, MicroRNAs, [ SDV.BBM.GTP ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], NF1, 030220 oncology & carcinogenesis, Argonaute Proteins, Cancer research, biology.protein, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Carcinogenesis, Research Article, Signal Transduction, Biotechnology, Neurofibromatosis type 1
Abstract: Background Neurofibromatosis type 1 (NF1) is a common dominant tumor predisposition syndrome affecting 1 in 3,500 individuals. The hallmarks of NF1 are the development of peripheral nerve sheath tumors either benign (dermal and plexiform neurofibromas) or malignant (MPNSTs). Results To comprehensively characterize the role of microRNAs in NF1 tumorigenesis, we analyzed 377 miRNAs expression in a large panel of dermal and plexiform neurofibromas, and MPNSTs. The most significantly upregulated miRNA in plexiform neurofibromas was miR-486-3p that targets the major tumor suppressor gene, PTEN. We confirmed PTEN downregulation at mRNA level. In plexiform neurofibromas, we also report aberrant expression of four miRNAs involved in the RAS-MAPK pathway (miR-370, miR-143, miR-181a, and miR-145). In MPNSTs, significant deregulated miRNAs were involved in PTEN repression (miR-301a, miR-19a, and miR-106b), RAS-MAPK pathway regulation (Let-7b, miR-195, and miR-10b), mesenchymal transition (miR-200c, let-7b, miR-135a, miR-135b, and miR-9), HOX genes expression (miR-210, miR-196b, miR-10a, miR-10b, and miR-9), and cell cycle progression (miR-195, let-7b, miR-20a, miR-210, miR-129-3p, miR-449a, and miR-106b). Conclusion We confirmed the implication of PTEN in genesis of plexiform neurofibromas and MPNSTs in NF1. Markedly deregulated miRNAs might have potential diagnostic or prognostic value and could represent novel strategies for effective pharmacological therapies of NF1 tumors.
Published: 2013

12. Identification of mutations in TMEM5 and ISPD as a cause of severe cobblestone lissencephaly

Author: Louise Devisme, Koryna Socha, Malika Chelbi, Maryse Bonnière, Alix Clemenson, Marie Gonzales, Steven Gazal, Férechté Encha-Razavi, Catherine Fallet-Bianco, Jean-Pierre Bernard, Dominique Carles, Sylvie Odent, Annie Laquerrière, Anne Bazin, Christine Bole-Feysot, Céline Bouchet-Séraphin, Tania Attié-Bitach, Fabien Guimiot, Laurence Loeuillet, Nathalie Seta, Samuel Quentin, Sandrine Vuillaumier-Barrot, Jacqueline Aziza, Bernard Grandchamp, Sophie Monnot, Philippe Loget, Unité UMR_S956, Pôle de Pathologie, Centre de Biologie Pathologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Variabilité Génétique et Maladies Humaines, Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Anatomie et Cytologie Pathologique [CHU Rouen], Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU), Endothélium microcirculatoire cérébral et lésions du système nerveux central au cours du développement (Néovasc), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de pathologie et biologie cellulaire, Université de Montréal (UdeM)-Hôpital Sainte-Justine, Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Rennes] = Anatomy and Cytopathology [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de pathologie [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de foetopathologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], LInguistique et DIdactique des Langues Étrangères et Maternelles (LIDILEM), Université Stendhal - Grenoble 3, Service de Biologie du Développement, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service d'Anatomie et de Cytologie Pathologiques, CHI Poissy-Saint-Germain, CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Service de Cytogénétique et Embryologie, Laboratoire de biochimie métabolique et cellulaire, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montréal (UdeM)-CHU Sainte Justine [Montréal], Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'Anatomie et Cytologie Pathologique [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Endothélium microcirculatoire cérébral et lésions du système nerveux central au cours du développement ( Néovasc ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institute for Research and Innovation in Biomedicine ( IRIB ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Sainte-Justine-Université de Montréal, Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Rennes], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), LInguistique et DIdactique des Langues Étrangères et Maternelles ( LIDILEM ), Université Stendhal - Grenoble 3-Université Grenoble Alpes ( UGA ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Service de Génétique et d'Embryologie Médicales, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -CHU Trousseau [APHP], Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université Stendhal - Grenoble 3-Université Grenoble Alpes (UGA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-CHU Trousseau [APHP], and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Genotype, Cobblestone Lissencephaly, [SDV]Life Sciences [q-bio], Lissencephaly, Gonadal dysgenesis, Consanguinity, Biology, medicine.disease_cause, Frameshift mutation, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Fetus, Report, Gene Order, medicine, Dystroglycan, Genetics, Humans, Family, Genetics(clinical), Pentosyltransferases, Genetics (clinical), Alleles, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Mutation, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Membrane Proteins, Exons, Cortical dysplasia, medicine.disease, Nucleotidyltransferases, Introns, 3. Good health, biology.protein, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Cobblestone lissencephaly is a peculiar brain malformation with characteristic radiological anomalies. It is defined as cortical dysplasia that results when neuroglial overmigration into the arachnoid space forms an extracortical layer that produces agyria and/or a "cobblestone" brain surface and ventricular enlargement. Cobblestone lissencephaly is pathognomonic of a continuum of autosomal-recessive diseases characterized by cerebral, ocular, and muscular deficits. These include Walker-Warburg syndrome, muscle-eye-brain disease, and Fukuyama muscular dystrophy. Mutations in POMT1, POMT2, POMGNT1, LARGE, FKTN, and FKRP identified these diseases as alpha-dystroglycanopathies. Our exhaustive screening of these six genes, in a cohort of 90 fetal cases, led to the identification of a mutation in only 53% of the families, suggesting that other genes might also be involved. We therefore decided to perform a genome-wide study in two multiplex families. This allowed us to identify two additional genes: TMEM5 and ISPD. Because TMEM has a glycosyltransferase domain and ISPD has an isoprenoid synthase domain characteristic of nucleotide diP-sugar transferases, these two proteins are thought to be involved in the glycosylation of dystroglycan. Further screening of 40 families with cobblestone lissencephaly identified nonsense and frameshift mutations in another four unrelated cases for each gene, increasing the mutational rate to 64% in our cohort. All these cases displayed a severe phenotype of cobblestone lissencephaly A. TMEM5 mutations were frequently associated with gonadal dysgenesis and neural tube defects, and ISPD mutations were frequently associated with brain vascular anomalies.
Published: 2012

13. NF1 microdeletions in neurofibromatosis type 1: from genotype to phenotype

Author: Dominique Vidaud, Michel Vidaud, Jean Soulier, Marc Sanson, Eric Pasmant, Marie-José Hamel, Meena Upadhyaya, Sébastien Barbarot, Hélène Dollfus, Salah Ferkal, Gillian Spurlock, Béatrice Parfait, Anne Dieux-Coeslier, Bertrand Isidor, Ingrid Laurendeau, Audrey Sabbagh, Elisa Grillo, Diana Rodriguez, Ivan Bièche, Ludovic Martin, Didier Lacombe, Pierre Wolkenstein, Laurent Pasquier, B. Leheup, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Medical Genetics, Institute of Medical Genetics, Service de Biochimie et Génétique Moléculaire, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Department of Dermatology, Université d'Angers ( UA ), Service de Dermatologie, Hôtel Dieu, CHU de Nantes, Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Affections de la Myeline et des Canaux Ioniques Musculaires, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Pellegrin Hospital, Laboratoire de Génétique Médicale EA 3949, Faculté de Médecine de Strasbourg, Université de Strasbourg, Génétique et Développement, Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -IFR97-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Service de Génétique Médicale, CIC - CHU Henri Mondor, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), 3UMR728 INSERM Unité d'immuno-hématologie (UIH) and laboratoire d'hématologie, Hôpital St-Louis, AP-HP, Département de neurologie 2 - Mazarin, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Center for Clinical Genetics, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Service de dermatologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Cardiff University, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Génétique Médicale (LGM), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-IFR97-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), UPMC - Département de neurologie 2 - Mazarin, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-IFR97-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)
Subjects: Adult, Male, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Neurofibromatosis 1, Genotype, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biology, medicine.disease_cause, Contiguous gene syndrome, Young Adult, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Genetics, medicine, Humans, Genetic Predisposition to Disease, Neurofibromatosis, 10. No inequality, neoplasms, Genetic Association Studies, Genetics (clinical), Sequence Deletion, 030304 developmental biology, Comparative Genomic Hybridization, 0303 health sciences, Mutation, Neurofibromin 1, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Gene Expression Profiling, Breakpoint, Life Sciences, Middle Aged, medicine.disease, Phenotype, eye diseases, nervous system diseases, Gene expression profiling, Regression Analysis, Female, 030217 neurology & neurosurgery, Comparative genomic hybridization
Abstract: International audience; In 5-10% of patients, neurofibromatosis type 1 (NF1) results from microdeletions that encompass the entire NF1 gene and a variable number of flanking genes. Two recurrent microdeletion types are found in most cases, with microdeletion breakpoints located in paralogous regions flanking NF1 (proximal NF1-REP-a and distal NF1-REP–c for the 1.4 Mb type-1 microdeletion, and SUZ12 and SUZ12P for the 1.2 Mb type-2 microdeletion). A more severe phenotype is usually associated with NF1 microdeletion patients than in those with intragenic mutations. We characterized NF1 microdeletions in 70 unrelated NF1 microdeleted patients using a high-resolution NF1 custom array comparative genomic hybridization (CGH). Genotype-phenotype correlations were studied in 58 of these microdeletion patients and compared to 389 patients with intragenic truncating NF1 mutations and phenotyped in the same standardized way. Our results confirmed in an unbiased manner the existence of a contiguous gene syndrome with a significantly higher incidence of learning disabilities and facial dysmorphism in microdeleted patients compared to patients with intragenic NF1 mutations. Microdeleted NF1 patients also showed a trend toward significance for childhood overgrowth. High-resolution array-CGH identified a new recurrent ~1.0 Mb microdeletion type, designated as type-3, with breakpoints in the paralogous regions middle NF1-REP-b and distal NF1-REP–c.
Published: 2010

