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1. Metallomic profile in non-cirrhotic hepatocellular carcinoma supports a phenomenon of metal metabolism adaptation in tumor cells

Author: Luis Cano, Stéphane Bertani, Marie-Laure Island, Juan Pablo Cerapio, Eloy Ruiz, Pascal Pineau, Valérie Monbet, Karim Boudjema, Luis Taxa, Sandro Casavilca-Zambrano, Martine Ropert, Bruno Turlin, Olivier Loréal, Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Recherche Mathématique de Rennes (IRMAR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], This study was funded by the French National Alliance for Life Sciences and Health (ENV201408), LC was a recipient of a doctoral fellowship from French National Research Institute for Sustainable Development (IRD) (EMHE-ARTS-2016-878573B), JPC was a recipient of a doctoral fellowship from the Peruvian National Coun-cil for Science and Technology (212-2015-FONDECYT), SB has received funding from the European Union’s Horizon 2020 Framework program under the Marie Skłodowska-Curie Actions 823935 and from the Alliance pour les Sciences de la Vie et de la Santé (AVIESAN), ITMO Cancer ENV201408, and LC, ER, and SCZ have received funding from the World Bank Group and FONDECYT-CONCYTEC 016-2018-FONDECYT/BM., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Subjects: Adult, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Science, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Article, Young Adult, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, parasitic diseases, Humans, neoplasms, Aged, Retrospective Studies, Liver Neoplasms, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Middle Aged, Cancer metabolism, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, Liver, Metals, Medicine, Female, Liver cancer
Abstract: Our group has previously described a particular form of Hepatocellular carcinoma (HCC) developed in non-cirrhotic liver (HCC-NC) developed in Peruvian patients Our aim is to analyze the HCC-NC from clinical-biological findings in two different cohorts (Peruvian and French) and the link with metallomic profile. Clinical, histopathological and also tumoral (T) and non-tumoral liver (NTL) samples of 38 Peruvian and 45 French patients were studied. Twelve metals were assayed using ICP/MS: Mn, Fe, Cu, Co, Zn, As, Se, Rb, Mo, Cd, Pb, and Sn. Possible associations between metals and survival were also evaluated. Overall, results show clearly differences between both cohorts. Mean age were 41 ± 20 and 68 ± 9 years-old for Peruvians and French, respectively. 80% of Peruvian patients were positive for the HBsAg, versus 9% in French patients. Metals concentrations were higher in the NTL of Peruvians (p
Published: 2021

2. Exposure assessment of 170 pesticide ingredients and derivative metabolites in people from the Central Andes of Peru

Author: Jorge Honles, Claire Clisson, Claudia Monge, Pedro Vásquez-Ocmín, Juan Pablo Cerapio, Sysay Palamy, Sandro Casavilca-Zambrano, Javier Herrera, Pascal Pineau, Eric Deharo, Vincent Peynet, Stéphane Bertani, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Institut de Recherche et d'Expertise Scientifique [Europarc, Strasbourg], Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Health Sciences [Vientiane, Laos] (UHS), Laboratoire d'Economie de Dauphine (LEDa), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), This research has received funding from the International Joint Laboratories programme of IRD and the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie Actions (grant agreement 823935), European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Multidisciplinary, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Peru, Humans, [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Environmental Exposure, Pesticides, Agrochemicals
Abstract: The Central Andes of Peru are a region of great concern regarding pesticide risk to the health of local communities. Therefore, we conducted an observational study to assess the level of pesticide contamination among Andean people. Analytical chemistry methods were used to measure the concentrations of 170 pesticide-related compounds in hair samples from 50 adult Andean subjects living in rural and urban areas. As part of the study, a questionnaire was administered to the subjects to collect information regarding factors that increase the risk of pesticide exposure. Our results indicate that Andean people are strongly exposed to agrochemicals, being contaminated with a wide array of pesticide-related compounds at high concentration levels. Multivariate analyses and geostatistical modeling identified sociodemographic factors associated with rurality and food origin that increase pesticide exposure risk. The present study represents the first comprehensive investigation of pesticide-related compounds detected in body samples collected from people living in the Central Andes of Peru. Our findings pinpoint an alarming environmental situation that threatens human health in the region and provide a rationale for improving public policies to protect local communities.
Published: 2022

3. Global DNA hypermethylation pattern and unique gene expression signature in liver cancer from patients with Indigenous American ancestry

Author: Cerapio, Juan Pablo, Marchio, Agnès, Cano, Luis, López, Ignacio, Fournié, Jean-Jacques, Régnault, Béatrice, Casavilca-Zambrano, Sandro, Ruiz, Eloy, Dejean, Anne, Bertani, Stéphane, Pineau, Pascal, Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génotypage des Eucaryotes (Plate-Forme), Institut Pasteur [Paris] (IP), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Alliance pour les sciences de la vie et de la santé (Aviesan)., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Innovation et Recherche Technologique / Center for Innovation and Technological Research, Institut Pasteur [Paris], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: DNA methylation, MESH: Cancer, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, indigenous people, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, [SHS.ANTHRO-BIO] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, MESH: Comparative Genomics, liver cancer, integrative genomics, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hepatitis B virus, Research Paper
Abstract: International audience; Hepatocellular carcinoma (HCC) usually afflicts individuals in their maturity after a protracted liver disease. Contrasting with this pattern, the age structure of HCC in Andean people displays a bimodal distribution with half of the patients developing HCC in adolescence and early adulthood. To deepen our understanding of the molecular determinants of the disease in this population, we conducted an integrative analysis of gene expression and DNA methylation in HCC developed by 74 Peruvian patients, including 39 adolescents and young adults. While genome-wide hypomethylation is considered as a paradigm in human HCCs, our analysis revealed that Peruvian tumors are associated with a global DNA hypermethylation. Moreover, pathway enrichment analysis of transcriptome data characterized an original combination of signatures. Peruvian HCC forgoes canonical activations of IGF2, Notch, Ras/MAPK, and TGF-β signals to depend instead on Hippo/YAP1, MYC, and Wnt/β-catenin pathways. These signatures delineate a homogeneous subtype of liver tumors at the interface of the proliferative and non-proliferative classes of HCCs. Remarkably, the development of this HCC subtype occurs in patients with one of the four Native American mitochondrial haplogroups A-D. Finally, integrative characterization revealed that Peruvian HCC is apparently controlled by the PRC2 complex that mediates cell reprogramming with massive DNA methylation modulating gene expression and pinpointed retinoid signaling as a potential target for epigenetic therapy.
Published: 2021

4. Potent Antiplasmodial Derivatives of Dextromethorphan Reveal the Ent-Morphinan Pharmacophore of Tazopsine-Type Alkaloids

Author: Keita, Antoinette, Franetich, Jean-François, Carraz, Maëlle, Valentin, Loïse, Bordessoules, Mallaury, Baron, Ludivine, Bigeard, Pierre, Dupuy, Florian, Geay, Valentine, Tefit, Maurel, Sarrasin, Véronique, Michel, Sylvie, Lavazec, Catherine, Houzé, Sandrine, Mazier, Dominique, Soulard, Valérie, Porée, François-Hugues, Duval, Romain, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Cibles Thérapeutiques et conception de médicaments (CiTCoM - UMR 8038), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), We thank the Doctoral School of Paris University (ED 563, MTCI) for financial support (PhD fellowship to A.K.). L.V. was supported by the OrganoMal project funded by the French National Agency for Research (ANR) (ANR-[20 ? 21 ?]-CE17-0035-0011) and a CIFRE ANRT allocation N∘ 2019/0153. LB was supported by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Program under grant agreement N∘ 733273., Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and HAL UR1, Admin
Subjects: dextromethorphan, hepatic stages, Plasmodium berghei, [CHIM] Chemical Sciences, Plasmodium falciparum, hit compound, malaria, tazopsine, [CHIM]Chemical Sciences, blood stages, prophylaxis, N-alkylation
Abstract: International audience; The alkaloid tazopsine 1 was introduced in the late 2000s as a novel antiplasmodial hit compound active against Plasmodium falciparum hepatic stages, with the potential to develop prophylactic drugs based on this novel chemical scaffold. However, the structural determinants of tazopsine 1 bioactivity, together with the exact definition of the pharmacophore, remained elusive, impeding further development. We found that the antitussive drug dextromethorphan (DXM) 3, although lacking the complex pattern of stereospecific functionalization of the natural hit, was harboring significant antiplasmodial activity in vitro despite suboptimal prophylactic activity in a murine model of malaria, precluding its direct repurposing against the disease. The targeted N-alkylation of nor-DXM 15 produced a small library of analogues with greatly improved activity over DXM 3 against P. falciparum asexual stages. Amongst these, N-2’-pyrrolylmethyl-nor-DXM 16i showed a 2- to 36-fold superior inhibitory potency compared to tazopsine 1 and DXM 3 against P. falciparum liver and blood stages, with respectively 760 ± 130 nM and 2.1 ± 0.4 μM IC(50) values, as well as liver/blood phase selectivity of 2.8. Furthermore, cpd. 16i showed a 5- to 8-fold increase in activity relative to DXM 3 against P. falciparum stages I-II and V gametocytes, with 18.5 μM and 13.2 μM IC(50) values, respectively. Cpd. 16i can thus be considered a promising novel hit compound against malaria in the ent-morphinan series with putative pan cycle activity, paving the way for further therapeutic development (e.g., investigation of its prophylactic activity in vivo).
Published: 2022

5. Resistance to artemisinin in falciparum malaria parasites: A redox-mediated phenomenon

Author: Egwu, Chinedu, Pério, Pierre, Augereau, Jean-Michel, Tsamesidis, Ioannis, Benoit-Vical, Françoise, Reybier, Karine, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New Antimalarial Molecules and Pharmacological Approaches (ERL1289), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique, France), Université Paul Sabatier, Toulouse III (France), IRD (Institut de Recherche pour le Développement, France), ANR-16-CE35-0003,INMAR,Réseau intégré des mécanismes de quiescence & clairance impliqués dans la résistance à l'artémisinine chez Plasmodium(2016), ANR-17-CE18-0017,RADICAL,Stratégie thérapeutique par voie radicalaire pour combattre des maladies parasitaires(2017), Gulli, Marie-Hélène, Réseau intégré des mécanismes de quiescence & clairance impliqués dans la résistance à l'artémisinine chez Plasmodium - - INMAR2016 - ANR-16-CE35-0003 - AAPG2016 - VALID, Stratégie thérapeutique par voie radicalaire pour combattre des maladies parasitaires - - RADICAL2017 - ANR-17-CE18-0017 - AAPG2017 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Redox, GSH Resistance, parasitic diseases, Superoxide, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, Antioxidant, [CHIM.COOR] Chemical Sciences/Coordination chemistry, Artemisinin and Plasmodium
Abstract: International audience; Malaria remains a major public health disease due to its high yearly mortality and morbidity. Resistance to the gold standard drug, artemisinin, is worrisome and needs better understanding in order to be overcome. In this work, we sought to study whether redox processes are involved in artemisinin resistance. As artemisinin is known to act among others via production of reactive species, we first compared the production of reactive oxygen species and concomitant protein oxidation in artemisinin-sensitive and artemisinin-resistant parasites when treated with artemisinin. The results undoubtedly demonstrated, using different original methods, that the level of ROS, including superoxide production, and oxidized protein were lower in the resistant strain. Interestingly, the major in-between strain difference was reported at the earlier ring stages, which are the forms able to enter in a quiescence state according to the ART resistance phenomenon. Moreover, we demonstrated a better homeostasis regulation in relation with higher expression of antioxidants in the artemisinin-resistant parasites than their sensitive counterparts after artemisinin exposure, notably, superoxide dismutase and the glutathione (GSH) system. These findings enrich the body of knowledges about the multifaceted mechanism of artemisinin resistance and will help in the design and development of newer antimalarials strategies active against resistant parasites.
Published: 2022

6. A preoperative nomogram for predicting long-term survival after resection of large hepatocellular carcinoma (>10 cm)

Author: Benjamin Roche, R. Fernandez, Juan Pablo Cerapio, Stéphane Bertani, Ivan Chavez, Pascal Pineau, Sandro Casavilca-Zambrano, Francisco Berrospi, Eloy Ruiz, Luis Cano, Claudio Flores, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Centre de Recherches Ecologiques et Evolutives sur le Cancer (MIVEGEC-CREEC), Processus Écologiques et Évolutifs au sein des Communautés (PEEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), This work was supported by the European Union’s Horizon 2020 Framework Programme under the Marie Skłodowska-Curie Actions (Agreement N. 823935)., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Cirrhosis, [SDV.MHEP.CHI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Concordance, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.CHI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, 030230 surgery, Resection, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Long term survival, medicine, Hepatectomy, Humans, Internal validation, Retrospective Studies, Hepatology, business.industry, Liver Neoplasms, Gastroenterology, Cancer, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Nomogram, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 3. Good health, Nomograms, 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Radiology, business
Abstract: International audience; Background: It has previously been demonstrated that a fraction of patients with hepatocellular carcinoma (HCC) > 10 cm can benefit from liver resection. However, there is still a lack of effective decision-making tools to inform intervention in these patients.Methods: We analysed a comprehensive set of clinical data from 234 patients who underwent liver resection for HCC >10 cm at the National Cancer Institute of Peru between 1990 and 2015, monitored their survival, and constructed a nomogram to predict the surgical outcome based on preoperative variables.Results: We identified cirrhosis, multifocality, macroscopic vascular invasion, and spontaneous tumour rupture as independent predictors of survival and integrated them into a nomogram model. The nomogram's ability to forecast survival at 1, 3, and 5 years was subsequently confirmed with high concordance using an internal validation. Through applying this nomogram, we stratified three groups of patients with different survival probabilities.Conclusion: We constructed a preoperative nomogram to predict long-term survival in patients with HCC >10 cm. This nomogram is useful in determining whether a patient with large HCC might truly benefit from liver resection, which is paramount in low- and middle-income countries where HCC is often diagnosed at advanced stages.
Published: 2022

7. Clinical outcomes after treatment with direct antiviral agents: beyond the virological response in patients with previous HCV-related decompensated cirrhosis

