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1. Post-stroke pathway analysis and link with one year sequelae in a French cohort of stroke patients: the PAPASePA protocol study

Author: Broussy, Sophie, Rouanet, François, Lesaine, Emilie, Domecq, Sandrine, Kret, Marion, Maugeais, Mélanie, Aly, Florence, Dehail, Patrick, Bénard, Antoine, Wittwer, Jérome, Salamon, Roger, Sibon, Igor, Saillour-Glenisson, Florence, Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pôle des Neurosciences Cliniques [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Service d'Information médicale [Bordeaux], Pôle de Santé publique [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-CHU Bordeaux [Bordeaux], Physical and Rehabilitation Medicine Unit [Bordeaux], Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux], Stroke Unit [Bordeaux], Neurology [Bordeaux], Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d'Aquitaine [Bordeaux] (INCIA), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d'Aquitaine [Bordeaux] (INCIA), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This study has been externally funded by the Programme de Recherche sur la Performance du système des Soins (PREPS) 2016 (n°PREPS-16-0124) that is a grant from the French Ministry of Solidarity and Health (e.g. governmental funding)., and Bodescot, Myriam
Subjects: Adult, Male, lcsh:Public aspects of medicine, lcsh:RA1-1270, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Stroke, Study Protocol, Sequelae, Treatment Outcome, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Humans, Health services research, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, France, Prospective Studies, cardiovascular diseases, Pathways, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; BACKGROUND:Stroke is a health problem with serious consequences, both in terms of mortality, and after-effects affecting patient quality of life. Stroke requires both urgent and chronic management involving the entire health care system. Although large variability in the management of stroke patients have been noticed, knowledge of the diversity and the scalability of post-stroke pathways, whether it is the care pathway or the life pathway, is currently not sufficient. Moreover the link between post-stroke pathways and patients sequelae have not been yet clearly defined. All this information would be useful to better target the needs to improve stroke patient management. The purposes are to identify the post-stroke life pathways components associated with sequelae (activity limitations - main purpose, cognitive disorders, anxio-depressive disorders, fatigue, participation restrictions) at 3 months and 1 year post-stroke, to define a typology of life pathways of patients during the post-stroke year and to analyze the social and geographical inequalities in the management of stroke.METHODS:Design: a prospective multicenter comparative cohort study with a follow up to 1 year after the acute episode. Participant centers: 13 hospitals in the Aquitaine region (France).STUDY POPULATION:patients diagnosed with a confirmed ischemic or hemorrhagic stroke included in the Aquitaine Observatory of Stroke (ObA2) cohort and voluntary to participate. Data sources are existing databases (ObA2 database and the French National Health Data System - SNDS) to collect information about care pathways, patient characteristics and stroke characteristics and Ad hoc surveys to collect information about life pathways and post-stroke sequelae. The endpoints of the study are post-stroke activity limitations evaluated by the modified Rankin score, other post-stroke sequelae (Cognitive disorders, anxio-depressive disorders, fatigue, restriction of participation) assessed by standardized and validated scales and Clusters of patients responding to pathways with common or similar characteristics.; DISCUSSION: By integrating a longitudinal dimension and relying on a large cohort, the project will make it possible to identify the sources of disturbances and the factors favorable to the outcome of the life pathways, important for the planning of the offer and the management of the public policies concerning stroke pathways.TRIAL REGISTRATION:ClinicalTrials.gov ID: NCT03865173 , March 6th, 2019.
Published: 2019
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2. Efficacité et tolérance du fébuxostat chez 73 patients goutteux avec une insuffisance rénale chronique stade 4/5 : étude rétrospective de 10 centres

Author: Frédéric Lioté, Pierre-Antoine Juge, Evangeline Pillebout, Cécile Vigneau, Gérard Chalès, Marie-Elise Truchetet, Alain Saraux, Thierry Schaeverbeke, Philippe Dieudé, Renaud Snanoudj, Thomas Bardin, Sébastien Ottaviani, Emilie Cornec-Le Gall, Tristan Pascart, Hang-Korng Ea, Pascal Richette, René-Marc Flipo, Divi Cornec, Florian Bailly, Clotilde Loustau, Centre Viggo-Petersen, service de rhumatologie, Hôpital Lariboisière-APHP, Service de rhumatologie, CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de Néphrologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de rhumatologie [Bichat], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies (LBAI), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-LabEX IGO Immunothérapie Grand Ouest, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), CHRU Brest - Service de Rhumatologie (CHU - BREST - Rhumato), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Service de rhumatologie[Lille], Hôpital Roger Salengro [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de néphrologie adultes [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHRU - Service de néphrologie, dialyse et transplantation rénale, Département de Rhumatologie, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux], Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Service de Rhumatologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Biologie de l'Os et du Cartilage : Régulations et Ciblages Thérapeutiques (BIOSCAR (UMR_S_1132 / U1132)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Service de rhumatologie [Rennes] = Rheumatology [Rennes], Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Lymphocyte B et Auto-immunité (LBAI), Université de Brest (UBO)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de rhumatologie [CHU Pitié Salpêtrière] (GRC-08 EEMOIS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lymphocyte B et Auto-immunité ( LBAI ), Université de Brest ( UBO ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHRU Brest - Service de Rhumatologie ( CHU - BREST - Rhumato ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Hôpital Roger Salengro-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Service de Rhumatologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Département de Rhumatologie ( BORDEAUX - Rhumato ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux], Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Biologie de l'Os et du Cartilage : Régulations et Ciblages Thérapeutiques ( BIOSCAR ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Lariboisière-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpital Sud, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-LabEX IGO Immunothérapie Grand Ouest-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Service de Rhumatologie [CHU Pitié Salpêtrière], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: 030203 arthritis & rheumatology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Rheumatology, 030232 urology & nephrology, [ SDV.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 3. Good health
Abstract: Resume Objectif Les doses maximales de l’allopurinol sont limitees en cas d’insuffisance renale chronique, particulierement aux stades 4/5. Le febuxostat possede un metabolisme hepatique et son utilisation a ete autorisee sans modification posologique chez les patients insuffisants renaux stades 1 a 3. Notre objectif etait d’etudier la tolerance et l’efficacite du febuxostat chez les patients insuffisants renaux chroniques stades 4/5. Methodes Dans cette etude retrospective, nous avons inclus les patients presentant (1) un diagnostic de goutte, (2) un traitement par febuxostat, (3) un debit de filtration glomerulaire ≤ 30 mL/min/1,73m 2 (formule MDRD) lors de l’initiation du febuxostat et (4) un suivi d’au moins 3 mois apres le debut du traitement par febuxostat. L’efficacite, la tolerance et la variation de la fonction renale ont ete analysees. Resultats Nous avons inclus 73 patients goutteux (âge moyen 70,2 ± 11,8 ans, 61 hommes, 31 patients avec nephrangiosclerose et 18 patients transplantes renaux) provenant de 10 centres universitaires. L’uricemie a l’initiation etait de 9,86 ± 2,85 mg/dL, la duree devolution moyenne de la goutte etait de 6,2 ± 7,0 ans. Les comorbidites etaient constituees d’insuffisance cardiaque (17,8 %), d’hypertension arterielle (98,6 %), de diabete (30,1 %), de dyslipidemie (64,8 %) et d’antecedents d’evenements thromboemboliques (38,4 %). Lors de la derniere visite (suivi moyen de 68,5 ± 64,8 semaines), la dose de febuxostat etait de 40 mg/j pour 7 patients (10,5 %), 80 mg/j pour 50 (74,6 %) et 120 mg/j pour 10 patients (14,9 %). L’uricemie etait Conclusion Le febuxostat semble etre efficace chez les patients goutteux insuffisants renaux chroniques stades 4/5. Cependant, la tolerance concernant la fonction renale n’est pas certaine. De plus grandes etudes sont necessaires pour la determiner.
Published: 2018
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3. Cost of exome analysis in patients with intellectual disability: a micro-costing study in a French setting

Author: Soilly, Al, Robert-Viard, C, Besse, C, Bruel, Al, Gerard, B, Boland, A, Piton, A, Duffourd, Y, Muller, J, Poë, C, Jouan, T, El Doueiri, S, Faivre, L, Bacq-Daian, D, Isidor, B, Genevieve, D, Odent, S, Philip, N, Doco-Fenzy, M, Lacombe, D, Asensio, Ml, Deleuze, Jf, Binquet, C, Thauvin-Robinet, C, Lejeune, C, Arpin, S, Blanchet, P, Blesson, S, Boute-Benejean, O, Busa, T, Colin, E, Coubes, C, Devillard, F, Edery, P, El Chehadeh, S, Fradin, M, Goldenberg, A, Guerrot, A-M, Herenger, Y, Houcinat, N, Jean-Marcais, N, Jouk, P., Lambert, L, Lavillaureix, A, Legendre, M, Leheup, B, Manouvrier, S, Mercier, S, Moutton, S, Nizon, M, Pasquier, L, Petit, F, Pinson, L, Poirsier, C, Pons, L, Putoux, A, Quelin, C, Renaud, M, Rossi, M, Sorlin, A, Spodenkiewicz, M, Thevenon, J, Toutain, A, Van-Gils, J, Vanlerberghe, C, Verloes, A, Vincent, M, Vincent-Delorme, C, Willems, M, Ziegler, A, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de Génotypage (CNG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Laboratoire de Diagnostic Génétique [CHU Strasbourg], Université de Strasbourg (UNISTRA)-CHU Strasbourg, Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de génétique médicale [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU Pontchaillou [Rennes], Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), FHU TRANSLAD (CHU de Dijon), and This study was funded by the French Ministry of Health as part of the 2015 Medico-Economic Research Program.
Subjects: Exome sequencing, MESH: France, MESH: Exome, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, MESH: Humans, Cost analysis, Intellectual disability, Micro-costing, MESH: Intellectual Disability
Abstract: Background: With the development of next generation sequencing technologies in France, exome sequencing (ES) has recently emerged as an opportunity to improve the diagnosis rate of patients presenting an intellectual disability (ID). To help French policy makers determine an adequate tariff for ES, we aimed to assess the unit cost per ES diagnostic test for ID from the preparation of the pre-analytical step until the report writing step and to identify its main cost drivers.Methods: A micro-costing bottom-up approach was conducted for the year 2018 in a French setting as part of the DISSEQ study, a cost-effectiveness study funded by the Ministry of Health and performed in collaboration with the GAD (Génétique des Anomalies du Développement), a genetic team from the Dijon University Hospital, and a public sequencing platform, the Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH). The analysis was conducted from the point of view of these two ES stakeholders. All of the resources (labor, equipment, disposables and reagents, reusable material) required to analyze blood samples were identified, collected and valued. Several sensitivity analyses were performed.Results: The unit nominal cost per ES diagnostic test for ID was estimated to be €2,019.39. Labor represented 50.7% of the total cost. The analytical step (from the preparation of libraries to the analysis of sequences) represented 88% of the total cost. Sensitivity analyses suggested that a simultaneous price decrease of 20% for the capture kit and 50% for the sequencing support kit led to an estimation of €1,769 per ES diagnostic test for ID.Conclusion: This is the first estimation of ES cost to be done in the French setting of ID diagnosis. The estimation is especially influenced by the price of equipment kits, but more generally by the organization of the centers involved in the different steps of the analysis and the time period in which the study was conducted. This information can now be used to define an adequate tariff and assess the efficiency of ES.Trial registration: ClinicalTrials.gov identifier NCT03287206 on September 19, 2017.
Published: 2023
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4. Toward the Standardization of Mycological Examination of Sputum Samples in Cystic Fibrosis : Results from a French Multicenter Prospective Study

Author: Lafarge, Céline, Pontoire, Bruno, Cayot, Nathalie, Le Bail, Patricia, Coron, Noémie, Pihet, Marc, Fréalle, Emilie, Lemeille, Yolande, Pinel, Claudine, Pelloux, Hervé, Gargala, Gilles, Favennec, Loïc, Accoceberry, Isabelle, Durand-Joly, Isabelle, Dalle, Frédéric, Huet, Frédéric, Fanton, Annlyse, Boldron, Amale, Loeuille, Guy-André, Domblides, Philippe, Coltey, Bérengère, Pin, Isabelle, Llerena, Catherine, Troussier, Françoise, Person, Christine, Marguet, Christophe, Wizla, Nathalie, Thumerelle, Caroline, Turck, Dominique, Bui, Stéphanie, Fayon, Michael, Duhamel, Alain, Prévotat, Anne, Leroy, Sylvie, Wallaert, Benoit, Bouchara, Jean-Philippe, Delhaes, Laurence, Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (PAM), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Agroécologie [Dijon], Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, ATOMycA (CRCINA-ÉQUIPE 6), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA), Groupe d'Étude des Interactions Hôte-Pathogène (GEIHP), Université d'Angers (UA), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie (Parasito - Myco - LILLE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie (UGA UFRP), Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Pôle Biologie, Institut de Biologie et Pathologie, Centre Hospitalier Universitaire de Grenoble, Laboratoire de parasitologie-mycologie, CHU Grenoble, CHU Rouen, Normandie Université (NU), Appareil Digestif Environnement Nutrition (ADEN ), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité (MCMP), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interactions Muqueuses Agents Transmissibles (LIMA), Université de Bourgogne (UB), Service de pédiatrie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre de Ressources et de Compétences de la Mucoviscidose [CHU Dijon] (CRCM ), CHU Bordeaux, Ctr Rech Mucoviscidose CRCM Adulte, CHU Bordeaux [Bordeaux], CRCM Adulte [Grenoble], Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pédiatrie générale et maladies infectieuses, Service de Pneumologie Pédiatrique [Angers], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-Centre Robert Debré, PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Service de pédiatrie médicale et médecine de l'adolescent [Rouen], Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Clinique de Pédiatrie, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Pediatrics, CHU Bordeaux, Dept Pediat CRCM, INSERM Ctr Invest Clin CIC5, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Cardio-thoracique de Bordeaux, U1045, Institut d'Informatique et de Mathématiques Appliquées de Grenoble (IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut National Polytechnique de Grenoble (INPG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Pneumologie, Hôpital A. Calmette, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU de Nice), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle], Pole Cardio-vasculaire et pulmonaire [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de Parasitologie et de Mycologie [Lille], Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), French Ministry of Health and Research (PHRC N°2006/1902), the association 'Vaincre la Mucoviscidose' (Defeat Cystic Fibrosis) (MucoFong and Mucofong-ATF N8 2006/351), the Pharmaceutical Division of Pfizer France (Nu 2006/158), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur (FLAVIC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon (ENESAD), ATIP AVENIR / ATOMycA (CRCINA - Département INCIT - Equipe 6), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite (GEIHP), Université Grenoble Alpes (UGA), Service de Pédiatrie, Centre de Ressources et de Compétences de la Mucoviscidose [Dijon], Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie, Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Nantes (UN)-Université d'Angers (UA), Service de Parasitologie-Mycologie [CHRU LIlle], Institut de Microbiologie [CHRU Lille], Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), université de Bourgogne, PAM, Hôpital Charles Nicolle [Rouen], Université de Bordeaux (UB), CH Dunkerque, Centre de Recherche en Chimie Moléculaire (CRCM), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Groupe de Recherche sur les Antimicrobiens et les Micro-Organismes (GRAM 1.0), CHU Lille, CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Etudes et de Recherche en Informatique Médicale [Lille] (CERIM), Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] ( PAM ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages ( BIA ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), FLAveur, VIsion et Comportement du consommateur ( FLAVIC ), Etablissement National d'Enseignement Supérieur Agronomique de Dijon ( ENESAD ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Université de Bourgogne ( UB ), ATIP AVENIR / ATOMycA ( CRCINA - Département INCIT - Equipe 6 ), Centre de recherche de Cancérologie et d'Immunologie / Nantes - Angers ( CRCINA ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ) -Université d'Angers ( UA ) -Université de Nantes ( UN ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut de Recherche en Santé de l'Université de Nantes ( IRS-UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Groupe d'Etude des Interactions Hôte-Parasite ( GEIHP ), Université d'Angers ( UA ), Laboratoire de Parasitologie et Mycologie ( Parasito - Myco - LILLE ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Université Grenoble Alpes - UFR Pharmacie ( UGA UFRP ), Université Grenoble Alpes ( UGA ), Appareil Digestif Environnement Nutrition ( ADEN ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Microbiologie cellulaire et moléculaire et pathogénicité ( MCMP ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire Interactions Muqueuses Agents Transmissibles ( LIMA ), Université de Bourgogne ( UB ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers-Centre Robert Debré, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers ( CHU Angers ), PRES Université Nantes Angers Le Mans ( UNAM ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, Institut d'Informatique et de Mathématiques Appliquées de Grenoble ( IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut National Polytechnique de Grenoble ( INPG ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Nice ( CHU de Nice ), Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] ( CRCTB ), and Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Adult, Male, Microbiological Techniques, 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, Filamentous fungi, Adolescent, Veterinary (miscellaneous), Lung mycobiota, 030106 microbiology, Biology, Applied Microbiology and Biotechnology, Microbiology, Cystic fibrosis, Aspergillus fumigatus, Molds, Young Adult, 03 medical and health sciences, Medical microbiology, Exophiala, Mycological examination, medicine, Humans, Prospective Studies, Child, Candida albicans, [ SDV.MP.MYC ] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Aged, Aged, 80 and over, Aspergillus, Lung Diseases, Fungal, Fungi, Sputum, Scedosporium apiospermum, Middle Aged, biology.organism_classification, [SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Corpus albicans, 030104 developmental biology, Female, France, medicine.symptom, Agronomy and Crop Science
Abstract: IF 1.710; International audience; Fungal respiratory colonization of cystic fibrosis (CF) patients emerges as a new concern; however, the heterogeneity of mycological protocols limits investigations. We first aimed at setting up an efficient standardized protocol for mycological analysis of CF sputa that was assessed during a prospective, multicenter study: “MucoFong” program (PHRC-06/1902). Sputa from 243 CF patients from seven centers in France were collected over a 15-month period and submitted to a standardized protocol based on 6 semi-selective media. After mucolytic pretreatment, sputa were plated in parallel on cycloheximide-enriched (ACT37), erythritol-enriched (ERY37), benomyl dichloran–rose bengal (BENO37) and chromogenic (CAN37) media incubated at 37 °C and on Sabouraud–chloramphenicol (SAB27) and erythritol-enriched (ERY27) media incubated at 20–27 °C. Each plate was checked twice a week during 3 weeks. Fungi were conventionally identified; time for detection of fungal growth was noted for each species. Fungal prevalences and media performances were assessed; an optimal combination of media was determined using the Chi-squared automatic interaction detector method. At least one fungal species was isolated from 81% of sputa. Candida albicans was the most prevalent species (58.8%), followed by Aspergillus fumigatus (35.4%). Cultivation on CAN37, SAB27, ACT37 and ERY27 during 16 days provided an optimal combination, detecting C. albicans, A. fumigatus, Scedosporium apiospermum complex and Exophiala spp. with sensitivities of 96.5, 98.8, 100 and 100%. Combination of these four culture media is recommended to ensure the growth of key fungal pathogens in CF respiratory specimens. The use of such consensual protocol is of major interest for merging results from future epidemiological studies.
Published: 2018
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5. Risk factors of serious infections in patients with rheumatoid arthritis treated with tocilizumab in the French registry REGATE

Author: Emmanuelle Dernis, Alain Saraux, Jacques Morel, Jean Sibilia, Thierry Schaeverbeke, Maxime Dougados, Martin Soubrier, René Marc Flipo, Bernard Combe, Gabriel Baron, S. Rist, Arnaud Constantin, Xavier Mariette, Jacques-Eric Gottenberg, Olivier Vittecoq, Philippe Ravaud, Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps (LEASP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'épidémiologie, biostatistique et recherche clinique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier du Mans, Service de Rhumatologie, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Département de Rhumatologie[Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie, Immuno-Rhumatologie Moléculaire, Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Rhumatologie, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux], CHU Gabriel Montpied [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Service de rhumatologie [CHU Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Lymphocytes B, Autoimmunité et Immunothérapies (LBAI), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-LabEX IGO Immunothérapie Grand Ouest-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Université de Brest (UBO), CHRU Brest - Service de Rhumatologie (CHU - BREST - Rhumato), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Régulation de la réponse immune, infection VIH-1 et autoimmunité, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Faculté de Médecine (UPD5 Médecine), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'épidémiologie Clinique [Hôtel-Dieu], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Hôtel Dieu, French Cochrane Centre, Service Physiologie, Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS)-Nouvel Hôpital Civil, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Strasbourg (UNISTRA), Lymphocyte B et Auto-immunité (LBAI), Université de Brest (UBO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Brestois Santé Agro Matière (IBSAM), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier ( IGMM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ), Épidémiologie et analyses en santé publique : risques, maladies chroniques et handicaps, Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Centre Hospitalier Régional d'Orléans ( CHR ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Hôpital Lapeyronie, Université de Strasbourg ( UNISTRA ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Département de Rhumatologie ( BORDEAUX - Rhumato ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux], CHU Gabriel Montpied ( CHU ), Service de rhumatologie [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Lymphocyte B et Auto-immunité ( LBAI ), Université de Brest ( UBO ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHRU Brest - Service de Rhumatologie ( CHU - BREST - Rhumato ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université Paris Descartes - Faculté de Médecine ( UPD5 Médecine ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité ( CRESS (U1153 / UMR_A 1125) ), Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital Hôtel Dieu, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHR), Département de Rhumatologie (BORDEAUX - Rhumato), CHU Gabriel Montpied (CHU), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Hôtel Dieu
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Neutrophils, Opportunistic Infections, Antibodies, Monoclonal, Humanized, Lower risk, Peptides, Cyclic, Arthritis, Rheumatoid, Leukocyte Count, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Tocilizumab, Rheumatology, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, [ SDV.IMM ] Life Sciences [q-bio]/Immunology, Pharmacology (medical), Registries, 030212 general & internal medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, Autoantibodies, Proportional Hazards Models, 030203 arthritis & rheumatology, Univariate analysis, Proportional hazards model, business.industry, Incidence, Hazard ratio, Isoxazoles, Middle Aged, medicine.disease, 3. Good health, chemistry, Antirheumatic Agents, Concomitant, Rheumatoid arthritis, Absolute neutrophil count, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, Drug Therapy, Combination, Female, France, business, Leflunomide
Abstract: Objectives Observational studies have already reported the risk of serious infections in RA treated with tocilizumab, but in limited samples. The aim of this study was to investigate the predictive risk factors for serious infections in the largest European registry of patients treated with tocilizumab for RA. Methods A total of 1491 RA patients included in the French REGistry-RoAcTEmra were analysed to calculate the incidence rate of first serious infections rate after initiation of tocilizumab. To identify independent factors associated with serious infections, a Cox model was performed. Results Among the 1491 patients, average age 56.6 (13.6) years, 125 serious infections occurred in 122 patients (incidence rate of serious infection: 4.7/100 patient-years). Univariate analysis identified initial ACPA positivity as the only factor associated with a lower risk of serious infection [hazard ratio (HR) = 0.56, 95% CI: 0.36, 0.88]. Other factors significantly associated with a higher risk of serious infections were DAS28, concomitant Leflunomide (LEF) treatment, and absolute neutrophil count (ANC) at baseline. Initial ANC above 5.0 × 109/l (HR = 1.94, 95% CI: 1.32, 2.85; P < 0.001), negative ACPA (HR = 1.79, 95% CI: 1.15, 2.78; P = 0.012) at baseline and concomitant LEF treatment (LEF alone vs no treatment, HR = 2.18, 95% CI: 1.22, 3.88; P = 0.009) remained significantly associated with first serious infections in multivariate analysis after imputation for missing data. Conclusion The rate of first serious infections in current practice is similar to that reported in clinical trials. High ANC (above 5.0 × 109 at baseline), negative ACPA and concomitant therapy with LEF are predictive factors of serious infection, requiring in this case a tighter surveillance.
Published: 2017
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6. 9q33.3q34.11 microdeletion: new contiguous gene syndrome encompassing STXBP1, LMX1B and ENG genes assessed using reverse phenotyping

