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Cet article s’intéresse à l’émergence, la structuration et la déstabilisation, en France, d’un « régime intensif de sélection » en matière de gestion des ressources génétiques animales en agriculture. Ce régime, remplaçant à la fin des années 1960 les précédentes formes de sélection, a la particularité d’avoir reposé sur des dispositifs coopératifs à dimension publique associant éleveurs et la recherche publique, et d’avoir été fortement encadré par l’État. Au travers de l’analyse longitudinale du cas de la sélection génétique de races ovines laitières locales en Pyrénées-Atlantiques, nous retraçons les processus de construction institutionnelle des formes et pratiques de sélection animale au travers de la transformation conjointe des modes de production de connaissances, des objets et des marchés des ressources génétiques animales. Nous identifions plus largement différents régimes de sélection, reposant sur des modes de production de connaissances en tension, dont la coexistence, dans le cas étudié, menace la coopération indispensable au maintien des races locales. Nous mettons en lumière l’émergence de régimes néo-communautaires de sélection et montrons en quoi les progrès scientifiques (génomique) et les changements de politiques publiques reconfigurent le paysage organisationnel des activités de gestion des ressources génétiques animales. This article analyzes the emergence, structuring and undermining, in France, of an “intensive breeding regime” in the realm of animal genetic resources management in agriculture. In the 60’s, this regime replaced previous breeding practices. This regime is characterized by a cooperative and public organization between farmers and public research, and a strong State regulation of the production of knowledge on animals and breeding markets. Based on a longitudinal study of breeding activities in the Western-Pyrenees sheep milk industry, this article identifies the processes of institutional emergence of contemporary animal breeding practices. It focuses on the joint transformation of modes of knowledge production, objects and markets for animal genetic resources. This analysis helps identifying several breeding regimes, based on different modes of knowledge in tension. Their coexistence, in the case under study, threatens the compulsory cooperation for maintaining local breeds. It highlights the emergence of neo-communitarian breeding regimes and addresses the question of how recent scientific innovations (genomic tools for example) and political changes impact the socio-economic organization of animal genetic resources management. Este artículo se enfoca en la emergencia, estructuración y desestabilización, en Francia, de un «régimen intensivo de selección» en el ámbito de la gestión de los recursos genéticos pecuarios. Dicho régimen –que sustituyó a fines de los años 1960 a las antiguas formas de selección– se apoya sobre dispositivos estatales que facilitan la cooperación entre los ganaderos y la investigación pública. El análisis longitudinal del caso de la selección genética de las razas ovinas lecheras locales, en el departamento de los Pirineos-Atlánticos, nos permite reconstituir el proceso de construcción institucional de las formas y prácticas de selección de los animales a través de la transformación conjunta de los modos de producción del conocimiento, los objetos y mercados de los recursos genéticos pecuarios. De manera más amplia, identificamos distintos regímenes de selección y mostramos la tensión que prevalecen entre los distintos modos de producción de los conocimientos, cuya coexistencia en el caso estudiado amenaza la cooperación imprescindible para el mantenimiento de las razas locales. Ponemos de manifiesto la emergencia de regímenes neo-comunitarios de selección y mostramos cómo los avances científicos (genómica) y los cambios de políticas públicas reconfiguran el paisaje organizacional de las actividades de gestión de los recursos genéticos pecuarios.

International audience

International audience; For the past 50 yr, practices for ex situ preservation of endangered breeds have been extended. Semen and primordial germ cells, gonadic tissues have been frozen to create genetic stocks of chicken genetic diversity in cryobanks. Semen cryopreservation stays the preferred method since it is not invasive. Many protocols have been developed to cryopreserve chicken semen, but they give highly variable success rate. The aim of the present study was to standardize and prove the effectiveness of semen long-term storage for the restitution of lost families. We showed that semen straws stored for 18 yr in liquid nitrogen did not lose their fertilizing ability. We demonstrated the usefulness of cryopreserved semen stored in the French National Cryobank for the recovery of families of a subfertile experimental chicken line. In order to highlight the standardization of the cryopreserved method, different cryoprotectant protocols were also tested on a rare breed, freezing/thawing and insemination conditions were controlled. The best results were obtained using glycerol protocol, a sperm dilution of 1:4 (semen:extender). The insemination dose of 200 million sperm/female was as efficient as 400 million of sperm. Altogether, these results demonstrated the effectiveness of chicken semen long-term storage for the restoration of lost genetic resources and highlighted the importance of standardized chicken semen cryopreservation using procedures combining biophysical (cryoprotectants, freezing/thawing conditions) and zootechnical (artificial insemination) features.

