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1. Extracellular Vesicles Produced by the Cardiac Microenvironment Carry Functional Enzymes to Produce Lipid Mediators In Situ

Author: Varravaddheay Ong-Meang, Muriel Blanzat, Lesia Savchenko, Lucie Perquis, Mégane Guardia, Nathalie Pizzinat, Verena Poinsot, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Research and Legal Issues Kyiv International University, BIBAC - Chimie analytique et interactions biomolécules - matière molle biomimétique (BIBAC), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Inorganic Chemistry, Organic Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, General Medicine, Physical and Theoretical Chemistry, Molecular Biology, Spectroscopy, Catalysis, Computer Science Applications
Abstract: International audience; The impact of the polyunsaturated fatty acids (PUFAs) at physiological concentrations on the composition of eicosanoids transported within the extracellular vesicles (EVs) of rat bone marrow mesenchymal stem cells and cardiomyoblasts was reported by our group in 2020. The aim of this article was to extend this observation to cells from the cardiac microenvironment involved in the processes of inflammation, namely mouse J774 macrophages and rat heart mesenchymal stem cells cMSCs. Moreover, to enhance our capacity to understand the paracrine exchange between these orchestrators of cardiac inflammation, we investigated some machinery involved in the eicosanoid’s synthesis transported by the EVs produced by these cells (including the two formerly described cells: bone marrow mesenchymal stem cells BM-MSC and cardiomyoblasts H9c2). We analyzed the oxylipin and the enzymatic content of the EVs collected from cell cultures supplemented (or not) with PUFAs. We prove that large eicosanoid profiles are exported in the EVs by the cardiac microenvironment cells, but also that these EVs carry some critical and functional biosynthetic enzymes, allowing them to synthesize inflammation bioactive compounds by sensing their environment. Moreover, we demonstrate that these are functional. This observation reinforces the hypothesis that EVs are key factors in paracrine signaling, even in the absence of the parent cell. We also reveal a macrophage-specific behavior, as we observed a radical change in the lipid mediator profile when small EVs derived from J774 cells were exposed to PUFAs. To summarize, we prove that the EVs, due to the carried functional enzymes, can alone produce bioactive compounds, in the absence of the parent cell, by sensing their environment. This makes them potential circulating monitoring entities.
Published: 2023

2. Transcriptomics results

Author: Capel, Frédéric, Unité de Nutrition Humaine (UNH), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), U 858, Institut de Médecine Moléculaire de Rangueil, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Karine Clément & Thorkild Sorensen, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Section 10: Omics Technology and System Biology; Transcriptomics results
Published: 2007

3. New insights into the role of DNA methylation in Biomphalaria glabrata infection susceptibility

Author: Luviano, Nelia, Lopez, Marie, Gawehns, Fleur, Chaparro, Cristian, Arimondo, Paola, Halby, Ludovic, Verhoeven, Koen, Pujol, Benoit, Gourbal, Benjamin, Duval, David, Ittiprasert, Wannaporn, Allienne, Jean-François, Pouzol, Damien, Tavernier, Geneviève, Cosseau, Celine, Grunau, Christoph, Netherlands Institute of Ecology (NIOO), Terrestrial Ecology (TE), Interactions Hôtes-Pathogènes-Environnements (IHPE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Netherlands Institute of Ecology - NIOO-KNAW (NETHERLANDS), Chimie biologique épigénétique - Epigenetic Chemical Biology (EpiCBio), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Pharmacochimie de la Régulation Epigénétique du Cancer (ETaC), PIERRE FABRE-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de recherches insulaires et observatoire de l'environnement (CRIOBE), Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Georgetown University [Washington] (GU), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), This work was supported by Wellcome Trust strategic award (107475/Z/15/Z) and by a PhD grant to NL from the Region Occitanie (EPIPARA project) and the University of Perpignan Via Domitia graduate school ED305. With the support of LabEx CeMEB, an ANR'Investissements d’avenir' program (ANR-10-LABX-04-01) through the Environmental Epigenomics Platform and the 'projets de recherche exploratoires du CeMEB 2018' project 'Epigenetics of inbreeding depression (EPID)'. This study is set within the framework of the 'Laboratoires d'Excellences (LABEX)' TULIP (ANR-10-LABX-41). BQR UPVD provided funding for the Nanoject III Programmable Nanoliter Injector., FIOCRUZ, ANR-10-LABX-0004,CeMEB,Mediterranean Center for Environment and Biodiversity(2010), and ANR-10-LABX-0041,TULIP,Towards a Unified theory of biotic Interactions: the roLe of environmental(2010)
Subjects: [SDE]Environmental Sciences
Abstract: Introduction As for many transmissible diseases non-pharmacological interventions are one of the most effective ways to control schistosoma infections. One of theses, the control of the intermediate host, is also recognized by WHO as a key element to eradication of the disease in humans. Biomphalaria snails can show remarkable resistance to schistosomes and prevalence is low in snail populations even in regions where the parasite is highly present in the vertebrate host.Resistance is a heritable trait, but it shows also high plasticity e.g., snails can be become resistant to the same parasite strain after a primary infection. One of the components of heritable plasticity is epigenetic information that refers to the heritable but reversible changes in gene function, and one of the bearers of epigenetic information is DNA methylation. We reasoned that modifying DNA methylation in the snail would have potentially positive effects on resistance traits. Methods We developed chemical DNA methylation modulators to which the snails were exposed to modify their pan-genomic methylation and we established a method for targeted DNA methylation modifications based on dCas9/Crispr. For heritability of resistance measure we used epigenetic recombinant inbred lines (EpiRILs) and experimental infections. Results We applied a dCas9-SunTag-DNMT3A complex and synthetic sgRNA to transfect B. glabrata embryos and observed an increase of CpG methylation at the target site in 50% of the hatching snails. DNA methylations were also introduced in an inbred B.glabrata line by chemical treatment in F0. This led to phenotypic variation in F3 and methylation differences in F3. Both increase and decrease (up to 100% and down to 20% prevalence from 86% control) of infection success indicating variation in complex resistance/compatibility trait. Conclusions We show that DNA methylation can be modified in B.glabrata both chemically and dCas-based, and pan-genomic or targeted. These modifications produce heritable phenotypic variants and have an influence on infection susceptibility confirming the epigenetic component of this trait. A rational of DNA methylation-based vector control will be presented.
Published: 2022

4. Fibrosis Protein-Protein Interactions from Google Matrix Analysis of MetaCore Network

Author: Ekaterina Kotelnikova, Klaus M. Frahm, Dima L. Shepelyansky, Oksana Kunduzova, Information et Chaos Quantiques (LPT), Laboratoire de Physique Théorique (LPT), Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche sur les Systèmes Atomiques et Moléculaires Complexes (IRSAMC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INSERM UMR-1048, Institut de Médecine Moléculaire de Rangueil, Bât L3, CHU Rangueil 1, Av. J. Poulhès, 31403, Toulouse Cedex 4, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de recherche « Matière et interactions » (FeRMI), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and ANR-17-EURE-0009,NanoX,Science et Ingénierie à l'Echelle Nano(2017)
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, QH301-705.5, protein–protein interactions, 01 natural sciences, fibrosis, Markov chains, Google matrix, directed networks, Article, Catalysis, Inorganic Chemistry, Mice, 03 medical and health sciences, 0103 physical sciences, Animals, Humans, Protein Interaction Maps, Physical and Theoretical Chemistry, Biology (General), 010306 general physics, Molecular Biology, QD1-999, Spectroscopy, 030304 developmental biology, Heart Failure, 0303 health sciences, Ventricular Remodeling, Myocardium, Organic Chemistry, General Medicine, 3. Good health, Computer Science Applications, Search Engine, Chemistry, Algorithms
Abstract: International audience; Protein–protein interactions is a longstanding challenge in cardiac remodeling processes and heart failure. Here, we use the MetaCore network and the Google matrix algorithms for prediction of protein–protein interactions dictating cardiac fibrosis, a primary cause of end-stage heart failure. The developed algorithms allow identification of interactions between key proteins and predict new actors orchestrating fibroblast activation linked to fibrosis in mouse and human tissues. These data hold great promise for uncovering new therapeutic targets to limit myocardial fibrosis.
Published: 2021
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5. Haploinsufficiency of the mouse Tshz3 gene leads to kidney dysfunction

Author: Laurent Fasano, Colette Denis, Guylène Feuillet, Andy Saurin, Ahmed Fatmi, Thien Phong Vu Manh, Petra Zürbig, Joost P. Schanstra, Irene Sanchez-Martin, Xavier Caubit, Fabrice Richard, Pedro Magalhães, Institut de Biologie du Développement de Marseille (IBDM), Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hannover Medical School [Hannover] (MHH), Centre d'Immunologie de Marseille - Luminy (CIML), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Aix Marseille Université (AMU), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Mosaiques Diagnostics GmbH, Fasano, Laurent, Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Sklodowska-Curie grant agreement No 642937, ANR-17-CE16-0030-01 'TSHZ3inASD', Aix Marseille Univ, CNRS, INSERM, CIML, Centre d'Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille, France., Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0303 health sciences, Kidney, Stromal cell, urogenital system, Urinary system, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030232 urology & nephrology, Wild type, Biology, Molecular biology, Phenotype, [SHS]Humanities and Social Sciences, Transcriptome, [SDV] Life Sciences [q-bio], 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine.anatomical_structure, medicine, Haploinsufficiency, Renal pelvis, 030304 developmental biology
Abstract: Renal tract defects and autism spectrum disorder (ASD) deficits represent the phenotypic core of the 19q12 deletion syndrome caused by the loss of one copy of the TSHZ3 gene. While a proportion of Tshz3 heterozygous (Tshz3+/lacZ) mice display ureteral defects, no kidney defects have been reported in these mice. The purpose of this study was to characterize the expression of Tshz3 in adult kidney as well as the renal physiological consequences of embryonic haploinsufficiency of Tshz3 by analyzing the morphology and function of Tshz3 heterozygous adult kidney. Here, we described Tshz3 expression in the smooth muscle and stromal cells lining the renal pelvis, the papilla and glomerular endothelial cells (GEnCs) of the adult kidney. Histological analysis showed that Tshz3+/lacZ adult kidney had an average of 29% fewer glomeruli than wild type kidney. Transmission electron microscopy (TEM) of Tshz3+/lacZ glomeruli revealed ultrastructural defects. Compared to wild type, Tshz3+/lacZ mice showed no difference in their urine parameters but lower blood urea, phosphates, magnesium and potassium at 2 months of age. At the molecular level, transcriptome analysis identified differentially expressed genes related to inflammatory processes in Tshz3+/lacZ compare to wild type (WT; control) adult kidneys. Lastly, analysis of the urinary peptidome revealed 33 peptides associated with Tshz3+/lacZ adult mice. These results provide the first evidence that in the mouse Tshz3 haploinsufficiency leads to cellular, molecular and functional abnormalities in the adult mouse kidney.
Published: 2021

6. Enantioselective Stereodivergent Synthesis of Jaspine B and 4-epi-Jaspine B from Axially Chiral Allenols

Author: Yves Génisson, Stéphanie Ballereau, Tessa Castellan, Heba Alnazer, Yahya Salma, Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: epoxydation, Natural product, Primary (chemistry), jaspine B, 010405 organic chemistry, Stereochemistry, allenol, Organic Chemistry, Enantioselective synthesis, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, 0104 chemical sciences, chemistry.chemical_compound, enatioselective allenylation, chemistry, Pentadecanal, [CHIM]Chemical Sciences, pachastrissamine, Pachastrissamine
Abstract: A short enantioselective synthetic route to the cytotoxic marine natural product jaspine B has been developed. A chiral non-racemic primary α-allenol, obtained from pentadecanal, gave access to an enantioenriched 2-tetradecyl-2,5-dihydrofuran as key intermediate. A stereodivergent functionalization of this dihydrofuran allowed access in a few steps to jaspine B and its 4-epimer.
Published: 2018

7. Fairness and immunogenetics

Author: Thomsen, Mogens, Mabile, Laurence, Romain DAVID, Cambon-Thomsen, Anne, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA), Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Raynaud, Christelle, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), European Research Infrastructure on Highly Pathogenic Agents (ERINHA-AISBL), European Project: 824087,EOSC-Life, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), David, Romain, and EOSC-Life - Providing an open collaborative space for digital biology in Europe - EOSC-Life - 824087 - INCOMING
Subjects: scientific knowledge, [INFO.INFO-DB]Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], data sharing, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDE.ES]Environmental Sciences/Environmental and Society, [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, sample sharing, [INFO.INFO-ET] Computer Science [cs]/Emerging Technologies [cs.ET], [SDV.EE.ECO] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, [INFO.INFO-DB] Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [INFO.INFO-ET]Computer Science [cs]/Emerging Technologies [cs.ET], [SDE.ES] Environmental Sciences/Environmental and Society, Open science, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
Abstract: ReferencesCambon-Thomsen Assessing the impact of biobanks. Nat Genet. 2003; 34(1):25 . DOI: 10.1038/ng0503-25bCambon-Thomsen et al The role of a Bioresource Research Impact Factor as an incentive to share human bioresources. Nature Genetics. 2011, 43(6):503. DOI: 10.1038/ng.831Mabile et al. Quantifying the use of bioresources for promoting their sharing in scientific research. GigaScience 2013, 2:7 DOI: 10.1186/2047-217X-2-7Bravo et al Developing a guideline to standardize the citation of bioresources in journal articles (CoBRA). BMC Med. 2015;13(1):266. DOI: https://doi-org/10.1186/s12916-015-0266-yWilkinson et al.The FAIR Guiding Principles for scientific data management and stewardship. Sci Data. 2016 15;3:160018 DOI: 10.1038/sdata.2016.18.David et al., T.R.D., 2020. FAIRness Literacy: The Achilles’ Heel of Applying FAIR Principles. Data Science Journal, 19(1), p.32. DOI: http://doi.org/10.5334/dsj-2020-032RDA COVID-19 Working Group. Recommendations and Guidelines on data sharing. Research Data Alliance, 2020. DOI: https://doi.org/10.15497/rda00052.Open Journal of Bioresources (OJB) https://openbioresources.metajnl.com/; International audience; For many decades, the immunogenetics community has been among the frontrunners in sharing data and samples, ensuring a great scientific progress in this domain. International histocompatibility workshops and scientific meetings in immunogenetics societies as EFI and ASHI have largely contributed to this progress. In collaboration with Ubiquity press, the Open Journal of Bioresources (OJB) was created in 2014. Bioresources include not only data but also biological collections. OJB is a peer-reviewed open access journal with short papers describing bioresources dedicated to human biomedical research, providing the authors with a citable informative reference and a DOI (Digital Object Identifier). This is part of the recognition and rewarding of such important work. Finally, the citation of bioresources In journals should follow the format CoBRA as described by Bravo et al (2015). References
Published: 2020

8. Contribution of rare and predicted pathogenic gene variants to childhood-onset lupus: a large, genetic panel analysis of British and French cohorts

Author: Alexandre Belot, Gillian I Rice, Sulliman Ommar Omarjee, Quentin Rouchon, Eve M D Smith, Marion Moreews, Maud Tusseau, Cécile Frachette, Raphael Bournhonesque, Nicole Thielens, Christine Gaboriaud, Isabelle Rouvet, Emilie Chopin, Akihiro Hoshino, Sylvain Latour, Bruno Ranchin, Rolando Cimaz, Paula Romagnani, Christophe Malcus, Nicole Fabien, Marie-Nathalie Sarda, Behrouz Kassai, Jean-Christophe Lega, Stéphane Decramer, Pauline Abou-Jaoude, Ian N Bruce, Thomas Simonet, Claire Bardel, Pierre Antoine Rollat-Farnier, Sebastien Viel, Héloise Reumaux, James O'Sullivan, Thierry Walzer, Anne-Laure Mathieu, Gaelle Marenne, Thomas Ludwig, Emmanuelle Genin, Jamie Ellingford, Brigitte Bader-Meunier, Tracy A Briggs, Michael W Beresford, Yanick J Crow, Dominique Campion, Jean-Francois Dartigues, Jean-François Deleuze, Jean-Charles Lambert, Richard Redon, Emma Allain-Launay, Kenza Bouayed, Stephane Burtey, Aurélia Carbasse, Véronique Despert, Olivier Fain, Michel Fischbach, Hugues Flodrops, Caroline Galeotti, Eric Hachulla, Yves Hatchuel, Jean-Francois Kleinmann, Isabelle Kone-Paut, Aurélia Lanteri, Irène Lemelle, Hélène Maillard, François Maurier, Ulrich Meinzer, Isabelle Melki, Sandrine Morell-Dubois, Anne Pagnier, Maryam Piram, Charlotte Samaille, Jean Sibilia, Olivia Weill, Eslam Al-Abadi, Kate Armon, Kathryn Bailey, Michael Beresford, Mary Brennan, Coziana Ciurtin, Janet Gardner-Medwin, Kirsty Haslam, Daniel Hawley, Alice Leahy, Valentina Leone, Devesh Mewar, Rob Moots, Clarissa Pilkington, Athimalaipet Ramanan, Satyapal Rangaraj, Annie Ratcliffe, Philip Riley, Ethan Sen, Arani Sridhar, Nick Wilkinson, Fiona Wood, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Réponse immunitaire innée dans les maladies infectieuses et auto-immunes – Innate immunity in infectious and autoimmune diseases, Centre International de Recherche en Infectiologie - UMR (CIRI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Academic Unit of Medical Genetic, University of Manchester [Manchester], Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Biologie Moléculaire de la Cellule (LBMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Department of Pediatrics and Developmental Biology, Graduate School of Medical and Dental Sciences, Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Developpement Normal et Pathologique du Système Immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de néphrologie, rhumatologie et dermatologie pédiatriques [Hôpital Femme Mère Enfant, HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Mère Enfant, Rheumatology Unit, Department of Paediatrics, Anna Meyer Children's Hospital and University of Florence, Hospices Civils de Lyon, Laboratoire d'Immunologie, Groupement Hospitalier Edouard Herriot, 5 Place d'Arsonval, F-69437, Lyon Cedex 03, France, parent, Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Evaluation et modélisation des effets thérapeutiques, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement [LBBE], Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité Pédiatrique [Jeanne de Flandre], Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Genetic Medicine, University of Manchester [Manchester]-Faculty of Human and Medical Sciences, Spanish National Cancer Research Centre, Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078) (GGB), Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Université de Brest (UBO)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service d'immuno-hématologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de neurologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Université de Bordeaux (UB), Centre National de Génotypage (CNG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations, Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, unité de recherche de l'institut du thorax UMR1087 UMR6291 (ITX), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre de néphrologie et transplantation rénale [Hôpital de la Conception - APHM], Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Service Pédiatrique [Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], Service de Médecine Interne [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), service pédiatrique de dialyse et de transplantation rénales, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service de médecine interne [Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), 'Personal Protection Against Vectors' working group (PPAV), PPAV working group, CHU Strasbourg, Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Service de Pédiatrie [Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de médecine interne, Hôpital Sainte-Blandine-Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Paediatrics, Paediatric Internal Medicine, Rheumatology and Infectious Diseases [Paris], Centre de référence des rhumatismes inflammatoires et maladies autoimmunes systémiques rares de l'enfant [Paris] (RAISE), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Pédiatrie Générale et Rhumatologie Pédiatrique, Service de rhumatologie [Strasbourg], Service de Pédiatrie - Néphrologie, Médecine interne, Hypertension, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital des Enfants, CHU Toulouse [Toulouse], University of Edinburgh, Analyse et Traitement Informatique de la Langue Française (ATILF), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre International de Recherche en Infectiologie (CIRI), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Università degli Studi di Firenze = University of Florence (UniFI), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), EFS-Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), Unité de recherche de l'institut du thorax (ITX-lab), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Subjects: Proband, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Population, Genome-wide association study, Biology, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, 0302 clinical medicine, Rheumatology, immune system diseases, Genotype, medicine, Immunology and Allergy, 1000 Genomes Project, education, skin and connective tissue diseases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Genetic association, 030203 arthritis & rheumatology, Genetics, 0303 health sciences, education.field_of_study, Systemic lupus erythematosus, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], medicine.disease, 3. Good health, Mendelian inheritance, symbols
Abstract: Summary Background Systemic lupus erythematosus (SLE) is a rare immunological disorder and genetic factors are considered important in its causation. Monogenic lupus has been associated with around 30 genotypes in humans and 60 in mice, while genome-wide association studies have identified more than 90 risk loci. We aimed to analyse the contribution of rare and predicted pathogenic gene variants in a population of unselected cases of childhood-onset SLE. Methods For this genetic panel analysis we designed a next-generation sequencing panel comprising 147 genes, including all known lupus-causing genes in humans, and potentially lupus-causing genes identified through GWAS and animal models. We screened 117 probands fulfilling American College of Rheumatology (ACR) criteria for SLE, ascertained through British and French cohorts of childhood-onset SLE, and compared these data with those of 791 ethnically matched controls from the 1000 Genomes Project and 574 controls from the FREX Consortium. Findings After filtering, mendelian genotypes were confirmed in eight probands, involving variants in C1QA, C1QC, C2, DNASE1L3, and IKZF1. Seven additional patients carried heterozygous variants in complement or type I interferon-associated autosomal recessive genes, with decreased concentrations of the encoded proteins C3 and C9 recorded in two patients. Rare variants that were predicted to be damaging were significantly enriched in the childhood-onset SLE cohort compared with controls; 25% of SLE probands versus 5% of controls were identified to harbour at least one rare, predicted damaging variant (p=2·98 × 10−11). Inborn errors of immunity were estimated to account for 7% of cases of childhood-onset SLE, with defects in innate immunity representing the main monogenic contribution. Interpretation An accumulation of rare variants that are predicted to be damaging in SLE-associated genes might contribute to disease expression and clinical heterogeneity. Funding European Research Council.
Published: 2020