Author: Laurence Faivre, Marie-Ange Delrue, Nathalie Marle, Fanny Morice-Picard, Pierre-Simon Jouk, Delphine Héron, Alice Goldenberg, Stéphanie Perez-Martin, Julien Thevenon, Frédéric Huet, Véronique Dulieu, Alice Masurel, Patricia Calenda, Patrick Callier, Salima El Chehadeh, Sylvie Manouvrier-Hanu, Sophie Dupuis-Girod, Pascale Saugier-Veber, Gipsy Billy-Lopez, Joris Andrieux, Paul Kuentz, Ghislaine Plessis, Christel Thauvin-Robinet, Géraldine Joly-Helas, Sophie Nambot, Mathilde Lefebvre, Charles Coutton, Anne-Laure Mosca-Boidron, Caroline Rooryck, Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Service de Cardiologie, Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), Université de Bourgogne ( UB ) -IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Pôle Rééducation - Réadaptation (Médecine Physique et Réadaptation) (CHU de Dijon), Service de pédiatrie (CHU de Dijon), EDF ( EDF ), Laboratoire de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications [Grenoble] ( TIMC-IMAG ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology ( Grenoble INP ) -IMAG-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Grenoble Alpes ( UGA ), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] ( CHU ), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble ( INSERM U823 ), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme ( MRGM ), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Hôpital Pellegrin-Service de Génétique Médicale du CHU de Bordeaux, Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme ( GRC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Centre de Référence des Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], CHU Bordeaux [Bordeaux], Service de génétique [Rouen], CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques ( GMFC ), Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Groupe Hospitalier Est, Regional council of Burgundy, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de Cardiologie (hôpital général, CHU Dijon), Hôpital général (CHU Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, EDF (EDF), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Dynamiques Cellulaire et Tissulaire - Interdisciplinarité, Modélisation & Microscopie (TIMC-IMAG-DyCTiM2), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme (MRGM), Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme (GRC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques (GMFC), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Groupe Hospitalier Est, IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne (UB), Dynamique Cellulaire et Tissulaire- Interdisciplinarité, Modèles & Microscopies (TIMC-IMAG-DyCTiM), and Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, [ SDV.MHEP.PED ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Haploinsufficiency, cerebral hypomyelination, west-syndrome, Bioinformatics, Craniofacial Abnormalities, 0302 clinical medicine, Intellectual disability, STXBP1, Child, Genetics (clinical), Nail patella syndrome, Genetics, Endoglin, Syndrome, 3. Good health, developmental delay, Phenotype, intellectual disability, Medical genetics, Female, Chromosome Deletion, Chromosomes, Human, Pair 9, medicine.medical_specialty, Adolescent, LIM-Homeodomain Proteins, Biology, Contiguous gene syndrome, Article, 03 medical and health sciences, Munc18 Proteins, Genetic linkage, medicine, Humans, de-novo mutations, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, disease, Epilepsy, infantile epileptic encephalopathy, association, deletions, medicine.disease, Human genetics, 030104 developmental biology, nail-patella syndrome, 030217 neurology & neurosurgery, Transcription Factors
Abstract: International audience; The increasing use of array-CGH in malformation syndromes with intellectual disability could lead to the description of new contiguous gene syndrome by the analysis of the gene content of the microdeletion and reverse phenotyping. Thanks to a national and international call for collaboration by Achropuce and Decipher, we recruited four patients carrying de novo overlapping deletions of chromosome 9q33.3q34.11, including the STXBP1, the LMX1B and the ENG genes. We restrained the selection to these three genes because the effects of their haploinsufficency are well described in the literature and easily recognizable clinically. All deletions were detected by array-CGH and confirmed by FISH. The patients display common clinical features, including intellectual disability with epilepsy, owing to the presence of STXBP1 within the deletion, nail dysplasia and bone malformations, in particular patellar abnormalities attributed to LMX1B deletion, epistaxis and cutaneousmucous telangiectasias explained by ENG haploinsufficiency and common facial dysmorphism. This systematic analysis of the genes comprised in the deletion allowed us to identify genes whose haploinsufficiency is expected to lead to disease manifestations and complications that require personalized follow-up, in particular for renal, eye, ear, vascular and neurological manifestations.
Published: 2016
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7. Genetic counselling difficulties and ethical implications of incidental findings from array-CGH: A 7-year national survey

Author: M, Lefebvre, D, Sanlaville, N, Marle, C, Thauvin-Robinet, E, Gautier, S E, Chehadeh, A-L, Mosca-Boidron, J, Thevenon, P, Edery, M-P, Alex-Cordier, M, Till, S, Lyonnet, V, Cormier-Daire, J, Amiel, A, Philippe, S, Romana, V, Malan, A, Afenjar, S, Marlin, S, Chantot-Bastaraud, P, Bitoun, B, Heron, E, Piparas, F, Morice-Picard, S, Moutton, N, Chassaing, A, Vigouroux-Castera, J, Lespinasse, S, Manouvrier-Hanu, O, Boute-Benejean, C, Vincent-Delorme, F, Petit, N L, Meur, M, Marti-Dramard, A-M, Guerrot, A, Goldenberg, S, Redon, C, Ferrec, S, Odent, C L, Caignec, S, Mercier, B, Gilbert-Dussardier, A, Toutain, S, Arpin, S, Blesson, I, Mortemousque, E, Schaefer, D, Martin, N, Philip, S, Sigaudy, T, Busa, C, Missirian, F, Giuliano, H K, Benailly, P K V, Kien, B, Leheup, C, Benneteau, L, Lambert, R, Caumes, P, Kuentz, I, François, D, Heron, B, Keren, E, Cretin, P, Callier, S, Julia, L, Faivre, Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Université de Bourgogne (UB), Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de cytogénétique constitutionnelle, Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU de Lyon-Centre Neuroscience et Recherche, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de génétique médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM EMI0210 (EMI0210), Laboratoire Histologie Embryologie Cytogénétique [CHU Necker], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), CHU Trousseau [APHP], Service de Pédiatrie [Jean Verdier], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Maladies Rares - Génétique et Métabolisme (MRGM), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Hôpital Pellegrin-Service de Génétique Médicale du CHU de Bordeaux, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Service Génétique Médicale [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Département de Génétique Chromosomique, Bâtiment Hôtel Dieu - Centre Hospitalier de Chambéry, Laboratoire de Génétique Clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de Maladies Rares, Anomalies du Développement Nord de France-CH Arras - CHRU Lille, Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U837 (JPArc), Université Lille Nord de France (COMUE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), CHU Amiens-Picardie, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Génétique Médicale, Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)-Centre de Référence Anomalies du Développement Ouest, Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital l'Archet, Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), CHU Dijon, Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme (GRC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Clinical Investigation Centre, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Franche-Comté (UFC), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC), Pain & Palliative Care Department, Université de Franche-Comté (UFC), Logiques de l'Agir ( UR 2274) (LdA), The authors thanks the Regional Council of Burgundy for their support., Jonchère, Laurent, Unité Fonctionnelle de Génétique Clinique [CHU Pitié Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de Génétique Cytogénétique et Embryologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), Université de Bourgogne ( UB ) -IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Université de Bourgogne ( UB ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -CHU de Lyon-Centre Neuroscience et Recherche, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), INSERM EMI0210 ( EMI0210 ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Unité Fonctionnelle de Génétique Clinique, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Centre de référence 'Déficiences Intellectuelles de Causes Rares' - Paris-Groupe de Recherche Clinique 'Déficience Intellectuelle et Autisme' - Paris, Service de Neuropédiatrie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service de Génétique et d'Embryologie Médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris 13 ( UP13 ) -Hôpital Jean Verdier, Service de neurologie pédiatriques, Service de neuropédiatrie [Trousseau]-Centre de Référence des Maladies Lysosomales, Hôpital Jean Verdier, Maladies Rares - Génétique et Métabolisme ( MRGM ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Service de génétique médicale [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Centre de recherche Jean-Pierre Aubert-Neurosciences et Cancer, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lille, Droit et Santé, CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Centre hospitalier universitaire d'Amiens ( CHU Amiens-Picardie ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), CHU de Poitiers-Centre de Référence Anomalies du Développement Ouest, Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, CHU Le MAns, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nîmes ( CHRU Nîmes ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Besançon] ( CHRU Besançon ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre de Référence des Déficiences Intellectuelles de Causes Rares, Groupe de Recherche Clinique : Déficience Intellectuelle et Autisme ( GRC ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Service de neuropédiatrie [Trousseau], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), Université de Franche-Comté ( UFC ), Logiques de l'Agir - UFC ( LdA ), Université Bourgogne Franche-Comté ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), CHU Toulouse [Toulouse], Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ) -Centre de Référence Anomalies du Développement Ouest, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Logiques de l'Agir ( EA 2274) ( LdA ), Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] ( UBFC ) -Université de Franche-Comté ( UFC ), IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC-Université de Bourgogne (UB), Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Recherche Jean-Pierre AUBERT Neurosciences et Cancer - U1172 Inserm - U837 (JPArc), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Lille Nord de France (COMUE)-Université de Lille, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Logiques de l'Agir ( EA 2274) (LdA), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: Male, Comparative Genomic Hybridization, Physician-Patient Relations, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], Genetic Diseases, Inborn, Genes, Recessive, Genetic Counseling, Genetic Diseases, X-Linked, Disclosure, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Microarray Analysis, [SDV] Life Sciences [q-bio], incidental findings, aCGH, Surveys and Questionnaires, Humans, Female, ethical issues, pre-test information, France, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Genes, Dominant, Retrospective Studies
Abstract: International audience; Microarray-based comparative genomic hybridization (aCGH) is commonly used in diagnosing patients with intellectual disability (ID) with or without congenital malformation. Because aCGH interrogates with the whole genome, there is a risk of being confronted with incidental findings (IF). In order to anticipate the ethical issues of IF with the generalization of new genome-wide analysis technologies, we questioned French clinicians and cytogeneticists about the situations they have faced regarding IF from aCGH. Sixty-five IF were reported. Forty corresponded to autosomal dominant diseases with incomplete penetrance, 7 to autosomal dominant diseases with complete penetrance, 14 to X-linked diseases, and 4 were heterozygotes for autosomal recessive diseases with a high prevalence of heterozygotes in the population. Therapeutic/preventive measures or genetic counselling could be argued for all cases except four. These four IF were intentionally not returned to the patients. Clinicians reported difficulties in returning the results in 29% of the cases, mainly when the question of IF had not been anticipated. Indeed, at the time of the investigation, only 48% of the clinicians used consents mentioning the risk of IF. With the emergence of new technologies, there is a need to report such national experiences; they show the importance of pre-test information on IF.
Published: 2016
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8. The expanding spectrum of COL2A1 gene variants IN 136 patients with a skeletal dysplasia phenotype

Author: Albert David, Chloé Quélin, Clarisse Baumann-Morel, Eric Bieth, Bruno Dumont, Judith Melki, Elise Shaeffer, Yves Alembik, Fabienne Giuliano, Christel Thauvin, Nicolas Chassaing, Sophie Julia, Anne-Lise Delezoide, Marine Lebrun, Tiffany Busa, Geneviève Baujat, David Geneviève, Séverine Audebert, Yline Capri, Patricia Blanchet, Martine Le Merrer, Sandrine Marlin, Mouna Barat-Houari, Marianne Till, Nicole Philip, Laurence Faivre, Patrick Calvas, Karine Nguyen, Alice Masurel, Vidrica Ciorca, François Cartault, Jacqueline Vigneron, Alice Goldenberg, Jelena Martinovic, Monique Mozelle-Nivoix, Renaud Touraine, Ghislaine Plessis, Marie-Line Jacquemont, Jean-Luc Alessandri, Delphine Dupin-Deguine, Valérie Cormier-Daire, Aurélie Fabre, Jeanne Amiel, Marie Brechard, Bertrand Isidor, Salima El Chehadeh, Sylvie Odent, Isabelle Touitou, Josseline Kaplan, Dominique Martin-Coignard, Lucile Pinson, Sabine Sigaudy, Christine Coubes, Didier Lacombe, Frédéric Tm Them, Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion (CHU La Réunion), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de Génétique [CHU La Réunion], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de Biologie du Développement, Service de génétique médicale, Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital l'Archet, Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de génétique médicale [Toulouse], Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Service de foetopathologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de Génétique, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Service de Génétique [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Service de cytogénétique constitutionnelle, Hospices Civils de Lyon (HCL)-CHU de Lyon-Centre Neuroscience et Recherche, Service de Génétique Clinique Chromosomique et Moléculaire, CHU Saint-Etienne-Hôpital Nord - Saint-Etienne, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques ( UM2 ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Service de cytogénétique, CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service de Réanimation Néonatale et Pédiatrique, CHD Félix Guyon, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Service de Genetique, Service de Génétique Clinique, Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Centre Hospitalier Universitaire de La Réunion ( CHU La Réunion ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CH Le Mans, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Université Paris-Sud - Paris 11 ( UP11 ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bicêtre, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), CHU Caen-Hôpital Clémenceau, Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -CHU de Lyon-Centre Neuroscience et Recherche, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Université de Montpellier ( UM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Service Génétique Médicale [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, and Centre Hospitalier Universitaire de Saint-Etienne [CHU Saint-Etienne] (CHU ST-E)
Subjects: 0301 basic medicine, Proband, Male, Candidate gene, Hearing Loss, Sensorineural, [SDV]Life Sciences [q-bio], Biology, Osteochondrodysplasias, Article, 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Kniest dysplasia, Protein Domains, Genetics, medicine, Humans, Connective Tissue Diseases, Collagen Type II, Genetics (clinical), Sanger sequencing, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Arthritis, Collagen Diseases, Retinal Detachment, medicine.disease, Phenotype, Human genetics, 3. Good health, Pedigree, 030104 developmental biology, Amino Acid Substitution, Dysplasia, Spondyloepiphyseal dysplasia congenita, symbols, Female
Abstract: International audience; Heterozygous COL2A1 variants cause a wide spectrum of skeletal dysplasia termed type II collagenopathies. We assessed the impact of this gene in our French series. A decision tree was applied to select 136 probands (71 Stickler cases, 21 Spondyloepiphyseal dysplasia congenita cases, 11 Kniest dysplasia cases, and 34 other dysplasia cases) before molecular diagnosis by Sanger sequencing. We identified 66 different variants among the 71 positive patients. Among those patients, 18 belonged to multiplex families and 53 were sporadic. Most variants (38/44, 86%) were located in the triple helical domain of the collagen chain and glycine substitutions were mainly observed in severe phenotypes, whereas arginine to cysteine changes were more often encountered in moderate phenotypes. This series of skeletal dysplasia is one of the largest reported so far, adding 44 novel variants (15%) to published data. We have confirmed that about half of our Stickler patients (46%) carried a COL2A1 variant, and that the molecular spectrum was different across the phenotypes. To further address the question of genotype-phenotype correlation, we plan to screen our patients for other candidate genes using a targeted next-generation sequencing approach.European Journal of Human Genetics advance online publication, 2 December 2015; doi:10.1038/ejhg.2015.250
Published: 2016
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9. Treacher Collins syndrome: a clinical and molecular study based on a large series of patients

Author: Marie, Vincent, David, Geneviève, Agnès, Ostertag, Sandrine, Marlin, Didier, Lacombe, Dominique, Martin-Coignard, Christine, Coubes, Albert, David, Stanislas, Lyonnet, Catheline, Vilain, Anne, Dieux-Coeslier, Sylvie, Manouvrier, Bertrand, Isidor, Marie-Line, Jacquemont, Sophie, Julia, Valérie, Layet, Sophie, Naudion, Sylvie, Odent, Laurent, Pasquier, Sybille, Pelras, Nicole, Philip, Geneviève, Pierquin, Fabienne, Prieur, Nisrine, Aboussair, Tania, Attie-Bitach, Geneviève, Baujat, Patricia, Blanchet, Catherine, Blanchet, Hélène, Dollfus, Bérénice, Doray, Elise, Schaefer, Patrick, Edery, Fabienne, Giuliano, Alice, Goldenberg, Cyril, Goizet, Agnès, Guichet, Christian, Herlin, Laetitia, Lambert, Bruno, Leheup, Jelena, Martinovic, Sandra, Mercier, Cyril, Mignot, Marie-Laure, Moutard, Marie-José, Perez, Lucile, Pinson, Jacques, Puechberty, Marjolaine, Willems, Hanitra, Randrianaivo, Kateline, Szakszon, Kateline, Szaskon, Annick, Toutain, Alain, Verloes, Jacqueline, Vigneron, Elodie, Sanchez, Pierre, Sarda, Jean-Louis, Laplanche, Corinne, Collet, Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clinique de Génétique médicale Guy Fontaine [CHRU LIlle], Hôpital Jeanne de Flandres, Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Service de génétique médicale [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Unité de Cytogénétique et Génétique Médicale, Groupe Hospitalier du Havre-Hôpital Gustave Flaubert, Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Service de Génétique, Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Centre de Génétique Humaine, Université de Liège-CHU Liège, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de Référence pour les Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO) et Service de Génétique Médicale, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service de foetopathologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Groupe de recherche clinique 'déficience intellectuelle et autisme', Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Unité fonctionnelle de neurogénétique moléculaire et cellulaire, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Institut Lavoisier de Versailles (ILV), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU de Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service Génétique Médicale [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Head of the Department of Medical Genetics, Service de Génétique Clinique et Université Lille 2, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ), Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Institut de recherche, santé, environnement et travail ( Irset ), Université d'Angers ( UA ) -Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] ( EHESP ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ) -Université des Antilles ( UA ), Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut Jacques Monod ( IJM ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lorraine ( UL ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Service de Génétique [Pitié-Salpêtrière], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Institut de génétique humaine ( IGH ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Institut Lavoisier de Versailles ( ILV ), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP]-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA)
Subjects: Adult, Male, 0301 basic medicine, Franceschetti syndrome, medicine.medical_specialty, Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], Molecular Sequence Data, Biology, Treacher Collins syndrome, Young Adult, 03 medical and health sciences, medicine, Humans, Base sequence, POLR1D, Amino Acid Sequence, Child, Genetic Association Studies, Ribonucleoprotein, U5 Small Nuclear, Genetics (clinical), Sequence Deletion, phenotype–genotype correlations, Base Sequence, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Nuclear Proteins, Large series, DNA-Directed RNA Polymerases, Mandibulofacial dysostosis, Middle Aged, Peptide Elongation Factors, Phosphoproteins, medicine.disease, Dermatology, 3. Good health, Surgery, TCOF1, 030104 developmental biology, Mutation, Microcephaly, Female, Mandibulofacial Dysostosis
Abstract: International audience; Purpose - Treacher Collins/Franceschetti syndrome (TCS; OMIM 154500) is a disorder of craniofacial development belonging to the heterogeneous group of mandibulofacial dysostoses. TCS is classically characterized by bilateral mandibular and malar hypoplasia, downward-slanting palpebral fissures, and microtia. To date, three genes have been identified in TCS:,TCOF1, POLR1D, and POLR1C. Methods - We report a clinical and extensive molecular study, including TCOF1, POLR1D, POLR1C, and EFTUD2 genes, in a series of 146 patients with TCS. Phenotype-genotype correlations were investigated for 19 clinical features, between TCOF1 and POLR1D, and the type of mutation or its localization in the TCOF1 gene. Results - We identified 92/146 patients (63%) with a molecular anomaly within TCOF1, 9/146 (6%) within POLR1D, and none within POLR1C. Among the atypical negative patients (with intellectual disability and/or microcephaly), we identified four patients carrying a mutation in EFTUD2 and two patients with 5q32 deletion encompassing TCOF1 and CAMK2A in particular. Congenital cardiac defects occurred more frequently among patients with TCOF1 mutation (7/92, 8%) than reported in the literature. Conclusion - Even though TCOF1 and POLR1D were associated with extreme clinical variability, we found no phenotype-genotype correlation. In cases with a typical phenotype of TCS, 6/146 (4%) remained with an unidentified molecular defect.
Published: 2016
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10. Fetal phenotypes in otopalatodigital spectrum disorders

Author: Naudion, S., Moutton, S., Coupry, I., Sole, G., Deforges, J., Guerineau, E., Hubert, Cédric, Deves, S., Pilliod, J., Rooryck, C., Abel, C., Le Breton, F., Collardeau-Frachon, S., Cordier, M. P., Delezoide, A. L., Goldenberg, A., Loget, P., Melki, J., Odent, S., Patrier, S., Verloes, A., Viot, G., Blesson, S., Bessières, B., Lacombe, D., Arveiler, B., Goizet, C., Fergelot, P., CHU Bordeaux [Bordeaux], Neurogénétique moléculaire, Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) - Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Unité fonctionnelle de génétique clinique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Robert Debré - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), AP-HP Hôpital Necker - Enfants Malades [Paris], Laboratoire de Génétique Humaine, Développement et Cancer, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB) - CHU Bordeaux [Bordeaux] - Groupe hospitalier Pellegrin, Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Hôpital Robert Debré-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)
Subjects: Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], Filamins, DNA Mutational Analysis, Infant, Newborn, Melnick-Needles, Otopalatodigital, frontometaphyseal dysplasia, Osteochondrodysplasias, MNS, OPD2, Pedigree, FMD, FLNA, Craniofacial Abnormalities, [SDV] Life Sciences [q-bio], Fetus, Phenotype, Mutation, Humans, filamin A, Female, Hand Deformities, Congenital
Abstract: International audience; Otopalatodigital spectrum disorders (OPDSD) include OPD syndromes types 1 and type 2 (OPD1, OPD2), Melnick–Needles syndrome (MNS), and frontometaphyseal dysplasia (FMD). These conditions are clinically characterized by variable skeletal dysplasia associated in males, with extra‐skeletal features including brain malformations, cleft palate, cardiac anomalies, omphalocele and obstructive uropathy. Mutations in the FLNA gene have been reported in most FMD and OPD2 cases and in all instances of typical OPD1 and MNS. Here, we report a series of 10 fetuses and a neonatally deceased newborn displaying a multiple congenital anomalies syndrome suggestive of OPDSD and in whom we performed FLNA analysis. We found a global mutation rate of 44%. This series allows expanding the clinical and FLNA mutational spectrum in OPDSD. However, we emphasize difficulties to correctly discriminate OPDSD based on clinical criteria in fetuses due to the major overlap between these conditions. Molecular analyses may help pathologists to refine clinical diagnosis according to the type and the location of FLNA mutations. Discriminating the type of OPDSD is of importance in order to improve the genetic counseling to provide to families.
Published: 2016
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11. Targeted resequencing identifies PTCH1 as a major contributor to ocular developmental anomalies and extends the SOX2 regulatory network