Author: Pageaux, G. (Georges-Philippe), Nzinga, C. (Clovis Lusivika), Ganne, N. (Nathalie), Samuel, D. (Didier), Dorival, C. (Céline), Zoulim, F. (Fabien), Cagnot, C. (Carole), Decaens, T. (Thomas), Thabut, D. (Dominique), Asselah, T. (Tarik), Mathurin, P. (Philippe), Habersetzer, F. (Francois), Bronowicki, J. (Jean-Pierre), Guyader, D. (Dominique), Rosa, I. (Isabelle), Leroy, V. (Vincent), Chazouilleres, O. (Olivier), de Ledinghen, V. (Victor), Bourliere, M. (Marc), Causse, X. (Xavier), Cales, P. (Paul), Metivier, S. (Sophie), Loustaud-Ratti, V. (Véronique), Riachi, G. (Ghassan), Alric, L. (Laurent), Gelu-Simeon, M. (Moana), Minello, A. (Anne), Gournay, J. (Jérôme), Geist, C. (Claire), Tran, A. (Albert), Abergel, A. (Armand), Portal, I. (Isabelle), d'Alteroche, L. (Louis), Raffi, F. (François), Fontaine, H. (Hélène), Carrat, F. (Fabrice), Pol, S. (Stanislas), Baumert, Thomas F., Doffoel, M. (Michel), Mutter, C. (Catherine), Simo-Noumbissie, P. (Pauline), Razi, E. (Esma), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathogénèse et Traitement des Maladies du Foie, Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Saclay, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHI Créteil, Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Université d'Angers (UA), CHU Toulouse [Toulouse], Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), French ANRS CO22 Hepather Cohort: Delphine Bonnet, Virginie Payssan-Sicart, Chloe Pomes, François Bailly, Marjolaine Beaudoin, Dominique Giboz, Kerstin Hartig-Lavie, Marianne Maynard, Eric Billaud, David Boutoille, Morane Cavellec, Caroline Chevalier, Isabelle Hubert, Pierre Goepfert, Adrien Lannes, Françoise Lunel, Jérôme Boursier, Nathalie Boyer, Nathalie Giuily, Corinne Castelnau, Giovanna Scoazec, Aziza Chibah, Sylvie Keser, Karim Bonardi, Anaïs Vallet-Pichard, Philippe Sogni, Juliette Foucher, Jean-Baptiste Hiriart, Amandine Legendre, Faiza Chermak, Marie Irlès-Depé, Si Nafa Si Ahmed, Christelle Ansaldi, Nisserine Ben Amara, Valérie Oules, Jacqueline Dunette, Rodolphe Anty, Eve Gelsi, Régine Truchi, Elena Luckina, Nadia Messaoudi, Joseph Moussali, Barbara De Dieuleveult, Héloïse Goin, Damien Labarrière, Pascal Potier, Si Nafa Si Ahmed, Véronique Grando-Lemaire, Pierre Nahon, Séverine Brulé, Rym Monard, Caroline Jezequel, Audrey Brener, Anne Laligant, Aline Rabot, Isabelle Renard, Thomas F Baumert, Michel Dofföel, Catherine Mutter, Pauline Simo-Noumbissie, Esma Razi, Hélène Barraud, Mouni Bensenane, Abdelbasset Nani, Sarah Hassani-Nani, Marie-Albertine Bernard, Georges-Philippe Pageaux, Michael Bismuth, Ludovic Caillo, Stéphanie Faure, Marie Pierre Ripault, Christophe Bureau, Sarah Launay, Jean Marie Peron, Marie Angèle Robic, Léa Tarallo, Marine Faure, Bruno Froissart, Marie-Noelle Hilleret, Jean-Pierre Zarski, Odile Goria, Victorien Grard, Hélène Montialoux, Muriel François, Christian Ouedraogo, Christelle Pauleau, Anne Varault, Tony Andreani, Bénédicte Angoulevant, Azeline Chevance, Lawrence Serfaty, Teresa Antonini, Audrey Coilly, Jean-Charles Duclos Vallée, Mariagrazia Tateo, Corinne Bonny, Chanteranne Brigitte, Géraldine Lamblin, Léon Muti, Abdenour Babouri, Virginie Filipe, Camille Barrault, Laurent Costes, Hervé Hagège, Soraya Merbah, Paul Carrier, Maryline Debette-Gratien, Jérémie Jacques, Guillaume Lassailly, Florent Artu, Valérie Canva, Sébastien Dharancy, Alexandre Louvet, Marianne Latournerie, Marc Bardou, Thomas Mouillot, Yannick Bacq, Didier Barbereau, Charlotte Nicolas, Caroline Chevalier, Isabelle Archambeaud, Sarah Habes, Nisserine Ben Amara, Danièle Botta-Fridlund, Eric Saillard, Marie-Josée Lafrance, Carole Cagnot, Alpha Diallo, Lena Wadouachi, Ventzi Petrov-Sanchez, Douae Ammour, Loubna Ayour, Jaouad Benhida, Fabrice Carrat, Frederic Chau, Céline Dorival, Audrey Gilibert, Isabelle Goderel, Warda Hadi, Clovis Luzivika Nzinga, Grégory Pannetier, François Pinot, Odile Stahl, François Téloulé, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), and Jonchère, Laurent
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Survival, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Decompensated cirrhosis, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Hepacivirus, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, complications, drug therapy, Gastroenterology, Antiviral Agents, Virological response, Internal medicine, Medicine, Humans, In patient, business.industry, Hepatitis C virus, Research, Liver Neoplasms, Hepatitis C, [SDV] Life Sciences [q-bio], Sustained virological response, Infectious Diseases, Direst-acting antiviral agents, therapeutic use, business, After treatment
Abstract: Background In HCV-infected patients with advanced liver disease, the direct antiviral agents-associated clinical benefits remain debated. We compared the clinical outcome of patients with a previous history of decompensated cirrhosis following treatment or not with direct antiviral agents from the French ANRS CO22 HEPATHER cohort. Methods We identified HCV patients who had experienced an episode of decompensated cirrhosis. Study outcomes were all-cause mortality, liver-related or non-liver-related deaths, hepatocellular carcinoma, liver transplantation. Secondary study outcomes were sustained virological response and its clinical benefits. Results 559 patients met the identification criteria, of which 483 received direct antiviral agents and 76 remained untreated after inclusion in the cohort. The median follow-up time was 39.7 (IQR: 22.7–51) months. After adjustment for multivariate analysis, exposure to direct antiviral agents was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.45, 95% CI 0.24–0.84, p = 0.01) and non-liver-related death (HR 0.26, 95% CI 0.08–0.82, p = 0.02), and was not associated with liver-related death, decrease in hepatocellular carcinoma and need for liver transplantation. The sustained virological response was 88%. According to adjusted multivariable analysis, sustained virological response achievement was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.29, 95% CI 0.15–0.54, p Conclusion Treatment with direct antiviral agents is associated with reduced risk for mortality. The sustained virological response was 88%. Thus, direct antiviral agents treatment should be considered for any patient with HCV-related decompensated cirrhosis. Trial registration: ClinicalTrials.gov registry number: NCT01953458.
Published: 2022

8. Non-traumatic coma in young children in Benin: are viral and bacterial infections gaining ground on cerebral malaria?

Author: Josselin, Brisset, Karl, Angendu Baki, Laurence, Watier, Elisée, Kinkpé, Justine, Bailly, Linda, Ayédadjou, Maroufou Jules, Alao, Ida, Dossou-Dagba, Gwladys I, Bertin, Michel, Cot, Farid, Boumédiène, Daniel, Ajzenberg, Agnès, Aubouy, Sandrine, Houzé, Jean-François, Faucher, Bertin, Vianou, Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], CHU Limoges, Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale (EpiMaCT), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-OmégaHealth (ΩHealth), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens - Epidemiology and modelling of bacterial escape to antimicrobials (EMAE), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Universitaire de Zone d'Abomey Calavi / Sô-Ava (CHUZ / AS), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de la Mère et de l'Enfant Lagune (CHU-MEL), Service de Parasitologie Mycologie [CHU Limoges], Institut de Recherche Clinique du Bénin [Abomey-Calavi, Bénin] (IRCB), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), This work was funded by the French National Research Agency (ANR-17-CE17-0001)., NeuroCM group: Dissou Affolabi (Pediatric Department, Calavi Hospital, Calavi, Benin), Nicolas Argy (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bibiane Biokou (Pediatric Department, Mother and Child University and Hospital Center (CHUMEL), Cotonou, Benin), Jean-Eudes Degbelo (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Calavi, Benin), Philippe Deloron (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Latifou Dramane (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Jérémy Fraering (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Emilie Guillochon (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Sayeh Jafari-Guemouri (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Ludivine Houzé (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Valentin Joste (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Claire Kamaliddin (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Anaïs Labrunie (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Yélé Ladipo (Pediatric Department, Mother and Child University and Hospital Center (CHUMEL), Cotonou, Benin), Thomas Lathiere (Ophtalmology department, Limoges University Hospital, Limoges, France), Achille Massougbodji (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Audrey Mowendabeka (Paediatric Department, Hopital de la Mère et de l'Enfant, Limoges, France), Jade Papin (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bernard Pipy (PHARMADEV, Université de Toulouse, IRD, UPS, France), Pierre-Marie Preux (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Marie Raymondeau (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Jade Royo (PHARMADEV, Université de Toulouse, IRD, UPS, France), Darius Sossou (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Brigitte Techer (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bertin Vianou (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin)., ANR-17-CE17-0001,NEUROCM,Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme(2017), Grelier, Elisabeth, Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme - - NEUROCM2017 - ANR-17-CE17-0001 - AAPG2017 - VALID, Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: MESH: Bacterial Infections, Malaria, Cerebral, Non-traumatic coma, MESH: Malaria, Cerebral, [SDV.MHEP.PED] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, MESH: Benin, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, MESH: Child, West Africa, Odds Ratio, Benin, Humans, Prospective Studies, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Child, Cerebral malaria, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, MESH: Humans, MESH: Child, Preschool, Public Health, Environmental and Occupational Health, Bacterial Infections, General Medicine, Central nervous system infection, MESH: Odds Ratio, MESH: Prospective Studies, Co-infection, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Child, Preschool, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: Background While malaria morbidity and mortality have declined since 2000, viral central nervous system infections appear to be an important, underestimated cause of coma in malaria-endemic Eastern Africa. We aimed to describe the etiology of non-traumatic comas in young children in Benin, as well as their management and early outcomes, and to identify factors associated with death. Methods From March to November 2018, we enrolled all HIV-negative children aged between 2 and 6 years, with a Blantyre Coma Score ≤ 2, in this prospective observational study. Children were screened for malaria severity signs and assessed using a systematic diagnostic protocol, including blood cultures, malaria diagnostics, and cerebrospinal fluid analysis using multiplex PCR. To determine factors associated with death, univariate and multivariate analyses were performed. Results From 3244 admissions, 84 children were included: malaria was diagnosed in 78, eight of whom had a viral or bacterial co-infection. Six children had a non-malarial infection or no identified cause. The mortality rate was 29.8% (25/84), with 20 children dying in the first 24 h. Co-infected children appeared to have a poorer prognosis. Of the 76 children who consulted a healthcare professional before admission, only 5 were prescribed adequate antimalarial oral therapy. Predictors of early death were jaundice or increased bilirubin [odd ratio (OR)= 8.6; 95% confidential interval (CI): 2.03–36.1] and lactate > 5 mmol/L (OR = 5.1; 95% CI: 1.49–17.30). Antibiotic use before admission (OR = 0.1; 95% CI: 0.02–0.85) and vaccination against yellow fever (OR = 0.2, 95% CI: 0.05–0.79) protected against mortality. Conclusions Infections were found in all children who died, and cerebral malaria was by far the most common cause of non-traumatic coma. Missed opportunities to receive early effective antimalarial treatment were common. Other central nervous system infections must be considered in their management. Some factors that proved to be protective against early death were unexpected.
Published: 2022

9. Improving Aqueous Solubility and In Vitro Pharmacokinetic Properties of the 3-Nitroimidazo[1,2-a]pyridine Antileishmanial Pharmacophore

Author: Romain Paoli-Lombardo, Nicolas Primas, Sandra Bourgeade-Delmas, Sébastien Hutter, Alix Sournia-Saquet, Clotilde Boudot, Emilie Brenot, Caroline Castera-Ducros, Sophie Corvaisier, Marc Since, Aurélie Malzert-Fréon, Bertrand Courtioux, Alexis Valentin, Pierre Verhaeghe, Nadine Azas, Pascal Rathelot, Patrice Vanelle, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale (EpiMaCT), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-OmégaHealth (ΩHealth), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Aix-Marseille Université (AMU), Centre national de la recherche scientifique (CNRS), Assistance publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Gulli, Marie-Hélène
Subjects: [SDV.SP.MED] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Thermodynamic solubility, Imidazo[1,2-a]pyridine, nitroaromatic, nitroreductases, Leishmania spp, structure-activity relationships, thermodynamic solubility, microsomal stability, gastrointestinal permeability, Pharmaceutical Science, Structure-activity relationships, Nitroreductases, Imidazo[1 2-a]pyridine, Nitroaromatic, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Drug Discovery, Molecular Medicine, Microsomal stability, Gastrointestinal permeability
Abstract: An antileishmanial structure–activity relationship (SAR) study focused on positions 2 and 8 of the imidazo[1,2-a]pyridine ring was conducted through the synthesis of 22 new derivatives. After being screened on the promatigote and axenic amastigote stages of Leishmania donovani and L. infantum, the best compounds were tested against the intracellular amastigote stage of L. infantum and evaluated regarding their in vitro physicochemical and pharmacokinetic properties, leading to the discovery of a new antileishmanial6-chloro-3-nitro-8-(pyridin-4-yl)-2-[(3,3,3-trifluoropropylsulfonyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine hit. It displayed low cytotoxicities on both HepG2 and THP1 cell lines (CC50 > 100 µM) associated with a good activity against the intracellular amastigote stage of L. infantum (EC50 = 3.7 µM versus 0.4 and 15.9 µM for miltefosine and fexinidazole, used as antileishmanial drug references). Moreover, in comparison with previously reported derivatives in the studied series, this compound displayed greatly improved aqueous solubility, good mouse microsomal stability (T1/2 > 40 min) and high gastrointestinal permeability in a PAMPA model, making it an ideal candidate for further in vivo studies on an infectious mouse model.
Published: 2022

10. Prediction of hepatocellular carcinoma in Hepatitis C patients with advanced fibrosis after sustained virologic response

Author: Azzi, Jessica, Dorival, Céline, Cagnot, Carole, Fontaine, Hélène, Lusivika-Nzinga, Clovis, Leroy, Vincent, de Ledinghen, Victor, Tran, Albert, Zoulim, Fabien, Alric, Laurent, Gournay, Jérôme, Bronowicki, Jean-Pierre, Decaens, Thomas, Riachi, Ghassan, Mikhail, Nabiel, Soliman, Reham, Shiha, Gamal, Pol, Stanislas, Carrat, Fabrice, Ganne-Carrié, Nathalie, Hepather, Anrs-Afef, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Assiut University, Port Said University, Mansoura University [Egypt], Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpitaux Universitaires Paris Seine-Saint-Denis (GHU 93), INSERM U1053, Université Bordeaux, Bordeaux, France., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Purpan (CHU Purpan), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Inserm U1254, Centre Hospitalier Universitaire de Nancy (CHU Nancy), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Egyptian Liver Research Institute and Hospital (ELRIAH), Mansoura, Egypt, Biostatistics and Cancer Epidemiology Department, South Egypt Cancer Institute, Assiut University, Assuit, Egypt., Tropical Medicine Department, Faculty of Medicine, Port Said University, Port Said, Egypt., Hepatology and Gastroenterology Unit, Internal Medicine Department, Faculty of Medicine, Mansoura University, Mansoura, Egypt., Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), École pratique des hautes études (EPHE), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPC)
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Hepatology, Sustained Virologic Response, Hepatitis C virus, Liver Neoplasms, Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Hepacivirus, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, Antiviral Agents, Hepatitis C, Risk factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Risk score, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, HCC, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Background & Aims: Prediction of hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in patients with chronic hepatitis C (HCV) who achieved a sustained virological response (SVR) after direct acting antivirals (DAAs) remains challenging.Methods: Among HCC-free HCV patients with advanced fibrosis enrolled in the ANRS CO22 HEPATHER cohort who achieved SVR 12 weeks after treatment with DAAs, HCC predictive models were developed using Cox multivariable regression. The derived score was externally validated in a large Egyptian cohort. Our main outcome was the HCC-free survival.Results: During follow-up (median 3.05 years), 153 out of 3531 patients developed a HCC. Main variables associated with HCC occurrence were: male gender, HCV genotype 3, esophageal varices, albumin < 40 g/L, total bilirubin >11 µmol/L and hypercholesterolemia before DAA initiation, together with age > 58 years, FIB-4 index ≥3.25 evaluated at SVR. A score was established allowing the stratification of patients by high (score ≥ 12/22), intermediate (7 ≤ score
Published: 2022

11. Cannabinoids vs. whole metabolome: Relevance of cannabinomics in analyzing Cannabis varieties

Author: Maxime Bonhomme, Pedro Vásquez-Ocmín, Sylvie Fournier, Alexandre Maciuk, Stéphane Bertani, Guillaume Marti, Fabienne Mathis, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse (BioCIS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), HEMP-it ADN, Fédération Nationale des Producteurs de Chanvre (FNPC), Metatoul - Agromix, MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Evolution des Interactions Plantes-Microorganismes, Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), MetaToul Agromix, MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Bertani, Stéphane, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: Chemotypes, Computational biology, Cannabis sativa, 01 natural sciences, Biochemistry, Cannabinomics, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, [CHIM] Chemical Sciences, Metabolome, Environmental Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Statistical analysis, Genotyping, [SDV.BV.PEP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, Spectroscopy, 030304 developmental biology, Cannabis, 0303 health sciences, Chemotype, biology, Cannabinoids, Chemistry, 010401 analytical chemistry, biology.organism_classification, MESH: Cannabis, 0104 chemical sciences, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, MESH: Cannabinoids, Identification (biology), MESH: Metabolome, Phytocannabinoids
Abstract: International audience; Cannabis sativa has a long history of domestication both for its bioactive compounds and its fibers. This has produced hundreds of varieties, usually characterized in the literature by chemotypes, with Δ9-THC and CBD content as the main markers. However, chemotyping could also be done based on minor compounds (phytocannabinoids and others). In this work, a workflow, which we propose to name cannabinomics, combines mass spectrometry of the whole metabolome and statistical analysis to help differentiate C. sativa varieties and deciphering their characteristic markers. By applying this cannabinomics approach to the data obtained from 20 varieties of C. sativa (classically classified as chemotype I, II, or III), we compared the results with those obtained by a targeted quantification of 11 phytocannabinoids. Cannabinomics can be considered as a complementary tool for phenotyping and genotyping, allowing the identification of minor compounds playing a key role as markers of differentiation.
Published: 2021

12. Reactive Oxygen Species as the Brainbox in Malaria Treatment

Author: Françoise Benoit-Vical, Jean-Michel Augereau, Karine Reybier, Chinedu O. Egwu, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New Antimalarial Molecules and Pharmacological Approaches (ERL1289), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique, France), Université Paul Sabatier, Toulouse III (France), IRD (Institut de Recherche pour le Développement, France), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Pagès, Nathalie
Subjects: malaria and oxidative stress, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Plasmodium falciparum, RM1-950, Review, medicine.disease_cause, Biochemistry, antimalarials, parasitic diseases, medicine, Artemisinin, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, Reactive oxygen species, biology, ROS, Cell Biology, biology.organism_classification, medicine.disease, [SDV] Life Sciences [q-bio], chemistry, Immunology, Therapeutics. Pharmacology, Malaria control, Malaria, Oxidative stress, medicine.drug
Abstract: International audience; Several measures are in place to combat the worldwide spread of malaria, especially in regions of high endemicity. In part, most common antimalarials, such as quinolines and artemisinin and its derivatives, deploy an ROS-mediated approach to kill malaria parasites. Although some antimalarials may share similar targets and mechanisms of action, varying levels of reactive oxygen species (ROS) generation may account for their varying pharmacological activities. Regardless of the numerous approaches employed currently and in development to treat malaria, concerningly, there has been increasing development of resistance by Plasmodium falciparum, which can be connected to the ability of the parasites to manage the oxidative stress from ROS produced under steady or treatment states. ROS generation has remained the mainstay in enforcing the antiparasitic activity of most conventional antimalarials. However, a combination of conventional drugs with ROS-generating ability and newer drugs that exploit vital metabolic pathways, such antioxidant machinery, could be the way forward in effective malaria control.
Published: 2021