The Algerian sheep stock remains little known, despite its high economic value and the very precious qualities of the local breeds which show exceptional adaptation under extreme environmental conditions. The phenotypic variability of Rembi, an endangered Algerian breed, was studied by multivariate discriminant analysis. Sampling took into account the diversity of production environments in the country according to FAO recommendations. In total 722 females and 60 males were phenotyped across a wide area including the cradle of the breed, using 21 quantitative and 12 qualitative variables. The results show strong phenotypic homogeneity, thus suggesting intrabreed homogeneity at the genetic level, to be confirmed by molecular analysis. Indeed, there was no evidence of a phenotypic structure when considering the farm status (private/State-owned), the climate zone (arid/semi-arid/subhumid), herd mobility (sedentary/semi-sedentary/transhumant) or the variety. Only the region factor discriminated subgroups within the breed. Trade, organized around major markets, promotes the flow of individuals between regions and seems responsible for the single phenotypic model. These results finely characterized the Rembi breed for the first time. Morphological indices place it in particular among meat breeds. This study is the first step toward the implementation of conservation programs for this breed, highly threatened by crosses with the Ouled-Djellal, the dominant Algerian breed.

EnglishThe evolving nature of a local breed can disrupt its relationships with its home territory. We explore such relationships through the case of dairy sheep breeds of Corsica island and French Western Pyrenees. We analyze the trajectory of evolution of these breeds according to the evolving patterns of breeding and the valorization of cheeses (PDO Brocciu and PDO Ossau-Iraty). The local breeds and their selection settings are put in tension between choices of cheese qualification (proof of origin), and the choice of breeding, which can be contradictory processes: intensification of farming systems and re-anchorage of products. In Western Pyrenees, recent appropriation of local breeds leads to renewing their selection settings. There are no such noticeable processes in Corsica. Thus, territorialization of agriculture challenges the territoriality of the local breeds francaisLe caractere evolutif d’une race locale peut perturber ses relations avec son territoire d’origine. Nous les explorons a travers le cas des races ovines laitieres de Corse et des Pyrenees-Atlantiques. Nous analysons la trajectoire de ces races en regard de l’evolution des modeles d’elevage et de la valorisation des fromages de terroir (AOP Brocciu et AOP Ossau-Iraty). Les races locales et leurs referentiels de selection sont mis en tension entre des choix de qualification des fromages, et des choix d’elevage, deux processus parfois contradictoires : intensification des systemes d’elevage et re-ancrage des produits. Alors qu’en Pyrenees-Atlantiques, l’enjeu de durabilite locale des elevages pousse a une nouvelle appropriation des races locales et a renover les referentiels de selection, on n’observe pas de tel phenomene en Corse. La reterritorialisation de l’agriculture interroge ainsi la territorialite des races locales.

Lettre de la Cryobanque Nationale; Des avancées sur les techniques de cryopréservation de la semence et sur son utilisation en insémination animale

International audience

Apports de la génétique sur la santé de la mamelle et le débit de traite. 2. Journée UMT SPR – OMACAP