Author: Nicolas Chassaing, Josseline Kaplan, Catherine Vincent-Delorme, Adrienne R. Niederriter, Sophie Lamarre, Stanislas Faguer, Nicholas Katsanis, Kelly L. McKnight, Erica E. Davis, Didier Lacombe, Annaïck Desmaison, Jean-Louis Dufier, Massimiliano Rossi, Christine Coubes, Laurent Pasquier, Heather C. Etchevers, Alexandre Causse, Hélène Dollfus, Patrick Calvas, Véronique David, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Unité différenciation épidermique et auto-immunité rhumatoïde (UDEAR), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de biologie moléculaire, Hôpital Pontchaillou, Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant (ITAV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Centre de Maladies Rares, Anomalies du Développement Nord de France-CH Arras - CHRU Lille, CHU Pontchaillou [Rennes], Service de Génétique Clinique, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service d'ophtalmologie [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Centre de Référence pour les Affections Rares en Génétique Ophtalmologique (CARGO) et Service de Génétique Médicale, Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, Imagine - Institut des maladies génétiques (IMAGINE - U1163), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Center for Human Disease Modeling, Duke University [Durham], Département de Néphrologie et Transplantation d'organes, Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre de référence des maladies rénales rares, CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital de Rangueil, Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), PHRC 09 109 01, Clinical Research Hospital Program from the French Ministry of Health, Retina France, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Duke University Medical Center, Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Jeanne de Flandres, Université de Lille, Droit et Santé-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de Néphrologie et Transplantation d'organes [CHU Toulouse], Pôle Urologie - Néphrologie - Dialyse - Transplantations - Brûlés - Chirurgie plastique - Explorations fonctionnelles et physiologiques [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Référence du sud-Ouest des maladies rénales rares [CHU Toulouse] (SODARE), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut des Technologies Avancées en sciences du Vivant ( ITAV ), Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés ( LISBP ), Institut National de la Recherche Agronomique ( INRA ) -Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse ( INSA Toulouse ), Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Institut National des Sciences Appliquées ( INSA ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Inserm U1028, équipe TIGER, Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Service de Génétique, Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Groupe Hospitalier Est-Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Groupe Hospitalier Est, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Imagine - Institut des maladies génétiques ( IMAGINE - U1163 ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ), Duke university [Durham], Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires ( I2MC ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Hôpital de Rangueil, and CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier ( UPS )
Subjects: 0301 basic medicine, Patched, Candidate gene, Heterozygote, endocrine system, Biology, Microphthalmia, Frameshift mutation, 03 medical and health sciences, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Genetics, medicine, Missense mutation, Animals, Humans, Gene Regulatory Networks, Eye Abnormalities, Sonic hedgehog, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics (clinical), Alleles, Zebrafish, Anophthalmia, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], SOXB1 Transcription Factors, Research, Sequence Analysis, DNA, medicine.disease, Patched-1 Receptor, Disease Models, Animal, 030104 developmental biology, Phenotype, PTCH1, Gene Expression Regulation, Genetic Loci, Case-Control Studies, Mutation, embryonic structures, biology.protein
Abstract: Ocular developmental anomalies (ODA) such as anophthalmia/microphthalmia (AM) or anterior segment dysgenesis (ASD) have an estimated combined prevalence of 3.7 in 10,000 births. Mutations in SOX2 are the most frequent contributors to severe ODA, yet account for a minority of the genetic drivers. To identify novel ODA loci, we conducted targeted high-throughput sequencing of 407 candidate genes in an initial cohort of 22 sporadic ODA patients. Patched 1 (PTCH1), an inhibitor of sonic hedgehog (SHH) signaling, harbored an enrichment of rare heterozygous variants in comparison to either controls, or to the other candidate genes (four missense and one frameshift); targeted resequencing of PTCH1 in a second cohort of 48 ODA patients identified two additional rare nonsynonymous changes. Using multiple transient models and a CRISPR/Cas9-generated mutant, we show physiologically relevant phenotypes altering SHH signaling and eye development upon abrogation of ptch1 in zebrafish for which in vivo complementation assays using these models showed that all six patient missense mutations affect SHH signaling. Finally, through transcriptomic and ChIP analyses, we show that SOX2 binds to an intronic domain of the PTCH1 locus to regulate PTCH1 expression, findings that were validated both in vitro and in vivo. Together, these results demonstrate that PTCH1 mutations contribute to as much as 10% of ODA, identify the SHH signaling pathway as a novel effector of SOX2 activity during human ocular development, and indicate that ODA is likely the result of overactive SHH signaling in humans harboring mutations in either PTCH1 or SOX2.
Published: 2016
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12. Mutations of the Imprinted CDKN1C Gene as a Cause of the Overgrowth Beckwith–Wiedemann Syndrome: Clinical Spectrum and Functional Characterization

Author: Isabelle Coupier, Patrick Edery, Valérie Cormier-Daire, Séverine Audebert-Bellanger, Claire Calmel, Marilyne Le Jule, Fabienne Giuliano, Stanislas Lyonnet, Sophie Blesson, Bérénice Doray, Frédéric Brioude, Clarisse Baumann, Odile Boute, Martin Catala, Jean-Luc Alessandri, Sabine Sigaudy, Fanny Laffargue, Sylvie Odent, Alain Verloes, Lydie Burglen, Didier Lacombe, James Lespinasse, Françoise Praz, Michel Polak, Irène Netchine, Sylvie Rossignol, Bruno Leheup, Géraldine Viot, Yves Le Bouc, Bertrand Isidor, Patricia Blanchet, Centre de Recherche Saint-Antoine (UMRS893), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre de recherche en neurosciences de Lyon - Lyon Neuroscience Research Center (CRNL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie du Développement (LBD), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Service de génétique médicale - Unité de génétique clinique [Nantes], Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Médecine Infantile III et Génétique Clinique [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service de Pédiatrie et de Génétique Médicale, Hôpital Morvan [Brest]-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest), Hôpital l'Archet, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Service de génétique médicale [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Unité d'Oncogénétique, CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque, Département de Génétique Chromosomique, Bâtiment Hôtel Dieu - Centre Hospitalier de Chambéry, Hôpital Arnaud de Villeneuve [CHRU Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de Génétique clinique, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Département de Génétique Médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de Génétique, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Physiopathologie et neuroprotection des atteintes du cerveau en développement, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département de génétique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de Génétique [Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg (HUS), BM1208, Institut National de la Santé Et de la Recherche Médicale, Centre de Recherche Saint-Antoine ( CR Saint-Antoine ), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre de recherche en neurosciences de Lyon ( CRNL ), Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] ( UJM ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biologie du Développement ( LBD ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 ( UPMC ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Nantes ( UN ) -Centre hospitalier universitaire de Nantes ( CHU Nantes ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy ( CHRU Nancy ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lorraine ( UL ), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest ( CHRU Brest ) -Hôpital Morvan [Brest], Service de Génétique et d'Embryologie Médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Trousseau [APHP], Service de neuropédiatrie et pathologie du développement, Service de Génétique Médical, CHU Clermont-Ferrand, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Hôpital Arnaud de Villeneuve, Hôpital Arnaud de Villeneuve, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ), Hôpital Jeanne de Flandre [Lille]-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] ( CHRU Lille ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Institut Cochin ( UM3 (UMR 8104 / U1016) ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP], Centre de recherche en neurosciences de Lyon (CRNL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest (CHRU Brest)-Hôpital Morvan [Brest], Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université de Lorraine (UL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Robert Debré-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Cochin [AP-HP]
Subjects: Male, Pathology, medicine.medical_specialty, Beckwith-Wiedemann Syndrome, Genotype, [SDV]Life Sciences [q-bio], Molecular Sequence Data, Beckwith–Wiedemann syndrome, Beckwith–Wiedemann, Biology, 03 medical and health sciences, Genomic Imprinting, Genetics, medicine, Macroglossia, Missense mutation, Humans, Epigenetics, Amino Acid Sequence, Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p57, Genetics (clinical), Alleles, Genetic Association Studies, 030304 developmental biology, Ganglioneuroblastoma, 0303 health sciences, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], 030305 genetics & heredity, Cell Cycle, medicine.disease, Phenotype, 3. Good health, Pedigree, CDKN1C, Amino Acid Substitution, Overgrowth syndrome, Mutation, Female, medicine.symptom, imprinting, Sequence Alignment, overgrowth syndrome, Visceromegaly
Abstract: International audience; Beckwith–Wiedemann syndrome (BWS) is an imprinting disorder associating macroglossia, abdominal wall defects, visceromegaly, and a high risk of childhood tumor. Molecular anomalies are mostly epigenetic; however, mutations of CDKN1C are implicated in 8% of cases, including both sporadic and familial forms. We aimed to describe the phenotype of BWS patients with CDKN1C mutations and develop a functional test for CDKN1C mutations. For each propositus, we sequenced the three exons and intron–exon boundaries of CDKN1C in patients presenting a BWS phenotype, including abdominal wall defects, without 11p15 methylation defects. We developed a functional test based on flow cytometry. We identified 37 mutations in 38 pedigrees (50 patients and seven fetuses). Analysis of parental samples when available showed that all mutations tested but one was inherited from the mother. The four missense mutations led to a less severe phenotype (lower frequency of exomphalos) than the other 33 mutations. The following four tumors occurred: one neuroblastoma, one ganglioneuroblastoma, one melanoma, and one acute lymphoid leukemia. Cases of BWS caused by CDKN1C mutations are not rare. CDKN1C sequencing should be performed for BWS patients presenting with abdominal wall defects or cleft palate without 11p15 methylation defects or body asymmetry, or in familial cases of BWS
Published: 2015
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13. Comparison of the long-term outcome for patients with rheumatoid arthritis with persistent moderate disease activity or disease remission during the first year after diagnosis: data from the ESPOIR cohort

Author: Thierry Schaeverbeke, Isabelle Logeart, Sabrina Dadoun, Bernard Combe, J.-P. Daurès, M. C. Belkacemi, Maxime Dougados, Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Département de Rhumatologie[Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Lapeyronie, Pfizer Ltd France, Pfizer, Département de Rhumatologie, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Université de Bordeaux (UB), Aide à la Décision pour une Médecine Personnalisé - Laboratoire de Biostatistique, Epidémiologie et Recherche Clinique - EA 2415 (AIDMP), Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM), Service de rhumatologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier ( IGMM ), Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Université de Montpellier ( UM ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Hôpital Lapeyronie, Pfizer SAS, Département de Rhumatologie ( BORDEAUX - Rhumato ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux], Aide à la Décision pour une Médecine Personnalisé - Laboratoire de Biostatistique, Epidémiologie et Recherche Clinique - EA 2415 ( AIDMP ), Université Montpellier 1 ( UM1 ) -Université de Montpellier ( UM ), CHU Cochin [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de Biostatistique, Epidémiologie et Recherche Clinique - IURC, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Cochin [AP-HP], Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Blood Sedimentation, Logistic regression, Peptides, Cyclic, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Arthritis, Rheumatoid, Cohort Studies, Disease activity, symbols.namesake, Rheumatology, Internal medicine, medicine, Humans, Immunology and Allergy, Longitudinal Studies, Prospective Studies, Fisher's exact test, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Tumor Necrosis Factor-alpha, business.industry, Remission Induction, Middle Aged, Prognosis, medicine.disease, Connective tissue disease, 3. Good health, Surgery, Logistic Models, Methotrexate, Treatment Outcome, Antirheumatic Agents, Rheumatoid arthritis, Multivariate Analysis, Disease remission, Cohort, Disease Progression, symbols, Female, Outcomes research, business
Abstract: International audience; OBJECTIVE: To investigate if patients with early RA with persistent moderate disease activity during the first year after diagnosis have a worse 3-5 year outcome than those who achieve sustained clinical remission within the first year, in a daily life setting. METHODS: The ESPOIR cohort included patients with early arthritis of 3.2 and ≤5.1) at both the 6- and 12-month visits, with those who were in sustained DAS28 remission. The primary outcome was radiographic progression at the 36-month visit. Secondary endpoints were clinical remission (DAS28 score, Simplified Disease Activity Index, ACR/EULAR criteria), Health Assessment Questionnaire-Disability Index (HAQ-DI) and number of missed workdays at months 36 and 60. A Fisher exact test was used to compare categorical variables, and the Kruskal-Wallis test for quantitative variables. Logistic regression analysis was used to determine predictors of outcome. RESULTS: Patients were aged 48.1±12.5 years and their duration of symptoms was 103.2±52.1 days. Mean baseline DAS28 was 5.1±1.3. Persistent moderate disease activity (107 patients) rather than sustained remission (155 patients) during the first year was associated with increased radiographic disease progression at 3 years (OR=1.99 (95% CI 1.01 to 3.79)), increased HAQ-DI at 3 and 5 years (5.23 (2.81 to 9.73) and 4.10 (2.16 to 7.80), respectively), a 7-11 times smaller chance of achieving clinical remission and a five times greater number of missed workdays. CONCLUSIONS: Patients with early RA with persistent moderate disease activity during the first year had a worse outcome than patients who achieved sustained clinical remission. Persistent moderate disease activity affects long-term structure, remission rate and functional and work disability. Such patients may benefit from intensive treatment.
Published: 2014
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14. Systematic molecular and cytogenetic screening of 100 patients with marfanoid syndromes and intellectual disability

Author: Callier , P., Aral , B., Hanna , N., Lambert , S., Dindy , H., Ragon , C., Payet , M., Collod-Béroud , Gwenaëlle, Carmignac , V., Delrue , M. A., Goizet , C., Philip , N., Busa , Tiffany, Dulac , Y., Missotte , I., Sznajer , Y., Toutain , A., Francannet , C., Megarbane , A., Julia , S., Edouard , T., Sarda , P., Amiel , J., Lyonnet , S., Cormier-Daire , V., Gilbert , B., Jacquette , A., Heron , D., Collignon , P., Lacombe , D., Morice-Picard , F., Jouk , P. S., Cusin , V., Willems , M., Sarrazin , E., Amarof , K., Coubes , C., Addor , M. C., Journel , H., Colin , E., Khau Van Kien , P., Baumann , C., Leheup , B., Martin-Coignard , D., Doco-Fenzy , M., Goldenberg , A., Plessis , G., Thevenon , J., Pasquier , L., Odent , S., Vabres , P., Huet , F., Marle , N., Mosca-Boidron , A. L., Mugneret , F., Gauthier , S., Binquet , C., Thauvin-Robinet , C., Jondeau , G., Boileau , C., Faivre , L., Equipe GAD (LNC - U1231), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle (GMGF), Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de génétique médicale [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Centre hospitalier territorial Gaston-Bourret [Nouméa], Cliniques Universitaires Saint-Luc [Bruxelles], Service de génétique [Tours], Hôpital Bretonneau-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), CHU Clermont-Ferrand, Université Saint-Joseph de Beyrouth (USJ), Service Pédiatrique [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital des Enfants, Service de génétique médicale [Montpellier], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Hôpital Arnaud de Villeneuve, Service de Génétique Médicale [CHU Necker], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service Génétique Médicale [CHU Poitiers], Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital intercommunal de Font-Pré, Département de génétique, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble, Consultation Marfan, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bichat, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Pierre Zobda-Quitman [CHU de la Martinique], CHU de la Martinique [Fort de France], Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), Centre hospitalier de Vannes, Service de génétique [Angers], Université d'Angers (UA)-Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Service Génétique Médicale [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Pôle Enfants [CHU Toulouse], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] ( LNC ), Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Bourgogne ( UB ) -AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Hôpital Ambroise Paré, Génétique Médicale et Génomique Fonctionnelle ( GMGF ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Centre de résonance magnétique biologique et médicale ( CRMBM ), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) -Aix Marseille Université ( AMU ), Hôpital Bretonneau-CHRU Tours, Université Saint-Joseph de Beyrouth ( USJ ), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] ( CHRU Montpellier ) -Hôpital Arnaud de Villeneuve, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP), Centre hospitalier universitaire de Poitiers ( CHU Poitiers ), CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Université Joseph Fourier - Grenoble 1 ( UJF ) -CHU Grenoble, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bichat, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), CHU de la Martinique, Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] ( CHUV ), Université d'Angers ( UA ) -CHU Angers, Institut de génétique humaine ( IGH ), Université de Montpellier ( UM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux ( NGERE ), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Lorraine ( UL ), CHU Le MAns, CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Institut de Génétique et Développement de Rennes ( IGDR ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ) -Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques ( CIC-EC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Jonchère, Laurent, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hopital Necker-Enfants Malades, CHU de Poitiers, and Université de Lorraine ( UL ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM )
Subjects: Adult, Male, musculoskeletal diseases, Comparative Genomic Hybridization, congenital, hereditary, and neonatal diseases and abnormalities, [ SDV ] Life Sciences [q-bio], Adolescent, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sequence Analysis, DNA, Middle Aged, Marfan Syndrome, [SDV] Life Sciences [q-bio], Young Adult, X Chromosome Inactivation, Child, Preschool, Intellectual Disability, Cytogenetic Analysis, Mutation, Humans, Female, Genetic Testing, Prospective Studies, Child
Abstract: International audience; The association of marfanoid habitus (MH) and intellectual disability (ID) has been reported in the literature, with overlapping presentations and genetic heterogeneity. A hundred patients (71 males and 29 females) with a MH and ID were recruited. Custom-designed 244K array-CGH (Agilent®; Agilent Technologies Inc., Santa Clara, CA) and MED12, ZDHHC9, UPF3B, FBN1, TGFBR1 and TGFBR2 sequencing analyses were performed. Eighty patients could be classified as isolated MH and ID: 12 chromosomal imbalances, 1 FBN1 mutation and 1 possibly pathogenic MED12 mutation were found (17%). Twenty patients could be classified as ID with other extra-skeletal features of the Marfan syndrome (MFS) spectrum: 4 pathogenic FBN1 mutations and 4 chromosomal imbalances were found (2 patients with both FBN1 mutation and chromosomal rearrangement) (29%). These results suggest either that there are more loci with genes yet to be discovered or that MH can also be a relatively non-specific feature of patients with ID. The search for aortic complications is mandatory even if MH is associated with ID since FBN1 mutations or rearrangements were found in some patients. The excess of males is in favour of the involvement of other X-linked genes. Although it was impossible to make a diagnosis in 80% of patients, these results will improve genetic counselling in families.
Published: 2013
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15. Search for a gene responsible for Floating-Harbor syndrome on chromosome 12q15q21.1

Author: Frédéric Huet, Alice Goldenberg, Armand Bottani, Sandy Lambert, Estelle Lopez, Laurence Duplomb, Bérénice Doray, Valérie Cormier-Daire, Patrick Callier, Anne Moncla, Bernard Aral, Laurence Faivre, Lucie Gueneau, Christel Thauvin-Robinet, Sylvie Odent, Damien Sanlaville, Didier Lacombe, Génétique des Anomalies du Développement (GAD), Université de Bourgogne (UB)-IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Laboratoire de cytogénétique (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Génétique médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG), Laboratoire de Biologie de la reproduction CECOS - [CHU de Dijon], Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), CHU Strasbourg-Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Service de génétique clinique [Rennes], Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Service de Cytogénétique (HFME), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Laboratoire de Génétique Chromosomique et Moléculaire [CHU Dijon], Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Génétique des Anomalies du Développement ( GAD ), Université de Bourgogne ( UB ) -IFR100 - Structure fédérative de recherche Santé-STIC, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Aix Marseille Université ( AMU ) -Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille ( APHM ) - Hôpital de la Timone [CHU - APHM] ( TIMONE ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Hôpitaux Universitaires de Genève ( HUG ), Service de Biologie Moléculaire, CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -CHU Pontchaillou [Rennes]-Hôpital Sud, Service de Cytogénétique ( HFME ), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] ( HFME ), Hospices Civils de Lyon ( HCL ) -Hospices Civils de Lyon ( HCL ), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-hôpital Sud, Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hospices Civils de Lyon (HCL), and De Villemeur, Hervé
Subjects: Adult, Heart Septal Defects, Ventricular, Male, Candidate gene, Floating Harbor syndrome, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Haploinsufficiency, Biology, Bioinformatics, Short stature, Craniofacial Abnormalities, 03 medical and health sciences, 12q15q21.1 microdeletion, [SDV.BDD] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, Genetic Predisposition to Disease, [ SDV.BDD ] Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Child, [SDV.BDD]Life Sciences [q-bio]/Development Biology, Genetics (clinical), Growth Disorders, 030304 developmental biology, Sequence Deletion, Phenocopy, 0303 health sciences, Comparative Genomic Hybridization, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Chromosomes, Human, Pair 12, Genetic heterogeneity, 030305 genetics & heredity, Chromosome, High-Throughput Nucleotide Sequencing, high-throughput sequencing, medicine.disease, 3. Good health, Phenotype, Floating–Harbor syndrome, Child, Preschool, Mutation (genetic algorithm), Female, medicine.symptom, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics
Abstract: International audience; Floating-Harbor syndrome (FHS) is characterized by characteristic facial dysmorphism, short stature with delayed bone age, and expressive language delay. To date, the gene(s) responsible for FHS is (are) unknown and the diagnosis is only made on the basis of the clinical phenotype. The majority of cases appeared to be sporadic but rare cases following autosomal dominant inheritance have been reported. We identified a 4.7 Mb de novo 12q15-q21.1 microdeletion in a patient with FHS and intellectual deficiency. Pangenomic 244K array-CGH performed in a series of 12 patients with FHS failed to identify overlapping deletions. We hypothesized that FHS is caused by haploinsufficiency of one of the 19 genes or predictions located in the deletion found in our index patient. Since none of them appeared to be good candidate gene by their function, a high-throughput sequencing approach of the region of interest was used in eight FHS patients. No pathogenic mutation was found in these patients. This approach failed to identify the gene responsible for FHS, and this can be explained by at least four reasons: (i) our index patient could be a phenocopy of FHS; (ii) the disease may be clinically heterogeneous (since the diagnosis relies exclusively on clinical features), (iii) these could be genetic heterogeneity of the disease, (iv) the patient could carry a mutation in a gene located elsewhere. Recent descriptions of patients with 12q15-q21.1 microdeletions argue in favor of the phenocopy hypothesis. © 2012 Wiley Periodicals, Inc.
Published: 2012
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16. Comparison of clinical presentations and outcomes between patients with TGFBR2 and FBN1 mutations in Marfan syndrome and related disorders