13. Atherosclerotic Cardiovascular Events in Patients Infected With Human Immunodeficiency Virus and Hepatitis C Virus

Author: Didier Neau, Camille Gilbert, Anne Gervais, Laure Esterle, Linda Wittkop, Laurent Alric, Lionel Piroth, Eric Rosenthal, Alissa Naqvi, François Dabis, Jose-Luis Lopez-Zaragoza, Dominique Salmon Ceron, Philippe Sogni, Julie Chas, Alexandre Cinaud, Christine Katlama, Anne Simon, Patrick Miailhes, Daniel Garipuy, Isabelle Poizot-Martin, Olivier Bouchaud, Karine Lacombe, Mathieu Chalouni, Marc Arthur Loko, Karl Barange, Franck Boccara, Firouzé Bani-Sadr, François Boué, François Raffi, Caroline Lascoux-Combe, David Zucman, Philippe Morlat, Claudine Duvivier, Hugues Aumaitre, Cécile Goujard, Estibaliz Lazaro, Boun Kim Tan, David Rey, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpitaux Universitaires Paris Centre (CHU Paris Centre), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Team MORPH3EUS (INSERM U1219 - UB - ISPED), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB), Hôtel-Dieu, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CHU Tenon [AP-HP], Hôpital Saint-André, Hôpital l'Archet, Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Sorbonne Paris Nord, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Université Paris-Saclay, Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Henri Mondor, Hôpital Foch [Suresnes], Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Le Trait d'Union, centre de soins de l'infection par le VIH [CHU Strasbourg], CHU Strasbourg, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université de Bourgogne (UB), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Hôpital universitaire Robert Debré [Reims], Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Malbec, Odile, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CHU Saint-Antoine], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Statistics In System biology and Translational Medicine (SISTM), Inria Bordeaux - Sud-Ouest, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)- Bordeaux population health (BPH)
Subjects: Microbiology (medical), Adult, Male, hepatitis C virus, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, Hepacivirus, 030204 cardiovascular system & hematology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Interquartile range, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Sida, biology, business.industry, Proportional hazards model, Incidence (epidemiology), cardiovascular, Hazard ratio, HIV, Middle Aged, medicine.disease, biology.organism_classification, Hepatitis C, coinfection, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Cardiovascular Diseases, Cohort, Coinfection, Female, atherosclerosis, business, Viral load
Abstract: Background An increased risk of cardiovascular disease (CVD) was reported in patients coinfected with human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis C virus (HCV), without identifying factors associated with atherosclerotic CVD (ASCVD) events. Methods HIV-HCV coinfected patients were enrolled in the Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les hépatites virales (ANRS) CO13 HEPAVIH nationwide cohort. Primary outcome was total ASCVD events. Secondary outcomes were coronary and/or cerebral ASCVD events, and peripheral artery disease (PAD) ASCVD events. Incidences were estimated using the Aalen-Johansen method. Factors associated with ASCVD were identified using cause-specific Cox proportional hazards models. Results At baseline, median age of the study population (N = 1213) was 45.4 (interquartile range [IQR] 42.1−49.0) years and 70.3% were men. After a median follow-up of 5.1 (IQR 3.9−7.0) years, the incidence was 6.98 (95% confidence interval [CI], 5.19−9.38) per 1000 person-years for total ASCVD events, 4.01 (2.78−6.00) for coronary and/or cerebral events, and 3.17 (2.05−4.92) for PAD ASCVD events. Aging (hazard ratio [HR] 1.06; 95% CI, 1.01−1.12), prior CVD (HR 8.48; 95% CI, 3.14−22.91), high total cholesterol (HR 1.43; 95% CI, 1.11−1.83), high-density lipoprotein cholesterol (HR 0.22; 95% CI, 0.08−0.63), statin use (HR 3.31; 95% CI, 1.31−8.38), and high alcohol intake (HR 3.18; 95% CI, 1.35−7.52) were independently associated with total ASCVD events, whereas undetectable baseline viral load (HR 0.41, 95% CI, 0.18−0.96) was associated with coronary and/or cerebral events. Conclusions HIV-HCV coinfected patients experienced a high incidence of ASCVD events. Some traditional cardiovascular risk factors were the main determinants of ASCVD. Controlling cholesterol abnormalities and maintaining undetectable HIV RNA are essential to control cardiovascular risk.
Published: 2021

14. Herbal medicine for epilepsy seizures in Asia, Africa and Latin America: A systematic review

Author: Mayoura Bounlu, Pierre-Marie Preux, Voa Ratsimbazafy, Farid Boumediene, Geneviève Bourdy, Jaime Luna, François Chassagne, Emilie Auditeau, Jeremy Jost, Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Emory University [Atlanta, GA], Institut de la Francophonie pour la Médecine Tropicale (IFMT), Service de Pharmacie Centrale [CHU Limoges], CHU Limoges, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CCSD, Accord Elsevier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Asia, Latin Americans, Chemical models, 03 medical and health sciences, Epilepsy, 0302 clinical medicine, Drug Discovery, Text messaging, Humans, Medicine, Medicinal plants, 030304 developmental biology, 2. Zero hunger, Pharmacology, 0303 health sciences, Plants, Medicinal, Traditional medicine, business.industry, Medicinal plant, Chronic epilepsy, medicine.disease, Seizure, 3. Good health, Latin America, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, 030220 oncology & carcinogenesis, Ethnopharmacology, Africa, Quality of Life, Plant species, Anticonvulsants, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Pharmacological models, Critical assessment, Medicine, Traditional, Plant Preparations, Herbal medicine, business, Phytotherapy
Abstract: Relevance More than 70 million people suffer epilepsy worldwide. Low availability of anti-epileptic drugs, side-effects and drug-resistant epilepsy affect the quality of life of persons with epilepsy in countries with a poorly developed health system. Herbal medicine is frequently used for this neurological condition. Objectives The main objective was to provide a detailed analysis of Herbal Medicine used for neurological conditions related with epilepsy in Asia, Africa and Latin America. More broadly, this study aims to highlight species with assessed efficacy (cross-cultural use, pharmacological effects on models of epileptic seizures) and safety (toxicological data in laboratory) information, in order to point out species of interest for further studies. A critical assessment of models used in pharmacological evaluations was done. Materials and methods The systematic search for Herbal Medicine treatments for epilepsy was performed considering all the articles published until February 2017 through three scientific databases. It was made with MeSH terms and free text defining the epilepsy seizures and plant species. We included studies carried out in Asia, Africa and Latin America. All articles reporting the use of Herbal Medicine to treat epilepsy seizures and/or their pharmacological evaluation were retained for further analysis. Results The search yielded 1886 articles, from 30 countries. Hundred and six articles published between 1982 and 2017 were included, corresponding to a total of 497 use reports for 351 plant species belonging to 106 families. Three hundred and seventy seven use reports corresponding to 264 species in ethnopharmacological surveys and 120 evaluation reports corresponding to 107 species were noted. Twenty-nine reports, for 29 species, combined both ethnopharmacological and pharmacological evaluation. Fifty eight studies originated from Africa, 35 studies from Asia and 18 from Latin America. Highest use report was noted for rhizomes of Acorus calamus L. (12 use report in 1 country) and leaves of Bacopa monnieri (L.) Wettst. (8 use report in 2 countries). Therefore these species display the highest use convergence. Regarding pharmacological evaluation most studied species were: Leonotis leonurus (L.) R.Br. (4 evaluation reports in 1 country), Uncaria rhynchophylla (Miq.) Miq. ex Havil. (3 evaluation reports in 2 countries) and Calotropis gigantea (L.) Dryand. (3 evaluation reports in 1 country). In vivo models of chronic epilepsy were more relevant than in vitro models or chemical models inducing acute seizures for pharmacological assessment. Conclusion Species with the highest use report were not those with pharmacological evaluation. It will be pertinent to assess the pharmacological effects and safety of medicinal plants used mostly by traditional healers on predictive models of seizures.
Published: 2019

15. Predictive Factors for Hepatocellular Carcinoma in Chronic Hepatitis B Using Structural Equation Modeling: A Prospective Cohort Study

Author: Jean-Pierre Bronowicki, Clovis Lusivika-Nzinga, Jean-Charles Duclos-Vallée, Ghassan Riachi, Anne Minello, Thomas Decaens, Louis d’Alteroche, Fabrice Carrat, Isabelle Portal, François Raffi, Fabien Zoulim, Sophie Metivier, Véronique Loustaud-Ratti, François Habersetzer, Jérôme Gournay, Olivier Chazouillères, Paul Calès, Victor de Ledinghen, Xavier Causse, Stanislas Pol, Céline Dorival, Isabelle Rosa, Dominique Larrey, Tarik Asselah, Marc Bourlière, Claire Geist, Nathanael Lapidus, Laurent Lam, Moana Gelu-Simeon, Laurent Alric, Vincent Leroy, Hélène Fontaine, Armand Abergel, Nathalie Ganne, Dominique Thabut, Philippe Mathurin, Albert Tran, Dominique Guyader, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CHU Saint-Antoine], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] (CHB), Hôpital Paul Brousse-Assistance Publique - Hôpitaux de Paris, CRHU Nancy, Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHI Créteil, Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe], Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université d'Angers (UA), Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), CHU Rouen, Normandie Université (NU), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], The ANRS CO22 HEPATHER cohort is sponsored and funded by INSERM‐ANRS and conducted in collaboration with Association Française pour l'étude du Foie (AFEF). The cohort received supports from ANR (Agence Nationale de la Recherche), DGS (Direction Générale de la Santé), MSD, Janssen, Gilead, Abbvie, BMS, and Roche., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHU Saint-Antoine], Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and Jonchère, Laurent
Subjects: Male, Liver Cancer, medicine.medical_specialty, Hepatocarcinogenesis, Hepatitis B virus, Carcinoma, Hepatocellular, Epidemiology, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Liver transplantation, Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer, medicine.disease_cause, Gastroenterology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Hepatitis B, Chronic, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, Prospective Studies, Prospective cohort study, Aged, Hepatology, business.industry, Liver Neoplasms, Carcinoma, Hepatocellular, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Cohort, 030211 gastroenterology & hepatology, Metabolic syndrome, business, Liver cancer
Abstract: International audience; BACKGROUND and AIMS: The factors predicting hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in chronic hepatitis B need to be precisely known to improve its detection. We identified pathways and individual predictive factors associated with HCC in the ANRS CO22 HEPATHER cohort. METHODS: The study analyzed HBV-infected patients recruited at 32 French expert hepatology centers from August 6, 2012, to December 31, 2015. We excluded patients with chronic HCV, HDV and a history of HCC, decompensated cirrhosis or liver transplantation. Structural equation models were developed to characterize the causal pathways leading to HCC occurrence. The association between clinical characteristics (age, gender, body-mass index, liver fibrosis, alcohol consumption, smoking status, diabetes, hypertension, dyslipidemia, alpha-fetoprotein, HBV DNA levels, antiviral therapy) and incident HCC was quantified. RESULTS: Among the 4,489 patients included, 33 patients reported incident HCC. The median follow-up was 45.2 months. Age (β = 0.18 by decade, 95% CI 0.14-0.23), male gender (β = 0.23, 95% CI 0.18-0.29), metabolic syndrome (β = 0.28, 95% CI 0.22-0.33), alcohol consumption (β = 0.09, 95% CI 0.05-0.14) and HBV DNA (β = 0.25, 95% CI 0.17-0.34) had a significant and direct effect on the occurrence of advanced liver fibrosis. Liver fibrosis (β = 0.71, 95% CI 0.55-0.87) predicted, in turn, the occurrence of HCC. CONCLUSIONS: Liver fibrosis mediates the effects of age, gender, alcohol, metabolic syndrome and HBV DNA on the occurrence of HCC. Elderly men with chronic hepatitis B, risky alcohol use, advanced liver fibrosis, metabolic syndrome and high HBV DNA levels should be monitored closely to detect the development of HCC.
Published: 2021

16. Murlentamab, a Low Fucosylated Anti-Müllerian Hormone Type II Receptor (AMHRII) Antibody, Exhibits Anti-Tumor Activity through Tumor-Associated Macrophage Reprogrammation and T Cell Activation

Author: Mélissa Prat, Marie Salon, Thibault Allain, Olivier Dubreuil, Grégory Noël, Laurence Preisser, Bérangère Jean, Lydie Cassard, Fanny Lemée, Isabelle Tabah-Fish, Bernard Pipy, Pascale Jeannin, Jean-François Prost, Jean-Marc Barret, Agnès Coste, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Geroscience and rejuvenation research center (RESTORE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), GamaMabs Pharma SA [Toulouse] ( Centre Pierre Potier), Oncopole de Toulouse-Centre Pierre Potier [Toulouse], Institut Jules Bordet [Bruxelles], Faculté de Médecine [Bruxelles] (ULB), Université libre de Bruxelles (ULB)-Université libre de Bruxelles (ULB), Innate Immunity and Immunotherapy (CRCINA-ÉQUIPE 7), Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Nantes-Angers (CRCINA), Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Université d'Angers (UA)-Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Institut Gustave Roussy (IGR), Analyse moléculaire, modélisation et imagerie de la maladie cancéreuse (AMMICa), Institut Gustave Roussy (IGR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bernardo, Elizabeth, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Nantes - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (UFR MEDECINE), and Université de Nantes (UN)-Université de Nantes (UN)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université d'Angers (UA)
Subjects: glyco-engineered antibody, ovarian cancer, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, tumor-associated macrophages, murlentamab, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, adaptive immunity, immunotherapy, lcsh:Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, lcsh:RC254-282, Article
Abstract: Simple Summary AMHRII, the anti-Müllerian hormone receptor, is selectively expressed in normal sexual organs in healthy adults but is also re-expressed in ovarian, colorectal and lung cancers. In this context, we developed murlentamab, a humanized glyco-engineered anti-AMHRII monoclonal antibody, currently in clinical trial. Preliminary data suggest that murlentamab anti-tumor activity involves immune response activation. Thus, in vitro experiments were performed to precisely characterize the murlentamab effect on the human immune system. We show that murlentamab treatment is associated with evidences of innate and adaptive immune cell activation in cancer patient samples. Moreover, we demonstrate that the murlentamab opsonization of AMHRII-expressing ovarian tumor cells promotes a polarization switch of both naïve and tumor-associated macrophages towards an anti-tumor M1-like phenotype. Our work also supports that, through macrophage reeducation, murlentamab activates an anti-tumor adaptive immune response. Finally, the combination of murlentamab with pembrolizumab confirmed novel clinical perspectives of murlentamab association with checkpoint inhibitors and other immuno-modulators. Abstract AMHRII, the anti-Müllerian hormone receptor, is selectively expressed in normal sexual organs but is also re-expressed in gynecologic cancers. Hence, we developed murlentamab, a humanized glyco-engineered anti-AMHRII monoclonal antibody currently in clinical trial. Low-fucosylated antibodies are known to increase the antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP) potency of effector cells, but some preliminary results suggest a more global murlentamab-dependent activation of the immune system. In this context, we demonstrate here that the murlentamab opsonization of AMHRII-expressing ovarian tumor cells, in the presence of unstimulated- or tumor-associated macrophage (TAM)-like macrophages, significantly promotes macrophage-mediated ADCC and shifts the whole microenvironment towards a pro-inflammatory and anti-tumoral status, thus triggering anti-tumor activity. We also report that murlentamab orients both unstimulated- and TAM-like macrophages to an M1-like phenotype characterized by a strong expression of co-stimulation markers, pro-inflammatory cytokines and chemokines, favoring T cell recruitment and activation. Moreover, we show that murlentamab treatment shifts CD4+ Th1/Th2 balance towards a Th1 response and activates CD8+ T cells. Altogether, these results suggest that murlentamab, through naïve macrophage orientation and TAM reprogrammation, stimulates the anti-tumor adaptive immune response. Those mechanisms might contribute to the sustained clinical benefit observed in advanced cancer patients treated with murlentamab. Finally, the enhanced murlentamab activity in combination with pembrolizumab opens new therapeutic perspectives.
Published: 2021

17. A Citrullus colocynthis fruit extract acutely enhances insulin-induced GLUT4 translocation and glucose uptake in adipocytes by increasing PKB phosphorylation

