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1. Ley grassland under temperate climate had a legacy effect on soil organic matter quantity, biogeochemical signature and microbial activities

Author: A. Romian, Cornelia Rumpel, Abad Chabbi, Alexandra Creme, T. Lan, X. Le Roux, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Université Paris-Saclay, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, CNRS, IEES UMR (Sorbonne Université, CNRS, IRD, INRA, UPEC), Sorbonne Université, Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Université Paris Saclay, Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (IEES (UMR_7618 / UMR_D_242 / UMR_A_1392 / UM_113) ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)
Subjects: Biogeochemical cycle, Soil organic matter biogeochemistry, 010504 meteorology & atmospheric sciences, [SDV]Life Sciences [q-bio], Soil Science, 01 natural sciences, Microbiology, Temporary grassland management, Grassland, Organic matter, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Cambisol, geography, Topsoil, geography.geographical_feature_category, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Soil organic matter, 04 agricultural and veterinary sciences, Soil carbon, Long-term field experiment, 15. Life on land, Crop rotation, Potential N2O emission, Agronomy, chemistry, 13. Climate action, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, Microbial activities
Abstract: Temporary (ley) grassland introduced into cropping cycles has been advocated as being beneficial for the delivery of ecosystem services by agricultural soils. The management of these temporary grasslands has unknown effects on soil organic matter (SOM) concentrations and biogeochemical properties of the cropland soils following the grassland phase. Here, we investigated the legacy effect of differently managed temporary grasslands, i.e. change of soil properties lasting beyond three years of crop. We assessed soil organic carbon (SOC) quantity and SOM biogeochemical signature (composition of soil neutral carbohydrates and lignin), as well as microbial activities (potential C and N mineralization and denitrification). We used a long-term field experiment on Cambisol with temperate climate in western France, where temporary grassland management practices differed in terms of duration (3 or 6 years) and presence or absence of N fertilisation. Topsoil (10 cm) samples were collected after a 3-yr crop rotation (maize, wheat, barley). Our results showed that N fertilisation during the grassland phase was necessary to maintain soil C and N concentrations beyond three years of crop. Temporary grassland management may affect microbial activities as indicated by contrasting polysaccharide and lignin composition. It had however, no effect on potential CO2 and N2O emissions during laboratory incubations. The biogeochemical signature of SOM was close to continuous grassland only in treatments with 6 yrs of fertilized temporary grassland. We thus, conclude that the legacy effects of a grassland phase on SOC quantity and properties of SOM depend on its management.
Published: 2018

2. The ecologically relevant genetics of plant–plant interactions

Author: Claude Becker, Richard Berthomé, Philippe Delavault, Timothée Flutre, Hélène Fréville, Stéphanie Gibot-Leclerc, Valérie Le Corre, Jean-Benoit Morel, Nathalie Moutier, Stéphane Muños, Céline Richard-Molard, James Westwood, Pierre-Emmanuel Courty, Alexandre de Saint Germain, Gaëtan Louarn, Fabrice Roux, Ludwig-Maximilians University [Munich] (LMU), Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement (LIPME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies de Nantes (US2B), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (Nantes Univ - UFR MEDECINE), Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Virginia Tech [Blacksburg], Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and This International PLANTCOM network is financially supported by the Plant Health and Environment division of INRAE.
Subjects: environmental stresses, genotype-by-genotype interactions, [SDE]Environmental Sciences, microbiome, agro-ecology, Plant Science, ecological genomics, plant communities
Abstract: International audience; Interactions among plants have been long recognized as a major force driving plant community dynamics and crop yield. Surprisingly, our knowledge of the ecological genetics associated with variation of plant-plant interactions remains limited. In this opinion article by scientists from complementary disciplines, the international PLANTCOM network identified four timely questions to foster a better understanding of the mechanisms mediating plant assemblages. We propose that by identifying the key relationships among phenotypic traits involved in plant-plant interactions and the underlying adaptive genetic and molecular pathways, while considering environmental fluctuations at diverse spatial and time scales, we can improve predictions of genotype-by-genotype-by-environment interactions and modeling of productive and stable plant assemblages in wild habitats and crop fields.
Published: 2023

3. Workshop on marker-trait analyses and marker-assisted selection strategies

Author: Julier , Bernadette, Annicchiarico , Paolo, Nazzicari , Nelson, Aubert , Gregoire, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Research Centre for Fodder Crops and Dairy Productions, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l’analisi dell’economia agraria (CREA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Resilient, water- and energy-efficient forage and feed crops for Mediterranean agricultural systems (REFORMA), auto-saisine, Absent, ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l’analisi dell’economia agraria ( CREA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC )
Subjects: qta, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, caractère marqueur, education, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, sélection assistée par marqueurs
Abstract: Workshop on marker-trait analyses and marker-assisted selection strategies
Published: 2017

4. Gene Introgression in Weeds Depends on Initial Gene Location in the Crop: Brassica napus - Raphanus raphanistrum Model

Author: Bachar Alrustom, Virginie Huteau, Jérôme Morice, Henri Darmency, Maryse Lodé, Katarzyna Adamczyk-Chauvat, Gwenaëlle Thomas, Frédérique Eber, Anne-Marie Chèvre, Sabrina Delaunay, Mathieu Rousseau-Gueutin, Cyril Falentin, Olivier Coriton, Eric Jenczewski, Caroline François, Sylvie Negre, Marie Gilet, Anne Vannier, Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] (MaIAGE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, SAD Paysage (SAD Paysage), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement [Jouy-En-Josas] ( MaIAGE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut Jean-Pierre Bourgin ( IJPB ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, SAD Paysage ( SAD Paysage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST
Subjects: 0301 basic medicine, oilseed rape, [SDV]Life Sciences [q-bio], Brassica, introgression, Introgression, Plant Weeds, Investigations, Raphanus raphanistrum, Genes, Plant, Genome, Gene flow, Raphanus, 03 medical and health sciences, Botany, Genetics, Gene, Hybrid, intergeneric hybridization, 2. Zero hunger, biology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], food and beverages, 15. Life on land, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, Hybridization, Genetic, wild radish, Genetic Fitness, Weed
Abstract: The effect of gene location within a crop genome on its transfer to a weed genome remains an open question for gene flow assessment. To elucidate this question, we analyzed advanced generations of intergeneric hybrids, derived from an initial pollination of known oilseed rape varieties (Brassica napus, AACC, 2n = 38) by a local population of wild radish (Raphanus raphanistrum, RrRr, 2n = 18). After five generations of recurrent pollination, 307 G5 plants with a chromosome number similar to wild radish were genotyped using 105 B. napus specific markers well distributed along the chromosomes. They revealed that 49.8% of G5 plants carried at least one B. napus genomic region. According to the frequency of B. napus markers (0–28%), four classes were defined: Class 1 (near zero frequency), with 75 markers covering ∼70% of oilseed rape genome; Class 2 (low frequency), with 20 markers located on 11 genomic regions; Class 3 (high frequency), with eight markers on three genomic regions; and Class 4 (higher frequency), with two adjacent markers detected on A10. Therefore, some regions of the oilseed rape genome are more prone than others to be introgressed into wild radish. Inheritance and growth of plant progeny revealed that genomic regions of oilseed rape could be stably introduced into wild radish and variably impact the plant fitness (plant height and seed number). Our results pinpoint that novel technologies enabling the targeted insertion of transgenes should select genomic regions that are less likely to be introgressed into the weed genome, thereby reducing gene flow.
Published: 2017

5. Genome-wide genotyping data renew knowledge on genetic diversity of a worldwide alfalfa collection and give insights on genetic control of phenology traits

Author: Pégard, Marie, Barre, Philippe, Delaunay, Sabrina, Surault, Fabien, Karagić, Djura, Milić, Dragan, Zorić, Miroslav, Ruttink, Tom, Julier, Bernadette, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Horizon 2020 Program for Research & Innovation under grant agreement n°727312, project EUCLEG, and European Project: 727312
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], GWAS, genetic diversity, alfalfa genetic diversity phenology GWAS genomic prediction, alfalfa, phenology, genomic prediction
Abstract: International audience; China’s and Europe’s dependence on imported protein is a threat to the food self-sufficiency of these regions. It could be solved by growing more legumes, including alfalfa that is the highest protein producer under temperate climate. To create productive and high-value varieties, the use of large genetic diversity combined with genomic evaluation could improve current breeding programs. To study alfalfa diversity, we have used a set of 395 alfalfa accessions (i.e. populations), mainly from Europe, North and South America and China, with fall dormancy ranging from 3 to 7 on a scale of 11. Five breeders provided materials (617 accessions) that were compared to the 400 accessions. All accessions were genotyped using Genotyping-by-Sequencing (GBS) to obtain SNP allele frequency. These genomic data were used to describe genetic diversity and identify genetic groups. The accessions were phenotyped for phenology traits (fall dormancy and flowering date) at two locations (Lusignan in France, Novi Sad in Serbia) from 2018 to 2021. The QTL were detected by a Multi-Locus Mixed Model (mlmm). Subsequently, the quality of the genomic prediction for each trait was assessed. Cross-validation was used to assess the quality of prediction by testing GBLUP, Bayesian Ridge Regression (BRR), and Bayesian Lasso methods. A genetic structure with seven groups was found. Most of these groups were related to the geographical origin of the accessions and showed that European and American material is genetically distinct from Chinese material. Several QTL associated with fall dormancy were found and most of these were linked to genes. In our study, the infinitesimal methods showed a higher prediction quality than the Bayesian Lasso, and the genomic prediction achieved high (>0.75) predicting abilities in some cases. Our results are encouraging for alfalfa breeding by showing that it is possible to achieve high genomic prediction quality.
Published: 2023

6. A new method to estimate the nitrogen status of individual plants in canopies

Author: Delphine Moreau, Bruno Andrieu, Romain Barillot, Abad Chabbi, Danilo dos Reis Cardoso Passos, Jean-Louis Durand, Francois Gastal, Céline Richard-Molard, Anne-Sophie Voisin, Gaëtan Louarn, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and European Society for Agronomy (ESA).
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], nitrogen nutrition index, [SDV]Life Sciences [q-bio], plant nitrogen status, nitrogen, individual plant
Abstract: SPEEAGESTADGEAPSI; A new method to estimate the nitrogen status of individual plants in canopies. 14. ESA Congress ESA14
Published: 2016

7. L’herbe : un atout pour améliorer l’autonomie des systèmes d’élevages caprins du Grand Ouest et produire des fromages sous signes de qualité

Author: Caillat, Hugues, Barre, Philippe, Delagarde, Remy, Disenhaus, Catherine, Ferlay, Anne, Freund, Geneviève, Gaborit, Patrice, Giger-Reverdin, Sylvie, Jacquot, Anne-Lise, Jenot, Frantz, Jost, Jérémy, Lecaro, Leila, Pelletier, Estelle, Wimmer, Emilie, Verdier, Géraldine, UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ) -Fourrages Environnement Ruminants Lusignan ( FERLUS ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), ACTALIA [Villers-Bocage], Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants ( MoSAR ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Fédération Régionale Caprine de Nouvelle-Aquitaine et Vendée ( FRCap ), Institut de l'Elevage, Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne, Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire, Lycée d'Enseignement Général et Technologique Agricole de Melle ( LEGTA ), Bureau Régional Interprofessionnel du Lait de Chèvre de Charentes-Poitou et des Pays de la Loire ( BRILAC ), Fromages et laits issus d’élevages de chèvres conduits à l’herbe, Institut National de la Recherche Agronomique, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Fédération Régionale Caprine de Nouvelle-Aquitaine et Vendée (FRCap), Lycée d'Enseignement Général et Technologique Agricole de Melle (LEGTA), Bureau Régional Interprofessionnel du Lait de Chèvre de Charentes-Poitou et des Pays de la Loire (BRILAC), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut de l'élevage (IDELE), Financement : PSDR Grand-Ouest 4, Superviseur : Hugues Caillat, Commanditaire : Institut National de la Recherche Agronomique (France), and Partenaires : Bureau Régional Interprofessionnel du Lait de Chèvre de Charentes-Poitou et des Pays de la Loire (BRILAC), Institut de l'Elevage (IDELE), Actalia, Chambre Régionale d'Agriculture de Bretagne (CRA Bretagne), Chambre Régionale d'Agriculture des Pays de la Loire (CRA Pays de la Loire), EPLFPEA Terres et Paysages Sud Deux Sèvres, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, élevage caprin, fromage de chèvre, lait de chèvre, filière, produit de qualité, alimentation à l'herbe, ouest de la france, goat milk, herbe, autonomie alimentaire, goat cheese, caprin, qualité des produits, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: Programme Pour et Sur le Développement Régional 4; La France est le premier producteur de lait de chèvre en Europe. Le Grand Ouest représente 54% de cette production nationale et près de la moitié de l’effectif de chèvres.Cependant, les systèmes caprins peuvent être fragilisés par leur relative faible autonomie alimentaire. Le projet Flèche vise à renforcer la durabilité des filières caprines laitières du Grand Ouest par une plus grande utilisation de l’herbe dans les élevages.Flèche est basé sur un partenariat fort entre acteurs du territoire, interprofession caprine, unités de recherches, organismes de développement et établissements d’enseignement secondaire et supérieur.
Published: 2016

8. Les spécificités de leur fonctionnement agro-physiologique

Author: Voisin, Anne-Sophie, Gastal, Francois, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, and Terres Innovia. FRA.
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], nitrate, nutrition azotée, fonctionnement agrophysiologique, fixation symbiotique, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: EAGeapsiCT2EJ2; Nutrition azotée et fonctionnement agrophysiologique spécifique des légumineuses Anne-Sophie Voisin et François Gastal La nutrition azotée des plantes de la famille des légumineuses (Fabacées) est assurée par deux voies complémentaires : absorption de l’azote minéral du sol par les racines, comme chez tous les végétaux supérieurs, et fixation de l’azote atmosphérique, propre à ces espèces, grâce à une symbiose* avec des bactéries du sol. Cette spécificité confère aux cultures de légumineuses une autonomie vis-à-vis de la disponibilité en azote du sol et de l’apport d’engrais azotés, et un rôle clé dans les flux azotés des systèmes de production végétale. La fixation symbiotique de l’azote étant un processus biologique et dynamique, connaître ses déterminants agrophysiologiques permet d’affiner les stratégies de gestion des cultures, pour bénéficier au mieux des aménités liées à l’utilisation de cet azote « écologique ». Après un rappel sur les mécanismes relatifs à la fixation symbiotique des plantes, ce chapitre visera à résumer les connaissances qualitatives et quantitatives sur la dynamique des flux azotés au sein des cultures et de leur environnement. Par ailleurs, rappelons que d’autres spécificités propres à ces plantes peuvent amener une gestion différente de ces cultures par rapport aux autres cultures et avoir des conséquences sur leur utilisation en agriculture : leur potentiel génétique (ressources génétiques et amélioration variétale actuelle), leur réactivité face à des composantes du milieu (comme la lumière, la température ou l’eau), leur plasticité en termes de composition de produits récoltés (notamment teneur en composants secondaires spécifiques). Ces autres spécificités seront décrites dans ce chapitre si elles ont une interaction avec la nutrition azotée ; sinon elles seront seulement évoquées et renverront aux autres chapitres de l’ouvrage
Published: 2015