14. Transfusion independence and HMGA2 activation after gene therapy of human β-thalassaemia

Author: Floriane Fusil, Stany Chrétien, Riccardo Sgarra, Beatrix Gillet-Legrand, Françoise Bernaudin, Nabil Kabbara, Robert Girot, Philippe Leboulch, Laure Caccavelli, Maria Denaro, Frédéric Galactéros, Julian D. Down, Marina Cavazzana-Calvo, Emmanuel Payen, Kathleen M. Hehir, Leila Maouche-Chretien, Bernard Gourmel, Kenneth Cornetta, Frederick D. Bushman, Axel Polack, Alain Fischer, Patrick Aubourg, Salima Hacein-Bey-Abina, Gérard Socié, Jérôme Larghero, Karen A. Westerman, Gary P. Wang, Nathalie Cartier, Eliane Gluckman, Yves Beuzard, Arthur Bank, Ronald Dorazio, Troy Brady, Geert Jan Mulder, Resy Cavallesco, Olivier Negre, Bruno Dalle, Jean Soulier, Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Clinical Investigation Center in Biotherapy, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes (IMETI), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Thérapie génique et contrôle de l'expansion cellulaire (UMR E007), Genetix-France, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Department of Microbiology, University of Pennsylvania [Philadelphia], Genetix Pharmaceuticals, Genetics Division, Boston, Brigham and Women's Hospital [Boston], Department of Life Sciences, Trieste, University of Trieste, Service d'hématologie pédiatrique, Hôpital intercommunal de Créteil, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Department of Medicine and Department of Genetics and Development, Columbia University [New York], Departments of Hematology, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institute of Hematology, Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'hématologie greffe [Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Medical and Molecular Genetics, Indiana University [Bloomington], Indiana University System-Indiana University System, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), CHU Tenon [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Pennsylvania, Università degli studi di Trieste = University of Trieste, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes ( IMETI ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Thérapie génique et contrôle de l'expansion cellulaire ( UMR E007 ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ), Cambridge, MA, Department of Biology, Paris, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut Mondor de Recherche Biomédicale ( IMRB ), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR10, Cavazzana Calvo, M., Payen, E., Negre, O., Wang, G., Hehir, K., Fusil, F., Down, J., Denaro, M., Brady, T., Westerman, K., Cavallesco, R., Gillet Legrand, B., Caccavelli, L., Sgarra, Riccardo, Maouche Chrétien, L., Bernaudin, F., Girot, R., Dorazio, R., Mulder, G. J., Polack, A., Bank, A., Soulier, J., Larghero, J., Kabbara, N., Dalle, B., Gourmel, B., Socie, G., Chrétien, S., Cartier, N., Aubourg, P., Fischer, A., Cornetta, K., Galacteros, F., Beuzard, Y., Gluckman, E., Bushman, F., Hacein Bey Abina, S., and Leboulch, P.
Subjects: Male, Transcriptional Activation, Time Factors, Adolescent, Genetic enhancement, Genetic Vectors, Gene Expression, Bone Marrow Cells, beta-Globins, Gene Terapy HMGA2, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Southeast asian, Article, Young Adult, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, hemic and lymphatic diseases, medicine, Homeostasis, Humans, Blood Transfusion, RNA, Messenger, Progenitor cell, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Blood Cells, Multidisciplinary, [ SDV.BC ] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, HMGA2 Protein, Lentivirus, beta-Thalassemia, Genetic transfer, Beta thalassemia, Genetic Therapy, medicine.disease, Clone Cells, 3. Good health, Transplantation, MicroRNAs, Haematopoiesis, Organ Specificity, Child, Preschool, 030220 oncology & carcinogenesis, Immunology, Stem cell
Abstract: Blood disorders caused by abnormal β-globin — β-thalassaemia and sickle cell disease — are the most prevalent inherited disorders worldwide, with patients often remaining dependent on blood transfusions throughout their lives. So a report of the successful use of gene therapy in a case of severe β-thalassaemia — using a lentiviral vector expressing the β-globin gene — is an eagerly awaited event. More than two years after gene transfer, the adult male patient has been transfusion-independent for 21 months. The therapeutic benefit seems to result from a dominant, myeloid-biased cell clone that may remain benign, although it could yet develop into leukaemia — a reminder that gene therapy is still at an early stage. Disorders caused by abnormal β-globin, such as β-thalassaemia, are the most prevalent inherited disorders worldwide. For treatment, many patients are dependent on blood transfusions; thus far the only cure has involved matched transplantation of haematopoietic stem cells. Here it is shown that lentiviral β-globin gene transfer can be an effective substitute for regular transfusions in a patient with severe β-thalassaemia. The β-haemoglobinopathies are the most prevalent inherited disorders worldwide. Gene therapy of β-thalassaemia is particularly challenging given the requirement for massive haemoglobin production in a lineage-specific manner and the lack of selective advantage for corrected haematopoietic stem cells. Compound βE/β0-thalassaemia is the most common form of severe thalassaemia in southeast Asian countries and their diasporas1,2. The βE-globin allele bears a point mutation that causes alternative splicing. The abnormally spliced form is non-coding, whereas the correctly spliced messenger RNA expresses a mutated βE-globin with partial instability1,2. When this is compounded with a non-functional β0 allele, a profound decrease in β-globin synthesis results, and approximately half of βE/β0-thalassaemia patients are transfusion-dependent1,2. The only available curative therapy is allogeneic haematopoietic stem cell transplantation, although most patients do not have a human-leukocyte-antigen-matched, geno-identical donor, and those who do still risk rejection or graft-versus-host disease. Here we show that, 33 months after lentiviral β-globin gene transfer, an adult patient with severe βE/β0-thalassaemia dependent on monthly transfusions since early childhood has become transfusion independent for the past 21 months. Blood haemoglobin is maintained between 9 and 10 g dl−1, of which one-third contains vector-encoded β-globin. Most of the therapeutic benefit results from a dominant, myeloid-biased cell clone, in which the integrated vector causes transcriptional activation of HMGA2 in erythroid cells with further increased expression of a truncated HMGA2 mRNA insensitive to degradation by let-7 microRNAs. The clonal dominance that accompanies therapeutic efficacy may be coincidental and stochastic or result from a hitherto benign cell expansion caused by dysregulation of the HMGA2 gene in stem/progenitor cells.
Published: 2010

15. SPRED1 germline mutations caused a neurofibromatosis type 1 overlapping phenotype

Author: E Pasmant, A Sabbagh, N Hanna, J Masliah-Planchon, E Jolly, P Goussard, P Ballerini, F Cartault, S Barbarot, J Landman-Parker, N Soufir, B Parfait, M Vidaud, P Wolkenstein, D Vidaud, R N F France, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Biochimie et Génétique Moléculaire, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'hématologie-immunologie-oncologie pédiatrique [CHU Trousseau], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique, Centre hospitalier Félix Guyon, Bellepierre, Service de dermatologie [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de biochimie hormonale, métabolique et génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de dermatologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Service d'hématologie-immunologie-oncologie pédiatrique, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), and Peer, Hal
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Neurofibromatosis 1, Adolescent, DNA Mutational Analysis, education, Gene Dosage, medicine.disease_cause, Germline, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Germline mutation, Molecular genetics, Internal medicine, Genetics, medicine, Humans, Genetic Predisposition to Disease, Neurofibromatosis, Child, Germ-Line Mutation, Genetics (clinical), Adaptor Proteins, Signal Transducing, Aged, 030304 developmental biology, Aged, 80 and over, Legius syndrome, 0303 health sciences, Mutation, Neurofibromin 1, biology, Intracellular Signaling Peptides and Proteins, Membrane Proteins, Middle Aged, medicine.disease, Phenotype, Pedigree, 3. Good health, nervous system diseases, Endocrinology, Child, Preschool, biology.protein, Female, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Germline loss-of-function mutations in the SPRED1 gene have recently been identified in patients fulfilling the National Institutes of Health (NIH) diagnostic criteria for neurofibromatosis type 1 (NF1) but with no NF1 (neurofibromin 1) mutation found, suggesting a neurofibromatosis type 1-like syndrome.61 index cases with NF1 clinical diagnosis but no identifiable NF1 mutation were screened for SPRED1 mutation.We describe one known SPRED1 mutation (c.190CT leading to p.Arg64Stop) and four novel mutations (c.637CT leading to p.Gln213Stop, c.2TC leading to p.Met1Thr, c.46CT leading to p.Arg16Stop, and c.1048_1060del leading to p.Gly350fs) in five French families. Their NF1-like phenotype was characterised by a high prevalence of café-au-lait spots, freckling, learning disability, and an absence of neurofibromas and Lisch nodules in agreement with the original description. However, we did not observe Noonan-like dysmorphy. It is noteworthy that one patient with the p.Arg16Stop mutation developed a monoblastic acute leukaemia.In our series, SPRED1 mutations occurred with a prevalence of 0.5% in NF1 patients and in 5% of NF1 patients displaying an NF1-like phenotype. SPRED1 mutated patients did not display any specific dermatologic features that were not present in NF1 patients, except for the absence of neurofibromas that seem to be a specific clinical feature of NF1. The exact phenotypic spectrum and the putative complications of this NF1 overlapping syndrome, in particular haematological malignancies, remain to be further characterised. NIH diagnostic criteria for NF1 must be revised in view of this newly characterised Legius syndrome in order to establish a specific genetic counselling.
Published: 2009

16. Hematopoietic Stem Cell Gene Therapy with a Lentiviral Vector in X-Linked Adrenoleukodystrophy

Author: Ulrich Abel, Céline Bellesme, Denice Mittelstaedt, Christof von Kalle, Bruno l’Homme, Gabor Istvan Veres, Nizar Mahlaoui, Najiba Lahlou, Patrick Aubourg, Ina Kutschera, Stéphane Blanche, Emmanuel Payen, Salima Hacein-Bey-Abina, Laure Caccavelli, Manfred Schmidt, Marina Cavazzana-Calvo, Liliane Dal-Cortivo, Nathalie Cartier, François Lefrère, Philippe Leboulch, Muriel Audit, Michel Vidaud, Pierre Bougnères, Cynthia C. Bartholomae, Veronique Kiermer, Alain Fischer, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Biothérapie [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Immunologie et chimie thérapeutiques (ICT), Cancéropôle du Grand Est-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes (IMETI), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, Thérapie génique et contrôle de l'expansion cellulaire (UMR E007), Immunologie, génétique et traitement des maladies métaboliques et du diabète (UMR_S 561), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire du D eveloppement Normal et Pathologique du Syst eme Immunitaire, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Vincent de Paul, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] (DKFZ), Bluebird bio, Inc, National Referral Center for Rare Epilepsies - Department of Pediatric Neurology, Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Nature Publishing Group, Nature Publishing Group, New York, Oregon State University (OSU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institute for Radiological Protection and Nuclear Safety, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Immunologie et chimie thérapeutiques ( ICT ), Cancéropôle du Grand Est-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Institut des Maladies Emergentes et des Thérapies Innovantes ( IMETI ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Thérapie génique et contrôle de l'expansion cellulaire ( UMR E007 ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Immunologie, génétique et traitement des maladies métaboliques et du diabète ( UMR_S 561 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, Transplantation Conditioning, Genetic enhancement, CD34, Gene Expression, ATP Binding Cassette Transporter, Subfamily D, Member 1, Cell therapy, Mice, 0302 clinical medicine, Transduction, Genetic, Adrenoleukodystrophy, Child, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Fatty Acids, Hematopoietic Stem Cell Transplantation, Hematopoietic stem cell, Brain, Cell Differentiation, 3. Good health, Haematopoiesis, medicine.anatomical_structure, Disease Progression, Female, Microglia, Stem cell, Virus Integration, Genetic Vectors, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Transplantation, Autologous, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, Humans, Cell Lineage, 030304 developmental biology, [ SDV.BC ] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Genetic Therapy, Myeloablative Agonists, medicine.disease, Hematopoietic Stem Cells, Hematopoiesis, Transplantation, Immunology, HIV-1, Leukocytes, Mononuclear, ATP-Binding Cassette Transporters, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Slowing Brain Disease with Gene Therapy X-linked adrenoleukodystrophy (ALD), the hereditary brain demyelinating disorder that was featured in the movie “ Lorenzo's Oil ,” is typically treated by transplantation of bone marrow from matched donors. This treatment slows progression of the disease by introducing cells that differentiate into myelin-producing cells. Cartier et al. (p. 818 ; see Perspective by Naldini ) tested an alternative gene therapy–based approach in two young patients without matched donors. A lentiviral vector was used to introduce a wild-type copy of the ALD gene into the patients' hematopoietic stem cells ex vivo. The modified cells were then infused back into the patients. Expression of the transferred gene was still detectable in the patients' blood cells 2 years later, and both patients showed neurological improvement and a delay in disease progression comparable to that seen with bone marrow transplants.
Published: 2009