9. Microfluidics for minute DNA sample analysis: open challenges for genetic testing of cell-free circulating DNA in blood plasma

Author: Pierre Joseph, Aurélien Bancaud, Rémi Malbec, Thierry Leichle, Jean Cacheux, Pierre Cordelier, Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement (LAAS-MILE), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Équipe Microsystèmes électromécaniques (LAAS-MEMS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-16-CE18-0028,MicroLAS,µ-Laboratoire d'Analyse et de Séparation des chromosomes : développement d'un outil pour le typage rapide des bactéries, levures et cellules de mammifères(2016), Équipe MICrosystèmes d'Analyse (LAAS-MICA), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UPS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Centre de Recherche en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UPS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement ( LAAS-MILE ), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes [Toulouse] ( LAAS ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse ( INSA Toulouse ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National Polytechnique [Toulouse] ( INP ), Équipe Microsystèmes électromécaniques ( LAAS-MEMS ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: 0301 basic medicine, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Microfluidics, lcsh:TK7800-8360, Cell free, Computational biology, Biology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, lcsh:Technology (General), Blood plasma, medicine, Electrical and Electronic Engineering, Cell-free circulating DNA, Genetic testing, medicine.diagnostic_test, lcsh:Electronics, Dna concentration, Condensed Matter Physics, DNA concentration, Body fluid nucleic acid biomarkers, Atomic and Molecular Physics, and Optics, 3. Good health, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, 030104 developmental biology, chemistry, DNA separation, 030220 oncology & carcinogenesis, lcsh:T1-995, Circulating DNA, [ SPI.NANO ] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, DNA
Abstract: Genetic testing based on the analysis of circulating cell-free DNA (cfDNA) in body fluids, especially blood plasma, is raising interest for the management and follow-up of many diseases, including cancer. Because the concentration of cfDNA is low and its composition mostly degraded, this material can only be assayed with the most sensitive nucleic acid processing technologies. cfDNA analysis therefore constitutes a model target and a driving force for innovation in microfluidic biotechnologies. Here, we overview the main physico-chemical characteristics of cfDNA, and provide a critical review on the different methods for its processing out of blood samples. Then, we describe recent microfluidic developments for high sensitivity DNA analysis, evaluate their practical relevance for cfDNA analysis, and identify a few challenges for technologists in the near future. Keywords: Cell-free circulating DNA, Body fluid nucleic acid biomarkers, DNA separation, DNA concentration
Published: 2018

10. Spatial Analysis of Nanofluidic-Embedded Biosensors for Wash-Free Single-Nucleotide Difference Discrimination

Author: Aurélien Bancaud, Jean Cacheux, Marie Brut, Pierre Cordelier, Thierry Leichle, Équipe Microsystèmes électromécaniques (LAAS-MEMS), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Équipe Modélisation Multi-niveaux des Matériaux (LAAS-M3), Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement (LAAS-MILE), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), ANR-13-IS10-0001,DEPSLIT,Système nanofluidique biofonctionnalisé avec pré-concentrateur moléculaire pour la détection ultra-rapide et l'analyse cinétique(2013), Cacheux, Jean, Blanc – Accords bilatéraux 2013 - Système nanofluidique biofonctionnalisé avec pré-concentrateur moléculaire pour la détection ultra-rapide et l'analyse cinétique - - DEPSLIT2013 - ANR-13-IS10-0001 - Blanc – Accords bilatéraux 2013 - VALID, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Work (thermodynamics), [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Materials science, Channel (digital image), [SPI.NANO] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Oligonucleotides, Duplex (telecommunications), [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Bioengineering, Nanofluidics, Biosensing Techniques, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, [PHYS] Physics [physics], 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Fluorescence microscope, Nanotechnology, [PHYS.PHYS] Physics [physics]/Physics [physics], [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Instrumentation, Nanoscopic scale, [PHYS]Physics [physics], Fluid Flow and Transfer Processes, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], [PHYS.PHYS]Physics [physics]/Physics [physics], Nucleotides, Process Chemistry and Technology, Nucleic Acid Hybridization, Microfluidic Analytical Techniques, Fluorescence, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, 0104 chemical sciences, 030104 developmental biology, Microscopy, Fluorescence, Biological system, Biosensor
Abstract: International audience; In this work, we demonstrate that the analysis of spatially resolved nanofluidic-embedded biosensors permits the fast and direct discrimination of single-nucleotide difference (SND) within oligonucleotide sequences in a single step interaction. We design a sensor with a linear dimension much larger than the channel depth in order to ensure that the reaction over the whole sensor is limited by the convection rate. Thus, the targets are fully collected, inducing a nonuniform spatial hybridization profile. We also use the nanoscale height of the channel, which enables us to minimize the amount of labeled molecules flowing over the sensor and hence to reduce the fluorescence background, to carry out real-time hybridization detection by fluorescence microscopy. Taken together, these design rules allow us to show that the spatial hybridization profile depends on the duplex affinity, and we speculate that the on and off-rate constants can be inferred during target injection, which is not possible in local analysis where the dissociation step through rinsing must be conducted. We finally manage to discriminate a GT mismatch on a microRNA sequence by optimizing the interaction temperature and the probe design after a few minutes of interaction in a single step protocol. This work may be applied to any biosensing transduction scheme with spatial resolution, e.g., surface plasmon resonance imaging, integrated into nanofluidic channels for applications where high oligonucleotide sequence selectivity and short analysis times are required.
Published: 2018

11. Direct-acting antiviral agent–based regimen for HCV recurrence after combined liver-kidney transplantation: Results from the ANRS CO23 CUPILT study

Author: Jérôme Dumortier, A. Rohel, Jean-Charles Duclos-Vallée, Christophe Duvoux, Vincent Di Martino, Christine Silvain, Sébastien Dharancy, Danielle Botta-Fridlund, Sylvie Radenne, Maryline Debette-Gratien, Nassim Kamar, Audrey Coilly, Vincent Leroy, Georges-Philippe Pageaux, Armand Abergel, Louis d’Alteroche, Emilie Rossignol, Claire Francoz, Pauline Houssel-Debry, P. Perré, Filomena Conti, Claire Fougerou-Leurent, François Habersetzer, Camille Besch, Christophe Moreno, H. Montialoux, Valérie Canva, Albert Tran, Didier Samuel, Victor de Lédinghen, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Paul Brousse, Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service d'Hépatologie, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France., Hôpital Henri Mondor, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Gastroentérologie et hépatologie, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépato-gastro-entérologie, Hôpital Huriez-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Département d'hépatologie, Service d'hépatologie, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Chirurgie Digestive, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Chirurgie digestive et hépatobiliaire, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie et Nutrition [CHU Limoges], CHU Limoges, ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Graft Rejection, Male, Sofosbuvir, [SDV]Life Sciences [q-bio], medicine.medical_treatment, kidney transplantation/nephrology, Hepacivirus, 030230 surgery, Liver transplantation, medicine.disease_cause, 0302 clinical medicine, Recurrence, Risk Factors, Immunology and Allergy, liver disease: infectious, Pharmacology (medical), Prospective Studies, Prospective cohort study, education.field_of_study, Graft Survival, Middle Aged, Prognosis, Hepatitis C, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], kidney failure/injury, [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Drug Therapy, Combination, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, medicine.drug, Adult, medicine.medical_specialty, infectious disease, Hepatitis C virus, Population, clinical research/practice, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Humans, Adverse effect, education, [SDV.MP] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, Transplantation, business.industry, Kidney Transplantation, Liver Transplantation, Regimen, Immunology, infection and infectious agents - viral: hepatitis C, business, liver transplantation/hepatology, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Hepatitis C virus (HCV) infection is associated with reduced patient survival following combined liver-kidney transplantation (LKT). The aim of this study was to assess the efficacy and safety of second-generation direct-acting antivirals (DAAs) in this difficult-to-treat population. The ANRS CO23 "Compassionate use of Protease Inhibitors in Viral C Liver Transplantation" (CUPILT) study is a prospective cohort including transplant recipients with recurrent HCV infection treated with DAAs. The present work focused on recipients with recurrent infection following LKT. The study population included 23 patients. All patients received at least one NS5B inhibitor (sofosbuvir) in their antiviral regimen an average of 90 months after LKT. Ninety-six percent of recipients achieved a sustained virological response (SVR) at week 12 (SVR12). In terms of tolerance, 39% of recipients presented with at least one serious adverse event. None of the patients experienced acute rejection during therapy and there were no deaths during follow-up. The glomerular filtration rate (GFR) decreased significantly from baseline to the end of therapy. However, this study did not show that the decline in GFR persisted over time or that it was directly related to DAAs. The DAA-based regimen is well tolerated with excellent results in terms of efficacy. It will become the gold standard for the treatment of recurrent HCV following LKT.
Published: 2017

12. Hepatitis E Virus Infection in Solid Organ Transplant Recipients, France

Author: Nassim Kamar, Sébastien Lhomme, Laurent Bardiaux, Florence Abravanel, Pierre Gallian, Jacques Izopet, LAB'URBA (LAB'URBA), Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Etablissement français du sang [Pyrénées-Méditerranée] (EFS Pyrénées-Méditerranée), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Emergence des Pathologies Virales (EPV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Etablissement Français du Sang [La Plaine Saint-Denis] (EFS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Subjects: Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, Blood transfusion, Genes, Viral, Epidemiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], viruses, medicine.medical_treatment, Population, lcsh:Medicine, hepatitis E virus, blood transfusion, medicine.disease_cause, Organ transplantation, lcsh:Infectious and parasitic diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Hepatitis E virus, Research Letter, medicine, Humans, solid organ transplant patients, lcsh:RC109-216, 030212 general & internal medicine, education, Phylogeny, education.field_of_study, Hepatitis E Virus Infection in Solid Organ Transplant Recipients, France, business.industry, lcsh:R, virus diseases, Organ Transplantation, Viral Load, Hepatitis E, medicine.disease, Virology, digestive system diseases, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, hepatitis E, 030211 gastroenterology & hepatology, France, business, Solid organ transplantation, Viral load, Hepatitis E virus infection
Abstract: International audience; The rate of transfusion-transmitted hepatitis E virus (HEV) in transplant recipients is unknown. We identified 60 HEV-positive solid organ transplant patients and retrospectively assessed their blood transfusions for HEV. Seven of 60 patients received transfusions; 3 received HEV-positive blood products. Transfusion is not the major route of infection in this population.
Published: 2017

13. Comparing Electron Energetics and UV Brightness in Jupiter's Northern Polar Region During Juno Perijove 5

Author: Fran Bagenal, G. R. Gladstone, Steven Levin, Barry Mauk, Thomas K. Greathouse, Vincent Hue, P. Louarn, R. J. Wilson, Michelle F. Thomsen, Jamey Szalay, John E. P. Connerney, Robert Ebert, Masafumi Imai, P. W. Valek, George Clark, William S. Kurth, Frederic Allegrini, David J. McComas, Scott Bolton, Chris Paranicas, Southwest Research Institute [San Antonio] (SwRI), Laboratory for Atmospheric and Space Physics [Boulder] (LASP), University of Colorado [Boulder], NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Department of Nuclear Engineering, Kyoto University, ECLIPSE 2015, Laboratoire d'Astrophysique de Bordeaux [Pessac] (LAB), Université de Bordeaux (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Iowa [Iowa City], Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Johns Hopkins University Applied Physics Laboratory [Laurel, MD] (APL), Princeton University, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), School of Social and Community Medicine [Bristol], University of Bristol [Bristol], Louarn, Philippe, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Kyoto University [Kyoto], Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Juno, Brightness, Jupiter's aurora, 010504 meteorology & atmospheric sciences, polar auroral region, Astrophysics::High Energy Astrophysical Phenomena, Energy flux, Electron, Astrophysics, [SDU.ASTR] Sciences of the Universe [physics]/Astrophysics [astro-ph], 7. Clean energy, 01 natural sciences, Jupiter, [SDU] Sciences of the Universe [physics], Planetary Sciences: Solar System Objects, Flux (metallurgy), Altitude, Aurorae, 0103 physical sciences, Research Letter, Magnetospheric Physics, 010303 astronomy & astrophysics, Planetary Sciences: Fluid Planets, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Physics, electron energy flux, [SDU.ASTR]Sciences of the Universe [physics]/Astrophysics [astro-ph], Energetics, Planetary Magnetospheres, Energetic Particles: Precipitating, Polar Regions, Research Letters, polar UV emissions, Geophysics, Magnetospheres, precipitating electrons, 13. Climate action, [SDU]Sciences of the Universe [physics], Physics::Space Physics, General Earth and Planetary Sciences, Polar, Space Sciences
Abstract: We compare electron and UV observations mapping to the same location in Jupiter's northern polar region, poleward of the main aurora, during Juno perijove 5. Simultaneous peaks in UV brightness and electron energy flux are identified when observations map to the same location at the same time. The downward energy flux during these simultaneous observations was not sufficient to generate the observed UV brightness; the upward energy flux was. We propose that the primary acceleration region is below Juno's altitude, from which the more intense upward electrons originate. For the complete interval, the UV brightness peaked at ~240 kilorayleigh (kR); the downward and upward energy fluxes peaked at 60 and 700 mW/m2, respectively. Increased downward energy fluxes are associated with increased contributions from tens of keV electrons. These observations provide evidence that bidirectional electron beams with broad energy distributions can produce tens to hundreds of kilorayleigh polar UV emissions., Key Points Simultaneous peaks are observed in electron energy flux and UV brightness when they map to same location in Jupiter's polar region at the same timeUpward greater than downward electron energy fluxes are observed, suggesting that primary acceleration region may be below ~1.5 jovian radiiDownward energy fluxes able to produce tens to hundreds of kilorayleigh polar UV emissions are identified; increases in energy flux due to tens of keV electrons
Published: 2019

14. Differential Regulation of the Three Eukaryotic mRNA Translation Initiation Factor (eIF) 4Gs by the Proteasome

Author: Patrice Vende, Robert J. Schneider, Frédéric Lopez, Yvan Martineau, Didier Poncet, Christine Jean, Corinne Bousquet, Bertrand Fabre, Stéphane Pyronnet, Amandine Alard, Catherine Marboeuf, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biologie Moléculaire des Rotavirus (ROTA), Département Virologie (Dpt Viro), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), La Ligue Contre le Cancer (programme Equipes Labellisees), Investissements d'Avenir via the program CAPTOR, Investissements d'Avenir via the program LABEX TOUCAN, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SERRE, Marie-Claude, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pyronnet, Stéphane, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay, and Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Saclay
Subjects: 0301 basic medicine, proteolysis, site-mediated translation, mRNA translation, lcsh:QH426-470, Proteolysis, 20s proteasome, [SDV]Life Sciences [q-bio], Pest, eIF4G, DAP5, PEST, NQO1, NRF2, proteasome, oxidative stress, Nrf2, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Eukaryotic translation, nad(p)h, expression, Protein biosynthesis, medicine, Genetics, Gene silencing, Initiation factor, Genetics (clinical), Original Research, degradation, medicine.diagnostic_test, Proteasome, Chemistry, EIF4G, phosphorylation, pathway, protein-synthesis, Cell biology, [SDV] Life Sciences [q-bio], lcsh:Genetics, Oxidative Stress, 030104 developmental biology, 030220 oncology & carcinogenesis, Molecular Medicine, ornithine-decarboxylase, Intracellular
Abstract: WOS:000462822100001; International audience; The 4G family of eukaryotic mRNA translation initiation factors is composed of three members (eIF4GI, eIF4GII, and DAP5). Their specific roles in translation initiation are under intense investigations, but how their respective intracellular amounts are controlled remains poorly understood. Here we show that eIF4GI and eIF4GII exhibit much shorter half-lives than that of DAP5. Both eIF4GI and eIF4GII proteins, but not DAP5, contain computer-predicted PEST motifs in their N-termini conserved across the animal kingdom. They are both sensitive to degradation by the proteasome. Under normal conditions, eIF4GI and eIF4GII are protected from proteasomal destruction through binding to the detoxifying enzyme NQO1 [NAD(P)H:quinone oxidoreductase]. However, when cells are exposed to oxidative stress both eIF4GI and eIF4GII, but not DAP5, are degraded by the proteasome in an N-terminal-dependent manner, and cell viability is more compromised upon silencing of DAP5. These findings indicate that the three eIF4G proteins are differentially regulated by the proteasome and that persistent DAP5 plays a role in cell survival upon oxidative stress.
Published: 2019

15. Technological Challenges and Future Issues for the Detection of Circulating MicroRNAs in Patients With Cancer

Author: Cacheux, Jean, Bancaud, Aurélien, Leichle, Thierry, Cordelier, Pierre, Leichle, Thierry, Équipe Microsystèmes électromécaniques (LAAS-MEMS), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement (LAAS-MILE), Georgia Tech Lorraine [Metz], Ecole Nationale Supérieure des Arts et Metiers Metz-Georgia Institute of Technology [Atlanta]-Ecole Supérieure d'Electricité - SUPELEC (FRANCE)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Ecole Supérieure d'Electricité - SUPELEC (FRANCE)-Georgia Institute of Technology [Atlanta]-CentraleSupélec-Ecole Nationale Supérieure des Arts et Metiers Metz-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SPI.NANO] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics
Abstract: International audience; In the era of precision medicine, the success of clinical trials, notably for patients diagnosed with cancer, strongly relies on biomarkers with pristine clinical value but also on robust and versatile analytical technologies to ensure proper patients' stratification and treatment. In this review, we will first address whether plasmatic and salivary microRNAs can be considered as a reliable source of biomarkers for cancer diagnosis and prognosis. We will then discuss the pre-analytical steps preceding miRNA quantification (from isolation to purification), and how such process could be biased and time-consuming. Next, we will review the most recent tools derived from micro- and nano-technologies for microRNA detection available to date and how they may compete with current standards. This review will prioritize publications using relevant biological samples. The significance of various physical transduction schemes (mechanical, optical, electrical, etc.) for biological detection will be compared, and pros and cons of each method will be widely discussed. Finally, we will debate on how micro and nanotechnologies could widespread the use of biomarkers in modern medicine, to help manage patients with serious diseases such as cancer.
Published: 2019

16. Three Leptospira Strains From Western Indian Ocean Wildlife Show Highly Distinct Virulence Phenotypes Through Hamster Experimental Infection