9. Synthèse du chantier Agroécologie (AE) & Marché

Author: Magrini, Marie-Benoît, Alaphilippe, Aude, Bertagnoli, Stéphane, Cadoré, Jean-Luc, Caillat, Hugues, CARLIN, Frédéric, Cressent, Marion, Debaeke, Philippe, Delaby, Luc, Duclos, Michel, Foucher, Fabrice, Julier, Bernadette, Larzul, Catherine, Lauri, Pierre-Éric, Lamothe, Laurence, Lebret, Bénédicte, Le Gouis, Jacques, Lullien-Pellerin, Valérie, Nozières-Petit, Marie-Odile, Prache, Sophie, Renard, Michel, Sebillotte, Clementina, Schouler, Catherine, This, Patrice, Tchamitchian, Marc, Veysset, Patrick, Thiollet-Scholtus, Marie, Vandeputte, Marc, Lantremange, Hadrien, Saint-Ges, Veronique, Détang-Dessendre, Cécile, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Expérimentale de Recherches Intégrées en Production Fruitière (UERI), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (IBCP), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infections Virales et Pathologie Comparée - UMR 754 (IVPC), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Sécurité et Qualité des Produits d'Origine Végétale (SQPOV), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Recherche & Innovation, Institut Français du Cheval et de l'Equitation, Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Biologie des Oiseaux et Aviculture (BOA), Université de Tours (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS), Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Agrosystèmes Biodiversifiés (UMR ABSys), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Ingénierie des Agro-polymères et Technologies Émergentes (UMR IATE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Territoires (Territoires), AgroParisTech-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Alimentation et sciences sociales (ALISS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Station de Pathologie aviaire et parasitologie [Nouzilly] (PAP), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Unité de recherche d'Écodéveloppement (ECODEVELOPPEMENT), Laboratoire Agronomie et Environnement - Antenne Colmar (LAE-Colmar ), Laboratoire Agronomie et Environnement (LAE), Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Sciences pour l'Action et le Développement : Activités, Produits, Territoires (SADAPT), Centre d'Economie et de Sociologie Rurales Appliquées à l'Agriculture et aux Espaces Ruraux (CESAER), and Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], Agroécologie, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract: International audience
Published: 2023

10. Quantitative importance of various rhizodeposition processes: lessons from a mechanistic functional-structural root model

Author: Rees, Frédéric, Gauthier, Marion, Barillot, Romain, Richard-Molard, Céline, Jullien, Alexandra, Chenu, Claire, Pradal, Christophe, Andrieu, Bruno, Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), and Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: FSPM, border cells, wheat, [SDV]Life Sciences [q-bio], root exudation, mucilage, root hairs
Abstract: International audience
Published: 2023

11. Statistical analysis of large simulated yield datasets for studying climate change effects

Author: David Makowski, Senthold Asseng, Frank Ewert, Simona Bassu, Jean-Louis Durand, Pierre Martre, Myriam Adam, Pramod K. Aggarwal, Carlos Angulo, Christian Baron, Bruno Basso, Patrick Bertuzzi, Christian Biernath, Hendrik Boogaard, Kenneth J. Boote, Nadine Brisson, Davide Cammarano, Andrew J. Challinor, Sjakk J. G. Conijn, Marc Corbeels, Delphine Deryng, Giacomo De Sanctis, Jordi Doltra, Sebastian Gayler, Richard Goldberg, Patricio Grassini, Jerry L. Hatfield, Lee Heng, Steven Hoek, Josh Hooker, Tony L. A. Hunt, Joachim Ingwersen, Cesar Izaurralde, Raymond E. E. Jongschaap, James W. Jones, Armen R. Kemanian, Christian Kersebaum, Soo-Hyung Kim, Jon Lizaso, Christoph Müller, Naresh S. Kumar, Claas Nendel, Garry J. O'Leary, Jorgen E. Olesen, Tom M. Osborne, Taru Palosuo, Maria V. Pravia, Eckart Priesack, Dominique Ripoche, Cynthia Rosenzweig, Alexander C. Ruane, Fredirico Sau, Mickhail A. Semenov, Iurii Shcherbak, Pasquale Steduto, Claudio Stöckle, Pierre Stratonovitch, Thilo Streck, Iwan Supit, Fulu Tao, Edmar I. Teixeira, Peter Thorburn, Denis Timlin, Maria Travasso, Reimund Rötter, Katharina Waha, Daniel Wallach, Jeffrey W. White, Jimmy R. Williams, Joost Wolf, Agronomie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, University of Florida [Gainesville] (UF), Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), CGIAR Research Program on Climate Change, Agriculture and Food Security (CCAFS), Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System, Agroclim (AGROCLIM), German Research Center for Environmental Health, Centre for Geo-Information, University of Leeds, International Center for Tropical Agriculture, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Chinese Academy of Sciences [Changchun Branch] (CAS), University of East Anglia, Catabrian Agricultural Research and Training Center (CIFA), University of Tübingen, NASA Goddard Institute for Space Studies (GISS), NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), University of Nebraska [Lincoln], University of Nebraska System, National Laboratory for Agriculture and Environment, International Atomic Energy Agency [Vienna] (IAEA), University of Reading (UOR), University of Guelph, University of Hohenheim, Joint Global Change Research Institute, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Leibniz-Zentrum für Agrarlandschaftsforschung = Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF), University of Washington, Universidad Politécnica de Madrid (UPM), Potsdam Institute for Climate Impact Research (PIK), Indian Agricultural Research Institute (IARI), Department of Environment and Primary Industries, Landscape and Water Sciences, Aarhus University [Aarhus], Agrifood Research Finland, Pennsylvania State University (Penn State), Penn State System, Rothamsted Research, FAO Sub-regional Office for Eastern Africa [Addis Ababa, Ethiopie] (FAO), Food and Agriculture Organization of the United Nations [Rome, Italie] (FAO), Washington State University (WSU), Plant & Food Research, Ecosystem Sciences, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), USDA-ARS : Agricultural Research Service, Institute for Climate and Water, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Arid-Land Agricultural Research Center, Texas A&M University System, Hillel, D., Rosenzweig, C., Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, University of Florida, University of Bonn (Rheinische Friedrich-Wilhelms), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Université Clermont Auvergne ( UCA ), Université Blaise Pascal (Clermont Ferrand 2) ( UBP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, CGIAR Research Program on Climate Change, Agriculture and Food Security ( CCAFS ), Michigan State University, UE Agroclim ( UE AGROCLIM ), Wageningen University and Research Center ( WUR ), Chinese Academy of Sciences [Changchun Branch] ( CAS ), Catabrian Agricultural Research and Training Center ( CIFA ), NASA Goddard Institute for Space Studies ( GISS ), NASA Goddard Space Flight Center ( GSFC ), University of Nebraska Lincoln ( UNL ), International Atomic Energy Agency [Vienna] ( IAEA ), University of Reading ( UOR ), Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research, Universidad Politécnica de Madrid ( UPM ), Potsdam Institute for Climate Impact Research ( PIK ), Indian Agricultural Research Institute ( IARI ), Aarhus University, PennState University [Pennsylvania] ( PSU ), Food and Agricultural Organization ( FAO ), Washington State University ( WSU ), New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, United States Department of Agriculture - Agricultural Research Service, UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Texas A and M University ( TAMU ), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Florida [Gainesville], Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales - Clermont Auvergne (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université Blaise Pascal (Clermont Ferrand 2) (UBP), UE Agroclim (UE AGROCLIM), Wageningen University and Research Center (WUR), Food and Agricultural Organization (FAO), Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health, University of East Anglia [Norwich] (UEA), University of Nebraska–Lincoln, Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)
Subjects: analyse de données, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Earth Observation and Environmental Informatics, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Yield (finance), data analysis, Climate change, 01 natural sciences, Agro Water- en Biobased Economy, statistical analysis, Effects of global warming, Aardobservatie en omgevingsinformatica, Life Science, Alterra - Centrum Bodem, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, global change, 0105 earth and related environmental sciences, 2. Zero hunger, changement climatique, WIMEK, Mathematical model, analyse statistique, Crop yield, Soil Science Centre, Global change, Statistical model, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, PE&RC, Climate resilience, Climate Resilience, Plant Production Systems, Klimaatbestendigheid, 13. Climate action, Plantaardige Productiesystemen, Climatology, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science
Abstract: Many studies have been carried out during the last decade to study the effect of climate change on crop yields and other key crop characteristics. In these studies, one or several crop models were used to simulate crop growth and development for different climate scenarios that correspond to different projections of atmospheric CO2 concentration, temperature, and rainfall changes (Semenov et al., 1996; Tubiello and Ewert, 2002; White et al., 2011). The Agricultural Model Intercomparison and Improvement Project (AgMIP; Rosenzweig et al., 2013) builds on these studies with the goal of using an ensemble of multiple crop models in order to assess effects of climate change scenarios for several crops in contrasting environments. These studies generate large datasets, including thousands of simulated crop yield data. They include series of yield values obtained by combining several crop models with different climate scenarios that are defined by several climatic variables (temperature, CO2, rainfall, etc.). Such datasets potentially provide useful information on the possible effects of different climate change scenarios on crop yields. However, it is sometimes difficult to analyze these datasets and to summarize them in a useful way due to their structural complexity; simulated yield data can differ among contrasting climate scenarios, sites, and crop models. Another issue is that it is not straightforward to extrapolate the results obtained for the scenarios to alternative climate change scenarios not initially included in the simulation protocols. Additional dynamic crop model simulations for new climate change scenarios are an option but this approach is costly, especially when a large number of crop models are used to generate the simulated data, as in AgMIP. Statistical models have been used to analyze responses of measured yield data to climate variables in past studies (Lobell et al., 2011), but the use of a statistical model to analyze yields simulated by complex process-based crop models is a rather new idea. We demonstrate herewith that statistical methods can play an important role in analyzing simulated yield data sets obtained from the ensembles of process-based crop models. Formal statistical analysis is helpful to estimate the effects of different climatic variables on yield, and to describe the between-model variability of these effects.
Published: 2015

12. Légumineuses et prairies temporaires : des fournitures d'azote pour les rotations

Author: Vertès, Francoise, Jeuffroy, Marie-Helene, Louarn, Gaëtan, Voisin, Anne-Sophie, Justes, Eric, Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, ProdInra, Archive Ouverte, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), and Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, symbiotic nitrogen fixation, sol, agriculture durable, nitrogen efficiency, système fourrager, nitrogen balance, légumineuse, nitrogen, arrière-effet, soil, système de culture, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, nitrogen fertilisation, self-sufficiency, azote, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, bilan d'azote, soil fertility, prairie, legume, fixation symbiotique de l'azote, after-effects, rotation culturale, sustainable agriculture, fertilité du sol, fertilisation azotée, efficacité de l'azote, forage system, crop system, autonomie, grassland, france, crop succession
Abstract: Intervention présentée aux Journées de l'AFPF, "La fertilité des sols dans les systèmes fourragers", les 8 et 9 avril 2015; Les atouts des légumineuses (fixation symbiotique, diversité fonctionnelle...) leur permettent de contribuer à la fertilité des sols, à l'amélioration de la durabilité de l'agriculture et de l'autonomie protéique des systèmes alimentaires. Il convient donc de mieux connaître leurs rôles, directs et indirects, dans les flux d'azote des rotations.Les légumineuses fourragères (en culture pure ou dans des couverts multispécifiques) représentent une grande part des apports azotés symbiotiques. Il existe une grande diversité d'implication des légumineuses dans les rotations. Des bilans d'azote du sol sont présentés pour plusieurs espèces de légumineuses ; ils varient selon de nombreux facteurs (type de couvert, autres sources d'azote...). Lorsque la fixation est active, elle peut représenter un apport d'une centaine d'unités d'azote. On connaît mieux maintenant les rôles, direct et indirect, des légumineuses dans les flux d'azote sous cultures et prairies (fixation, arrière-effets...) mais il faut poursuivre les recherches pour intégrer ces effets à l'échelle de l'exploitation (ou du territoire) et des rotations afin de développer des pratiques et systèmes de production productifs et durables.
Published: 2015

13. Multiple cropping systems as drivers for providing multiple ecosystem services: from concepts to design

Author: Marion Prudent, Elise Pelzer, Sabrina Gaba, Simon Boudsocq, Marie-Laure Navas, Françoise Lescourret, Eric Malézieux, Jérôme Enjalbert, Gaëtan Louarn, Jacques Wery, Harry Ozier-Lafontaine, Etienne-Pascal Journet, Philippe Hinsinger, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-AgroParisTech-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Fonctionnement agroécologique et performances des systèmes de cultures horticoles (Cirad-Persyst-UPR 103 HORTSYS), Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agrosystèmes tropicaux (ASTRO), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Fonctionnement agroécologique et performances des systèmes de cultures horticoles (UPR HORTSYS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles ( PSH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes ( Eco&Sols ), Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) ( GQE-Le Moulon ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), UMR LIPM, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens ( SYSTEM ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), UR HortSys, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Agrosystèmes tropicaux ( ASTRO ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, F08 - Systèmes et modes de culture, Biodiversité et Ecologie, Multiple cropping, 01 natural sciences, service écosystémique, Interaction biotique, Ecosystem services, Interactions biologiques, Agriculture durable, système de culture, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 2. Zero hunger, Environmental resource management, 04 agricultural and veterinary sciences, Plant associations, Agroécologie, Agricultural sciences, Agroécosystème, Diversification, P01 - Conservation de la nature et ressources foncières, Culture associée, Biodiversité, Environmental Engineering, Cropping systems, Biotic interactions, Biodiversity and Ecology, Agroecology, Conservation des ressources, Production (economics), Intensification, Sustainable development, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business.industry, A01 - Agriculture - Considérations générales, Provisioning, Analyse économique, 15. Life on land, services écosystémiques, 13. Climate action, Agriculture, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Plante de culture, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business, Agronomy and Crop Science, Cropping, Sciences agricoles, 010606 plant biology & botany
Abstract: Provisioning services, such as the production of food, feed, and fiber, have always been the main focus of agriculture. Since the 1950s, intensive cropping systems based on the cultivation of a single crop or a single cultivar, in simplified rotations or monocultures, and relying on extensive use of agrochemical inputs have been preferred to more diverse, self-sustaining cropping systems, regardless of the environmental consequences. However, there is increasing evidence that such intensive agroecosystems have led to a decline in biodiversity as well as threatening the environment and have damaged a number of ecosystem services such as the biogeochemical nutrient cycles and the regulation of climate and water quality. Consequently, the current challenge facing agriculture is to ensure the future of food production while reducing the use of inputs and limiting environmental impacts and the loss of biodiversity. Here, we review examples of multiple cropping systems that aim to use biotic interactions to reduce chemical inputs and provide more ecosystem services than just provisioning. Our main findings are the identification of underlying ecological processes and management strategies related to the provision of pairs of ecosystem services namely food production and a regulation service. We also found gaps between ecological knowledge and the constraints of agricultural practices in taking account of the interactions and possible trade-offs between multiple ecosystem services as well as socioeconomic constraints. We present guidelines for the design of multiple cropping systems combining ecological, agricultural, and genetic concepts and approaches.
Published: 2015