A total of 6440 female sheep from Burkina Faso were scored for seven body measurements and four qualitative morphological traits. Sampling included the three main environmental areas and sheep breeds of Burkina Faso: the Sahel area (Burkina-Sahel sheep), the SudanSahel area (Mossi sheep) and the Sudan area (Djallonke sheep). Canonical analyses showed that differences in body measurements between the Sudan and the Sudan-Sahel sheep were small even though most body traits showed higher average values in the Burkina-Sahel sheep: the shortest Mahalanobis distance was found between the Sudan and the SudanSahel populations (1.54), whilst that between the Sudan and the Sahelian populations was the largest (7.88). Discriminant analysis showed that most Sudan (Djallonke) individuals (60.85%) were classified as Sudan-Sahel (Mossi) individuals whilst most Burkina-Sahel individuals were classified into their environmental area of sampling (89.46%). Correspondence analyses indicated that the Burkina-Sahel sheep population clustered together with dropping ears, black and brown colour patterns and presence of wattles, the Sudan sheep were closely associated with long hair and vertical and curled ears and that the Sudan-Sahel sheep did not have clear associations with qualitative phenotypic traits. At the morphological level, the Sudan-Sahel (Mossi) sheep population can be considered a geographical subpopulation belonging to the Djallonke breed, showing some particularities, namely larger body size, due to the particular environmental condition of the area in which it is managed and a continuous gene flow from Sahelian sheep, The information reported in this study will be the basis for the establishment of further characterization, conservation and selection strategies for Burkina Faso sheep.

International audience; The Belgian Blue cattle breed is a core example to illustrate the notion of lock-in in animal production. We study in this paper the situation of another hyper specialized breed, the Belgian Texel sheep, and we requestion an animal genetic resources management set-up, crossing both approaches of lock-in and of localization of agrifood systems. This work leads us to show how the Belgian Blue is a model for Belgian Texel stakeholders, even if the lock-in modalities are different. We discuss the question of adaptation and adaptive capacities of local breeds. Finally, we underline the importance of questioning what is the meaning of "local" for the stakeholders.; Le cas de la race bovine hyperspécialisée Blanc Bleu Belge illustre de façon emblématique la notion de verrouillage en élevage. Cet article étudie la situation d’une autre race hyper-spécialisée, le mouton Texel Belge, à partir de laquelle nous requestionnons un dispositif de gestion d’une ressource génétique animale en croisant une approche par les régimes socio-techniques et les verrouillages et une approche par l’ancrage local. Après avoir montré en quoi le Blanc Bleu Belge fait figure de modèle pour les sélectionneurs de Texel Belge, et bien que les formes de verrouillage associées ne soient pas entièrement similaires, nous discutons de l’adaptation et des capacités adaptatives des races locales, mais aussi de la nécessité de questionner, dans les dispositifs de gestion des ressources génétiques, quel est le « local » qui fait sens pour les acteurs impliqués car celui-ci peut prendre de multiples formes.

La carpe est le premier poisson de pisciculture à Madagascar ; sa population est issue d'introductions dont la première date de 1912. Partant d'un souci de recenser les ressources génétiques actuelles de cette espèce d'élevage au niveau national, des poissons de plusieurs bassins versants du milieu naturel et d'éleveurs variés ont été analysés. En parallèle, les producteurs d'alevins ont été enquêtés afin de comprendre si leurs pratiques étaient susceptibles d'avoir conservé des populations avec des caractéristiques spécifiques. Ce travail montre que la présentation habituelle des différentes variétés ne résiste pas à l'analyse génétique. Un réseau très actif d'écloseries incluant de nombreux producteurs de taille variable et donc un très grand nombre de géniteurs s'est montré en capacité d'entretenir une souche avec une bonne potentialité. Ce vaste réseau de producteurs d'alevins, de tailles différentes, constitue une ressource précieuse pour le développement de cet élevage qu'il convient de mettre en valeur. Les résultats obtenus sur le tilapia sont présentés en parallèle soulignant l'intérêt de s'interroger sur les ressources génétiques présentes.