Author: Cordonin, Colette, Turpin, Magali, Bascands, Jean-Loup, Dellagi, Koussay, Mavingui, Patrick, Tortosa, Pablo, Roche, Marjolaine, Processus Infectieux en Milieu Insulaire Tropical (PIMIT), Université de La Réunion (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche et de Veille sur les Maladies Émergentes dans l'Océan Indien (CRVOI), Université de La Réunion (UR), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Tortosa, Pablo, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IRD-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de La Réunion (UR), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Leptospira, kidney, lcsh:QR1-502, bats, Microbiology, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, lcsh:Microbiology, virulence, tenrecs, hamster model, leptospirosis, Western Indian Ocean, [SDV.MP.BAC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, Original Research
Abstract: International audience; Leptospirosis is one of the most widespread zoonoses worldwide, with highest incidence reported on tropical islands. Recent investigations carried out in a One-Health framework have revealed a wide diversity of pathogenic Leptospira lineages on the different islands of Western Indian Ocean carried out by a large diversity of mammal reservoirs, including domestic and wild fauna. Using golden Syrian hamsters as a model of acute infection, we studied the virulence of Leptospira interrogans, L. mayottensis, and L. borgpetersenii isolates obtained from rats, tenrecs, and bats, respectively. Hamsters were inoculated with 2.10 8 bacterial cells and monitored for 1 month. The L. interrogans isolate proved to be the most pathogenic while L. mayottensis and L. borgpetersenii isolates induced no clinical symptoms in the infected hamsters. High leptospiral DNA amounts were also detected in the urine and organs of hamsters infected with the L. interrogans isolate while L. mayottensis and L. borgpetersenii isolates mostly failed to disseminate into the organism. In addition, histological damage was more pronounced in the kidneys and lungs of hamsters infected with the L. interrogans isolate. Altogether, these data support that Leptospira strains shed by mammals endemic to this insular ecosystem (L. mayottensis and L. borgpetersenii isolates) are less pathogenic than the L. interrogans rat-borne isolate. These results may provide a relevant framework for understanding the contrasting epidemiology of human leptospirosis observed among Western Indian Ocean islands.
Published: 2019

17. Urinary proteome signature of Renal Cysts and Diabetes syndrome in children

Author: Pierbruno Ricci, Laura Goea, Jens Drube, Joost P. Schanstra, Petra Zürbig, Stéphane Decramer, Giuseppe Remuzzi, Magdalena Krochmal, Franz Schaefer, Martin Pejchinovski, Harald Mischak, Pedro Magalhães, Lars Pape, Muriel Umbhauer, Maria Rosa Caruso, Silvia Cereghini, Iwona Belczacka, Erica Daina, Schanstra, Joost, Development and disease of the renal tract - RENALTRACT - - H20202015-06-01 - 2019-05-31 - 642937 - VALID, Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GIPSA - Signal Images Physique (GIPSA-SIGMAPHY), Département Images et Signal (GIPSA-DIS), Grenoble Images Parole Signal Automatique (GIPSA-lab ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Grenoble Images Parole Signal Automatique (GIPSA-lab ), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut Polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Mosaiques Diagnostics GmbH [Hannover, Germany], Mosaiques Diagnostics and Therapeutics AG [Hannover, Germany], Istituti di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico (IRCCS), ASST Papa Giovanni XXIII [Bergamo, Italy], Laboratoire de Biologie du Développement [IBPS] (LBD), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Mario Negri Institute for Pharmacological Research, Laboratoire de Biologie du Développement (LBD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of Paediatric Kidney, Liver and Metabolic Diseases, Hannover Medical School [Hannover] (MHH), Department of Pediatric Kidney, Hannover Medical School [Hannover] (MHH)-Children's Hospital, Institute of Cardiovascular and Medical Sciences [Glasgow], University of Glasgow, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Division of Pediatric Nephrology, Universität Heidelberg [Heidelberg], Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Signalisation et morphogenèse = Signalling and morphogenesis (LBD-E12), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), The research presented in this manuscript was supported by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement No. 642937 (RENALTRACT, MSCA-ITN-2014-642937). Furthermore, J.D. and L.P. were supported by the NEOCYST consortium, which is funded by the German Federal Ministry of Research and Education (BMBF, grant 01GM1515)., European Project: 642937,H2020,H2020-MSCA-ITN-2014,RENALTRACT(2015), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie du Développement [Paris] (LBD), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Rheinisch-Westfälische Technische Hochschule Aachen (RWTH), CHU Toulouse [Toulouse], Centre de Référence du Sud Ouest des Maladies Rénales Rares, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital des Enfants, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Proteomics, Pathology, Proteome, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:Medicine, Disease, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, Mass Spectrometry, 0302 clinical medicine, Central Nervous System Diseases, lcsh:Science, Child, Congenital nephrotic syndrome, Multidisciplinary, Kidney Diseases, Cystic, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Phenotype, Child, Preschool, Female, medicine.medical_specialty, Adolescent, Urinary system, Autosomal dominant polycystic kidney disease, Article, Diagnosis, Differential, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.PED] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Diabetes mellitus, medicine, Humans, Dental Enamel, Hydronephrosis, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, PKD1, business.industry, lcsh:R, Reproducibility of Results, medicine.disease, [SDV.MHEP.UN] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, 030104 developmental biology, Diabetes Mellitus, Type 2, lcsh:Q, business, Peptides, 030217 neurology & neurosurgery, Biomarkers, Kidney disease
Abstract: Renal Cysts and Diabetes Syndrome (RCAD) is an autosomal dominant disorder caused by mutations in the HNF1B gene encoding for the transcriptional factor hepatocyte nuclear factor-1B. RCAD is characterized as a multi-organ disease, with a broad spectrum of symptoms including kidney abnormalities (renal cysts, renal hypodysplasia, single kidney, horseshoe kidneys, hydronephrosis), early-onset diabetes mellitus, abnormal liver function, pancreatic hypoplasia and genital tract malformations. In the present study, using capillary electrophoresis coupled to mass spectrometry (CE-MS), we investigated the urinary proteome of a pediatric cohort of RCAD patients and different controls to identify peptide biomarkers and obtain further insights into the pathophysiology of this disorder. As a result, 146 peptides were found to be associated with RCAD in 22 pediatric patients when compared to 22 healthy age-matched controls. A classifier based on these peptides was generated and further tested on an independent cohort, clearly discriminating RCAD patients from different groups of controls. This study demonstrates that the urinary proteome of pediatric RCAD patients differs from autosomal dominant polycystic kidney disease (PKD1, PKD2), congenital nephrotic syndrome (NPHS1, NPHS2, NPHS4, NPHS9) as well as from chronic kidney disease conditions, suggesting differences between the pathophysiology behind these disorders.
Published: 2019
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18. Differential protein profiling as a potential multi-marker approach for obese patients with heart failure: A retrospective study

Author: Oksana Kunduzova, Frederic Boal, Hélène Tronchère, Rodica Anesia, Mathieu Cinato, Andrei Timotin, Christine Lagente, Oleg Arnaut, Sébastien Déjean, Franck Desmoulin, Jerome Roncalli, Institute for Philosophy 'Alexandru Dragomir', Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Equipe 'Obésité et insuffisance cardiaque: approches moléculaires et cliniques ', Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Proteome, lcsh:Medicine, 030204 cardiovascular system & hematology, Gastroenterology, Article, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Internal medicine, Humans, Medicine, Obesity, 030212 general & internal medicine, lcsh:Science, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Retrospective Studies, Heart Failure, 2. Zero hunger, Multidisciplinary, business.industry, Mortality rate, Leptin, lcsh:R, Retrospective cohort study, KLK6, Odds ratio, Middle Aged, medicine.disease, Blood proteins, 3. Good health, Heart failure, lcsh:Q, business, Body mass index, Biomarkers
Abstract: Identification of novel circulating biomarkers predicting death and major cardio-metabolic events in obese patients with heart failure (HF) remains a research priority. In this study, we compared multi-marker profile of non-obese (NOB) and obese (OB) HF patients in relation to mortality outcome. The new multiplex proximity extension assay technology was used to analyze the levels of 92 proteins in plasma samples from HF patients according to body mass index (BMI) categories. At 2-year follow-up, all-cause mortality rates were significantly greater in NOB patients (BMI 2) compared to the OB patients (BMI > 30 kg/m2) with HF (odds ratio 26; 95% CI: 1.14–624, p r = −0.58 p = 0.02). This study identifies specific plasma protein signature in OB and NOB patients with HF in relation to mortality outcome.
Published: 2018

19. Periodontitis induced byPorphyromonas gingivalisdrives periodontal microbiota dysbiosis and insulin resistance via an impaired adaptive immune response

Author: Pascale Klopp, Simon Nicolas, Matteo Serino, Pascale Loubieres, Rémy Burcelin, Céline Pomié, André Colom, Martine Bonnaure-Mallet, Vincent Blasco-Baque, Sandrine Le Gall-David, Vincent Azalbert, Mathieu Lemaitre, Quentin Escoula, Aurélie Waget, Lucile Garidou, Philippe Kémoun, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Microbiologie : Risques Infectieux, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Faculté de Chirurgie Dentaire de Rennes-Faculté d'Odontologie-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Pontchaillou [Rennes], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Université de Rennes - UFR d'Odontologie (UR Odontologie), and Université de Rennes (UR)-Université de Rennes (UR)
Subjects: Lipopolysaccharides, 0301 basic medicine, Cell Transplantation, [SDV]Life Sciences [q-bio], Gingiva, Adaptive Immunity, immune response, Mice, Random Allocation, 0302 clinical medicine, Bacteroidaceae Infections, Lymphocytes, Gut Microbiota, biology, Microbiota, Vaccination, Gastroenterology, Prevotella intermedia, Acquired immune system, 3. Good health, Female, Porphyromonas gingivalis, BACTERIAL PATHOGENESIS, Diet, High-Fat, Microbiology, Interferon-gamma, 03 medical and health sciences, Immune system, Insulin resistance, Diabetes Mellitus, medicine, Animals, Periodontitis, Interleukin-6, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 030206 dentistry, biology.organism_classification, medicine.disease, BACTERIAL INFECTION, Diet, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Hyperglycemia, Immunology, Dysbiosis, Lymph Nodes, Insulin Resistance, Fusobacterium nucleatum, Spleen
Abstract: International audience; OBJECTIVE: To identify a causal mechanism responsible for the enhancement of insulin resistance and hyperglycaemia following periodontitis in mice fed a fat-enriched diet. DESIGN: We set-up a unique animal model of periodontitis in C57Bl/6 female mice by infecting the periodontal tissue with specific and alive pathogens like Porphyromonas gingivalis (Pg), Fusobacterium nucleatum and Prevotella intermedia. The mice were then fed with a diabetogenic/non-obesogenic fat-enriched diet for up to 3 months. Alveolar bone loss, periodontal microbiota dysbiosis and features of glucose metabolism were quantified. Eventually, adoptive transfer of cervical (regional) and systemic immune cells was performed to demonstrate the causal role of the cervical immune system. RESULTS: Periodontitis induced a periodontal microbiota dysbiosis without mainly affecting gut microbiota. The disease concomitantly impacted on the regional and systemic immune response impairing glucose metabolism. The transfer of cervical lymph-node cells from infected mice to naive recipients guarded against periodontitis-aggravated metabolic disease. A treatment with inactivated Pg prior to the periodontal infection induced specific antibodies against Pg and protected the mouse from periodontitis-induced dysmetabolism. Finally, a 1-month subcutaneous chronic infusion of low rates of lipopolysaccharides from Pg mimicked the impact of periodontitis on immune and metabolic parameters. CONCLUSIONS: We identified that insulin resistance in the high-fat fed mouse is enhanced by pathogen-induced periodontitis. This is caused by an adaptive immune response specifically directed against pathogens and associated with a periodontal dysbiosis
Published: 2016

20. Legionella pneumophila S1P-lyase targets host sphingolipid metabolism and restrains autophagy

Author: Tamara Nora, Malcolm J. McConville, Thierry Levade, Patrice Codogno, Thusitha Rupasinghe, Gilu Abraham, Pedro Escoll, Valérie Boitez, Charlotte Christophe, Dedreia Tull, Alexei Savchenko, Sze Ying Ong, Craig Daniels, Joëlle Botti, Christel Cazalet, Tatiana Skarina, Carmen Buchrieser, Elizabeth L. Hartland, Hubert Hilbi, Monica Rolando, Thomas Naderer, Peter J. Stogios, Delphine Dervins-Ravault, Carmen Bedia, Biologie des Bactéries intracellulaires - Biology of Intracellular Bacteria, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Régulations des réactions immunitaires et inflammatoires, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-IFR50-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Glycobiologie et signalisation cellulaire, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Chemical Engineering and Applied Chemistry (CHEM ENG), University of Toronto, Max Von Pettenkofer Institute (MVP), Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU), University of Melbourne, Department of Microbiology and Immunology, Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Conseil de la Region Ile-de-France, Fondation pour la Recherche Medicale [ANR-10-INSB-04-01], Institut Pasteur, Domaine d'Interet Majeur Malinf Grant [ANR-10-LABX-62-IBEID], US Department of Energy, Office of Biological and Environmental Research [DE-AC02-06CH11357], INSERM, Infect-European Research Area (ERA) project EUGENPATH [ANR-13-IFEC-0003-02], Fondation pour la Recherche Medicale (FRM) Grant [DEQ20120323697], Agencia de Gestio d'Ajuts Universitaris i Recerca, Generalitat de Catalunya, University of Zurich, Swiss National Science Foundation [31003A\₁53200], Bundesministerium fur Bildung und Forschung (Infect-ERA project EUGENPATH) [031A410A], National Institutes of Health [GM074942, GM094585], Biologie des Bactéries intracellulaires, Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -IFR50-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Department of Chemical Engineering and Applied Chemistry ( CHEM ENG ), Max Von Pettenkofer Institute ( MVP ), Ludwig-Maximilians-Universität München, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Institut Necker Enfants-Malades (INEM) ( INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre de Recherche en Cancérologie de Toulouse ( CRCT ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Buchrieser, Carmen, Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-IFR50-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, autophagy, Protein Conformation, 610 Medicine & health, Crystallography, X-Ray, Legionella pneumophila, Microbiology, Mice, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Catalytic Domain, Animals, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Secretion, [ SDV.BBM ] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Aldehyde-Lyases, 1000 Multidisciplinary, sphingolipids, Multidisciplinary, Innate immune system, 030102 biochemistry & molecular biology, Sphingosine, biology, 10179 Institute of Medical Microbiology, Effector, Intracellular parasite, Autophagy, Biological Sciences, biology.organism_classification, Sphingolipid, sphingosine-1-phosphate lyase, Cell biology, virulence, 030104 developmental biology, chemistry, 570 Life sciences, Legionnaires' Disease
Abstract: International audience; Autophagy is an essential component of innate immunity, enabling the detection and elimination of intracellular pathogens. Legionella pneumophila, an intracellular pathogen that can cause a severe pneumonia in humans, is able to modulate autophagy through the action of effector proteins that are translocated into the host cell by the pathogen's Dot/Icm type IV secretion system. Many of these effectors share structural and sequence similarity with eukaryotic proteins. Indeed, phylogenetic analyses have indicated their acquisition by horizontal gene transfer from a eukaryotic host. Here we report that L. pneumophila translocates the effector protein sphingosine-1 phosphate lyase (LpSpl) to target the host sphingosine biosynthesis and to curtail autophagy. Our structural characterization of LpSpl and its comparison with human SPL reveals high structural conservation, thus supporting prior phylogenetic analysis. We show that LpSpl possesses S1P lyase activity that was abrogated by mutation of the catalytic site residues. L. pneumophila triggers the reduction of several sphingolipids critical for macrophage function in an LpSpl-dependent and -independent manner. LpSpl activity alone was sufficient to prevent an increase in sphingosine levels in infected host cells and to inhibit autophagy during macrophage infection. LpSpl was required for efficient infection of A/J mice, highlighting an important virulence role for this effector. Thus, we have uncovered a previously unidentified mechanism used by intracellular pathogens to inhibit autophagy, namely the disruption of host sphingolipid biosynthesis.
Published: 2016

21. MFN2-associated lipomatosis: Clinical spectrum and impact on adipose tissue

Author: Corinne Vigouroux, Philippe Froguel, Olivier Lascols, Emmanuel Disse, Sara Barraud, Emilie Capel, Anne Miquel, J.J. Robert, Martine Laville, Héléna Mosbah, Isabelle Jéru, Pierre Gourdy, Brigitte Delemer, Martine Auclair, Florence Tenenbaum, Camille Vatier, Tanya Stojkovic, Amélie Bonnefond, Marie Christine Verpont, Stephan Züchner, Pascale Cervera, Anne-Ségolène Cottereau, Sophie Christin-Maitre, Bruno Fève, Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut de Myologie, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche en Nutrition Humaine Rhône-Alpes (CRNH-RA), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-CHU Saint-Etienne-Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU Grenoble, UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Pathologie de l'Adipocyte et des Cellules Hepatiques, CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Institute of cardiometabolism and nutrition (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), John P. Hussman Institute for Human Genomics, University of Miami Leonard M. Miller School of Medicine (UMMSM), Institut de recherche en biothérapie (IRB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Institut de biologie de Lille - UMS 3702 (IBL), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service d'Endocrinologie - Diabète - Nutrition [Reims], Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Hôpital Robert Debré-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition (CarMeN), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-CHU Grenoble-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases (ICAN), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] (IHU ICAN), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Université Montpellier 1 (UM1)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Hospices Civils de Lyon (HCL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), and Institute of Cardiometabolism and Nutrition,Institut National de la Sante et de la Recherche MedicaleSorbonne UniversiteAFERO (Association Francaise d’Etude et de Recherche sur l’Obesite)
Subjects: Adult, Male, Leptin, 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, FGF21, Lipodystrophy, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Lipomatosis, Adipose tissue, GTP Phosphohydrolases, Mitochondrial Proteins, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Insulin resistance, Internal medicine, Genetics, Mitofusin 2, Internal Medicine, medicine, Humans, RNA, Messenger, Lipoatrophy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Nutrition and Dietetics, Adiponectin, business.industry, Thermogenic markers, Middle Aged, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, medicine.disease, Mitochondria, Neuropathy, 3. Good health, 030104 developmental biology, Endocrinology, Adipose Tissue, Dyslipidemia, Positron-Emission Tomography, Lipomatosis, Multiple Symmetrical, Female, Cardiology and Cardiovascular Medicine, business, 030217 neurology & neurosurgery
Abstract: Background Multiple symmetric lipomatosis (MSL) is characterized by upper-body lipomatous masses frequently associated with metabolic and neurological signs. MFN2 pathogenic variants were recently implicated in a very rare autosomal recessive form of MSL. MFN2 encodes mitofusin-2, a mitochondrial fusion protein previously involved in Charcot-Marie-Tooth neuropathy. Objective To investigate the clinical, metabolic, tissular, and molecular characteristics of MFN2-associated MSL. Methods We sequenced MFN2 in 66 patients referred for altered fat distribution with one or several lipomas or lipoma-like regions and performed clinical and metabolic investigations in patients with positive genetic testing. Lipomatous tissues were studied in 3 patients. Results Six patients from 5 families carried a homozygous p.Arg707Trp pathogenic variant, representing the largest reported series of MFN2-associated MSL. Patients presented both lipomatous masses and a lipodystrophic syndrome (lipoatrophy, low leptinemia and adiponectinemia, hypertriglyceridemia, insulin resistance and/or diabetes). Charcot-Marie-Tooth neuropathy was of highly variable clinical severity. Lipomatous tissue mainly contained hyperplastic unilocular adipocytes, with few multilocular cells. It displayed numerous mitochondrial alterations (increased number and size, structural defects). As compared to control subcutaneous fat, mRNA and protein expression of leptin and adiponectin was strikingly decreased, whereas the CITED1 and fibroblast growth factor 21 (FGF21) thermogenic markers were strongly overexpressed. Consistently, serum FGF21 was markedly increased, and 18F-FDG-PET-scan revealed increased fat metabolic activity. Conclusion MFN2-related MSL is a novel mitochondrial lipodystrophic syndrome involving both lipomatous masses and lipoatrophy. Its complex neurological and metabolic phenotype justifies careful clinical evaluation and multidisciplinary care. Low leptinemia and adiponectinemia, high serum FGF21, and increased 18F-FDG body fat uptake may be disease markers.
Published: 2018