14. A statistical analysis of three ensembles of crop model responses to temperature and CO2 concentration

Author: Joost Wolf, Xinyou Yin, Pierre Martre, Zhengtao Zhang, H. K. Soo, Manuel Marcaida, Nadine Brisson, Patrick Bertuzzi, Soo-Hyung Kim, Yan Zhu, Roberto C. Izaurralde, L. A. Hunt, Maria I. Travasso, Christian Baron, James W. Jones, R.E.E. Jongschaap, T. Palosuo, Daniel Wallach, Jerry L. Hatfield, Christian Biernath, G. De Sanctis, Senthold Asseng, H. Yoshida, Donald S. Gaydon, Edmar Teixeira, Davide Cammarano, Alex C. Ruane, C. Nendel, T. Hasegawa, Thilo Streck, Garry O'Leary, Upendra Singh, Frank Ewert, Delphine Deryng, R. Goldberg, Bas A. M. Bouman, Peter J. Thorburn, Tao Li, Roberto Confalonieri, Myriam Adam, Jes Olesen, Reimund P. Rötter, Tamon Fumoto, Patricio Grassini, Joachim Ingwersen, Robert F. Grant, Katharina Waha, James Williams, Fulu Tao, Eckart Priesack, Pramod K. Aggarwal, Liang Tang, Sebastian Gayler, Jordi Doltra, L. Heng, Christoph Müller, J.G. Conijn, Iwan Supit, S. Naresh Kumar, Iurii Shcherbak, Jeffrey W. White, Hendrik Boogaard, Kenneth J. Boote, David Makowski, Federico Sau, Jean-Louis Durand, Mikhail A. Semenov, Claudio O. Stöckle, Marc Corbeels, Steven Hoek, Simone Bregaglio, Hiroshi Nakagawa, Philippe Oriol, Anthony Challinor, R. A. Kemanian, Carlos Angulo, Pasquale Steduto, Bruno Basso, Kurt Christian Kersebaum, Cynthia Rosenzweig, Dennis Timlin, J. Hooker, Samuel Buis, Maria Virginia Pravia, Françoise Ruget, Dominique Ripoche, Simona Bassu, Pierre Stratonovitch, Jon I. Lizaso, Balwinder Singh, Tom M. Osborne, Paul W. Wilkens, Agronomie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Department of Agricultural and Biological Engineering [Gainesville] (UF|ABE), Institute of Food and Agricultural Sciences [Gainesville] (UF|IFAS), University of Florida [Gainesville] (UF)-University of Florida [Gainesville] (UF), Institute of Crop Science and Resource Conservation [Bonn] (INRES), Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), International Rice Research Institute [Philippines] (IRRI), Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR), Int Rice Res Inst, Los Banos, Philippines, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), International Water Management Institute, Research Program on Climate Change, Agriculture and Food Security, CGIAR, Institute of Crops Science and Resource Conservation INRES, Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Department of Geological Sciences and W. K. Kellogg Biological Station, Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System-Michigan State University System, Department of Geological Sciences [East Lansing], Agroclim (AGROCLIM), German Research Center for Environmental Health, Institute of Soil Ecololgy, Helmholtz-Zentrum München (HZM), Center for Geo-information, Alterra, Department of Agronomy, University of Florida [Gainesville] (UF), Cassandra Lab, University of Milan, Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), The James Hutton Institute, CGIAR ESSP Program on Climate Change, Agriculture and Food Security, International Center for Tropical Agriculture, School of Earth and Environment [Leeds] (SEE), University of Leeds, Plant Research International, Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Embrapa Cerrados, Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Tyndall Centre for Climate Change Research, School of Environmental Science, University of East Anglia [Norwich] (UEA), European Commission - Joint Research Centre [Ispra] (JRC), Cantabrian Agricultural Research and Training Centre, Tsukuba, National Institute of Agro-Environmental Sciences (NIAES), Agriculture Flagship, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation [Canberra] (CSIRO), WESS Water and Earth System Science Competence Cluster, Eberhard Karls Universität Tübingen = Eberhard Karls University of Tuebingen, NASA Goddard Institute for Space Studies (GISS), NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Departement of Renewable Resources, University of Alberta, Department of Agronomy and Horticulture, University of Nebraska [Lincoln], University of Nebraska System-University of Nebraska System, National Laboratory for Agriculture and Environment, International Atomic Energy Agency [Vienna] (IAEA), Centre for Geo-Information, Agriculture Department, University of Reading (UOR), Department of Plant Agriculture, University of Guelph, Institute of Soil Science and Land Evaluation, University of Hohenheim, Department of Geographical Sciences, University of Maryland [College Park], University of Maryland System-University of Maryland System, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Institute of Landscape System Analysis, Leibniz-Zentrum für Agrarlandschaftsforschung = Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF), College of the Environment, School of Environmental and Forest Sciences, University of Washington, Department Produccion Vegetal, Fitotecnia, Universidad Politécnica de Madrid (UPM), Potsdam Institute for Climate Impact Research (PIK), National Agriculture and Food Research Organization (NARO), Centre for Environment Science and Climate Resilient Agriculture (CESCRA), Indian Agricultural Research Institute (IARI), Institute of Landscape Systems Analysis, Department of Economic Development Jobs, Transport and Resources, Grains Innovation Park, Department of Agroecology, Aarhus University [Aarhus], Walker Institute, NCAS Climate, Natural Resources Institute Finland, Department of Plant Science, Pennsylvania State University (Penn State), Penn State System-Penn State System, German Research Center for Environmental Health, Institute of Soil Ecology, Department Biologia Vegetal, Computational and Systems Biology Department, Rothamsted Research, Department of Geological Sciences and W.K. Kellogg Biological Station, International Maize and Wheat Improvement Centre [Inde] (CIMMYT), International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR)-Consultative Group on International Agricultural Research [CGIAR] (CGIAR), International Fertilizer Development Center (IFDC), College of the Environment, School of Environmental and Forest Science, University of Washington [Seattle], FAO Sub-regional Office for Eastern Africa [Addis Ababa, Ethiopie] (FAO), Food and Agriculture Organization of the United Nations [Rome, Italie] (FAO), Biological Systems Engineering, Washington State University (WSU), Plant Production Systems and Earth System Science, National Engineering and Technology Center for Information Agriculture, Nanjing Agricultural University, Sustainable Production, Plant & Food Research, ARS Crop Systems and Global Change Laboratory, United States Department of Agriculture, CIRN, Institute for Climate and Water, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Agriculture, Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Arid-Land Agricultural Research Center, Texas AgriLife Research and Extension, Texas A&M University System, Centre for Crop Systems Analysis, State Key Laboratory of Earth Surface Processes and Resource Ecology, Beijing Normal University (BNU), Metaprogramme ACCAF, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Helmholtz Zentrum München = German Research Center for Environmental Health, Università degli Studi di Milano = University of Milan (UNIMI), University of Nebraska–Lincoln, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Natural Resources Institute Finland (LUKE), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC)-Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), Nanjing Agricultural University (NAU), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agricultural and Biological Engineering Department, University of Florida [Gainesville], Institute of Crop Science and Resource Conservation INRES, International Rice Research Institute, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), UE Agroclim (UE AGROCLIM), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (Cirad-Persyst-UPR 115 AIDA), Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Eberhard Karls Universität Tübingen, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), National Agriculture and Food Research Organization, International Maize and Wheat Improvement Centre (CIMMYT), Food and Agricultural Organization (FAO), New Zealand Institute for Plant and Food Research Limited, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Beijing Normal University, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, University of Bonn (Rheinische Friedrich-Wilhelms), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales ( GDEC ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 ( UBP ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale ( UMR TETIS ), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -AgroParisTech-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Department of Geological Sciences, W.K. Kellogg Biological Station, Michigan State Univ, Dept Geol Sci, E Lansing, MI 48823 USA, UE Agroclim ( UE AGROCLIM ), Helmholtz-Zentrum München ( HZM ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Invergowrie, School of Earth and Environment [Leeds] ( SEE ), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), Agro-ecologyand Sustainable Intensification of Annual Crops, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), University of East Anglia [Norwich] ( UEA ), European Commission - Joint Research Centre [Ispra] ( JRC ), National Institute for Agro-Environmental Sciences, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, NASA Goddard Institute for Space Studies ( GISS ), NASA Goddard Space Flight Center ( GSFC ), University of Nebraska-Lincoln, International Atomic Energy Agency [Vienna] ( IAEA ), University of Reading ( UOR ), UMR 1248 Agrosystèmes et Développement Territorial (AGIR), Agro-ecology and Sustainable Intensification of Annual Crops, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research, Universidad Politécnica de Madrid ( UPM ), Potsdam Institute for Climate Impact Research ( PIK ), Centre for Environment Science and Climate Resilient Agriculture ( CESCRA ), Indian Agricultural Research Institute ( IARI ), PennState University [Pennsylvania] ( PSU ), W.K. Kellogg Biological Station, Department of Geological Sciences, International Maize and Wheat Improvement Centre ( CIMMYT ), International Fertilizer Development Center ( IFDC ), Food and Agricultural Organization ( FAO ), Washington State University ( WSU ), Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, and Texas A and M University ( TAMU )
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Atmospheric Science, 010504 meteorology & atmospheric sciences, F62 - Physiologie végétale - Croissance et développement, 01 natural sciences, Statistics, Aardobservatie en omgevingsinformatica, Climate change, Crop model, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Triticum, Mathematics, 2. Zero hunger, Global and Planetary Change, Mathematical model, Air, Forestry, Regression analysis, 04 agricultural and veterinary sciences, PE&RC, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Rendement des cultures, Plant Production Systems, Statistical model, Modèle mathématique, Atmosphère, Earth Observation and Environmental Informatics, Yield, Crop Physiology, P40 - Météorologie et climatologie, [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Oryza sativa, Zea mays, Earth System Science, Emulator, Agro Water- en Biobased Economy, Alterra - Centrum Bodem, Precipitation, Croissance, 0105 earth and related environmental sciences, Meta-model, Changement climatique, Hydrology, Modélisation des cultures, Crop yield, Simulation modeling, Soil Science Centre, 15. Life on land, Température, Laboratorium voor Phytopathologie, Climate Resilience, 13. Climate action, Klimaatbestendigheid, Yield (chemistry), Plantaardige Productiesystemen, Laboratory of Phytopathology, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Leerstoelgroep Aardsysteemkunde, Plante de culture, Agronomy and Crop Science, Dioxyde de carbone
Abstract: Ensembles of process-based crop models are increasingly used to simulate crop growth for scenarios of temperature and/or precipitation changes corresponding to different projections of atmospheric CO2 concentrations. This approach generates large datasets with thousands of simulated crop yield data. Such datasets potentially provide new information but it is difficult to summarize them in a useful way due to their structural complexities. An associated issue is that it is not straightforward to compare crops and to interpolate the results to alternative climate scenarios not initially included in the simulation protocols. Here we demonstrate that statistical models based on random-coefficient regressions are able to emulate ensembles of process-based crop models. An important advantage of the proposed statistical models is that they can interpolate between temperature levels and between CO2 concentration levels, and can thus be used to calculate temperature and [CO2] thresholds leading to yield loss or yield gain, without rerunning the original complex crop models. Our approach is illustrated with three yield datasets simulated by 19 maize models, 26 wheat models, and 13 rice models. Several statistical models are fitted to these datasets, and are then used to analyze the variability of the yield response to [CO2] and temperature. Based on our results, we show that, for wheat, a [CO2] increase is likely to outweigh the negative effect of a temperature increase of +2 degrees C in the considered sites. Compared to wheat, required levels of [CO2] increase are much higher for maize, and intermediate for rice. For all crops, uncertainties in simulating climate change impacts increase more with temperature than with elevated [CO2]. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.
Published: 2015

15. The amounts and dynamics of nitrogen transfer to grasses differ in alfalfa and white clover-based grass-legume mixtures as a result of rooting strategies and rhizodeposit quality

Author: Anne-Sophie Voisin, Gaëtan Louarn, Edina Pereira-Lopès, Joëlle Fustec, François Gastal, Bruno Mary, Paulo César de Faccio Carvalho, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Universidade Federal do Paraná (UFPR), UR LEVA, Ecole Superieure d'Agriculture (ESA), UR 1158 Agroressources et impacts environnementaux, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Agroressources et impacts environnementaux (AgroImpact)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universidade Federal do Rio Grande do Sul [Porto Alegre] (UFRGS), CAPES/Cofecub exchange programme from Brazil (project 684/10), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Universidade Federal do Paraná ( UFPR ), Ecole Superieure d'Agriculture ( ESA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Agroressources et impacts environnementaux ( AgroImpact ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Universidade Federal do Rio Grande do Sul [Porto Alegre] ( UFRGS ), and Agroressources et Impacts environnementaux (AgroImpact)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, forage legumes, nitrogen transfer, Perennial plant, Field experiment, Population, Soil Science, chemistry.chemical_element, Plant Science, Biology, Population density, grass-legume mixture, population dynamics, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, education, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Legume, 2. Zero hunger, education.field_of_study, Plant physiology, food and beverages, Nitrogen, Agronomy, chemistry, nitrogen fixation, Nitrogen fixation, residue quality
Abstract: Differences in the ability to fix and transfer N have been shown between perennial legume species. However, the traits responsible for such variations are largely to be identified. This study aimed at comparing the dynamics of N transfer from alfalfa and white clover and test whether their differences resulted from difference in fixation, legume proportion, population dynamics or tissue composition. [br/]A three-year field experiment and a greenhouse experiment were carried out. Nitrogen fixation and transfer were assessed trough (15) N dilution and difference methods.[br/]Both experiments confirmed significant differences between legumes regarding N transfer capacity. Although alfalfa cumulated twice as much biomass and fixed nitrogen, it transferred smaller amounts of N (59 versus 147 kg N.ha(-1) over three years in the field) under a delayed dynamic. The amounts of nitrogen transferred were related to recent decreases in legume population density. Moreover, root tissue composition differed; white clover had a higher proportion of fine roots with a lower C/N and lignin content. This resulted in more rapid N release from the severed roots of clover.[br/]The traits controlling plant persistency, root material turnover and residue quality may better explain N transfer dynamics than overall legume production and fixation.
Published: 2015

16. Nutrition azotée et fonctionnement agrophysiologique spécifique des légumineuses

Author: Anne-Sophie Voisin, François Gastal, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ) -Fourrages Environnement Ruminants Lusignan ( FERLUS ), and Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [SDV.SA] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
Abstract: Avec la contribution de : Guénaëlle Corre-Hellou, Jean-Jacques Drevon, Gérard Duc, Pierre Jouffret, Eric Justes, Bernadette Julier, Christophe Naudin, Anne Schneider, Pascal Thiébeau, Françoise Vertès.; absent
Published: 2015

17. Do non-native plants affect terrestrial arthropods in the sub-Antarctic Kerguelen Islands?

Author: Isabelle Badenhausser, Damien Fourcy, Mathilde Bertrand, Aurélien Pierre, Brigitte Bonneau, Jean-Louis Chapuis, Yann Rantier, Maurice Hullé, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l’océan (DECOD), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Ecologie et des Sciences de la COnservation (CESCO), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), The research was supported by the ‘Institut Polaire Français Paul-Emile Victor’ (IPEV, programme 136 subanteco) and the CNRS (Zone-Atelier de Recherches sur l’Environnement Antarctique et Subantarctique)., Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers
Subjects: [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Vascular plants, [SDE]Environmental Sciences, fungi, food and beverages, Biodiversity, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Biological invasions, General Agricultural and Biological Sciences, Functional traits, Species richness
Abstract: International audience; Biological invasions are a major threat to the terrestrial ecosystems of the sub-Antarctic islands. While non-native plants generally have negative impacts on native arthropods, few studies have investigated how both native and non-native arthropods and plants interact in the sub-Antarctic islands. This was the aim of our study, which was conducted on three islands of the Kerguelen archipelago. The design was based on the spatial proximity of areas dominated by non-native or native plant species. Trait-based indices were calculated to characterize the functional structure of plant communities, considering plant stature and leaf traits. Native and non-native vegetation had contrasting functional composition but their functional diversity was similar. The effects of the type of vegetation, native or non-native, and plant functional diversity on arthropods were tested. Native macro-arthropod richness and abundance were similar or higher in non-native vegetation, and benefited from greater plant functional diversity. Abundances of macro-herbivores, macro-decomposers and macro-predators were also similar or higher in non-native vegetation. Conversely, the abundances of micro-arthropods, Symphypleona springtails and Oribatida mites, were higher in native vegetation but we also found that plant functional diversity had a negative effect on Symphypleona. Our results suggest that non-native plants can affect micro-arthropods directly or indirectly, likely through their effects on abiotic factors. By affecting macro-arthropod abundances across different trophic groups and by depleting micro-arthropods, non-native plants can alter trophic interactions, functional balances and the functioning of whole ecosystem.
Published: 2022

18. AnaEE-France research infrastructure services for experimental studies on soil biodiversity and associated ecological functions