Frontiers in Genetics, 5, ISSN:1664-8021

Gastrointestinal nematode (GIN) infections have an important negative impact on small ruminant production. The selection of genotypes resistant to these parasitic infections is a promising alternative control strategy. Thus, resistance against GIN is an important component of small ruminant breeding schemes, based on phenotypic measurements of resistance in immune mature infected animals. In this study we evaluated both the impact of the post-weaning parasitism history on the response to an experimental Haemonchus contortus infection of resistant and susceptible Creole kids chosen on the basis of their estimated breeding value, and the interaction with the kid's genetic status. During the post-weaning period (from 3 months until 7 months of age) Creole kids were reared at pasture according to four different levels of a mixed rotational stocking system with Creole cattle: 100% (control), 75% (GG75), 50% (GG50), and 25% (GG25) of the total stocking rate of the pasture. The level of infection of the kids decreased significantly at 50% and 25% of the total stocking rate. After the post-weaning period at pasture, at 11 months of age kids were experimentally infected with H. contortus. The faecal egg counts (FEC) were significantly lower in the groups showing the highest FEC at pasture. This result suggests that a degree of protection against an experimental H. contortus infection occurred during the post-weaning period and was dependant on the level of parasitism. Interestingly, no interaction was observed between this level of protection and the genetic status. In conclusion, the level of post-weaning natural parasitism history at pasture would not influence the genetic status evaluation. More generally our results suggest that it would be better to expose kids to a high level of gastrointestinal parasitism during the post-weaning period in order to increase the basal level of resistance thereafter.

Background The advent and democratization of next generation sequencing and genotyping technologies lead to a huge amount of data for the characterization of population genetic diversity in model and non model-species. However, efficient storage, management, cross-analyzing and exploration of such dense genotyping datasets remain challenging. This is particularly true for the bovine species where many SNP datasets have been generated in various cattle populations with different genotyping tools. Description We developed WIDDE, a Web-Interfaced Next Generation Database that stands as a generic tool applicable to a wide range of species and marker types (http://widde.toulouse.inra.fr). As a first illustration, we hereby describe its first version dedicated to cattle biodiversity, which includes a large and evolving cattle genotyping dataset for over 750,000 SNPs available on 129 (89 public) different cattle populations representative of the world-wide bovine genetic diversity and on 7 outgroup bovid species. This version proposes an optional marker and individual filtering step, an export of genotyping data in different popular formats, and an exploration of genetic diversity through a principal component analysis. Users can also explore their own genotyping data together with data from WIDDE, assign their samples to WIDDE populations based on distance assignment method and supervised clustering, and estimate their ancestry composition relative to the populations represented in the database. Conclusion The cattle version of WIDDE represents to our knowledge the first database dedicated to cattle biodiversity and SNP genotyping data that will be very useful for researchers interested in this field. As a generic tool applicable to a wide range of marker types, WIDDE is overall intended to the genetic diversity exploration of any species and will be extended to other species shortly. The structure makes it easy to include additional output formats and new tools dedicated to genetic diversity exploration. Electronic supplementary material The online version of this article (doi:10.1186/s12864-015-2181-1) contains supplementary material, which is available to authorized users.