22. Stromal protein βig-h3 reprogrammes tumour microenvironment in pancreatic cancer

Author: Goehrig, Delphine, Nigri, Jérémy, Samain, Rémi, Wu, Zhichong, Cappello, Paola, Gabiane, Gaëlle, Zhang, Xinyi, Zhao, Yajie, Kim, In-San, Chanal, Marie, Curto, Roberta, Hervieu, Valerie, de La Fouchardière, Christelle, Novelli, Francesco, Milani, Pascale, Tomasini, Richard, Bousquet, Corinne, Bertolino, Philippe, Hennino, Ana, Physiopathologie, diagnostic et traitements des maladies osseuses / Pathophysiology, Diagnosis & Treatments of Bone Diseases (LYOS), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), USC Institute for Creative Technologies (USC-ICT), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL), Tumeurs endocrines digestives : mécanismes de la tumorigenèse et de la progression tumorale, Centre Léon Bérard [Lyon], Génétique Humaine des Maladies Infectieuses (Inserm U980), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Joliot Curie, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École Pratique des Hautes Études (EPHE), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bidaut, Ghislain, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: MESH: Extracellular Matrix Proteins, T-Lymphocytes, animal diseases, [SDV]Life Sciences [q-bio], pancreatic cancer, t lymphocytes, Fluorescent Antibody Technique, MESH: Flow Cytometry, CD8-Positive T-Lymphocytes, Microscopy, Atomic Force, Transgenic, immune response, Mice, Transforming Growth Factor beta, MESH: Tumor Microenvironment, Tumor Microenvironment, MESH: Animals, MESH: Fluorescent Antibody Technique, MESH: Microscopy, Atomic Force, Microscopy, Extracellular Matrix Proteins, Gastroenterology, Atomic Force, Flow Cytometry, MESH: CD8-Positive T-Lymphocytes, Immunohistochemistry, [SDV] Life Sciences [q-bio], Editorial Commentary, Pancreatic Ductal, Adenocarcinoma, Animals, Carcinoma, Pancreatic Ductal, Fibroblasts, Humans, Macrophages, Mice, Transgenic, Pancreatic Neoplasms, Paracrine Communication, MESH: Pancreatic Neoplasms, MESH: Mice, Transgenic, chemical and pharmacologic phenomena, [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, MESH: Paracrine Communication, Pancreas, [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, MESH: Mice, MESH: Transforming Growth Factor beta, MESH: Humans, MESH: Carcinoma, Pancreatic Ductal, Carcinoma, MESH: Adenocarcinoma, MESH: Macrophages, MESH: Immunohistochemistry, biochemical phenomena, metabolism, and nutrition, MESH: Fibroblasts, bacteria
Abstract: Objective Pancreatic cancer is associated with an abundant stromal reaction leading to immune escape and tumour growth. This massive stroma drives the immune escape in the tumour. We aimed to study the impact of βig-h3 stromal protein in the modulation of the antitumoural immune response in pancreatic cancer. Design We performed studies with p48-Cre;KrasG12D, pdx1-Cre;KrasG12D;Ink4a/Arffl/fl, pdx1-Cre;KrasG12D; p53R172H mice and tumour tissues from patients with pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA). Some transgenic mice were given injections of anti-βig-h3, anti-CD8, anti-PD1 depleting antibodies. Tumour growth as well as modifications in the activation of local immune cells were analysed by flow cytometry, immunohistochemistry and immunofluorescence. Tissue stiffness was measured by atomic force microscopy. Results We identified βig-h3 stromal-derived protein as a key actor of the immune paracrine interaction mechanism that drives pancreatic cancer. We found that βig-h3 is highly produced by cancer-associated fibroblasts in the stroma of human and mouse. This protein acts directly on tumour-specific CD8+ T cells and F4/80 macrophages. Depleting βig-h3 in vivo reduced tumour growth by enhancing the number of activated CD8+ T cell within the tumour and subsequent apoptotic tumour cells. Furthermore, we found that targeting βig-h3 in established lesions released the tissue tension and functionally reprogrammed F4/80 macrophages in the tumour microenvironment. Conclusions Our data indicate that targeting stromal extracellular matrix protein βig-h3 improves the antitumoural response and consequently reduces tumour weight. Our findings present βig-h3 as a novel immunological target in pancreatic cancer.
Published: 2018

23. nSMase2 (Type 2-Neutral Sphingomyelinase) Deficiency or Inhibition by GW4869 Reduces Inflammation and Atherosclerosis in Apoe −/− Mice

Author: Nancy Geoffre, Anne Nègre-Salvayre, Agnès Coste, Emeline Recazens, Marie-Hélène Grazide, Paul Alayrac, Myriam Rouahi, Audrey Swiader, Tom Lallemand, Robert Salvayre, Nathalie Augé, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), U1048, Inst Malad Metabol & Cardiovasc, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Régulations cellulaires: lipidoses et atherosclerose, IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM U1048 (I2CM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Mice, Knockout, ApoE, NF-E2-Related Factor 2, [SDV]Life Sciences [q-bio], Anti-Inflammatory Agents, Aortic Diseases, Sphingomyelinase deficiency, Inflammation, Disease, Benzylidene Compounds, Mice, 03 medical and health sciences, medicine, Animals, Enzyme Inhibitors, Aorta, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aniline Compounds, sphingolipids, Apoe mice, Basic Sciences, business.industry, Endothelial Cells, Atherosclerosis, Sphingolipid, Plaque, Atherosclerotic, macrophages, 3. Good health, Mice, Inbred C57BL, Disease Models, Animal, RAW 264.7 Cells, Sphingomyelin Phosphodiesterase, 030104 developmental biology, Immunology, ComputingMethodologies_DOCUMENTANDTEXTPROCESSING, Macrophages, Peritoneal, Inflammation Mediators, medicine.symptom, Cardiology and Cardiovascular Medicine, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Signal Transduction
Abstract: Supplemental Digital Content is available in the text., Objective— Atherosclerosis is a chronic multifactorial and inflammatory disease of large and medium arteries and the leading cause of cardiovascular diseases worldwide. The aim of this study was to investigate whether and how the nSMase2 (type 2-neutral sphingomyelinase), a key enzyme of sphingolipid metabolism, may contribute to the development of atherosclerotic lesions. Approach and Results— The role of nSMase2 in atherosclerosis was investigated in Apoe−/−;Smpd3fro/fro mice, mutant for nSMase2, and in Apoe−/−;Smpd3+/+ mice intraperitoneally injected with GW4869, a pharmacological nSMase2 inhibitor. The defect or inhibition of nSMase2 resulted in a reduction of atherosclerotic lesions and a decrease in macrophage infiltration and lipid deposition, although cholesterolemia remained unchanged. nSMase2 inhibition decreased the inflammatory response of murine endothelial cells to oxLDL (oxidized low-density lipoprotein), as assessed by the significant reduction of MCP-1 (monocyte chemoattractant protein 1), ICAM-1 (intercellular adhesion molecule-1), and VCAM-1 (vascular cell adhesion molecule-1) mRNA expressions and macrophage recruitment. Likewise, in RAW264.7 or in macrophages isolated from Apoe−/−/Smpd3fro/fro or Apoe−/−/Smpd3+/+ mice stimulated by lipopolysaccharides, nSMase2 inhibition resulted in a decrease in the expression of inflammatory molecules. Mechanistically, the anti-inflammatory response resulting from nSMase2 inhibition involves Nrf2 (nuclear factor [erythroid-derived 2]-like 2 or NF-E2–related factor-2) activation in both endothelial cells and macrophages, as assessed by the lack of protective effect of GW4869 in endothelial cells silenced for Nrf2 by small interfering RNAs, and in lipopolysaccharide-stimulated macrophages issued from Nrf2-KO mice. Conclusions— The genetic deficiency or inhibition of nSMase2 strongly decreases the development of atherosclerotic lesions in Apoe−/− mice, by reducing inflammatory responses through a mechanism involving the Nrf2 pathway. Inhibitors of nSMase2 may, therefore, constitute a novel approach to slow down atherosclerosis progression.
Published: 2018

24. [Fertility preservation, contraception and menopause hormone therapy in women treated for rare ovarian tumors: Guidelines from the French national network dedicated to rare gynaecological cancer]

Author: Rousset-Jablonski, Christine, Selle, Frédéric, Adda-Herzog, Elodie, Planchamp, François, Selleret, Lise, Pomel, Christophe, Chabbert-Buffet, Nathalie, Darai, Emile, Pautier, Patricia, Trémollières, Florence, Guyon, Frédéric, Rouzier, Roman, Laurence, Valérie, Chopin, Nicolas, Faure-Conter, Cécile, Bentivegna, Enrica, Vacher-Lavenu, Marie-Cécile, Lhomme, Catherine, Floquet, Anne, Treilleux, Isabelle, Lecuru, Fabrice, Gouy, Sébastien, Kalbacher, Elsa, Genestie, Catherine, de La Motte Rouge, Thibault, Ferron, Gwenaël, Devouassoux-Shisheboran, Mojgan, Kurtz, Jean-Emmanuel, Namer, Moïse, Joly, Florence, Pujade-Lauraine, Eric, Grynberg, Michael, Querleu, Denis, Morice, Philippe, Gompel, Anne, Ray-Coquard, Isabelle, Centre Léon Bérard [Lyon], CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Jean Perrin [Clermont-Ferrand] (UNICANCER/CJP), UNICANCER, Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Service d'Oncologie Médicale [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Molécules Thérapeutiques in silico (MTI), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École Nationale de la Statistique et de l'Administration Économique (ENSAE Paris), Institut Gustave Roussy (IGR), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Beninois pour l'Environnement et le développement économique et Social (CEBEDES), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Chemistry, Oncogenesis, Stress and Signaling (COSS), Université de Rennes (UR)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Claudius Regaud, Service d'Anatomo-Pathologie [Hôpital de la Croix-Rousse - HCL], Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), Cancérologie (Inserm U599/IPC), Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Oncologie médicale [CHU Caen], CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service d'Oncologie Médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative (BFA (UMR_8251 / U1133)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de chirurgie générale [Gustave Roussy], Unité de Gynécologie, Health Service and Performance Research (HESPER), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Alliance Pour la Recherche En Cancérologie [CHU Tenon] (APREC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Tenon [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Gynécologie-obstétrique et médecine de la reproduction - Maternité [CHU Tenon], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'anatomie pathologique [CHU Pitié-Salpêtrière], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Tumeurs germinales, Fertilité, Delphi Technique, Borderline ovarian tumor, Menopause, Premature, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Carcinoma, Ovarian Epithelial, Rare Diseases, Sex cord tumor, Germ cell tumor, Humans, Neoplasms, Glandular and Epithelial, Rare ovarian tumor, Hormone therapy, Ovarian Neoplasms, Contraindications, Drug, Fertility Preservation, Tumeur borderline, Neoplasms, Germ Cell and Embryonal, Traitement hormonal, Contraception, Fertility, Female, Tumeurs des cordons sexuels, Tumeur rare de l’ovaire, Infertility, Female
Abstract: National audience; Introduction - Rare ovarian tumors include complex borderline ovarian tumors, sex-cord tumors, germ cell tumors, and rare epithelial tumors. Indications and modalities of fertility preservation, infertility management and contraindications for hormonal contraception or menopause hormone therapy are frequent issues in clinical practice. A panel of experts from the French national network dedicated to rare gynaecological cancers, and of experts in reproductive medicine and gynaecology have worked on guidelines about fertility preservation, contraception and menopause hormone therapy in women treated for ovarian rare tumors. Methods - A panel of 39 experts from different specialties contributed to the preparation of the guidelines, following the DELPHI method (formal consensus method). Statements were drafted after a systematic literature review, and then rated through two successive rounds. Results - Thirty-five recommendations were selected, and concerned indications for fertility preservation, contraindications for ovarian stimulation (in the context of fertility preservation or for infertility management), contraceptive options (especially hormonal ones), and menopause hormone therapy for each tumor type. Overall, prudence has been recommended in the case of potentially hormone-sensitive tumors such as sex cord tumors, serous and endometrioid low-grade adenocarcinomas, as well as for high-risk serous borderline ovarian tumors. Discussion - In the context of a scarce literature, a formal consensus method allowed the elaboration of guidelines, which will help clinicians in the management of these patients.
Published: 2018

25. Caloric Restriction and Diet-Induced Weight Loss Do Not Induce Browning of Human Subcutaneous White Adipose Tissue in Women and Men with Obesity

Author: Valentin Barquissau, Frédéric Martins, Ez-Zoubir Amri, Cedric Moro, Jean-José Maoret, Sébastien Déjean, Nathalie Viguerie, Arne Astrup, Didier F. Pisani, Diane Beuzelin, Jason S. Iacovoni, Dominique Langin, Wim H. M. Saris, Benjamin Léger, Unité de Nutrition Humaine - Clermont Auvergne (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Plateforme GeT (Génome et Transcriptome), Génopole Toulouse, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institute of Developmental Biology and Cancer (IBDC), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Valrose (IBV), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA), Department of Human Biology, Nutrition and Toxicology Research Institute Maastricht, NUTRIM, Department of Nutrition, Exercise and Sports [Copenhagen], Faculty of Science [Copenhagen], University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (KU), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Pharmacologie Clinique, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie clinique, CHU Toulouse [Toulouse], Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH)-University of Copenhagen = Københavns Universitet (UCPH), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Pharmacologie Clinique [CHU Toulouse], Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de Biochimie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), RS: NUTRIM - R1 - Obesity, diabetes and cardiovascular health, Humane Biologie, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, [SDV]Life Sciences [q-bio], Adipose tissue, PROTEIN, White adipose tissue, BEIGE ADIPOCYTES, MOUSE, Mice, 0302 clinical medicine, FUNCTIONAL-CHARACTERIZATION, Weight loss, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], insulin resistance, lcsh:QH301-705.5, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 2. Zero hunger, browning of white fat, Thermogenin, Very low calorie diet, RESTING ENERGY-EXPENDITURE, VISCERAL FAT, subcutaneous abdominal white adipose tissue, caloric restriction, medicine.symptom, medicine.medical_specialty, Diet, Reducing, Adipose Tissue, White, uncoupling protein 1, sex difference, food.diet, Subcutaneous Fat, 030209 endocrinology & metabolism, DISTINCT, METABOLISM, ADULT HUMANS, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, human obesity, 03 medical and health sciences, food, Insulin resistance, dietary intervention, Internal medicine, Weight Loss, medicine, Animals, Humans, Resting energy expenditure, Obesity, business.industry, medicine.disease, 030104 developmental biology, Endocrinology, lcsh:Biology (General), CELLS, business
Abstract: Summary Caloric restriction (CR) is standard lifestyle therapy in obesity management. CR-induced weight loss improves the metabolic profile of individuals with obesity. In mice, occurrence of beige fat cells in white fat depots favors a metabolically healthy phenotype, and CR promotes browning of white adipose tissue (WAT). Here, human subcutaneous abdominal WAT samples were analyzed in 289 individuals with obesity following a two-phase dietary intervention consisting of an 8 week very low calorie diet and a 6-month weight-maintenance phase. Before the intervention, we show sex differences and seasonal variation, with higher expression of brown and beige markers in women with obesity and during winter, respectively. The very low calorie diet resulted in decreased browning of subcutaneous abdominal WAT. During the whole dietary intervention, evolution of body fat and insulin resistance was independent of changes in brown and beige fat markers. These data suggest that diet-induced effects on body fat and insulin resistance are independent of subcutaneous abdominal WAT browning in people with obesity.
Published: 2018

26. Pancreatic preneoplastic lesions plasma signatures and biomarkers based on proteome profiling of mouse models

Author: Jérémy Nigri, Richard Tomasini, Frédéric Lopez, Frédéric Pont, Talal Al Saati, Aïcha El-Mrani, Pierre Cordelier, Julie Guillermet-Guibert, Véronique Gigoux, Marlène Dufresne, Laetitia Ligat, Romain Baer, Nathalie Saint-Laurent, Sébastien Déjean, Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux (SCSV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie et Pathologie Digestive, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'anatomie et cytologie pathologiques [Purpan], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Cancer Research, Pathology, medicine.medical_specialty, Proteome, endocrine system diseases, Colorectal cancer, pancreatic cancer, Protein Array Analysis, Pancreatic Intraepithelial Neoplasia, Mice, 03 medical and health sciences, Prostate cancer, proteomics, 0302 clinical medicine, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Biomarkers, Tumor, Animals, Medicine, Molecular Diagnostics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, business.industry, Carcinoma in situ, ITIH, complement C3, medicine.disease, genetically engineered mouse model, Neoplasm Proteins, 3. Good health, Pancreatic Neoplasms, Disease Models, Animal, medicine.anatomical_structure, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer cell, biomarker, PanIN, Peptides, business, Pancreas, Liver cancer, Precancerous Conditions, Carcinoma in Situ, alpha-2-macroglobulin, Carcinoma, Pancreatic Ductal
Abstract: Background: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the most lethal malignancies with a mortality that is almost identical to incidence. Because early detected PDAC is potentially curable, blood-based biomarkers that could detect currently developing neoplasia would improve patient survival and management. PDAC develops from pancreatic intraepithelial neoplasia (PanIN) lesions, graded from low grade (PanIN1) to high grade (PanIN3). We made the hypothesis that specific proteomic signatures from each precancerous stage exist and are detectable in plasma. Methods: We explored the peptide profiles of microdissected PanIN cells and of plasma samples corresponding to the different PanIN grade from genetically engineered mouse models of PDAC using capillary electrophoresis coupled to mass spectrometry (CE-MS) and Chip-MS/MS. Results: We successfully characterised differential peptides profiles from PanIN microdissected cells. We found that plasma from tumor-bearing mice and age-matched controls exhibit discriminative peptide signatures. We also determined plasma peptide signatures corresponding to low- and high-grade precancerous step present in the mice pancreas using the two mass spectrometry technologies. Importantly, we identified biomarkers specific of PanIN3. Conclusions: We demonstrate that benign and advanced PanIN lesions display distinct plasma peptide patterns. This strongly supports the perspectives of developing a non-invasive screening test for prediction and early detection of PDAC.
Published: 2015

27. First-in-man Phase 1 Clinical Trial of Gene Therapy for Advanced Pancreatic Cancer: Safety, Biodistribution, and Preliminary Clinical Findings

Author: Fabienne Vernejoul, Gérard Tiraby, Frédéric Martins, Naïma Hanoun, Laetitia Ligat, Hubert Lulka, Pierre Cordelier, Barbara Bournet, Aline Meulle, Sébastien Déjean, Odile Barbey, Rosine Guimbaud, Marion Gayral, Gilles Cambois, Marlène Dufresne, Philippe Otal, Louis Buscail, Fabian Gross, Frédéric Lopez, Frédéric Pont, Jérôme Torrisani, Nathalie Saint-Laurent, Alix Vignolle-Vidoni, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biologie et Pathologie Digestive, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Végétaux (SCSV), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Plateforme GeT (Génome et Transcriptome), Génopole Toulouse, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire de Biothérapie, CHU Toulouse [Toulouse], Institut Claudius Regaud, CRLCC Institut Claudius Regaud, Department of Radiology, InvivoGen, INVIVOGEN, IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Module Biothérapies, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service Radiologie et imagerie médicale - Rangueil / Larrey [CHU Toulouse], Pôle imagerie médicale [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: Male, Endoscopic ultrasound, Oncology, medicine.medical_specialty, Genetic enhancement, medicine.medical_treatment, Phases of clinical research, Pharmacology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Pancreatic cancer, Internal medicine, Drug Discovery, medicine, Genetics, Humans, Tissue Distribution, Adverse effect, Molecular Biology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Chemotherapy, medicine.diagnostic_test, business.industry, Genetic Therapy, Middle Aged, medicine.disease, Gemcitabine, 3. Good health, Pancreatic Neoplasms, Clinical trial, 030220 oncology & carcinogenesis, Molecular Medicine, Original Article, Female, business, medicine.drug
Abstract: This phase 1 trial was aimed to determine the safety, pharmacokinetics, and preliminary clinical activity of CYL-02, a nonviral gene therapy product that sensitizes pancreatic cancer cells to chemotherapy. CYL-02 was administrated using endoscopic ultrasound in 22 patients with pancreatic cancer that concomitantly received chemotherapy (gemcitabine). The maximum-tolerated dose (MTD) exceeded the maximal feasible dose of CYL-02 and was not identified. Treatment-related toxicities were mild, without serious adverse events. Pharmacokinetic analysis revealed a dose-dependent increase in CYL-02 DNA exposure in blood and tumors, while therapeutic RNAs were detected in tumors. No objective response was observed, but nine patients showed stable disease up to 6 months following treatment and two of these patients experienced long-term survival. Panels of plasmatic microRNAs and proteins were identified as predictive of gene therapy efficacy. We demonstrate that CYL-02 nonviral gene therapy has a favorable safety profile and is well tolerated in patients. We characterize CYL-02 biodistribution and demonstrate therapeutic gene expression in tumors. Treated patients experienced stability of disease and predictive biomarkers of response to treatment were identified. These promising results warrant further evaluation in phase 2 clinical trial.
Published: 2015
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28. Long-term prognostic impact of left ventricular remodeling after a first myocardial infarction in modern clinical practice