17. Effect of tyrosine kinase inhibitor STI571 on the kinase activity of wild-type and various mutated c-kit receptors found in mast cell neoplasms

Author: Frédéric Féger, Sebastion Létard, Joelle Kersual, Michel Dy, Yael Zermati, Olivier Lortholary, Nathalie Casteran, Michel Arock, Olivier Hermine, Yann Bieche, Karim Dorgham, Paulo De Sepulveda, Patrice Dubreuil, Michel Vidaud, Antoni Ribadeau Dumas, Guy Gorochov, Christophe Parizot, Cytokines, hématopoïèse et réponse immune (CHRI), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux (ICMCB), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Université de Bordeaux (UB), Cancérologie (Inserm U599/IPC), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherches et d'Etudes sur le Monde Arabe et Musulman (IREMAM), Sciences Po Aix - Institut d'études politiques d'Aix-en-Provence (IEP Aix-en-Provence)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherche francais de Jérusalem (CRFJ), MIN AFF ETRANG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de génétique moléculaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-UPRES JE2195, Centre d'infectiologie Necker-Pasteur [CHU Necker], Institut Pasteur [Paris]-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée (LBPA), École normale supérieure - Cachan (ENS Cachan)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathologie et virologie moléculaire (PVM (UMR_7151)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de Recherches et d'Etudes sur les Mondes Arabes et Musulmans (IREMAM), Cytokines, hématopoïèse et réponse immune ( CHRI ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux ( ICMCB ), Université de Bordeaux ( UB ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Cancérologie, Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de Recherches et d'Etudes sur le Monde Arabe et Musulman ( IREMAM ), Sciences Po Aix - Institut d'études politiques d'Aix-en-Provence ( IEP Aix-en-Provence ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de recherche francais de Jérusalem ( CRFJ ), MIN AFF ETRANG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 ), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement ( IFR71 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL ( ENSCP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -UPRES JE2195, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Laboratoire de Biologie et de Pharmacologie Appliquée ( LBPA ), École normale supérieure - Cachan ( ENS Cachan ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Pathologie et virologie moléculaire ( PVM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire des sciences et matériaux pour l'électronique et d'automatique ( LASMEA ), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ministère de l'Europe et des Affaires étrangères (MEAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-UPRES JE2195, Institut Pasteur [Paris] (IP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-UPRES JE2195, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Pathologie et virologie moléculaire (PVM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Subjects: MESH : Cell Line, Cancer Research, MESH : Pyrimidines, MESH: Piperazines, MESH: Catalytic Domain, medicine.disease_cause, Piperazines, 0302 clinical medicine, MESH: Structure-Activity Relationship, Catalytic Domain, MESH : Structure-Activity Relationship, [ SDV.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology, Systemic mastocytosis, Enzyme Inhibitors, MESH: Mastocytosis, Systemic, 0303 health sciences, Mutation, Kinase, MESH : Catalytic Domain, MESH : Mastocytosis, Systemic, Protein-Tyrosine Kinases, Mast cell, 3. Good health, MESH: Proto-Oncogene Proteins c-kit, MESH : Antineoplastic Agents, Proto-Oncogene Proteins c-kit, medicine.anatomical_structure, MESH: Enzyme Inhibitors, 030220 oncology & carcinogenesis, Benzamides, Imatinib Mesylate, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Signal transduction, Intracellular, Antineoplastic Agents, Biology, MESH: Protein-Tyrosine Kinases, MESH : Proto-Oncogene Proteins c-kit, Cell Line, 03 medical and health sciences, Structure-Activity Relationship, Mastocytosis, Systemic, MESH : Protein-Tyrosine Kinases, Genetics, medicine, Humans, Kinase activity, Molecular Biology, 030304 developmental biology, MESH : Enzyme Inhibitors, MESH: Humans, MESH : Humans, Wild type, medicine.disease, MESH: Cell Line, Pyrimidines, MESH: Pyrimidines, MESH : Piperazines, Cancer research, MESH: Antineoplastic Agents
Abstract: Systemic mastocytosis (SM) is a rare disease caused by an abnormal mast cell accumulation in various tissues. Two classes of constitutive activating c-kit mutations are found in SM. The most frequent class occurs in the catalytic pocket coding region with substitutions at codon 816 and the other in the intracellular juxtamembrane coding region. Therefore, kinase inhibitors that block mutated c-kit activity might be used as therapeutic agents in SM. Here, we show that STI571 inhibits both wild-type and juxtamembrane mutant c-kit kinase activity, but has no effect on the activity of the D816 V mutant. Accordingly, STI571 selectively decreases the survival of normal mast cell and of mast cell lines either with juxtamembrane c-kit mutations, but not that of tumoral mast cell from patient with SM or of mast cell lines with the D816 V mutation. Therefore, STI571 is not a good candidate to treat SM and specific kinase inhibitors should be designed to inhibit constitutive activating mutations at codon 816.
Published: 2003

18. CYP46A1 gene therapy deciphers the role of brain cholesterol metabolism in Huntington’s disease

Author: Antonin Lamaziere, Coline Mounier, Wilhelm Christaller, Sandrine Betuing, Peter Vanhoutte, Satish Sasidharan Nair, Jocelyne Caboche, Nicolas Heck, Radhia Kacher, Vincent Kappes, Nathalie Cartier, Valérie Messent, Gaëtan Despres, Elodie Perrin, Laurent Venance, Frédéric Saudou, Yulia Dembitskaya, Christian Neri, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Signalisation Neuronale et Régulations Géniques = Neuronal Signaling and Gene Regulation (NPS-02), Neurosciences Paris Seine (NPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neurobiologie des processus adaptatifs (NPA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Team Dynamic and Pathophysiology of Neuronal Networks, Center for Interdisciplinary Research in Biology (CIRB), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), [GIN] Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes (UGA), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Chaire Neuropharmacologie (INSERM U114), Collège de France (CdF (institution)), Régulations cellulaires et oncogenèse (RCO), Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Adaptation Biologique et Vieillissement = Biological Adaptation and Ageing (B2A), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuroscience Paris Seine (NPS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Collège de France (CdF)-PSL Research University (PSL), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Neurobiologie pharmacologique, Collège de France (CdF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Thérapie génique, Génomique et Epigénomique (U 1169), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Dynamics and Pathophysiology of neuronal networks, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Vanhoutte, Peter, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Chimie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Huntingtin, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, Tropomyosin receptor kinase B, Disease, Axonal Transport, Mice, 0302 clinical medicine, Neural Pathways, Medicine, Gene Knock-In Techniques, Cells, Cultured, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cerebral Cortex, Huntingtin Protein, Membrane Glycoproteins, Brain, Oxysterols, Dependovirus, Protein-Tyrosine Kinases, 3. Good health, Huntington Disease, Neuroprotective Agents, neuroprotection, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Proteasome Endopeptidase Complex, autophagy, Genetic Vectors, Mice, Transgenic, Endosomes, Protein Aggregation, Pathological, Neuroprotection, 03 medical and health sciences, Huntington's disease, mental disorders, Cholesterol 24-Hydroxylase, Animals, Humans, synaptic transmission, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Brain-derived neurotrophic factor, business.industry, Brain-Derived Neurotrophic Factor, Autophagy, cholesterol, Genetic Therapy, medicine.disease, Corpus Striatum, Mice, Inbred C57BL, 030104 developmental biology, Proteasome, Rotarod Performance Test, Neurology (clinical), business, transcriptome, Neuroscience, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Dysfunctions in brain cholesterol homeostasis have been extensively related to brain disorders. The main pathway for brain cholesterol elimination is its hydroxylation into 24S-hydroxycholesterol by the cholesterol 24-hydrolase, CYP46A1. Increasing evidence suggests that CYP46A1 has a role in the pathogenesis and progression of neurodegenerative disorders, and that increasing its levels in the brain is neuroprotective. However, the mechanisms underlying this neuroprotection remain to be fully understood. Huntington’s disease is a fatal autosomal dominant neurodegenerative disease caused by an abnormal CAG expansion in huntingtin’s gene. Among the multiple cellular and molecular dysfunctions caused by this mutation, altered brain cholesterol homeostasis has been described in patients and animal models as a critical event in Huntington’s disease. Here, we demonstrate that a gene therapy approach based on the delivery of CYP46A1, the rate-limiting enzyme for cholesterol degradation in the brain, has a long-lasting neuroprotective effect in Huntington’s disease and counteracts multiple detrimental effects of the mutated huntingtin. In zQ175 Huntington’s disease knock-in mice, CYP46A1 prevented neuronal dysfunctions and restored cholesterol homeostasis. These events were associated to a specific striatal transcriptomic signature that compensates for multiple mHTT-induced dysfunctions. We thus explored the mechanisms for these compensations and showed an improvement of synaptic activity and connectivity along with the stimulation of the proteasome and autophagy machineries, which participate to the clearance of mutant huntingtin (mHTT) aggregates. Furthermore, BDNF vesicle axonal transport and TrkB endosome trafficking were restored in a cellular model of Huntington’s disease. These results highlight the large-scale beneficial effect of restoring cholesterol homeostasis in neurodegenerative diseases and give new opportunities for developing innovative disease-modifying strategies in Huntington’s disease.
Published: 2019