Author: Mohamed Haddad, Farid Lahfa, Farah Drissi, Teresa Gonzalez, Franck Peiretti, Roland Govers, Jean-François Tanti, Nicolas Fabre, Centre recherche en CardioVasculaire et Nutrition = Center for CardioVascular and Nutrition research (C2VN), Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Aix Marseille Université (AMU), Université Côte D'Azur, Inserm, Centre Méditerranéen de Médecine Moleculaire( C3M), Team « Cellular and Molecular Pathophysiology of Obesity and Diabetes », Laboratoire de biomécanique de Toulouse (EA 3697), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA), Université Aboubekr Belkaid - University of Belkaïd Abou Bekr [Tlemcen], Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Tanti, Jean-François, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Traditional medicine Powered by Editorial Manager® and ProduXion Manager® from Aries Systems Corporation, Glucose uptake, medicine.medical_treatment, Chromosomal translocation, Pharmacology, Signal transduction, Mice, 0302 clinical medicine, Drug Discovery, colocynthis, Adipocytes, Insulin, Phosphorylation, 2. Zero hunger, 0303 health sciences, Chromatography, Glucose Transporter Type 4, biology, Chemistry, Diabetes, Type 2 diabetes, Cucurbitacins, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, 3. Good health, [SDV.MHEP.CSC] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Type 2 Diabetes, Protein Transport, 030220 oncology & carcinogenesis, Carbohydrate Metabolism, Cell Survival, Citrullus, 03 medical and health sciences, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, Citrullus colocynthis, 3T3-L1 Cells, medicine, Animals, Hypoglycemic Agents, Viability assay, 030304 developmental biology, Plant Extracts, Traditional herbal medicine, Metabolism, Insulin enhancers, Insulin receptor, Glucose, Fruit, biology.protein, Medicine, Traditional, Insulin Resistance, GLUT4Insulin enhancers, Proto-Oncogene Proteins c-akt, GLUT4
Abstract: Ethnopharmacological relevance Citrullus colocynthis (L.) Schrad is a common fruit in traditional medicine and used as remedy against various diseases, especially diabetes. Up to now, its anti-diabetic effects have been fully attributed to its enhancement of pancreatic insulin secretion. Whether C. colocynthis also ameliorates insulin action in peripheral tissues has not been investigated. Aim of the study In the present study, using 3T3-L1 adipocytes as cell model, we have investigated whether colocynth fruit extracts affect insulin action. Materials and methods Various extracts were prepared from the C. colocynthis fruit and screened using a cell-based 96 well plate GLUT4 translocation assay. Promising extracts were further studied for their effects on glucose uptake and cell viability. The effect on insulin signal transduction was determined by Western blot and the molecular composition was established by LC-MS. Results The ethyl acetate fractions of aqueous non-defatted extracts of seed and pulp, designated Sna1 and Pna1, acutely enhanced insulin-induced GLUT4 translocation. In accordance, both extracts increased insulin-stimulated cellular glucose uptake. Pna1, which displayed greater effects on GLUT4 and glucose uptake than Sna1, was further investigated and was demonstrated to increase GLUT4 translocation without changing the half-maximum dose (ED50) of insulin, nor changing GLUT4 translocation kinetics. At the molecular level, Pna1 was found to enhance insulin-induced PKB phosphorylation without changing phosphorylation of the insulin receptor. Pna1 appeared not to be toxic to cells and, like insulin, restored cell viability during serum starvation. By investigating the molecular composition of Pna1, nine compounds were identified that made up 87% of the mass of the extract, one of which is likely to be responsible for the insulin-enhancing effects of Pna1. Conclusions The C. colocynthis fruit possesses insulin-enhancing activity. This activity may explain in part its anti-diabetic effects in traditional medicine. It also identifies the C. colocynthis as a source of a potential novel insulin enhancer that may prove to be useful to reduce hyperglycemia in type 2 diabetes.
Published: 2021

18. The Threat of Multiple Liver Carcinogens in the Population of Laos: A Review

Author: Pascal Pineau, Agnès Marchio, Eric Deharo, Philavanh Sitbounlang, Phimpha Paboriboune, Cheriet Rauline, Samia, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Ministry of Health [Laos], Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Philavanh Sitbounlang is supported by the European Union’s Horizon 2020 Marie Sklodowska-Curie Actions MSCA—Research and Innovation Staff Exchange—RISE under grant agreement No 823935., We are grateful to Elizabeth Elliott for editorial assistance and constructive criticisms. The authors would like to thank Jean Marc Dubost for the photo of artisanal alcohol production device, taken in Sayaboury Province, Laos., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.medical_specialty, mutagens, primary liver cancer, hepatitis virus, [SDV]Life Sciences [q-bio], Population, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Environmental health, medicine, Opisthorchis viverrini, education, 2. Zero hunger, education.field_of_study, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, biology, business.industry, Liver cell, Incidence (epidemiology), Public health, hepatocellular carcinoma, Liver fluke, Hepatitis B, medicine.disease, biology.organism_classification, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, 030211 gastroenterology & hepatology, Liver cancer, business, cholangiocarcinoma, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Laos is a landlocked country in South East Asia, ranking fifth for primary liver cancer incidence worldwide. Risk factors that might explain this worrying situation are poorly known. We conducted a review of the literature concerning the etiologies of terminal liver diseases in Laos. A double infectious burden with hepatitis B and C viruses and the liver fluke Opisthorchis viverrini seems to be the main cause of the high liver cancer incidence. Moreover, it was also suggested that mutagenic substances frequently found in tobacco, alcoholic beverages, fermented fish, and mold-contaminated cereals or nuts, which are all substances heavily consumed by Lao people, lead to the accumulation of DNA mutations in the liver cell genome causing tumor processes. However, the respective proportions of liver cancer cases attributable to each category of infections and substances consumed, as well as the histological nature of the neoplasia are still not precisely documented in Laos. The international medical and scientific communities as well as public health stakeholders should urgently consider the alarming situation of liver health in Laos to stimulate both research and subsequent implementation of prevention policies.
Published: 2021

19. Personalized surveillance for hepatocellular carcinoma in cirrhosis – using machine learning adapted to HCV status

Author: Jean-Marie Péron, Dominique Larrey, Albert Tran, Marc Bourlière, Paul Calès, Thong Dao, Eric Nguyen-Khac, Olivier Chazouillères, Brigitte Bernard-Chabert, Pierre Attali, Ghassan Riachi, Jean-Didier Grangé, Dominique Guyader, Pierre Nahon, Victor de Ledinghen, Claire Wartelle, Ariane Mallat, Christos Christidis, Christophe Pilette, Vincent Di Martino, Jean-Pierre Bronowicki, Stanislas Pol, Philippe Mathurin, Dominique Roulot, Denis Ouzan, Jean-Frédéric Blanc, Louis d’Alteroche, David Zucman, Jean-Pierre Zarski, Tarik Asselah, Etienne Audureau, Dominique Thabut, Angela Sutton, Fabien Zoulim, Laurent Alric, Carole Cagnot, Christine Silvain, Armand Abergel, Richard Layese, Fabrice Carrat, Service de santé publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Clinical Epidemiology and Ageing : Geriatrie Soins Primaires et Santé Publique (CEpiA), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Investigation Clinique [Rennes] (CIC), Université de Rennes (UR)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Institut Arnault Tzanck, Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie - Center for Research in Transplantation and Translational Immunology (U1064 Inserm - CR2TI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Nantes Université - UFR de Médecine et des Techniques Médicales (Nantes Univ - UFR MEDECINE), Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université - pôle Santé, Nantes Université (Nantes Univ)-Nantes Université (Nantes Univ), Hôpital Michallon, Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Hôpital Pontchaillou-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: 0301 basic medicine, Cirrhosis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Machine learning, computer.software_genre, HCV clearance, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Prothrombin time, Hepatology, medicine.diagnostic_test, business.industry, Incidence (epidemiology), Cancer, medicine.disease, digestive system diseases, 3. Good health, 030104 developmental biology, Hepatocellular carcinoma, Cohort, Screening, 030211 gastroenterology & hepatology, Artificial intelligence, Liver cancer, business, Risk assessment, computer
Abstract: Background & Aims Refining hepatocellular carcinoma (HCC) surveillance programs requires improved individual risk prediction. Thus, we aimed to develop algorithms based on machine learning approaches to predict the risk of HCC more accurately in patients with HCV-related cirrhosis, according to their virological status. Methods Patients with compensated biopsy-proven HCV-related cirrhosis from the French ANRS CO12 CirVir cohort were included in a semi-annual HCC surveillance program. Three prognostic models for HCC occurrence were built, using (i) Fine-Gray regression as a benchmark, (ii) single decision tree (DT), and (iii) random survival forest for competing risks survival (RSF). Model performance was evaluated from C-indexes validated externally in the ANRS CO22 Hepather cohort (n = 668 enrolled between 08/2012–01/2014). Results Out of 836 patients analyzed, 156 (19%) developed HCC and 434 (52%) achieved sustained virological response (SVR) (median follow-up 63 months). Fine-Gray regression models identified 6 independent predictors of HCC occurrence in patients before SVR (past excessive alcohol intake, genotype 1, elevated AFP and GGT, low platelet count and albuminemia) and 3 in patients after SVR (elevated AST, low platelet count and shorter prothrombin time). DT analysis confirmed these associations but revealed more complex interactions, yielding 8 patient groups with varying cancer risks and predictors depending on SVR achievement. On RSF analysis, the most important predictors of HCC varied by SVR status (non-SVR: platelet count, GGT, AFP and albuminemia; SVR: prothrombin time, ALT, age and platelet count). Externally validated C-indexes before/after SVR were 0.64/0.64 [Fine-Gray], 0.60/62 [DT] and 0.71/0.70 [RSF]. Conclusions Risk factors for hepatocarcinogenesis differ according to SVR status. Machine learning algorithms can refine HCC risk assessment by revealing complex interactions between cancer predictors. Such approaches could be used to develop more cost-effective tailored surveillance programs. Lay summary Patients with HCV-related cirrhosis must be included in liver cancer surveillance programs, which rely on ultrasound examination every 6 months. Hepatocellular carcinoma (HCC) screening is hampered by sensitivity issues, leading to late cancer diagnoses in a substantial number of patients. Refining surveillance periodicity and modality using more sophisticated imaging techniques such as MRI may only be cost-effective in patients with the highest HCC incidence. Herein, we demonstrate how machine learning algorithms (i.e. data-driven mathematical models to make predictions or decisions), can refine individualized risk prediction.
Published: 2020

20. Alsinol, an arylamino alcohol derivative active against Plasmodium, Babesia, Trypanosoma, and Leishmania: past and new outcomes

Author: Alexis Valentin, Cécile Minet, Eric Deharo, María Helena Arias, Isabelle Fabing, Sandra Bourgeade-Delmas, Isabelle Chantal, Jonathan Sorres, Véronique Eparvier, David Berthier, Giovanny Garavito, Silvia Galiano, Miguel Quiliano, Didier Stien, Ignacio Aldana, Universidad Nacional de Colombia [Bogotà] (UNAL), Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas (Lima) (UPC), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes (LBBM), PIERRE FABRE-EDF (EDF)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Universidad de Navarra [Pamplona] (UNAV), Representation du Laos (IRD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)
Subjects: Plasmodium, [SDV]Life Sciences [q-bio], Expérimentation in vivo, 030308 mycology & parasitology, Mice, 0302 clinical medicine, Chloroquine, Chlorocebus aethiops, Babesia divergens, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Leishmania, 0303 health sciences, biology, Contrôle de maladies, General Medicine, Amino Alcohols, Expérimentation in vitro, 3. Good health, Infectious Diseases, Treatment Outcome, S50 - Santé humaine, Parasitose, medicine.drug, Trypanosoma, Cell Survival, 030231 tropical medicine, Plasmodium falciparum, Antiprotozoal Agents, Babesia, 03 medical and health sciences, Plasmodium falciparum gametocytes, parasitic diseases, medicine, Gametocyte, Animals, Protozoa, Amastigote, Vero Cells, Efficacité, Life Cycle Stages, Protozoan Infections, General Veterinary, biology.organism_classification, Virology, Disease Models, Animal, Insect Science, Antiprotozoan, Parasitology, Alsinol, [CHIM.OTHE]Chemical Sciences/Other
Abstract: Malaria, babesiosis, trypanosomosis, and leishmaniasis are some of the most life-threatening parasites, but the range of drugs to treat them is limited. An effective, safe, and low-cost drug with a large activity spectrum is urgently needed. For this purpose, an aryl amino alcohol derivative called Alsinol was resynthesized, screened in silico, and tested against Plasmodium, Babesia, Trypanosoma, and Leishmania. In silico Alsinol follows the Lipinski and Ghose rules. In vitro it had schizontocidal activity against Plasmodium falciparum and was able to inhibit gametocytogenesis; it was particularly active against late gametocytes. In malaria-infected mice, it showed a dose-dependent activity similar to chloroquine. It demonstrated a similar level of activity to reference compounds against Babesia divergens, and against promastigotes, and amastigotes stages of Leishmania in vitro. It inhibited the in vitro growth of two African animal strains of Trypanosoma but was ineffective in vivo in our experimental conditions. It showed moderate toxicity in J774A1 and Vero cell models. The study demonstrated that Alsinol has a large spectrum of activity and is potentially affordable to produce. Nevertheless, challenges remain in the process of scaling up synthesis, creating a suitable clinical formulation, and determining the safety margin in preclinical models. Departamento Administrativo de Ciencia, TecnologÃa e InnovaciÃ³n (COLCIENCIAS) Revisión por pares
Published: 2020

21. 8-Alkynyl-3-nitroimidazopyridines display potent antitrypanosomal activity against both T. b. brucei and cruzi

Author: Line Seguy, Cyril Fersing, Sébastien Hutter, Marc Since, Alexandre Destere, Bertrand Courtioux, Julien Pedron, Sophie Corvaisier, Elisa Boutet-Robinet, Pascal Rathelot, Alexis Valentin, Alix Sournia-Saquet, Jean Yves Brossas, Caroline Castera-Ducros, Dominique Mazier, Sandra Bourgeade-Delmas, Aurélie Malzert-Fréon, Susan Wyllie, Romain Paoli-Lombardo, Clotilde Boudot, Patrice Vanelle, Jean Luc Stigliani, Nicolas Primas, Luc Paris, Nadine Azas, Emilie Pinault, Pierre Verhaeghe, Alan H. Fairlamb, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Biologie Intégrative Santé Chimie Environnement (BISCEm), Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Service de parasitologie - mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), University of Dundee, Contaminants & Stress Cellulaire (ToxAlim-COMICS), ToxAlim (ToxAlim), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), CHU Limoges, Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Service de Parasitologie - Mycologie [CHU Pitié-Salpétrière], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Aix-Marseille Université, Université de Toulouse, CNRS, CCSD, Accord Elsevier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), and Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INP - PURPAN)
Subjects: SARs, Pyridines, Stereochemistry, Trypanosoma cruzi, [SDV]Life Sciences [q-bio], Trypanosoma brucei brucei, Sonogashira coupling, 01 natural sciences, Structure-Activity Relationship, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Nitroaromatic, Parasitic Sensitivity Tests, Drug Discovery, medicine, Moiety, Cytotoxicity, Comet assay, Imidazo[1, 030304 developmental biology, Pharmacology, 0303 health sciences, 2-a]pyridine, [SDV.MHEP] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Dose-Response Relationship, Drug, Molecular Structure, 010405 organic chemistry, Chemistry, Organic Chemistry, Kinetoplastids, General Medicine, Nitroreductases, Trypanocidal Agents, 0104 chemical sciences, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Nitroimidazoles, Benznidazole, Pharmacophore, Lead compound, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology, Imidazo[1,2-alpha]pyridine, Fexinidazole, medicine.drug
Abstract: International audience; An antikinetoplastid pharmacomodulation study was done at position 8 of a previously identified pharmacophore in 3-nitroimidazo[1,2-a]pyridine series. Twenty original derivatives bearing an alkynyl moiety were synthesized via a Sonogashira cross-coupling reaction and tested in vitro, highlighting 3 potent (40 nM ≤ EC50 blood stream form≤ 70 nM) and selective (500 ≤ SI ≤ 1800) anti-T. brucei brucei molecules (19, 21 and 22), in comparison with four reference drugs. Among these hit molecules, compound 19 also showed the same level of activity against T. cruzi (EC50 amastigotes = 1.2 μM) as benznidazole and fexinidazole. An in vitro comet assay showed that nitroaromatic derivative 19 was not genotoxic. It displayed a low redox potential value (-0.68 V/NHE) and was shown to be bioactivated by type 1 nitroreductases both in Leishmania and Trypanosoma. The SAR study indicated that an alcohol function improved aqueous solubility while maintaining good activity and low cytotoxicity when the hydroxyl group was at position beta of the alkyne triple bond. Hit-compound 19 was also evaluated regarding in vitro pharmacokinetic data: 19 is BBB permeable (PAMPA assay), has a 16 min microsomal half-life and a high albumin binding (98.5%). Moreover, compound 19 was orally absorbed and was well tolerated in mouse after both single and repeated administrations at 100 mg/kg. Its mouse plasma half-life (10 h) is also quite encouraging, paving the way toward further efficacy evaluations in parasitized mouse models, looking for a novel antitrypanosomal lead compound.
Published: 2020