Author: Abad Chabbi, Andre Chanzy, Jean Clobert, Sabine Houot, Katja Klumpp, Francois Lafolie, Jean-François Le Galliard, Benjamin Loubet, Christian Mougin, Christian Pichot, Lionel Ranjard, Roy, J., laurent saint-andre, Bernhard Zeller, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Station d’Ecologie Expérimentale du CNRS à Moulis (SEEM), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), CEREEP-Ecotron Ile de France (UMS 3194), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Ecotron européen, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers (BEF), ANR-11-INBS-0001, UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Écotron Européen de Montpellier, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), USR SEEM, Station d’Ecologie Expérimentale, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes ( ECOSYS ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -École normale supérieure - Paris ( ENS Paris ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie des Forêts Méditerranéennes ( URFM 629 ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), and Unité de recherche Biogéochimie des Ecosystèmes Forestiers ( BEF )
Subjects: base de données, expérimentation in vitro, Infrastructure, Expérimentation, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], plateforme de modélisation, AnaEE-France, [SDV]Life Sciences [q-bio], écologie du sol, in vitro experimentation, fonctionnement des écosystèmes, écosystème
Abstract: AnaEE-France research infrastructure services for experimental studies on soil biodiversity and associated ecological functions. 1. Global Soil Biodiversity Conference : Assessing Soil Biodiversity and its Role for Ecosystem Services
Published: 2014

19. How do various maize crop models vary in their responses to climate change factors?

Author: Federico Sau, Sjaak Conijn, Delphine Deryng, Jean-Louis Durand, Katharina Waha, Edmar Teixeira, Iurii Shcherbak, R.E.E. Jongschaap, James W. Jones, Kenneth J. Boote, Maria Virginia Pravia, Jerry L. Hatfield, Alex C. Ruane, Christian Biernath, Patricio Grassini, H.L. Boogaard, Steven Hoek, K. Christian Kersebaum, Fulu Tao, Christian Baron, David Makowski, Claas Nendel, Sebastian Gayler, Dennis Timlin, Marc Corbeels, Christoph Müller, Nadine Brisson, Jon I. Lizaso, Naresh S. Kumar, Cynthia Rosenzweig, Simona Bassu, Armen R. Kemanian, Cesar Izaurralde, Bruno Basso, Giacomo De Sanctis, Myriam Adam, Soo-Hyung Kim, Eckart Priesack, Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Department of agronomy, University of Florida [Gainesville], Department Produccion vegetal, Fitotecnia, Universidad Politécnica de Madrid (UPM), Department of agricultural and biological engineering, GISS Climate impacts group, NASA Goddard Institute for Space Studies (GISS), NASA Goddard Space Flight Center (GSFC)-NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro), Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale (UMR TETIS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Department of geological sciences, Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System-Michigan State University System, Department crop systems, forestry and environmental sciences, University of Basilicata, Centre for Geo-Information, ALTERRA, WUR-Plant research international, Wageningen University and Research Centre [Wageningen] (WUR), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (Cirad-Persyst-UPR 115 AIDA), Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Tyndall Centre for Climate Change Research, University of East Anglia [Norwich] (UEA), School of Environmental Sciences [Norwich], UE Agroclim (UE AGROCLIM), Water and earth system science [Tübingen] (WESS), Eberhard Karls Universität Tübingen, Department of agronomy and horticulture, University of Nebraska [Lincoln], University of Nebraska System-University of Nebraska System, Department of plant science, University of Pensylvania, Institute of Lanscape Systems Analysis, Leibniz-Zentrum für Agrarlandschaftsforschung = Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF), School of environmental and forest sciences, University of Washington [Seattle], Centre for Environment Science and Climate Resilient Agriculture (CESCRA), Indian Agricultural Research Institute (IARI), Institute of landscape systems analysis, Institute of geographical sciences and natural resources research, Chinese Academy of Sciences [Changchun Branch] (CAS), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Universidad Politécnica de Madrid ( UPM ), NASA Goddard Institute for Space Studies ( GISS ), NASA Goddard Space Flight Center ( GSFC ) -NASA Goddard Space Flight Center ( GSFC ), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales ( UMR AGAP ), Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale ( UMR TETIS ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ), Wageningen University and Research Centre [Wageningen] ( WUR ), Annual cropping systems, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Tyndall Centre for climate change research and school of environmental sciences, University of East Anglia [Norwich] ( UEA ), UE Agroclim ( UE AGROCLIM ), Water and earth system science (WESS) competence cluster, University of Nebraska-Lincoln, Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research, Centre for Environment Science and Climate Resilient Agriculture ( CESCRA ), Indian Agricultural Research Institute ( IARI ), Chinese Academy of Sciences [Changchun Branch] ( CAS ), University of Florida [Gainesville] (UF), Department of Agricultural and Biological Engineering [Gainesville] (UF|ABE), Institute of Food and Agricultural Sciences [Gainesville] (UF|IFAS), University of Florida [Gainesville] (UF)-University of Florida [Gainesville] (UF), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Wageningen University and Research [Wageningen] (WUR), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Agroclim (AGROCLIM), and Eberhard Karls Universität Tübingen = Eberhard Karls University of Tuebingen
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 010504 meteorology & atmospheric sciences, nitrogen dynamics, Atmospheric sciences, maize, 01 natural sciences, Standard deviation, F01 - Culture des plantes, wheat, Aardobservatie en omgevingsinformatica, water-use efficiency, uncertainty, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, General Environmental Science, agriculture, 2. Zero hunger, Global and Planetary Change, elevated co2, Ecology, Geography, Phenology, U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, Agricultura, 04 agricultural and veterinary sciences, simulation, Rendement des cultures, model intercomparison, climate change, CO2, Crop simulation model, Modèle mathématique, Crops, Agricultural, simulation-model, Earth Observation and Environmental Informatics, air co2 enrichment, P40 - Météorologie et climatologie, Agmip, Climate, Maize, Model Intercomparison, Simulation, Temperature, Uncertainty, Climate change, carbon-dioxide, Models, Biological, Zea mays, Agro Water- en Biobased Economy, Environmental Chemistry, Water-use efficiency, climate, 0105 earth and related environmental sciences, Changement climatique, systems simulation, Modélisation des cultures, Crop yield, Simulation modeling, Water, temperature, Modèle de simulation, Carbon Dioxide, yield, Température, Agronomy, 13. Climate action, Yield (chemistry), 040103 agronomy & agriculture, AgMIP, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Environmental science, Dioxyde de carbone
Abstract: Comments This article is a U.S. government work, and is not subject to copyright in the United States. Abstract Potential consequences of climate change on crop production can be studied using mechanistic crop simulation models. While a broad variety of maize simulation models exist, it is not known whether different models diverge on grain yield responses to changes in climatic factors, or whether they agree in their general trends related to phenology, growth, and yield. With the goal of analyzing the sensitivity of simulated yields to changes in temperature and atmospheric carbon dioxide concentrations [CO2], we present the largest maize crop model intercomparison to date, including 23 different models. These models were evaluated for four locations representing a wide range of maize production conditions in the world: Lusignan (France), Ames (USA), Rio Verde (Brazil) and Morogoro (Tanzania). While individual models differed considerably in absolute yield simulation at the four sites, an ensemble of a minimum number of models was able to simulate absolute yields accurately at the four sites even with low data for calibration, thus suggesting that using an ensemble of models has merit. Temperature increase had strong negative influence on modeled yield response of roughly 0.5 Mg ha 1 per °C. Doubling [CO2] from 360 to 720 lmol mol 1 increased grain yield by 7.5% on average across models and the sites. That would therefore make temperature the main factor altering maize yields at the end of this century. Furthermore, there was a large uncertainty in the yield response to [CO2] among models. Model responses to temperature and [CO2] did not differ whether models were simulated with low calibration information or, simulated with high level of calibration information.
Published: 2014

20. Analyse de risque phytosanitaire [i]Plasmopara halstedii[/i] agent responsable de la maladie du mildiou du tournesol

Author: Frederic Suffert, François Delmotte, Marc Delos, Valérie Grimault, Denis Tourvieille de Labrouhe, Patrick Vincourt, Veronique Wilson, Philippe Reignault, Sylvie Augustin, Nathalie Breda, Philippe Castagnone, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Abraham ESCOBAR GUTIERREZ, Laurent Gentzbittel, Herve Jactel, Jean-Claude Laberche, Thomas Le Bourgeois, Guy Lemperiere, Didier Mugniery, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, François Verheggen, Thierry Wetzel, BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Santé Végétale ( SV ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux ( ENITAB ), Direction Générale de l'Alimentation, Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt ( DGAL-SDQPV ), 0971 Gip Geves SNES Angers, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Accueil GEVES ( Accueil GEVES ) -Groupe d'étude et de controle des variétés et des semences ( GEVES ) -Gip Geves SNES Angers ( Gip Geves SNES Angers ), UE 1375 Phénotypage Au Champ des Céréales, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Santé des plantes et environnement ( S.P.E. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ) -Phénotypage Au Champ des Céréales ( PHACC ), Interactions plantes-microorganismes et santé végétale, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de la Santé des Végétaux, Unité de Mycologie, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant, Université du Littoral Côte d'Opale ( ULCO ), Unité de recherche Zoologie Forestière ( UZF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement ( EcoLab (ENSAT-Bat A) ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-PRES Université de Toulouse-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biodiversité, Gènes & Communautés ( BioGeCo ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bordeaux ( UB ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations ( UMR AMAP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Centre de Recherche et de Veille sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), Indépendant, UR Systèmes de cultures annuels, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Département Sciences du Vivant, Unité Biologie des nuisibles et biovigilance, Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), Faculté de Gembloux Agro-Bio Tech, Unité Entomologie fonctionnelle et évolutive, Université de Liège, Laboratoire de Virologie Végétale, RLP-Agroscience GmbH/Alplanta-Institute for Plant Research, ARP Mildiou du tournesol, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Absent, BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Santé Végétale (SV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École Nationale d'Ingénieurs des Travaux Agricoles - Bordeaux (ENITAB), Ministère de l'Agriculture, de l'Agroalimentaire et de la Forêt (DGAL-SDQPV), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Accueil GEVES (Accueil GEVES)-Groupe d'étude et de controle des variétés et des semences (GEVES)-Gip Geves SNES Angers (Gip Geves SNES Angers), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Santé des plantes et environnement (S.P.E.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Phénotypage Au Champ des Céréales (PHACC), Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Mycologie, Laboratoire de la Santé des Végétaux, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Chercheur indépendant, Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), Contrat : 2012-SA-0159, Superviseur : Xavier Tassus, Commanditaire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Date de signature : 2014-01-08, ProdInra, Archive Ouverte, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de la Santé des Végétaux, Unité de Mycologie (LSV Nancy), Unité de recherche Zoologie Forestière (UZF), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), and Systèmes de Cultures Annuelles (UPR 102 SCA)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], plasmopara halstedii, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], helianthus annuus, analyse de risque phytosanitaire, directive 2000/29/CE, mildiou du tournesol, tournesol
Abstract: absent
Published: 2014

21. Demande d’avis relatif à une demande de complément d’analyse de risque phytosanitaire sur le nématode destiges et bulbes ([i]Ditylenchus dipsaci[/i]) sur la luzerne avec élargissement aux autres végétaux réglementés

Author: Castagnone , Philippe, Escobar Gutiérrez , Abraham, Esquibet , Magali, Gentzbittel , Laurent, Mugniery , Didier, Reignault , Philippe, Sarniguet , Corinne, Augustin , Sylvie, Breda , Nathalie, Chauvel , Bruno, Desneux , Nicolas, Jactel , Herve, Laberche , Jean-Claude, Le Bourgeois , Thomas, Lemperiere , Guy, Silvie , Pierre, Steyer , Stéphan, Suffert , Frederic, Verheggen , François, Wetzel , Thierry, Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Independent, Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant, Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Laboratoire de la Santé des Végétaux, Unité de Nématologie, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de recherche Zoologie Forestière (UZF), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre de Recherche et de Veille sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Systèmes de Cultures Annuelles (UPR 102 SCA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Département Sciences du Vivant, Unité Biologie des nuisibles et biovigilance, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Faculté de Gembloux Agro-Bio Tech, Unité Entomologie fonctionnelle et évolutive, Université de Liège, Laboratoire de Virologie Végétale, RLP-Agroscience GmbH/Alplanta-Institute for Plant Research, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Absent, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV), Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Contrat : 2013-SA-0155, Superviseur : Charles Manceau, Christine Tayeh, Commanditaire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Date de signature : 2014-05-06, Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement ( EcoLab (ENSAT-Bat A) ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-PRES Université de Toulouse-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université du Littoral Côte d'Opale ( ULCO ), Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Unité de recherche Zoologie Forestière ( UZF ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Biodiversité, Gènes & Communautés ( BioGeCo ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bordeaux ( UB ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations ( UMR AMAP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ), UR Systèmes de cultures annuels, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ), Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, union européenne, liliacées maraichères, bulbe, nématode des tiges et bulbes, liliacées florales, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, directive 2000/29/CE, Ditylenchus dipsaci
Abstract: Saisine liée n°2012-SA-0086 « ARP Ditylenchus dipsaci sur luzerne »; absent
Published: 2014

22. Boucler les grands cycles, Biologie des sols et matière organique, GES

Author: Lemanceau, Philippe, Chabbi, Abad, Flechard, Christophe, Fontaine, Sébastien, Recous, Sylvie, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Fractionnement des AgroRessources et Environnement - UMR-A 614 (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-SFR Condorcet, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Fractionnement des AgroRessources et Environnement (FARE), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation ( SAS ), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherche sur l'Ecosystème Prairial, Fractionnement des AgroRessources et Environnement - UMR-A 614 ( FARE ), Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -SFR Condorcet, and Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Reims Champagne-Ardenne ( URCA ) -Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: sol, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], biologie du sol, matière organique, [SDV]Life Sciences [q-bio], Agroécologie, Agroecology, soil, organic matter
Abstract: SPEPôle ECOLDUR14 slidesColloque international Agroécologie et RechercheLe 17 octobre 2013 l'Inra a organisé à Paris, sous le haut patronage du Ministre en charge de l’Agriculture, en partenariat avec Agreenium et l’alliance de recherche AllEnvi, un colloque "Agroécologie et Recherche". Cet événement a constitué un point d’étape important dans la réflexion nationale sur ces questions.L’agro-écologie a pour projet de concevoir une agriculture qui réponde à nos besoins futurs, guidée par les outils de l’écologie et des sciences sociales pour en améliorer les performances environnementales et économiques.; Boucler les grands cycles, Biologie des sols et matière organique, GES. Colloque Agroécologie et Recherche INRA
Published: 2013

23. Variation et prévision de la valeur énergétique de l’ensilage de sorgho plante entière

Author: Jocelyne Aufrere, Jean Claude Emile, Dominique Dozias, Luc Delaby, Aline Le Morvan, Philippe Barre, René Baumont, Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Domaine expérimental animal du Pin (SEA), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ) -Fourrages Environnement Ruminants Lusignan ( FERLUS ), Domaine expérimental animal du Pin ( SEA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] ( PEGASE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), AGROCAMPUS OUEST-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement
Subjects: aléa climatique, plante entière, fourrage, digestibilité, maïs, [ SDV.AEN ] Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition, Ingénierie des aliments, sorgho, [ SDV.IDA ] Life Sciences [q-bio]/Food engineering, prévision, valeur énergétique des aliments, Alimentation et Nutrition, [SDV.IDA]Life Sciences [q-bio]/Food engineering, ensilage, Food and Nutrition, Food engineering, [SDV.AEN]Life Sciences [q-bio]/Food and Nutrition
Abstract: absent
Published: 2013