19. Clonally Expanded T Cells Reveal Immunogenicity of Rhabdoid Tumors

Author: Sonia Lameiras, Pamela Caudana, Sylvain Baulande, Arnault Tauziède-Espariat, Nicolas Servant, Franck Bourdeaut, Amaury Leruste, Joshua J. Waterfall, Didier Surdez, Mamy Andrianteranagna, Stéphanie Puget, Sandrine Grossetête-Lalami, Eliane Piaggio, Christine Sedlik, Jimena Tosello, Mylène Bohec, Philippe Benaroch, Rodrigo Nalio Ramos, Celio Pouponnot, Jovan Nikolic, Julie Helft, Solene Brohard, Valeria Manriquez, Louise Galmiche, Leticia Laura Niborski, Olivier Delattre, Aurore Coulomb, Zhi-Yan Han, Céline Chauvin, Kevin Beccaria, Julien Masliah-Planchon, Wilfrid Richer, Unité de génétique et biologie des cancers (U830), Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre Hospitalier Sainte Anne [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Faculté de Médecine (UPD5 Médecine), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, Institut Curie [Paris]-MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Bioinformatique (CBIO), MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL), Centre de recherche Croissance et signalisation (UMR_S 845), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie [Paris], Signalisation normale et pathologique de l'embryon aux thérapies innovantes des cancers, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Pitié-Salpêtrière] (ACP), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Pathology Department [Paris], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Department of Gene and Cell Medicine [New York], Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] (MSSM), Immunité et cancer (U932), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), PRES Sorbonne Paris Cité, Immunité et cancer, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Génétique Somatique, This work was funded by the BMS and the Janssen Horizon Foundations, the Société Française des Cancers de l’Enfant (SFCE) with the associations 'Enfants et Santé' and 'L’Étoile de Martin,' INCA PL-BIO 2016 call for Project from the French Minister of Research, the 'Abigael,' 'ADAM,' 'Au Nom d’Andréa,' and 'Marabout de Ficelles' associations. RTOP team is supported by the SiRIC-Curie Program (grant INCa-DGOS-4654). INSERM U830 is supported by the Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Curie Institute and the Ligue Nationale Contre Le Cancer. TransImm team is supported by the SiRIC-Curie Program (grant INCa-DGOS-12554), the LabEx DCBIOL (ANR-10-IDEX-0001-02 PSL and ANR-11-LABX-0043), and the Center of Clinical Investigation (CIC IGR-Curie 1428). A.L. and P.C. were supported by the PhD program of Curie Institute., The authors thank S. Cairo, M. Chicard, J. Denizeau, C. Goudot, P. Gueguen, I. Jimenez, N. Manel, A. Pinto, S. Viel, S. Zaidi, and the mouse and the cytometry facility cores at Curie Institute., Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cancer et génôme: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MINES ParisTech - École nationale supérieure des mines de Paris-PSL Research University (PSL), PSL Research University (PSL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie, Signalisation normale et pathologique de l'embryon aux thérapies innovante des cancers, Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'anatomie pathologique [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), and Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, Chromosomal Proteins, Non-Histone, medicine.medical_treatment, T-Lymphocytes, [SDV]Life Sciences [q-bio], SMARCB1, Mice, Transgenic, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, single-cell RNA sequencing, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Immune system, endogenous retrovirus, medicine, Animals, Humans, tumor immunology, AT/RT, rhabdoid tumor, Immunogenicity, T-cell receptor, Nuclear Proteins, Cell Biology, Immunotherapy, Chromatin Assembly and Disassembly, Pediatric cancer, Immunohistochemistry, SWI/SNF, 3. Good health, Chromatin, pediatric cancer, DNA-Binding Proteins, Mice, Inbred C57BL, 030104 developmental biology, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Mutation, Cancer research, immunotherapy, T cell receptor, CD8, Transcription Factors
Abstract: International audience; Rhabdoid tumors (RTs) are genomically simple pediatric cancers driven by the biallelic inactivation of SMARCB1, leading to SWI/SNF chromatin remodeler complex deficiency. Comprehensive evaluation of the immune infiltrates of human and mice RTs, including immunohistochemistry, bulk RNA sequencing and DNA methylation profiling studies showed a high rate of tumors infiltrated by T and myeloid cells. Single-cell RNA (scRNA) and T cell receptor sequencing highlighted the heterogeneity of these cells and revealed therapeutically targetable exhausted effector and clonally expanded tissue resident memory CD8+ T subpopulations, likely representing tumor-specific cells. Checkpoint blockade therapy in an experimental RT model induced the regression of established tumors and durable immune responses. Finally, we show that one mechanism mediating RTs immunogenicity involves SMARCB1-dependent re-expression of endogenous retroviruses and interferon-signaling activation.
Published: 2019

20. Familial predisposition to TP53/complex karyotype MDS and leukemia in DNA repair-deficient xeroderma pigmentosum

Author: Nathalie Droin, Alain Sarasin, Jean-Luc Schmutz, Stéphane de Botton, Samuel Quentin, Anna Raimbault, Filippo Rosselli, Alain Taieb, Véronique Saada, Vahid Asnafi, Jean Soulier, Yannick Boursin, Philippe Dessen, Patricia Kannouche, Thierry Leblanc, Nathalie Auger, Caroline Robert, Flore Sicre de Fontbrune, Mourad Sahbatou, Laurianne Drieu La Rochelle, Marie Sebert, Carlos Frederico Martins Menck, Eric Solary, Génomes et cancer (GC (FRE2939)), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bourgogne (UB), Fondation Jean Dausset CEPH, Laboratory of Hematology, Gustave Roussy, Villejuif, Praxiling (Praxiling), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM), Plateforme de Bioinformatique [Gustave Roussy], Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hématopoïèse normale et pathologique (U1170 Inserm), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Service de Dermatologie et Allergologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Universidade de Sao Paulo, Institute of Biomedical Sciences, Universidade de São Paulo (USP)-Institute of Biomedical Sciences (ICB/USP), Universidade de São Paulo (USP), Stabilité Génétique et Oncogenèse (UMR 8200), Hematopoïèse et Cellules Souches (U362), Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Louis, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service d'hématologie et immunologie pédiatrique, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Robert Debré-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut Gustave Roussy (IGR), Radiothérapie moléculaire (UMR 1030), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), 3UMR728 INSERM Unité d'immuno-hématologie (UIH) and laboratoire d'hématologie, Hôpital St-Louis, AP-HP, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité d'Hémato-Immunologie pédiatrique [Hôpital Robert Debré, Paris], Service d'Immuno-hématologie pédiatrique [Hôpital Robert Debré, Paris], Hôpital Robert Debré-Hôpital Robert Debré, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Praxiling UMR 5267 (Praxiling), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), and Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Robert Debré-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)
Subjects: 0301 basic medicine, Xeroderma pigmentosum, DNA repair, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, medicine.disease_cause, Biochemistry, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Complex Karyotype, Familial predisposition, medicine, Letter to Blood, Gene, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Genetics, Mutation, business.industry, Cell Biology, Hematology, medicine.disease, 3. Good health, Leukemia, 030104 developmental biology, 030220 oncology & carcinogenesis, business, Founder effect
Abstract: There is a Blood Commentary on this article in this issue.
Published: 2019

21. SHH medulloblastoma in a young adult with a TCF4 germline pathogenic variation

Author: Lydie Burglen, Olivier Ayrault, Irina Giurgea, Maud Blanluet, Franck Bielle, François Doz, David Gentien, Audrey Rapinat, Julien Masliah-Planchon, Olivier Delattre, Badreddine Mohand Oumoussa, Diane Doummar, Gaëlle Pierron, Christine Bourneix, Stéphane Clemenceau, Elodie Girard, Franck Bourdeaut, Celio Pouponnot, Mamy Andrianteranagna, UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire de Neuropathologie Raymond Escourolle, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Sorbonne Université (SU), École supérieure du professorat et de l'éducation - Académie de Grenoble (ESPE Grenoble), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de neurogénétique moléculaire, CHU Trousseau [APHP], Service: neuropédiatrie pathologie du développement, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Signalisation cellulaire et neurobiologie (SNC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Signalisation normale et pathologique de l'embryon aux thérapies innovante des cancers, Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de recherche translationnelle, Institut Curie, Service de Génétique Oncologique, Unité de génétique et biologie des cancers (U830), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Génétique Somatique, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique (UMRS_933), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Neuropathologie [CHU Pitié Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Grenoble Alpes - École supérieure du professorat et de l'éducation - Académie de Grenoble (UGA ESPE Grenoble), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], UMS omique (OMIQUE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Plateforme Post-génomique de la Pitié-Salpêtrière (P3S), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Signalisation normale et pathologique de l'embryon aux thérapies innovantes des cancers, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Curie [Paris], Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Maladies génétiques d'expression pédiatrique (U933), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Trousseau [APHP], and Département de Recherche Translationnelle
Subjects: Medulloblastoma, 0303 health sciences, Pathology, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, TCF4, Biology, medicine.disease, Germline, Pathology and Forensic Medicine, 03 medical and health sciences, Cellular and Molecular Neuroscience, 0302 clinical medicine, Variation (linguistics), medicine, Neurology (clinical), Young adult, 030217 neurology & neurosurgery, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract: International audience
Published: 2019