Author: David Attias, Philippe Gabriel Steg, Franck Iserin, Daniel Sidi, Mireille Claustres, Laurence Faivre, Marlène Rio, Marie-Ange Delrue, Philippe Ravaud, Catherine Boileau, Carine Roy, Christine Francannet, Henri Plauchu, Sylvie Odent, Christophe Béroud, Guillaume Jondeau, Martine Le Merrer, Chantal Stheneur, Gwenaëlle Collod-Béroud, Stanislas Lyonnet, Philippe Khau Van Kien, Annick Rossi, Laurence Cohen, Didier Lacombe, Delphine Detaint, Consultation Marfan, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Bichat, Service de cardiologie, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de pédiatrie, urgences enfants [CHU Ambroise-Paré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Modèles et méthodes de l'évaluation thérapeutique des maladies chroniques, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'épidémiologie, biostatistique et recherche clinique, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques (LGMR), Université Montpellier 1 (UM1)-IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Service de génétique médicale, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Unité de Cardiologie Pédiatrique, Hôpital Privé Jacques Cartier [Massy], Unité de Génétique Médicale, Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA), Service de cardiologie pédiatrique [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Service de Génétique Clinique, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Sud, Service de Génétique, Hôpital de l'Hôtel Dieu [CHU-HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon, Service de génétique [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hémostase, bio-ingénierie et remodelage cardiovasculaires (LBPC), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie, d'hormonologie et de génétique moléculaire [CHU Amrboise Paré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Service de pédiatrie, urgences enfants [Ambroise-Paré], Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP]-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris 13 (UP13)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Galilée, Service de biochimie, d'hormonologie et de génétique moléculaire [Amrboise Paré], Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bichat, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Laboratoire de Recherche Magellan, Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut d'Administration des Entreprises (IAE) - Lyon, Service de Génétique Médicale [CHU Clermont-Ferrand], CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Institut de génétique humaine (IGH), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Unité de génétique médicale, hôpital Sud, Hôpital Bichat - Claude Bernard, Modèles et méthodes de l'évaluation thérapeutique des maladies chroniques (U738 / UMR_S738), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bichat, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service de pédiatrie, urgences enfants, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré, Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Hôtel-Dieu-CHU Clermont-Ferrand-Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I ( UdA ), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Université de Rennes 1 ( UR1 ), Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Université de Rennes ( UNIV-RENNES ) -Hôpital Sud, Université Claude Bernard Lyon 1 ( UCBL ), Université de Lyon-Université de Lyon-Hôtel Dieu, CHU Rouen-Université de Rouen Normandie ( UNIROUEN ), Normandie Université ( NU ) -Normandie Université ( NU ), Hémostase, bio-ingénierie et remodelage cardiovasculaires ( LBPC ), Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Galilée, Service de biochimie, d'hormonologie et de génétique moléculaire, IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche Magellan, Institut d'Administration des Entreprises (IAE) - Lyon-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), and COLLOD-BEROUD, Gwenaëlle
Subjects: Male, MESH : Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH : Mitral Valve Prolapse, Gene mutation, Gastroenterology, Marfan Syndrome, 0302 clinical medicine, MESH: Pregnancy, MESH : Child, Pregnancy, Mitral valve, MESH: Child, Medicine, MESH: Incidence, Child, MESH: Aneurysm, Dissecting, Aortic dissection, 0303 health sciences, Mitral Valve Prolapse, MESH: Middle Aged, Incidence, Prognosis, MESH: Case-Control Studies, MESH : Incidence, Aortic Aneurysm, 3. Good health, Survival Rate, MESH : Phenotype, MESH: Young Adult, Cardiology and Cardiovascular Medicine, musculoskeletal diseases, MESH : Case-Control Studies, medicine.medical_specialty, MESH : Young Adult, MESH : Cohort Studies, Fibrillins, MESH: Phenotype, Sudden death, MESH: Prognosis, MESH: Protein-Serine-Threonine Kinases, 03 medical and health sciences, MESH: Mitral Valve Prolapse, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, MESH : Adolescent, Physiology (medical), Humans, MESH : Middle Aged, MESH : Aneurysm, Dissecting, MESH: Adolescent, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, MESH: Humans, MESH : Humans, Receptor, Transforming Growth Factor-beta Type II, Case-control study, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, MESH: Adult, medicine.disease, MESH: Aortic Aneurysm, MESH : Pregnancy, MESH : Mitral Valve Insufficiency, Case-Control Studies, Mutation, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH: Female, Marfan syndrome, MESH: Mitral Valve Insufficiency, Fibrillin-1, Kaplan-Meier Estimate, 030204 cardiovascular system & hematology, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Cohort Studies, MESH : Female, MESH: Kaplan-Meiers Estimate, MESH: Cohort Studies, MESH : Prognosis, Incidence (epidemiology), Microfilament Proteins, Mitral Valve Insufficiency, MESH : Adult, [ SDV.MHEP.CSC ] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Middle Aged, MESH : Survival Rate, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, MESH : Aortic Aneurysm, Phenotype, medicine.anatomical_structure, Female, MESH: Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH : Mutation, MESH : Protein-Serine-Threonine Kinases, Adult, MESH: Mutation, MESH : Microfilament Proteins, Adolescent, MESH: Survival Rate, MESH : Male, [SDV.GEN.GH] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, Protein Serine-Threonine Kinases, MESH: Marfan Syndrome, Young Adult, MESH: Microfilament Proteins, Internal medicine, Survival rate, 030304 developmental biology, MESH : Marfan Syndrome, business.industry, MESH : Kaplan-Meiers Estimate, MESH: Male, Surgery, Aortic Dissection, [SDV.GEN.GH]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Human genetics, business
Abstract: Background— TGFBR2 mutations were recognized recently among patients with a Marfan-like phenotype. The associated clinical and prognostic spectra remain unclear. Methods and Results— Clinical features and outcomes of 71 patients with a TGFBR2 mutation (TGFBR2 group) were compared with 50 age- and sex-matched unaffected family members (control subjects) and 243 patients harboring FBN1 mutations (FBN1 group). Aortic dilatation was present in a similar proportion of patients in both the TGFBR2 and FBN1 groups (78% versus 79%, respectively) but was highly variable. The incidence and average age for thoracic aortic surgery (31% versus 27% and 35±16 versus 39±13 years, respectively) and aortic dissection (14% versus 10% and 38±12 versus 39±9 years) were also similar in the 2 groups. Mitral valve involvement (myxomatous, prolapse, mitral regurgitation) was less frequent in the TGFBR2 than in the FBN1 group (all P TGFBR2 mutations, versus 32% with FBN1 mutations ( P =0.002). The rate of death was greater in TGFBR2 families before diagnosis but similar once the disease had been recognized. Most pregnancies were uneventful (without death or aortic dissection) in both TGFBR2 and FBN1 families (38 of 39 versus 213 of 217; P =1). Seven patients (10%) with a TGFBR2 mutation fulfilled international criteria for Marfan syndrome, 3 of whom presented with features specific for Loeys-Dietz syndrome. Conclusions— Clinical outcomes appear similar between treated patients with TGFBR2 mutations and individuals with FBN1 mutations. Prognosis depends on clinical disease expression and treatment rather than simply the presence of a TGFBR2 gene mutation.
Published: 2009
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17. Identification of 23 TGFBR2 and 6 TGFBR1 gene mutations and genotype-phenotype investigations in 457 patients with Marfan syndrome type I and II, Loeys-Dietz syndrome and related disorders

Author: Clarisse Baumann, Henri Plauchu, Didier Lacombe, Valérie Cormier-Daire, Marc Sznajder, Guillaume Jondeau, Stanislas Lyonnet, Chantal Stheneur, Bertrand Moura, Catherine Boileau, Mireille Claustres, Gwenaëlle Collod-Béroud, Christine Muti, Bertrand Chevallier, Claudine Junien, Marlène Rio, David Attias, Laurence Faivre, Laurent Gouya, Gilles Sultan, Jean-Marie Le Parc, Service de pédiatrie, urgences enfants, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ) -Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré, Consultation Marfan, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Bichat, Physiologie Cellulaire des Regulations Hormonales, Nutritionnelles et Pharmacologiques, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Centre National de la Recherche Scientifique ( CNRS ), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques, Université Montpellier 1 ( UM1 ) -IFR3-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Université de Montpellier ( UM ), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques ( CIC-EC ), Université de Bourgogne ( UB ) -Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand ( CHU Dijon ), Service de biochimie, d'hormonologie et de génétique moléculaire, UFR Paris-Ile-de-France-Ouest, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines ( UVSQ ), Interactions de l'épithelium intestinal avec le système immunitaire, Université Paris Descartes - Paris 5 ( UPD5 ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ), Service d'ophtalmologie, Service de Rhumatologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré, Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement ( Inserm U781 ), Département de Génétique Médicale, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Service de Génétique Médicale [CHU Necker], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-Hopital Necker-Enfants Malades, Service de Génétique, Hôtel Dieu, Service de génétique médicale, Université de Bordeaux ( UB ) -CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service de cardiologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]-Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ), Hémostase, bio-ingénierie et remodelage cardiovasculaires ( LBPC ), Université Paris Diderot - Paris 7 ( UPD7 ) -Université Paris 13 ( UP13 ) -Université Sorbonne Paris Cité ( USPC ) -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale ( INSERM ) -Institut Galilée, Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ) - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Ambroise Paré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Bichat, Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Montpellier 1 (UM1) - IFR3 - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Université de Montpellier (UM), Centre d'Investigation Clinique 1432 (Dijon) - Epidemiologie Clinique/Essais Cliniques (CIC-EC), Université de Bourgogne (UB) - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Ambroise Paré, Laboratoire de Génétique Moléculaire, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier) - Hôpital Arnaud de Villeneuve, Handicaps génétiques de l'enfant, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Robert Debré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hopital Necker-Enfants Malades, Université de Bordeaux (UB) - CHU Bordeaux [Bordeaux] - Groupe hospitalier Pellegrin, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Hémostase, bio-ingénierie et remodelage cardiovasculaires (LBPC), Université Paris 13 (UP13) - Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7) - Université Sorbonne Paris Cité (USPC) - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) - Institut Galilée, Service de pédiatrie, urgences enfants [CHU Ambroise-Paré], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Ambroise Paré [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Bichat, Pharmacologie, toxicologie et signalisation cellulaire (U747), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de génétique des maladies rares. Pathologie moleculaire, etudes fonctionnelles et banque de données génétiques (LGMR), IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de biochimie, d'hormonologie et de génétique moléculaire [CHU Amrboise Paré], Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'ophtalmologie [CHU Ambroise Paré], Génétique et épigénétique des maladies métaboliques, neurosensorielles et du développement (Inserm U781), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Robert Debré, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris 13 (UP13)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Galilée, CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), COLLOD-BEROUD, Gwenaëlle, Université Montpellier 1 (UM1)-IFR3, Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), and Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut Galilée-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Male, Proband, Marfan syndrome, Pathology, MESH : Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH : Polymorphism, Genetic, DNA Mutational Analysis, Receptor, Transforming Growth Factor-beta Type I, MESH : Genotype, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, 030204 cardiovascular system & hematology, Gene mutation, MESH : Child, Preschool, Loeys–Dietz syndrome, MESH : Syndrome, MESH: Genotype, Aortic aneurysm, 0302 clinical medicine, MESH : Child, MESH: Child, Genotype, MESH: Syndrome, MESH : Female, MESH: DNA Mutational Analysis, Child, Genetics (clinical), TGFBR1, TAAD, 0303 health sciences, MESH: Middle Aged, MESH : Aortic Aneurysm, Thoracic, MESH: Infant, Newborn, MESH : Infant, Syndrome, Middle Aged, MESH : Adult, Phenotype, MESH: Infant, MESH: Amino Acid Substitution, 3. Good health, TGFBR2, genotype-phenotype, MESH : Phenotype, Child, Preschool, MESH: Aortic Aneurysm, Thoracic, Female, MESH: Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH : Mutation, Adult, MESH : Protein-Serine-Threonine Kinases, medicine.medical_specialty, MESH: Abnormalities, Multiple, MESH: Mutation, Adolescent, MESH : Male, MESH : DNA Mutational Analysis, Protein Serine-Threonine Kinases, Biology, MESH: Phenotype, MESH : Infant, Newborn, MESH: Protein-Serine-Threonine Kinases, MESH: Marfan Syndrome, 03 medical and health sciences, MESH : Amino Acid Substitution, MESH : Adolescent, MESH: Polymorphism, Genetic, Genetics, medicine, Humans, Abnormalities, Multiple, MESH : Middle Aged, Gene, 030304 developmental biology, MESH: Adolescent, [SDV.GEN]Life Sciences [q-bio]/Genetics, Loeys-Dietz Syndrome, Polymorphism, Genetic, MESH: Humans, MESH : Marfan Syndrome, Aortic Aneurysm, Thoracic, MESH : Abnormalities, Multiple, MESH: Child, Preschool, MESH : Humans, Infant, Newborn, Receptor, Transforming Growth Factor-beta Type II, Infant, MESH: Adult, medicine.disease, MESH: Male, Amino Acid Substitution, Mutation, [ SDV.GEN ] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Receptors, Transforming Growth Factor beta, MESH: Female
Abstract: International audience; TGFBR1 and TGFBR2 gene mutations have been associated with Marfan syndrome types 1 and 2, Loeys-Dietz syndrome and isolated familial thoracic aortic aneurysms or dissection. In order to investigate the molecular and clinical spectrum of TGFBR2 mutations we screened the gene in 457 probands suspected of being affected with Marfan syndrome or related disorders that had been referred to our laboratory for molecular diagnosis. We identified and report 23 mutations and 20 polymorphisms. Subsequently, we screened the TGFBR1 gene in the first 74 patients for whom no defect had been found, and identified 6 novel mutations and 12 polymorphisms. Mutation-carrying probands displayed at referral a large clinical spectrum ranging from the Loeys-Dietz syndrome and neonatal Marfan syndrome to isolated aortic aneurysm. Furthermore, a TGFBR1 gene mutation was found in a Shprintzen-Goldberg syndrome patient. Finally, we observed that the yield of mutation detection within the two genes was very low : 4.8% for classical MFS, 4.6% for incomplete MFS and 1% for TAAD in the TGFBR2 gene; 6.2%, 6.2% and 7% respectively in the TGFBR1 gene; in contrast to LDS, where the yield was exceptionally high (87.5%).
Published: 2008
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18. Impact of Childhood Onset Psoriasis on Addictive Behaviours, Socioeconomic and Educational Data in Adulthood

Author: Emmanuel, Mahé, Florence, Tubach, Denis, Jullien, Diep, Tran, Carle, Paul, Marie, Beylot-Barry, Alain, Dupuy, Manuelle, Viguier, Marie-Aleth, Richard, Emilie, Sbidian, Nathalie, Beneton, Pascal, Joly, Olivier, Chosidow, Hervé, Bachelez, Centre Hospitalier Victor Dupouy, Epidémiologie Clinique et Evaluation Economique Appliquées aux Populations Vulnérables (ECEVE (U1123 / UMR_S_1123)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Hospices Civils de Lyon (HCL), Unité différenciation épidermique et auto-immunité rhumatoïde (UDEAR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Immuno-Régulation dans les Maladies Auto-Immunes Inflammatoires et le Cancer - EA 7509 (IRMAIC), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), CHU Marseille, Epidemiology in Dermatology and Evaluation in Therapeutics (EpiDermE), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices (PANTHER), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), French Ministry of Health [PHRC AOM 09 195], French Drugs Agency (ANSM), AbbVie, Janssen, MSD France, Pfizer, Departement a la Recherche Clinique et au Developpement (DRCD), Assistance Publique-Hopitaux de Paris, French Society of Dermatology (Societe Francaise de Dermatologie), Groupe de Recherche sur le Psoriasis, Jonchère, Laurent, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Adult, socioeconomic data, alcohol, [SDV]Life Sciences [q-bio], Dermatology, General Medicine, psoriasis, tobacco, Behavior, Addictive, [SDV] Life Sciences [q-bio], Cross-Sectional Studies, educational level, Socioeconomic Factors, children, adolescent, Educational Status, Humans, Prospective Studies, Child
Abstract: International audience; Paediatric psoriasis has been associated with school absenteeism, limitation of physical activities, psychiatric disorders and, in the longer term, with sexual dysfunction and addictions. This raises the hypothesis that childhood onset psoriasis may affect patients' educational development, and further social and professional outcomes. This study evaluated the relationship between childhood onset psoriasis and patients' educational and socioeconomic characteristics, and the development of addictions in adulthood. This cross-sectional ancillary study captured patients' characteristics at baseline in the French PSOBIOTEQ registry. Data in adulthood included: educational (baccalaureate) and socioeconomic (working activity) groups, smoking status (self-reporting of being a current smoker vs past smoker or non-smoker), alcohol consumption (defined as at least 1 glass of alcoholic beverage per day), and living conditions (alone/family/social institutions; child at home). A total of 1,960 patients were included, of whom 26.2% had childhood onset psoriasis. In multivariate analyses, childhood onset psoriasis was associated with smoker status (p = 0.02). No association was observed with educational level, working activity, living conditions, or alcohol consumption. This study provides reassuring data overall with regard to the impact of childhood onset psoriasis on major social outcomes. Evidence for some association with addictive behaviours paves the way for larger prospective studies assessing in depth the social and educational impact of this disease.
Published: 2022
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19. Vestigial-like 3 is a novel Ets1 interacting partner and regulates trigeminal nerve formation and cranial neural crest migration

Author: Simon, Emilie, Thézé, Nadine, Fédou, Sandrine, Thiébaud, Pierre, Faucheux, Corinne, Inserm U1035, Biotherapies des Maladies Genetiques et Cancers, Univ Bordeaux, CHU de Bordeaux, Pole de Biologie et Pathologie, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and THIEBAUD, PIERRE
Subjects: animal structures, QH301-705.5, Science, Ets1, Xenopus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Trigeminal nerve, Vestigial-like, [SDV] Life Sciences [q-bio], Wnt-FGF, Cranial neural crest, Biology (General), Research Article
Abstract: Drosophila Vestigial is the founding member of a protein family containing a highly conserved domain, called Tondu, which mediates their interaction with members of the TEAD family of transcription factors (Scalloped in Drosophila). In Drosophila, the Vestigial/Scalloped complex controls wing development by regulating the expression of target genes through binding to MCAT sequences. In vertebrates, there are four Vestigial-like genes, the functions of which are still not well understood. Here, we describe the regulation and function of vestigial-like 3 (vgll3) during Xenopus early development. A combination of signals, including FGF8, Wnt8a, Hoxa2, Hoxb2 and retinoic acid, limits vgll3 expression to hindbrain rhombomere 2. We show that vgll3 regulates trigeminal placode and nerve formation and is required for normal neural crest development by affecting their migration and adhesion properties. At the molecular level, vgll3 is a potent activator of pax3, zic1, Wnt and FGF, which are important for brain patterning and neural crest cell formation. Vgll3 interacts in the embryo with Tead proteins but unexpectedly with Ets1, with which it is able to stimulate a MCAT driven luciferase reporter gene. Our findings highlight a critical function for vgll3 in vertebrate early development., Summary: Here, we provide the first description of Vgll3 function during vertebrate development. Vgll3 is a new partner of Ets1 and regulates trigeminal nerve formation and cranial neural crest cell migration.
Published: 2022
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20. Evolution of Drug Survival with Biological Agents and Apremilast Between 2012 and 2018 in Patients with Psoriasis from the PsoBioTeq Cohort

Author: Olivier Chosidow, Hervé Bachelez, Thomas Bettuzzi, Marie Beylot-Barry, Pascal Joly, Alain Dupuy, Florence Tubach, Emmanuel Mahé, Nathalie Beneton, Manuelle Viguier, Marie-Aleth Richard, Denis Jullien, Hugo Arlegui, Emilie Sbidian, Carle Paul, CHU Henri Mondor [Créteil], Epidemiology in Dermatology and Evaluation in Therapeutics (EpiDermE), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Unité différenciation épidermique et auto-immunité rhumatoïde (UDEAR), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AP-HP Hôpital universitaire Robert-Debré [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Victor Dupouy, Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Hospices Civils de Lyon (HCL), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Physiopathologie, Autoimmunité, maladies Neuromusculaires et THErapies Régénératrices (PANTHER), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Pontchaillou, Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Investigation Clinique Henri Mondor (CIC Henri Mondor), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Dynamic Microbiology - EA 7380 (DYNAMIC), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est (UPE)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), AOM 09 195, Amgen, Pfizer, Novartis, AbbVie, Meso Scale Diagnostics, MSD, Novartis Pharma, Janssen Pharmaceuticals, MSD France, Ministère des Affaires Sociales et de la Santé, Société Française de Dermatologie et de Pathologie Sexuellement Transmissible, SFD: JMD/MDM/177-11, NCT01617018, Agence Nationale de Sécurité du Médicament et des Produits de Santé, ANSM, LEO Pharma Research Foundation, Assistance publique-Hôpitaux de Paris, Jonchère, Laurent, CHU Henri Mondor, Centre de Pharmacoépidémiologie de l'AP-HP (Cephepi), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), and Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Dermatology, Biological Factors, Primary outcome, drug survival, Psoriasis, Internal medicine, apre-milast, medicine, Humans, Biological Products, treatment, business.industry, Proportional hazards model, Hazard ratio, General Medicine, psoriasis, Middle Aged, [SDV.MHEP.DERM] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology, medicine.disease, Thalidomide, Drug survival, [SDV] Life Sciences [q-bio], Antirheumatic Agents, Cohort, Observational study, Female, Apremilast, business, biologic, [SDV.MHEP.DERM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology, medicine.drug
Abstract: International audience; Drug survival reflects treatment effectiveness and safety in real life. There is limited data on the variation of drug survival with the availability of systemic treatments with additional biological disease-modifying antirheumatic drugs (bDMARDs) or synthetic disease-modifying antirheumatic drugs (sDMARDs). The aim of this study was to determine whether the increasing number of available systemic treatments for psoriasis affects drug survival over time. Patients were selected from the PsoBioTeq cohort, a French prospective observational cohort enrolling patients with moderate to severe psoriasis. All patients initiating a first bDMARD or sDMARD were included. The primary outcome was comparison of drug survival over time. A multivariate Cox proportional hazard ratio model was computed. A total of 1,866 patients were included; 739 females (39%), median age 47 years. In the multivariate Cox model, no association was found between the calendar year of initiation and drug survival (hazard ratio) over-lapping from 0.80 (0.42–1.52) to 1.17 (0.64–2.17), p = 0.633). In conclusion, drug survival in psoriasis is not affected by the year of initiation.
Published: 2022
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21. Blépharo-conjonctivites sous dupilumab : recommandations du groupe CEDRE. Dermatite atopique, conjonctivites et dupilumab

Author: Doan, S., Arnould, L., Febvay, C., Fournié, P., Gueudry, J., Labalette, P., Ouilhon, C., Tran, T.-H.-C., Vabres, B., Barbarot, S., Bouaziz, J.-D., Du-Thanh, A., Jachiet, M., Seneschal, J., Soria, A., Staumont-Sallé, D., Baudouin, C., Mortemousque, B., Service d'ophtalmologie [Hopital Bichat - Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Service d'Ophtalmologie (CHU de Dijon), Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires (Infinity), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 (INFINITE (Ex-Liric)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Service d'Ophtalmologie [Hôpital Edouard Herriot - HCL]], Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Université Catholique de Lille - Faculté de Médecine, Maïeutique, Sciences de la santé (FMMS), Institut Catholique de Lille (ICL), Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (Nantes Univ - UFR MEDECINE), Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pathogénèse et contrôle des infections chroniques (PCCI), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Inserm U1035, Biotherapies des Maladies Genetiques et Cancers, Univ Bordeaux, CHU de Bordeaux, Pole de Biologie et Pathologie, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre Hospitalier National d'Ophtalmologie des Quinze-Vingts (CHNO)
Subjects: Dermatite atopique, Conjonctivite, Atopic Dermatitis, Dupilumab, Conjunctivitis, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Dupilumab is a recombinant monoclonal IgG4 type antibody which inhibits IL4 and IL13 signaling. It is indicated in moderate to severe atopic dermatitis (AD) in adults and adolescents over 12 years of age. Its side effects include conjunctivitis and blepharoconjunctivitis, affecting between 4.7% and 28% of patients depending on the study. The incidence of conjunctivitis in patients treated with dupilumab for AD appears to be higher than placebo in clinical studies. This increase was not observed in patients treated with dupilumab for asthma or sinonasal polyposis. The risk factors for conjunctivitis in patients with AD are disease severity, pre-existence of conjunctivitis and low concentrations of dupilumab, but the pathophysiology of this disease is poorly understood. A literature search carried out in April and May 2020 showed an increase in the number of publications on the subject, but there are currently no official joint dermatologist-ophthalmologist recommendations for prevention and management. The objective of this article is to provide an overview of the status of this subject, to address the main questions raised by this type of conjunctivitis and to suggest a course of action for starting and continuing treatment with dupilumab in patients with AD, according to the recommendations of the French Ophthalmologist/Dermatologist group CEDRE.
Published: 2022
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22. Clinical outcomes after treatment with direct antiviral agents: beyond the virological response in patients with previous HCV-related decompensated cirrhosis