Author: Bauters, Christophe, Dubois, Emilie, Porouchani, Sina, Saloux, Eric, Fertin, Marie, De Groote, Pascal, Lamblin, Nicolas, Pinet, Florence, Rouet, Philippe, Epidémiologie des maladies chroniques: impact des intéractions gène environnement sur la santé des populations, Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 (RID-AGE), Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de cardiologie et de pathologie vasculaire [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Pinet, Florence
Subjects: Male, Critical Care and Emergency Medicine, Time Factors, Myocardial Infarction, lcsh:Medicine, Kaplan-Meier Estimate, 030204 cardiovascular system & hematology, Biochemistry, Vascular Medicine, Diagnostic Radiology, Cohort Studies, 0302 clinical medicine, Ultrasound Imaging, Medicine and Health Sciences, Coronary Heart Disease, 030212 general & internal medicine, Myocardial infarction, Enzyme Inhibitors, Practice Patterns, Physicians', lcsh:Science, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Multidisciplinary, Ejection fraction, Ventricular Remodeling, Radiology and Imaging, Hazard ratio, Middle Aged, Prognosis, 3. Good health, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Hospitalization, Echocardiography, Cohort, Cardiology, Female, Cohort study, Research Article, medicine.medical_specialty, Imaging Techniques, Endpoint Determination, Context (language use), Research and Analysis Methods, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Diagnostic Medicine, Internal medicine, medicine, Humans, Ventricular remodeling, Heart Failure, business.industry, lcsh:R, Biology and Life Sciences, medicine.disease, Heart failure, Reperfusion, Enzymology, lcsh:Q, business, Ejection Fraction, Follow-Up Studies
Abstract: Background The association of left ventricular remodeling (LVR) after myocardial infarction (MI) with the subsequent risk of heart failure (HF) and death has not been studied in patients receiving optimal secondary prevention. Methods and results We performed a long-term clinical follow-up of patients included in 2 prospective multicentric studies on LVR after first anterior MI. At 1-year echocardiography, LVR (≥20% increase in end-diastolic volume from baseline to 1 year) occurred in 67/215 (31%) patients in cohort 1 and in 87/226 (38%) patients in cohort 2. The prescription rate of secondary prevention medications was very high (s-blockers at 1 year: 90% and 95% for cohorts 1 and 2, respectively; angiotensin-converting enzyme inhibitors or angiotensin II receptor blockers (ACE-I/ARB) at 1 year: 93% and 97% for cohorts 1 and 2, respectively). Median clinical follow-up after LVR assessment was 11.0 years in cohort 1 and 7.8 years in cohort 2. In both cohorts, LVR patients had a progressive increase in the risk of cardiovascular death or hospitalization for HF (p = 0.0007 in cohort 1 and 0.009 in cohort 2) with unadjusted hazard ratios of 2.52 [1.45–4.36] and 2.52 [1.23–5.17], respectively. Similar results were obtained when cardiovascular death was considered as an isolated endpoint. After adjustement on baseline characteristics including ejection fraction, the association with the composite endpoint was unchanged. Conclusion In a context of a modern therapeutic management with a large prescription of evidence-based medications, LVR remains independently associated with HF and cardiovascular death at long-term follow-up after MI.
Published: 2017

29. Value of biomarkers for predicting immunoglobulin A vasculitis nephritis outcome in an adult prospective cohort

Author: Claire Demongeot, Manuelle Viguier, Jean-Jacques Boffa, Stéphanie Tellier, Margarita Hurtado-Nedelec, Vincent Pestre, Gérard Cheron, Guillaume Burda, Martin Flamant, Héloïse Flament, Jérôme Verine, Alexandre Seidowsky, E Bourrat, Stéphane Decramer, Mathilde de Menthon, Karine Brochard, Karim Bouchireb, Maud Bezier, Evangeline Pillebout, Fabrice Mihout, Martine Bagot, Olivier Fain, Maya Halabi-Tawil, Agnès Jamin, Philippe Remy, Sonia Azib, Vincent Audard, Monique Dehoux, Jacqueline Rivet, Quentin Raimbourg, Denis Viglietti, Alexis Mathian, Laure Champion, Guillaume Bussone, Bertrand Godeau, Eric Daugas, Anne Saussine-Hickman, Antoine Froissart, Eric Thervet, Elisa Funck-Brentano, Alain Robert, Laureline Berthelot, Nathalie Vittoz, Nicolas Limal, Denis Glotz, Georges Deschênes, Isabelle Halphen, Theresa Kwon, Laurence Vrigneaud, Pierre Housset, Sophie Georgin-Lavialle, Florence Cordoliani, Arsene Mekinian, Virginia Sauvaget, Philippe Grimbert, Jean Christophe Mercier, Philippe Vanhille, Véronique Baudouin, François Vrtovsnik, Agathe Raynaud-Simon, Renato C. Monteiro, Jean-David Bouaziz, Leila Tricot, Laurène Dehoux, Melissa Pierre, Alexandre Karras, Laure Dehen, Céline Lebas, Nathalie Bocquet, Marc Fila, Claire Dossier, Thomas Quemeneur, Maryam Piram, Coralie Bloch-Queyrat, Antoine Dossier, David Verhelst, Anne Maisin, Olivier Benveniste, Dominique Farge, Charlotte Fite, Loïc Guillevin, Rémi Salomon, Emmanuelle Vidal-Petiot, Zahir Amoura, Valérie Caudwell, Assia Smail, Philippe Bouvier, Michel Delahousse, Gentiane Monsel, Jonathan M. Chemouny, Hamza Ayari, Anne-Sophie Verhoeven, Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie (U1064 Inserm - CRTI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Néphrologie [Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Néphrologie [Bichat - Claude Bernard], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), UMR 1599, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de médecine interne [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de néphrologie [CHU Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Henri Mondor, Service de néphrologie pédiatrique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de neuropédiatrie et maladies métaboliques [CHU Robert-Debré], Sorbonne Université (SU), Hôpital Saint-Louis, Institut National de l'Environnement Industriel et des Risques (INERIS), Remodelage et Reparation du Tissu Renal, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Dermatologie [AP-HP Hôpital Saint-Louis], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Department of dermatology, Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Service Pédiatrique [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Sud Francilien, Department of Dermatology, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de dermatologie [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Service de transplantation rénale, Hôpital Foch [Suresnes], AP-HP, Service de Néphrologie Pédiatrique, Hôpital Robert Debré, Paris, Hôpital Bicêtre, Service de Médecine Interne, Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Physiopathologie et Epidemiologie de l'Insuffisance Respiratoire, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de médecine interne, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de dermatologie, Service de Physiologie [Bichat-Claude Bernard], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Immunité et cancer (U932), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biomarqueurs et essais cliniques en Cancérologie et Onco-Hématologie (BECCOH), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Université Paris-Saclay, Physiopathologie des maladies génétiques d'expression pédiatrique, Service de médecine interne [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de médecine interne et centre de référence des maladies rares [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Service de Néphrologie [CHRU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de rhumatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Département de Néphrologie = Service de Néphrologie et Dialyses [CHU Tenon], CHU Tenon [AP-HP], Service de Pédiatrie Générale et Rhumatologie Pédiatrique, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, CH Valenciennes, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Gvh et Gvl : Physiopathologie Chez l'Homme et Chez l'Animal, Incidence et Role Therapeutique, Développement et Communication Chimique chez les Insectes (DCCI), Université de Bourgogne (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de néphrologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre de Référence du Sud Ouest des Maladies Rénales Rares, Service de néphrologie adultes [CHU Necker], Service de médecine interne et néphrologie, Centre Hospitalier Henri Duffaut (Avignon), Service de Néphrologie [Valenciennes], Centre Hospitalier de Valenciennes, Service d'anatomo-pathologie [Paris], Paris-Centre de Recherche Cardiovasculaire (PARCC - UMR-S U970), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Henri Mondor [Créteil], Pôle Enfants [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Néphrologie et Dialyses [CHU Tenon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Tenon [AP-HP], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital des Enfants, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CH Evry-Corbeil, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), and Hôpital Cochin [AP-HP]
Subjects: 0301 basic medicine, Immunoglobulin A, Adult, Male, medicine.medical_specialty, IgA Vasculitis, Urinary system, 030232 urology & nephrology, Antigen-Antibody Complex, Gastroenterology, [SDV.MHEP.UN]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Urology and Nephrology, 03 medical and health sciences, Young Adult, 0302 clinical medicine, Internal medicine, medicine, Humans, Prospective Studies, 10. No inequality, Prospective cohort study, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Transplantation, Proteinuria, Nephritis, biology, business.industry, Middle Aged, medicine.disease, Prognosis, 3. Good health, 030104 developmental biology, IgA vasculitis, ROC Curve, Nephrology, biology.protein, Female, medicine.symptom, Vasculitis, business, Biomarkers, Systemic vasculitis, Glomerular Filtration Rate
Abstract: Background Henoch-Schonlein purpura, more recently renamed immunoglobulin A vasculitis (IgAV), is a systemic vasculitis characterized by IgA deposits. The current markers used to assess IgAV inaccurately evaluate the risk of nephritis occurrence and its long-term outcomes. The current study assessed biomarkers of nephritis outcomes. Methods This French multicentre prospective study enrolled 85 adult patients at the time of disease onset. Patients were assessed for clinical and biological parameters and re-examined after 1 year. Immunoglobulins, cytokines, IgA glycosylation, IgA complexes and neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL) concentrations were assessed in blood and urine. Results We identified 60 patients with IgAV-related nephritis (IgAV-N) and 25 patients without nephritis (IgAV-woN). At the time of inclusion (Day 1), the serum levels of galactose-deficient IgA1 (Gd-IgA1) and urinary concentrations of IgA, IgG, IgM, NGAL, interleukin (IL)-1β, IL-6, IL-8, IL-10, IgA-IgG and IgA-sCD89 complexes were higher in the IgAV-N patients than in the IgAV-woN patients (P
Published: 2017

30. Long non-coding RNA expression profile in cytogenetically normal acute myeloid leukemia identifies a distinct signature and a new biomarker in NPM1-mutated patients

Author: De Clara, Etienne, Gourvest, Morgane, Ma, Hanjing, Vergez, François, Tosolini, Marie, Déjean, Sébastien, Demur, Cécile, Delabesse, Eric, Recher, Christian, Touriol, Christian, Martelli, Maria Paola, Falini, Brunangelo, Brousset, Pierre, Bousquet, Marina, Equipe 1 'Emergence des Cellules Souches & Initiation Tumorale' (Groupe 1 : Identité intestinale : des Cellules Souches aux Pathologies) (SMART - Inserm U1113), Interface de Recherche Fondamentale et Appliquée en Cancérologie (IRFAC - Inserm U1113), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Paul Strauss : Centre Régional de Lutte contre le Cancer (CRLCC)-Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg (FMTS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Paul Strauss : Centre Régional de Lutte contre le Cancer (CRLCC)-Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg (FMTS), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Mathématiques de Toulouse UMR5219 (IMT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hematology Laboratory, Oncopole, Institut Universitaire du Cancer Toulouse - Oncopôle (IUCT), Service d'hématologie, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle IUCT [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg (FMTS)-Centre Paul Strauss : Centre Régional de Lutte contre le Cancer (CRLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Fédération de Médecine Translationelle de Strasbourg (FMTS)-Centre Paul Strauss : Centre Régional de Lutte contre le Cancer (CRLCC)
Subjects: Acute Myeloid Leukemia, Myeloid, Karyotype, Apoptosis, Acute, Article, Cell Line, [MATH.MATH-ST]Mathematics [math]/Statistics [math.ST], Cell Line, Tumor, Biomarkers, Cluster Analysis, Gene Expression Profiling, Gene Expression Regulation, Leukemic, Humans, Leukemia, Myeloid, Acute, Nuclear Proteins, Prognosis, RNA, Long Noncoding, Sequence Analysis, RNA, Mutation, Transcriptome, Hematology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Leukemic, Tumor, Leukemia, Gene Expression Regulation, RNA, Long Noncoding, Nucleophosmin, Sequence Analysis
Abstract: Long non-coding RNAs are defined as transcripts larger than 200 nucleotides but without protein-coding potential. There is growing evidence of the important role of long non-coding RNAs in cancer initiation, development and progression. In this study, we sought to evaluate the long non-coding RNA expression profile of patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia (AML). RNA-sequencing of 40 cytogenetically normal AML patients allowed us to quantify 11,036 long non-coding RNAs. Among these, more than 8000 were previously undescribed long non-coding RNAs. Using unsupervised analysis, we observed a specific long non-coding RNA expression profile dependent on the mutational status of the NPM1 gene. Statistical analysis allowed us to identify a minimal set of 12 long non-coding RNAs capable of discriminating NPM1-mutated from NPM1-wild-type patients. These results were validated by qRT-PCR on an independent cohort composed of 134 cytogenetically normal AML patients. Furthermore, we have identified one putative biomarker, the long non-coding RNA XLOC_109948 whose expression pattern predicts clinical outcome. Interestingly, low XLOC_109948 expression indicates a good prognosis especially for NPM1-mutated patients. Transient transfection of GapmeR against XLOC_109948 in NPM1-mutated OCI-AML3 cell line treated with Ara-C or ATRA enhances apoptosis suggesting XLOC_109948 plays a role in drug sensitivity. This study improves our knowledge of the long non-coding RNA transcriptome in cytogenetically normal AML patients. We observed a distinct long non-coding RNA expression profile in patients with the NPM1 mutation. The newly identified XLOC_109948 long non-coding RNA emerged as a strong prognostic factor able to better stratify NPM1-mutated patients.
Published: 2017

31. BREAKTHROUGH IN THE MANAGEMENT OF ATYPICAL HEMOLYTIC UREMIC SYNDROME AFTER KIDNEY TRANSPLANTATION: A NATIONWIDE STUDY

Author: Zuber, Julien, Kamar, Nassim, Frimat, Marie, Le Quintrec, Moglie, Gatault, Philippe, Jourde-Chiche, Noemie, Gaisne, Raphaël, Couzi, Lionel, Thierry, Antoine, Bertrand, Dominique, Sayegh, Johnny, Colosio, Charlotte, Rerolle, Jean-Philippe, Sberro-Soussan, Rebecca, Hourmant, Mayvonne, Pouteil-Noble, C., Rondeau, Éric, Legendre, Christophe, Frémeaux-Bacchi, Véronique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de Néphrologie CHU TOURS, Vascular research center of Marseille (VRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Unité de Sensométrie et Chimiométrie, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale d'ingénieurs des techniques des industries agricoles et alimentaires (ENITIAA), Department of Kidney Transplantation CHU Angers, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Pharmacologie des Immunosuppresseurs et de la Transplantation (PIST), Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche Croissance et signalisation (UMR_S 845), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'immunologie [HEGP, Paris], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers, Unité Sensométrie et Chimiométrie, Ecole Nationale d'Ingénieurs des Techniques des Industries Agricoles et Alimentaires, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), CHU Tenon [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), and DIGNAT-GEORGE, Françoise
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2017

32. CD163-positive tumor-associated macrophages and CD8-positive cytotoxic lymphocytes are powerful diagnostic markers for the therapeutic stratification of osteosarcoma patients: An immunohistochemical analysis of the biopsies fromthe French OS2006 phase 3 trial

Author: Françoise Rédini, Marta Jimenez, Corinne Bouvier, Claire Illac, Laurence Brugieres, Véronique Minard, Béatrice Marie, Vincent Minville, Gonzague de Pinieux, François Gouin, Marie-cecile Ledeley, Julia Gilhodes, Thomas Filleron, Sophie Piperno-Neumann, Natacha Entz-Werle, Frédérique Larousserie, Eric Mascard, Anne Gomez-Brouchet, Jean-Marc Guinebretière, Sébastien Aubert, Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité de Biostatistiques [Toulouse], Institut Claudius Regaud-Institut Universitaire du Cancer Toulouse - Oncopôle (IUCT), Service d'Anatomo-Cyto-Pathologie et de NeuroPathologie [Hôpital de la Timone - APHM] (ACPNP), Aix Marseille Université (AMU)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de pathologie [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de Pathologie [Institut Curie], Institut Curie [Paris], Service de Pathologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de Pathologie [AP-HP Hôpital Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département d'Oncologie Pédiatrique [CHU Hautepierre, Strasbourg], Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Sarcomes osseux et remodelage des tissus calcifiés - Phy-Os [Nantes - INSERM U1238] (Phy-Os), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bretagne Loire (UBL)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Service de Pathologie [CHRU Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Département de cancérologie de l'enfant et de l'adolescent [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de chirurgie orthopédique et traumatologie pédiatrique [CHU Necker ], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Département d'Orthopédie [CHU Hôtel Dieu, Nantes], Hôtel-Dieu de Nantes, UNICANCER [Paris], Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC), Service de biostatistique et d'épidémiologie (SBE), Direction de la recherche clinique [Gustave Roussy], Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut Gustave Roussy (IGR), Département d'Oncologie Médicale [Institut Curie, Paris], Funding were obtained from the French National Cancer Institute (INCa Novartis Chugai Ligue Nationale contre le Cancer Fédération Enfants et Santé Société Française des Cancers et Leucémies de l’enfant (SFC and the Association Etoile de Martin). The ancillary biological studies were approved by the Sarcoma Group of UNICANCER, the 'Groupe des Sarcomes Français-Groupe d’étude des Tumeurs Osseuses' (GSF-GETO), the SFCE and the InterSarc network., Institut Universitaire du Cancer Toulouse - Oncopôle (IUCT)-Institut Claudius Regaud, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Claudius Regaud-Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), maurice, sandrine, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Oncology, lcsh:Immunologic diseases. Allergy, medicine.medical_specialty, Pathology, medicine.medical_treatment, Immunology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, cd163, lcsh:RC254-282, Metastasis, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Internal medicine, osteosarcoma, Immunology and Allergy, Medicine, Cytotoxic T cell, Original Research, Chemotherapy, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, business.industry, CD68, cd8, medicine.disease, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, 3. Good health, macrophages, 030104 developmental biology, pd1/pdl-1 checkpoint, 030220 oncology & carcinogenesis, Immunohistochemistry, Osteosarcoma, business, lcsh:RC581-607, CD163, CD8, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; The French phase 3 trial (OS 2006) testing zoledronic acid, an osteoclast inhibitor, with chemotherapy and surgery did not improve the outcome of patients with osteosarcoma (OS). To understand this unexpected result, the presence of infiltrating immune cells was investigated in 124 pre-therapeutic biopsies of patients enrolled in the trial. The percentage of CD68/CD163 tumor-infiltrating macrophages (TAMs), CD8+ lymphocytes, osteoclasts, and the PD1/PDL-1 checkpoint were assessed by immunohistochemistry. M1/M2 macrophage polarization was characterized by pSTAT1/CMAF staining. The expression of these biomarkers was correlated with clinical outcome. No statistical correlations were found with response to chemotherapy. High CD163 levels (>50% of cells per core; 43.8% of patients) were associated with CMAF nuclear expression and significantly correlated with better overall survival (p = 0.0025) and longer metastasis progression-free survival (MPFS, p = 0.0315) independently of metastatic status (p = 0.002). Only a trend was observed for patients with high CD68-positive cells (p = 0.0582). CD8+ staining was positive in >50% of cases with a median staining of 1%. Lower CD8+ levels were associated with metastatic disease at diagnosis and the presence of CD8-positive cells significantly correlated with improved overall survival in zoledronate-treated patients (p = 0.0415). PD1/PDL-1 staining was negative in >80% of cases and was not correlated with outcome. Finally, CD163-positive TAMs and CD8 positive cells are crucial prognostic biomarkers in OS, whereas PD1/PDL-1 checkpoint plays a minor role. For the first time, we described a correlation between CD8 positive cells and survival in zoledronate-treated patients. The immunohistochemical analysis of the microenvironment in biopsies may represent a novel tool for therapeutic stratification.
Published: 2017

