1. Laboratory-based surveillance for Cryptosporidium in France, 2006-2009
- Author
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D. Haouchine, Sandrine Houzé, Didier Basset, Adela Angoulvant, C. Chartier, Eric Dannaoui, Christine Aznar, Francis Derouin, Gabriela Certad, Frédéric Dalle, B. Degeilh, Jean-Marc Dewitte, Françoise Botterel, Marie-Laure Dardé, Chantal Duhamel, A. Berry, Marie-Elisabeth Bougnoux, M. Cambon, Patrice Agnamey, G. Belkadi, B. Couprie, Bernard Carme, Patrice Bourée, Pierre Buffet, Pascal Beaudeau, E. Dei Cas, Thanh Hai Duong, Alain Bonnin, Karine Guyot, Dominique Aubert, Frédéric Grenouillet, Pierre Flori, Jean Dupouy-Camet, Loïc Favennec, Gilles Gargala, N. Desbois, Nausicaa Gantois, Ml Grillot, Alexandra Faussart, Anofel Cryptosporidium National Network, Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses et tropicales [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Laboratoire Hospitalo-Universitaire de Parasitologie-Mycologie, Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles (UA), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Centre Hospitalier Universitaire Lapeyronnie, Département santé environnement, Institut de Veille Sanitaire (INVS), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de parasitologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Immunité et Infection, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Epidémiologie des parasitoses et mycoses tropicales, Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Européen Georges Pompidou, Assistance Publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre National de Référence (CNR) Toxoplasmose/Toxoplasma Biological Resource Center (BRC) (CNR Toxoplasmose-Toxoplasma BRC), CHU Limoges, Université de Limoges (UNILIM), Neuroépidémiologie Tropicale et Comparée (NETEC), Université de Limoges (UNILIM)-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Parasitologie-Mycologie Fort de France, CHU Fort de France, Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes (GIMAP), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (LCE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), The ANOFEL Cryptosporidium National Network (ACNN) is supported by a grant from InVS and ANOFEL. The genotyping was also supported financially by the French Ministry of Research (EA 3609)., We thank Nathalie Lelieur for providing useful assistance in data analysis, Anthony Pinon for his advice on statistics and Annie Sulahian for English revision of the manuscript., Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Université de Lille-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR113-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Centre d’Infection et d’Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 8204 ( CIIL ), Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Réseau International des Instituts Pasteur ( RIIP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR142-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Coordination Régionale de la lutte contre le Virus de L'Immunodéficience Humaine (COREVIH)-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Université des Antilles ( UA ), Institut de Veille Sanitaire, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 ( UPEC UP12 ), Hôpital Necker, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -IFR113-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université des Antilles et de la Guyane ( UAG ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre National de Référence (CNR) Toxoplasmose/Toxoplasma Biological Resource Center (BRC) ( CNR Toxoplasmose-Toxoplasma BRC ), Université de Limoges ( UNILIM ), Neuroépidémiologie Tropicale et Comparée ( NETEC ), Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST FR CNRS 3503 ) -Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Université de Limoges ( UNILIM ), Groupe Immunité des Muqueuses et Agents Pathogènes ( GIMAP ), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ), Appareil Digestif Environnement Nutrition ( ADEN ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Laboratoire Chrono-environnement ( LCE ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), and Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE)
- Subjects
Male ,Veterinary medicine ,MESH: Cryptosporidium ,Epidemiology ,MESH : Aged ,Cryptosporidiosis ,MESH : Child, Preschool ,0302 clinical medicine ,MESH: Aged, 80 and over ,MESH : Child ,MESH: Child ,Genotype ,MESH : Population Surveillance ,MESH : Female ,Child ,Aged, 80 and over ,MESH: Aged ,0303 health sciences ,MESH: Middle Aged ,Incidence (epidemiology) ,MESH: Infant, Newborn ,Cryptosporidium ,MESH : Infant ,[ SDV.SPEE ] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie ,Middle Aged ,MESH : Adult ,MESH: Infant ,3. Good health ,MESH : Cryptosporidium ,Canis ,MESH: Young Adult ,Child, Preschool ,Population Surveillance ,Female ,France ,Adult ,medicine.medical_specialty ,Adolescent ,MESH : Male ,MESH: Disease Notification ,030231 tropical medicine ,MESH : Young Adult ,Biology ,MESH : Infant, Newborn ,MESH: Population Surveillance ,Young Adult ,03 medical and health sciences ,Virology ,MESH : Adolescent ,medicine ,Humans ,MESH : Middle Aged ,MESH : France ,MESH : Aged, 80 and over ,MESH : Cryptosporidiosis ,Disease Notification ,Genotyping ,Aged ,030304 developmental biology ,MESH: Adolescent ,MESH: Humans ,Public health ,MESH : Humans ,MESH: Child, Preschool ,MESH: Cryptosporidiosis ,Infant, Newborn ,Public Health, Environmental and Occupational Health ,Infant ,MESH : Disease Notification ,MESH: Adult ,biology.organism_classification ,MESH: Male ,MESH: France ,Parasitology ,[SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie ,MESH: Female ,Demography - Abstract
International audience; In 2002, the French Food Safety Agency drew attention to the lack of information on the prevalence of human cryptosporidiosis in the country. Two years later, the ANOFEL Cryptosporidium National Network (ACNN) was set up to provide public health authorities with data on the incidence and epidemiology of human cryptosporidiosis in France. Constituted on a voluntary basis, ACNN includes 38 hospital parasitology laboratories (mainly in university hospitals). Each laboratory is engaged to notify new cases of confirmed human cryptosporidiosis, store specimens (e.g. stools, duodenal aspirates or biopsies) and related clinical and epidemiological data, using data sheet forms. From January 2006 to December 2009, 407 cryptosporidiosis cases were notified in France and 364 specimens were collected. Of the notified cases, 74 were children under four years of age, accounting for 18.2%. HIV-infected and immunocompetent patients represented 38.6% (n=157) and 28% (n=114) of cases, respectively. A marked seasonal pattern was observed each year, with increased number of cases in mid to late summer and the beginning of autumn. Genotyping of 345 isolates from 310 patients identified C. parvumin 168 (54.2%) cases, C. hominis in 113 (36.4%) and other species in 29 (9.4%), including C. felis (n=15), C. meleagridis (n=4), C. canis (n=4), Cryptosporidium chipmunk genotype (n=1), Cryptosporidium rabbit genotype (n=1) and new Cryptosporidium genotypes (n=4). These data represent the first multisite report of laboratory-confirmed cases of cryptosporidiosis in France.
- Published
- 2010
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