22. UMD-MEN1 database: an overview of the 370 MEN1 variants present in 1,676 patients from the French population

Author: Pierre Goudet, Alain Calender, Pauline Romanet, Marie-Françoise Odou, Anne Barlier, Celine Guien, Lucie Coppin, Marie-Odile North, Françoise Borson-Chazot, Christophe Béroud, Eric Pasmant, Amira Mohamed, S. Giraud, Morgane Pertuit, Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Laboratoire de Génétique, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de biologie pathologie [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 (JPArc), Université Lille Nord de France (COMUE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de médecine nucléaire, Groupement Hospitalier Lyon-Est (GHE), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Fédération d'endocrinologie, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), CHU Cochin [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche Jean-Pierre Aubert-Neurosciences et Cancer, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Fédération d'endocrinologie-Groupement hospitalier Lyon-Est, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille
Subjects: 0301 basic medicine, Male, endocrine system diseases, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Penetrance, computer.software_genre, Biochemistry, French population, 0302 clinical medicine, Endocrinology, Multiple endocrine neoplasia, Child, Databases, Protein, Aged, 80 and over, education.field_of_study, medicine.diagnostic_test, Database, Hyperparathyroidism, Multiple Endocrine Neoplasia, Age Factors, Autosomal dominant trait, Middle Aged, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, Child, Preschool, Female, Mutation Analysis, France, Neuroendocrine tumors, Adult, endocrine system, Adolescent, Genotype, Genetic counseling, Population, 030209 endocrinology & metabolism, Context (language use), 03 medical and health sciences, Young Adult, Proto-Oncogene Proteins, medicine, Multiple Endocrine Neoplasia Type 1, Humans, Genetic Testing, education, Genetic testing, Aged, business.industry, Biochemistry (medical), Infant, Newborn, Infant, Odds ratio, medicine.disease, 030104 developmental biology, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Mutation, business, computer
Abstract: Context Multiple endocrine neoplasia type 1 (MEN1) is an autosomal dominant disease caused by mutations in the MEN1 gene characterized by a broad spectrum of clinical manifestations, of which the most frequent are primary hyperparathyroidism, pituitary adenomas, and neuroendocrine tumors. Objective The aim of this work was to facilitate interpretation of variants and improve the genetic counseling and medical care of families of patients with MEN1. Design, Setting, and Patients The TENGEN network (Oncogenetics Network of Neuroendocrine Tumors) has interpreted and collected all allelic variants and clinical characteristics of the MEN1-positive patients identified through genetic testing performed in the French population from 1997 to 2015. Patients and their variants were registered in the locus-specific UMD-MEN1 database (www.umd.be/MEN1/). Main Outcomes Variant classification, age-related penetrance, and odds ratios. Results A total of 370 distinct variants reported in 1676 patients, including 181 unpublished variants, have been registered. This database analysis revealed a low frequency (6.6%) of benign or likely benign missense variants in MEN1. Eight families (1.9%) had members with familial isolated hyperparathyroidism and harbored the same mutations as that found in families with authentic MEN1. An association existed between large rearrangements and an earlier onset of the disease, whereas no difference was observed between truncating and nontruncating variants. Conclusion The UMD-MEN1 database provides an exhaustive overview of the MEN1 variants present in the French population. For each variant, a classification is publicly available. Clinical data collections allow the determination of genotype-phenotype correlation and age-related penetrance of lesions in the cohort.
Published: 2019

23. Active cell migration is critical for steady-state epithelial turnover in the gut

Author: Denis Krndija, Olivier Leroy, Sophie Richon, Yohanns Bellaïche, Fatima El Marjou, Danijela Matic Vignjevic, Edouard Hannezo, Boris Guirao, Bellaiche, Yohanns, Génétique et Biologie du Développement, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Polarity Division and Morphogenesis, Institut Curie, CNRS UMR 3215, INSERM U934, 75248 Paris Cedex 05, France, Cavendish Laboratory, University of Cambridge [UK] (CAM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Guirao, Boris
Subjects: Tissue imaging, Cell, Mitosis, Models, Biological, Actin-Related Protein 2-3 Complex, 03 medical and health sciences, Basal (phylogenetics), 0302 clinical medicine, Imaging, Three-Dimensional, Cell Movement, Cell polarity, [SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, medicine, Animals, Intestinal Mucosa, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, 030304 developmental biology, Mice, Knockout, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Chemistry, Cell Polarity, Cell migration, Cell biology, medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, Active cell, Steady state (chemistry)
Abstract: Active migration renews gut epithelia Epithelial tissues are continuously renewed throughout adult life, and the gut epithelium is the fastest self-renewing tissue in mammals. Over 3 days or so, epithelial cells migrate from the crypts, where they are born, to the tips of the villi, where they die. It is commonly believed that migration is strictly passive, driven by mitotic pressure in crypts—as cells divide, they push their neighbors upward. Krndija et al. now challenge this concept and show that cells migrate actively, using actin-rich basal protrusions oriented in the direction of migration (see the Perspective by Jansen). Science , this issue p. 705 ; see also p. 642
Published: 2019

24. Detection and monitoring of circulating tumor DNA in adrenocortical carcinoma

Author: Mario Neou, Olivier Soubrane, Guillaume Assié, Lucie Orhant, Juliana Pipoli da Fonseca, Franck Letourneur, Jérôme Bertherat, Anne Jouinot, Eric Pasmant, Lionel Groussin, Rossella Libé, Bertrand Dousset, Juliette Nectoux, Karine Perlemoine, Léopoldine Bricaire, Simon Garinet, Mathilde Sibony, Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Biochimie et biologie moléculaire, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de chirurgie hepato-pancreato-biliaire, Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut Cochin (UMR_S567 / UMR 8104), and Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Male, Cancer Research, Sequence analysis, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Circulating Tumor DNA, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Endocrinology, X ray computed, Adrenocortical Carcinoma, Medicine, Adrenocortical carcinoma, Humans, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Aged, 80 and over, business.industry, Sequence Analysis, DNA, Middle Aged, medicine.disease, Adrenal Cortex Neoplasms, 030104 developmental biology, Oncology, chemistry, Circulating tumor DNA, Cancer research, Female, business, Tomography, X-Ray Computed, DNA
Abstract: International audience
Published: 2018

25. Long Noncoding RNAs as New Architects in Cancer Epigenetics, Prognostic Biomarkers, and Potential Therapeutic Targets

Author: Ivan Bièche, Antonin Morillon, Didier Meseure, Kinan Drak Alsibai, André Nicolas, Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer (DIG CANCER), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie des Tumeurs, Institut Curie, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Platform of Investigative Pathology, Institut Curie [Paris], Department of Pharmacogenomics, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)
Subjects: Microarray, lcsh:Medicine, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Review Article, Biology, medicine.disease_cause, Interactome, Genome, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Epigenesis, Genetic, Neoplasms, Biomarkers, Tumor, medicine, Animals, Humans, RNA, Neoplasm, Cancer epigenetics, Epigenetics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Genetics, Massive parallel sequencing, General Immunology and Microbiology, lcsh:R, Alternative splicing, General Medicine, Prognosis, Gene Expression Regulation, Neoplastic, RNA, Long Noncoding, Carcinogenesis
Abstract: International audience; Recent advances in genome-wide analysis have revealed that 66% of the genome is actively transcribed into noncoding RNAs (ncRNAs) while less than 2% of the sequences encode proteins. Among ncRNAs, high-resolution microarray and massively parallel sequencing technologies have identified long ncRNAs (>200 nucleotides) that lack coding protein function. LncRNAs abundance, nuclear location, and diversity allow them to create in association with protein interactome, a complex regulatory network orchestrating cellular phenotypic plasticity via modulation of all levels of protein-coding gene expression. Whereas lncRNAs biological functions and mechanisms of action are still not fully understood, accumulating data suggest that lncRNAs deregulation is pivotal in cancer initiation and progression and metastatic spread through various mechanisms, including epigenetic effectors, alternative splicing, and microRNA-like molecules. Mounting data suggest that several lncRNAs expression profiles in malignant tumors are associated with prognosis and they can be detected in biological fluids. In this review, we will briefly discuss characteristics and functions of lncRNAs, their role in carcinogenesis, and their potential usefulness as diagnosis and prognosis biomarkers and novel therapeutic targets.
Published: 2015

26. Cytidine Deaminase Deficiency Reveals New Therapeutic Opportunities against Cancer

Author: Sudhir Varma, Hamza Mameri, Géraldine Buhagiar-Labarchède, André Nicolas, Didier Meseure, Sophie Vacher, Vinodh N. Rajapakse, Ivan Bièche, Rosine Onclercq-Delic, William C. Reinhold, Elisabetta Marangoni, Yves Pommier, Mounira Amor-Guéret, Intégrité du génome, ARN et cancer, Institut Curie [Paris]-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer (DIG CANCER), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Recherche Translationnelle, Institut Curie [Paris], Stress génotoxiques et cancer, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie des Tumeurs, Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin-Institut Curie [Paris], Laboratory of Molecular Pharmacology, National Institutes of Health [Bethesda] (NIH)-National Cancer Institute [Bethesda] (NCI-NIH), National Institutes of Health [Bethesda] (NIH), Institut Curie, PSL Research University, CNRS UMR3348, Orsay, France, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Genetic Department, Institut de l'élevage (IDELE), Platform of Investigative Pathology, Translational Research Department, Institut Curie, National Institutes of Health, Recherches Avicoles (SRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and CRLCC René Huguenin-Institut Curie
Subjects: 0301 basic medicine, Cancer Research, [SDV]Life Sciences [q-bio], Blotting, Western, Population, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Biology, Real-Time Polymerase Chain Reaction, Bioinformatics, Article, Mice, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Cell Line, Tumor, Cytidine Deaminase, Neoplasms, Biomarkers, Tumor, medicine, Animals, Humans, Epigenetics, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, education.field_of_study, Predictive marker, Cancer, Cytidine deaminase, medicine.disease, Immunohistochemistry, Xenograft Model Antitumor Assays, Primary tumor, 3. Good health, 030104 developmental biology, Oncology, Drug Resistance, Neoplasm, 030220 oncology & carcinogenesis, DNA methylation, Cancer cell, Cancer research, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Purpose: One of the main challenges in cancer therapy is the identification of molecular mechanisms mediating resistance or sensitivity to treatment. Cytidine deaminase (CDA) was reported to be downregulated in cells derived from patients with Bloom syndrome, a genetic disease associated with a strong predisposition to a wide range of cancers. The purpose of this study was to determine whether CDA deficiency could be associated with tumors from the general population and could constitute a predictive marker of susceptibility to antitumor drugs. Experimental Design: We analyzed CDA expression in silico, in large datasets for cancer cell lines and tumors and in various cancer cell lines and primary tumor tissues using IHC, PDXs, qRT-PCR, and Western blotting. We also studied the mechanism underlying CDA silencing and searched for molecules that might target specifically CDA-deficient tumor cells using in silico analysis coupled to classical cellular experimental approaches. Results: We found that CDA expression is downregulated in about 60% of cancer cells and tissues. We demonstrate that DNA methylation is a prevalent mechanism of CDA silencing in tumors. Finally, we show that CDA-deficient tumor cells can be specifically targeted with epigenetic treatments and with the anticancer drug aminoflavone. Conclusions: CDA expression status identifies new subgroups of cancers, and CDA deficiency appears to be a novel and relevant predictive marker of susceptibility to antitumor drugs, opening up new possibilities for treating cancer. Clin Cancer Res; 23(8); 2116–26. ©2016 AACR.
Published: 2017

