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Introduction L’appellation « tsiperifery » est un des noms vernaculaires des poivriers sauvages de Madagascar qui a été adopté pour son nom commercial sur le marché international. Les poivriers appartiennent au genre Piper (Piperaceae). La taxonomie de ce genre est souvent lacunaire et la dernière tentative de révision mondiale remonte au début du xxe siècle (De Candolle, 1923). Une récente étude basée sur des critères morphologiques a identifié quatre types morphologiques, ou morphotypes, de...

Dans un monde confronté aux changements climatiques et à des pandémies en lien avec la destruction des milieux naturels, les enjeux liés à la préservation de la biodiversité sont dorénavant bien connus et ont donné lieu à des accords internationaux majeurs, comme le protocole de Nagoya. Dans ce contexte mondial, les recherches menées au Sud sont primordiales. Les contributions rédigées ici par des chercheurs dʼAfrique, de lʼocéan Indien, dʼAsie du Sud-Est et dʼEurope traduisent la vigueur de la recherche sur la biodiversité dans les pays intertropicaux francophones. Documenter la diversité des écosystèmes végétaux locaux, mieux connaître les savoirs traditionnels et les utilisations populaires des plantes ou des champignons, valoriser le rôle des collections botaniques, identifier des chaînes de valorisation économique responsables, gérer durablement les écosystèmes et leurs ressources, élaborer des outils stratégiques pour une gouvernance environnementale basée sur la science et, enfin, montrer la nécessité de lʼimplication citoyenne et de lʼensemble des acteurs concernés, tels sont les grands thèmes déclinés ici. Cet ouvrage collectif intéressera tous ceux qui travaillent sur la biodiversité des écosystèmes intertropicaux. Il souligne la nécessité dʼune science de lʼaction au service du développement durable.

In this study we explore the performance of multi-trait genomic selection (MT-GS) using the single-trait version (ST-GS) as the baseline. We implemented the approaches in two Eucalyptus breeding schemes. In Congo, where commercial plantations of E. urophylla*grandis are dedicated to pulp production, we considered height increment between 8 and 18 months (H8 18), critical trait to avoid weed competition, and volume at 55 months (V55), the target trait, to analyse the interest of MT-GS. We used 3303 SNP to define the relationship matrices and to estimate breeding values of 1130 cloned hybrid progenies. The prediction accuracy was estimated through a cross validation process (75% of tree in the training set). For H8 18, the accuracy was 0.354 and 0.370 for ST-GS and MT-GS respectively. For V55, the accuracy attained 0.414 and 0.424 for ST-GS and MT-GS respectively. Although MT-GS presented higher accuracies, estimates were not significantly di↵erent. This result was explained by the low heritability of V55 and H8 18 (h2=0.26 and h2=0.13) and the relatively high genetic correlation (⇢a =0.77). In Madagascar, where E. robusta small-scale plantations are grown for fuel wood, the volume at 49 months (V49), the total lignin (TL) and the holo-cellulose (Holo) are the targeted traits for breeding. 2919 SNP were used to define the relationship matrix and estimate breeding values of 415 individuals of a provenance trial. Accuracies were estimated through the same procedure. For V49, the prediction accuracy attained 0.30 for both ST-GS and MT-GS. For TL, the prediction accuracy was near zero whatever the approach (0.05 for ST-GS and 0.04 for MT-GS).

Illegal selective logging of tropical timber is of increasing concern worldwide. Madagascar is a biodiversity hotspot and home to some of the world’s most sought after tropical timber species. Malagasy rosewoods belong to the genus Dalbergia (Fabaceae), which is highly diverse and has a pantropical distribution, but these timber species are among the most threatened as a consequence of intensive illegal selective logging and deforestation. Reliable identification of Dalbergia species from Madagascar is important for law enforcement but is almost impossible without fertile plant material, which is often unavailable during forest inventories or when attempting to identify logged trees of cut wood. DNA barcoding has been promoted as a promising tool for species identification in such cases. In this study we tested whether DNA barcoding with partial sequences of three plastid markers (matK, rbcL and trnL (UAA)) can distinguish between Dalbergia from Madagascar and from other areas of its distributional range, and whether Malagasy species can be distinguished from one another. Phylogenetic analyses revealed that the Malagasy Dalbergia species studied form two monophyletic groups, each containing two subgroups, only one of which corresponds to a single species. We characterized diagnostic polymorphisms in the three DNA barcoding markers that allow rapid discrimination between Dalbergia from Madagascar and from other areas of its distribution range. Species identification success based on individual barcoding markers or combinations was poor, whereas subgroup identification success was much higher (up to 98%), revealing both the value and limitations of a DNA barcoding approach for the identification of closely related Malagasy rosewoods., PLoS ONE, 11 (6), ISSN:1932-6203