Le néologisme « agro-écologie » est apparu dans la littérature dans les années 30, d’abord pour désigner une discipline scientifique au carrefour de l’écologie et de l’agronomie, puis à partir des années 70 un ensemble de pratiques et un mouvement social en réaction à l’intensification de l’agriculture (Wezel et al., 2009). Francis et al. (2003) ont encore élargi cette définition en considérant l’ensemble des dimensions environnementales et socio-économiques à l’échelle des filières. Dans son acception scientifique, qui est l’angle choisi dans cette étude, l’agro-écologie se définit comme l’application des concepts et principes de l’écologie à la conception et à la gestion d’agroécosystèmes durables. La question du bouclage des cycles pour limiter les intrants et les pollutions par une meilleure réutilisation des sorties des différents ateliers est au coeur de ces problématiques. On vise également un recours accru à des régulations biologiques et écologiques que l’on cherche à piloter au mieux des attendus de l’élevage. Ceci implique de prendre en compte la diversité biologique à tous ses niveaux d'organisation, de comprendre et d’utiliser les capacités adaptatives des animaux et les interactions biotiques dans les agroécosystèmes, en considérant les systèmes de culture ou les systèmes d'élevage comme des écosystèmes particuliers (Dumont et al. 2013). Ainsi, l’agro-écologie s’inscrit-elle dans un mouvement de fond autour du « Comment produire autrement ? » dans des systèmes de production dont on cherche à concilier les performances techniques, environnementales, économiques et sociales. Lancé le 18 décembre 2012, le Projet Agro-Ecologique pour la France (PAEF) vise à conjuguer l’ensemble de ces performances tant au niveau de l'exploitation qu’au niveau collectif (territoires, filières, etc.). Il s’agit d’engager une évolution des systèmes de production, qui remette l’agronomie au coeur des pratiques, pour combiner ces différentes performances. La Loi n° 2014-1170 du 13 octobre 2014 dite Loi d'avenir pour l'agriculture, l'alimentation et la forêt en donne la définition suivante : « Les politiques publiques visent à promouvoir et à pérenniser les systèmes de production agro-écologiques, dont le mode de production biologique, qui combinent performance économique, sociale, notamment au travers d’un haut niveau de protection sociale, environnementale et sanitaire. Ces systèmes privilégient l'autonomie des exploitations agricoles et l'amélioration de leur compétitivité, en maintenant ou en augmentant la rentabilité économique, en améliorant la valeur ajoutée des productions et en réduisant la consommation d'énergie, d'eau, d'engrais, de produits phytopharmaceutiques et de médicaments vétérinaires, en particulier les antibiotiques. Ils sont fondés sur les interactions biologiques et l'utilisation des services écosystémiques et des potentiels offerts par les ressources naturelles, en particulier les ressources en eau, la biodiversité, la photosynthèse, les sols et l'air, en maintenant leur capacité de renouvellement du point de vue qualitatif et quantitatif. Ils contribuent à l'atténuation et à l'adaptation aux effets du changement climatique.

La gestion des races locales repose sur des dispositifs coopératifs qui sont aujourd’hui au cœur de différentes tensions (libéralisation des marchés de la génétique, diminution des financements publics, développement de nouvelles technologies). Or ces races locales sont des biens communs et le maintien de leur diversité est un enjeu pour assurer un développement durable des capacités d’élevage dans le futur. Cet article vise à comprendre sur quoi repose la coopération au sein des dispositifs de gestion de ces races, et quelles sont les initiatives et innovations sociales qui peuvent être développées pour la favoriser. Le cas étudié ici est celui des races locales de brebis laitières dans les Pyrénées-Atlantiques, dont les schémas de sélection ont fait l’objet de difficultés de coopération. Après avoir défini différents « régimes de sélection » se succédant dans le temps et rentrant parfois en conflit autour de la même ressource, nous analysons trois dimensions de ces dispositifs coopératifs (la conception et les usages des outils de sélection, les activités collectives de qualification, le marché des reproducteurs). Nous concluons par la présentation de différentes démarches innovantes pour favoriser la coopération et redéfinir un projet partagé autour de la gestion de ces ressources., The preservation and genetic improvement of local breeds relies on cooperative and distributed organizations, which are facing increasing tensions (liberalization of breeding markets, decrease in public funding, development of genomic technologies, etc.). Local breeds are common goods and their diversity is a major asset for the sustainable development of livestock systems in the future. This article aims at understanding cooperation difficulties in the management of local breeds, and what types of social innovations and initiatives can be drawn to favour this cooperation. We analyse the case of local milk sheep breeds in the Western Pyrenees, where cooperation for their management is at stake. First, we define several breeding regimes and identify how they are sometimes conflicting around a same resource. Then, we define three important dimensions for cooperation in the management of local breeds (the design and uses of breeding tools, qualification activities, and markets for breeding animals). We conclude in presenting several innovative initiatives to favour cooperation and define a shared project for the management of such animal resources.