27. Chronic hepatitis E virus infection in a cirrhotic patient

Author: Barrague, Hugo, Condat, Bertrand, Petitdidier, Nicolas, Champagne, Eric, Renou, Christophe, Izopet, Jacques, Abravanel, Florence, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hepatology, Hopital, Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Laboratoire de Virologie [CHU Purpan, Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, Enzyme-Linked Immunospot Assay, viruses, cirrhosis, [SDV]Life Sciences [q-bio], virus diseases, hepatitis E virus, Middle Aged, chronic infection, Antiviral Agents, [SDV.IMM.II]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Innate immunity, digestive system diseases, Hepatitis E, Interferon-gamma, Ribavirin, Humans, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Clinical Case Report, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Research Article, Hepatitis, Chronic
Abstract: Rationale: Acute hepatitis E virus (HEV) infections are usually self-limiting in immunocompetent patients. HEV persistence has been described only in immunosuppressed patients such as solid-organ transplant recipients, patients with hematological diseases, or patients with human immunodeficiency virus (HIV) infection. Patient concerns: A 61-year-old patient was admitted in hospital for jaundice and asthenia. Diagnoses: The patient had underlying cirrhosis and developed a chronic HEV infection. Intervention: Ribavirin therapy was initiated. Outcomes: Ribavirin therapy for 12 months allowed the clearance of the virus and HEV viral load remained undetectable thereafter. This patient had taken no immunosuppressive drugs, was not suffering from any autoimmune disease and was not infected with HIV. We studied the patient's anti-HEV immune response months after the viral clearance. His peripheral blood mononuclear cells (PBMC) were stimulated in vitro by HEV peptides. The patient had a mild T lymphopenia, but polyclonal stimulation of PBMC showed a robust T cell response. The response of his anti-HEV specific interferon-γ producing T cells was low. Lessons: Other studies are now needed to identify the population with a chronic evolution of HEV infection despite no apparent immunodepression.
Published: 2017

28. CAG repeat size in Huntingtin alleles is associated with cancer prognosis

Author: Cécile Cazeneuve, Olga M. Sinilnikova, Dominique Stoppa-Lyonnet, Ivan Bièche, Sophie Vacher, Valérie Sornin, Jean-Louis Golmard, Sophie Tezenas du Montcel, Laure Barjhoux, Morgane Sonia Thion, Alexandra Durr, Sandrine Humbert, Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modeling in Clinical Research (ER4), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Département de Biostatistiques [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin-Institut Curie [Paris], Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Léon Bérard [Lyon], Université Paris sciences et lettres (PSL), THION, Morgane Sonia, Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris
Subjects: 0301 basic medicine, Oncology, Adult, medicine.medical_specialty, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, Heterozygote, Huntingtin, Receptor, ErbB-2, [SDV]Life Sciences [q-bio], Breast Neoplasms, Disease, Biology, Bioinformatics, Article, Metastasis, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Breast cancer, Trinucleotide Repeats, Internal medicine, mental disorders, Genetics, medicine, Biomarkers, Tumor, Humans, Allele, skin and connective tissue diseases, Genetics (clinical), Alleles, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, BRCA2 Protein, Huntingtin Protein, BRCA1 Protein, Cancer, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, nervous system diseases, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Medical genetics, Female, Ovarian cancer, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: The abnormal expansion of a ≥36 CAG unit tract in the Huntingtin gene (HTT) leads to Huntington's disease (HD), but has also been associated with cancer: the incidence of cancer is lower in HD patients than in age-matched controls, but HD-causing variants of HTT accelerate the progression of breast tumors and the development of metastases in mouse models of breast cancer. To investigate the relationship between HTT CAGs and cancer, data concerning 2407 women with BRCA1 or BRCA2 mutations that predispose to breast and ovarian cancers and 431 patients with breast cancer without family histories were studied; the size of the CAG expansions on both HTT alleles was determined in each subject. The proportion of individuals carrying a CAG expansion in a pathological range for HD was 10 times more frequent than previously reported in the literature. In carriers of BRCA2 mutations, the length of the HTT CAG tract was correlated with lower incidence of ovarian cancer. Among carriers of BRCA1 mutations who developed a breast cancer, its onset occurred 2.4 years earlier in individuals with intermediate HTT alleles (≥27) than in those with a CAG tract
Published: 2016

29. Prognostic value of a newly identified MALAT1 alternatively spliced transcript in breast cancer

Author: Ivan Bièche, Didier Meseure, Kinan Drak Alsibai, Rosette Lidereau, Sophie Vacher, Leanne De Koning, François Lallemand, Rana Hatem, André Nicolas, Eric Pasmant, Céline Callens, Antonin Morillon, Walid Chemlali, Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer (DIG CANCER), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Oncogénétique, CRLCC René Huguenin-Institut Curie [Paris], Genetique Moleculaire des Cancers d'Origine Epitheliale, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Platform of Investigative Pathology, Institut Curie [Paris], Biologie des Tumeurs, Compartimentation et dynamique cellulaires (CDC), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cytokines, hématopoïèse et réponse immune (CHRI), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique moléculaire des cancers d'origine épithéliale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CRLCC René Huguenin-Institut Curie, Institut Curie-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Curie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Curie-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut Curie-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Adult, Epigenomics, Cancer Research, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, 03 medical and health sciences, Breast cancer, breast cancer, medicine, Humans, prognostic value, Epigenetics, RNA, Messenger, MALAT1, Molecular Diagnostics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Cell Proliferation, Aged, 80 and over, Cell growth, Alternative splicing, Cancer, RNA, Middle Aged, medicine.disease, Prognosis, Molecular biology, 3. Good health, Alternative Splicing, 030104 developmental biology, alternatively spliced transcript, Oncology, Female, RNA, Long Noncoding, signalling pathways
Abstract: Background: Epigenetic deregulation is considered as a new hallmark of cancer. The long non-coding RNA MALAT1 has been implicated in several cancers; however, its role in breast cancer is still little known. Methods: We used RT–PCR, in situ hybridisation, and RPPA methods to quantify (i) the full-length (FL) and an alternatively spliced variant (Δsv) of MALAT1, and (ii) a panel of transcripts and proteins involved in MALAT1 pathways, in a large series of breast tumours from patients with known clinical/pathological status and long-term outcome. Results: MALAT1 was overexpressed in 14% (63/446) of the breast tumours. MALAT1-overexpressed tumour epithelial cells showed marked diffuse nuclear signals and numerous huge nuclear speckles. Screening of the dbEST database led to the identification of Δsv-MALAT1, a major alternatively spliced MALAT1 transcript, with a very different expression pattern compared with FL-MALAT1. This alternative Δsv-MALAT1 transcript was mainly underexpressed (18.8%) in our breast tumour series. Multivariate analysis showed that alternative Δsv-MALAT1 transcript is an independent prognostic factor. Δsv-MALAT1 expression was associated with alterations of the pre-mRNAs alternative splicing machinery, and of the Drosha-DGCR8 complex required for non-coding RNA biogenesis. Alternative Δsv-MALAT1 transcript expression was associated to YAP protein status and with an activation of the PI3K-AKT pathway. Conclusions: Our results reveal a complex expression pattern of various MALAT1 transcript variants in breast tumours, and suggest that this pattern of expressions should be taken into account to evaluate MALAT1 as predictive biomarker and therapeutic target.
Published: 2016

30. Rett networked database: An integrated clinical and genetic network of rett syndrome databases

Author: Francesca Cogliati, Edvige Veneselli, Elisa Grillo, Kirstine Ravn, Mercedes Pineda, Thierry Bienvenu, Ana Roche-Martínez, Laurent Villard, Angus John Clarke, Vlatka Mejaški Bošnjak, Maria Pintaudi, Giorgio Pini, Milena Djuric, Silvia Russo, Judith Armstrong, Aglaia Vignoli, Béla Melegh, Nadia Bahi-Buisson, Anne-Marie Bisgaard, Anna Hryniewiecka-Jaworska, Francesca Mari, Dana Craiu, Alessandra Renieri, Bruria Ben Zeev, Noémi Polgár, Aleksandra Djukic, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Neuropédiatrie, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Medical Genetics, IRCCS Istituto Auxologico Italiano, Kennedy Center, Department of Medical Genetics and Child Development, University of Pecs, University of Medicine and Pharmacy 'Carol Davila' Bucharest (UMPCD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), university of Pécs, and Carol Davila university of Medicine and Pharmacy of Bucharest
Subjects: Methyl-CpG-Binding Protein 2, [SDV]Life Sciences [q-bio], CDKL5, Rett syndrome, Biology, computer.software_genre, Bioinformatics, MECP2, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Neurodevelopmental disorder, Genotype-phenotype distinction, Databases, Genetic, Rett Syndrome, Genetics, medicine, Humans, Rett Networked Database, FOXG1, Genetics (clinical), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Database, medicine.disease, 3. Good health, Clinical trial, Mutation, Mutation (genetic algorithm), [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], computer, 030217 neurology & neurosurgery, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Rett syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder with one principal phenotype and several distinct, atypical variants (Zappella, early seizure onset and congenital variants). Mutations in MECP2 are found in most cases of classic RTT but at least two additional genes, CDKL5 and FOXG1, can underlie some (usually variant) cases. There is only limited correlation between genotype and phenotype. The Rett Networked Database (http://www.rettdatabasenetwork.org/) has been established to share clinical and genetic information. Through an “adaptor” process of data harmonization, a set of 293 clinical items and 16 genetic items was generated ; 62 clinical and 7 genetic items constitute the core dataset ; 23 clinical items contain longitudinal information. The database contains information on 1838 patients from 11 countries (December 2011), with or without mutations in known genes. These numbers can expand indefinitely. Data are entered by a clinician in each center who supervises accuracy. This network was constructed to make available pooled international data for the study of RTT natural history and genotype–phenotype correlation and to indicate the proportion of patients with specific clinical features and mutations. We expect that the network will serve for the recruitment of patients into clinical trials and for developing quality measures to drive up standards of medical management.
Published: 2012

31. First description of ABCB4 gene deletions in familial low phospholipid-associated cholelithiasis and oral contraceptives-induced cholestasis

Author: Philippe Ponsot, Ingrid Laurendeau, Béatrice Parfait, Eric Pasmant, Yann Consigny, Jian-Min Chen, Olivier Farges, Michel Vidaud, Samuel Quentin, Bertrand Condat, Dominique Vidaud, P Goussard, Laetitia Baranes, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, ATP Binding Cassette Transporter, Subfamily B, Cholestasis, Intrahepatic, Gallbladder Diseases, Gene dosage, Gastroenterology, Article, Biliary disease, Young Adult, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Cholestasis, Cholelithiasis, Internal medicine, Genotype, Genetics, Humans, Medicine, LPAC, Genotyping, Genetics (clinical), 030304 developmental biology, Comparative Genomic Hybridization, 0303 health sciences, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Base Sequence, business.industry, Progressive familial intrahepatic cholestasis, Syndrome, ABCB4, Middle Aged, medicine.disease, Pedigree, 3. Good health, Pregnancy Complications, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, business, Chromosomes, Human, Pair 7, Gene Deletion, Cholestasis of pregnancy, Contraceptives, Oral
Abstract: International audience; The wide clinical spectrum of the ABCB4 gene (ATP-binding cassette subfamily B member 4) deficiency syndromes in humans includes low phospholipid-associated cholelithiasis (LPAC), intrahepatic cholestasis of pregnancy (ICP), oral contraceptives-induced cholestasis (CIC) and progressive familial intrahepatic cholestasis type 3 (PFIC3). No ABCB4 mutations are found in a significant proportion of patients with these syndromes. In the present study, 102 unrelated adult patients with LPAC (43 patients) or CIC/ICP (59 patients) were screened for ABCB4 mutations using DNA sequencing. Heterozygous ABCB4 point or short insertion/deletion mutations were found in 37% (16/43) of LPAC patients and in 27% (16/59) of ICP/CIC patients. High resolution gene dosage methodologies were used in the 70 negative patients. Here, we describe for the first time ABCB4 partial or complete heterozygous deletions in 7% (3/43) of LPAC patients, and in 2% (1/59) of ICP/CIC patients. Our observations urge to systematically test patients with LPAC, ICP/CIC, and also children with PFIC3 for the presence of ABCB4 deletions using molecular tools allowing detection of gross rearrangements. In clinical practice, a comprehensive ABCB4 alteration screening algorithm will permit the use of ABCB4 genotyping to confirm the diagnosis of LPAC or ICP/CIC, and allow familial testing. An early diagnosis of these biliary diseases may be beneficial because of the preventive effect of ursodeoxycholic acid on biliary complications. Further comparative studies of patients with well-characterized genotypes (including deletions) and phenotypes will help determine whether ABCB4 mutation types influence clinical outcomes.
Published: 2011