33. Management of Severe Bleeding in Patients Treated with Direct Oral Anticoagulants

Author: Dennis, Jessica, Medina-Rivera, Alejandra, Truong, Vinh, Antounians, Lina, Zwingerman, Nora, Carrasco, Giovana, Strug, Lisa, Wells, Phil, Trégouët, France, Morange, France, Wilson, Michael, Gagnon, France, Albaladejo, Pierre, Samama, Marc, Sié, Pierre, Kauffmann, Sophie, Mémier, Vincent, Suchon, Pierre, Viallon, Alain, David, Stéphane, Gruel, Yves, Bellamy, Lorenn, de Maistre, Emmanuel, Romegoux, Pauline, Thoret, Sophie, Pernod, Gilles, Bosson, Jean-Luc, Bazin, Etienne, Combaret, Nicolas, Cherprenet, Anne, Fares, Moustafa, Dufraisse, Sophie, Minville, Vincent, Morange, Pierre-Emmanuel, Leone, Marc, Cohen, William, Néant, Nadège, Marlu, Raphaël, Carpentier, Françoise, Defaye, Pascal, Mismetti, Patrick, Molliex, Serge, Lanoiselée, Julien, Piriou, Vincent, Delaleu-Rague, Carine, Lefèvre, Mathilde, Lagrange, Sophie, Ardillon, Lauren, Ozier, Yves, Bovet, Julien, Steib, Annick, Mebaouj, Sonia, Profumo, Louis, Roullet, Stéphanie, Smadja, David, Meyer, Guy, Journois, Didier, Trinh-Duc, Albert, Viard, Thibault, Belle, Loic, Levrat, Albrice, Gautheron, Etienne, Heluwaert, Frédéric, Schlumberger, Sylvie, Blanié, Antonia, Benhamou, Dan, Flaujac, Claire, Rosencher, Nadia, Beloeil, Hélène, Blery, Catherine, Daviet, Lauren, Guéret, Pierre, Faraoni, David, Schved, Jean François, Deras, Pauline, Jaber, Samir, Gueugniaud, Pierre Yves, Floccard, Bernard, Asehnoune, Karim, Paulus, Jerome, Amrani, Omar, Gonthier, Marie Caroline, Huisse, Marie Geneviève, Josserand, Julien, de Raucourt, Emmanuelle, Defournel, Cécile, Dubois, Yohann, Bouvier, Stéphane, Roy, Pierre-Marie, Lasocki, Sigismond, Carmagnac, Christian, Chastagner, Catherine, Thouret, Jean Marc, Sevestre, Marie Antoinette, Meaudre, Eric, Cungi, Pierre-Julien, Susen, Sophie, Lefrant, Jean Yves, Macey, Stéphane, Rieu, Jean Baptiste, Godier, Anne, University of Toronto, Program in genetics and genome biology, The Hospital for sick children [Toronto] (SickKids), Department of Molecular Genetics, Laboratorio Internacional de Investigación sobre el Genoma Humano, Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), Division of Biostatistics, Dalla Lana School of Public Health, Ottawa Hospital Research Institute, ThEMAS, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Pôle Anesthésie Réanimation, CHU Grenoble-Hôpital Michallon-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition, obésité et risque thrombotique (NORT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E), Génétique, immunothérapie, chimie et cancer (GICC), UMR 7292 CNRS [2012-2017] (GICC UMR 7292 CNRS), Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'Hématologie Clinique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Techniques pour l'Evaluation et la Modélisation des Actions de la Santé (TIMC-IMAG-ThEMAS), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Pôle Anesthésie Réanimation [CHU de Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biotechnologies, Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire, Institut de Recherches Servier, Service des urgences, CHU Grenoble, Cardiac Stimulation and Rhythmology, Groupe de recherche sur la thrombose, pharmacologie des antithrombotiques et situations à risque (GRT), Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM), Santé Ingénierie Biologie Saint-Etienne (SAINBIOSE), Centre Ingénierie et Santé (CIS-ENSMSE), École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hopital Cardiovasculaire, Hôpital Cardiologique de Lyon, Service de réanimation médicale polyvalente [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Anesthésie-Réanimation (TP - SAR), CHU Strasbourg, Espace Ethiques et Politiques - Institut Hannah Arendt (EEP), Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Service d'Accueil des Urgences (AGEN - SAU), Centre Hospitalier d'Agen, Université de Bordeaux (UB), Service de Cardiologie (hôpital d'Annecy), Centre hospitalier de la région d'Annecy, Service d'hépato-gastroentérologie, Hôpital Cochin [AP-HP], Service d'anesthésie réanimation chirurgicale [Rennes], Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou, CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de réanimation chirurgicale, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Thérapeutiques cliniques et expérimentales des infections (EA 3826) (EA 3826), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Clinique de réanimation médicale, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-Hôpital Michallon, Laboratoire SUBATECH Nantes (SUBATECH), Mines Nantes (Mines Nantes)-Université de Nantes (UN)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des Urgences (PMR), CHRU - ANGERS, CHU d'Angers [Département Urgences], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Pôle de Pathologie cardiologie-vasculaire, Institut d'Hématologie-Transfusion-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Unité de soins intensifs, Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Pôle Anesthésie Réanimation, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne (CHU de Saint-Etienne), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux (ICMCB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB), Service d'Anesthésie-Réanimation, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Louis Bugnard-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe de recherche sur la thrombose (GRT (EA 3065)), Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM), INSERM U1059, SAINBIOSE - Santé, Ingénierie, Biologie, Saint-Etienne (SAINBIOSE-ENSMSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), CHU Cochin [AP-HP], Service Anesthésie et Réanimation, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes (CHRU Nîmes), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Pôle Anesthésie Réanimation, Hôpital Pontchaillou-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Université de Nantes (UN)-Mines Nantes (Mines Nantes), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Louis Bugnard, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou, Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Ingénierie et Santé (CIS-ENSMSE), and Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)
Subjects: Rivaroxaban, business.industry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Renal function, 030204 cardiovascular system & hematology, 3. Good health, Dabigatran, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Anesthesiology and Pain Medicine, Anesthesia, Medicine, Apixaban, Observational study, In patient, 030212 general & internal medicine, business, Prospective cohort study, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, medicine.drug, Cohort study
Abstract: Background The use of prothrombin complex concentrates and the role of plasma concentration of anticoagulants in the management of bleeding in patients treated with direct oral anticoagulants are still debated. Our aim was to describe management strategies and outcomes of severe bleeding events in patients treated with direct oral anticoagulants. Methods We performed a prospective cohort study of 732 patients treated with dabigatran, rivaroxaban, or apixaban hospitalized for severe bleeding, included prospectively in the registry from June 2013 to November 2015. Results Bleeding was gastrointestinal or intracranial in 37% (212 of 732) and 24% (141 of 732) of the cases, respectively. Creatinine clearance was lower than 60 ml/min in 61% (449 of 732) of the cases. The plasma concentration of direct oral anticoagulants was determined in 62% (452 of 732) of the cases and was lower than 50 ng/ml or higher than 400 ng/ml in 9.2% (41 of 452) and in 6.6% (30 of 452) of the cases, respectively. Activated or nonactivated prothrombin complex concentrates were administered in 38% of the cases (281 of 732). Mortality by day 30 was 14% (95% CI, 11 to 16). Conclusions Management of severe bleeding in patients treated with direct oral anticoagulants appears to be complex. The use of prothrombin complex concentrates differs depending on bleeding sites and direct oral anticoagulant plasma concentrations. Mortality differs according to bleeding sites and was similar to previous estimates.
Published: 2017

34. A Review of Gaucher Disease Pathophysiology, Clinical Presentation and Treatments

Author: Jacques Serratrice, Leonardo Astudillo, Thierry Billette de Villemeur, Thierry Levade, Catherine Caillaud, Christian Rose, Anaïs Brassier, Fabrice Camou, Jérôme Stirnemann, Marc G. Berger, Christine Serratrice, Roseline Froissart, Nadia Belmatoug, Modèles et méthodes de l'évaluation thérapeutique des maladies chroniques, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpitaux Universitaires Paris Nord Val de Seine, Hôpital St-André, Réanimation, CHU Bordeaux [Bordeaux], Unité de Recherches Zootechniques (URZ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Service de biochimie métabolique [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de médecine interne, hôpital Purpan, CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Nord [CHU - APHM], Hôpital Claude Huriez, Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Neuroprotection du Cerveau en Développement / Promoting Research Oriented Towards Early Cns Therapies (PROTECT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Role of intra-Clonal Heterogeneity and Leukemic environment in ThErapy Resistance of chronic leukemias - Clermont Auvergne (CHELTER), Université Clermont Auvergne (UCA), Modèles et méthodes de l'évaluation thérapeutique des maladies chroniques (U738 / UMR_S738), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Role of intra-Clonal Heterogeneity and Leukemic environment in ThErapy Resistance of chronic leukemias (CHELTER), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service Médecine Interne et immunologie clinique [CHU Toulouse], Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], and Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)
Subjects: 0301 basic medicine, GBA1 gene, Imiglucerase, Population, Review, Models, Biological, Catalysis, Inorganic Chemistry, lcsh:Chemistry, 03 medical and health sciences, Miglustat, medicine, Humans, Physical and Theoretical Chemistry, education, Molecular Biology, lcsh:QH301-705.5, Spectroscopy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Monitoring, Physiologic, education.field_of_study, Gaucher Disease, business.industry, glucocerebrosidase, Organic Chemistry, Genetic disorder, biomarkers, [SDV.MHEP.HEM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hematology, General Medicine, Enzyme replacement therapy, medicine.disease, Prognosis, Ashkenazi jews, 3. Good health, Computer Science Applications, substrate reduction therapy, 030104 developmental biology, lcsh:Biology (General), lcsh:QD1-999, lysosomal storage disease, Immunology, business, Glucocerebrosidase, Eliglustat, Metabolic Networks and Pathways, medicine.drug, enzyme replacement therapy
Abstract: Gaucher disease (GD, ORPHA355) is a rare, autosomal recessive genetic disorder. It is caused by a deficiency of the lysosomal enzyme, glucocerebrosidase, which leads to an accumulation of its substrate, glucosylceramide, in macrophages. In the general population, its incidence is approximately 1/40,000 to 1/60,000 births, rising to 1/800 in Ashkenazi Jews. The main cause of the cytopenia, splenomegaly, hepatomegaly, and bone lesions associated with the disease is considered to be the infiltration of the bone marrow, spleen, and liver by Gaucher cells. Type-1 Gaucher disease, which affects the majority of patients (90% in Europe and USA, but less in other regions), is characterized by effects on the viscera, whereas types 2 and 3 are also associated with neurological impairment, either severe in type 2 or variable in type 3. A diagnosis of GD can be confirmed by demonstrating the deficiency of acid glucocerebrosidase activity in leukocytes. Mutations in the GBA1 gene should be identified as they may be of prognostic value in some cases. Patients with type-1 GD—but also carriers of GBA1 mutation—have been found to be predisposed to developing Parkinson’s disease, and the risk of neoplasia associated with the disease is still subject to discussion. Disease-specific treatment consists of intravenous enzyme replacement therapy (ERT) using one of the currently available molecules (imiglucerase, velaglucerase, or taliglucerase). Orally administered inhibitors of glucosylceramide biosynthesis can also be used (miglustat or eliglustat).
Published: 2017

35. Sofosbuvir and NS5A inhibitors without Ribavirin during 12 weeks are efficient to treat hepatitis C recurrence after liver transplantation only in genotype 1. Results from the CO23 ANRS CUPILT study

Author: Houssel-Debry, Pauline, Coilly, Audrey, Fougerou-Leurent, Claire, Jezequel, Caroline, Duvoux, Christophe, Ledinghen, Victor, Radenne, Sylvie, Kamar, Nassim, Leroy, Vincent, Di Martino, Vincent, d'Alteroche, Louis, Canva-Delcambre, Valerie, Conti, Filomena, Dumortier, Jérôme, Montialoux, Helene, Lebray, Pascal, Botta-Fridlund, Danielle, Anty, Rodolphe, Moreno, Christophe, Silvain, Christine, Besch, Camille, Perré, Philippe, Francoz, Claire, Abergel, Armand, Habersetzer, François, Debette-Gratien, Maryline, Rohel, Alexandra, Diallo, Alpha, Rossignol, Emilie, Danjou, Helene, Veislinger, Aurelie, Duclos-Vallée, Jean-Charles, Pageaux, Georges-Philippe, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Paul Brousse, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service des Maladies de l'Appareil Digestif [CHU Rennes], Pôle Recherche Clinique-Santé Publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor, Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'hépatologie, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Grenoble Alpes - UFR Médecine (UGA UFRM), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], service d'Hépato-gastro-entérologie, Hospices Civiles de Lyon-Hôpital Edouard Heriault, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Chirurgie Digestive, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Département Digestif, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice)-Hôpital de l'Archet, Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Hôpital de la Milétrie, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Beaujon [AP-HP], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques (RESINFIT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Hepatinov (DHU), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson (CNR wilson), CNR Wilson, Service de Neurologie, Hôpital Lariboisière, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Service de gastro-entérologie [CHU Trousseau], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service de Chirurgie Digestive, Hépato-Bilio-pancréatique et Transplantation Hépatique [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-CHU Saint-Eloi, Hôpital Paul Brousse-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)-CHU Limoges, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] ( CIC ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse, Centre hépato-biliaire ( CHB ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP Hôpital Paul Brousse, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Henri-Mondor, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Grenoble Alpes - UFR Médecine ( UGA UFRM ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ) -Hôpital Jean Minjoz-Université de Franche-Comté ( UFC ), Service de gastro-entérologie, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], CHRU Tours, Service de chirurgie digestive hépato-bilio-pancréatique transplantation hépatique [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Human HepCell [AP-HP Hôpital Saint-Antoine], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -AP-HP - Hôpital Saint-Antoine -Paris Biotech santé, APHP, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Hôpital de la Conception [CHU - APHM] ( LA CONCEPTION ), Centre méditérannéen de médecine moléculaire ( C3M ), Université Nice Sophia Antipolis ( UNS ), Université Côte d'Azur ( UCA ) -Université Côte d'Azur ( UCA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU Nice-Hôpital de l'Archet, Hôpital Erasme, Université Libre de Bruxelles [Bruxelles] ( ULB ), Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Hôpital Beaujon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut de Virologie, Anti-infectieux : supports moléculaires des résistances et innovations thérapeutiques ( RESINFIT ), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique ( GEIST ), Université de Limoges ( UNILIM ) -Université de Limoges ( UNILIM ), Hepatinov ( DHU ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Centre Hépato-Biliaire Paul Brousse, Centre National de Référence pour la maladie de Wilson ( CNR wilson ), and Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -CHU Saint-Eloi
Subjects: [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Meeting Abstract: 925
Published: 2017

36. Chemotherapy-resistant human acute myeloid leukemia cells are not enriched for leukemic stem cells but require oxidative metabolism

Author: François Vergez, Marine Fraisse, Nicolas Broin, Thomas Farge, Robin L. Perry, Jean-Emmanuel Sarry, Audrey Sarry, Suzanne Tavitian, Stéphanie Cassant-Sourdy, Mayumi Sugita, Laetitia K. Linares, Jason S. Iacovoni, Claudie Bosc, Olivier Duchamp, Gwenn Danet-Desnoyers, Fabienne De Toni, Sarah J. Scotland, Y Barreira, Pierre Hirsch, Emmanuel Griessinger, Estelle Saland, Camille Montersino, Rémy Castellano, Héléna Boutzen, Nizar Serhan, Laurent Vallar, Martin Carroll, Christian Recher, Moshen Hosseini, Yves Collette, Lara Gales, François Delhommeau, Marion David, Marie-Laure Nicolau-Travers, Jean-Charles Portais, Nesrine Aroua, Lucille Stuani, Clément Larrue, Tony Kaoma, Tony Lionel Palama, Mary A. Selak, Barbara Garmy-Susini, Virginie Féliu, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), University of Pennsylvania [Philadelphia], Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Oncology, University Hospital-Hälsouniversitetet Universitetssjukhuset, Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), U1065 Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire, Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), Oncodesign, UMS006 Service d'Experimentation Animale, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UMR-S938 CDR Saint-Antoine, Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service d'Hématologie [IUCT Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Fondation ARC [SFI20121205478], Laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer (TOUCAN) [ANR11-LABEX], Programme Hospitalo-Universitaire en Cancerologie (CAPTOR) [ANR11-PHUC0001], INCA [PLBIO 2012-105], Veterans Affairs Administration [1I01BX000918-01], NIH [1R01CA149566-01A1], Métabolisme Plasticité et Mitochondrie [lié à l'ex IFR 31] (LMPM), IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe 11-E.Moyal/C.Toulas, Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de biologie clinique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-CRLCC Henri Becquerel-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel), Luxembourg Institute of Health (LIH), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Université Côte d'Azur (UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Oncodesign Inc., Oncodesign Biotechnology®, Service d'hématologie clinique et de thérapie cellulaire [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Saint-Antoine [APHP], Centre Européen de Résonance Magnétique Nucléaire à Très Hauts Champs (CERMNTHC), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon, Service d'immunologie et hématologies biologiques [Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Sorbonne Université (SU)-CHU Saint-Antoine [APHP], Service d'hématologie, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU), CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Paoli-Calmettes, Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Aix Marseille Université (AMU), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Oncodesign [Dijon], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service d'immunologie et hématologies biologiques [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015 - 2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Pennsylvania, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Normandie Université (NU)-Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Hématologie - IUCT-Oncopole [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle IUCT [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Linares, Laetitia, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: CD36 Antigens, 0301 basic medicine, Myeloid, cancerologie, Mitochondrion, human health, Oxidative Phosphorylation, Mice, pharmacotherapy, 0302 clinical medicine, protéine mitochondriale, chimiothérapie, leucemie, Cytarabine, leukemia, Myeloid leukemia, santé humaine, Mitochondria, 3. Good health, Leukemia, Myeloid, Acute, Leukemia, medicine.anatomical_structure, Biochemistry, 030220 oncology & carcinogenesis, oncologie, oncology, Neoplastic Stem Cells, Stem cell, medicine.drug, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, 03 medical and health sciences, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Downregulation and upregulation, Cell Line, Tumor, medicine, Animals, Humans, Cell Lineage, chimiothérapie, oncologie, cancerologie, approche thérapeutique, leucemie, protéine mitochondriale, santé humaine, approche thérapeutique, medicine.disease, Xenograft Model Antitumor Assays, carbohydrates (lipids), 030104 developmental biology, Drug Resistance, Neoplasm, Cell culture, Cancer research, pharmacotherapy, oncology, leukemia, human health, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Chemotherapy-resistant human acute myeloid leukemia (AML) cells are thought to be enriched in quiescent immature leukemic stem cells (LSC). To validate this hypothesis in vivo, we developed a clinically relevant chemotherapeutic approach treating patient-derived xenografts (PDX) with cytarabine (AraC). AraC residual AML cells are enriched in neither immature, quiescent cells nor LSCs. Strikingly, AraC-resistant preexisting and persisting cells displayed high levels of reactive oxygen species, showed increased mitochondrial mass, and retained active polarized mitochondria, consistent with a high oxidative phosphorylation (OXPHOS) status. AraC residual cells exhibited increased fatty-acid oxidation, upregulated CD36 expression, and a high OXPHOS gene signature predictive for treatment response in PDX and patients with AML. High OXPHOS but not low OXPHOS human AML cell lines were chemoresistant in vivo. Targeting mitochondrial protein synthesis, electron transfer, or fatty-acid oxidation induced an energetic shift toward low OXPHOS and markedly enhanced antileukemic effects of AraC. Together, this study demonstrates that essential mitochondrial functions contribute to AraC resistance in AML and are a robust hallmark of AraC sensitivity and a promising therapeutic avenue to treat AML residual disease. Significance: AraC-resistant AML cells exhibit metabolic features and gene signatures consistent with a high OXPHOS status. In these cells, targeting mitochondrial metabolism through the CD36–FAO–OXPHOS axis induces an energetic shift toward low OXPHOS and strongly enhanced antileukemic effects of AraC, offering a promising avenue to design new therapeutic strategies and fight AraC resistance in AML. Cancer Discov; 7(7); 716–35. ©2017 AACR. See related commentary by Schimmer, p. 670. This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 653
Published: 2017

37. Interaction and Communication in an Immersive Learning Game: The Challenges of Modelling Real-Time Collaboration in a Virtual Operating Room