Author: Pageaux, G. (Georges-Philippe), Nzinga, C. (Clovis Lusivika), Ganne, N. (Nathalie), Samuel, D. (Didier), Dorival, C. (Céline), Zoulim, F. (Fabien), Cagnot, C. (Carole), Decaens, T. (Thomas), Thabut, D. (Dominique), Asselah, T. (Tarik), Mathurin, P. (Philippe), Habersetzer, F. (Francois), Bronowicki, J. (Jean-Pierre), Guyader, D. (Dominique), Rosa, I. (Isabelle), Leroy, V. (Vincent), Chazouilleres, O. (Olivier), de Ledinghen, V. (Victor), Bourliere, M. (Marc), Causse, X. (Xavier), Cales, P. (Paul), Metivier, S. (Sophie), Loustaud-Ratti, V. (Véronique), Riachi, G. (Ghassan), Alric, L. (Laurent), Gelu-Simeon, M. (Moana), Minello, A. (Anne), Gournay, J. (Jérôme), Geist, C. (Claire), Tran, A. (Albert), Abergel, A. (Armand), Portal, I. (Isabelle), d'Alteroche, L. (Louis), Raffi, F. (François), Fontaine, H. (Hélène), Carrat, F. (Fabrice), Pol, S. (Stanislas), Baumert, Thomas F., Doffoel, M. (Michel), Mutter, C. (Catherine), Simo-Noumbissie, P. (Pauline), Razi, E. (Esma), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathogénèse et Traitement des Maladies du Foie, Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Saclay, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHI Créteil, Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Université d'Angers (UA), CHU Toulouse [Toulouse], Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), French ANRS CO22 Hepather Cohort: Delphine Bonnet, Virginie Payssan-Sicart, Chloe Pomes, François Bailly, Marjolaine Beaudoin, Dominique Giboz, Kerstin Hartig-Lavie, Marianne Maynard, Eric Billaud, David Boutoille, Morane Cavellec, Caroline Chevalier, Isabelle Hubert, Pierre Goepfert, Adrien Lannes, Françoise Lunel, Jérôme Boursier, Nathalie Boyer, Nathalie Giuily, Corinne Castelnau, Giovanna Scoazec, Aziza Chibah, Sylvie Keser, Karim Bonardi, Anaïs Vallet-Pichard, Philippe Sogni, Juliette Foucher, Jean-Baptiste Hiriart, Amandine Legendre, Faiza Chermak, Marie Irlès-Depé, Si Nafa Si Ahmed, Christelle Ansaldi, Nisserine Ben Amara, Valérie Oules, Jacqueline Dunette, Rodolphe Anty, Eve Gelsi, Régine Truchi, Elena Luckina, Nadia Messaoudi, Joseph Moussali, Barbara De Dieuleveult, Héloïse Goin, Damien Labarrière, Pascal Potier, Si Nafa Si Ahmed, Véronique Grando-Lemaire, Pierre Nahon, Séverine Brulé, Rym Monard, Caroline Jezequel, Audrey Brener, Anne Laligant, Aline Rabot, Isabelle Renard, Thomas F Baumert, Michel Dofföel, Catherine Mutter, Pauline Simo-Noumbissie, Esma Razi, Hélène Barraud, Mouni Bensenane, Abdelbasset Nani, Sarah Hassani-Nani, Marie-Albertine Bernard, Georges-Philippe Pageaux, Michael Bismuth, Ludovic Caillo, Stéphanie Faure, Marie Pierre Ripault, Christophe Bureau, Sarah Launay, Jean Marie Peron, Marie Angèle Robic, Léa Tarallo, Marine Faure, Bruno Froissart, Marie-Noelle Hilleret, Jean-Pierre Zarski, Odile Goria, Victorien Grard, Hélène Montialoux, Muriel François, Christian Ouedraogo, Christelle Pauleau, Anne Varault, Tony Andreani, Bénédicte Angoulevant, Azeline Chevance, Lawrence Serfaty, Teresa Antonini, Audrey Coilly, Jean-Charles Duclos Vallée, Mariagrazia Tateo, Corinne Bonny, Chanteranne Brigitte, Géraldine Lamblin, Léon Muti, Abdenour Babouri, Virginie Filipe, Camille Barrault, Laurent Costes, Hervé Hagège, Soraya Merbah, Paul Carrier, Maryline Debette-Gratien, Jérémie Jacques, Guillaume Lassailly, Florent Artu, Valérie Canva, Sébastien Dharancy, Alexandre Louvet, Marianne Latournerie, Marc Bardou, Thomas Mouillot, Yannick Bacq, Didier Barbereau, Charlotte Nicolas, Caroline Chevalier, Isabelle Archambeaud, Sarah Habes, Nisserine Ben Amara, Danièle Botta-Fridlund, Eric Saillard, Marie-Josée Lafrance, Carole Cagnot, Alpha Diallo, Lena Wadouachi, Ventzi Petrov-Sanchez, Douae Ammour, Loubna Ayour, Jaouad Benhida, Fabrice Carrat, Frederic Chau, Céline Dorival, Audrey Gilibert, Isabelle Goderel, Warda Hadi, Clovis Luzivika Nzinga, Grégory Pannetier, François Pinot, Odile Stahl, François Téloulé, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), and Jonchère, Laurent
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Survival, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Decompensated cirrhosis, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Hepacivirus, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, complications, drug therapy, Gastroenterology, Antiviral Agents, Virological response, Internal medicine, Medicine, Humans, In patient, business.industry, Hepatitis C virus, Research, Liver Neoplasms, Hepatitis C, [SDV] Life Sciences [q-bio], Sustained virological response, Infectious Diseases, Direst-acting antiviral agents, therapeutic use, business, After treatment
Abstract: Background In HCV-infected patients with advanced liver disease, the direct antiviral agents-associated clinical benefits remain debated. We compared the clinical outcome of patients with a previous history of decompensated cirrhosis following treatment or not with direct antiviral agents from the French ANRS CO22 HEPATHER cohort. Methods We identified HCV patients who had experienced an episode of decompensated cirrhosis. Study outcomes were all-cause mortality, liver-related or non-liver-related deaths, hepatocellular carcinoma, liver transplantation. Secondary study outcomes were sustained virological response and its clinical benefits. Results 559 patients met the identification criteria, of which 483 received direct antiviral agents and 76 remained untreated after inclusion in the cohort. The median follow-up time was 39.7 (IQR: 22.7–51) months. After adjustment for multivariate analysis, exposure to direct antiviral agents was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.45, 95% CI 0.24–0.84, p = 0.01) and non-liver-related death (HR 0.26, 95% CI 0.08–0.82, p = 0.02), and was not associated with liver-related death, decrease in hepatocellular carcinoma and need for liver transplantation. The sustained virological response was 88%. According to adjusted multivariable analysis, sustained virological response achievement was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.29, 95% CI 0.15–0.54, p Conclusion Treatment with direct antiviral agents is associated with reduced risk for mortality. The sustained virological response was 88%. Thus, direct antiviral agents treatment should be considered for any patient with HCV-related decompensated cirrhosis. Trial registration: ClinicalTrials.gov registry number: NCT01953458.
Published: 2022
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23. Association between birth weight, preterm birth, and nonalcoholic fatty liver disease in a community‐based cohort

Author: Coralie Amadou, Oumarou Nabi, Lawrence Serfaty, Karine Lacombe, Jérôme Boursier, Philippe Mathurin, Céline Ribet, Victor de Ledinghen, Marie Zins, Marie‐Aline Charles, Université Paris Cité - UFR Médecine [Santé] (UPCité UFR Médecine), Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Sud Francilien, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Service d'Hépato-gastroentérologie [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Cohortes épidémiologiques en population (CONSTANCES), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), The Constances Cohort Study is supported and funded by the Caisse nationale d’assurance maladie. The Constances Cohort Study is an 'Infrastructure nationale en Biologie et Santé' and received a grant from the National Research Agency, ANR (ANR-11-INBS-0002), and from the French Ministry of Research. Constances is also partly funded by Merck Sharp and Dohme, AstraZeneca, and Lundbeck. The findings and conclusions in this study are those of the authors and do not necessarily represent the views of the sponsors., ANR-11-INBS-0002,CONSTANCES,La cohorte CONSTANCES - Infrastructure épidémiologique ouverte pour la recherche et la surveillance(2011), Demarquay, Sandrine, and Infrastructures - La cohorte CONSTANCES - Infrastructure épidémiologique ouverte pour la recherche et la surveillance - - CONSTANCES2011 - ANR-11-INBS-0002 - INBS - VALID
Subjects: Adult, Male, Hepatology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Infant, Newborn, Cohort Studies, [SDV] Life Sciences [q-bio], Non-alcoholic Fatty Liver Disease, Risk Factors, Humans, Birth Weight, Premature Birth, Female, Prospective Studies
Abstract: International audience; Background and AimsThe association between birth weight (BW) and metabolic outcomes has been described since the 1980s but NAFLD has been rarely studied. This study aimed to investigate the association between BW and NAFLD occurrence in adult subjects.Approach and ResultsThe study population consisted of participants from the French nationwide Constances cohort from 2012 to 2019. Participants with a history of chronic viral hepatitis or excessive alcohol consumption were excluded. Noninvasive diagnosis of NAFLD and fibrosis was performed using a combination of the Fatty Liver Index (FLI) and the Forns Index. The relationship between BW and NAFLD was analyzed with a sex-stratified logistic regression model adjusted for sociodemographic parameters, lifestyle, and birth term, whereas liver fibrosis was analyzed with a sex-stratified linear regression model. In total, 55,034 individuals with reliable BW were included (43% men, mean age: 38 years). NAFLD (FLI ≥ 60) was present in 5530 individuals (10%). Multivariate logistic regression showed a significant U-shaped relationship between BW and NAFLD, with no significant interaction with sex. A significant and slightly decreasing association was found between BW and Forns Index (β = −0.05; p = 0.04). Premature birth (OR, 1.23; 95% CI, 1.03–1.48 for birth between 33 and 37 weeks versus ≥ 37 weeks) was associated with NAFLD, with a significant direct effect of premature birth, and without an indirect effect of low BW in mediation analysis. Forns Index was not significantly higher in participants with preterm birth compared to full-term birth.ConclusionsThis large prospective adult-based cohort confirms the relationship between BW and NAFLD occurrence.
Published: 2022
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24. Non-invasive diagnosis and follow-up of chronic infection with Hepatitis C Virus

Author: Stéphane Chevaliez, Sarah Shili-Masmoudi, Lucile Moga, Isaac Ruiz, Nathalie Ganne-Carrié, Albert Tran, M. Bourlière, Christophe Bureau, Victor de Lédinghen, Alain Luciani, Hôpital l'Archet, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Sorbonne Paris Nord, Hôpital Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), and Malbec, Odile
Subjects: Liver Cirrhosis, HBsAg, medicine.medical_specialty, Hepatitis C virus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Hepacivirus, medicine.disease_cause, Gastroenterology, Virus, Fibrosis, Internal medicine, medicine, Humans, Hepatology, business.industry, Liver Diseases, virus diseases, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, Hepatitis C, digestive system diseases, [SDV] Life Sciences [q-bio], Chronic infection, Liver, HBeAg, Hepatocellular carcinoma, Elasticity Imaging Techniques, Portal hypertension, Persistent Infection, business, Follow-Up Studies
Abstract: Diagnosis of chronic hepatitis B virus (HBV) infection, initial staging of infection and monitoring of treated and untreated patients are mainly based on clinical, biological and imaging criteria allowing a complete non-invasive management for the majority of patients. Along to the conventional virological tools, rapid diagnostic tests and blotting paper tests for HBV DNA are validated alternatives. After diagnosis, the initial work-up should include HIV, HCV and HDV serologies, HBeAg status, and HBsAg and HBV DNA quantification. Assessment of severity (inflammation and fibrosis) is based on ALT serum levels and non-invasive evaluation of liver fibrosis by elastography or blood tests, which must be interpreted cautiously using specific cut-offs and taking into account ALT levels. Taken together, these parameters allow disease classification and treatment decision. Decision of hepatocellular carcinoma screening by ultra-sound every six months may be difficult in non-cirrhotic patients and the use of risk-scores such as PAGE-B is encouraged. Chronic HBV infection often has a dynamic and often unpredictable profile and regular monitoring is mandatory. In untreated patients, regular (3-12 months) follow-up should include ALT and HBV DNA serum levels. Periodical HBsAg quantification and non-invasive evaluation of liver fibrosis may refine disease outcome and prognosis. In treated patients, checking efficacy is mainly based on HBV DNA negativity. In patients with advanced fibrosis, evolution of liver stiffness can be useful for portal hypertension evaluation, but its improvement should not be considered to stop hepatocellular carcinoma screening. Finally, new parameters (HBV RNA, HBcrAg) are promising but their use is still restricted for research.
Published: 2022
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25. Common genetic variation in alcohol-related hepatocellular carcinoma: a case-control genome-wide association study

Author: Eric Trépo, Stefano Caruso, Jie Yang, Sandrine Imbeaud, Gabrielle Couchy, Quentin Bayard, Eric Letouzé, Nathalie Ganne-Carrié, Christophe Moreno, Abderrahim Oussalah, Cyrille Féray, Jean Frédéric Blanc, Bruno Clément, Patrick Hillon, Jérôme Boursier, Valérie Paradis, Julien Calderaro, Viviane Gnemmi, Jean-Charles Nault, Jean-Louis Guéant, Jacques Devière, Isabelle Archambeaud, Carole Vitellius, Bruno Turlin, Jean-Pierre Bronowicki, Thierry Gustot, Angela Sutton, Marianne Ziol, Pierre Nahon, Jessica Zucman-Rossi, Clément Meiller, Qian Cao, Théo Z. Hirsch, Sandra Rebouissou, Delphine Degré, Lukas Otero Sanchez, Nicolas Rosewick, Eric Quertinmont, Mireille Desille-Dugast, Muriel François-Vié, Cécile Moins, Emmanuelle Leteurtre, Guillaume Lassailly, Massih Ningarhari, Emmanuel Boleslawski, Vanessa Cottet, Université libre de Bruxelles (ULB), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), People's Hospital of Peking University (PKUPH), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Hôpital Paul Brousse, CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHU Pontchaillou [Rennes], Centre de Ressources Biologiques Santé (CRB Santé), Université de Rennes (UR)-CHU Pontchaillou [Rennes]-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hôpital Beaujon [AP-HP], Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Henri Mondor, Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 (CANTHER), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Lille, Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Hôtel-Dieu de Nantes, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle (LVTS (UMR_S_1148 / U1148)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Hôpitaux Universitaires Paris Seine-Saint-Denis [Sevran] (HUP2SD), Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), BB-0033-00027, H2020 Marie Skłodowska-Curie Actions, MSCA, University Hospitals, UH: NCT03311152, Bpifrance, Agence Nationale de la Recherche, ANR: ANR-11-LABX-0021, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale, Inserm, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, AP-HP, Ligue Contre le Cancer, Fondation de France, Institut National Du Cancer, INCa, Université Libre de Bruxelles, Conseil régional de Bourgogne-Franche-Comté, Korean Association for the Study of the Liver, KASL, GENTHEP Consortium: Clément Meiller, Qian Cao, Théo Z Hirsch, Sandra Rebouissou, Delphine Degré, Lukas Otero Sanchez, Nicolas Rosewick, Eric Quertinmont, Mireille Desille-Dugast, Muriel François-Vié, Cécile Moins, Emmanuelle Leteurtre, Guillaume Lassailly, Massih Ningarhari, Emmanuel Boleslawski, Vanessa Cottet, ANR-11-LABX-0021,Lipstic,Lipoprotéines et santé : prévention et traitement des maladies inflammatoires non vasculaires et du cancer(2011), École pratique des hautes études (EPHE), Jonchère, Laurent, Laboratoires d'excellence - Lipoprotéines et santé : prévention et traitement des maladies inflammatoires non vasculaires et du cancer - - Lipstic2011 - ANR-11-LABX-0021 - LABX - VALID, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CHU Pontchaillou [Rennes]-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC), Faculté de Médecine [Bruxelles] [ULB], Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)], Biochimie – Biologie moléculaire et Nutrition [CHRU Nancy], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale [INSERM], Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] [CHB], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] [BaRITOn], Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] [LNC], Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand [CHU Dijon], Centre Hospitalier Universitaire d'Angers [CHU Angers], Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques [HIFIH], Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12], Institut Mondor de Recherche Biomédicale [IMRB], Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER], Université Sorbonne Paris Nord, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy [CHRU Nancy], Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux [NGERE], Nutrition, Métabolismes et Cancer [NuMeCan], Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] [HEGP], Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 [ONCO-THAI], and Equipe EPICAD (LNC - U1231)
Subjects: Adult, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Genotype, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Polymorphism, Single Nucleotide, Young Adult, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Wnt3A Protein, Humans, Genetic Predisposition to Disease, Aged, Aged, 80 and over, Liver Neoplasms, Genetic Variation, Middle Aged, Wnt Proteins, [SDV] Life Sciences [q-bio], Oncology, Case-Control Studies, Phospholipases A2, Calcium-Independent, Female, Alcohol-Related Disorders, Acyltransferases, Genome-Wide Association Study
Abstract: International audience; Background: Hepatocellular carcinoma is a frequent consequence of alcohol-related liver disease, with variable incidence among heavy drinkers. We did a genome-wide association study (GWAS) to identify common genetic variants for alcohol-related hepatocellular carcinoma. Methods: We conducted a two-stage case-control GWAS in a discovery cohort of 2107 unrelated European patients with alcohol-related liver disease aged 20–92 years recruited between Oct 22, 1993, and March 12, 2017. Cases were patients with alcohol-related hepatocellular carcinoma diagnosed by imaging or histology. Controls were patients with alcohol-related liver disease without hepatocellular carcinoma. We used an additive logistic regression model adjusted for the first ten principal components to assess genetic variants associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma. We did another analysis with adjustment for age, sex, and liver fibrosis. New candidate associations (pandlt;1 × 10−6) and variants previously associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma were evaluated in a validation cohort of 1933 patients with alcohol-related liver disease aged 29–92 years recruited between July 21, 1995, and May 2, 2019. We did a meta-analysis of the two case–control cohorts. Findings: The discovery cohort included 775 cases and 1332 controls. Of 7 962 325 variants assessed, we identified WNT3A-WNT9A (rs708113; p=1·11 × 10−8) and found support for previously reported regions associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma risk at TM6SF2 (rs58542926; p=6·02 × 10−10), PNPLA3 (rs738409; p=9·29 × 10−7), and HSD17B13 (rs72613567; p=2·49 × 10−4). The validation cohort included 874 cases and 1059 controls and three variants were replicated: WNT3A-WNT9A (rs708113; p=1·17 × 10−3), TM6SF2 (rs58542926; p=4·06 × 10−5), and PNPLA3 (rs738409; p=1·17 × 10−4). All three variants reached GWAS significance in the meta-analysis: WNT3A-WNT9A (odds ratio 0·73, 95% CI 0·66–0·81; p=3·93 × 10−10), TM6SF2 (1·77, 1·52–2·07; p=3·84×10−13), PNPLA3 (1·34, 1·22–1·47; p=7·30 × 10−10). Adjustment for clinical covariates yielded similar results. We observed an additive effect of at-risk alleles on alcohol-related hepatocellular carcinoma. WNT3A-WNT9A rs708113 was not associated with liver fibrosis. Interpretation: WNT3A-WNT9A is a susceptibility locus for alcohol-related hepatocellular carcinoma, suggesting an early role of the Wnt–β-catenin pathway in alcohol-related hepatocellular carcinoma carcinogenesis.
Published: 2022
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26. Non-invasive diagnosis and follow-up of non-alcoholic fatty liver disease

Author: Sarra Smatti, Victor de Lédinghen, Bertrand Cariou, Maeva Guillaume, Charlotte Bouzbib, M. Bourlière, Nathalie Ganne-Carrié, Christophe Bureau, Raluca Pais, Adrien Lannes, Jérôme Boursier, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Clinique Pasteur [Toulouse], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Guillaume-et-René-Laennec [Saint-Herblain], Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), École pratique des hautes études (EPHE), and Malbec, Odile
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Disease, Asymptomatic, digestive system, Liver disease, Non-alcoholic Fatty Liver Disease, Internal medicine, Diabetes mellitus, medicine, Humans, education, education.field_of_study, Hepatology, medicine.diagnostic_test, business.industry, Fatty liver, Gastroenterology, nutritional and metabolic diseases, medicine.disease, digestive system diseases, [SDV] Life Sciences [q-bio], Liver, Liver biopsy, Elasticity Imaging Techniques, Metabolic syndrome, medicine.symptom, business, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; NAFLD is a frequent disease that affects 25% of the worldwide population. There is no specific diagnostic test for NAFLD, and the diagnosis mainly relies on the elimination of the other causes of chronic liver diseases with liver biopsy kept for unsure diagnoses. Non-invasive tests are now available to assess NAFLD severity and therefore to help physicians decide on the patient management and follow-up. These non-invasive tests can also be used to define pathways that organize referrals from primary care and diabetology clinics to the liver specialist, with the ambition to improve the screening of asymptomatic patients with NAFLD and advanced liver disease. NAFLD being the liver expression of the metabolic syndrome, physicians need also take care to screen for diabetes and to evaluate the cardiovascular risk in those patients. These recommendations from the French Association for the Study of the Liver (AFEF) aim at providing guidance on the following questions: how to diagnose NAFLD; how non-invasive tests should be used to assess NAFLD severity; how to follow patients with NAFLD; when to perform liver biopsy in NAFLD; and how to decide referral to the liver specialist for a patient with NAFLD.
Published: 2022
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27. Prediction of hepatocellular carcinoma in Hepatitis C patients with advanced fibrosis after sustained virologic response

Author: Azzi, Jessica, Dorival, Céline, Cagnot, Carole, Fontaine, Hélène, Lusivika-Nzinga, Clovis, Leroy, Vincent, de Ledinghen, Victor, Tran, Albert, Zoulim, Fabien, Alric, Laurent, Gournay, Jérôme, Bronowicki, Jean-Pierre, Decaens, Thomas, Riachi, Ghassan, Mikhail, Nabiel, Soliman, Reham, Shiha, Gamal, Pol, Stanislas, Carrat, Fabrice, Ganne-Carrié, Nathalie, Hepather, Anrs-Afef, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Assiut University, Port Said University, Mansoura University [Egypt], Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpitaux Universitaires Paris Seine-Saint-Denis (GHU 93), INSERM U1053, Université Bordeaux, Bordeaux, France., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Purpan (CHU Purpan), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Inserm U1254, Centre Hospitalier Universitaire de Nancy (CHU Nancy), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Egyptian Liver Research Institute and Hospital (ELRIAH), Mansoura, Egypt, Biostatistics and Cancer Epidemiology Department, South Egypt Cancer Institute, Assiut University, Assuit, Egypt., Tropical Medicine Department, Faculty of Medicine, Port Said University, Port Said, Egypt., Hepatology and Gastroenterology Unit, Internal Medicine Department, Faculty of Medicine, Mansoura University, Mansoura, Egypt., Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), École pratique des hautes études (EPHE), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPC)
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Hepatology, Sustained Virologic Response, Hepatitis C virus, Liver Neoplasms, Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Hepacivirus, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, Antiviral Agents, Hepatitis C, Risk factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Risk score, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, HCC, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Background & Aims: Prediction of hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in patients with chronic hepatitis C (HCV) who achieved a sustained virological response (SVR) after direct acting antivirals (DAAs) remains challenging.Methods: Among HCC-free HCV patients with advanced fibrosis enrolled in the ANRS CO22 HEPATHER cohort who achieved SVR 12 weeks after treatment with DAAs, HCC predictive models were developed using Cox multivariable regression. The derived score was externally validated in a large Egyptian cohort. Our main outcome was the HCC-free survival.Results: During follow-up (median 3.05 years), 153 out of 3531 patients developed a HCC. Main variables associated with HCC occurrence were: male gender, HCV genotype 3, esophageal varices, albumin < 40 g/L, total bilirubin >11 µmol/L and hypercholesterolemia before DAA initiation, together with age > 58 years, FIB-4 index ≥3.25 evaluated at SVR. A score was established allowing the stratification of patients by high (score ≥ 12/22), intermediate (7 ≤ score
Published: 2022
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28. Non-invasive diagnosis and follow-up of primary biliary cholangitis

Author: Pascal Potier, Marie Decraecker, Florence Tanné, Christophe Bureau, Victor de Lédinghen, Nathalie Ganne-Carrié, Bertrand Hanslik, M. Bourlière, Alexandra Heurgue, Christophe Corpechot, CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de référence des Maladies Vasculaires du Foie [Paris] (FILFOIE), Centre de référence pour les maladies biliaires inflammatoires et les hépatites auto-immunes [Paris] (CRMBIHAI), Health Care Provider of the European Reference Network onRare Liver Disorders (ERN-Liver), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Hôpital de la Cavale Blanche - CHRU Brest (CHU - BREST ), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Montpellierain des maladies du foie et de l’appareil digestif [Montpellier] (C2MFAD), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Dupuis, Christine, and École pratique des hautes études (EPHE)
Subjects: medicine.medical_specialty, Cirrhosis, Hepatology, business.industry, Cholangitis, Liver Cirrhosis, Biliary, [SDV]Life Sciences [q-bio], Non invasive, Gastroenterology, Autoantibody, medicine.disease, Chronic inflammatory disease, PBC, [SDV] Life Sciences [q-bio], Bile Ducts, Intrahepatic, Liver stiffness, Internal medicine, Chronic cholestasis, medicine, Portal hypertension, Humans, business, Histological examination, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Non-invasive diagnosis and follow-up of primary biliary cholangitis Summary Primary biliary cholangitis (PBC) is a chronic inflammatory disease of the intrahepatic bile ducts [1]. It is characterised biologically by chronic cholestasis associated with the presence of specific autoantibodies, and histologically by lesions of nonsuppurative destructive cholangitis. If left untreated it can progress to cirrhosis, portal hypertension and liver failure. Diagnosis, staging and follow-up are largely based on non-or minimally-invasive assessment (blood tests, ultrasound, liver stiffness measurement). Histological examination of the liver and upper gastrointestinal endoscopy are sometimes necessary, but their indications remain limited. The purpose of this chapter is to provide the clinicians with what should be known about the non-invasive assessment of PBC and to provide specific recommendations for clinical practice.
Published: 2022
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29. French clinical practice guidelines for the diagnosis and management of lung disease with alpha 1-antitrypsin deficiency