24. Analyse de risque phytosanitaire Ditylenchus dipsaci sur luzerne

Author: Castagnone-Sereno, Philippe, Escobar Gutiérrez, Abraham, Esquibet, Magali, Gentzbittel, Laurent, Mugniery, Didier, Reignault, Philippe, Sarniguet, Corinne, Augustin, Sylvie, Bréda, Nathalie, Chauvel, Bruno, Desneux, Nicolas, Jactel, Herve, Laberche, Jean-Claude, Le Bourgeois, Thomas, Lemperière, Guy, Silvie, Pierre, Steyer, Stéphan, Suffert, Frederic, Verheggen, François, Wetzel, Thierry, Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Chercheur indépendant, Unité de Chimie Environmentale et Interactions sur le Vivant, Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Unité de Nématologie, laboratoire de la Santé des Végétaux, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de recherche Zoologie Forestière (UZF), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Biodiversité, Gènes et Communautés, Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre de Recherche et de Veille sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), UR Systèmes de cultures annuels, Département Sciences du Vivant, Unité Biologie des nuisibles et biovigilance, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Faculté de Gembloux Agro-Bio Tech, unité Entomologie fonctionnelle et évolutive, Université de Liège, Laboratoire de Virologie Végétale, RLP-Agroscience GmbH/Alplanta-Institute for Plant Research, ARP Ditylenchus dipsaci sur luzerne, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV), Unité de Nématologie (LSV Rennes), Laboratoire de la santé des végétaux (LSV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Contrat : 2012-SA-0086, Superviseur : Raphaëlle Mouttet, Commanditaire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Date de signature : 2013-04-16, Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Ecologie FOnctionnelle et Environnement, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Indépendant, Université du Littoral Côte d’Opale ( ULCO ), Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Unité de recherche Zoologie Forestière ( UZF ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations ( UMR AMAP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Université du Littoral Côte d’Opale (ULCO), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de Nématologie, Laboratoire de la Santé des Végétaux, and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, risque phytosanitaire, semences, medicago sativa, luzerne, union européenne, directive2000/29/CE, analyse de risque phytosanitaire, semence, nématode des tiges et bulbes, ditylenchus dipsaci, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, analyse de risque, nématode
Abstract: Il est demandé à l’Anses de réaliser une ARP sur le nématode des tiges et bulbes (D.dipsaci) sur luzerne (M. sativa).L’ARP consiste à évaluer, selon des normes internationales1, 2 , les preuves biologiques etautres données scientifiques ou économiques pour déterminer si un organisme nuisibledoit être réglementé (ou déréglementé) et la nature des mesures phytosanitaireséventuelles à prendre à son égard. L’ARP s’attache à évaluer l'importance potentielle d'unorganisme nuisible particulier pour une zone clairement définie. Elle peut être initiée pourune ou plusieurs raisons, les plus fréquentes étant : l’identification d'une filière,l’identification d’un organisme nuisible, l’examen ou la révision d'une politique.
Published: 2013

25. Métaprogramme EcoServ : proposition de cahier des charges

Author: Guy Richard, Anne-Francoise Adam-Blondon, Isabelle Litrico, Marion Bardy, Francoise Lescourret, Sylvain Pellerin, Francois Lefèvre, Bernard Montuelle, Roger Martin-Clouaire, Bertrand Dumont, Christian Ducrot, Jacques Baudry, Daniele Magda, Isabelle Doussan, Alban THOMAS, Manuel Plantegenest, Elise Tancoigne, Département Environnement et Agronomie (DPT_EA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Unité INFOSOL (ORLEANS INFOSOL), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles (PSH), Interactions Sol Plante Atmosphère (ISPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine (Bordeaux Sciences Agro), Ecologie des Forêts Méditerranéennes [Avignon] (URFM 629), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques (CARRTEL), Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes (UMR CMAEE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), SAD Paysage (SAD Paysage), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, UMR : AGroécologie, Innovations, TeRritoires, Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Groupe de Recherche en Droit, Economie et Gestion (GREDEG), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toulouse School of Economics (TSE), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), AGROCAMPUS OUEST-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés (LISIS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-ESIEE Paris-Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut National de la Recherche Agronomique, Département Environnement et Agronomie (DEPT EA), InfoSol (InfoSol), Interactions Sol Plante Atmosphère (UMR ISPA), Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry]), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-ESIEE Paris-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commanditaire : Institut National de la Recherche Agronomique (France), Type de commande : Commande non formalisée, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Toulouse School of Economics (TSE-R), Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-AGROCAMPUS OUEST, Département Environnement et Agronomie ( DPT_EA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité de Recherche Génomique Info ( URGI ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Unité INFOSOL ( ORLEANS INFOSOL ), Unité de recherche Plantes et Systèmes de Culture Horticoles ( PSH ), Interactions Sol Plante Atmosphère ( ISPA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure des Sciences Agronomiques de Bordeaux-Aquitaine ( Bordeaux Sciences Agro ), Ecologie des Forêts Méditerranéennes ( URFM 629 ), Centre Alpin de Recherche sur les Réseaux Trophiques et Ecosystèmes Limniques ( CARRTEL ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse ( MIAT INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Contrôle des maladies animales exotiques et émergentes [Montpellier] ( CMAEE ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement [CIRAD] : UMR15, SAD Paysage ( SAD Paysage ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AGROCAMPUS OUEST, Groupe de Recherche en Droit, Economie et Gestion ( GREDEG ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Toulouse School of Economics ( TSE ), Toulouse School of Economics, Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes ( IGEPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -AGROCAMPUS OUEST, Laboratoire Interdisciplinaire Sciences, Innovations, Sociétés ( LISIS ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université Paris-Est Marne-la-Vallée ( UPEM ) -ESIEE Paris-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS )
Subjects: [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, cahier des charges, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, contract specifications, [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [ SDE.ES ] Environmental Sciences/Environmental and Society, service écosystémique
Abstract: Métaprogramme EcoServ : proposition de cahier des charges
Published: 2013

26. Evaluation de risque simplifiée pour les Lethal yellowing type syndromes (LYTS)

Author: Michel Dollet, Bruno Hostachy, Philippe Reignault, Sylvie Augustin, Nathalie Breda, Philippe Castagnone, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Abraham ESCOBAR GUTIERREZ, Laurent Gentzbittel, Herve Jactel, Jean-Claude Laberche, Thomas Le Bourgeois, Guy Lemperiere, Didier Mugniery, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, Frederic Suffert, François Verheggen, Thierry Wetzel, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Unité Ravageurs et agents pathogènes tropicaux, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant, Université du Littoral Côte d’Opale ( ULCO ), Unité de recherche Zoologie Forestière ( UZF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement ( EcoLab (ENSAT-Bat B) ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-PRES Université de Toulouse-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biodiversité, Gènes et Communautés, Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations ( UMR AMAP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Centre de Recherche et de Veille sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien, Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Indépendant, UR Systèmes de cultures annuels, Département Sciences du Vivant, Unité Biologie des nuisibles et biovigilance, Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Faculté de Gembloux Agro-Bio Tech, unité Entomologie fonctionnelle et évolutive, Université de Liège, Laboratoire de Virologie Végétale, RLP-Agroscience GmbH/Alplanta-Institute for Plant Research, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Université du Littoral Côte d’Opale (ULCO), Unité de recherche Zoologie Forestière (UZF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Chercheur indépendant, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Contrat : 2012-SA-0101, Superviseur : Xavier Tassus, Commanditaire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Date de signature : 2012-11-14, Unité Ravageurs et agents pathogènes tropicaux (RAPT), Laboratoire de la santé des végétaux (LSV), Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), and Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, lethal yellowing type syndromes (LYTS), jaunissement du feuillage, palm tree, palmiers, risk assessment, phytoplasmes, maladie à phytoplasme, palmier, évaluation des risques, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, evaluation du risque simplifiée
Abstract: La Direction Générale de l’Alimentation du ministère en charge de l’agriculture a saisi l’Anses en vue de la réalisation d’une évaluation du risque simplifiée (ERS) des LYTS. Ce travail a pour but notamment d’évaluer le risque d’introduction et l’impact économique des LYTS dans la zone ARP. La zone ARP à considérer comprend la Martinique, la Guadeloupe, la Guyane, la Réunion et Mayotte.
Published: 2012

27. Evaluation de risque simplifiée pour Xyllela fastidiosa

Author: Charles Manceau, Bruno Legendre, Philippe Reignault, Sylvie Augustin, Nathalie Breda, Philippe Castagnone, Bruno Chauvel, Nicolas Desneux, Abraham ESCOBAR GUTIERREZ, Laurent Gentzbittel, Herve Jactel, Jean-Claude Laberche, Thomas Le Bourgeois, Guy Lemperiere, Didier Mugniery, Pierre Silvie, Stéphan Steyer, Frederic Suffert, François Verheggen, Thierry Wetzel, Santé du végétal, Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES), Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant (UCEIV), Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO), Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] (EEF), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Lorraine (UL), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (LEFE), Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Centre de Recherche et de Veille sur les maladies émergentes dans l'Océan Indien, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Chercheur indépendant, UR Systèmes de cultures annuels, Département Sciences du Vivant, Unité Biologie des nuisibles et biovigilance, Centre Wallon de Recherches Agronomiques (CRA-W), BIOlogie et GEstion des Risques en agriculture (BIOGER), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Faculté de Gembloux Agro-Bio Tech, unité Entomologie fonctionnelle et évolutive, Université de Liège, Laboratoire de Virologie Végétale, RLP-Agroscience GmbH/Alplanta-Institute for Plant Research, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail, Contrat : 2012-SA-0121, Superviseur : Xavier Tassus, Commanditaire : Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (France), Type de commande : Commande avec contrat/convention/lettre de saisine, Date de signature : 2012-07-02, Unité de Chimie Environnementale et Interactions sur le Vivant, Unité de recherche Zoologie Forestière (UZF), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] (ISA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement (ECOLAB), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Biodiversité, Gènes et Communautés, Agence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du Travail ( ANSES Maisons-Alfort ), Université du Littoral Côte d’Opale ( ULCO ), Unité de recherche Zoologie Forestière ( UZF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Ecologie et Ecophysiologie Forestières [devient SILVA en 2018] ( EEF ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Lorraine ( UL ), Institut Sophia Agrobiotech [Sophia Antipolis] ( ISA ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Laboratoire Ecologie Fonctionnelle et Environnement ( EcoLab (ENSAT-Bat B) ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-PRES Université de Toulouse-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations ( UMR AMAP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Ouest] ), Indépendant, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Centre Wallon de Recherches Agronomiques ( CRA-W ), BIOlogie GEstion des Risques en agriculture - Champignons Pathogènes des Plantes ( BIOGER-CPP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Université du Littoral Côte d’Opale (ULCO)
Subjects: bactérie phytopathogène, risque phytosanitaire, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, xylella fastidiosa, risk assessment, phytopathogenic bacteria, évaluation des risques, [ SDV.SA ] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, evaluation du risque simplifiée
Abstract: En vue de possible échanges sur la présente thématique à un prochain Comité Permanent Phytosanitaire (CPP) à Bruxelles, il est demandé à l’Anses de réaliser une Evaluation du Risque Simplifiée (ERS) pour le 29/06/2012. Cette ERS devra faire notamment un bilan de la situation de Xylella fastidiosa dans le monde, détailler la biologie de la bactérie, son cycle de développement, les conditions météo et exigences climatiques nécessaires à son développement ou l’observation des symptômes, ses plantes hôtes, les moyens de contamination possibles, ainsi que les moyens de contamination possibles, ainsi que les moyens de lutte disponibles.
Published: 2012

28. Vulnerability assessment of livestock and grasslands to climate change and extreme events (VALIDATE project)

Author: X. Le Roux, Florence Volaire, Jacques Roy, F Ruget, Jean-Louis Durand, René Baumont, G A Alessio, N. Viovy, Michel Duru, L Terray, Pierre-Alain Jayet, Sandra Lavorel, Jean-François Soussana, UR 0874 Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP)-Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques (EFPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Unité de Recherches sur les Herbivores (URH), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens (UMR SYSTEM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ecologie Microbienne - UMR 5557 (LEM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers (ARCHE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Economie Publique (ECO-PUB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique (CERFACS), CERFACS, International Alliance of Research Universities (IARU). Zurich, INT., Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS), Université Paris-Saclay-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Génie et Microbiologie des Procédés Alimentaires (GMPA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National Agronomique Paris-Grignon (INA P-G), CERFACS [Toulouse], Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UM3)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial (UREP), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Université de Lyon-Université de Lyon-Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon (ENVL)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Unité de recherche sur l'Ecosystème Prairial ( UREP ) -Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques ( EFPA ), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Unité Mixte de Recherches sur les Herbivores ( UMR 1213 Herbivores ), VetAgro Sup ( VAS ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Fonctionnement et conduite des systèmes de culture tropicaux et méditerranéens ( SYSTEM ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive ( CEFE ), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 ( UM3 ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -École pratique des hautes études ( EPHE ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Laboratoire d'Ecologie Alpine ( LECA ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Université Savoie Mont Blanc ( USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry] ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Ecologie microbienne ( EM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Ecole Nationale Vétérinaire de Lyon ( ENVL ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -VetAgro Sup ( VAS ), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] ( LSCE ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes ( EMMAH ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse ( UAPV ), Agrosystèmes Cultivés et Herbagers ( ARCHE ), Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse, Economie Publique ( ECO-PUB ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech, and Centre Européen de Recherche et de Formation Avancée en Calcul Scientifique ( CERFACS )
Subjects: Biodiversité et Ecologie, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE.MCG]Environmental Sciences/Global Changes, Vulnerability, Climate change, changement climatique, prairie, Biodiversity and Ecology, Environmental protection, Milieux et Changements globaux, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, modélisation, 2. Zero hunger, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business.industry, Environmental resource management, Extreme events, 15. Life on land, [ SDE.MCG ] Environmental Sciences/Global Changes, Geography, 13. Climate action, cheptel, Livestock, adaptation au changement climatique, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business
Abstract: International audience
Published: 2009

29. Gestion durable des ressources naturelles en plaine céréalière : le rôle central des milieux pérennes dans les agro-écosystèmes céréaliers : Rapport final du projet ANR 2005 'ECCO'

Author: Badenhausser , Isabelle, Bretagnolle , Vincent, Chauvel , Bruno, Cosson , Jean-Francois, Darmency , Henri, Houte , Sylvie, Inchausti , Pablo, Larzak , El Ghali, Lemaire , Gilles, Mari , Jean-François, Mediene , Safia, Munier-Jolain , Nicolas, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre d'études biologiques de Chizé (CEBC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie et Gestion des Adventices (BGA), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 (CEBC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR), UR 0055 SAD ASTER, Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications (LORIA), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agronomie, AgroParisTech-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), ANR, auto-saisine, Absent, Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de La Rochelle (ULR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Agro-Systèmes Territoires Ressources Mirecourt (ASTER Mirecourt), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Lorraine (UL)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Superviseur : Vincent Bretagnolle, Partenaires : Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), AgroParisTech, Centre d'Études Biologiques de Chizé (CEBC), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), UPR 1934 Centre d'Etudes Biologiques de Chizé. CEBC, Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Biologie et Gestion des Adventices ( BGA ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations ( CBGP ), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement ( CIRAD ) -Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques ( Montpellier SupAgro ) -Institut national de la recherche agronomique [Montpellier] ( INRA Montpellier ) -Université de Montpellier ( UM ) -Institut de Recherche pour le Développement ( IRD [France-Sud] ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro ), Centre d'Études Biologiques de Chizé - UMR 7372 ( CEBC ), Université de La Rochelle ( ULR ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications ( LORIA ), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique ( Inria ) -Université de Lorraine ( UL ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -AgroParisTech
Subjects: [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, prairies, conservation, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, itinéraires techniques, agriculture, biodiversité
Abstract: Localisation : ERIST Lusignan, DOCLUS-TP10811, SDAR, Poitou-Charentes; absent
Published: 2008