Author: Michel Galaup, Vincent Lubrano, Pierre Lagarrigue, David Panzoli, Vincent Minville, Catherine Pons Lelardeux, Serious Game Research Network (SGRN), Institut national universitaire Champollion [Albi] (INUC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT), Real Expression Artificial Life (IRIT-REVA), Institut de recherche en informatique de Toulouse (IRIT), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Education, Formation, Travail, Savoirs (EFTS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), Institut Clément Ader (ICA), Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace (ISAE-SUPAERO)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT École nationale supérieure des Mines d'Albi-Carmaux (IMT Mines Albi), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), 12th innovation cluster French funding scheme 'Fonds Unique Interministériel' (FUI), Minhua Ma, Andreas Oikonomou, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-École Nationale Supérieure de Formation de l'Enseignement Agricole de Toulouse-Auzeville (ENSFEA), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IMT École nationale supérieure des Mines d'Albi-Carmaux (IMT Mines Albi), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Supérieur de l'Aéronautique et de l'Espace (ISAE-SUPAERO), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Purpan [Toulouse], and CHU Toulouse [Toulouse]
Subjects: Multiplayer collaboration In-game communication, Immersive learning, Multimedia, Computer science, Debriefing, ComputingMilieux_PERSONALCOMPUTING, Immersive learning game, 02 engineering and technology, 030230 surgery, computer.software_genre, Communications system, Business process modelling and notation, 03 medical and health sciences, Immersive technology, Patient safety, 0302 clinical medicine, Virtual machine, Human–computer interaction, Design methodology, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, [INFO]Computer Science [cs], 020201 artificial intelligence & image processing, Design methods, Engineering design process, computer
Abstract: International audience; In this chapter, we describe the methodology we have engineered during the design process of the collaborative and immersive learning game 3D Virtual Operating Room. The game targets an audience of practitioners involved in the operating room and the training consists in virtually re-enacting typical perioperative activities so as to learn or improve skills related to patient safety. The challenges faced in this project include multiplayer collaboration in a shared, interactive and dynamically evolving virtual environment, and modelling educational scenarios on the basis of actual observations inside the operating room. The model we detail is grounded on a semantic definition of the environment which allowed for three innovative features. A game-mediated communication system where information pertaining to the game is exchanged in real time by the players. AI-controlled characters replacing missing players as fully equal partners. And, the ability for the game to provide feedback in real time or during a debriefing on the team’s performance against predefined pedagogical objectives.
Published: 2017

38. Application of a sparseness constraint in multivariate curve resolution - Alternating least squares

Author: Cyril Ruckebusch, Siewert Hugelier, Sara Piqueras, Carmen Bedia, Anna de Juan, European Research Council, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Avancé de Spectroscopie pour les Intéractions la Réactivité et l'Environnement - UMR 8516 (LASIRE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Lille-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centrale Lille Institut (CLIL)
Subjects: 0301 basic medicine, Gaussian, Bilinear interpolation, 01 natural sciences, Biochemistry, Analytical Chemistry, Chemometrics, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Statistics, Environmental Chemistry, Hyperspectral image analysis, Spectroscopy, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Interpretability, Multivariate curve resolution, Mass spectrometry, Chemistry, 010401 analytical chemistry, Hyperspectral imaging, 0104 chemical sciences, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, MCR-ALS, 030104 developmental biology, Sparseness, Norm (mathematics), symbols, A priori and a posteriori, Algorithm
Abstract: The use of sparseness in chemometrics is a concept that has increased in popularity. The advantage is, above all, a better interpretability of the results obtained. In this work, sparseness is implemented as a constraint in multivariate curve resolution - alternating least squares (MCR-ALS), which aims at reproducing raw (mixed) data by a bilinear model of chemically meaningful profiles. In many cases, the mixed raw data analyzed are not sparse by nature, but their decomposition profiles can be, as it is the case in some instrumental responses, such as mass spectra, or in concentration profiles linked to scattered distribution maps of powdered samples in hyperspectral images. To induce sparseness in the constrained profiles, one-dimensional and/or two-dimensional numerical arrays can be fitted using a basis of Gaussian functions with a penalty on the coefficients. In this work, a least squares regression framework with L0-norm penalty is applied. This L0-norm penalty constrains the number of non-null coefficients in the fit of the array constrained without having an a priori on the number and their positions. It has been shown that the sparseness constraint induces the suppression of values linked to uninformative channels and noise in MS spectra and improves the location of scattered compounds in distribution maps, resulting in a better interpretability of the constrained profiles. An additional benefit of the sparseness constraint is a lower ambiguity in the bilinear model, since the major presence of null coefficients in the constrained profiles also helps to limit the solutions for the profiles in the counterpart matrix of the MCR bilinear model. © 2017 Elsevier B.V., The authors thank Paul Eilers for his involvement in the development of the algorithms and appreciate the fruitful discussions on the topic. C. R. thanks the Agence National de la Recherche ( ANR-15-CE09-0020-01 Blink). C.B. and A.J have received funding from the European Research Council under the European Union's Seventh Framework Program ( FP/2007-2013 )/ ERC Grant Agreement n. 320737 (CHEMAGEB project). S.P. acknowledges the support of the Spanish government through project CTQ2015-66254-C2-2-P .
Published: 2017

39. Use of direct-acting agents for hepatitis C virus-positive kidney transplant candidates and kidney transplant recipients

Author: Lionel Rostaing, Nassim Kamar, Laurent Alric, Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Hôpital Purpan [Toulouse], Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Cyclopropanes, hepatitis C virus, Sofosbuvir, [SDV]Life Sciences [q-bio], Hepacivirus, medicine.disease_cause, Kidney, Gastroenterology, Polyethylene Glycols, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, 030212 general & internal medicine, Kidney transplantation, education.field_of_study, Sulfonamides, Imidazoles, virus diseases, 3. Good health, Grazoprevir, 030211 gastroenterology & hepatology, Immunosuppressive Agents, medicine.drug, medicine.medical_specialty, Elbasvir, Genotype, Hepatitis C virus, Population, kidney transplantation, elbasvir, Antiviral Agents, sofosbuvir, 03 medical and health sciences, Internal medicine, Quinoxalines, Ribavirin, medicine, Humans, education, Benzofurans, direct‐acting antiviral agents, Transplantation, business.industry, Interferon-alpha, grazoprevir, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, Amides, Transplant Recipients, digestive system diseases, chemistry, Hepatitis C Virus Positive, Kidney Failure, Chronic, Carbamates, business
Abstract: International audience; In some parts of the world, hepatitis C virus (HCV) infection remains a huge problem for kidney transplant candidates and kidney transplant (KT) recipients. Until 2 years ago, anti‐HCV treatment for the general population relied on pegylated alpha‐interferon plus ribavirin, but led to a sustained viral response (SVR) in 90%, whatever the patient's HCV genotype. In KT patients, sofosbuvir‐based therapy is associated with a SVR at nearly 100% in patients with a HCV genotype‐1 infection, with almost no side effects and only mild interference with immunosuppressive drugs. Most HCV(+) patients with ESRD are genotype 1: in that setting, a recent study reported that the association of grazoprevir/elbasvir 100/50 mg/day led to a SVR of nearly 95% with very few side effects. Thus, it is concluded that DAAs can be safely used and lead to results in KT candidates and KT patients that are as good as those observed in the nonrenal population.
Published: 2016

40. Increasing Uptake of Silica Nanoparticles with Electroporation: From Cellular Characterization to Potential Applications

Author: Marc Verelst, Audrey Ferrand, Erick Phonesouk, Christine Bezombes, Muriel Golzio, Séverine Lechevallier, Marie-Pierre Rols, ChromaLys S.A.S., Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Matériaux Multi-fonctionnels et Multi-échelles (CEMES-M3), Centre d'élaboration de matériaux et d'études structurales (CEMES), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Region Midi-Pyrenees Project grants NanoRAD 2015-2016, MULTIMAGE (30062015), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and VERELST, Marc
Subjects: Fluorescence-lifetime imaging microscopy, Cell, Nanoparticle, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, 02 engineering and technology, lcsh:Technology, 01 natural sciences, General Materials Science, lcsh:QC120-168.85, silica nanoparticles fluorescence imaging, Chemistry, Electroporation, [CHIM.MATE]Chemical Sciences/Material chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, electric field, 3. Good health, medicine.anatomical_structure, Drug delivery, Veterinary medicine and animal Health, 0210 nano-technology, lcsh:TK1-9971, [CHIM.INOR] Chemical Sciences/Inorganic chemistry, electroporation, Biocompatibility, [CHIM.THER] Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [CHIM.INOR]Chemical Sciences/Inorganic chemistry, 010402 general chemistry, Endocytosis, Article, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [CHIM.CRIS]Chemical Sciences/Cristallography, medicine, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, Viability assay, [CHIM.CRIS] Chemical Sciences/Cristallography, lcsh:Microscopy, [CHIM.MATE] Chemical Sciences/Material chemistry, lcsh:QH201-278.5, lcsh:T, tumor targeting, [CHIM.COOR] Chemical Sciences/Coordination chemistry, 0104 chemical sciences, Médecine vétérinaire et santé animal, drug delivery, lcsh:TA1-2040, Biophysics, lcsh:Descriptive and experimental mechanics, lcsh:Electrical engineering. Electronics. Nuclear engineering, lcsh:Engineering (General). Civil engineering (General)
Abstract: International audience; In the fields of biology and medicine, nanoproducts such as nanoparticles (NPs) are specifically interesting as theranostic tools, since they offer the double capacity to locally deliver active drugs and to image exactly where the product is delivered. Among the many described possibilities, silica nanoparticles (SiNPs) represent a good choice because of their ease of synthesis, the possibility of their vast functionalization, and their good biocompatibility. However, SiNPs' passive cell internalization by endocytosis only distributes NPs into the cell cytoplasm and is unable to target the nucleus if SiNPs are larger than a few nanometers. In this study, we demonstrate that the cell penetration of SiNPs of 28-30 nm in diameter can be strongly enhanced using a physical method, called electroporation or electropermeabilization (EP). The uptake of fluorescently labelled silica nanoparticles was improved in two different cancer cell lines, namely, HCT-116 (human colon cancer) cells and RL (B-lymphoma) cells. First, we studied cells' capability for the regular passive uptake of SiNPs in vitro. Then, we set EP parameters in order to induce a more efficient and rapid cell loading, also comprising the nuclear compartment, while preserving the cell viability. In the final approach, we performed in vivo experiments, and evidenced that the labeling was long-lasting, as confirmed by fluorescence imaging of labeled tumors, which enabled a 30-day follow-up. This kind of SiNPs delivery, achieved by EP, could be employed to load extensive amounts of active ingredients into the cell nucleus, and concomitantly allow the monitoring of the long-term fate of nanoparticles.
Published: 2019

41. Reduction of extended-release tacrolimus dose in low immunological risk kidney transplant recipients increases risk of rejection and appearance of DSA - a randomized study

Author: Gatault, Philippe, Kamar, Nassim, Buchler, Matthias, Colosio, Charlotte, Bertrand, Dominique, Durrbach, Antoine, Albano, Laeticia, Rivalan, Joseph, Le Meur, Yannick, Essig, Marie, Bouvier, Nicolas, Legendre, Christophe, Moulin, Bruno, Heng, Anne-Elisabeth, Weestel, Pierre-François, Sayegh, Johnny, Charpentier, Bernard, Rostaing, Lionel, Thervet, Eric, Lebranchu, Yvon, Service de néphrologie et immunologie clinique [CHRU Tours], Université de Tours (UT)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale (LGCIE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Service de néphrologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Nephrology and Transplantation, University Hospital, Nice, Departement of Nephrology and Transplantation, University Hospital, Nice, Service de néphrologie [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], CHRU - Service de néphrologie, dialyse et transplantation rénale, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Immunologie et Pathologie (EA2216), Université de Brest (UBO)-IFR148, Department of Nephrology, Intitute for clinical and Experimental Medicine, CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Micro et Nanomédecines Biomimétiques (MINT), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Bretagne Loire (UBL), Département d'Informatique - Université Laval (IFT), Université Laval [Québec] (ULaval), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Affectations Mineralisantes du Systeme Cardiovasculaire : Calcifications Arterielles et Valvulaires Aortiques, Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de dyalise et transplantation, Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-CHU Amiens-Picardie, Department of Kidney Transplantation CHU Angers, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de Néphrologie - Hypertension Artérielle Dialyse - Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Service de Néphrologie et Hémodialyse [CHU HEGP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Service de Néphrologie, Immunologie clinique, Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHRU Tours, Centre Hospitalier Universitaire de Reims ( CHU Reims ), Laboratoire de Génie Civil et d'Ingénierie Environnementale ( LGCIE ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon ( INSA Lyon ), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Immunologie et Pathologie ( EA2216 ), Université de Brest ( UBO ) -IFR148, Micro et nanomédecines biomimétiques ( MINT ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université d'Angers ( UA ) -Université Bretagne Loire ( UBL ), Département d'Informatique - Université Laval ( IFT ), Université de Lille, Sciences Humaines et Sociales, Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Picardie Jules Verne ( UPJV ) -CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ) -PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ) -Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ) -PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] ( HEGP ), Service de Néphrologie et d’Immunologie Clinique, Hôpital Bretonneau-CHU Tours, Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau-Université de Tours (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-CHU Pontchaillou [Rennes]
Subjects: [ SDV.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2016

42. Versatile multicharacterization platform involving tailored superhydrophobic SU-8 micropillars for the investigation of breast cancer estrogen receptor isoforms

Author: Angelo Accardo, Emmanuelle Trevisiol, Aline Cerf, Christophe Thibault, Henrik Laurell, Melissa Buscato, Françoise Lenfant, Jean-François Arnal, Coralie Fontaine, Christophe Vieu, Équipe Ingénierie pour les sciences du vivant (LAAS-ELIA), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: 0301 basic medicine, Materials science, Estrogen receptor, Nanotechnology, Context (language use), [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, 02 engineering and technology, law.invention, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, law, Materials Chemistry, Electrical and Electronic Engineering, Fourier transform infrared spectroscopy, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Instrumentation, Process Chemistry and Technology, Molecular biophysics, 021001 nanoscience & nanotechnology, Surfaces, Coatings and Films, Electronic, Optical and Magnetic Materials, Characterization (materials science), 030104 developmental biology, symbols, Photolithography, 0210 nano-technology, Raman spectroscopy, Microfabrication
Abstract: International audience; Here, the authors report the fabrication of lotus-leaf-like tailored SU8 micropillars and their application in the context of a multitechnique characterization protocol for the investigation of the structural properties of the two estrogen receptors (ERα66/ERα46). ER (α) expression is undoubtedly the most important biomarker in breast cancer, as it provides the index for sensitivity to endocrine treatment. Beside the well-characterized ERα66 isoform, a shorter one (ERα46) is also expressed in ERα positive breast cancers and breast cancer cell lines. The superhydrophobic supports were developed by using a two-step approach including an optical lithography process and a plasma reactive ion roughening one. Upon drying on the micropillars, the biological samples resulted in stretched fibers of different diameters which were then characterized by synchrotron x-ray diffraction (XRD), Raman and Fourier-transform infrared spectroscopy. The evidence of both different spectroscopic vibrational responses and XRD signatures in the two estrogen receptors suggests the presence of conformational changes between the two biomarkers. The SU8 micropillar platform therefore represents a valid tool to enhance the discrimination sensitivity of structural features of this class of biomarkers by exploiting a multitechnique in situ characterization approach.
Published: 2016

43. Efficacy and Safety of Everolimus and Mycophenolic Acid With Early Tacrolimus Withdrawal After Liver Transplantation: A Multicenter Randomized Trial

Author: Christophe Duvoux, Georges Philippe Pageaux, Faouzi Saliba, Sébastien Dharancy, Jean Hardwigsen, Pauline Houssel-Debry, Yvon Calmus, D. Eyraud, Claire Vanlemmens, F. Di Giambattista, François Durand, Jean Gugenheim, Martine Neau-Cransac, Ephrem Salamé, Filomena Conti, Jérôme Dumortier, Nassim Kamar, Centre hépato-biliaire (CHB), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépatologie, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France., Hôpital Henri Mondor, Hôpital Universitaire l'Archet - Nice - France, Hôpital Universitaire Archet, Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Hôpital Trousseau, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Charles Foix [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Novartis Pharma SAS, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Département d'hépatologie, Novartis Pharma, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Eloi, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Subjects: Graft Rejection, Male, immunosuppressant, Basiliximab, medicine.medical_treatment, immunosuppression/immune modulation, 030230 surgery, Pharmacology, Liver transplantation, law.invention, 0302 clinical medicine, Postoperative Complications, Randomized controlled trial, law, Risk Factors, Immunology and Allergy, Pharmacology (medical), Prospective Studies, Graft Survival, Middle Aged, Prognosis, 3. Good health, surgical procedures, operative, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, glomerular filtration rate (GFR), Immunosuppressive Agents, medicine.drug, medicine.medical_specialty, Randomization, Urology, clinical research/practice, Mycophenolic acid, Tacrolimus, 03 medical and health sciences, mechanistic target of rapamycin (mTOR), medicine, Humans, Everolimus, calcineurin inhibitor (CNI), Transplantation, business.industry, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.IMM.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Immunotherapy, Mycophenolic Acid, Liver Transplantation, Calcineurin, business, liver transplantation/hepatology, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; SIMCER was a 6-mo, multicenter, open-label trial. Selected de novo liver transplant recipients were randomized (week 4) to everolimus with low-exposure tacrolimus discontinued by month 4 (n = 93) or to tacrolimus-based therapy (n = 95), both with basiliximab induction and enteric-coated mycophenolate sodium with or without steroids. The primary end point, change in estimated GFR (eGFR; MDRD formula) from randomization to week 24 after transplant, was superior with everolimus (mean eGFR change +1.1 vs. −13.3 mL/min per 1.73 m2 for everolimus vs. tacrolimus, respectively; difference 14.3 [95% confidence interval 7.3–21.3]; p 3], graft loss, or death) from randomization to week 24 was similar (everolimus 10.0%, tacrolimus 4.3%; p = 0.134). BPAR was more frequent between randomization and month 6 with everolimus (10.0% vs. 2.2%; p = 0.026); the rate of treated BPAR was 8.9% versus 2.2% (p = 0.055). Sixteen everolimus-treated patients (17.8%) and three tacrolimus-treated patients (3.2%) discontinued the study drug because of adverse events. In conclusion, early introduction of everolimus at an adequate exposure level with gradual calcineurin inhibitor (CNI) withdrawal after liver transplantation, supported by induction therapy and mycophenolic acid, is associated with a significant renal benefit versus CNI-based immunosuppression but more frequent BPAR.
Published: 2016

44. Sofosbuvir-based treatment of hepatitis C with severe fibrosis (METAVIR F3/F4) after liver transplantation results from the CO23 ANRS CUPILT study