Author: Mornex, J.-F., Balduyck, M., Bouchecareilh, M., Cuvelier, A., Epaud, R., Kerjouan, M., Le Rouzic, O., Pison, C., Plantier, L., Pujazon, M.-C., Reynaud-Gaubert, M., Toutain, A., Trumbic, B., Willemin, M.-C., Zysman, M., Brun, O., Campana, M., Chabot, F., Chamouard, V., Dechomet, M., Fauve, J., Girerd, B., Gnakamene, C., Lefrançois, S., Lombard, J.-N., Maitre, B., Maynié-François, C., Moerman, A., Payancé, A., Reix, P., Revel, D., Revel, M.-P., Schuers, M., Terrioux, P., Theron, D., Willersinn, F., Cottin, V., Mal, H., Infections Virales et Pathologie Comparée - UMR 754 (IVPC), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Référence des Maladies Pulmonaires Rares [Hôpital Louis Pradel - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 (RADEME), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), CHU Lille, Université de Lille, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe de Recherche sur le Handicap Ventilatoire et Neurologique (GRHVN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de pneumologie, oncologie thoracique et soins intensifs respiratoires [Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Intercommunal de Créteil (CHIC), Hôpital Pontchaillou, Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de Pneumologie et Immuno-Allergologie [CHU LIlle], Pole Cardio-vasculaire et pulmonaire [CHU Lille], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Université Grenoble Alpes (UGA), Service de pneumologie [Grenoble], Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Centre d’Etude des Pathologies Respiratoires (CEPR), UMR 1100 (CEPR), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Nord [CHU - APHM], Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Aix Marseille Université (AMU), Imagerie et cerveau (iBrain - Inserm U1253 - UNIV Tours ), Service de génétique [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-Hôpital Bretonneau, Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), CIC Bordeaux, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Centre de recherche Cardio-Thoracique de Bordeaux [Bordeaux] (CRCTB), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de pneumologie et d'allergologie respiratoire [Perpignan], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique (DCAC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service de Pneumologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS), Hypertension pulmonaire : physiopathologie et innovation thérapeutique (HPPIT), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Centre de Référence de l’Hypertension Pulmonaire Sévère [CHU Le Kremlin Bicêtre], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Faculté de Médecine Paris-Saclay, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre)-Université Paris-Saclay, Centre Hospitalier Montélimar, CH Montélimar, Physiopathologie des Maladies du Système Nerveux Central, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Lyon, Hôpital Jeanne de Flandre [Lille], Centre de référence des Maladies Vasculaires du Foie [Paris] (FILFOIE), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Femme Mère Enfant [CHU - HCL] (HFME), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé (LIMICS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Sorbonne Paris Nord, Physiopathologie et Epidémiologie des Maladies Respiratoires (PHERE (UMR_S_1152 / U1152)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), and AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
Subjects: Déficit en alpha 1-antitrypsine, Cirrhose du foie, Emphysème pulmonaire, Bronchopneumopathie chronique obstructive, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.MHEP.PSR]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pulmonology and respiratory tract
Abstract: International audience; Contexte: Le déficit en alpha 1-antitrypsine (DAAT) est une maladie génétique autosomique récessive associée à l’état homozygote du variant Z du gène SERPINA1. Les manifestations cliniques sont un déficit sévère en alpha 1-antitrypsine, un emphysème pulmonaire et une fibrose hépatique.Méthodes: Des recommandations de prise en charge du DAAT ont été élaborées à l’initiative du centre coordonnateur de référence des maladies pulmonaires rares, sous l’égide de la Société de pneumologie de langue française, par des groupes de coordination, rédaction, et lecture, impliquant des pneumologues de divers modes d’exercice, biologistes, hépatologue, pharmacien hospitalier, conseiller en génétique, radiologues, médecins généralistes, cadre de santé, et associations de patients. La méthode d’élaboration des « Recommandations pour la pratique clinique » de la Haute autorité de santé a été suivie, incluant un vote en ligne selonune échelle Likert.Résultats: Après une analyse bibliographique, 20 recommandations ont été proposées par les groupes de travail, portant sur tous les aspects de la maladie : diagnostic biologique, bilan initial, conseils d’hygiène de vie, information, indications et modalités du traitement substitutif, dépistage.Conclusion: Ces recommandations fondées sur les preuves sont destinées à guider le diagnostic et la prise en charge pratique du DAAT.
Published: 2022
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30. Non-invasive diagnosis and follow-up of benign liver tumours

Author: Thong Dao, Victor de Lédinghen, M. Bourlière, Jean-Frédéric Blanc, Julien Calderaro, Jean-Charles Nault, Arnaud Hocquelet, Boris Guiu, Ephrem Salamé, Christophe Bureau, Lucile Moga, Nathalie Ganne-Carrié, Valérie Paradis, Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Beaujon [AP-HP], Hôpital Henri Mondor, CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), CHU Montpellier, Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire Vaudois [Lausanne] (CHUV), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), École pratique des hautes études (EPHE), and Malbec, Odile
Subjects: medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Biliary Cyst, [SDV]Life Sciences [q-bio], Bile Duct Diseases, Gallbladder Diseases, Adenoma, Liver Cell, Diagnosis, Differential, medicine, Humans, Hepatology, medicine.diagnostic_test, Cysts, business.industry, Liver Diseases, Liver Neoplasms, Non invasive, Gastroenterology, Focal nodular hyperplasia, Histology, Hepatocellular adenoma, medicine.disease, digestive system diseases, Benign liver tumours, [SDV] Life Sciences [q-bio], Liver, Focal Nodular Hyperplasia, Liver biopsy, Radiology, Ultrasonography, Hemangioma, business, Follow-Up Studies
Abstract: International audience; Hepatocellular benign liver tumours are mainly developed on normal liver and include hepatic hemangioma, focal nodular hyperplasia and hepatocellular adenoma from the most frequent to the less frequent. The diagnosis of hepatic hemangioma and of simple hepatic biliary cysts can be performed using non-invasive criteria using liver ultrasonography or contrast enhanced MRI. Most of the time the diagnosis of focal nodular hyperplasia can be achieved using contrast-enhanced ultrasonography or contrast enhanced MRI with an additional value of hepatobiliary contrast-agent in this setting. Rarely, if a doubt persists, a tumour and non-tumour liver biopsy can be required in order to establish the diagnosis. As hepatic hemangioma, simple hepatic biliary cysts and focal nodular hyperplasia are not associated with complications, they don't require any treatments or follow-up. Hepatocellular adenomas are mainly diagnosed at histology on surgical samples or liver biopsy even if some radiological features are highly suggestive of several subtypes of hepatocellular adenomas. Finally, the management of hepatocellular adenomas should be guided according to the tumour size, gender but also to the molecular subtypes.
Published: 2022
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31. Biological and mechanical characterization of a decellularized porcine esophageal biological matrix

Author: Lesieur, Romane, Monfoulet, Cécile, Roques, Samantha, Renard, Martine, Drochon, Agnès, Collet, Denis, Bordenave, Laurence, Durand, Marlène, Drochon, Agnes, CIC-IT Bordeaux, Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), INSERM, U1026, Tissue Bioengn, Univ Bordeaux, Université de Bordeaux (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Mécanique et d'Ingénierie (I2M), Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Arts et Métiers Sciences et Technologies, HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM), Service de chirurgie viscérale et digestive (CHU de Bordeaux), and CHU Bordeaux [Bordeaux]
Subjects: [SDV.IB.BIO] Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Biomaterials, [SDV.IB.BIO]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Biomaterials
Abstract: International audience
Published: 2022

32. Teignes de l’enfant : algorithme de prise en charge après l’arrêt de la commercialisation de la griséofulvine en France

Author: Nicolas Dupin, M. Caseris, J. Toubiana, Sophie Brun, Bernard Guillot, A. Maruani, Olivier Chosidow, J. Menotti, Marie Beylot-Barry, S. Barbarot, L. Chouchana, J.-P. Gangneux, Françoise Botterel, C. Moreau, Physiopathologie des Adaptations Nutritionnelles (PhAN), Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Tours (UT), Université de Nantes (UN), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), MethodS in Patients-centered outcomes and HEalth ResEarch (SPHERE), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Hôpital Robert Debré, Environnement, Ville, Société (EVS), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Université Jean Moulin - Lyon 3 (UJML), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet - Saint-Étienne (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hospices Civils de Lyon (HCL), HCL Groupement Hospitalier Nord [Lyon], Université Paris Cité (UPCité), CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-André, Université de Bordeaux (UB), Service de Dermatologie [CHU Cochin], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP], Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Hôpital Henri Mondor, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Environnement Ville Société (EVS), École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-École des Mines de Saint-Étienne (Mines Saint-Étienne MSE), and Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-École Nationale des Travaux Publics de l'État (ENTPE)-École nationale supérieure d'architecture de Lyon (ENSAL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: International audience
Published: 2021
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33. Targeting Epigenetic Modifiers Can Reduce the Clonogenic Capacities of Sézary Cells

Author: Chebly, Alain, Prochazkova-Carlotti, Martina, Idrissi, Yamina, Bresson-Bepoldin, Laurence, Poglio, Sandrine, Farra, Chantal, Beylot-Barry, Marie, Merlio, Jean-Philippe, Tomb, Roland, Chevret, Edith, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Saint Joseph University [Beirut, Lebanon] (SJU), Hôpital Hôtel Dieu de France, and CHU Bordeaux [Bordeaux]
Subjects: Histone deacetylase inhibitor, Oncology, 5-azacytidine, vorinostat, hemic and lymphatic diseases, TERT, [SDV]Life Sciences [q-bio], Sezary syndrome (SS), romidepsin, Brief Research Report, cutaneous T-cell lymphomas (CTCL), DNA methyltransferase inhibitor
Abstract: International audience; Seźary syndrome (SS) is an aggressive leukemic variant of cutaneous T-cell lymphomas (CTCL) in which the human Telomerase Reverse Transcriptase (hTERT) gene is reexpressed. Current available treatments do not provide long-term response. We previously reported that Histone deacetylase inhibitors (HDACi, romidespin and vorinostat) and a DNA methyltransferase inhibitor (DNMTi, 5-azacytidine) can reduce hTERT expression without altering the methylation level of hTERT promoter. Romidepsin and vorinostat are approved for CTCL treatment, while 5-azacytidine is approved for the treatment of several hematological disorders, but not for CTCL. Here, using the soft agar assay, we analyzed the functional effect of the aforementioned epidrugs on the clonogenic capacities of Seźary cells. Our data revealed that, besides hTERT downregulation, epidrugs' pressure reduced the proliferative and the tumor formation capacities in Seźary cells in vitro.
Published: 2021
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34. L‐DOPA and 5‐HTP modulation of air‐stepping in newborn rats

Author: Grégory Barrière, Zied Oueghlani, Gilles Courtand, Laurent Juvin, Vianney Salvi, Wei Yuan, Philippe De Deurwaerdère, Marie Boulain, Christophe Halgand, Inès Khsime, Didier Morin, Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d'Aquitaine [Bordeaux] (INCIA), and Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: medicine.medical_specialty, Serotonin, Physiology, Dopamine, [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, 5-Hydroxytryptophan, Levodopa, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Internal medicine, Neuromodulation, medicine, Animals, Neurochemistry, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Neonatal rat, Chemistry, 3. Good health, Rats, Lumbar Spinal Cord, medicine.anatomical_structure, Endocrinology, Monoamine neurotransmitter, Animals, Newborn, Catecholamine, 030217 neurology & neurosurgery, medicine.drug
Abstract: Key points In newborn rats, L-DOPA increases the occurrence of air-stepping activity without affecting movement characteristics. L-DOPA administration increases the spinal content of dopamine in a dose-dependent manner. Injection of 5-HTP increases the spinal serotonin content but does not trigger air-stepping. 5-HTP counteracts the pro-locomotor action of L-DOPA. Less dopamine and serotonin are synthesized when L-DOPA and 5-HTP are administered as a cocktail. Abstract The catecholamine precursor, L-3,4-dihydroxyphenylalanine (L-DOPA), is a well-established pharmacological agent for promoting locomotor action in vertebrates, including triggering air-stepping activities in the neonatal rat. Serotonin is also a well-known neuromodulator of the rodent spinal locomotor networks. Here, using kinematic analysis, we compared locomotor-related activities expressed by newborn rats in response to varying doses of L-DOPA and the serotonin precursor 5-hydroxytryptophan (5-HTP) administered separately or in combination. L-DOPA alone triggered episodes of air-stepping in a dose-dependent manner (25-100 mg/kg), notably determining the duration of locomotor episodes, but without affecting step cycle frequency or amplitude. In contrast, 5-HTP (25-150 mg/kg) was ineffective in instigating air-stepping, but altered episode durations of L-DOPA-induced air-stepping, and decreased locomotor cycle frequency. High performance liquid chromatography revealed that L-DOPA, which was undetectable in control conditions, accumulated in a dose-dependent manner in the lumbar spinal cord 30 min after its administration. This was paralleled by an increase in dopamine levels, whereas the spinal content of noradrenaline and serotonin remained unaffected. In the same way, the spinal levels of serotonin increased in parallel with the dose of 5-HTP without affecting the levels of dopamine and noradrenaline. When both precursors are administrated, they counteract each other for the production of serotonin and dopamine. Our data thus indicate for the first time that both L-DOPA and 5-HTP exert opposing neuromodulatory actions on air-stepping behaviour in the developing rat, and we speculate that competition for the production of dopamine and serotonin occurs when they are administered as a cocktail.
Published: 2021
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35. Synergistic interaction between sensory inputs and propriospinal signalling underlying quadrupedal locomotion

Author: Mélissa Sourioux, Didier Morin, Marie Boulain, Muriel Thoby-Brisson, Inès Khsime, Laurent Juvin, John Simmers, Grégory Barrière, Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d'Aquitaine [Bordeaux] (INCIA), and Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: animal structures, Physiology, [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, Sensory system, Stimulation, Hindlimb, Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, Animals, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Motor Neurons, 0303 health sciences, Central pattern generator, Spinal cord, Rats, Lumbar Spinal Cord, medicine.anatomical_structure, Animals, Newborn, Spinal Cord, Brainstem, Forelimb, Neuroscience, 030217 neurology & neurosurgery, Locomotion
Abstract: KEY POINTS Stimulation of hindlimb afferent fibres can both stabilize and increase the activity of fore- and hindlimb motoneurons during fictive locomotion. The increase in motoneuron activity is at least partially due to the production of doublets of action potentials in a subpopulation of motoneurons. These results were obtained using an in vitro brainstem/spinal cord preparation of neonatal rat. ABSTRACT Quadrupedal locomotion relies on a dynamic coordination between central pattern generators (CPGs) located in the cervical and lumbar spinal cord, and controlling the fore- and hindlimbs, respectively. It is assumed that this CPG interaction is achieved through separate closed-loop processes involving propriospinal and sensory pathways. However, the functional consequences of a concomitant involvement of these different influences on the degree of coordination between the fore- and hindlimb CPGs is still largely unknown. Using an in vitro brainstem/spinal cord preparation of neonatal rat, we found that rhythmic, bilaterally alternating stimulation of hindlimb sensory input pathways elicited coordinated hindlimb and forelimb CPG activity. During pharmacologically induced fictive locomotion, lumbar dorsal root (DR) stimulation entrained and stabilized an ongoing cervico-lumbar locomotor-like rhythm and increased the amplitude of both lumbar and cervical ventral root bursting. The increase in cervical burst amplitudes was correlated with the occurrence of doublet action potential firing in a subpopulation of motoneurons, enabling the latter to transition between low and high frequency discharge according to the intensity of DR stimulation. Moreover, our data revealed that propriospinal and sensory pathways act synergistically to strengthen cervico-lumbar interactions. Indeed, split-bath experiments showed that fully coordinated cervico-lumbar fictive locomotion was induced by combining pharmacological stimulation of either the lumbar or cervical CPGs with lumbar DR stimulation. This study thus highlights the powerful interactions between sensory and propriospinal pathways which serve to ensure the coupling of the fore- and hindlimb CPGs for effective quadrupedal locomotion.
Published: 2021
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36. E2A Modulates Stemness, Metastasis, and Therapeutic Resistance of Breast Cancer

Author: Francisco García-del Portillo, Amparo Cano, Pierre Dubus, Alberto Vázquez-Naharro, Celia López-Menéndez, Marisa M. Faraldo, Vanesa Santos, Patricia G. Santamaría, Gema Moreno-Bueno, Ángel Martínez-Ramírez, Instituto de Investigaciones Biomedicas, Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Spanish National Cancer Research Center (CNIO), Biologie Cellulaire et Cancer, Institut Curie [Paris]-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Ministerio de Economía y Competitividad (España), Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España), Agencia Estatal de Investigación (España), Instituto de Salud Carlos III, Asociación Española Contra el Cáncer, Association for International Cancer Research, Worldwide Cancer Research, Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), and Gestionnaire, HAL Sorbonne Université 5
Subjects: Male, Cancer Research, Carcinogenesis, Triple Negative Breast Neoplasms, Tumor initiation, Piperazines, Metastasis, Mice, 0302 clinical medicine, hemic and lymphatic diseases, Basic Helix-Loop-Helix Transcription Factors, Transgenes, Neoplasm Metastasis, Aged, 80 and over, 0303 health sciences, Genome, Cell Differentiation, hemic and immune systems, Middle Aged, Primary tumor, Metastatic breast cancer, 3. Good health, Cell Transformation, Neoplastic, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Neoplastic Stem Cells, Female, Adult, therapeutic resistance, Epithelial-Mesenchymal Transition, Genotype, Snail1, Breast Neoplasms, Mammary Neoplasms, Animal, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, tumor-initiating cells, Article, E2A, 03 medical and health sciences, Breast cancer, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Cancer stem cell, Cell Line, Tumor, medicine, Animals, Humans, metastasis, Computer Simulation, Aged, 030304 developmental biology, business.industry, Cancer, medicine.disease, Mice, Inbred C57BL, Drug Resistance, Neoplasm, Tumor progression, Cancer research, Phthalazines, Snail Family Transcription Factors, business, Gene Deletion
Abstract: © 2021 The Authors., Cancer stem cells (CSC) are considered responsible for tumor initiation, therapeutic resistance, and metastasis. A comprehensive knowledge of the mechanisms governing the acquisition and maintenance of cancer stemness is crucial for the development of new therapeutic approaches in oncology. E2A basic helix–loop–helix (bHLH) transcription factors are associated with epithelial–mesenchymal transition (EMT) and tumor progression, but knowledge of their functional contributions to cancer biology is still limited. Using a combination of in vivo and in vitro analyses in a novel PyMT-E2A conditional knockout mouse model and derived primary tumor cell lines, we report here an essential role of E2A in stemness, metastasis, and therapeutic resistance in breast cancer. Targeted deletion of E2A in the mammary gland impaired tumor-initiating ability and dedifferentiation potential and severely compromised metastatic competence of PyMT-driven mammary tumors. Mechanistic studies in PyMT-derived cell lines indicated that E2A actions are mediated by the upregulation of Snai1 transcription. Importantly, high E2A and SNAIL1 expression occurred in aggressive human basal-like breast carcinomas, highlighting the relevance of the E2A–Snail1 axis in metastatic breast cancer. In addition, E2A factors contributed to the maintenance of genomic integrity and resistance to PARP inhibitors in PyMT and human triple-negative breast cancer cells. Collectively, these results support the potential for E2A transcription factors as novel targets worthy of translational consideration in breast cancer., This work has been supported by grants from the Spanish Ministry of Economy and Innovation (SAF2013–44739-R, SAF2016–76504-R to A. Cano and F. Portillo), PID2019–111052RB-I00 to F. Portillo, PID2019–104644RB-I00 to G. Moreno-Bueno; the Spanish Institute of Health Carlos III (CIBERONC-CB16/12/00295 to A. Cano, G. Moreno-Bueno; all of them partly supported by FEDER funds); the AECC Scientific Foundation 2019 (PROYE19036MOR to G. Moreno-Bueno); the Association International for Cancer Research (AICR; 12–1057 to A. Cano, P.G. Santamaría); and Worldwide Cancer Research (16–0295 to A. Cano, F. Portillo, and P.G. Santamaría). A. Vázquez-Naharro was funded by a PhD contract from SAF2016–76504-R grant; V. Santos by AICR (12–1057) and SAF2016–76504-R grants; P.G. Santamaría by a research contract of the AECC Scientific Foundation, and from Worldwide Cancer Research (16–0295) and SAF2016–76504-R grants.
Published: 2021
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37. A novel 3D culture model recapitulates primary FL B cell features and promotes their survival