22. Identification of compounds active against quiescent artemisinin-resistant Plasmodium falciparum parasites via the quiescent-stage survival assay (QSA)

Author: Sandie Menard, Manel Ouji, Michel Nguyen, Lucie Paloque, Thibaud Reyser, Françoise Benoit-Vical, Jean-Michel Augereau, Benoit Witkowski, Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Malaria Molecular Epidemiology (MMEU), Institut Pasteur du Cambodge, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP)-Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CNRS, ANR-13-BSV3-0018,MALARTRES,Résistance de Plasmodium aux antipaludiques de la famille des artémisinines(2013), ANR-14-CE35-0003,CAP-G4,Development of photo-reactive probes to capture G-quadruplex DNA in complex with endogenous proteins and exogenous synthetic ligands(2014), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Malaria Molecular Epidemiology, Gulli, Marie-Hélène, Blanc 2013 - Résistance de Plasmodium aux antipaludiques de la famille des artémisinines - - MALARTRES2013 - ANR-13-BSV3-0018 - Blanc 2013 - VALID, Appel à projets générique - Development of photo-reactive probes to capture G-quadruplex DNA in complex with endogenous proteins and exogenous synthetic ligands - - CAP-G42014 - ANR-14-CE35-0003 - Appel à projets générique - VALID, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Microbiology (medical), [CHIM.THER] Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Plasmodium falciparum, Drug Resistance, Protozoan Proteins, Context (language use), Drug resistance, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, Pharmacology, 03 medical and health sciences, Antimalarials, Chloroquine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, parasitic diseases, medicine, Animals, Pharmacology (medical), Parasites, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Artemisinin, Malaria, Falciparum, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, biology, 030306 microbiology, Drug discovery, biology.organism_classification, Artemisinins, 3. Good health, Infectious Diseases, Drug development, [SDV.SP.PHARMA] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.SP.PHARMA]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Pharmacology, Cambodia, Artemisinine, Atovaquone, [SDV.MP.PAR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, medicine.drug
Abstract: Background Quiescence is an unconventional mechanism of Plasmodium survival, mediating artemisinin resistance. This phenomenon increases the risk of clinical failures following artemisinin-based combination therapies (ACTs) by slowing parasite clearance and allowing the selection of parasites resistant to partner drugs. Objectives To thwart this multiresistance, the quiescent state of artemisinin-resistant parasites must be taken into consideration from the very early stages of the drug discovery process. Methods We designed a novel phenotypic assay we have named the quiescent-stage survival assay (QSA) to assess the antiplasmodial activity of drugs on quiescent parasites. This assay was first validated on quiescent forms from different artemisinin-resistant parasite lines (laboratory strain and field isolates), using two reference drugs with different mechanisms of action: chloroquine and atovaquone. Furthermore, the efficacies of different partner drugs of artemisinins used in ACTs were investigated against both laboratory strains and field isolates from Cambodia. Results Our results highlight that because of the mechanism of quiescence and the respective pharmacological targets of drugs, drug efficacies on artemisinin-resistant parasites may be different between quiescent parasites and their proliferating forms. Conclusions These data confirm the high relevance of adding the chemosensitivity evaluation of quiescent parasites by the specific in vitro QSA to the antiplasmodial drug development process in the current worrisome context of artemisinin resistance.
Published: 2020

23. Divergent Roles for Macrophage C-type Lectin Receptors, Dectin-1 and Mannose Receptors, in the Intestinal Inflammatory Response

Author: Rahabi, Mouna, Jacquemin, Godefroy, Prat, Mélissa, Meunier, Etienne, Alaeddine, Mohamad, Bertrand, Bénédicte, Lefèvre, Lise, Benmoussa, Khaddouj, Batigne, Philippe, Aubouy, Agnès, Auwerx, Johan, Kirzin, Sylvain, Bonnet, Delphine, Danjoux, Marie, Pipy, Bernard, Alric, Laurent, Authier, Hélène, Coste, Agnès, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Delegation Regionale a la Recherche Clinique des Hopitaux de Toulouse, France : NCT01990716, Fondation pour la Recherche Medicale, France (FRM) : ECO20170637477, University Hospital of Toulouse, ANR-10-AIRT-0003,BIOASTER,BIOASTER(2010), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Suisse de Recherches Expérimentales sur le Cancer Lausanne (EPFL) (ISREC - EPFL), and CHU Toulouse [Toulouse]
Subjects: Adult, Male, Colon, Inflammasomes, Receptors, CCR2, C-type lectin receptor, colitis, [SDV]Life Sciences [q-bio], Interleukin-1beta, IBD, Down-Regulation, Receptors, Cell Surface, macrophage, Leukotriene B4, Young Adult, inflammatory bowel disease, mucosal immmunity, Animals, Antigens, Ly, Humans, Lectins, C-Type, Chemokine CCL2, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Aged, mannose receptor, Aged, 80 and over, Inflammation, Arachidonate 5-Lipoxygenase, Macrophages, Middle Aged, Inflammatory Bowel Diseases, Intestines, Mice, Inbred C57BL, Mannose-Binding Lectins, innate immune response, Female, Dectin-1, Signal Transduction
Abstract: International audience; Colonic macrophages are considered to be major effectors of inflammatory bowel diseases (IBDs) and the control of gut inflammation through C-type lectin receptors is an emerging concept. We show that during colitis, the loss of dectin-1 on myeloid cells prevents intestinal inflammation, while the lack of mannose receptor (MR) exacerbates it. A marked increase in dectin-1 expression in dextran sulfate sodium (DSS)-exposed MR-deficient mice supports the critical contribution of dectin-1 to colitis outcome. Dectin-1 is crucial for Ly6C(high)CCR2(high) monocyte population enrichment in the blood and their recruitment to inflamed colon as precursors of inflammatory macrophages. Dectin-1 also promotes inflammasome-dependent interleukin-1 beta (IL-1 beta) secretion through leukotriene B4 production. Interestingly, colonic inflammation is associated with a concomitant overexpression of dectin-1/CCL2/LTA4H and downregulation of MR on macrophages from IBD patients. Thus, MR and dectin-1 on macrophages are important mucosal inflammatory regulators that contribute to the intestinal inflammation.
Published: 2020

24. New 8-Nitroquinolinone Derivative Displaying Submicromolar in Vitro Activities against Both Trypanosoma brucei and cruzi

Author: Pedron, Julien, Boudot, Clotilde, Brossas, Jean-Yves, Pinault, Emilie, Bourgeade-Delmas, Sandra, Sournia-Saquet, Alix, Boutet-Robinet, Elisa, Destere, Alexandre, Tronnet, Antoine, Bergé, Justine, Bonduelle, Colin, Deraeve, Céline, Pratviel, Geneviève, Stigliani, Jean-Luc, Paris, Luc, Mazier, Dominique, Corvaisier, Sophie, Since, Marc, Malzert-Fréon, Aurélie, Malzert-Freón, Aureĺie, Wyllie, Susan, Milne, Rachel, Fairlamb, Alan, Valentin, Alexis, Courtioux, Bertrand, Verhaeghe, Pierre, Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Université de Limoges (UNILIM), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Contaminants & Stress Cellulaire (ToxAlim-COMICS), ToxAlim (ToxAlim), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service de Pharmacologie, toxicologie et pharmacovigilance [CHU Limoges], CHU Limoges, Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), University of Dundee, Paul Sabatier University, Région Occitanie, Wellcome Trust (WT105021), Institut Pasteur de Lille, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre d'Immunologie et de Maladies Infectieuses (CIMI), LCC-CNRS, Université de Toulouse, CNRS, UPS, Toulouse, France, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (APHP)-CHU Pitié-Salpêtrière [APHP], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Laboratoire Hétérochimie Fondamentale et Appliquée (LHFA), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immunité et Infection, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR113-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Department of Biochemistry, Medical Sciences Institute, Dundee University, Dundee, Grelier, Elisabeth, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière], and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Letter, Trypanosoma cruzi, Trypanosoma brucei brucei, Trypanosoma brucei, 01 natural sciences, Biochemistry, Drug Discovery, parasitic diseases, NTR1, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, redox potentials, biology, 010405 organic chemistry, Chemistry, 8-nitroquinolin-2(1H)-ones, Organic Chemistry, [CHIM.COOR] Chemical Sciences/Coordination chemistry, biology.organism_classification, In vitro, 0104 chemical sciences, 3. Good health, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Pharmacophore
Abstract: International audience; An antikinetoplastid pharmacomodulation study was conducted at position 6 of the 8-nitroquinolin-2(1H)-one pharmacophore. Fifteen new derivatives were synthesized and evaluated in vitro against L. infantum, T. brucei brucei, and T. cruzi, in parallel with a cytotoxicity assay on the human HepG2 cell line. A potent and selective 6-bromo-substituted antitrypanosomal derivative 12 was revealed, presenting EC50 values of 12 and 500 nM on T. b. brucei trypomastigotes and T. cruzi amastigotes respectively, in comparison with four reference drugs (30 nM ≤ EC50 ≤ 13 μM). Moreover, compound 12 was not genotoxic in the comet assay and showed high in vitro microsomal stability (half life >40 min) as well as favorable pharmacokinetic behavior in the mouse after oral administration. Finally, molecule 12 (E° = −0.37 V/NHE) was shown to be bioactivated by type 1 nitroreductases, in both Leishmania and Trypanosoma, and appears to be a good candidate to search for novel antitrypanosomal lead compounds.
Published: 2020

25. Takamalaimë, Wayana malaleja epit: une perspective holistique pour l’étude de Psidium acutangulum Mart. Ex DC. (Myrtaceae), un remède antipaludique des amérindiens wayana de Guyane

Author: Emeline Houël, Flore Nardella, Marie Fleury, Valérie Jullian, Alexis Valentin, Catherine Vonthron-Sénécheau, Pascal Villa, Adeline Obrecht, Matthias Kaiser, Eliane Bourreau, Guillaume Odonne, Véronique Eparvier, Genevieve Bourdy, Eric Deharo, Stien, D., Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale (IPPTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Patrimoines Locaux et Gouvernance (PALOC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Innovation Thérapeutique (LIT), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plate-forme de chimie biologique intégrative de Strasbourg (PCBiS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA), University of Basel (Unibas), Institut Pasteur de la Guyane, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), Laboratoire Ecologie, évolution, interactions des systèmes amazoniens (LEEISA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Chimie des Substances Naturelles (ICSN), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes (LBBM), PIERRE FABRE-EDF (EDF)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Banyuls (OOB), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Patrimoines locaux, Environnement et Globalisation (PALOC), Sorbonne Université (SU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire Ecologie, Evolution, Interactions des Systèmes amazoniens (LEEISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Guyane (UG)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER), Fleury, M., Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience
Published: 2020

26. Adaptation of a microbead assay for the easy evaluation of traditional anti-sickling medicines: application to DREPANOSTAT and FACA

Author: Villaret, Joran, Marti, Guillaume, Dubois, Frédérique, Reybier, Karine, Gaudre, Noémie, Haddad, Mohamed, Valentin, Alexis, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse], Pagès, Nathalie, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Zanthoxylum, [SDV.SP.MED] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Plant Extracts, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:RM1-950, Drug Evaluation, Preclinical, traditional medicines, Zanthoxylum zanthoxiloides, Anemia, Sickle Cell, metabolomics, Microspheres, [SDV] Life Sciences [q-bio], lcsh:Therapeutics. Pharmacology, Calotropis, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Antisickling Agents, Sickle cell anemia, UHPLC-HRMS, Humans, Medicine, Traditional, Calotropis procera, Research Article
Abstract: International audience; Context: Sickle cell disease is a common inherited blood disorder affecting millions of people worldwide. Due to lack of progress in drug discovery for a suitable treatment, sufferers often turn to traditional medicines that take advantage of the plant extracts activity used by traditional healers.Objective: This study optimizes an anti-sickling screening test to identify preparations capable of reverting sickle cells back to the morphology of normal red blood cells. We focused on the miniaturization and practicability of the assay, so that it can be adapted to the laboratory conditions commonly found in less developed countries.Materials and methods: We tested two traditional anti-sickling herbal medicines, FACA® and DREPANOSTAT®, composed of Zanthoxylum zanthoxyloides (Lam.) Zepern. & Timler (Rutaceae) and Calotropis procera (Aiton) Dryand. (Apocynaceae) at screening concentrations of hydroethanol extracts from 0.2 to 1 mg/mL. Potential bioactive molecules present in the extracts were profiled using Ultra High Performance Liquid Chromatography coupled with High Resolution Mass Spectrometry (UHPLC-HRMS/MS) method, identified through HRMS, MS/MS spectra and in silico fragmentation tools.Results: Hydroethanol extracts of FACA® and DREPANOSTAT® showed low anti-sickling activity, inhibiting less than 10% of the sickling process. The UHPLC-HRMS/MS profiles identified 28 compounds (18 in FACA® and 15 in DREPANOSTAT®, including common compounds) among which l-phenylalanine is already described as potential anti-sickling agent. When used as positive control, 7 mg/mL phenylalanine reduced the sickled RBC to 52%.Discussion and conclusions: This assay has been optimized for the easy screening of plant extracts or extracted compounds from bioassay guided fractionation, valuable to laboratories from less developed countries.
Published: 2018

27. Serological diagnosis of Toxoplasma gondii

Author: Pierre Marty, Isabelle Villena, Judith Fillaux, Aurélie Guigon, Loïc Simon, Christelle Pomares, Rose-Anne Lavergne, Odile Villard, Inserm U1065, Centre Méditerranéen de Médecine Moléculaire, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Service de Parasitologie et Mycologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Département de Radiologie [HCL, Lyon], Hospices civils de Lyon (HCL), Institut de Parasitologie et de Pathologie Tropicale (IPPTS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Laboratoire de Parasitologie-Mycologie (LPM), IFR 53, Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-CHU Maison Blanche-UPRES EA 2070, Laboratoire de recherche en Hydrodynamique, Énergétique et Environnement Atmosphérique (LHEEA), École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infections Parasitaires : Transmission, Physiopathologie et Thérapeutiques (IP-TPT), Service de Santé des Armées-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Toxoplasma p35 Study Group, Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Université Côte d'Azur (UCA), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Université de Nantes (UN), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Service de Santé des Armées
Subjects: Male, [SDV]Life Sciences [q-bio], ved/biology.organism_classification_rank.species, Antibodies, Protozoan, Serology, Hammondia hammondi, 0302 clinical medicine, Child, Aged, 80 and over, 0303 health sciences, biology, Middle Aged, Neospora caninum, 3. Good health, Infectious Diseases, Child, Preschool, Female, Toxoplasma, Toxoplasmosis, Research Article, Adult, Adolescent, IgG, Veterinary (miscellaneous), 030231 tropical medicine, Toxoplasma gondii, Cross Reactions, lcsh:Infectious and parasitic diseases, 03 medical and health sciences, Young Adult, False-positive, Antigen, parasitic diseases, medicine, Humans, lcsh:RC109-216, False Positive Reactions, Serologic Tests, Aged, Pregnancy, Fetus, 030306 microbiology, ved/biology, Infant, medicine.disease, biology.organism_classification, Architect, Insect Science, Immunoglobulin G, Immunology, Animal Science and Zoology, Parasitology, Reagent Kits, Diagnostic
Abstract: Background: Primary infection byToxoplasma gondiiin pregnant women can result in serious outcomes for the foetus. A false-positive IgG result during pregnancy can lead to a misdiagnosis of past infection and to stopping preventive measures. We collected 189 sera with positive Architect®Toxo IgG assay (Abbott Laboratories) and negative IgG results with at least two other serological tests, in order to find an explanation for the suspected false-positive IgG results. We used therecomLine Toxoplasma IgG®immunoblot (Mikrogen Diagnostik) to search for specific antigenic reactivities of the sera, and the LDBio Toxo II IgG®immunoblot (LDBio Diagnostics) as a confirmatory test.Results: The bands GRA8 and/or GRA7 were positive for 148 samples (78.3%). GRA8 was the most frequent band, appearing in 133 patterns (70.4%), whereas GRA7 was present for 49 samples (25.9%). Of the 81 samples tested with LDBio®, 23 (28.4%) turned out to be positive. Of the 58 negative LDBio®tests (71.6%) (real false-positive Architect®IgG), 23 samples (39.6%) did not show either a GRA8 or p30 band byrecomLine®. Their false positivity with Architect®remains unexplained since Abbott uses these two recombinant antigens for their assay.Conclusions: The Architect®IgG false positivity forT. gondiiseems to be due to reactivity against GRA8 for the majority of the sera and GRA7 to a lesser extent. The hypothesis of past contact with parasites genetically close toT. gondiisuch asHammondia hammondiorNeospora caninumseems promising and should be assessed further.
Published: 2019