30. Land Use History Shifts In Situ Fungal and Bacterial Successions following Wheat Straw Input into the Soil

Author: Abad Chabbi, Tiffanie Reignier, Lionel Ranjard, Xavier Charrier, Pierre-Alain Maron, Christophe de Berranger, Céline Faivre-Primot, Vincent Tardy, Samuel Dequiedt, Sébastien Terrat, Agroécologie [Dijon], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), UE 1373 Fourrages Environnement Ruminants Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage (PHASE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Environnement et Agronomie (E.A.)-Biologie et Amélioration des Plantes (BAP)-Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), ANR Systerra project DIMIMOS (ANR-08-STRA-06), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères ( P3F ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), and Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage ( PHASE ) -Environnement et Agronomie ( E.A. ) -Biologie et Amélioration des Plantes ( BAP ) -Fourrages Environnement Ruminants Lusignan ( FERLUS )
Subjects: [ SDV.BV ] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Biodiversité et Ecologie, Climate, Biodiversity, Ribotyping, Decomposer, Soil management, Soil, Soil Microbiology, Triticum, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Vegetal Biology, communauté microbienne, Multidisciplinary, Plant Stems, Ecology, Microbiota, food and beverages, Soil chemistry, Agriculture, Phosphorus, 04 agricultural and veterinary sciences, Grassland, bactérie du sol, Agricultural soil science, Medicine, France, Seasons, activité microbienne du sol, Soil microbiology, Research Article, Crops, Agricultural, Nitrogen, Science, Soil biology, Biology, Poaceae, Biodiversity and Ecology, 03 medical and health sciences, blé, Species Specificity, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, pratique culturale, 030304 developmental biology, [ SDE.BE ] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Bacteria, Fungi, Soil carbon, 15. Life on land, Carbon, Agronomy, 040103 agronomy & agriculture, Microbial Interactions, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, champignon du sol, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, human activities, Biologie végétale
Abstract: Soil microbial communities undergo rapid shifts following modifications in environmental conditions. Although microbial diversity changes may alter soil functioning, the in situ temporal dynamics of microbial diversity is poorly documented. Here, we investigated the response of fungal and bacterial diversity to wheat straw input in a 12-months field experiment and explored whether this response depended on the soil management history (grassland vs. cropland). Seasonal climatic fluctuations had no effect on the diversity of soil communities. Contrastingly fungi and bacteria responded strongly to wheat regardless of the soil history. After straw incorporation, diversity decreased due to the temporary dominance of a subset of copiotrophic populations. While fungi responded as quickly as bacteria, the resilience of fungal diversity lasted much longer, indicating that the relative involvement of each community might change as decomposition progressed. Soil history did not affect the response patterns, but determined the identity of some of the populations stimulated. Most strikingly, the bacteria Burkholderia, Lysobacter and fungi Rhizopus, Fusarium were selectively stimulated. Given the ecological importance of these microbial groups as decomposers and/or plant pathogens, such regulation of the composition of microbial successions by soil history may have important consequences in terms of soil carbon turnover and crop health.
Published: 2015

31. Narrowing uncertainties in the effects of elevated CO2 on crops

Author: Kenneth J. Boote, Franz Badeck, Thomas A. M. Pugh, Andrej Ceglar, Gerard W. Wall, Remi Lecerf, Raúl López-Lozano, Matteo Zampieri, Andrea Toreti, Håkan Pleijel, Jean-Louis Durand, Frank Dentener, Remy Manderscheid, Francesco N. Tubiello, Gerald Moser, Christoph Müller, Bruce A. Kimball, Senthold Asseng, Erik Mencos Contreras, Garry O'Leary, Xuhui Wang, Eline Vanuytrecht, Cynthia Rosenzweig, Delphine Deryng, Stefano Galmarini, Heidi Webber, Maurits van den Berg, Petra Hoegy, European Commission - Joint Research Centre [Ispra] (JRC), NewClimate Institute, IRI THESys, Humboldt State University (HSU), Leibniz-Zentrum für Agrarlandschaftsforschung = Leibniz Centre for Agricultural Landscape Research (ZALF), Food and Agriculture Organization of the United Nations [Rome, Italie] (FAO), Potsdam Institute for Climate Impact Research (PIK), USDA Agricultural Research Service [Maricopa, AZ] (USDA), United States Department of Agriculture (USDA), Justus-Liebig-Universität Gießen (JLU), University of Florida [Gainesville] (UF), University of Birmingham [Birmingham], Lund University [Lund], Flemish Institute for Technological Research (VITO), Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven), University of Gothenburg (GU), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Laboratoire des Sciences du Climat et de l'Environnement [Gif-sur-Yvette] (LSCE), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Sino-French Institute for Earth System Science, College of Urban and Environmental Sciences, Peking University [Beijing], Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l’analisi dell’economia agraria (CREA), University of Hohenheim, Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agriculture Victoria (AgriBio), Thünen Institute of Biodiversity, NASA Goddard Institute for Space Studies (GISS), NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Center for Climate Systems Research [New York] (CCSR), Columbia University [New York], Justus-Liebig-Universität Gießen = Justus Liebig University (JLU), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l’analisi dell’economia agraria = Council for Agricultural Research and Economics (CREA)
Subjects: 0106 biological sciences, CARBON-DIOXIDE ENRICHMENT, PROTEIN-CONCENTRATION, 010504 meteorology & atmospheric sciences, Natural resource economics, Climate change, Nutritional quality, 01 natural sciences, Crop, WHEAT-GRAIN QUALITY, FUTURE CO2, USE EFFICIENCY, Sustainable agriculture, Precipitation, ATMOSPHERIC CO2, Agricultural productivity, [SDU.ENVI]Sciences of the Universe [physics]/Continental interfaces, environment, 0105 earth and related environmental sciences, [SDU.OCEAN]Sciences of the Universe [physics]/Ocean, Atmosphere, 2. Zero hunger, Carbon dioxide in Earth's atmosphere, Science & Technology, FACE EXPERIMENT, business.industry, FOOD SECURITY, fungi, food and beverages, 15. Life on land, CLIMATE-CHANGE IMPACT, MODEL, 13. Climate action, Agriculture, Food Science & Technology, Environmental science, Animal Science and Zoology, business, Life Sciences & Biomedicine, Agronomy and Crop Science, 010606 plant biology & botany, Food Science
Abstract: International audience; Plant responses to rising atmospheric carbon dioxide (CO2) concentrations, together with projected variations in temperature and precipitation will determine future agricultural production. Estimates of the impacts of climate change on agriculture provide essential information to design effective adaptation strategies, and develop sustainable food systems. Here, we review the current experimental evidence and crop models on the effects of elevated CO2 concentrations. Recent concerted efforts have narrowed the uncertainties in CO2-induced crop responses so that climate change impact simulations omitting CO2 can now be eliminated. To address remaining knowledge gaps and uncertainties in estimating the effects of elevated CO2 and climate change on crops, future research should expand experiments on more crop species under a wider range of growing conditions, improve the representation of responses to climate extremes in crop models, and simulate additional crop physiological processes related to nutritional quality.Understanding of the effects of elevated CO2 on crops has improved sufficiently that modelling future climatic effects on agriculture should eliminate 'no CO2' simulations. Further advancement in the estimation of the effects can be realized by studying a wider variety of crop species under a wider range of growing conditions, improving the representation of responses to climate extremes in crop models and simulating additional crop physiological processes related to nutritional quality.
Published: 2020

32. Dynamic of 16 fodder trees' nutritive values from June to October

Author: Geoffrey Mesbahi, Philippe Barre, Rémy Delagarde, Fabien Bourgoin, Romain Perceau, Sandra Novak, Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Physiologie, Environnement et Génétique pour l'Animal et les Systèmes d'Elevage [Rennes] (PEGASE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ADEME (PARASOL), French Ministry of Agriculture and Food (Casdar Arbele) and Fondation de France (Patura3D)., European Project: 613520,EC:FP7:KBBE,FP7-KBBE-2013-7-single-stage,AGFORWARD(2014), Mesbahi, Geoffrey, and AGFORWARD - AGFORWARD - - EC:FP7:KBBE2014-01-01 - 2017-12-31 - 613520 - VALID
Subjects: [SDV.SA.AGRO] Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, digestibility, crude protein, temperate region, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, livestock production, feeding value
Abstract: International audience; Trees could help to reduce livestock production vulnerability to climate change by providing a fodder resource during periods of drought. Fodder trees are commonly used in tropical and Mediterranean areas, but they remain poorly studied in temperate regions. Previous studies highlighted that leaves of some tree fodder species have nutritive values close to those of herbaceous forages in summer (e.g. Mahieu et al. 2021). However, little is known about the variation in nutritive value of fodder trees throughout their growing period, from June to October (i.e from early summer to autumn). This study focused on 16 tree species sampled in June, August and October, from 2014 to 2017, in 22 French locations (Acer pseudoplatanus, Alnus cordata, Castanea sativa, Corylus avellana, Fagus sylvatica, Fraxinus americana, Fraxinus excelsior, Gleditsia triacanthos, Juglans x intermedia, Morus alba, Paulownia tomentosa, Prunus avium, Robinia pseudoacacia, Sorbus domestica, Ulmus minor, Ulmus ‘Nanguen’; n = 292). Leaf samples were analysed to determine their in vitro dry matter digestibility (IVDMD) and their contents in dry matter (DM), ash, crude protein (CP), neutral detergent fibre (NDF), acid detergent fibre (ADF) and acid detergent lignin (ADL). The seasonal variation of these variables was analysed using a linear mixed model and estimated marginal means. Sampling location and year were used as random factors.Our results highlighted divergent seasonal dynamics depending on the nutritive values (Figure 1). Only leaf CP decreased from June to August and from August to October (P ≤ 0.001). DM, ash content and IVDMD decreased from June to August (P ≤ 0.001), but had weak evidence to evolve from August to October (P > 0.05). We found no evidence of seasonal variation for NDF, ADF and ADL (P > 0.1). The dynamics of IVDMD, CP, NDF, ADF and ADL were similar of those observed by Vandermeulen et al. (2018), who focused on different temperate tree species. Castanea sativa was the only species to strongly improve CP (from 140 g/kg in June to 172 g/kg in August). Robinia pseudoacacia increased NDF, ADF and ADL from June to August and Fraxinus americana decreased mineral content from August to October, while other species mainly remained constant. Robinia pseudoacacia behaviour was similar to the results of Papachristou et al. (1999), but few studies focused on the seasonal variability of the studied species. However, the effects of species could be higher than those of season, as previously showed (Wood et al. 1994; Ravetto Enri et al. 2020).Our results as well as bibliography references highlighted specific dynamics between the different components of the nutritive value, as well as diversity among species in the seasonal variability. More studies are now required to better characterise the variation in nutritive value of tree fodder species across seasons, their biomass production and palatability.
Published: 2022

33. PSDR4 Flèche -L'herbe : un atout pour les élevages caprins du Grand Ouest

Author: Caillat, Hugues, Delagarde, Remy, Ferlay, Anne, Barre, Philippe, Disenhaus, Catherine, Gaborit, Patrice, Giger-Reverdin, Sylvie, Jacquot, Anne-Lise, Jenot, Frantz, Leroux, Benoît, Wimmer-Bonneau, Emilie, Verdier, Géraldine, Jost, Jérémie, Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), ACTALIA Produits laitiers, Modélisation Systémique Appliquée aux Ruminants (MoSAR), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Les chevriers de Nouvelle-Aquitaine & Vendée, Partenaires INRAE, Groupe de REcherches Sociologiques sur les sociétés COntemporaines (GRESCO), Université de Poitiers-Institut Sciences de l'Homme et de la Société (IR SHS UNILIM), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Établissement Public Local d’Enseignement et de Formation Professionnelle Agricole (EPLEFPA), Bureau Régional Interprofessionnel du Lait de Chèvre de Charentes-Poitou et des Pays de la Loire (BRILAC), Institut de l'élevage, and soutien financier accordé par le 4e programme PSDR (INRAE, Institut Agro-Agrocampus Ouest et Régions Bretagne, Normandie, Nouvelle-Aquitaine et Pays de la Loire) dans le cadre du projet Flèche.
Subjects: Prairies, [SDV]Life Sciences [q-bio], Fromages, Filière, Grassland, Pâturage, Sustainability, Cheese, [SDE]Environmental Sciences, Goat, Pasture, Dairy goat sector, Durabilité, Chèvre
Abstract: One of challenges of the French dairy goat sector is to develop, promote and support the development of sustainable farming systems. French dairy goat farms are strong users of grass, used mainly in hay, butthe feeding self-sufficiency of these farms remains relatively low (on average 61%). Greater use of herb is a technical solution to respond this societal demand, reduce feeding costs and the environmental footprint. On the 2015-2020 period, a strong mobilization of Research and Development stakeholders in the PSDR4 Flèche to understand the grass use place and level in dairy goat farming systems, to determine its technical and sociological pros and obstacles, and to provide scientific and technicalknowledge. This project has made it possible to acquire new knowledge on the use of multi-species grasslands by dairy goats, their use level and the nutritional qualities of milks and cheeses. Associatedwith agricultural education, the agroecological transition of goat farms can take place to make them more sustainable, more competitive and more resilient to hazards, especially in a context of climate change; Un des enjeux de la filière caprine française est de mettre au point, promouvoir et accompagner le développement de systèmes de production plus durables. Cependant, malgré une forte utilisation del’herbe, principalement sous forme de foin, l’autonomie alimentaire des exploitations caprines françaises techniques pour répondre aux exigences sociétales en matière d’élevage, mais également pour réduirele coût alimentaire et l’empreinte environnementale. Sur la période 2015-2020, les acteurs de la recherche, du développement et de la formation se sont mobilisés dans le projet PSDR4 Flèche pourcomprendre la place et le niveau de valorisation de l’herbe dans les systèmes caprins, d’en déterminer les avantages et les freins techniques et sociologiques, et d’apporter des références scientifiques ettechniques sur son utilisation. Ce projet a ainsi permis d’acquérir de nouvelles connaissances sur l’utilisation des prairies multi-espèces par les chèvres, leur niveau de valorisation et les qualitésnutritionnelles des laits et des fromages des systèmes herbagers. Associé à l’enseignement agricole, la transition agro-écologique des élevages caprins peut s’opérer pour les rendre plus durables, compétitifset résilients aux aléas, tout particulièrement dans un contexte de changement climatique.
Published: 2022

34. Editorial: Carbon storage in agricultural and forest soils

Author: Chabbi, A., Rumpel, C., Hagedorn, F., Schrumpf, M., Baveye, P., Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research WSL, Max Planck Institute for Biogeochemistry (MPI-BGC), Max-Planck-Gesellschaft, and Saint Loup Research Institute
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, climate change, soil organic matter, [SDV.BDLR]Life Sciences [q-bio]/Reproductive Biology, soil functions, greenhouse gas production, ecosystem services, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, General Environmental Science
Abstract: International audience
Published: 2022

35. Pesticide-free agriculture as a new paradigm for research

Author: Florence Jacquet, Marie-Hélène Jeuffroy, Julia Jouan, Edith Le Cadre, Isabelle Litrico, Thibaut Malausa, Xavier Reboud, Christian Huyghe, Montpellier Interdisciplinary center on Sustainable Agri-food systems (Social and nutritional sciences) (UMR MoISA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Agronomie, AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Sol Agro et hydrosystème Spatialisation (SAS), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UCA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon, Collège de Direction (CODIR), and This work was supported by the French Priority Research Program 'Cultiver et Protéger Autrement.'
Subjects: Environmental Engineering, Cropping systems, Epidemiological surveillance, [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, [SDV.SA.AEP]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agriculture, economy and politics, Breeding, Mission-oriented research, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, Biological control, [SDV.SA.STA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of agriculture, Digital agriculture, Pest regulation, Microbiome, Collective action, Agronomy and Crop Science
Abstract: Reducing pesticide use has become a goal shared by several European countries and a major issue in public policies due to the negative impacts of pesticides on the environment and on human health. However, since most of the agri-food sector relies on pesticides in these countries, substantially reducing pesticide use is a complex issue. To overcome this situation, we argue that agricultural research has a major role to play and must adopt a pesticide-free paradigm to expect a deep impact on pesticide use. In this article, we explain why this new paradigm is needed and outline research fronts that it will help address. These research fronts are related to five strategies: (1) redesigning cropping systems to enhance prophylaxis, (2) diversifying biocontrol strategies and associated business models, (3) broadening the scope of plant breeding to include functional biodiversity and evolutionary ecology concepts, (4) setting new goals for agricultural machinery and digital technologies, and (5) supporting development of public policies and private initiatives for the transition toward pesticide-free agri-food systems. The corresponding research activities must be managed conjointly to develop systemic and coupled innovations, which are essential for reducing pesticide use significantly. We therefore provide examples of cross-cutting objectives that combine these fronts while also highlighting the need for interdisciplinary research projects. By doing so, we provide an overall orientation for research to achieve sustainable agriculture.
Published: 2022