Author: Valérie Le Morvan, Pierre Nassoy, Patricia Legoix, Céline Pangault, Simon Latour, Pierre Soubeyran, Laurence Bresson-Bepoldin, Frédéric Mourcin, Kevin Alessandri, Elise Dessauge, Martina Prochazkova-Carlotti, Julien Saint-Vanne, Lea Broca-Brisson, Nelson Hélaine, Karin Tarte, Jean-Philippe Merlio, Sylvain Baulande, Laurent Deleurme, Isabelle Mahouche, Laetitia Andrique, Céline Monvoisin, Gaëlle Recher, Christelle Dussert, Claire Lamaison, Marine Seffals, Microenvironment, Cell Differentiation, Immunology and Cancer (MICMAC), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Etablissement français du sang [Rennes] (EFS Bretagne), University of Toronto, Laboratoire Photonique, Numérique et Nanosciences (LP2N), Université de Bordeaux (UB)-Institut d'Optique Graduate School (IOGS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology (ACTION), Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB), Université de Rennes (UR), Institut Curie [Paris], Plateforme de sequencage ICGEX, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UNICANCER, CHU Bordeaux [Bordeaux], This work was supported by INSERM, University of Bordeaux, Ligue Régionalecontre le Cancer (comités de Gironde, Charentes, Pyrénées, Landes), the FondationARC pour la Recherche sur le Cancer (Grant PGA1 RF20170205386), the InstitutNational du cancer (INCA AAP PNP-19-009), Emergence GSO Cancéropole, andSIRIC BRIO. S.L. is supported by Ligue Nationale contre le Cancer and C.L. is arecipient of a doctoral fellowship from the FHU CAMIn and LBB (Léa Broca-Brisson)of a master fellowship from CNRS GDR Imabio. J.S.V. is funded by the InfrastructureeCellFrance (ANR-11-INBS-005). The 3D capsules were obtained from the VoxCellOrganoïds Plateform, a service of the CNRS-INSERM and Bordeaux University -UMS TBMCore 3427. We thank Stéphanie Durand-Panteix for her technical supportwith transduction experiments. We thank Atika Zouine and Vincent Pitard fortechnical assistance at the Flow cytometry facility, CNRS UMS 3427, INSERM US005, Univ. Bordeaux, F-33000 Bordeaux, France. We acknowledge the BordeauxImaging Center, a service unit of the CNRS-INSERM and Bordeaux University,member of the national infrastructure France BioImaging supported by the FrenchResearch Agency (ANR-10-INBS-04). Cell sorting was performed at the Biosit FlowCytometry and Cell Sorting Facility CytomeTRI (UMS 6480 Biosit, Rennes, France).High-throughput sequencing has been performed by the ICGex NGS platform of theInstitut Curie supported by the grants ANR-10-EQPX-03 (Equipex) and ANR-10-INBS-09-08 (France Génomique Consortium) from the ANR, by the ITMO-CANCER,and by the SiRIC-Curie program (SiRIC Grant INCa-DGOS-4654)., The authors are indebted to the Centre de Ressources Biologiques (CRB)-Santé (BB-0033-00056) of Rennes hospital for the processing of biological samples., ANR-11-INBS-0005,ECELLFRANCE,Développement d'une Plateforme Nationale pour la médecine régénératrice(2011), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-10-EQPX-0003,ICGex,Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée(2010), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Plateforme de Séquençage ADN haut débit [Institut Curie] (NGS - ICGex), H2P2 - Histo Pathologie Hight Precision (H2P2), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université de Rennes 1 - Faculté de Médecine (UR1 Médecine), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER, Université de Rennes (UNIV-RENNES), Chard-Hutchinson, Xavier, Infrastructures - Développement d'une Plateforme Nationale pour la médecine régénératrice - - ECELLFRANCE2011 - ANR-11-INBS-0005 - INBS - VALID, Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée - - France-BioImaging2010 - ANR-10-INBS-0004 - INBS - VALID, and Equipements d'excellence - Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée - - ICGex2010 - ANR-10-EQPX-0003 - EQPX - VALID
Subjects: Stromal cell, Lymphoma, B-Cell, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH]Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], [SDV]Life Sciences [q-bio], Follicular lymphoma, neoplasms, lymphoma, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, doxorubicin, Extracellular matrix, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, alginates, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, follicular lymphoma, immune system diseases, hemic and lymphatic diseases, b-lymphocytes, medicine, Tumor Microenvironment, antineoplastic agents, Humans, cancer, Doxorubicin, Cell encapsulation, B cell, 030304 developmental biology, Cell Proliferation, 0303 health sciences, Chemistry, Lymphoma, Non-Hodgkin, Hematology, medicine.disease, In vitro, Lymphoma, b-cell lymphomas, [SDV] Life Sciences [q-bio], medicine.anatomical_structure, 030220 oncology & carcinogenesis, Cancer research, bcl-2 protein, medicine.drug
Abstract: Non-Hodgkin B-cell lymphomas (B-NHL) mainly develop within lymph nodes as aggregates of tumor cells densely packed with their surrounding microenvironment, creating a tumor niche specific to each lymphoma subtypes. In vitro preclinical models mimicking biomechanical forces, cellular microenvironment, and 3D organization of B-cell lymphomas remain scarce, while all these parameters are key determinants of lymphomagenesis and drug resistance. Using a microfluidic method based on cell encapsulation inside permeable, elastic, and hollow alginate microspheres, we developed a new tunable 3D model incorporating lymphoma B cells, extracellular matrix (ECM), and/or tonsil stromal cells (TSC). Under 3D confinement, lymphoma B cells were able to form cohesive spheroids resulting from overexpression of ECM components. Moreover, lymphoma B cells and TSC dynamically formed self-organized 3D spheroids favoring tumor cell growth. 3D culture induced resistance to the classical chemotherapeutic agent doxorubicin, but not to the BCL2 inhibitor ABT-199, identifying this approach as a relevant in vitro model to assess the activity of therapeutic agents in B-NHL. RNA-sequence analysis highlighted the synergy of 3D, ECM, and TSC in upregulating similar pathways in malignant B cells in vitro than those overexpressed in primary lymphoma B cells in situ. Finally, our 3D model including ECM and TSC allowed long-term in vitro survival of primary follicular lymphoma B cells. In conclusion, we propose a new high-throughput 3D model mimicking lymphoma tumor niche and making it possible to study the dynamic relationship between lymphoma B cells and their microenvironment and to screen new anti-cancer drugs.
Published: 2021
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38. Allosteric inhibition of HER2 by Moesin-mimicking compounds targets HER2-positive cancers and brain metastases

Author: Anaïs Domingot, Yanis Saidi, Jean-Luc Lenormand, Saïd Taouji, Haniaa Bouzinba-Segard, Camille Faure, Rym Djerbi-Bouillie, Sandra Bernard, Floriane Carallis, Sandrine Bourdoulous, Romy Rothe-Walther, Eric Chevet, Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Inovarion, University Hospital Carl Gustav Carus [Dresden, Germany], Technische Universität Dresden = Dresden University of Technology (TU Dresden), Translational microbial Evolution and Engineering (TIMC-TrEE), Translational Innovation in Medicine and Complexity / Recherche Translationnelle et Innovation en Médecine et Complexité - UMR 5525 (TIMC ), VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP ), Université Grenoble Alpes (UGA), Chemistry, Oncogenesis, Stress and Signaling (COSS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Institut du Fer à Moulin, Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Groupe de Recherche sur L’Étude du Foie [Bordeaux], Université de Bordeaux Ségalen [Bordeaux 2], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Université de Rennes (UR)-CRLCC Eugène Marquis (CRLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), SFI20101201780, Association pour la Recherche contre le Cancer, GEFLUC2016, GEFLUC Association, Société de Transfert de Technologies, ANR-10-SATT-05-01, Ile de France Innov, and Faure, Camille
Subjects: ERM family, Cancer Research, Receptor, ErbB-2, [SDV]Life Sciences [q-bio], Apoptosis, Receptor tyrosine kinase, Mice, 0302 clinical medicine, Ezrin, Biomimetics, Radixin, Moesin, Tumor Cells, Cultured, skin and connective tissue diseases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 0303 health sciences, biology, Brain Neoplasms, Chemistry, Microfilament Proteins, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Gene Expression Regulation, Neoplastic, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, Female, Allosteric regulation, Mice, Nude, Breast Neoplasms, 03 medical and health sciences, Allosteric inhibition, Allosteric Regulation, In vivo, medicine, Animals, Humans, HER2-positive breast cancer, neoplasms, Cell Proliferation, 030304 developmental biology, Cancer, Brain metastases, Clopenthixol, medicine.disease, Xenograft Model Antitumor Assays, biology.protein, Cancer research, Dopamine Antagonists, Brain metastasis
Abstract: Therapies targeting the tyrosine kinase receptor HER2 have significantly improved survival of patients with HER2+ cancer. However, both de novo and acquired resistance remain a challenge, particularly in the brain metastatic setting. Here we report that, unlike other HER tyrosine kinase receptors, HER2 possesses a binding motif in its cytosolic juxtamembrane region that allows interaction with members of the Ezrin/Radixin/Moesin (ERM) family. Under physiologic conditions, this interaction controls the localization of HER2 in ERM-enriched domains and stabilizes HER2 in a catalytically repressed state. In HER2+ breast cancers, low expression of Moesin correlated with increased HER2 expression. Restoring expression of ERM proteins in HER2+ breast cancer cells was sufficient to revert HER2 activation and inhibit HER2-dependent proliferation. A high-throughput assay recapitulating the HER2–ERM interaction allowed for screening of about 1,500 approved drugs. From this screen, we found Zuclopenthixol, an antipsychotic drug that behaved as a Moesin-mimicking compound, because it directly binds the juxtamembrane region of HER2 and specifically inhibits HER2 activation in HER2+ cancers, as well as activation of oncogenic mutated and truncated forms of HER2. Zuclopenthixol efficiently inhibited HER2+ breast tumor progression in vitro and in vivo and, more importantly, showed significant activity on HER2+ brain tumor progression. Collectively, these data reveal a novel class of allosteric HER2 inhibitors, increasing the number of approaches to consider for intervention on HER2+ breast cancers and brain metastases. Significance: This study demonstrates the functional role of Moesin in maintaining HER2 in a catalytically repressed state and provides novel therapeutic approaches targeting HER2+ breast cancers and brain metastasis using Moesin-mimicking compounds.
Published: 2021
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39. Baseline Characteristics of a National French E-Cohort of Hidradenitis Suppurativa in ComPaRe and Comparison with Other Large Hidradenitis Suppurativa Cohorts

Author: Marie-France Bru, Laetitia Penso, Hervé Bachelez, Eric Jacquet, Viet-Thi Tran, Pierre Perrot, Marie-Aleth Richard, C. Hotz, Axel Patrice Villani, Emilie Sbidian, M. Viguier, Pierre Wolkenstein, Morgane Condamina, Philippe Ravaud, Aude Nassif, Marie Beylot-Barry, Philippe Guillem, Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Epidemiology in Dermatology and Evaluation in Therapeutics (EpiDermE), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé [Saint-Denis] (ANSM), Centre de Recherche Épidémiologie et Statistique Sorbonne Paris Cité (CRESS (U1153 / UMR_A_1125 / UMR_S_1153)), Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM), HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Hôtel-Dieu, CHU Henri Mondor, Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Sarcomes osseux et remodelage des tissus calcifiés - Phy-Os [Nantes - INSERM U1238] (Phy-Os), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bretagne Loire (UBL)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Médical de l'Institut Pasteur (CMIP), Institut Pasteur [Paris], Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Henri Mondor, Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Faculté de médecine (UPEC Médecine), Service de dermatologie [Bordeaux], Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], French Cochrane Centre, Service de dermatologie [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), HESAM Université (HESAM)-HESAM Université (HESAM)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service de dermatologie [HCL Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL)-Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), Cochrane France [Paris], Service de dermatologie (CHU de Reims), Clinique du Val d'Ouest, Hôtel-Dieu de Nantes, Clinique Beau Soleil [Montpellier], Institut Pasteur [Paris] (IP), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'études et de recherche sur les services de santé et la qualité de vie (CEReSS), Aix Marseille Université (AMU), Centre d'Investigation Clinique Henri Mondor (CIC Henri Mondor), and Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)
Subjects: Adult, Male, medicine.medical_specialty, Sociodemographic Factors, Dermatology, Disease, Overweight, Severity of Illness Index, Cohort Studies, Young Adult, Quality of life, Internal medicine, Epidemiology, Humans, Medicine, Sex organ, Hidradenitis suppurativa, Family history, business.industry, medicine.disease, Hidradenitis Suppurativa, Cohort, Quality of Life, Female, France, medicine.symptom, business, [SDV.MHEP.DERM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Dermatology
Abstract: Background: Hidradenitis suppurativa (HS) is a chronic inflammatory skin condition substantially impacting patients’ quality of life; the pathogenesis remains unclear, and treatment is complex and not yet standardized. Observational data are increasingly being used to evaluate therapeutics in “real-life” interventions, and the development of e-cohorts is offering new tools for epidemiological studies at the population level. Objective: The aim of this study was to describe the clinical characteristics and treatment history of HS participants in the Community of Patients for Research (ComPaRe) cohort and to compare these to other cohorts. Methods: We performed a cross-sectional study of the baseline data of HS participants in ComPaRe, an e-cohort of patients with chronic diseases. Data were collected using patient-reported questionnaires about clinical-demographic aspects, quality of life, and treatment history. Results: A total of 396 participants (339 females, 57 males) were included (mean age 38 years); 83 (21%) had a family history of HS, 227 (57.3%) were current smokers, and 241 (60.9%) were overweight or obese. Most of the participants declared a Hurley stage II (n = 263, 66.4%) or III (n = 76, 20.3%). The breast was more frequently affected in women than men (37.5 vs. 5.3%, p < 0.0001), whereas the dorsal region was more frequently affected in men (39.5 vs. 10.9%, p < 0.0001). Increased disease stage was associated with obesity (25.9 vs. 33.8 vs. 51.3%, p = 0.02) and some HS localizations (genital [p < 0.005], pubis [p < 0.007], gluteal fold [p = 0.02], and groin [p < 0.0001]). The most frequently prescribed treatments were oral antibiotics (n = 362, 91.4%), especially amoxicillin-clavulanic acid and cyclins. Less than 10% of participants received biologics. Most of these results were consistent with previously published cohorts. Conclusion: Recruitment of participants by such a web platform can be a faster way to get relevant scientific data for a wide variety of patients that could be used for epidemiological studies and to evaluate therapeutics in “real-life” interventions.
Published: 2021
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40. Real-time cognitive performance and positive symptom expression in schizophrenia

Author: Elodie Barse, Sandra Chanraud, Mélina Fatséas, Marc Auriacombe, David Misdrahi, Pierre Schweitzer, Majd Abdallah, Maud Dupuy, Joel Swendsen, Fuschia Serre, Bernard N'Kaoua, Institut de Neurosciences Cognitives et Intégratives d'Aquitaine [Bordeaux] (INCIA), and Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Ecological Momentary Assessment, [SDV]Life Sciences [q-bio], Executive control network, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Cognition, medicine, Humans, Pharmacology (medical), Effects of sleep deprivation on cognitive performance, Association (psychology), Biological Psychiatry, medicine.diagnostic_test, business.industry, Magnetic resonance imaging, General Medicine, medicine.disease, 030227 psychiatry, Psychiatry and Mental health, Expression (architecture), Psychotic Disorders, Schizophrenia, [SDV.MHEP.PSM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Psychiatrics and mental health, business, 030217 neurology & neurosurgery, Clinical psychology
Abstract: Deficits in cognitive functions are frequent in schizophrenia and are often conceptualized as stable characteristics of this disorder. However, cognitive capacities may fluctuate over the course of a day and it is unknown if such variation may be linked to the dynamic expression of psychotic symptoms. This investigation used Ecological Momentary Assessment (EMA) to provide mobile tests of cognitive functions and positive symptoms in real time. Thirty-three individuals with schizophrenia completed five EMA assessments per day for a one-week period that included real-time assessments of cognitive performance and psychotic symptoms. A subsample of patients and 31 healthy controls also completed a functional MRI examination. Relative to each individual’s average score, moments of worsened cognitive performance on the mobile tests were associated with an increased probability of positive symptom occurrence over subsequent hours of the day (coef = 0.06, p
Published: 2021
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41. Etude du microenvironnement inflammatoire dans la lymphomagenèse gastrique induite par l’infection à Helicobacter pylori

Author: BLOSSE, Alice, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux, Philippe Lehours, STAR, ABES, Lehours, Philippe, Pereyre, Sabine, Matysiak-Budnik, Tamara, and Burucoa, Christophe
Subjects: Inflammation, MicroARNs, Modèle animal, Lymphome gastrique, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Helicobacter, Animal model, Gastric lymphoma, April, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: H. pylori colonizes the stomach of about half of the world population and induces a chronic inflammation named gastritis, most often asymptomatic but which may evolve towards more serious gastroduodenal pathologies including gastric MALT lymphoma (mucosa-associated lymphoid tissue) or GML. Although occurring in a very small number of infected subjects, it is now well demonstrated that GML’s development is directly caused by H. pylori infection. In this disease, H. pylori-antigenic chronic stimulation to the gastric mucosa leads to the recruitment of lymphocytes and maintains a monoclonal proliferation of B lymphocytes organizing into lymphoid follicles which are normally absent in the gastric mucosa. Therefore GML is part of an inflammatory continuum response to H. pylori. However, the mechanisms leading to this lymphoma are not clearly understood. Since bacterial virulence factors seem to play a minimal role, the study of host factors and in particular the study of the inflammatory microenvironment appears to be an interesting way to better understanding the pathogenesis of this lymphoma.In the first part, we looked at the molecular mechanisms that may be involved by studying the deregulation of microRNAs (miRNAs). Our results showed an up regulation of 4 miRNAs (miR-155, miR-150, miR-196 and miR-138) and a down-regulation of 2 miRNAs (miR-7 and miR-153) in human stomachs at the GML stage, globally different results from those previously obtained by the team in the d3Tx mouse model of GML. Except miR-138, deregulated miRNAs could act synergistically on multiple validated targets involved in a common anti-apoptotic signaling pathway promoting cell survival and B lymphocytes proliferation leading to the lymphomagenesis process.Some cytokines, such as the the APRIL cytokine, would play a leading role in GML pathogenesis. Thus, the team has developed a promising GML model based on transgenic mice with the human form of this cytokine (Tg-hAPRIL). In a second part, we therefore focused on the study of the polarization of the inflammatory response in this novel animal model, and validated these results in the gastric biopsies of GML patients. Our results showed the presence of a balanced gastric Th1, Th2 and T regulatory inflammatory response at the lymphoma stage, both in the Tg-hAPRIL mouse model and in humans. After confirming the gastric overexpression of the APRIL cytokine in patients with GML, we demonstrated, on the one hand, that the target cells of the APRIL cytokine were mainly B lymphocytes present within the lymphoid infiltrates, thus supporting the hypothesis according to which the APRIL cytokine would participate in uncontrolled B lymphocyte proliferation and, on the other hand that the APRIL-producing cells were rare eosinophils present in the tumor microenvironment, suggesting a pro-tumoral role of this cell type in gastric lymphomagenesis.To conclude, all of our results demonstrate that the inflammatory microenvironment is a key contributor to the development of GML., H. pylori colonise l’estomac de près de la moitié de la population mondiale et y induit une inflammation chronique nommée gastrite, le plus souvent asymptomatique mais pouvant évoluer vers des pathologies gastroduodénales plus sévères dont le lymphome gastrique du MALT (mucosa-associated lymphoid tissue) ou LGM. Bien que n’apparaissant que chez un nombre restreint de sujets infectés, il est maintenant bien démontré que le développement du LGM est directement lié à l’infection par H. pylori. Dans cette pathologie, la stimulation antigénique chronique exercée par H. pylori sur la muqueuse gastrique entraîne un recrutement de lymphocytes et entretient une prolifération monoclonale de lymphocytes B s’organisant en follicules lymphoïdes normalement absents de la muqueuse gastrique. Le LGM s’inscrit donc dans un continuum de la réaction inflammatoire à H. pylori. Cependant, les mécanismes physiopathologiques conduisant à ce lymphome ne sont pas clairement élucidés. Les facteurs de virulence bactériens semblant jouer un rôle minime, l’étude des facteurs de l’hôte et notamment l’étude du microenvironnement inflammatoire paraît être une piste intéressante afin de mieux comprendre la physiopathologie de ce lymphome.Dans une première partie, nous nous sommes intéressés aux mécanismes moléculaires pouvant être impliqués via l’étude de la dérégulation des microARNs (miARNs). Nos résultats ont montré la surexpression de 4 miARNs (miR-155, miR-150, miR-196 et miR-138) et la sous-expression de 2 miARNs (miR-7 et miR-153) au niveau gastrique chez des patients atteints par ce lymphome, résultats globalement différents de ceux préalablement obtenus par l’équipe en modèle murin d3Tx. A l’exception du miR-138, les miARNs dérégulés agiraient en synergie, via des cibles validées, dans une voie de signalisation commune anti-apoptotique induisant une prolifération lymphocytaire B nécessaire au processus de lymphomagenèse.Certaines cytokines, dont la cytokine APRIL, joueraient également un rôle majeur dans la physiopathologie du LGM. L’équipe a ainsi développé un modèle prometteur de LGM basé sur l’utilisation de souris transgéniques pour la forme humaine de cette cytokine (Tg-hAPRIL). Dans une deuxième partie, nous nous sommes donc intéressés à l’étude de la polarisation de la réponse inflammatoire dans ce nouveau modèle et à sa comparaison avec celle observée chez l’homme. Nos résultats ont montré la présence d’une réponse inflammatoire gastrique équilibrée Th1, Th2 et T régulatrice au stade lymphome, aussi bien en modèle murin Tg-hAPRIL que chez l’homme. Après avoir confirmé la surexpression gastrique de la cytokine APRIL chez des patients atteints du LGM, nous avons mis en évidence, d’une part que les cellules cibles de la cytokine APRIL étaient majoritairement des lymphocytes B présents au sein des infiltrats lymphoïdes, appuyant ainsi l’hypothèse selon laquelle la cytokine APRIL participerait à la prolifération lymphocytaire B non contrôlée et, d’autre part que les cellules productrices de cette cytokine étaient de rares polynucléaires éosinophiles présents dans le microenvironnement tumoral, suggérant un rôle pro-tumoral de ce type cellulaire dans la lymphomagenèse gastrique.Pour conclure, l’ensemble de nos résultats met en évidence le rôle clé du microenvironnement inflammatoire gastrique dans le développement du LGM.
Published: 2021

42. Impact of the COVID-19 pandemic on children with psoriasis

Author: Denis Jullien, Q. Beytout, D. Devulder, R. Aubert, J.-M. Amici, J. Pepiot, Annabel Maruani, Marie Beylot-Barry, E. Mahé, Centre Hospitalier Victor Dupouy, MethodS in Patients-centered outcomes and HEalth ResEarch (SPHERE), Université de Tours (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques, Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-André, Université de Bordeaux (UB), Hôpital Edouard Herriot [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), and Université de Tours-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, 2019-20 coronavirus outbreak, Coronavirus disease 2019 (COVID-19), Adolescent, Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), media_common.quotation_subject, Hand Sanitizers, [SDV]Life Sciences [q-bio], Dermatology, Adolescents, Severity of Illness Index, 030207 dermatology & venereal diseases, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Hygiene, Psoriasis, Surveys and Questionnaires, Pandemic, Medicine, Humans, In patient, Child, Children, Pandemics, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, media_common, business.industry, Teleconsultation, Remote Consultation, Masks, COVID-19, medicine.disease, 3. Good health, Emergency medicine, Communicable Disease Control, Original Article, Female, France, business, Gloves, Protective
Abstract: Background Children with psoriasis may have been directly impacted by the COVID-19 pandemic and their illness may also have affected their ability to follow preventive measures. Objective To investigate the impact of the COVID-19 pandemic on children with psoriasis. Methods A survey of children (
Published: 2021
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43. Comorbidities Are Associated with Fibrosis in NAFLD Subjects: A Nationwide Study (NASH-CO Study)

Author: Karine Lacombe, Jérôme Boursier, Lawrence Serfaty, Philippe Mathurin, Victor de Ledinghen, Marie Zins, Marcel Goldberg, Oumarou Nabi, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Services des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Saint-Antoine], CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Bordeaux [Bordeaux], Cohortes épidémiologiques en population (CONSTANCES), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité), Université Paris Cité (UPCité), Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Gestionnaire, Hal Sorbonne Université, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), and Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP]
Subjects: Adult, Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, Forns Index, Renal function, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, Liver disease, 0302 clinical medicine, Fibrosis, Non-alcoholic Fatty Liver Disease, Risk Factors, Internal medicine, Chronic kidney disease, medicine, Humans, Fatty Liver Index, Renal Insufficiency, Chronic, education, Cancer, education.field_of_study, business.industry, Fatty liver, Hepatology, medicine.disease, Cardiovascular disease, Colorectal cancer, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Cardiovascular Diseases, 030220 oncology & carcinogenesis, Cohort, Population study, 030211 gastroenterology & hepatology, business, Glomerular Filtration Rate
Abstract: International audience; Background: The relationship between the severity of NAFLD and extra-hepatic events such as cardiovascular disease (CVD), extra-hepatic cancer (EHC) or chronic kidney diseases (CKD) has not been clearly investigated in the general population.Aims: The aim of this study was to assess whether the severity of fibrosis in NAFLD subjects was associated with extra-hepatic diseases based on noninvasive markers in a large population-based cohort.Methods: The study population included a cohort of 118,664 participants from the nationwide CONSTANCES cohort. After excluding individuals with excessive alcohol consumption and other causes of liver disease, 102,344 were included. The noninvasive diagnosis of NAFLD and fibrosis was performed using a combination of the Fatty Liver Index (FLI) and the Forns Index. The history of CVD or EHC was recorded by a physician, and CKD was defined by a glomerular filtration rate < 60 ml/mn.Results: The prevalence of NAFLD (FLI > 60) was 18.2%, 10% with mild fibrosis (Forns Index < 4.2), 7.7% with intermediate fibrosis (Forns Index 4.2-6.9), and 0.4% with advanced fibrosis (Forns Index > 6.9). The prevalence of CVD, EHC, or CKD increased significantly with the severity of fibrosis (p < 0.0001). When adjusted for demographic, metabolic risk factors, and smoking, NAFLD with intermediate or advanced fibrosis remained associated with CVD (OR 1.36, p < 0.0001 and OR 3.07, p < 0.0001, respectively), EHC (OR 1.24, p = 0.001 and OR 1.64, p = 0.004, respectively), and CKD (OR 1.18, p = 0.03 and OR 2.09, p < 0.0001, respectively).Conclusions: In a large adult population-based cohort, there is a dose-dependent relationship between the severity of fibrosis and CVD, EHC, or CKD in NAFLD subjects.
Published: 2021
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44. Downregulation of Glutamine Synthetase, not glutaminolysis, is responsible for glutamine addiction in Notch1‐driven acute lymphoblastic leukemia