28. Extrahepatic cancers are the leading cause of death in patients achieving hepatitis B virus control or hepatitis C virus eradication

Author: Thong Dao, Pierre Nahon, Christos Christidis, Jean-Pierre Zarski, Pierre Attali, Valérie Bourcier, Ghassan Riachi, Victor de Ledinghen, Laurent Alric, Dominique Thabut, Claire Wartelle, Eric Nguyen-Khac, Patrick Marcellin, Carole Cagnot, Dominique Roulot, Christophe Pilette, Armand Abergel, Fabien Zoulim, Vincent Di Martino, Eric Letouzé, Richard Layese, Jean-Pierre Bronowicki, Jean-Frédéric Blanc, Christine Silvain, Ariane Mallat, Stanislas Pol, Denis Ouzan, Jean-Didier Grangé, Angela Sutton, Jean-Marie Péron, Brigitte Bernard-Chabert, Dominique Larrey, Albert Tran, David Zucman, Marc Bourlière, Etienne Audureau, Lawrence Serfaty, Manon Allaire, Paul Calès, Yannick Bacq, Dominique Guyader, Philippe Mathurin, Françoise Roudot-Thoraval, Service d'Hépato-Gastro-Enterologie et Nutrition [CHU Caen], Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Clinical Epidemiology and Ageing : Geriatrie Soins Primaires et Santé Publique (CEpiA), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Service d’Hépatologie [Hôpital Beaujon], Hôpital Beaujon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'hépatologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Institut Arnault Tzanck, Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Gastro-entérologie [Avicenne], Université Paris 13 (UP13)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Avicenne [AP-HP], Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Département d'hépato-gastroentérologie, CHU Grenoble-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Service d'hépatologie et de gastroentérologie [Hôpital Saint-Joseph - Marseille], Aix Marseille Université (AMU)-Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Hôpital Claude Huriez [Lille], CHU Lille, Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pascal (IP), SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18) (Inserm U955), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Tenon [AP-HP], Onxeo S.A., Département d'hépato-gastro-entérologie [Hôpital Trousseau : CHRU Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre Hospitalier d'Aix en Provence [Aix-en-Provence] (CHIAP ), CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers), Hellenic Open University [Patras], Service d'Hépato Gastroenterologie [CHU Amiens-Picardie], CHU Amiens-Picardie, Groupe de Recherche sur l'alcool et les pharmacodépendances - UMR INSERM_S 1247 (GRAP), Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims), Hôpital Foch [Suresnes], Service d'Hépatologie [CHRU Besançon], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon), Service de santé publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), ANRS (France Recherche Nord & sud Sida‐HIV Hépatites‐FRENCH)HECAM (Hepatocellular Carcinoma Multi‐Technological) Consortium, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Cochin [AP-HP], CHU Saint-Eloi, Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Centre d'investigation de la fibrose hépatique [CHU de Bordeaux] (Hôpital Haut-Lévêque ), Hôpital Haut-Lévêque [CHU de Bordeaux], Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), SIGMA Clermont, Hépatologie Gastro-Entérologie, CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand-CHU Clermont-Ferrand, Service d'hépatologie [CHU Saint-Antoine], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), UMR INSERM U955, École nationale vétérinaire d'Alfort (ENVA), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)-CHU Trousseau [APHP], Service d'Hépato-Gastro-Entérologie [CHU Pitié-Salpêtrière], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépato-gastroentérologie [CHU Amiens-Picardie], Service de Médecine Interne [Hôpital Foch, Suresnes] (SMI), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Grenoble Alpes (UGA)-CHU Grenoble, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-CHU Trousseau [APHP], Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHU Saint-Antoine], CHU Trousseau [APHP], and Univ Angers, Okina
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, Cirrhosis, Databases, Factual, [SDV]Life Sciences [q-bio], medicine.disease_cause, Gastroenterology, Cohort Studies, 0302 clinical medicine, Neoplasms, Prospective Studies, education.field_of_study, Hepatocellular / virology, Liver Neoplasms, Liver Neoplasms / epidemiology, Hepatitis C, Middle Aged, Hepatitis B, Prognosis, 3. Good health, 030220 oncology & carcinogenesis, Disease Progression, Female, Liver Cirrhosis / epidemiology, 030211 gastroenterology & hepatology, France, Databases Factual, Adult, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Hepatitis C virus, Antiviral Agents / therapeutic use, Population, Liver Neoplasms / pathology, Chronic / complications, Antiviral Agents, Risk Assessment, Article, Liver Cirrhosis / virology, 03 medical and health sciences, Hepatitis B, Chronic, Liver Cirrhosis / physiopathology, Internal medicine, medicine, Humans, education, Aged, Hepatitis B virus, Chronic / drug therapy, Neoplasms / pathology, Hepatology, business.industry, Carcinoma, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, Chronic / pathology, Survival Analysis, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Hepatocellular / epidemiology, Liver Neoplasms / virology, Neoplasms / virology Prognosis, Carcinom, Standardized mortality ratio, Hepatocellular / pathology, Male Middle Aged Neoplasms / mortality, business
Abstract: Comment in Does cirrhosis associated with well controlled viral hepatitis confer a risk for extrahepatic cancer? Yang JD, Gores GJ. Hepatology. 2018 Oct;68(4):1217-1219. doi: 10.1002/hep.30063. Epub 2018 Jul 10.; International audience; Data on extrahepatic cancers (EHCs) in compensated viral cirrhosis are limited. The objective of the prospective multicenter Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les Hépatites virales CO12 CirVir cohort was to assess the occurrence of all clinical events in patients with compensated viral cirrhosis, including all types of cancer. Patients with the following inclusion criteria were enrolled in 35 French centers: (1) biopsy-proven hepatitis B virus (HBV) or hepatitis C virus (HCV) cirrhosis, (2) Child-Pugh A, or (3) absence of previous liver complications including primary liver cancer (PLC). Patients were followed up prospectively every 6 months. The standardized mortality ratio (SMR) was calculated according to age and gender using 5-year periods. The impact of sustained viral response (SVR) in HCV patients and maintained viral suppression in HBV patients were assessed using time-dependent analysis. A total of 1,671 patients were enrolled between 2006 and 2012 (median age, 54.9 years; men, 67.3%; HCV, 1,323; HBV, 317; HCV-HBV, 31). Metabolic features and excessive alcohol and tobacco consumption were recorded in 15.2%, 36.4%, and 56.4% of cases, respectively. After a median follow-up of 59.7 months, 227 PLCs were diagnosed (5-year cumulative incidence [CumI] 13.4%) and 93 patients developed EHC (14 patients with lymphoid or related tissue cancer and 79 with solid tissue cancer; 5-year EHC CumI, 5.9%). Compared to the general French population, patients were younger at cancer diagnosis, with significantly higher risk of EHC in HCV patients (SMR, 1.31; 95 confidence interval [CI], 1.04-1.64; P = 0.017) and after SVR (SMR = 1.57; 95% CI, 1.08-2.22; P = 0.013). EHC was the fourth leading cause of death in the whole cohort and the first in patients with viral control/eradication.CONCLUSION: Compared to the general French population, HCV cirrhosis is associated with a higher risk of EHC and the first cause of death in patients with viral cirrhosis who achieve virological control/eradication. (Hepatology 2018).
Published: 2018

29. Quassia 'biopiracy' case and the Nagoya Protocol: A researcher's perspective

Author: Geneviève Bourdy, Eric Deharo, Catherine Aubertin, Valérie Jullian, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Patrimoines locaux, Environnement et Globalisation (PALOC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), and Sorbonne Université (SU)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: INDIANS, 0301 basic medicine, RESOURCES, [SDV]Life Sciences [q-bio], NATURAL BIOACTIVE COMPOUNDS, 030106 microbiology, MULTIDISCIPLINARY APPROACH, Context (language use), AMARA L. SIMAROUBACEAE, Indigenous, FRENCH-GUIANA, Patents as Topic, 03 medical and health sciences, Misconduct, Politics, SEARCH, Drug Discovery, Medicine, Nagoya Protocol, Traditional knowledge, Ratification, SIMALIKALACTONE-D, Pharmacology, Plants, Medicinal, business.industry, Biodiversity, French Guiana, Quassia, 030104 developmental biology, Law, BOLIVIA, ANTIMALARIAL ACTIVITY, business, Allegation
Abstract: International audience; Biopiracy accusations are common in the world of biodiversity research. At the end of 2015, a French NGO accused researchers from the Institut de Recherche pour le Développement (IRD) of biopiracy. These researchers had applied for a patent for a natural bioactive molecule against malaria and cancer, the Simalikalactone E, isolated from Quassia amara L. (Simaroubaceae) leaves. This biopiracy allegation triggered a huge wave of attacks from the media and social networks, and vehement recrimination from political officials in French Guiana against researchers who have been accused of ethical misconduct, by stealing the traditional knowledge of indigenous people. These accusations were made in the contentious context of the ratification of the Nagoya Protocol in the frame of implementing the French law on biodiversity, nature and landscapes. So, in an atmosphere of heightened emotions it is crucial to understand the issues behind these accusations. We describe herein the genesis of our discovery, present the detractors' arguments, and discuss the consequences of such biopiracy denunciations for scientific research. We also address our concerns about the gap between rhetoric and reality and the real impact of the Nagoya Protocol on biodiversity conservation.
Published: 2017

30. Baseline and Post-Treatment Hepatitis C NS5A Resistance in Relapsed Patients from a Multicentric Real-Life Cohort

Author: Philippe Halfon, Jacques Izopet, Pascale Trimoulet, Caroline Scholtes, Sofiane Mohamed, Denis Ouzan, Laurent Chiche, Victor de Ledinghen, Hacène Khiri, Marc Bourlière, M.A. Thelu, Sophie Metivier, Guillaume Penaranda, Anne Plauzolles, Laurent Alric, Vincent Leroy, Fabien Zoulim, Sylvie Larrat, Florence Abravanel, ALPHABIO - Laboratoire de biologie médicale, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Service de virologie et d'immunologie biologique, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, Service d'Hépatologie et de Gastroentérologie [Lyon], Hospices Civils de Lyon (HCL), Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de Gastro-entérologie - Hépatologie [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], Hôpital Michallon, Institut Arnault Tzanck, Service d'Hépato-Gastro-Entérologie, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Saint-André, Institut d'oncologie/développement Albert Bonniot de Grenoble (INSERM U823), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-CHU Grenoble-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de médecine interne [Hôpital Nord - APHM], Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital Nord [CHU - APHM], Service d'hépatologie et de gastroentérologie [Hôpital Saint-Joseph - Marseille], Aix Marseille Université (AMU)-Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan ex IFR 30 et IFR 150 (CPTP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Européen [Fondation Ambroise Paré - Marseille], Centre Hospitalier Universitaire de Lyon (CHU Lyon), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), CHU Bordeaux [Bordeaux], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre Léon Bérard [Lyon], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie structurale (IBS - UMR 5075 ), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019])-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-EFS-CHU Grenoble-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF), Laboratoire de Virologie [CHU Purpan, Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, DNA Mutational Analysis, Viral Nonstructural Proteins / genetics, Drug Resistance, Hepacivirus, Drug resistance, Viral Nonstructural Proteins, Virological response, Viral Nonstructural Proteins / antagonists & inhibitors, 0302 clinical medicine, Medicine, Pharmacology (medical), Viral, Treatment Failure, Hepatitis C, Viral Load, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 3. Good health, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biomolecules [q-bio.BM], Treatment Outcome, Infectious Diseases, Antiviral Agents / pharmacology, Cohort, Drug Therapy, Combination, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, Viral load, Hepacivirus / genetics, medicine.medical_specialty, Genotype, Antiviral Agents / therapeutic use, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Pharmacotherapy, Drug Therapy, Internal medicine, Drug Resistance, Viral, Humans, NS5A, Pharmacology, business.industry, medicine.disease, 030104 developmental biology, Hepatitis C / virology, Hepacivirus / drug effects, Post treatment, Hepatitis C / drug therapy, business
Abstract: Background Recent data have suggested that failure to achieve sustained virological response with direct-acting antiviral therapy is usually due to relapse and is primarily associated with the emergence of resistance-associated substitutions. The aim of this study was to investigate the prevalence and characterization of non-structural-5A resistance-associated substitutions in patients infected with HCV genotypes 1, 3 and 4 treated by direct-acting antiviral therapy, including anti-non-structural-5A, and to characterize the pre-existing resistance-associated substitutions in subjects treated with anti-non-structural-5A inhibitors. Methods From January 2014 to March 2016, 2,995 patients infected with HCV genotypes 1, 3 and 4 were exposed to non-structural-5A inhibitors. Sequencing results at the time of virological failure were available for 61 patients; sequencing at baseline was available for 35 of these patients. Results Among the 35 patients with sequencing results available at baseline, 15 had no resistance-associated substitution, 16 had only one resistance-associated substitution, and 4 had more than one resistance-associated substitution. Resistance-associated substitutions were harbored in 57% of the sequences in the non-structural-5A region. Among the 61 patients sequenced at virological failure, 50 (82%) patients presented at least one resistance-associated substitutions inducing a high level of resistance to non-structural-5A inhibitors (>10-fold resistance). Conclusions This pooled analysis suggests that non-structural-5A resistance-associated substitutions screening should be recommended when considering retreatment with a non-structural-5A inhibitor regimen in patients who have previously experienced failed non-structural-5A treatment.
Published: 2017

31. Time before anti-Toxoplasma IgG seroconversion detection by 7 commercial assays in French pregnant women

Author: Xavier Iriart, Catherine Armengol, Judith Fillaux, Antoine Berry, Pamela Chauvin, Christine Roques-Malecaze, Sophie Cassaing, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Adult, 0301 basic medicine, Microbiology (medical), Time Factors, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, Antibodies, Protozoan, Toxoplasma gondii, Immunoblot, 03 medical and health sciences, Pregnancy, medicine, Humans, Pregnancy Complications, Infectious, Immunodiagnosis, Seroconversion, Automation, Laboratory, biology, Diagnostic Tests, Routine, business.industry, General Medicine, medicine.disease, biology.organism_classification, Virology, 3. Good health, Infectious Diseases, Immunoglobulin G, Immunology, Female, France, Reagent Kits, Diagnostic, Automated tests, business, Toxoplasma, Toxoplasmosis
Abstract: International audience; We assessed the ability to early detect a toxoplasmic seroconversion between 1 immunoblot (LDBIO II®) and 6 automated assays (TGS TA®, Architect®, Vidas II®, Liaison II®, Platelia®, and Elecsys®), comparing the time before anti-Toxoplasma gondii IgG detection during infection in pregnant women. From 2007 to 2015, 620 sera of 269 women were included. The median durations before positive IgG detection with Vidas II®, Liaison II®, Platelia®, and Elecsys® were significantly longer than Architect® with differential times from 11 to 28days (P
Published: 2017

32. Hepatitis E Virus Infects Neurons and Brains

Author: Qiuwei Pan, Femke M.S. de Vrij, Laurent Alric, Ane C Ayo-Martin, Yijin Wang, Eleonora Aronica, Jeroen J.J. van Eijk, Wanlu Cao, Manzhi Zhao, Xinying Zhou, Maikel P. Peppelenbosch, Wenshi Wang, Nassim Kamar, Fen Huang, Bart C. Jacobs, Mark van der Kroeg, Yuebang Yin, Zhanmin Lin, Harry R. Dalton, Chris I. De Zeeuw, Jean-Marie Peron, Robert A. de Man, Lei Xu, Herold J. Metselaar, Steven A. Kushner, Dave Sprengers, Erasmus University Medical Center [Rotterdam] (Erasmus MC), Kunming University of Science and Technology (KMUST), Département de Gastroentérologie, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Jeroen Bosch Ziekenhuis, Department of Pathology [Amsterdam, the Netherlands], Academic Medical Center - Academisch Medisch Centrum [Amsterdam] (AMC), University of Amsterdam [Amsterdam] (UvA)-University of Amsterdam [Amsterdam] (UvA), Netherlands Institute for Neuroscience (NIN), Royal Netherlands Academy of Arts and Sciences (KNAW), Royal Cornwall Hospital, University of Exeter, Gastroenterology & Hepatology, Neurosciences, Psychiatry, Immunology, Neurology, ANS - Cellular & Molecular Mechanisms, Pathology, APH - Mental Health, APH - Aging & Later Life, Pôle Maladies de l'appareil digestif [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Hôpital de Rangueil, CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: 0301 basic medicine, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], Alpha interferon, hepatitis E virus, Biology, medicine.disease_cause, Virus, cerebrospinal fluid, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Hepatitis E virus, SDG 3 - Good Health and Well-being, peripheral nervous system, medicine, Journal Article, Immunology and Allergy, Viral shedding, Hepatitis, Ribavirin, virus diseases, Hepatitis E, medicine.disease, central nervous system, Virology, digestive system diseases, 3. Good health, 030104 developmental biology, Infectious Diseases, chemistry, Viral replication
Abstract: International audience; Hepatitis E virus (HEV), as a hepatotropic virus, is supposed to exclusively infect the liver and only cause hepatitis. However, a broad range of extrahepatic manifestations (in particular, idiopathic neurological disorders) have been recently reported in association with its infection. In this study, we have demonstrated that various human neural cell lines (embryonic stem cell-derived neural lineage cells) induced pluripotent stem cell-derived human neurons and primary mouse neurons are highly susceptible to HEV infection. Treatment with interferon-α or ribavirin, the off-label antiviral drugs for chronic hepatitis E, exerted potent antiviral activities against HEV infection in neural cells. More importantly, in mice and monkey peripherally inoculated with HEV particles, viral RNA and protein were detected in brain tissues. Finally, patients with HEV-associated neurological disorders shed the virus into cerebrospinal fluid, indicating a direct infection of their nervous system. Thus, HEV is neurotropic in vitro, and in mice, monkeys, and possibly humans. These results challenge the dogma of HEV as a pure hepatotropic virus and suggest that HEV infection should be considered in the differential diagnosis of idiopathic neurological disorders.
Published: 2017