Author: Dumortier, Jerome, Leroy, V., Duvoux, C., Lédinghen, V., Francoz, C., Houssel-Debry, P., Radenne, S., d'Alteroche, L., Fougerou-Leurent, C., Canva, V., Martino, V., Conti, F., Kamar, Nassim, Moreno, C., Lebray, P., Tran, A., Besch, C., Diallo, A., Rohel, A., Rossignol, E., Abergel, A., Botta-Fridlund, D., Coilly, A., Samuel, D., Duclos-Vallée, J.-C., Pageaux, G.-P., Département d'hépatologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Epidémiologie pronostique des cancers et affections graves, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépatologie, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France., Hôpital Henri Mondor, Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Services de Maladies de l'Appareil Digestif, Hôpital Claude Huriez, Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Lille, France, Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille-CHU Lille, Service d'Hépatologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Service de Transplantation, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg (CHU de Strasbourg ), Unité de la recherche fondamentale et clinique sur l' hépatite virale, France Recherche Nord & Sud Asdi-VIH Hépatites, Agence Nationale de Recherche sur le Sida, Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Image Science for Interventional Techniques (ISIT), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Clermont Université-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'hépato-gastroentérologie, Hôpital de la Conception, AP-HM, Marseille, Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Physiopathologie et traitement des maladies du foie, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Paul Brousse, Département d'Hépato-Gastroentérologie et de Transplantation Hépatique [CHU Saint-Eloi], Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Université de Montpellier (UM), National Agency for Research on Acquired Immune Deficiency Syndrome and Viral Hepatitis, Agence Nationale de Recherche sur le Sida, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université de Montpellier (UM)-CHU Saint-Eloi, Jonchère, Laurent, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], hepatitis C virus, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, [SDV.SP.MED] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, treatment, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, severe fibrosis (METAVIR F3/F4), [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, sofosbuvir-based, transplantation
Abstract: International audience; Recurrence of hepatitis C virus (HCV) after liver transplantation (LT) can rapidly lead to liver graft cirrhosis and, therefore, graft failure and retransplantation or death. The aim of the present study was to assess efficacy and tolerance of sofosbuvir (SOF)–based regimens for the treatment of HCV recurrence in patients with severe fibrosis after LT. The Compassionate Use of Protease Inhibitors in Viral C Liver Transplantation (CULPIT) study is a prospective multicenter cohort including patients with HCV recurrence following LT treated with second generation direct antivirals. The present study focused on patients included between October 2013 and November 2014 and diagnosed with HCV recurrence and liver graft extensive fibrosis (METAVIR F3/F4). A SOF-based regimen was administered to 125 patients fulfilling inclusion criteria. The median delay from LT was 95.9 ± 69.6 months. The characteristics of patients were as follows: mean age, 59.4 ± 9.0 years; 78.4% male; infected by HCV genotype 1: 78.2%, mean HCV RNA: 6.1 ± 1.0 log10 IU/mL. Eighty patients had failed previous post-LT antiviral therapy (64.0%) including triple therapy with first generation protease inhibitors in 19 (15.2%) patients. The main combination regimen was SOF/daclatasvir (73.6%). Ribavirin was used in 60 patients. Sustained virological response 12 weeks after treatment was 92.8% (on an intention-to-treat basis); 7 patients with virological failure were observed. Serious adverse events occurred in 25.6% of the patients during antiviral treatment. During antiviral treatment and follow-up, 3 patients were retransplanted and 4 patients died. In conclusion, SOF-based antiviral treatment shows very promising results in patients with HCV recurrence and severe fibrosis after LT. Liver Transplantation 22 1367–1378 2016 AASLD. © 2016 by the American Association for the Study of Liver Diseases
Published: 2016

45. TP53 drives invasion through expression of its Δ133p53β variant

Author: Frances V. Fuller-Pace, Samer Abdallah, Pierre Roux, Christelle Anguille, Marie P. Khoury, Alexandra Diot, Nikola Arsic, Valerie Meuray, Colin A. Purdie, Philip R. Quinlan, Judit Remenyi, Stï¿½phanie Vinot, Marion de Toledo, Sï¿½bastien M. Joruiz, Maï¿½lys Cren, Gilles Gadea, Lee B. Jordan, Kenneth Fernandes, Alastair M. Thompson, Jean-Christophe Bourdon, Centre de recherches de biochimie macromoléculaire ( CRBM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier ( IGMM ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre for Oncology and Molecular Medicine, University of Dundee-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre of Oncology and Molecular Medicine, Centre for Digital Music, Queen Mary University of London ( QMUL ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -IFR122-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Paul Sabatier - Toulouse 3 ( UPS ) -IFR31-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Department of Surgery and Molecular Oncology, University of Dundee, Department of Pathology [Dundee], Ninewells Hospital and Medical School [Dundee], Dundee Cancer Center, University of Dundee, Ninewells Hospital and Medical School, Cellules souches normales et cancéreuses, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Department of Breast Surgical Oncology [Houston], The University of Texas M.D. Anderson Cancer Center [Houston], Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies ( LIST ), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives ( CEA ) -Université Paris-Saclay, Centre de recherche en Biologie Cellulaire (CRBM), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), University of Dundee-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre de recherche en Biologie cellulaire de Montpellier (CRBM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Univ, Réunion
Subjects: 0301 basic medicine, Gene isoform, endocrine system diseases, QH301-705.5, Science, Mutant, Endogeny, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Biology, Bioinformatics, survival, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Metastasis, 03 medical and health sciences, Breast cancer, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], medicine, Biology (General), neoplasms, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Cancer Biology, General Immunology and Microbiology, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], General Neuroscience, EMT, Cancer, General Medicine, medicine.disease, 3. Good health, 030104 developmental biology, p53 isoforms, Cell culture, Cancer cell, Cancer research, [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Medicine, cancer invasion, Research Article, Human
Abstract: TP53 is conventionally thought to prevent cancer formation and progression to metastasis, while mutant TP53 has transforming activities. However, in the clinic, TP53 mutation status does not accurately predict cancer progression. Here we report, based on clinical analysis corroborated with experimental data, that the p53 isoform Δ133p53β promotes cancer cell invasion, regardless of TP53 mutation status. Δ133p53β increases risk of cancer recurrence and death in breast cancer patients. Furthermore Δ133p53β is critical to define invasiveness in a panel of breast and colon cell lines, expressing WT or mutant TP53. Endogenous mutant Δ133p53β depletion prevents invasiveness without affecting mutant full-length p53 protein expression. Mechanistically WT and mutant Δ133p53β induces EMT. Our findings provide explanations to 2 long-lasting and important clinical conundrums: how WT TP53 can promote cancer cell invasion and reciprocally why mutant TP53 gene does not systematically induce cancer progression. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.14734.001, eLife digest Most cancers are caused by a build-up of mutations that are acquired throughout life. One gene in particular, called TP53, is the most commonly mutated gene in many types of human cancers. This suggests that TP53 mutations play an important role in cancer development. It is widely considered that the TP53 gene normally stops tumors from forming, while mutant forms of the gene somehow promote cancer growth. Evidence from patients with cancer has shown, however, that the relationship between TP53 mutations and cancer is not that simple. Some very aggressive cancers that resist treatment and spread have a normal TP53 gene. Some cancers with a mutated gene do not spread and respond well to cancer treatments. Recent studies have shown that the normal TP53 gene produces many different versions of its protein, and that some of these naturally occurring forms are found more often in tumors that others. However, it was not clear if certain versions of TP53’s proteins contributed to the development of cancer. Now, Gadea, Arsic, Fernandes et al. show that Δ133p53β, one version of the protein produced by the TP53 gene in human cells, helps tumor cells to spread to other organs. Tests of 273 tumors taken from patients with breast cancer revealed that tumors with the Δ133p53β protein were more likely to spread. Patients with these Δ133p53β-containing tumors were also more likely to develop secondary tumors at other sites in the body and to die within five years. Next, a series of experiments showed that removing Δ133p53β from breast cancer cells grown in the laboratory made them less likely to invade, while adding it back had the opposite effect. The same thing happened in colon cancer cells grown in the laboratory. The experiments showed that Δ133p53β causes tumor cells with the normal TP53 gene or a mutated TP53 gene to spread to other organs. Together the new findings help explain why some aggressive cancers develop even with a normal version of the tumor-suppressing TP53 gene. They also help explain why not all cancers with a mutant version of the TP53 gene go on to spread. Future studies will be needed to determine whether drugs that prevent the production of the Δ133p53β protein can help to treat aggressive cancers. DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.14734.002
Published: 2016

46. Sex hormone levels are not associated with progression of renal disease in male patients with T2DM

Author: Bruno Guerci, Jean-Michel Halimi, Pierre Gourdy, Stéphanie Ragot, P. Zaoui, Ronan Roussel, Pierre-Jean Saulnier, Samy Hadjadj, Elise Gand, Dured Dardari, Philippe Sosner, E. Feigerlová, M. Marre, Ischémie Reperfusion en Transplantation d’Organes Mécanismes et Innovations Thérapeutiques ( IRTOMIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Poitiers, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), CIC - Poitiers, Université de Poitiers-Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Direction Générale de l'Organisation des Soins (DGOS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biomécanique et génie biomédical (BIM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Department of electrical, electronic and information engineering 'GUGLIELMO MARCONI' [Bologna] (DEI), Alma Mater Studiorum Università di Bologna [Bologna] (UNIBO), Service d'endocrinologie diabétologie et nutrition [Rennes], Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Anne-de-Bretagne, Centre EPIC [Institut de Cardiologie de Montréal], Université de Montréal (UdeM)-Montreal Heart Institute - Institut de Cardiologie de Montréal, CIC - CHU Bichat, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Poitiers-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Anne-de-Bretagne
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, medicine.drug_class, Endocrinology, Diabetes and Metabolism, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Renal function, 030209 endocrinology & metabolism, 030204 cardiovascular system & hematology, Gastroenterology, End stage renal disease, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Endocrinology, Sex hormone-binding globulin, Internal medicine, Sex Hormone-Binding Globulin, Internal Medicine, medicine, Humans, Diabetic Nephropathies, Testosterone, Prospective Studies, education, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Creatinine, education.field_of_study, biology, Estradiol, business.industry, General Medicine, Middle Aged, Androgen, 3. Good health, Cross-Sectional Studies, chemistry, Diabetes Mellitus, Type 2, Sex steroid, Case-Control Studies, biology.protein, Disease Progression, business, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: Background Greater renal function decline (RFD) in type 2 diabetes (T2DM) has been suggested in men compared with women, and imbalances in estrogen/androgen levels have been associated with cardiovascular disease mortality in elderly men, but it remains unclear whether sex hormone disequilibrium is related to diabetic nephropathy (DN) in men with T2DM. Objective This study examined the relationship between sex steroid concentrations and renal outcomes in male T2DM patients. Population and methods Total testosterone (T), total estradiol (E2), sex hormone-binding globulin (SHBG), and total and calculated free (cf) E2/T ratios were compared in 735 male T2DM patients with ( n =513) and without ( n =222) DN, using a cross-sectional approach. Also, in a pilot complementary prospective nested case-control cohort, total E2/total T and cfE2/cfT were evaluated according to a hard renal outcome (HRO): end-stage renal disease/doubling of baseline serum creatinine (36 HRO cases, 72 HRO controls) and rate of eGFR decline (68 rapid vs 68 slow RFD). Result With the cross-sectional approach, E2 and cfE2 were higher in DN cases vs DN controls (95.5 vs 86.8pmol/L [ P =0.0246] and 2.59 vs 2.36pmol/L [ P =0.005], respectively). The difference in E2 persisted on multivariate analysis. In the prospective approach, E2 and T concentrations, and total E2/total T and cfE2/cfT2 ratios did not differ in HRO cases vs controls or in patients with rapid vs slow RFD. Conclusion Although positively related to DN in the cross-sectional analysis, progression of renal disease in male patients with T2DM was not related to either sex hormone levels or aromatase index as reflected by E2/T ratio.
Published: 2016

47. Cassini in situ observations of long-duration magnetic reconnection in Saturn’s magnetotail

Author: James A. Slavin, Michelle F. Thomsen, Laurent Lamy, Ariah Kidder, Michele K. Dougherty, Aikaterina Radioti, Nick Sergis, Andrew Walsh, Daniel B. Reisenfeld, Philippe Zarka, Jonathan Eastwood, Caitriona M. Jackman, Andrew J. Coates, Gangkai Poh, Nicolas André, Xianzhe Jia, Chris S. Arridge, Martin Volwerk, KinetX Aerospace Inc., NASA Goddard Space Flight Center (GSFC), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'études spatiales et d'instrumentation en astrophysique (LESIA), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Physique Atmosphérique et Planétaire (LPAP), Université de Liège, Office for Space Research and Applications [Athens], Academy of Athens, Space Research Institute of Austrian Academy of Sciences (IWF), Austrian Academy of Sciences (OeAW), Observatoire de Paris - Site de Paris (OP), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Space and Atmospheric Physics Group [London], Blackett Laboratory, Imperial College London-Imperial College London, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), and Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 010504 meteorology & atmospheric sciences, Fluids & Plasmas, FOS: Physical sciences, General Physics and Astronomy, Magnetosphere, Astrophysics, 7. Clean energy, 01 natural sciences, Jupiter, Physics - Space Physics, Physics::Plasma Physics, Saturn, 0103 physical sciences, Astrophysics::Solar and Stellar Astrophysics, 010303 astronomy & astrophysics, 01 Mathematical Sciences, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0105 earth and related environmental sciences, Earth and Planetary Astrophysics (astro-ph.EP), Physics, [PHYS]Physics [physics], 02 Physical Sciences, Magnetic energy, Magnetic reconnection, Space Physics (physics.space-ph), Nanoflares, Magnetosphere of Saturn, Physics::Space Physics, Astrophysics::Earth and Planetary Astrophysics, Magnetosphere of Jupiter, [PHYS.ASTR]Physics [physics]/Astrophysics [astro-ph], Astrophysics - Earth and Planetary Astrophysics
Abstract: Magnetic reconnection is a fundamental process in solar system and astrophysical plasmas, through which stored magnetic energy associated with current sheets is converted into thermal, kinetic and wave energy. Magnetic reconnection is also thought to be a key process involved in shedding internally produced plasma from the giant magnetospheres at Jupiter and Saturn through topological reconfiguration of the magnetic field. The region where magnetic fields reconnect is known as the diffusion region and in this letter we report on the first encounter of the Cassini spacecraft with a diffusion region in Saturn's magnetotail. The data also show evidence of magnetic reconnection over a period of 19 h revealing that reconnection can, in fact, act for prolonged intervals in a rapidly rotating magnetosphere. We show that reconnection can be a significant pathway for internal plasma loss at Saturn. This counters the view of reconnection as a transient method of internal plasma loss at Saturn. These results, although directly relating to the magnetosphere of Saturn, have applications in the understanding of other rapidly rotating magnetospheres, including that of Jupiter and other astrophysical bodies., Comment: Initially submitted version (submitted 24 March 2015), published online in Nature Physics 30 November 2015
Published: 2016

48. Targeting KRAS for diagnosis, prognosis, and treatment of pancreatic cancer: Hopes and realities

Author: Pierre Cordelier, Camille Buscail, Fabrice Muscari, Louis Buscail, Barbara Bournet, Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Gastro-entérologie et Nutrition[Rangueil], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], Département d'Information Médicale, Centre Hospitalier Universitaire [Rennes]-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Chirurgie Générale et Digestive [Rangueil], Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service de l'information médicale [CHU Rennes], CHU Pontchaillou [Rennes], and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Oncology, Cancer Research, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], DNA Mutational Analysis, Biology, medicine.disease_cause, P21 RAS Protein, Diagnosis, Differential, Proto-Oncogene Proteins p21(ras), Pancreatic ductal adenocarcinoma, 03 medical and health sciences, Quantitative PCR, 0302 clinical medicine, Growth factor receptor, Predictive Value of Tests, Pancreatic cancer, Internal medicine, medicine, Biomarkers, Tumor, Animals, Humans, Genetic Predisposition to Disease, Molecular Targeted Therapy, Endoscopic Ultrasound-Guided Fine Needle Aspiration, MEK inhibitors, Oncogene, KRAS mutation, medicine.disease, Prognosis, Pancreatic Neoplasms, 030104 developmental biology, Real-time polymerase chain reaction, Phenotype, Cytopathology, 030220 oncology & carcinogenesis, Mutation, Cancer research, Adenocarcinoma, KRAS, Solid pancreatic masses, Carcinoma, Pancreatic Ductal, Signal Transduction
Abstract: International audience; Mutation of the KRAS oncogene in pancreatic cancer is responsible for permanent activation of the P21 RAS protein and the cascade of signalling pathways. Consequently, multiple cellular processes, such as transformation, proliferation, invasion, and survival are activated. The aim of this review was to present all potential clinical applications of targeting KRAS in terms of diagnosis and management of pancreatic adenocarcinoma. Quantitative polymerase chain reaction technology provides reliable assessment of KRAS mutations, both in tissues and from fine-needle aspiration biopsies. Numerous studies report that the combination of endoscopic ultrasound-guided cytopathology and a KRAS mutation assay can improve the positive and differential diagnosis of pancreatic cancer, differentiating between benign versus malignant solid pancreatic cancer, and reducing false-negative results compared to cytopathology alone. In addition, the presence of a KRAS mutation is frequently associated with a worse prognosis, both in cases of advanced and resected tumours. However, the KRAS mutation assay is not as efficient at predicting a response to both anti-epidermal growth factor receptor treatments and/or chemotherapy. Targeting of KRAS to treat pancreatic adenocarcinoma has been applied at different stages of RAS molecular intracellular processes: at the transcription level with antisense or interference RNA, at the posttranslational level with inhibitors of farnesyl transferase or anti-RAS vaccination peptides, and to target multiple signalling pathways using inhibitors of mitogen-activated protein kinase, phosphoinositide 3-kinase, AKT, mammalian target of rapamycin, RAF. Despite some encouraging results at pre-clinical and phase I stages, no significant clinical benefits have been observed. Combinatory approaches with standard chemotherapy will be welcome
Published: 2016

49. OUTCOME OF RETRANSPLANTED PATIENTS AFTER POST TRANSPLANT ă LYMPHOPROLIFERATIVE DISORDERS: A FRENCH NATIONWIDE STUDY

Author: Cellot, E., Provot, F., Thaunat, O., Anglicheau, D., ă Buchler, M., Dantal, J., Janbon, B., Kamar, N., Merville, P. ă, Frimat, L., Alamartine, E., Colosio, C., Heng, A. E., ă Lang, P., Moal, V., Rivalan, J., Etienne, I., Moulin, B., ă Caillard, S., Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Labex_Transplantex (Labex_Transplantex), Institut Necker Enfants-Malades (INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service Néphrologie et transplantation rénale Adultes [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Department of Multiorgan Transplantation, CHU Toulouse [Toulouse], Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Néphrologie [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Information – Technologies – Analyse Environnementale – Procédés Agricoles (UMR ITAP), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Labex_Transplantex ( Labex_Transplantex ), Institut Necker Enfants-Malades (INEM) ( INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut de médecine moléculaire de Rangueil ( I2MR ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes ( URMITE ), Institut de Recherche pour le Développement ( IRD ) -Aix Marseille Université ( AMU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -IFR48, INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Information – Technologies – Analyse Environnementale – Procédés Agricoles ( UMR ITAP ), and Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture ( IRSTEA ) -Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier ( Montpellier SupAgro )
Subjects: [ SDV.MHEP.MI ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; no abstract
Published: 2016

50. Should we keep using Ribavirin to Treat Hepatitis C Recurrence after Liver Transplantation? Results from the CO23 ANRS Cupilt Study

Author: Jean Charles Duclos-Vallée, F. Durand, Valérie Canva, V. Di Martino, Abou Diallo, G.-P. Pageaux, S. Radenne, Claire Fougerou-Leurent, Emilie Rossignol, Aurelie Veislinger, Pauline Houssel-Debry, Rodolphe Anty, H. Danjou, Vincent Leroy, Christophe Duvoux, L. D’Alteroche, C. Silvain, Audrey Coilly, V. de Ledinghen, Camille Besch, Caroline Jezequel, Maryline Debette-Gratien, A. Rohel, François Habersetzer, Nassim Kamar, H. Montialoux, Jérôme Dumortier, Armando Abergel, Christophe Moreno, Fabio Conti, Pascal Lebray, Danielle Botta-Fridlund, P. Perré, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service d'Hépatologie, Hôpital Henri Mondor, AP-HP, Créteil, France., Hôpital Henri Mondor, Hôpital Paul Brousse, Département d'hépatologie, Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de médecine moléculaire de Rangueil (I2MR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-IFR150-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Services de Maladies de l'Appareil Digestif, Hôpital Claude Huriez, Centre Hospitalier Universitaire de Lille, Lille, France, Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille-CHU Lille, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Service d'hépato-gastroentérologie, Hôpital de la Conception, AP-HM, Marseille, Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Hôpital Erasme [Bruxelles] (ULB), Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Laboratoire Inflammation, Tissus épithéliaux et Cytokines (LITEC), Université de Poitiers, Service de Transplantation, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg, Centre Hospitalier Universitaire de Strasbourg (CHU de Strasbourg ), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Unité de la recherche fondamentale et clinique sur l' hépatite virale, France Recherche Nord & Sud Asdi-VIH Hépatites, Agence Nationale de Recherche sur le Sida, Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)- Institut Fédératif de Recherche Bio-médicale Institution (IFR150)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: medicine.medical_specialty, Hepatology, business.industry, medicine.medical_treatment, Ribavirin, [SDV]Life Sciences [q-bio], Hepatitis C, 030230 surgery, Liver transplantation, medicine.disease, Gastroenterology, 3. Good health, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, chemistry, Internal medicine, Medicine, 030211 gastroenterology & hepatology, business
Abstract: International audience; EASL International Liver Congress, APR 13-17, 2016, Barcelona, SPAIN
Published: 2016

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