absent

National audience; Animal genetic resources can be involved in valorisation with strong stakes and consequences on resource management. In this paper we show that it is necessary to take into account the various ways to add value to local breeds, for instance products without PDO (see the Bretonne Pie Noir breed case) or landscape management (see the Solognote breed case). Indeed, the results of research concerning interactions between local breed management and PDO products show different consequences of such projects on local breeds but we show that other ways of adding value must be considered (food products, without PDO, specific livestock farming system, landscape management, non food products etc.). They must be considered in further research, by identifying the specificity involved.; Un certain nombre de ressources génétiques animales sont mobilisées dans des démarches de valorisation qui représentent un enjeu fort et ne sont pas sans conséquence sur la façon dont ces ressources sont gérées. Nous montrons, en mobilisant des exemples de valorisation de races locales, combien il est important d’étendre les recherches aux formes de valorisation autres que sous formes de Signes Officiels de Qualité (SOQ) territorialisés. Le cas de la Bretonne Pie Noir, par exemple, invite à considérer les produits valorisés en dehors des SOQ et celui de la brebis Solognote invite à considérer la mobilisation de ces races pour la gestion d’espaces spécifiques. D’une manière générale, les avancées dans les travaux de recherche sur les interactions entre races locales et produits sous AOP invitent à étendre le questionnement à d’autres formes de valorisation, qui posent différemment la question de l’interaction, et qui ne sont pas sans réinterroger la gestion génétique des races. Nous discutons les spécificités de démarche qu’implique pour la recherche le fait d’aborder l’ensemble de ces formes de valorisation.

Un certain nombre de ressources génétiques animales sont mobilisées dans des démarches de valorisation qui représentent un enjeu fort et ne sont pas sans conséquence sur la façon dont ces ressources sont gérées. Nous montrons, en mobilisant des exemples de valorisation de races locales, combien il est important d’étendre les recherches aux formes de valorisation autres que sous formes de Signes Officiels de Qualité (SOQ) territorialisés. Le cas de la Bretonne Pie Noir, par exemple, invite à considérer les produits valorisés en dehors des SOQ et celui de la brebis Solognote invite à considérer la mobilisation de ces races pour la gestion d’espaces spécifiques. D’une manière générale, les avancées dans les travaux de recherche sur les interactions entre races locales et produits sous AOP invitent à étendre le questionnement à d’autres formes de valorisation, qui posent différemment la question de l’interaction, et qui ne sont pas sans réinterroger la gestion génétique des races. Nous discutons les spécificités de démarche qu’implique pour la recherche le fait d’aborder l’ensemble de ces formes de valorisation., Animal genetic resources can be involved in valorisation with strong stakes and consequences on resource management. In this paper we show that it is necessary to take into account the various ways to add value to local breeds, for instance products without PDO (see the Bretonne Pie Noir breed case) or landscape management (see the Solognote breed case). Indeed, the results of research concerning interactions between local breed management and PDO products show different consequences of such projects on local breeds but we show that other ways of adding value must be considered (food products, without PDO, specific livestock farming system, landscape management, non food products etc.). They must be considered in further research, by identifying the specificity involved.

Le lancement du projet PROCAMED signe le 9 janvier 2012 était prévu lors d'un séminaire qui s'est tenu a Djerba du 27 février au 1 er mars 2012. A cette occasion, tous les partenaires étaient présents, à savoir, outre le coordonateur et les responsables scientifiques, administratifs et financiers du projet pour le CIRAD (Sophie Janssen, Martine Enjame, Céline Dutilly), les collègues de l'Université de Bari (Italie), du Desert Research Center (Egypte) et de l'Institut des régions arides (Tunisie), à raison de 4 personnes par délégation et de tous les intervenants tunisiens du projet, soit environ au total environ 35 personnes. Par ailleurs, un représentant le l'AGC, structure contractante, a participé a la journée consacrée aux aspects financiers.