36. Current NPP cannot predict future soil organic carbon sequestration potential. Comment on 'Photosynthetic limits on carbon sequestration in croplands'

Author: Budiman Minasny, Dominique Arrouays, Rémi Cardinael, Abad Chabbi, Mark Farrell, Beverley Henry, Lydie-Stella Koutika, Jagdish K. Ladha, Alex. B. McBratney, Jose Padarian, Mercedes Román Dobarco, Cornelia Rumpel, Pete Smith, Jean-François Soussana, The University of Sydney, InfoSol (InfoSol), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Agroécologie et Intensification Durables des cultures annuelles (UPR AIDA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), University of Zimbawe [Harare] (UZ), University of Zimbawe, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CSIRO Agriculture and Food (CSIRO), Queensland University of Technology [Brisbane] (QUT), Centre de Recherche sur la Durabilité et la Productivité des Plantations Industrielles (CRDPI), University of California [Davis] (UC Davis), University of California (UC), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and University of Aberdeen
Subjects: [SDE]Environmental Sciences, Soil Science
Abstract: International audience
Published: 2022

37. Land-use intensification differentially affects bacterial, fungal and protist communities and decreases microbiome network complexity

Author: Sana Romdhane, Aymé Spor, Samiran Banerjee, Marie-Christine Breuil, David Bru, Abad Chabbi, Sara Hallin, Marcel G. A. van der Heijden, Aurélien Saghai, Laurent Philippot, University of Zurich, Philippot, Laurent, Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), North Dakota State University (NDSU), Agroscope, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), and Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH)
Subjects: Microbial communities, 580 Plants (Botany), Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, complex mixtures, 03 medical and health sciences, 10126 Department of Plant and Microbial Biology, 1311 Genetics, Genetics, 2402 Applied Microbiology and Biotechnology, GE1-350, 10211 Zurich-Basel Plant Science Center, Land-use intensification, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, 2404 Microbiology, fungi, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, 15. Life on land, QR1-502, Environmental sciences, Microbiology (Microbiology in the medical area to be 30109), [SDE]Environmental Sciences, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Networks, Research Article
Abstract: Background Soil microbial communities are major drivers of cycling of soil nutrients that sustain plant growth and productivity. Yet, a holistic understanding of the impact of land-use intensification on the soil microbiome is still poorly understood. Here, we used a field experiment to investigate the long-term consequences of changes in land-use intensity based on cropping frequency (continuous cropping, alternating cropping with a temporary grassland, perennial grassland) on bacterial, protist and fungal communities as well as on their co-occurrence networks. Results We showed that land use has a major impact on the structure and composition of bacterial, protist and fungal communities. Grassland and arable cropping differed markedly with many taxa differentiating between both land use types. The smallest differences in the microbiome were observed between temporary grassland and continuous cropping, which suggests lasting effects of the cropping system preceding the temporary grasslands. Land-use intensity also affected the bacterial co-occurrence networks with increased complexity in the perennial grassland comparing to the other land-use systems. Similarly, co-occurrence networks within microbial groups showed a higher connectivity in the perennial grasslands. Protists, particularly Rhizaria, dominated in soil microbial associations, as they showed a higher number of connections than bacteria and fungi in all land uses. Conclusions Our findings provide evidence of legacy effects of prior land use on the composition of the soil microbiome. Whatever the land use, network analyses highlighted the importance of protists as a key element of the soil microbiome that should be considered in future work. Altogether, this work provides a holistic perspective of the differential responses of various microbial groups and of their associations to agricultural intensification.
Published: 2022

38. Breeding for Economically and Environmentally Sustainable Wheat Varieties: An Integrated Approach from Genomics to Selection

Author: Etienne Paux, Stéphane Lafarge, François Balfourier, Jérémy Derory, Gilles Charmet, Michael Alaux, Geoffrey Perchet, Marion Bondoux, Frédéric Baret, Romain Barillot, Catherine Ravel, Pierre Sourdille, Jacques Le Gouis, on behalf of the BREEDWHEAT Consortium, Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales (GDEC), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Limagrain Centre de Recherche – Route d’Ennezat – 63720 Chappes, France, Unité de Recherche Génomique Info (URGI), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris-Saclay, INRAE, BioinfOmics, Plant Bioinformatics Facility, Versailles, France (BioinfOmics, Plant Bioinformatics Facility), Vegepolys Valley, INRAE Transfert, Environnement Méditerranéen et Modélisation des Agro-Hydrosystèmes (EMMAH), Avignon Université (AU)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), 2013-0544, FSOV-2012D, ANR-10-BTBR-0003,BREEDWHEAT,Développer de nouvelles variétés de blé pour une agriculture durable(2010), and ANR-11-INBS-0012,PHENOME,Centre français de phénomique végétale(2011)
Subjects: Triticum aestivum, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, General Immunology and Microbiology, QH301-705.5, [SDV]Life Sciences [q-bio], high throughput phenotyping, food and beverages, Review, molecular tools, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, diversity, genomic selection, wheat, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, wheat breeding, Biology (General), General Agricultural and Biological Sciences, wheat database
Abstract: Simple Summary The BREEDWHEAT project has laid the foundation for future commercial varieties by providing new and original modern molecular tools to breeders who have applied them to: (1) efficiently analyze and structure the genetic diversity; (2) decipher traits of agronomical interest including biotic and abiotic resistance and tolerance; (3) develop methodologies to implement genomic and phenomic selection; (4) store and bring tools to the world wheat community to access all of the results and data. This will provide a helping hand to developing new original and adapted wheat varieties that will be more productive in terms of the quantity and quality in the context of sustainable agriculture using less fertilizers, pesticides, fungicides, and water. This would help in tackling the challenges that we have to face, especially with regard to global change. Abstract There is currently a strong societal demand for sustainability, quality, and safety in bread wheat production. To address these challenges, new and innovative knowledge, resources, tools, and methods to facilitate breeding are needed. This starts with the development of high throughput genomic tools including single nucleotide polymorphism (SNP) arrays, high density molecular marker maps, and full genome sequences. Such powerful tools are essential to perform genome-wide association studies (GWAS), to implement genomic and phenomic selection, and to characterize the worldwide diversity. This is also useful to breeders to broaden the genetic basis of elite varieties through the introduction of novel sources of genetic diversity. Improvement in varieties particularly relies on the detection of genomic regions involved in agronomical traits including tolerance to biotic (diseases and pests) and abiotic (drought, nutrient deficiency, high temperature) stresses. When enough resolution is achieved, this can result in the identification of candidate genes that could further be characterized to identify relevant alleles. Breeding must also now be approached through in silico modeling to simulate plant development, investigate genotype × environment interactions, and introduce marker–trait linkage information in the models to better implement genomic selection. Breeders must be aware of new developments and the information must be made available to the world wheat community to develop new high-yielding varieties that can meet the challenge of higher wheat production in a sustainable and fluctuating agricultural context. In this review, we compiled all knowledge and tools produced during the BREEDWHEAT project to show how they may contribute to face this challenge in the coming years.
Published: 2022

39. Interactions Between Environment and Genetic Diversity in Perennial Grass Phenology: A Review of Processes at Plant Scale and Modeling

Author: Simon Rouet, Romain Barillot, Denis Leclercq, Marie-Hélène Bernicot, Didier Combes, Abraham Escobar-Gutiérrez, Jean-Louis Durand, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité expérimentale du GEVES de Lusignan, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), and Groupe d'Etude et de Contrôle des Variétés et des Semences (GEVES)
Subjects: grasslands, perennial grasses, Plant culture, food and beverages, temperature, Review, Plant Science, photoperiod, phenology, SB1-1110, heading date, climate change, [SDE]Environmental Sciences, phenological models
Abstract: International audience; In perennial grasses, the reproductive development consists of major phenological stages which highly determine the seasonal variations of grassland biomass production in terms of quantity and quality. The reproductive development is regulated by climatic conditions through complex interactions subjected to high genetic diversity. Understanding these interactions and their impact on plant development and growth is essential to optimize grassland management and identify the potential consequences of climate change. Here, we review the main stages of reproductive development, from floral induction to heading, i.e., spike emergence, considering the effect of the environmental conditions and the genetic diversity observed in perennial grasses. We first describe the determinants and consequences of reproductive development at individual tiller scale before examining the interactions between plant tillers and their impact on grassland perenniality. Then, we review the available grassland models through their ability to account for the complexity of reproductive development and genetic × environmental interactions. This review shows that (1) The reproductive development of perennial grasses is characterized by a large intraspecific diversity which has the same order of magnitude as the diversity observed between species or environmental conditions. (2) The reproductive development is determined by complex interactions between the processes of floral induction and morphogenesis of the tiller. (3) The perenniality of a plant is dependent on the reproductive behavior of each tiller. (4) Published models only partly explain the complex interactions between morphogenesis and climate on reproductive development. (5) Introducing more explicitly the underlying processes involved in reproductive development in models would improve our ability to anticipate grassland behavior in future growth conditions.
Published: 2021
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40. Do grassland management practices affect soil lignin chemistry by changing the composition of plant-derived organic matter input?

Author: Cornelia Rumpel, Aliia Gilmullina, Katja Klumpp, Abad Chabbi, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie fonctionnelle et écotoxicologie des agroécosystèmes (ECOSYS), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité Mixte de Recherche sur l'Ecosystème Prairial - UMR (UREP), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Mowing, Lignin monomer ratios, Soil Science, Plant Science, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, Grazing, Lignin, Organic matter, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Soil organic matter, Input quality, Biogeochemistry, 04 agricultural and veterinary sciences, Soil carbon, 15. Life on land, Plant litter, Grassland, chemistry, Agronomy, 040103 agronomy & agriculture, Litter, 0401 agriculture, forestry, and fisheries
Abstract: International audience; Background and aims Grassland management practices alter plant litter input into soil in terms of quantity and quality via defoliation, nutrient input and trampling. These alterations may impact litter decomposition and soil organic matter (SOM) quality and quantity. Here, we aimed to investigate the effect of four grassland management practices (unmanaged, low and high intensity grazing, and mowing) on organic matter (OM) input quality and its relation with SOM composition. Methods We considered three types of OM input: aboveground and belowground material from living plants and partly degraded aboveground litter. We assessed their quality based on their elemental (C and N) contents, their stable carbon isotope (C-13) and their lignin composition. Results The results showed that C/N ratios differed among plant-derived OM input types but did not vary among treatments. In contrast, lignin biogeochemistry and lignin/N ratios of plant tissues were differentiated according to input type and treatment. High grazing intensity resulted in the lowest lignin/N ratios of aboveground litter. Lignin chemistry of all plant OM input types under grazing treatments indicated low maturity stage. Despite the similar lignin contribution to soil carbon under all grassland management practices, soil lignin was more degraded under mowing than under the other practices. Conclusions We conclude that grassland management may have an impact on SOM composition by altering plant OM input composition rather than its stoichiometry.
Published: 2021

41. Genomics assisted breeding in alfalfa

Author: Julier, Bernadette, Pégard, Marie, Leuenberger, Julien, Barre, Philippe, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Julier, Bernadette
Subjects: [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, [SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, Alfalfa, breeding, genomics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021

42. Mobilizing sorghum genetic diversity: Biochemical and histological‐assisted design of a stem ideotype for biomethane production

Author: Barotin, Charlène, Bonnal, Laurent, Andueza, Donato, Trupin-Maudemain, Séverine, Jost, Jérémie, Caillat, Hugues, Julien, Lionel, Juanes, Xavier, Lesnoff, Matthieu, Assouma, Mohamed-Habibou, Picard, Fabienne, Fumat, Norbert, El Radi, Hadi, Barre, Philippe, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Systèmes d'élevage méditerranéens et tropicaux (UMR SELMET), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Environnements et Sociétés (Cirad-ES), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores - UMR 1213 (UMRH), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ARVALIS - Institut du Végétal [Boigneville], ARVALIS - Institut du végétal [Paris], Institut de l'élevage (IDELE), Fourrages Environnement Ruminants Lusignan (FERLUS), and ANR-11-BTBR-0006,BFF,Biomasse pour le futur(2011)
Subjects: anaerobic digestion, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, animal feed, internode anatomy, [SDV]Life Sciences [q-bio], sorghum, genetic diversity, heritability, stem composition, combustion, ideotype
Abstract: International audience; Sorghum currently contributes to the species portfolio that is supporting bioenergy production including anaerobic digestion. Although agro-morphological ideotypes maximizing biogas production have been recently proposed, there is a crucial need to refine our understanding of the impacts of the stem composition and structure on this processing trait in order to ensure genetic gains in the mid to long terms. This study aims to assess the potential of Sorghum bicolor ssp bicolor stem genetic diversity to maximize genetic gains for biogas production and define a biogas stem ideotype. In this context, a panel of 57 genotypes, encompassing most of the stem composition variability available in cultivated sorghum, was characterized over five sites. Simultaneous histological and biochemical characterizations were performed. A high broad sense heritability associated with a moderate genetic variability was detected for stem biogas potential ensuring significant genetic gains in the future. In addition, the development of a stem histological phenotyping pipeline made it possible to describe the genetic diversity available for the internode anatomy and the repartition of key cell wall components. Consistently with previous studies, moderate to high heritability was observed for stem biochemical components. Genetic correlation, hierarchical clustering, and multiple stepwise regression analyses identified soluble sugar content as the first main driver of biogas potential genetic variability. Nevertheless, breeding programs should anticipate that biogas yield improvement will also rely on the monitoring of the cell wall components and their distribution in the stem jointly with the soluble sugar content. According to the assets of sorghum in terms of adaptation to environmental stresses and the present results regarding the identification of stem ideotypes suitable for different value chains, this species will surely play a key role to optimize the economic and environmental sustainability of the agrosystems that are currently facing the effects of climate change.
Published: 2021

43. New insights on the genetic structure of lucerne with GBS markers

Author: Pégard, Marie, Barre, Philippe, Julier, Bernadette, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Julier, Bernadette
Subjects: Medicago sativa L, [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, genetic resources, [SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, breeding, SNP, alfalfa
Abstract: International audience; GBS markers at the population level were used to study the genetic structure of lucerne in a set of 395 accessions from Europe, North and South America and China. More than 100K SNP without missing data were obtained. The structure revealed a certain genetic distance between European and American accessions, with a continuous variation between these groups. Contrastingly, Chinese accessions were genetically separated from the other accessions. This analysis is an invitation to go more deeply into a phenotypic analysis of these genetic resources to exploit them in breeding.
Published: 2021

44. Optimisation of GBS protocols for efficient genotyping of forage species

Author: Julier, Bernadette, Blugeon, Sébastien, Delaunay, Sabrina, Mappa, Gaëtan, Ruttink, Tom, Pégard, Marie, Barre, Philippe, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Research Institute for Agricultural, Fisheries and Food (ILVO), and Julier, Bernadette
Subjects: [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, cocksfoot, [SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, bacteria, heterozygous, SNP, lucerne, polyploidy
Abstract: International audience; GBS is an efficient genotyping tool for heterozygous and polyploid species, yet the fraction of missing data, inherent to the method, may be detrimental to genetic analyses. We tested several restriction enzymes to choose the ones that were likely to provide the maximum number of loci with little missing data considering a certain sequencing effort. For lucerne and cocksfoot, the enzymes that met the target of about 10 000 loci were the combination of PstI-MseI for lucerne and PstI for cocksfoot. 1 066 lucerne accessions were genotyped with PstI-MseI, and more than 200 000 SNP with less than 5% missing data were obtained. Based on these results, we recommend performing such a test to optimize GBS genotyping efforts in forage species.
Published: 2021