32. Expression analysis of mitotic spindle checkpoint genes in breast carcinoma: role of NDC80/HEC1 in early breast tumorigenicity, and a two-gene signature for aneuploidy

Author: Frédérique Spyratos, Hind Bennani, Keltouma Driouch, Ivan Bièche, Sophie Vacher, Géraldine Cizeron-Clairac, Etienne Rouleau, Hugues Ripoche, M. Beuzelin, Florence Lerebours, Sengul Tozlu-Kara, François Lallemand, Rosette Lidereau, Genetique Moleculaire des Cancers d'Origine Epitheliale, Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Stabilité Génétique et Oncogenèse (UMR 8200), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work was supported by Association pour la Recherche sur le Cancer, INCA (Institut National du Cancer), and Cancéropôle Ile-de-France., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - INSTITUT CURIE, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11) - Institut Gustave Roussy (IGR) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BMC, Ed., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Curie [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Cancer Research, Aneuploidy, 0302 clinical medicine, Chromosome instability, Breast, 0303 health sciences, Nuclear Proteins, DNA, Neoplasm, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, 3. Good health, Up-Regulation, Gene Expression Regulation, Neoplastic, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Disease Progression, Molecular Medicine, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Female, Breast carcinoma, Breast Neoplasms, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Spindle Apparatus, Biology, PLK1, lcsh:RC254-282, 03 medical and health sciences, Breast cancer, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Cell Line, Tumor, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Humans, Neoplasm Invasiveness, RNA, Messenger, 030304 developmental biology, Research, Gene Expression Profiling, Reproducibility of Results, Epithelial Cells, Gene signature, Fibroblasts, Mitotic spindle checkpoint, medicine.disease, Molecular biology, Diploidy, Gene expression profiling, Cytoskeletal Proteins, Precancerous Conditions, Genes, Neoplasm
Abstract: Background Aneuploidy and chromosomal instability (CIN) are common abnormalities in human cancer. Alterations of the mitotic spindle checkpoint are likely to contribute to these phenotypes, but little is known about somatic alterations of mitotic spindle checkpoint genes in breast cancer. Methods To obtain further insight into the molecular mechanisms underlying aneuploidy in breast cancer, we used real-time quantitative RT-PCR to quantify the mRNA expression of 76 selected mitotic spindle checkpoint genes in a large panel of breast tumor samples. Results The expression of 49 (64.5%) of the 76 genes was significantly dysregulated in breast tumors compared to normal breast tissues: 40 genes were upregulated and 9 were downregulated. Most of these changes in gene expression during malignant transformation were observed in epithelial cells. Alterations of nine of these genes, and particularly NDC80, were also detected in benign breast tumors, indicating that they may be involved in pre-neoplastic processes. We also identified a two-gene expression signature (PLK1 + AURKA) which discriminated between DNA aneuploid and DNA diploid breast tumor samples. Interestingly, some DNA tetraploid tumor samples failed to cluster with DNA aneuploid breast tumors. Conclusion This study confirms the importance of previously characterized genes and identifies novel candidate genes that could be activated for aneuploidy to occur. Further functional analyses are required to clearly confirm the role of these new identified genes in the molecular mechanisms involved in breast cancer aneuploidy. The novel genes identified here, and/or the two-gene expression signature, might serve as diagnostic or prognostic markers and form the basis for novel therapeutic strategies.
Published: 2011

33. Transarterial chemoembolisation: effect of selectivity on tolerance, tumour response and survival

Author: Valérie Vilgrain, Violaine Ozenne, Olivier Farges, Christophe Aubé, F. Thouveny, Jérôme Boursier, Antoine Bouvier, Marie Pierre Vullierme, Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Hôpital Lariboisière-Fernand-Widal [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche biomédicale Bichat-Beaujon (CRB3), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'imagerie, and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Beaujon [AP-HP]
Subjects: Male, Survival, Tumour response, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Contrast Media, Gastroenterology, 030218 nuclear medicine & medical imaging, Diagnostic Radiology, 0302 clinical medicine, Ethiodized Oil, Interventional Radiology, Selective technique, medicine.diagnostic_test, Imaging / Radiology, Biopsy, Needle, Liver Neoplasms, Interventional radiology, General Medicine, Prognosis, 3. Good health, Survival Rate, Treatment Outcome, Neuroradiology, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, Radiology, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Trans arterial chemoembolisation, Statistics, Nonparametric, 03 medical and health sciences, Text mining, Internal medicine, Triiodobenzoic Acids, Biopsy, Ultrasound, medicine, Carcinoma, Internal Medicine, Humans, Radiology, Nuclear Medicine and imaging, Chemoembolization, Therapeutic, Survival rate, Aged, Proportional Hazards Models, Retrospective Studies, Proportional hazards model, business.industry, Retrospective cohort study, medicine.disease, Surgery, Logistic Models, business, Tomography, X-Ray Computed, Tolerance
Abstract: International audience; Aims To compare selective and non-selective TACE techniques in the treatment of HCC with a special emphasis on clinical and liver tolerance, tumour response and survival. Methods 184 patients with advanced HCC were retrospectively included. Three different TACE techniques were compared: non selective lipiodol-chemotherapy + non selective embolisation (TACE-technique group 1), non selective lipiodol-chemotherapy + selective embolisation (group 2), and selective lipiodol-chemotherapy + selective embolisation (group 3). Results In multivariate analysis TACE-technique group is an independently significant prognostic factor for poor clinical tolerance, poor liver tolerance and tumour response. The rate of patients with poor clinical tolerance was lower in group 3 (27.0%) than in groups 1 (64.1%, p < 10−3) or 2 (66.7%, p < 10−3). The rate of patients with poor liver tolerance was higher in group 2 (34.0%) than in groups 1 (17.6%, p = 0.050) or 3 (6.9%, p = 0.011). The rate of patients with tumour response was higher when embolisation was selective versus non-selective, i.e., group 2 + 3 (78.7%) versus group 1 (62.5%, p = 0.054). Overall survival was not significantly different between the three groups (p = 0.383). Conclusion Both selective techniques resulted in better tumour response. As for improving tolerance, our study suggests that the main technical factor is the use of selective lipiodol-chemotherapy injection.
Published: 2011

34. Brain gene therapy for metachromatic leukodystrophy: towards clinical trial

Author: Piguet, F., Sondhi, D., Colle, Marie-Anne, Raoul, Solène, Roujeau, T., Piraud, M., Ahouansou, O., Bouquet, C., Vanier, M.T., Moullier, P., Cherel, Yan, Hackett, N.R, Zerah, M., Aubourg, P., Crystal, R.G., Cartier, N., Sevin, C., Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Cornell University [New York], Développement et Pathologie du Tissu Musculaire (DPTM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Nantes, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de Lyon, Métabolomique et maladies métaboliques, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Vecteurs viraux et transfert de gènes in vivo, Université de Nantes (UN)-IFR26-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and ProdInra, Migration
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], brain gene therapy, [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, metachromatic leukodystrophy
Abstract: International audience
Published: 2010

35. CD133, CD15/SSEA-1, CD34 or side populations do not resume tumor-initiating properties of long-term cultured cancer stem cells from human malignant glio-neuronal tumors

Author: Ivan Bièche, Vivaldo Moura-Neto, Jacques Haiech, Francois Renault-Mihara, Maria Mihalescu-Maingot, Cristina Patru, Pascale Varlet, Josette Cadusseau, Luciana Romão, Hervé Chneiweiss, Cécile Thirant, Alain Berhneim, Nadine Leonard, Eric Raponi, Catherine Daumas-Duport, Laure Coulombel, Marie-Pierre Junier, BMC, Ed., Institut de psychiatrie et neurosciences (U894 / UMS 1266), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Anatomy, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Service de neuropathologie, Centre Hospitalier Saint-Anne (GHU Paris), Grenoble Institut des Neurosciences (GIN), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Génomes et cancer (GC (FRE2939)), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Gilbert-Laustriat : Biomolécules, Biotechnologie, Innovation Thérapeutique, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was supported by Inserm and the following grants: ARC 3952 (HC), Ligue National contre le Cancer (La Ligue 2007, HC), Cancéropole (INCa/Région Ile de France) (CT), Cancer Stem Cell Network Ile de France (HC, MPJ)., Centre Hospitalier Saint-Anne, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Psychiatrie et Neurosciences (CPN - U894), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UFRJ, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF) - CHU Grenoble - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - IFR10 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11) - Institut Gustave Roussy (IGR) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre de Psychiatrie et Neurosciences (U894)
Subjects: Proteomics, Pathology, Cancer Research, CD34, MESH: Neurons, Antigens, CD34, MESH : Proteomics, MESH: Glioma, Mice, 0302 clinical medicine, Nude mouse, Medicine, MESH: Animals, AC133 Antigen, MESH: Antigens, CD, Neurons, 0303 health sciences, biology, Brain Neoplasms, MESH : Peptides, MESH: Peptides, MESH: Proteomics, MESH: Antigens, CD15, MESH : Mice, Nude, Glioma, MESH: Gene Expression Regulation, Neoplastic, Cell sorting, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, Gene Expression Regulation, Neoplastic, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, MESH: Brain Neoplasms, Neoplastic Stem Cells, MESH : Antigens, CD34, Stem cell, Research Article, medicine.medical_specialty, MESH: Cell Line, Tumor, MESH : Gene Expression Regulation, Neoplastic, MESH: Glycoproteins, Lewis X Antigen, Mice, Nude, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, CD15, lcsh:RC254-282, MESH : Neurons, 03 medical and health sciences, MESH : Neoplastic Stem Cells, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Cancer stem cell, Antigens, CD, Cell Line, Tumor, MESH : Mice, Genetics, MESH : Antigens, CD, MESH: Mice, Nude, Animals, Humans, MESH : Neoplasm Transplantation, MESH : Brain Neoplasms, MESH: Mice, 030304 developmental biology, Glycoproteins, Medulloblastoma, MESH: Humans, business.industry, MESH : Cell Line, Tumor, MESH : Humans, MESH: Antigens, CD34, medicine.disease, biology.organism_classification, MESH : Glycoproteins, MESH: Neoplastic Stem Cells, MESH : Antigens, CD15, MESH : Glioma, MESH : Animals, business, Peptides, Neoplasm Transplantation, MESH: Neoplasm Transplantation
Abstract: Background Tumor initiating cells (TICs) provide a new paradigm for developing original therapeutic strategies. Methods We screened for TICs in 47 human adult brain malignant tumors. Cells forming floating spheres in culture, and endowed with all of the features expected from tumor cells with stem-like properties were obtained from glioblastomas, medulloblastoma but not oligodendrogliomas. Results A long-term self-renewal capacity was particularly observed for cells of malignant glio-neuronal tumors (MGNTs). Cell sorting, karyotyping and proteomic analysis demonstrated cell stability throughout prolonged passages. Xenografts of fewer than 500 cells in Nude mouse brains induced a progressively growing tumor. CD133, CD15/LeX/Ssea-1, CD34 expressions, or exclusion of Hoechst dye occurred in subsets of cells forming spheres, but was not predictive of their capacity to form secondary spheres or tumors, or to resist high doses of temozolomide. Conclusions Our results further highlight the specificity of a subset of high-grade gliomas, MGNT. TICs derived from these tumors represent a new tool to screen for innovative therapies.
Published: 2010