33. Search for novel metabolites in fungal endophytes: study of Phomopsis sp. and Colletotrichum sp. co-cultivation and Botryosphaeria mamane epigenetic modification

Author: Alexis Valentin, L. Rieusset, Patricia Jargeat, Marieke Vansteelandt, C. Amasifuen, Mohamed Haddad, Fatima Barakat, Asih Triastuti, Nicolas Fabre, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Evolution et Diversité Biologique (EDB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])
Subjects: Fungal endophytes, 0106 biological sciences, 2. Zero hunger, Pharmacology, new metabolite production, [SDV]Life Sciences [q-bio], Organic Chemistry, Pharmaceutical Science, Biology, 01 natural sciences, Botryosphaeria mamane, Analytical Chemistry, Complementary and alternative medicine, Colletotrichum sp, 010608 biotechnology, Drug Discovery, Phomopsis sp, Botany, co-cultivation, Molecular Medicine, Epigenetics, epigenetic, 010606 plant biology & botany
Abstract: International audience; Fungal endophytes are fungi that grow within plant tissues without causing immediate signs of disease. They are gaining increased attention for their ability to produce natural products with diverse structure and pharmacological activity [1]. Under conventional cultures conditions some endophytes show loss of activity in producing secondary metabolites (SM) due to inactivation of metabolite gene clusters [2]. Several strategies have been applied to activate these silent gene clusters including epigenetic modifications and co-cultivation. The signal come to the cell will modify the silence gene and lead to an enhanced production and/or to an accumulation of different compounds that are not detected in axenic cultures [3].The purpose of this study was to find new SM and analyze gene clusters activation through co-cultivation and through the addition of molecular and epigenetic modifier such as suberoylanilide hydroxamic acid or valproic acid into the culture medium. Our research group isolated 409 Ascomycetes strains from 21 medicinal plants from South America [4]. Among them, we chose Phomopsis sp. and Colletotrichum sp on the basis of ecological data as model for co-cultivation and Botrysosphaeria mamane for the epigenetic modification studies. First results obtained highlighted that the fungal co-cultivation can induce de novo synthesis of secondary metabolites (Barakat et al., data not published). In order to understand the mechanisms underlying these modifications, we focused on B. mamane, known to produce SM such as mellein, primin, botryomaman, and 4,5-dihydroxy-2-hexenoic acid[5]. This strain is being under investigation in our group for producing anti-leishmania SM. It exhibited good activity against Leishmania infantum with IC50= 17. 04 µg/ml. Investigations are currently in process to apply epigenetic modifier in order to induce SM production in this strain and analyze its metabolomics and pharmacological activity modifications against L. infantum through immunomodulatory approaches.
Published: 2016

34. Co-cultivation approach and untargeted metabolomics in the search for new secondary metabolites from endophytic fungi

Author: L. Rieusset, Fatima Barakat, Nicolas Fabre, Marieke Vansteelandt, Mohamed Haddad, Asih Triastuti, Billy Cabanillas, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Instituto de Investigaciones de la Amazonía Peruana (IIAP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Pharmacology, 010405 organic chemistry, Chemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Organic Chemistry, Pharmaceutical Science, fungal endophytes, 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Plant use of endophytic fungi in defense, 0104 chemical sciences, Analytical Chemistry, Untargeted metabolomics, Complementary and alternative medicine, Drug Discovery, Botany, co-cultivation, UHPLC-HRMS, Molecular Medicine, metabolome
Abstract: Article issu d'une présentation lors du congrès : 9th Joint Meeting of AFERP, ASP, GA, JSP, PSE and SIF qui s'est tenu du 24 au 27 juillet 2016 à Copenhague, Danemark; International audience; Fungal endophytes are fungi living within the internal tissues of a host-plant, without causing any symptoms. Such microorganisms develop interactions not only with their host-plant but also with the entire microbiome of the host [1]. These organisms, and especially those isolated from plants of high biodiversity areas, are arousing researchers interest since they represent a relatively untapped renewable source of novel secondary metabolites [2]. Nevertheless, as micromycetes can modulate their metabolome very fast, depending on their environment, some endophytes lose their ability to produce compounds of interest in standard laboratory conditions [3]. Thus, different strategies have been investigated to induce the production of these metabolites, via the activation of silent genes. Such methods include the addition of epigenetic modifier or a modification of nutrients into the culture medium, but also the co-cultivation of endophytes. This last approach may induce the activation of some metabolic pathway leading to the production of bioactive metabolites, in response to the interactions between the species [4]. In order to search for new bioactive compounds from fungal endophytes, we investigated two fungal strains isolated from a South American plant, and belonging to the Phomopsis and Colletotrichum genera. These strains were both cultured in axenic conditions and as co-cultures. Ethyl acetate extractions of the cultures were performed and extracts were analysed by Ultra high-performance-liquid-chromatography coupled to high resolution mass spectrometry (UHPLC-HRMS). Chemical fingerprints obtained by untargeted metabolomics showed that the co-cultivation modified the metabolism of the strains and induced the production of new secondary metabolites. In vitro bioactivity of these extracts against Plasmodium falciparum, Leishmania infantum and VERO cells is under investigation, such as the isolation and characterization of the co-cultivation induced compounds.
Published: 2016

35. On hepatocellular carcinoma in South America and early-age onset of the disease

Author: Eric Deharo, Pascal Pineau, Eloy Ruiz, Stéphane Bertani, Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), This work was supported by the French National Alliance for Life Sciences and Health [grant number ENV201408], the French National League Against Cancer, Paris, France, and the French National Research Institute for Sustainable Development, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), CCSD, Accord Elsevier, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Adult, Male, Cancer risk factor, Pediatrics, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Disease, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.PED] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Epidemiology, Peru, medicine, Hepatitis B virus HBV, Humans, East Asia, Hepatitis B virus (HBV), Age of Onset, [SDV.MP.VIR] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, Low- and middle-income countries, Hepatology, Indigenous people, business.industry, Liver Neoplasms, Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Middle Aged, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, Low and middle income countries, 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, 030211 gastroenterology & hepatology, Female, Liver cancer, business, Global health transition
Abstract: International audience; Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the most predominant tumor types worldwide, being particularly prevalent in sub-Saharan Africa and East Asia. However, HCC is inexplicably underreported in South America, despite unsettling clinical epidemiological trends of the disease on this continent. Here, we review the current knowledge on HCC presentation in Peru. We emphasize the well-documented occurrence of an early-age nosological form of the disease in Andean descent populations. We further discuss the reasons for such HCC clinical presentation, as well as the implications for liver cancer screening, management, and prevention.
Published: 2019

36. Ribavirin for Chronic Hepatitis E Virus Infection in Ibrutinib-Exposed Patients

Author: Jacques Izopet, Loic Ysebaert, Laurent Alric, Caroline Protin, Suzanne Tavitian, Guillaume Martin-Blondel, Lucie Oberic, Florence Abravanel, Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), ANR-11-PHUC-0001,CAPTOR,Cancer et Pharmacologie : Projet de Toulouse-Oncopole et de sa Région(2011), Pagès, Nathalie, Pôle hospitalier Universitaire Cancer (PHUC) - Cancer et Pharmacologie : Projet de Toulouse-Oncopole et de sa Région - - CAPTOR2011 - ANR-11-PHUC-0001 - PHUC - VALID, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: 0301 basic medicine, medicine.drug_class, ribavirin, viruses, [SDV]Life Sciences [q-bio], 030106 microbiology, hepatitis E virus, Virus diseases, medicine.disease_cause, Tyrosine-kinase inhibitor, Virus, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Hepatitis E virus, ibrutinib, Medicine, Chronic hepatitis E, hematological malignancies, business.industry, immuno-deficiency, Ribavirin, Brief Report, medicine.disease, Virology, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Infectious Diseases, Oncology, chemistry, Ibrutinib, business, Viral hepatitis
Abstract: Ibrutinib is an oral first-in-class Bruton’s tyrosine kinase inhibitor approved for the therapy of various B-cell lymphoid malignancies. Among ibrutinib-related infections, viral hepatitis are poorly described. We report our single-center experience with 4 cases of chronic hepatitis E virus infection and their management with ribavirin.
Published: 2019

37. Performance of seven commercial automated assays for the detection of low levels of anti-Toxoplasma IgG in French immunocompromised patients

Author: Tiphaine Douet, Catherine Armengol, Pamela Chauvin, Judith Fillaux, Antoine Berry, Xavier Iriart, Sophie Cassaing, Eléna Charpentier, Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Comminges Pyrénées (CHCP), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Service de Parasitologie et Mycologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), ESIM - Déterminants Sociaux de la Santé et du Recours aux Soins (DS3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Service de Parasitologie-Mycologie [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Bordeaux [Bordeaux], Unité de Nutrition Humaine (UNH), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Adult, Male, Veterinary (miscellaneous), [SDV]Life Sciences [q-bio], Toxoplasma gondii, Antibodies, Protozoan, Biology, IgG low level, Sensitivity and Specificity, lcsh:Infectious and parasitic diseases, Serology, 03 medical and health sciences, Immunocompromised Host, Young Adult, medicine, Humans, Mass Screening, lcsh:RC109-216, In patient, Serologic Tests, Immunodiagnosis, Mass screening, 030304 developmental biology, Automation, Laboratory, 0303 health sciences, 030306 microbiology, Middle Aged, medicine.disease, biology.organism_classification, Toxoplasmosis, 3. Good health, Titer, Infectious Diseases, Insect Science, Immunoglobulin G, Immunology, biology.protein, Animal Science and Zoology, Parasitology, Female, Enzyme immunoassays, Automated tests, Reagent Kits, Diagnostic, Antibody, Toxoplasma, Research Article
Abstract: International audience; Background: Immunocompromised patients are at high risk for the development of severe toxoplasmosis from tissue cyst reactivation, the most frequently, or from recently acquired acute infections. Knowledge of serologic status is therefore crucial. Screening for toxoplasmosis is sometimes performed while patients are already immunocompromised and have a low or even undetectable IgG titer by routine automated enzyme immunoassays. The aim of this study was to assess the sensitivity and specificity of seven reagents for the detection of low levels of IgG. Sera from 354 patients were collected and analysed. Results: Elecsys® offered the best analytic performances, superior to those of Architect® and Platelia®, which were superior to those of Access II® and TGS TA®. Vidas II® and Liaison II® reagents exhibited poor analytical performances in this cohort. For Elecsys®, Platelia® and Architect®, new thresholds for the grey zone and positive zone have been defined to improve the sensitivity of these reagents while maintaining excellent specificity. Conclusions: Commercialized assays for toxoplasmosis screening are not suitable for IgG low-level detection in patients without adapting the supplier thresholds to avoid false negative results and risk generalized toxoplasmosis.; Contexte : Les patients immunodéprimés courent un risque élevé de développer une toxoplasmose grave résultant de la réactivation de kystes tissulaires, le plus souvent, ou d’infections aiguës récemment contractées. La connaissance du statut sérologique est donc cruciale. Le dépistage de la toxoplasmose est parfois effectué chez des patients déjà immunodéprimés et dont le titre en IgG est faible, voire indétectable, par les immunoessais enzymatiques automatisés de routine. Le but de cette étude était d’évaluer la sensibilité et la spécificité de sept réactifs pour la détection de faibles taux d’IgG. Les sérums de 354 patients ont été recueillis et analysés. Résultats : Elecsys® offre les meilleures performances analytiques, supérieures à celles d’Architect® et de Platelia®, supérieures à celles d’Access II® et de TGS TA®. Les réactifs Vidas II® et Liaison II® ont présenté des performances analytiques médiocres dans cette cohorte. Pour Elecsys®, Platelia® et Architect®, de nouveaux seuils pour la zone grise et la zone positive ont été définis pour améliorer la sensibilité de ces réactifs tout en maintenant une excellente spécificité. Conclusions : Les tests commercialisés pour le dépistage de la toxoplasmose ne conviennent pas à la détection de faibles taux d’IgG chez les patients sans adaptation des seuils des fournisseurs pour éviter les résultats faux négatifs et le risque de toxoplasmose généralisée.
Published: 2019

38. Overcoming deterrent metabolites by gaining essential nutrients A lichen/snail case study

Author: Anne-Cécile Le Lamer, Hélène Rogniaux, Mathieu Fanuel, Maryvonne Charrier, Françoise Lohézic-Le Dévéhat, Joël Boustie, Alice Gadea, Philippe Clerc, Aurélie Sauvager, Corentin Daugan, Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de recherche sur les Biopolymères, Interactions Assemblages (BIA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Conservatoire et Jardin Botaniques, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Subantarctic field trip was funded by l'Institut Polaire Paul-Émile Victor, Plouzané, France (IPEV, programme 136)., Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Conservatoire et Jardin Botaniques de Genève, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0106 biological sciences, chemistry_other, Usnea, Metabolite, Snails, Usnea taylorii, Lichen, Plant Science, Snail, Horticulture, 01 natural sciences, Biochemistry, Mass Spectrometry, Mass spectrometry imaging, chemistry.chemical_compound, Sugar Alcohols, stomatognathic system, Arabitol, biology.animal, Botany, Animals, Molecular Biology, Chromatography, High Pressure Liquid, Benzofurans, integumentary system, biology, 010405 organic chemistry, Parmeliaceae, Usnic acid, Primary metabolite, General Medicine, biology.organism_classification, 0104 chemical sciences, Thallus, stomatognathic diseases, Notodiscus hookeri, chemistry, D-arabitol, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering, 010606 plant biology & botany, Feeding choice
Abstract: International audience; Specialised metabolites in lichens are generally considered repellent compounds by consumers. Nevertheless, if the only food available is lichens rich in specialised metabolites, lichenophages must implement strategies to overcome the toxicity of these metabolites. Thus, the balance between phagostimulant nutrients and deterrent metabolites could play a key role in feeding preferences. To further understand lichen-gastropod interactions, we studied the feeding behaviour and consumption in Notodiscus hookeri, the land snail native to sub-Antarctic islands. The lichen Usnea taylorii was used because of its simple chemistry, its richness in usnic acid (specialised metabolite) and arabitol (primary metabolite) and its presence in snail habitats. Choice tests in arenas with intact lichens versus acetone-rinsed lichens were carried out to study the influence of specialised metabolites on snail behaviour and feeding preference. Simultaneously, usnic acid and arabitol were quantified and located within the lichen thallus using HPLC-DAD-MS and in situ imaging by mass spectrometry to assess whether their spatial distribution explained preferential snail grazing. No-choice feeding experiments, with the pure metabolites embedded in an artificial diet, defined a gradual gustatory response, from strong repellence (usnic acid) to high appetence (D-arabitol). This case study demonstrates that the nutritional activity of N. hookeri is governed by the chemical quality of the food and primarily by nutrient availability (arabitol), despite the presence of deterrent metabolite (usnic acid).
Published: 2019