Liquidambar styraciflua ou copalme d'Amérique est une espèce feuillue originaire du Sud-Est des États Unis d'Amérique et de l'Amérique Centrale. L'espèce possède un comportement remarquable en plantation et les propriétés de son bois en font un matériau à usage multiples. En 1986, dans le cadre d'un essai international de provenances de Liquidambar styraciflua, le Commonwealth Forestry Institute (CFI) d'Oxford a diffusé dans plusieurs pays (Brésil, Mexique, Madagascar) des graines de treize provenances récoltées essentiellement dans l'aire de distribution naturelle de l'espèce dans l'Est des États-Unis d'Amérique, du Mexique et de l'Amérique centrale. À Madagascar, le Département des Recherches Forestières et Piscicoles (DRFP-FOFIFA) les a plantées à Mandraka (Madagascar). Des données annuelles de la croissance ont été collectées durant 25 ans ; cependant les résultats n'ont pas encore été publiés contrairement à ceux du Brésil et du Mexique. Il s'agit ici d'évaluer l'adaptation de l'essence à Mandraka et d'étudier la variabilité intraspécifique de sa croissance. Jusqu'à 25 ans, la croissance de l'espèce est régulière pour atteindre en moyenne 26 m en hauteur, 38 cm en diamètre et 0,12 m²/arbre en surface terrière. Les valeurs moyennes des provenances pour ces mêmes caractéristiques et la surface terrière sont significativement différentes. L'héritabilité au sens large à 25 ans est de 0,76, 0,60 et 0,63 respectivement pour la hauteur, le diamètre et la surface terrière, montrant un contrôle génétique de la croissance. Dans des conditions écologiques similaires et à âges équivalents, la croissance de L. styraciflua est équivalente à celle des espèces du genre Eucalyptus et supérieure à celle des Pinus. Par rapport aux essais internationaux du CFI, l'essai de provenances de L. styraciflua dans le site de la Mandraka montre une meilleure adaptation et une bonne croissance de l'espèce.

Standardized methods of wood modulus of elasticity (MOB) evaluation are destructive and require many replicates. To overcome these constraints, the research of new technologies to characterize the wood properties has been focused towards tools such as NIRS and ultrasonic measurement (Bailleres and al. 2002; Hein and al. 2010; Brancheriau, 2013). Thus, the aim of this study is to compare two measurement methods of the MOB using ultrasonic device (Method 1) and NIRS (Method 2) applied to cores of wood from standing trees. Liquidambar was used, as this timber has a rather un-conventional behavior (e.g. its MOB is not correlated with its density). 292 samples (360x20x20mm3) were extracted on 54 diametrical planks. The MOB was measured by acoustic method BING® (Brancheriau and Bailleres 2002). NIRS calibration model was established using spectra measured on these samples and regressed by Partial Least Square (PLS) with MOB. Meanwhile, 30 long samples (360x20x20mm3) were used for correlation between MOB estimated by ultrasonic device and by BING® respectively. From the middle of each long sample, a small sample (10x20x20mm3) was cut and used in the same way as described above. To confront the value of the MOB predicted by NIRS model (292 samples) and the MOE measured by ultrasonic device (30 small samples), 33 diametrical cores of Liquidambar were extracted from each-tree. The MOB estimated by BING with the 30 long samples and the MOE' measured by ultrasonic device with the 30 small samples are not statistically different (r =0.72,p