36. Pentoxifylline Does Not Decrease Short-term Mortality but Does Reduce Complications in Patients With Advanced Cirrhosis

Author: Richard Moreau, Philippe Renard, Faouzi Saliba, Frédéric Oberti, Thierry Poynard, Perarnau Jm, Dominique Thabut, Nicolas Carbonell, Bertrand Condat, Didier Lebrec, Marie José Ramond, Hélène Barraud, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pathogénèse et traitement de l'hépatite fulminante et du cancer du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépatologie [Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Université de Neuchâtel (UNINE), U773 Centre de Recherche Biomédical Bichat-Beaujon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: Adult, Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Cirrhosis, Time Factors, [SDV]Life Sciences [q-bio], Administration, Oral, Kaplan-Meier Estimate, Placebo, Gastroenterology, Risk Assessment, Severity of Illness Index, law.invention, Pentoxifylline, 03 medical and health sciences, Liver disease, 0302 clinical medicine, Randomized controlled trial, Double-Blind Method, law, Risk Factors, Internal medicine, Severity of illness, medicine, Clinical endpoint, Humans, Renal Insufficiency, Hepatic encephalopathy, 030304 developmental biology, Aged, Proportional Hazards Models, 0303 health sciences, Hepatology, business.industry, Tumor Necrosis Factor-alpha, Bacterial Infections, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, Surgery, Treatment Outcome, Hepatic Encephalopathy, 030211 gastroenterology & hepatology, France, business, Gastrointestinal Hemorrhage, medicine.drug
Abstract: International audience; Background & AimsPentoxifylline, an inhibitor of tumor necrosis factor-α, is given to patients with liver diseases, but its effects in patients with advanced cirrhosis are unknown. We performed a randomized, placebo-controlled, double-blind trial of its effects in patients with cirrhosis. Methods A total of 335 patients with cirrhosis (Child–Pugh class C) were assigned to groups given either pentoxifylline (400 mg, orally, 3 times daily; n = 164) or placebo (n = 171) for 6 months. The primary end point was mortality at 2 months. Secondary end points were mortality at 6 months and development of liver-related complications. Results By 2 months, 28 patients in the pentoxifylline group (16.5%) and 31 in the placebo group (18.2%) had died (P = .84). At 6 months, 50 patients in the pentoxifylline group (30.0%) and 54 in the placebo group (31.5%) had died (P = .75). The proportions of patients without complications (eg, bacterial infection, renal insufficiency, hepatic encephalopathy, or gastrointestinal hemorrhage) were higher in the pentoxifylline group than in the placebo group at 2 months (78.6% vs 63.4%; P = .006) and 6 months (66.8% vs 49.7%; P = .002). The probability of survival without complications was higher in the pentoxifylline group than in the placebo group at 2 and 6 months (P = .04). In multivariate analysis, the factors associated with death were age, the Model for End-Stage Liver Disease score, and presence of early-stage carcinoma. Treatment with pentoxifylline was the only factor associated with liver-related complications. Conclusions Although pentoxifylline does not decrease short-term mortality in patients with advanced cirrhosis, it does reduce the risk of complications.
Published: 2010

37. MALDI reveals membrane lipid profile reversion in MDX mice

Author: Sabine De La Porte, Alain Brunelle, Hua Yu, Olivier Laprévote, Farida Benabdellah, Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de neurobiologie cellulaire et moléculaire (NBCM), Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF), Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Duchenne muscular dystrophy, Molsidomine, Tandem mass spectrometry, MALDI-MS, lcsh:RC321-571, Nitric oxide, Membrane Lipids, Mice, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Phosphatidylcholine, Utrophin, medicine, Animals, Regeneration, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Muscle, Skeletal, Myopathy, lcsh:Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, Chemistry, [CHIM.ORGA]Chemical Sciences/Organic chemistry, medicine.disease, Molecular biology, Mice, Inbred C57BL, Muscular Dystrophy, Duchenne, In situ profiling, Neurology, Biochemistry, Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization, Mice, Inbred mdx, Phosphatidylcholines, biology.protein, NO donor, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], medicine.symptom, Dystrophin, mdx, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: International audience; Duchenne muscular dystrophy (DMD), the most common and severe X-linked myopathy, is characterized by the lack of dystrophin, a sub-sarcolemmal protein necessary for normal muscle functions. In a previous study of the lipid content of skeletal muscles of dystrophic (mdx) mice, the animal model for DMD, by in situ Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization Mass Spectrometry (MALDI-MS), an inversion of the phosphatidylcholine PC34:2/PC34:1 ion peaks intensity ratio was observed between destructured (abnormal fiber morphology) and structured (normal fiber morphology). A possible treatment for this dramatic disease is to introduce an exogenous nitric oxide (NO) donor into the organism, leading to an increase of utrophin and a regression of the dystrophic phenotype. In the present work, after confirmation by tandem mass spectrometry of the structure of these two phospholipids, their intensity ratio inversion was used to evidence a restoration of membrane lipid composition very similar to those of wild-type mice after the treatment of mdx mice with molsidomine, a NO donor. This was associated with the observation by immunohistology of an increase of the regeneration process in the mice.
Published: 2009

38. Identification of the first intragenic deletion of the PITX2 gene causing an Axenfeld-Rieger Syndrome: case report

Author: Maurice Menasche, Jean-Louis Dufier, Hatem Zeghidi, Ivan Bièche, P. Rapp, Michel Vidaud, Guillaume de la Houssaye, Véronique Vieira, Marc Abitbol, Philippe Halimi, Ingrid Laurendeau, Laurence Arbogast, Olivier Roche, Autard, Delphine, Centre de recherche thérapeutique en ophtalmologie, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-EA2502, Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux (Inserm U745), Institut des sciences du Médicament -Toxicologie - Chimie - Environnement (IFR71), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'ophtalmologie [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de radiologie et d'imagerie médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - EA2502, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Institut de Recherche pour le Développement (IRD) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP] - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP)
Subjects: Male, Umbilicus (mollusc), DNA Mutational Analysis, MESH: Insulin-Like Growth Factor I, MESH: Cricetinae, Case Report, MESH: Insulin-Like Growth Factor Binding Proteins, 0302 clinical medicine, MESH: Cricetulus, Genetics(clinical), MESH: Animals, Eye Abnormalities, Genetics (clinical), Electrophoresis, Agar Gel, Genetics, 0303 health sciences, PITX2, Axenfeld-Rieger syndrome, Syndrome, Middle Aged, MESH: Chromatography, Affinity, Pedigree, Anterior Eye Segment, Female, Adult, lcsh:Internal medicine, medicine.medical_specialty, lcsh:QH426-470, MESH: Carrier Proteins, Biology, 03 medical and health sciences, medicine, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Humans, Abnormalities, Multiple, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, lcsh:RC31-1245, MESH: Chromatography, High Pressure Liquid, Gene, 030304 developmental biology, Family Health, Homeodomain Proteins, MESH: Humans, Base Sequence, Tooth Abnormalities, Cytogenetics, Optic Nerve, Human genetics, MESH: Cell Line, lcsh:Genetics, MESH: M, PITX2 Gene, 030221 ophthalmology & optometry, sense organs, MESH: Female, Gene Deletion, Transcription Factors, MESH: Electrophoresis, Polyacrylamide Gel
Abstract: Background Axenfeld-Rieger syndrome (ARS) is characterized by bilateral congenital abnormalities of the anterior segment of the eye associated with abnormalities of the teeth, midface, and umbilicus. Most cases of ARS are caused by mutations in the genes encoding PITX2 or FOXC1. Here we describe a family affected by a severe form of ARS. Case presentation Two members of this family (father and daughter) presented with typical ARS and developed severe glaucoma. The ocular phenotype was much more severe in the daughter than in the father. Magnetic resonance imaging (MRI) detected an aggressive form of meningioma in the father. There was no mutation in the PITX2 gene, determined by exon screening. We identified an intragenic deletion by quantitative genomic PCR analysis and characterized this deletion in detail. Conclusion Our findings implicate the first intragenic deletion of the PITX2 gene in the pathogenesis of a severe form of ARS in an affected family. This study stresses the importance of a systematic search for intragenic deletions in families affected by ARS and in sporadic cases for which no mutations in the exons or introns of PITX2 have been found. The molecular genetics of some ARS pedigrees should be re-examined with enzymes that can amplify medium and large genomic fragments.
Published: 2006

Catalog

Books, media, physical & digital resources

See catalog results

Searchworks

Select search scope, currently: Articles Catalog books, media & more in Jio Institute collections Articles journal articles & other e-resources

Search

Search Constraints

Refine your results

Search Limiters

Topic

Publication Year Range

Language

Journal

Database

Publisher

38 results on '"Genetique et Biotherapies des Maladies Degeneratives et Proliferatives du Systeme Nerveux ( Inserm U745 )"'

Search Results

Catalog

Select search scope, currently: Articles

Catalog

books, media & more in Jio Institute collections

Articles

journal articles & other e-resources