45. Genomic prediction of lucerne forage yield and quality

Author: Pégard, Marie, Leuenberger, Julien, Julier, Bernadette, Barre, Philippe, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Julier, Bernadette
Subjects: [SDV.GEN.GPL]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, [SDV.GEN.GPL] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Plants genetics, GBS, alfalfa, genomic selection
Abstract: International audience; Genomic prediction has proven its efficiency in numerous animal and plant species. In this study, we used diverse lucerne varieties and populations to test the predicting ability of genomic prediction. Several parameters, such as the number of markers, the population size and the addition of QTL effects, were tested for their effect on the quality of prediction. Based on a large number of SNPs (227 K) obtained by GBS and phenotypes observed in different locations, our results showed a good quality of predicting ability for dry matter yield, ADF (acid detergent fiber) and protein content, especially with a large training population size (around 0.6). The predicting ability is improved by the integration of QTL information directly in the model (above 0.8). A reduction of number of markers (less than 100K) did not alter much the predictive ability. Our results show an accurate prediction of the phenotype of populations via genomic prediction models that could speed up the creation of new lucerne varieties.
Published: 2021

46. Interspecific interactions regulate plant reproductive allometry in cereal-legume intercropping systems

Author: Isabelle Litrico, Etienne-Pascal Journet, Christophe Naudin, Elise Pelzer, Antoine Couëdel, Bochra Kammoun, Philippe Hinsinger, Florian Fort, Eric Justes, Catherine Bonnet, Laurent Bedoussac, Nathalie Moutier, Pierre Casadebaig, Henrik Hauggaard-Nielsen, Cyrille Violle, Guénaëlle Corre-Hellou, Rémi Mahmoud, Erik Steen Jensen, Safia Médiène, Xavier Gendre, Noémie Gaudio, AGroécologie, Innovations, teRritoires (AGIR), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace (ISAE-SUPAERO), Agronomie, AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Roskilde Universitet [Roskilde], École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA), Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement (LIPME), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Direction du département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Direction Persyst), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire d'Analyse, Topologie, Probabilités (LATP), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech, Roskilde University, Unité Expérimentale Forestière Méditerranéenne (UEFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Légumineuses, Ecophysiologie Végétale, Agroécologie (LEVA), Ecole supérieure d'Agricultures d'Angers (ESA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Agrosystèmes Biodiversifiés (UMR ABSys), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre International de Hautes Etudes Agronomiques Méditerranéennes - Institut Agronomique Méditerranéen de Montpellier (CIHEAM-IAMM), Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Centre International de Hautes Études Agronomiques Méditerranéennes (CIHEAM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier, Département Performances des systèmes de production et de transformation tropicaux (Cirad-PERSYST), Unité de recherches de génétique et amélioration des plantes, ANR-16-CONV-0004,DIGITAG,Institut Convergences en Agriculture Numérique(2016), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Cropping Systems Ecology, Department of Biosystems and Technology, Box 103, SE-230 53 Alnarp, Sweden, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-AGROCAMPUS OUEST, H2020 European Research Council, Grant/Award Number: ERC-StG-2014-639706-CONSTRAINTS, Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, and European Project: 639706,H2020,ERC-2014-STG,CONSTRAINTS(2015)
Subjects: 0106 biological sciences, F08 - Systèmes et modes de culture, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.SA.AGRO]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Agronomy, F62 - Physiologie végétale - Croissance et développement, 01 natural sciences, Interactions biologiques, Plante légumière, Allométrie, media_common, 2. Zero hunger, [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, Biomass (ecology), 0303 health sciences, biology, Ecology, Intercropping, 04 agricultural and veterinary sciences, Assembly rules, Resource (biology), cereal–legume mixtures, media_common.quotation_subject, Competition (biology), Culture intercalaire, 03 medical and health sciences, Biomass allocation, [SDV.SA.STA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences/Sciences and technics of agriculture, Plant reproductive allometry, 030304 developmental biology, Plante céréalière, business.industry, Interspecific competition, 15. Life on land, Metabolic scaling theory, biology.organism_classification, Agronomy, Agriculture, 040103 agronomy & agriculture, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Système de culture, Allometry, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, business, 010606 plant biology & botany
Abstract: Calls for ecological principles in agriculture have gained momentum. Intercropping systems have long been designed by growing two, or more, annual crop species in the same field, aiming for a better resource use efficiency. However, assembly rules for their design are lacking. Notably, it is still unknown whether species performances are maximized during both the vegetative and reproductive phases given the sensitivity of reproductive allocation rules to resource limitation. Interestingly, ecological theory provides expectations regarding putative invariance of plant reproductive allometry (PRA) under non-limiting conditions for plant growth. Here we examined whether and how PRA changes in response to plant-plant interactions in intercropping systems, which can inform both ecological theory and the understanding of the functioning of intercropping systems.We analyzed a dataset of 28 field cereal-legume intercropping trials from various climatic and management conditions across Western Europe. PRA was quantified in both mixing and single-species situations.PRA was positively impacted in specific management conditions, leading to a greater increase in yield for a given increase in plant size. Variations in PRA were more beneficial for legumes grown in unfertilized mixture, which explains their use as a key component in actual intercrop systems. The response for cereals was similar but less pronounced in magnitude, and was greater under limiting resource conditions. Focusing on intercropping conditions, hierarchical competition (indicated by biomass difference between intercropped species) appears as a strong driver of the reproductive output of a given species.Synthesis and applications. Plant reproductive allometry behaves in crop species in the same way as it does in wild species. However, contrary to theoretical expectations about an overall invariance of PRA, we highlighted taxon-specific and context-dependent effects of plant-plant interactions on PRA. This systematic deviation to PRA expectations could be leveraged to cultivate each species up to its reproductive optimum while accounting for the performance of the other, whether farmer’s objective is to favor one species or to reach an equilibrium in seed production. Sowing density and cultivar choice could regulate the biomass of each component, with specific targets derived from allometric relationships, aiming for an optimal reproductive allocation in mixtures.
Published: 2021

47. Inter-annual and spatial climatic variability have led to a balance between local fluctuating selection and wide-range directional selection in a perennial grass species

Author: Thomas Keep, Fabien Surault, Isabelle Litrico, E. Willner, Klaus J. Dehmer, Philippe Barre, Tom Ruttink, Isabel Roldán-Ruiz, R Veron, Mathew Hegarty, Jean-Paul Sampoux, Hilde Muylle, Thomas Ledauphin, José Luis Blanco-Pastor, S Rouet, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Research Institute for Agricultural, Fisheries and Food (ILVO), Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research [Gatersleben] (IPK-Gatersleben), Institute of Biological, Environmental and Rural Sciences (IBERS), Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC)-Aberystwyth University, ANR-14-JFAC-0004,GrassLandscape,Bridging landscape genomics and quantitative genetics for a regional adaptation of European grasslands to climate change(2014), European Project: 618105,EC:FP7:KBBE,FP7-ERANET-2013-RTD,FACCE ERA NET PLUS(2013), and Aberystwyth University
Subjects: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Climate Change, Lolium perenne, Quantitative Trait Loci, Population, Climatic adaptation, Plant Science, Quantitative trait locus, Biology, adaptive diversity, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Lolium, genome-wide genotyping, Selection, Genetic, Allele, education, Alleles, 2. Zero hunger, Functional ecology, education.field_of_study, natural genetic diversity, Directional selection, Phenology, Ecology, perennial ryegrass, Allele diversity, food and beverages, intra-specific variability, Original Articles, climatic adaptation, 15. Life on land, Adaptation, Physiological, Genetics, Population, Phenotype, 030104 developmental biology, fluctuating selection, Adaptation, grassland, 010606 plant biology & botany
Abstract: Background and Aims The persistence of a plant population under a specific local climatic regime requires phenotypic adaptation with underlying particular combinations of alleles at adaptive loci. The level of allele diversity at adaptive loci within a natural plant population conditions its potential to evolve, notably towards adaptation to a change in climate. Investigating the environmental factors that contribute to the maintenance of adaptive diversity in populations is thus worthwhile. Within-population allele diversity at adaptive loci can be partly driven by the mean climate at the population site but also by its temporal variability. Methods The effects of climate temporal mean and variability on within-population allele diversity at putatively adaptive quantitative trait loci (QTLs) were evaluated using 385 natural populations of Lolium perenne (perennial ryegrass) collected right across Europe. For seven adaptive traits related to reproductive phenology and vegetative potential growth seasonality, the average within-population allele diversity at major QTLs (HeA) was computed. Key Results Significant relationships were found between HeA of these traits and the temporal mean and variability of the local climate. These relationships were consistent with functional ecology theory. Conclusions Results indicated that temporal variability of local climate has likely led to fluctuating directional selection, which has contributed to the maintenance of allele diversity at adaptive loci and thus potential for further adaptation.
Published: 2021

48. QTL analysis for grazing tolerance, autumn dormancy and growth habit offers prospects for marker-assisted selection in lucerne

Author: Luciano Pecetti, Bernadette Julier, Philippe Barre, Paola Lambroni, Sabrina Delaunay, Paolo Annicchiarico, Consiglio per la Ricerca in Agricoltura e l’analisi dell’economia agraria (CREA), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and ANR-12-AGRI-0006,REFORMA,Des cultures résilientes, efficaces en énergie et en eau pour la nutrition des animaux dans les systèmes agricoles méditerranéens(2012)
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, 0106 biological sciences, Germplasm, QTL, media_common.quotation_subject, Plant Science, Horticulture, Quantitative trait locus, Biology, 01 natural sciences, Genetics, Cultivar, Selection (genetic algorithm), media_common, 2. Zero hunger, Alfalfa, food and beverages, 04 agricultural and veterinary sciences, Marker-assisted selection, Agronomy, Mapping population, 040103 agronomy & agriculture, Trait, 0401 agriculture, forestry, and fisheries, Dormancy, Genotyping-by-sequencing, Habit, Agronomy and Crop Science, Medicago sativa, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; Selection of grazing-tolerant lucerne (Medicago sativa) germplasm with low autumn dormancy and erect growth habit, suitable to environments with mild winters, is hindered by genetically-based tradeoffs among these traits. Marker-assisted selection (MAS) may help overcoming the difficulty of phenotypic selection and hasten the breeding process. Over 400 progenies from four bi-parental crosses between contrasting parents from two cultivars were phenotyped for grazing tolerance and six other morpho-physiological characters. In parallel, genotyping-by-sequencing marker data were generated, with the objective to facilitate the multi-trait MAS by identifying quantitative trait loci (QTL) for the traits and assessing the extent of their co-location. In total, 9594 markers, with less than 20% missing data, segregated as simplex markers in at least one progeny family. Twenty-seven QTL were identified for six traits in the different bi-parental crosses. QTL were found to a different extent on all homology groups except homology group 4. No QTL was found for dry-matter yield before grazing imposition. The number of QTL for other traits varied from one (basal plant diameter) to nine (plant growth habit). Only for growth habit were QTL observed in all four crosses. The QTL analysis largely confirmed the association between grazing tolerance, non-erect growth habit and autumn dormancy. However, the absence of complete co-location of QTL highlighted a partly different genetic control of these traits, thereby offering scope for MAS exploitation to select genotypes carrying useful trait combinations.
Published: 2021

49. Functional-Structural Plant Models Mission in Advancing Crop Science: Opportunities and Prospects

Author: Soualihou Soualiou, Zhiwei Wang, Weiwei Sun, Philippe de Reffye, Brian Collins, Gaëtan Louarn, Youhong Song, Anhui Agriculture University (AHAU), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), James Cook University (JCU), Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and University of Queensland [Brisbane]
Subjects: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, plant architecture, plant phenotyping, assisted molecular breeding, fungi, functional-structural plant modeling, Plant culture, food and beverages, Plant Science, Review, genotype to phenotype, SB1-1110
Abstract: Functional–structural plant models (FSPMs) have been evolving for over 2 decades and their future development, to some extent, depends on the value of potential applications in crop science. To date, stabilizing crop production by identifying valuable traits for novel cultivars adapted to adverse environments is topical in crop science. Thus, this study will examine how FSPMs are able to address new challenges in crop science for sustainable crop production. FSPMs developed to simulate organogenesis, morphogenesis, and physiological activities under various environments and are amenable to downscale to the tissue, cellular, and molecular level or upscale to the whole plant and ecological level. In a modeling framework with independent and interactive modules, advanced algorithms provide morphophysiological details at various scales. FSPMs are shown to be able to: (i) provide crop ideotypes efficiently for optimizing the resource distribution and use for greater productivity and less disease risk, (ii) guide molecular design breeding via linking molecular basis to plant phenotypes as well as enrich crop models with an additional architectural dimension to assist breeding, and (iii) interact with plant phenotyping for molecular breeding in embracing three-dimensional (3D) architectural traits. This study illustrates that FSPMs have great prospects in speeding up precision breeding for specific environments due to the capacity for guiding and integrating ideotypes, phenotyping, molecular design, and linking molecular basis to target phenotypes. Consequently, the promising great applications of FSPMs in crop science will, in turn, accelerate their evolution and vice versa.
Published: 2021

50. Annual and perennial Medicago show signatures of parallel adaptation to climate and soil in highly conserved genes

Author: Yanling Wei, Bernard E. Pfeil, Muhammet Sakiroglu, E. Charles Brummer, Isabel M Liberal, Rose L. Andrew, José Luis Blanco-Pastor, Unité de Recherche Pluridisciplinaire Prairies et Plantes Fourragères (P3F), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Department of Biological and Environmental Sciences [Gothenburg], University of Gothenburg (GU), Consejo Superior de Investigaciones Científicas [Madrid] (CSIC), Adana Alparslan Turkes Science and Technology University, University of California [Davis] (UC Davis), University of California, and University of New England (UNE)
Subjects: 0106 biological sciences, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Candidate gene, Acclimatization, comparative genomics, 01 natural sciences, Soil, 03 medical and health sciences, omnigenic model, Medicago truncatula, Medicago, Genetics, Humans, Medicago sativa, climate, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, Comparative genomics, 0303 health sciences, biology, Abiotic stress, fungi, food and beverages, conserved genes, Phenotypic trait, 15. Life on land, biology.organism_classification, Adaptation, Physiological, 13. Climate action, Evolutionary biology, Adaptation, alfalfa, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; Human induced environmental change may require rapid adaptation of plant populations and crops, but the genomic basis of environmental adaptation remain poorly understood. We analysed polymorphic loci from the perennial crop Medicago sativa (alfalfa or lucerne) and the annual legume model species M. truncatula to search for a common set of candidate genes that might contribute to adaptation to abiotic stress in both annual and perennial Medicago species. We identified a set of candidate genes of adaptation associated with environmental gradients along the distribution of the two Medicago species. Candidate genes for each species were detected in homologous genomic linkage blocks using genome-environment (GEA) and genome-phenotype association analyses. Hundreds of GEA candidate genes were species-specific, of these, 13.4% (M. sativa) and 24% (M. truncatula) were also significantly associated with phenotypic traits. A set of 168 GEA candidates were shared by both species, which was 25.4% more than expected by chance. When combined, they explained a high proportion of variance for certain phenotypic traits associated with adaptation. Genes with highly conserved functions dominated among the shared candidates and were enriched in gene ontology terms that have shown to play a central role in drought avoidance and tolerance mechanisms by means of cellular shape modifications and other functions associated with cell homeostasis. Our results point to the existence of a molecular basis of adaptation to abiotic stress in Medicago determined by highly conserved genes and gene functions. We discuss these results in light of the recently proposed omnigenic model of complex traits.
Published: 2021

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