The expansion of intensive livestock production systems in developing countries has increased the introduction of highly productive exotic breeds facilitating indiscriminate crossbreeding with local breeds. In this study, we set out to investigate the genetic status of the Vietnamese Black H'mong pig breed by evaluating (1) genetic diversity and (2) introgression from exotic breeds. Two exotic breeds, namely Landrace and Yorkshire used for crossbreeding, and the H'mong pig population from Ha Giang (HG) province were investigated using microsatellite markers. Within the province, three phenotypes were observed: a White, a Spotted and a Black phenotype. Genetic differentiation between phenotypes was low (0.5-6.1%). The White phenotypes showed intermediate admixture values between exotic breeds and the Black HG population (0.53), indicating a crossbreed status. Management practices were used to predict the rate of private diversity loss due to exotic gene introgressions. After 60 generations, 100% of Black private alleles will be lost. This loss is accelerated if the admixture rate is increased but can be slowed down if the mortality rate (e.g., recruitment rate) is decreased. Our study showed that a large number of markers are needed for accurately identifying hybrid classes for closely related populations. While our estimate of admixture still seems underestimated, genetic erosion can occur very fast even through indiscriminate crossbreeding.

Cet article s’intéresse à l’émergence, la structuration et la déstabilisation, en France, d’un « régime intensif de sélection » en matière de gestion des ressources génétiques animales en agriculture. Ce régime, remplaçant à la fin des années 1960 les précédentes formes de sélection, a la particularité d’avoir reposé sur des dispositifs coopératifs à dimension publique associant éleveurs et la recherche publique, et d’avoir été fortement encadré par l’État. Au travers de l’analyse longitudinale du cas de la sélection génétique de races ovines laitières locales en Pyrénées-Atlantiques, nous retraçons les processus de construction institutionnelle des formes et pratiques de sélection animale au travers de la transformation conjointe des modes de production de connaissances, des objets et des marchés des ressources génétiques animales. Nous identifions plus largement différents régimes de sélection, reposant sur des modes de production de connaissances en tension, dont la coexistence, dans le cas étudié, menace la coopération indispensable au maintien des races locales. Nous mettons en lumière l’émergence de régimes néo-communautaires de sélection et montrons en quoi les progrès scientifiques (génomique) et les changements de politiques publiques reconfigurent le paysage organisationnel des activités de gestion des ressources génétiques animales.

Correspondance: Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium, E-mail: editorial.office@molecol.com; International audience; This article documents the addition of 512 microsatellite marker loci and nine pairs of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecology Resources Database. Loci were developed for the following species: Alcippe morrisonia morrisonia, Bashania fangiana, Bashania fargesii, Chaetodon vagabundus, Colletes floralis, Coluber constrictor flaviventris, Coptotermes gestroi, Crotophaga major, Cyprinella lutrensis, Danaus plexippus, Fagus grandifolia, Falco tinnunculus, Fletcherimyia fletcheri, Hydrilla verticillata, Laterallus jamaicensis coturniculus, Leavenworthia alabamica, Marmosops incanus, Miichthys miiuy, Nasua nasua, Noturus exilis, Odontesthes bonariensis, Quadrula fragosa, Pinctada maxima, Pseudaletia separata, Pseudoperonospora cubensis, Podocarpus elatus, Portunus trituberculatus, Rhagoletis cerasi, Rhinella schneideri, Sarracenia alata, Skeletonema marinoi, Sminthurus viridis, Syngnathus abaster, Uroteuthis (Photololigo) chinensis, Verticillium dahliae, Wasmannia auropunctata, and Zygochlamys patagonica. These loci were cross-tested on the following species: Chaetodon baronessa, Falco columbarius, Falco eleonorae, Falco naumanni, Falco peregrinus, Falco subbuteo, Didelphis aurita, Gracilinanus microtarsus, Marmosops paulensis, Monodelphis Americana, Odontesthes hatcheri, Podocarpus grayi, Podocarpus lawrencei, Podocarpus smithii, Portunus pelagicus, Syngnathus acus, Syngnathus typhle,Uroteuthis (Photololigo) edulis, Uroteuthis (Photololigo) duvauceli and Verticillium albo-atrum. This article also documents the addition of nine sequencing primer pairs and sixteen allele specific primers or probes for Oncorhynchus mykiss and Oncorhynchus tshawytscha; these primers and assays were cross-tested in both species.