Author: Clément Bodineau, Benjamin Uzan, Sebastian van Liempd, Jean-Max Pasquet, Juan M. Falcón-Pérez, Elodie Muzotte, H. Rezvani, Julien Calvo, Elodie Richard, María L. Toribio, Patricia Fuentes, Isabelle Redonnet-Vernhet, Silvia Terés, Marion Bouchecareilh, Mercedes Tomé, Pierre Soubeyran, Piedad del Socorro Murdoch, Benoit Rousseau, Tra Ly Nguyen, Françoise Pflumio, Marie-Julie Nokin, Oriane Galmar, Raúl V. Durán, Abdel-Majid Khatib, Muriel Priault, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad de Sevilla. Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (MICINN). España, European Commission (EC). Fondo Europeo de Desarrollo Regional (FEDER), Agencia Estatal de Investigación (España), European Commission, Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades (España), Ministerio de Economía y Competitividad (España), Consejo Superior de Investigaciones Científicas (España), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (France), Ligue Nationale contre le Cancer (France), Université de Bordeaux, Fondation pour la Recherche Médicale, Conseil régional d'Aquitaine, Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer, Fonds de la Recherche Scientifique (Fédération Wallonie-Bruxelles), Actions for OnCogenesis understanding and Target Identification in ONcology (ACTION), Institut Bergonié [Bordeaux], UNICANCER-UNICANCER-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire Angiogenèse et Micro-environnement des Cancers (LAMC), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Biothérapies des maladies génétiques et cancers, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biochimie et génétique cellulaires (IBGC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), [Nguyen,TL, Nokin,MJ, Terés,S, Bodineau,C, Galmnar,O, Durán,RV] Institut Europeen de Chimie et Biologie, INSERM U1218, Université de Bordeaux, Pessac, France. [Tomé,M, Murdoch,PDS, Durán,RV] Centro Andaluz de Biología Molecular y Medicina Regenerativa - CABIMER, Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Universidad de Sevilla, Universidad Pablo de Olavide, Seville, Spain. [Tomé,M, Khatib,AM] Angiogenesis and Cancer Microenvironment Laboratory INSERM U1029, Universite de Bordeaux, Pessac, France. [Pasquet,JM, Muzotte,E, Rezvani,HR] INSERM, BMGIC, U1035, University of Bordeaux, France. [Rousseau,B] Service Commun des Animaleries, University of Bordeaux, France. [van Liempd,S, Falcon-Perez,JM] Exosomes Laboratory and Platform of Metabolomics, CIC bioGUNE, CIBERehd, Derio, Spain. [Falcon-Perez,JM] IKERBASQUE, Basque Foundation for Science, Bilbao, Spain. [Richard,E] Institut Bergonie, INSERM U1218, University of Bordeaux, France. [Priault,M] Institut de Biochimie et Gen etique Cellulaires, CNRS UMR 5095, Université de Bordeaux, France. [Bouchecareilh,M] Bordeaux Research in Translational Oncology, INSERM U1053, Universite de Bordeaux, France. [Redonnet-Vernhet,I] Maladies Heréditaires du Métabolisme, Laboratoire de Biochimie, Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux, France. [Calvo,J, Uzan,B, Pflumio, F] UMR967, Inserm, CEA, Universite Paris 7, UniversitéParis 11, Fontenay-aux-Roses, France. [Fuentes,P, Toribio,ML] Centro de Biología Molecular 'Severo Ochoa', Consejo Superior de Investigaciones Científicas, Universidad Autonoma de Madrid, Spain. [Murdoch,PDS] Departamento de Bioquímica Vegetal y Biología Molecular, Universidad de Sevilla, Spain, and This work was supported by funds from the following institutions: Agencia Estatal de Investigación/European Regional Development Fund, European Union (PGC2018-096244-B-I00, SAF2016-75442-R), Ministry of Science, Innovation and Universities of Spain, Spanish National Research Council—CSIC, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale—INSERM, Ligue Contre le Cancer—Gironde, Université de Bordeaux, Fondation pour la Recherche Médicale, the Conseil Régional d'Aquitaine, SIRIC-BRIO, Fondation ARC and Institut Européen de Chimie et Biologie. MJN was supported by a bourse d’excellence de la Fédération Wallonie-Bruxelles (WBI) and a postdoctoral fellowship from Fondation ARC. We thank Vincent Pitard (Flow Cytometry Platform, Université de Bordeaux, France) for technical assistance in flow cytometry experiments. We thank Diana Cabrera (Metabolomics Platform, CIC bioGUNE, Spain) for technical assistance in metabolomics analysis.
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Anatomy::Cells::Cells, Cultured::Cell Line::Cell Line, Tumor [Medical Subject Headings], Cancer Research, Glutamina, Regulación hacia abajo, [SDV]Life Sciences [q-bio], Glutamine, mTORC1, [SDV.BC.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology/Subcellular Processes [q-bio.SC], Diana mecanicista del complejo 1 de la rapamicina, Organisms::Eukaryota::Animals::Chordata::Vertebrates::Mammals::Primates::Haplorhini::Catarrhini::Hominidae::Humans [Medical Subject Headings], Mice, 0302 clinical medicine, Mice, Inbred NOD, hemic and lymphatic diseases, Organisms::Eukaryota::Animals [Medical Subject Headings], Receptor, Notch1, Research Articles, RC254-282, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Metabolismo, Anatomy::Cells::Blood Cells::Leukocytes::Leukocytes, Mononuclear::Lymphocytes::T-Lymphocytes [Medical Subject Headings], Organisms::Eukaryota::Animals::Animal Population Groups::Animals, Laboratory::Animals, Inbred Strains::Mice, Inbred Strains::Mice, Inbred NOD [Medical Subject Headings], Chemistry, Gene Expression Regulation, Leukemic, Línea celular, Metabolicaddiction, Phenomena and Processes::Chemical Phenomena::Biochemical Phenomena::Biochemical Processes::Signal Transduction [Medical Subject Headings], Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, General Medicine, Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma, 3. Good health, Leukemia, Oncology, 030220 oncology & carcinogenesis, embryonic structures, cardiovascular system, Molecular Medicine, biological phenomena, cell phenomena, and immunity, Glutamato-amoníaco ligasa, T-cell acute lymphoblastic leukemia, Research Article, Signal Transduction, Receptor Notch1, Chemicals and Drugs::Amino Acids, Peptides, and Proteins::Proteins::Membrane Proteins::Receptors, Cell Surface::Receptors, Notch::Receptor, Notch1 [Medical Subject Headings], Down-Regulation, Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Processes::Gene Expression Regulation::Gene Expression Regulation, Neoplastic::Gene Expression Regulation, Leukemic [Medical Subject Headings], Check Tags::Male [Medical Subject Headings], Mice, Transgenic, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Mechanistic Target of Rapamycin Complex 1, Gene Expression Regulation, Enzymologic, Glutamine synthetase, 03 medical and health sciences, Downregulation and upregulation, Glutamate-Ammonia Ligase, Cell Line, Tumor, T‐cell acute lymphoblastic leukemia, Diseases::Neoplasms::Neoplasms by Histologic Type::Leukemia::Leukemia, Lymphoid::Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma [Medical Subject Headings], Genetics, medicine, Animals, Humans, Metabolic addiction, T-cell acutelymphoblastic leukemia, Organisms::Eukaryota::Animals::Chordata::Vertebrates::Mammals::Rodentia::Muridae::Murinae::Mice [Medical Subject Headings], Notch1, Glutaminolysis, Phenomena and Processes::Chemical Phenomena::Biochemical Phenomena::Biochemical Processes::Down-Regulation [Medical Subject Headings], Phenomena and Processes::Chemical Phenomena::Biochemical Phenomena::Biochemical Processes::Up-Regulation [Medical Subject Headings], Cell growth, Leucemia-linfoma linfoblástico de células T precursoras, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, Chemicals and Drugs::Amino Acids, Peptides, and Proteins::Amino Acids::Amino Acids, Basic::Glutamine [Medical Subject Headings], medicine.disease, Chemicals and Drugs::Enzymes and Coenzymes::Enzymes::Ligases::Carbon-Nitrogen Ligases::Amide Synthases::Glutamate-Ammonia Ligase [Medical Subject Headings], Phenomena and Processes::Genetic Phenomena::Genetic Processes::Gene Expression Regulation::Gene Expression Regulation, Enzymologic [Medical Subject Headings], 030104 developmental biology, Apoptosis, Downregulation, metabolic addiction, Cancer research, Organisms::Eukaryota::Animals::Chordata::Vertebrates::Mammals::Rodentia::Muridae::Murinae::Mice::Mice, Transgenic [Medical Subject Headings], sense organs, Cell line
Abstract: During glutamine sufficiency, both Notch‐positive and Notch‐negative T‐ALL cells promote glutamine catabolism, leading to mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) activation and cell growth and proliferation. However, during glutamine scarcity, only Notch‐negative T‐ALL cells can perform a metabolic adaptation by promoting glutamine synthesis. By contrast, Notch‐positive T‐ALL cells maintain glutamine catabolism during glutamine restriction, leading to glutamine addiction and mTORC1 dependency., The cellular receptor Notch1 is a central regulator of T‐cell development, and as a consequence, Notch1 pathway appears upregulated in > 65% of the cases of T‐cell acute lymphoblastic leukemia (T‐ALL). However, strategies targeting Notch1 signaling render only modest results in the clinic due to treatment resistance and severe side effects. While many investigations reported the different aspects of tumor cell growth and leukemia progression controlled by Notch1, less is known regarding the modifications of cellular metabolism induced by Notch1 upregulation in T‐ALL. Previously, glutaminolysis inhibition has been proposed to synergize with anti‐Notch therapies in T‐ALL models. In this work, we report that Notch1 upregulation in T‐ALL induced a change in the metabolism of the important amino acid glutamine, preventing glutamine synthesis through the downregulation of glutamine synthetase (GS). Downregulation of GS was responsible for glutamine addiction in Notch1‐driven T‐ALL both in vitro and in vivo. Our results also confirmed an increase in glutaminolysis mediated by Notch1. Increased glutaminolysis resulted in the activation of the mammalian target of rapamycin complex 1 (mTORC1) pathway, a central controller of cell growth. However, glutaminolysis did not play any role in Notch1‐induced glutamine addiction. Finally, the combined treatment targeting mTORC1 and limiting glutamine availability had a synergistic effect to induce apoptosis and to prevent Notch1‐driven leukemia progression. Our results placed glutamine limitation and mTORC1 inhibition as a potential therapy against Notch1‐driven leukemia.
Published: 2021
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45. Predictive Factors for Hepatocellular Carcinoma in Chronic Hepatitis B Using Structural Equation Modeling: A Prospective Cohort Study

Author: Jean-Pierre Bronowicki, Clovis Lusivika-Nzinga, Jean-Charles Duclos-Vallée, Ghassan Riachi, Anne Minello, Thomas Decaens, Louis d’Alteroche, Fabrice Carrat, Isabelle Portal, François Raffi, Fabien Zoulim, Sophie Metivier, Véronique Loustaud-Ratti, François Habersetzer, Jérôme Gournay, Olivier Chazouillères, Paul Calès, Victor de Ledinghen, Xavier Causse, Stanislas Pol, Céline Dorival, Isabelle Rosa, Dominique Larrey, Tarik Asselah, Marc Bourlière, Claire Geist, Nathanael Lapidus, Laurent Lam, Moana Gelu-Simeon, Laurent Alric, Vincent Leroy, Hélène Fontaine, Armand Abergel, Nathalie Ganne, Dominique Thabut, Philippe Mathurin, Albert Tran, Dominique Guyader, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CHU Saint-Antoine], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] (CHB), Hôpital Paul Brousse-Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, CRHU Nancy, Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHI Créteil, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], The ANRS CO22 HEPATHER cohort is sponsored and funded by INSERM‐ANRS and conducted in collaboration with Association Française pour l'étude du Foie (AFEF). The cohort received supports from ANR (Agence Nationale de la Recherche), DGS (Direction Générale de la Santé), MSD, Janssen, Gilead, Abbvie, BMS, and Roche., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHU Saint-Antoine], Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Male, Liver Cancer, medicine.medical_specialty, Hepatocarcinogenesis, Hepatitis B virus, Carcinoma, Hepatocellular, Epidemiology, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Liver transplantation, Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer, medicine.disease_cause, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Hepatitis B, Chronic, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, Prospective Studies, Prospective cohort study, Aged, Hepatology, business.industry, Liver Neoplasms, Carcinoma, Hepatocellular, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, Metabolic syndrome, business, Liver cancer
Abstract: International audience; BACKGROUND and AIMS: The factors predicting hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in chronic hepatitis B need to be precisely known to improve its detection. We identified pathways and individual predictive factors associated with HCC in the ANRS CO22 HEPATHER cohort. METHODS: The study analyzed HBV-infected patients recruited at 32 French expert hepatology centers from August 6, 2012, to December 31, 2015. We excluded patients with chronic HCV, HDV and a history of HCC, decompensated cirrhosis or liver transplantation. Structural equation models were developed to characterize the causal pathways leading to HCC occurrence. The association between clinical characteristics (age, gender, body-mass index, liver fibrosis, alcohol consumption, smoking status, diabetes, hypertension, dyslipidemia, alpha-fetoprotein, HBV DNA levels, antiviral therapy) and incident HCC was quantified. RESULTS: Among the 4,489 patients included, 33 patients reported incident HCC. The median follow-up was 45.2 months. Age (β = 0.18 by decade, 95% CI 0.14-0.23), male gender (β = 0.23, 95% CI 0.18-0.29), metabolic syndrome (β = 0.28, 95% CI 0.22-0.33), alcohol consumption (β = 0.09, 95% CI 0.05-0.14) and HBV DNA (β = 0.25, 95% CI 0.17-0.34) had a significant and direct effect on the occurrence of advanced liver fibrosis. Liver fibrosis (β = 0.71, 95% CI 0.55-0.87) predicted, in turn, the occurrence of HCC. CONCLUSIONS: Liver fibrosis mediates the effects of age, gender, alcohol, metabolic syndrome and HBV DNA on the occurrence of HCC. Elderly men with chronic hepatitis B, risky alcohol use, advanced liver fibrosis, metabolic syndrome and high HBV DNA levels should be monitored closely to detect the development of HCC.
Published: 2021
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46. Helicobacter pylori resistance to antibiotics in Europe in 2018 and its relationship to antibiotic consumption in the community

Author: Megraud, Francis, Bruyndonckx, Robin, Coenen, Samuel, Wittkop, Linda, Huang, Te-Din, Hoebeke, Martin, Benejat, Lucie, Lehours, Philippe, Goossens, Herman, Glupczynski, youri, European Helicobacter Pylori Antimicrobial Susceptibility Testing Working, Group, Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), European Helicobacter Pylori, DARMIGNY, SANDRINE, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Vaccine & Infectious Disease Institute [Antwerp, Belgium] (VAXINFECTIO), University of Antwerp (UA), Hasselt University (UHasselt), Institut de Santé Publique, d'Epidémiologie et de Développement (ISPED), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Université de Bordeaux (UB), CHU UCL Namur, European Helicobacter pylori Antimicrobial Susceptibility Testing Working Group: Athanasios Makristathis, Lyudmila Boyanova, Ante Tonkic, Marija Tonkic, Leif Andersen, Benjamin Blumel, Erick Glocker, Ina Tammer, Alexander Link, Sebastian Suerbaum, Karl Dichtl, Andreas Mentis, Beatriz Marintez-Gonzales, Sinead Smith, Deirdre McNamara, Maria Pina Dore, Rosa Monno, Antonio Lippolis, Dace Rudzite, Marcis Leja, Juozas Kupcinskas, Kjetil K Melby, Grazyna Gosciniak, Tomasz M Karpinski, Monica Oleastro, Samo Jeverica, Xavier Calvet, Maria José Ramirez-Lázaro, Milagrosa Montes Ros, Ana Morilla, Sjoukje Boonstra, Peter M Schneeberger, UCL - SSS/IREC/MONT - Pôle Mont Godinne, and UCL - (MGD) Laboratoire de biologie clinique
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, medicine.drug_class, [SDV]Life Sciences [q-bio], Gastric diseases, 030106 microbiology, Antibiotics, Drug resistance, antibiotics, WATER, SURVEILLANCE, ERADICATION, MULTICENTER, PREVALENCE, Helicobacter pylori infection, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Antibiotic resistance, Levofloxacin, Clarithromycin, Internal medicine, medicine, drug resistance, biology, business.industry, Gastroenterology, gastric diseases, Helicobacter pylori, biology.organism_classification, Quinolone, bacterial infections and mycoses, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Metronidazole, 030211 gastroenterology & hepatology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Human medicine, business, medicine.drug
Abstract: ObjectiveOur aim was to prospectively assess the antibiotic resistance rates in Helicobacter pylori strains in Europe in 2018 and to study the link between antibiotic consumption in the community and H. pylori resistance levels in the different countries.DesignThe proportion of primary antibiotic resistance cases of H. pylori and their corresponding risk factors were investigated in 24 centres from 18 European countries according to a standardised protocol. Data on antibiotic consumption in the community were collected for the period 2008–2017. The link between antibiotic consumption and resistance data was assessed using generalised linear mixed models. The model with the best fit was selected by means of the Akaike Information Criterion.ResultsH. pylori resistance rates for the 1211 adult patients included were 21.4% for clarithromycin, 15.8% for levofloxacin and 38.9% for metronidazole and were significantly higher in Central/Western and Southern than in the Northern European countries.The best model fit was obtained for the Poisson distribution using 2013 consumption data. A signiﬁcant association was found between H. pylori clarithromycin resistance and consumption in the community of macrolides (p=0.0003) and intermediate-acting macrolides (p=0.005), and between levoﬂoxacin resistance and consumption of quinolones (p=0.0002) and second-generation quinolones (p=0.0003).ConclusionThis study confirms the positive correlation between macrolide and quinolone consumption in the community and corresponding H. pylori resistance in European countries. Hence, H. pylori treatment with clarithromycin and levofloxacin should not be started without susceptibility testing in most European countries.
Published: 2021
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47. La réduction des ponts disulfures de la matrice extracellulaire: Un prérequis à l’invasion par les cellules tumorales

Author: Ros, Manon, Bard, Frédéric, Saltel, Frédéric, Unité mixte de recherche biologie moléculaire de la cellule, École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Sciences, EDP
Subjects: [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV]Life Sciences [q-bio], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience
Published: 2021
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48. La réduction des ponts disulfures de la matrice extracellulaire

Author: Manon Ros, Frédéric Saltel, Frederic Bard, Unité mixte de recherche biologie moléculaire de la cellule, École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École normale supérieure - Lyon (ENS Lyon)
Subjects: 0303 health sciences, Chemistry, business.industry, Disulfide bond reduction, [SDV]Life Sciences [q-bio], General Medicine, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Extracellular matrix, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Text mining, Biophysics, business, 030217 neurology & neurosurgery, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract: International audience
Published: 2021
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49. 1D continuous gel electrophoresis composition for the separation of deamidated proteins

Author: Claude Bobo, Axel Boudier-Lemosquet, Muriel Priault, Violaine Moreau, Adrien Mahler, Institut de biochimie et génétique cellulaires (IBGC), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Priault, Muriel
Subjects: Electrophoresis, Gel electrophoresis, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, RHOA, Calmodulin, biology, 030302 biochemistry & molecular biology, GTPase, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, 03 medical and health sciences, chemistry, Ionic strength, Biophysics, biology.protein, Counterion, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Peptides, Deamidation, Molecular Biology, [SDV.BBM.BC] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology
Abstract: International audience; Deamidation is a spontaneous modification of peptides and proteins that has potent repercussions on their activity and stability in vivo and in vitro. Being able to implement easy techniques to detect and quantify protein deamidation is a major goal in this field. Here we focus on electrophoretic methods that can be deployed to assess protein deamidation. We provide an update on the use of Taurine/Glycinate as trailing ions to assist the detection of several examples of deamidated proteins, namely the small GTPases RhoA, Rac1 and Cdc42, but also the oncogene Bcl-xL and calcium-binding Calmodulin. We also report on the use of imidazole as a counter ion to improve the focusing of deamidated bands. Finally, we provide examples of how these gels proved useful to compare on full-length proteins the effect of ions and pH on the catalytic rates of spontaneous deamidation. Taken together, the electrophoretic method introduced here proves useful to screen at once the effect of various conditions of pH, ionic strength and buffer ions on protein stability. Direct applications can be foreseen to tailor buffer formulations to control the stability of proteins drug products.
Published: 2021
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50. Hepatitis B virus integrations promote local and distant oncogenic driver alterations in hepatocellular carcinoma

Author: Eric Letouzé, Théo Z. Hirsch, Sandrine Imbeaud, Tiziana La Bella, Jean-Frédéric Blanc, Giuliana Amaddeo, Julien Calderaro, Jessica Zucman-Rossi, Valérie Paradis, Camille Peneau, Jean-Charles Nault, Stefano Caruso, Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Henri Mondor, Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Beaujon, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Avicenne [AP-HP], Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université de Paris (UP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), and Gestionnaire, Hal Sorbonne Université
Subjects: Male, Hepatitis B virus, Carcinoma, Hepatocellular, Carcinogenesis, Virus Integration, [SDV]Life Sciences [q-bio], cancer genetics, Genomics, Biology, medicine.disease_cause, Cohort Studies, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Gene mapping, medicine, Humans, Gene, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Liver Neoplasms, Gastroenterology, virus diseases, hepatocellular carcinoma, Hepatitis B, medicine.disease, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Editorial, Hepatocellular carcinoma, Case-Control Studies, DNA, Viral, Cancer research, 030211 gastroenterology & hepatology, Human genome, Female, hepatitis B
Abstract: ObjectiveInfection by HBV is the main risk factor for hepatocellular carcinoma (HCC) worldwide. HBV directly drives carcinogenesis through integrations in the human genome. This study aimed to precisely characterise HBV integrations, in relation with viral and host genomics and clinical features.DesignA novel pipeline was set up to perform viral capture on tumours and non-tumour liver tissues from a French cohort of 177 patients mainly of European and African origins. Clonality of each integration event was determined with the localisation, orientation and content of the integrated sequence. In three selected tumours, complex integrations were reconstructed using long-read sequencing or Bionano whole genome mapping.ResultsReplicating HBV DNA was more frequently detected in non-tumour tissues and associated with a higher number of non-clonal integrations. In HCC, clonal selection of HBV integrations was related to two different mechanisms involved in carcinogenesis. First, integration of viral enhancer nearby a cancer-driver gene may lead to a strong overexpression of oncogenes. Second, we identified frequent chromosome rearrangements at HBV integration sites leading to cancer-driver genes (TERT, TP53, MYC) alterations at distance. Moreover, HBV integrations have direct clinical implications as HCC with a high number of insertions develop in young patients and have a poor prognosis.ConclusionDeep characterisation of HBV integrations in liver tissues highlights new HBV-associated driver mechanisms involved in hepatocarcinogenesis. HBV integrations have multiple direct oncogenic consequences that remain an important challenge for the follow-up of HBV-infected patients.
Published: 2021
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