Cet article s'intéresse à l'émergence, la structuration et la déstabilisation, en France, d'un " régime intensif de sélection " en matière de gestion des ressources génétiques animales en agriculture. Ce régime, remplaçant à la fin des années 1960 les précédentes formes de sélection, a la particularité d'avoir reposé sur des dispositifs coopératifs à dimension publique associant éleveurs et la recherche publique, et d'avoir été fortement encadré par l'État. Au travers de l'analyse longitudinale du cas de la sélection génétique de races ovines laitières locales en Pyrénées-Atlantiques, nous retraçons les processus de construction institutionnelle des formes et pratiques de sélection animale au travers de la transformation conjointe des modes de production de connaissances, des objets et des marchés des ressources génétiques animales. Nous identifions plus largement différents régimes de sélection, reposant sur des modes de production de connaissances en tension, dont la coexistence, dans le cas étudié, menace la coopération indispensable au maintien des races locales. Nous mettons en lumière l'émergence de régimes néo-communautaires de sélection et montrons en quoi les progrès scientifiques (génomique) et les changements de politiques publiques reconfigurent le paysage organisationnel des activités de gestion des ressources génétiques animales.

The present study aimed at investigating characteristics of reproduction, growth and meat quality traits of Lung pu pig breed was undertaken. Data collected from 40 sows, 10 boars and 48 fattening Lung Pu pigs in different experiments in Meo Vac and Hoang Su Phi districts, belonging Ha Giang province from 2006 to 2007 were used. It was found out in the survey that Lung Pu pig had the black coat color, except the front, feet and end of the tail; medium to big sizes and a good adaptation to harsh conditions of the high mountain areas of Vietnam. The number born alive (NBA) of first two litters in trails 1 was higher than that of the control groups. The number of weaned pigs (NW), weight at birth (BW) and weaning (WW) had similar tendency as NBA. The average daily gain (ADG) of selected pigs and control groups was 396.75, 20.17 g/day, respectively. The loin area was 22.09 cm2 and lipid percentage was 25.34%. Meat percentage was similar to that of other local pigs. It appeared that selected Lung Pu pigs performed better than unselected Lung Pu pigs (the control groups). Therefore, to get any success in the genetic improvement and/or genetic conservation of Lung Pu pigs, nuclear herds should be established and more training courses for farmers would be necessary.

The current study aiming at Goat populations in Ha Giang based on microsatellite markers was undertaken. A total of 301 goats from 5 districts in Ha Giang were genotyped for 20 microsatellite markers recommended by FAO. Seventeen of twenty microsatellite markers used in this analysis had four or more alleles with mean number of allele/locus were 7.12. The mean expected heterozygote and the mean observed heterozygote for all populations ranged from 0.22 (SRCRSP7 and INRA063) to 0.63 (OARFCB20) and 0.28 (SRCRSP7) to 0.76 (OARAE54), respectively. The mean Fis of 0.293 showed high inbreeding in Ha Giang goat populations. The mean Fst (0.047) demonstrated that about 95.3% of the total genetic variation was due to the genetic differentiation within each population. A phylogenetic tree based on the Nei (1972) standard genetic distance displayed 3 genetic groups: Dong Van, Meo Vac and Quan Ba, Hoang Su Phi and Xin Man group in the population. The mean Fis values of phenotypic groups (hornless, long-hair and prolific group) ranged from 0.275 to 0.331. Genetic variation (Fst values) between these groups was very small. Conservation of Ha Giang goat populations should be established according to phenotypic characteristics.

Dans les initiatives conjointes de conservation des ressources génétiques, tant d'origine animale que végétale, menées avec les Centres du CGIAR, les compétences offertes par des scientifiques français conjuguées aux points forts des instituts nationaux de recherche contribuent, de diverses manières importantes, à faire en sorte que la biodiversité agricole dans le monde devienne le fondement d'un type d'intensification de la production agricole plus durable, qui repose non sur la simplification, mais sur l'intégration de la biodiversité dans les systèmes agricoles. Le succès de la cryconservation de graines de café au Costa Rica, qui permet de conserver une précieuse collection de cette espèce, représente un exemple significatif de collaboration destinée à préserver et à utiliser la biodiversité agricole pour répondre à des besoins futurs imprévisibles et améliorer la productivité.