39. Direct‐Acting Antivirals in Hepatitis C Virus‐Associated Diffuse Large B‐cell Lymphomas

Author: Maria Grazia Rumi, Laurent Alric, Francesco Passamonti, Dario Marino, Virginia Valeria Ferretti, Isabel Cano, Michele Merli, Manuel Gotti, Roberta Sciarra, Maria Chiara Tisi, Paolo Grossi, Véronique Loustaud-Ratti, Angela Ferrari, Alice Di Rocco, Carlo Visco, Maria Goldaniga, Chiara Rusconi, Emanuele Cencini, F. Benanti, Antonello Sica, Massimo Gentile, Marco Frigeni, Luca Arcaini, Lucia Farina, Francesco Piazza, Annalisa Arcari, Valentina Zuccaro, Lara Mannelli, Caroline Besson, Mario Pirisi, Universitá degli Studi dell’Insubria = University of Insubria [Varese] (Uninsubria), Università degli Studi di Pavia = University of Pavia (UNIPV), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ospedale San Bortolo, Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Azienda Ospedaliera Careggi, Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome] (UNIROMA), Azienda Unita` Sanitaria Locale, Azienda Unita` Sanitaria Locale, La Spezia, IRCCS Istituto Nazionale dei Tumori [Milano], University of Piemonte Orientale, Partenaires INRAE, Università degli Studi di Padova = University of Padua (Unipd), Université de Limoges (UNILIM), Azienda Unità Sanitaria Locale di Bologna (AUSL), Veneto Institute of Oncology, IOV - IRCCS, Fondazione IRCCS Ca' Granda - Ospedale Maggiore Policlinico, Ospedale Niguarda Ca' Granda Hospital, Università degli Studi di Siena = University of Siena (UNISI), University of Catania [Italy], Università degli Studi di Milano = University of Milan (UNIMI), Fondazione IRCCS Policlinico San Matteo, Service d’Hématologie et d’Oncologie, Centre Hospitalier de Versailles, Le Chesnay, France, Pagès, Nathalie, University of Insubria, Varese, University of Pavia, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Università degli Studi di Roma 'La Sapienza' = Sapienza University [Rome], University of Padova [Padova, Italy], University of Siena (University of Siena), University of Milan, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Male, Cancer Research, Sofosbuvir, Diffuse large B‐cell lymphoma, Hematologic Malignancies, [SDV]Life Sciences [q-bio], Direct‐acting antivirals, Hepatitis C virus, R‐CHOP, Hepacivirus, Direct-acting antivirals, Gastroenterology, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Antineoplastic Combined Chemotherapy Protocols, 030212 general & internal medicine, Aged, 80 and over, Dasabuvir, Incidence, Hepatitis C, Diffuse large B-cell lymphoma, Middle Aged, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], [SDV.SP] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, Italy, Oncology, Vincristine, R-CHOP, 030220 oncology & carcinogenesis, Rituximab, Female, Lymphoma, Large B-Cell, Diffuse, medicine.drug, Ledipasvir, Adult, medicine.medical_specialty, Antiviral Agents, Disease-Free Survival, 03 medical and health sciences, Internal medicine, medicine, Humans, Progression-free survival, Cyclophosphamide, Aged, Retrospective Studies, business.industry, Ribavirin, Hepatitis C, Chronic, medicine.disease, chemistry, Paritaprevir, Doxorubicin, Prednisone, business
Abstract: International audience; Background: International guidelines suggest hepatitis C virus (HCV) eradication by direct-acting antivirals (DAAs) after first-line immunochemotherapy (I-CT) in patients with HCV-positive diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), although limited experiences substantiate this recommendation. Moreover, only a few data concerning concurrent administration of DAAs with I-CT have been reported.Subjects, materials, and methods: We analyzed hematological and virological outcome and survival of 47 consecutive patients with HCV-positive DLBCL treated at 23 Italian and French centers with DAAs either concurrently (concurrent cohort [ConC]: n = 9) or subsequently (sequential cohort [SeqC]: n = 38) to first-line I-CT (mainly rituximab, cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine and prednisone [R-CHOP]-like).Results: Median age was 61 years, 89% of patients had stage III/IV, and 25% presented evidence of cirrhosis. Genotype was 1 in 56% and 2 in 34% of cases. Overall, 46 of 47 patients obtained complete response to I-CT. All patients received appropriate DAAs according to genotype, mainly sofosbuvir-based regimens (n = 45). Overall, 45 patients (96%) achieved sustained virological response, 8 of 9 in ConC and 37 of 38 in SeqC. DAAs were well tolerated, with only 11 patients experiencing grade 1-2 adverse events. Twenty-three patients experienced hepatic toxicity (grade 3-4 in seven) following I-CT in SeqC, compared to only one patient in ConC. At a median follow-up of 2.8 years, two patients died (2-year overall survival, 97.4%) and three progressed (2-year progression-free survival, 93.1%).Conclusion: Excellent outcome of this cohort of HCV-positive DLBCL suggests benefit of HCV eradication by DAAs either after or during I-CT. Moreover, concurrent DAAs and R-CHOP administration appeared feasible, effective, and ideally preferable to deferred administration of DAAs for the prevention of hepatic toxicity.Implications for practice: Hepatitis C virus (HCV)-associated diffuse large B-cell lymphomas (DLBCLs) represent a great therapeutic challenge, especially in terms of hepatic toxicity during immune-chemotherapy (I-CT) and long-term hepatic complications. The advent of highly effective and toxicity-free direct-acting antivirals (DAAs) created an exciting opportunity to easily eradicate HCV shortly after or in concomitance with first-line immunochemotherapy (usually R-CHOP). This retrospective international study reports the real-life use of the combination of these two therapeutic modalities either in the concurrent or sequential approach (DAAs after I-CT) in 47 patients. The favorable reported results on long-term outcome seem to support the eradication of HCV with DAAs in all patients with HCV-positive DLBCL. Moreover, the results from the concurrent approach were effective and safe and displayed an advantage in preventing hepatic toxicity during I-CT.
Published: 2019

40. Increased CXCR3+ T Cells Impairs Recruitment of T-Helper Type 17 Cells via Interferon γ and Interleukin 18 in the Small Intestine Mucosa During Treated HIV-1 Infection

Author: Nicolas Carrere, Jacques Izopet, Bertrand Suc, Claire Loiseau, Michelle Cazabat, Pierre Delobel, Mary Requena, Manon Nayrac, Laurent Alric, M Mavigner, A L Iscache, Centre de Physiopathologie Toulouse Purpan (CPTP), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Virologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Emory University School of Medicine, Emory University [Atlanta, GA], Université de Toulouse (UT), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Service Maladies infectieuses et tropicales [CHU Toulouse], Pôle Inflammation, infection, immunologie et loco-moteur [CHU Toulouse] (Pôle I3LM Toulouse), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS) and Sidaction, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Virologie [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Service des maladies infectieuses et tropicales [Toulouse], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Pagès, Nathalie, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: CD4-Positive T-Lymphocytes, 0301 basic medicine, medicine.medical_treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], MESH: Anti-Retroviral Agents / therapeutic use, HIV Infections, CD8-Positive T-Lymphocytes, CXCR3, Chemokine CXCL9, Th1, 0302 clinical medicine, Cell Movement, MESH: Interferon-gamma / metabolism, MESH: HIV Infections / metabolism, Intestine, Small, MESH: Receptors, CXCR3 / metabolism, Immunology and Allergy, Intestinal Mucosa, IFN-γ, MESH: Cell Movement, Chemistry, MESH: Interleukin-18 / metabolism, Interleukin-18, MESH: Chemokine CXCL10 / metabolism, MESH: CD8-Positive T-Lymphocytes / metabolism, hemic and immune systems, MESH: Intestine, Small / metabolism, MESH: Chemokine CXCL11 / metabolism, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Cytokine, medicine.anatomical_structure, Anti-Retroviral Agents, Chemokines, CC, Cytokines, CXCL9, gut, 030211 gastroenterology & hepatology, Interleukin 18, MESH: Intestinal Mucosa / metabolism, IL-18, MESH: Chemokine CXCL9, Receptors, CXCR3, MESH: Th17 Cells / metabolism, MESH: Chemokines, CC / metabolism, MESH: Chemokine CCL20 / metabolism, chemical and pharmacologic phenomena, Interferon-gamma, 03 medical and health sciences, MESH: CD4-Positive T-Lymphocytes / metabolism, medicine, Humans, Chemokine CCL20, MESH: Humans, MESH: Cytokines / metabolism, CD8, MESH: HIV Infections / therapy, MESH: Th1 Cells / metabolism, Th1 Cells, Molecular biology, Small intestine, Chemokine CXCL11, Chemokine CXCL10, CCL20, 030104 developmental biology, HIV-1, Th17 Cells, CCL25
Abstract: The restoration of CD4+ T cells, especially T-helper type 17 (Th17) cells, remains incomplete in the gut mucosa of most human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)–infected individuals despite sustained antiretroviral therapy (ART). Herein, we report an increase in the absolute number of CXCR3+ T cells in the duodenal mucosa during ART. The frequencies of Th1 and CXCR3+ CD8+ T cells were increased and negatively correlated with CCL20 and CCL25 expression in the mucosa. In ex vivo analyses, we showed that interferon γ, the main cytokine produced by Th1 and effector CD8+ T cells, downregulates the expression of CCL20 and CCL25 by small intestine enterocytes, while it increases the expression of CXCL9/10/11, the ligands of CXCR3. Interleukin 18, a pro-Th1 cytokine produced by enterocytes, also contributes to the downregulation of CCL20 expression and increases interferon γ production by Th1 cells. This could perpetuate an amplification loop for CXCR3-driven Th1 and effector CD8+ T cells recruitment to the gut, while impairing Th17 cells homing through the CCR6-CCL20 axis in treated HIV-1–infected individuals.
Published: 2019

41. Capillary electrophoresis/visible‐LED induced fluorescence of tryptophan: What's new?

Author: Fabrice Collin, Lucie Perquis, Alix Poinso, Véréna Poinsot, Hai Yen Ta, Varravaddheay Ong-Meang, François Couderc, Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris- Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BIBAC - Chimie analytique et interactions biomolécules - matière molle biomimétique (BIBAC), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: Decarboxylation, Clinical Biochemistry, 02 engineering and technology, Mass spectrometry, 01 natural sciences, Biochemistry, Benzoates, Analytical Chemistry, chemistry.chemical_compound, Capillary electrophoresis, Leucine, Tandem Mass Spectrometry, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, Carboxylate, Derivatization, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Fluorescent Dyes, Chromatography, 010401 analytical chemistry, Tryptophan, Electrophoresis, Capillary, Stereoisomerism, 021001 nanoscience & nanotechnology, Fluorescence, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Spectrometry, Fluorescence, chemistry, Quinolines, Isoleucine, 0210 nano-technology
Abstract: Tryptophane (Trp) labelled by 3-(4-carboxybenzoyl)-2-quinolinecarboxaldehyde (CBQCA) is very difficult to identify using CE and fluorescence detection (480 nm). Why in this article some mass spectrometry experiments show that Trp is really labelled by CBQCA as Leucine (Leu)? If the maximum of UV absorption (λmax ) is the same between Leu-CBQCA and Trp-CBQCA, the molar extinction coefficient is around 2 fold higher for Trp-CBQCA. The fluorescence of the Leu-CBQCA derivative is 50 times more important than for Trp-CBQCA. The addition of 7.5 mM of β-cyclodextrin (β-CD) was found to be a good mean to improve 2.1 fold the sensitivity of the Trp-CBQCA fluorescence. Using a buffer containing SDS and β-CD in CE, a LOD of 0.7 µM of L-Trp can be reached and the ratio of the intensities between Leu, Isoleucine, Valine, Trp is 100, 21, 15, 1. Negative ESI/ MS and MS/MS of the labeled amino acids show that a loss of the carboxylate function takes place. In the presence of two enantiomers of Trp-CBQCA, we have shown that this decarboxylation is not due to the derivatization process in the solution but rather occurs in the source of the mass spectrometer.
Published: 2019

42. ON-CHIP PRE-TREATMENT OF BIOLOGICAL SAMPLES FOR THE ISOLATION OF ADIPOSE STEM CELLS (ASCs)

Author: Karine Reybier, Marie-Charline Blatche, Mathias Bouguelmouna, Coralie Sengenès, Melanie Mariotte, Marion Valette, Rémi Courson, Amandine Girousse, A.-M. Gue, Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement (LAAS-MILE), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Service Techniques et Équipements Appliqués à la Microélectronique (LAAS-TEAM), Service Instrumentation Conception Caractérisation (LAAS-I2C), STROMALab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Etablissement Français du Sang-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Valette, Marion, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: 0301 basic medicine, Pre treatment, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [SPI.NANO] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Microfluidics, Adipose tissue, [SPI.MECA.MEFL] Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph], 02 engineering and technology, Regenerative medicine, Dry Films, law.invention, Hydrodynamic Filtration, [SPI.MECA.MEFL]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph], 03 medical and health sciences, law, [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Filtration, Chemistry, Stem Cells, 021001 nanoscience & nanotechnology, Isolation (microbiology), [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, 3. Good health, Cell biology, 030104 developmental biology, Stem cell, 0210 nano-technology, Adipose Stem Cells
Abstract: International audience; This study presents the development of an original 2-steps Lab-on-chip that aims at isolating Adipose Stem Cells (ASCs), cells of considerable interest for regenerative medicine, from complex biological samples. Based on hydrodynamic filtration, the device pre-isolates ASCs by removing cells with a diameter below 10µm such as red blood cells or lymphocytes.
Published: 2019

43. Adipose Stem Cells (ASCs) isolation by on-chip pre-treatment of biological samples

Author: Valette, Marion, Bouguelmouna, Mathias, Mariotte, Mélanie, Courson, Rémi, Blatché, Marie-Charline, Girousse, Amandine, Sengenes, Coralie, Reybier, Karine, Gué, Anne Marie, Équipe Micro-Nanofluidique pour les sciences de la vie et de l’environnement (LAAS-MILE), Laboratoire d'analyse et d'architecture des systèmes (LAAS), Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, STROMALab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Etablissement Français du Sang-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Faculté des Sciences et Techniques de Limoges, Service Techniques et Équipements Appliqués à la Microélectronique (LAAS-TEAM), Service Instrumentation Conception Caractérisation (LAAS-I2C), Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université de Toulouse (UT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Valette, Marion, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse Capitole (UT Capitole), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse 1 Capitole (UT1)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, [PHYS.MECA.MEFL]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Mechanics of the fluids [physics.class-ph], [SPI.NANO] Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Stem Cells, Microfluidics, [SPI.MECA.MEFL] Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph], Dry Films, [SDV.BIO] Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Hydrodynamic Filtration, [SPI.MECA.MEFL]Engineering Sciences [physics]/Mechanics [physics.med-ph]/Fluids mechanics [physics.class-ph], [PHYS.MECA.MEFL] Physics [physics]/Mechanics [physics]/Fluid mechanics [physics.class-ph], [PHYS.MECA.MEFL]Physics [physics]/Mechanics [physics]/Fluid mechanics [physics.class-ph], [SPI.NANO]Engineering Sciences [physics]/Micro and nanotechnologies/Microelectronics, Adipose Stem Cells
Abstract: International audience; This study presents the development of an original 2-steps Lab-on-chip that aims at isolating Adipose Stem Cells (ASCs), cells of considerable interest for regenerative medicine, from complex biological samples. Based on hydrodynamic filtration, the device pre-isolates ASCs by removing cells with a diameter below 10µm such as red blood cells or lymphocytes.
Published: 2019

44. Identification of Plasmodium falciparum and host factors associated with cerebral malaria: description of the protocol for a prospective, case-control study in Benin (NeuroCM)

Author: Farid Boumediene, Agnès Aubouy, Daniel Ajzenberg, Achille Massougbodji, Maroufou J. Alao, Sandrine Houzé, Philippe Deloron, Gwladys Bertin, Nicolas Argy, Valentin Joste, Jean-François Faucher, Laurine Maurice, Michel Cot, Ida Dossou-Dagba, Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Neuroépidémiologie Tropicale (NET), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), laboratoire parasitologie, CHU Bichat Paris, Ministère de la santé, Laboratoire de Parasitologie-Mycologie, CHU Limoges, University of Abomey Calavi (UAC), Université Paris Descartes - Faculté de Pharmacie de Paris (UPD5 Pharmacie), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut de Recherche Clinique du Bénin [Abomey-Calavi, Bénin] (IRCB), Centre Hospitalier Universitaire de Zone d'Abomey Calavi / Sô-Ava (CHUZ / AS), Centre Hospitalier Universitaire de la Mère et de l'Enfant Lagune (CHU-MEL), ANR-17-CE17-0001,NEUROCM,Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme(2017), Grelier, Elisabeth, Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme - - NEUROCM2017 - ANR-17-CE17-0001 - AAPG2017 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, parasitology, paediatric neurology, Population, Plasmodium falciparum, Malaria, Cerebral, Host factors, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Epidemiology, parasitic diseases, medicine, Protocol, Benin, Humans, Prospective Studies, Malaria, Falciparum, education, Child, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, education.field_of_study, biology, business.industry, Case-control study, General Medicine, biology.organism_classification, medicine.disease, 3. Good health, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Cerebral Malaria, Research Design, Family medicine, Case-Control Studies, Child, Preschool, Tropical medicine, tropical medicine, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, business, 030217 neurology & neurosurgery, Malaria
Abstract: IntroductionIn 2016, an estimated 216 million cases and 445 000 deaths of malaria occurred worldwide, in 91 countries. In Benin, malaria causes 26.8% of consultation and hospitalisation motif in the general population and 20.9% in children under 5 years old.The goal of the NeuroCM project is to identify the causative factors of neuroinflammation in the context of cerebral malaria. There are currently very few systematic data from West Africa on the aetiologies and management of non-malarial non-traumatic coma in small children, and NeuroCM will help to fill this gap. We postulate that an accurate understanding of molecular and cellular mechanisms involved in neuroinflammation may help to define efficient strategies to prevent and manage cerebral malaria.Methods and analysisThis is a prospective, case-control study comparing cerebral malaria to uncomplicated malaria and non-malarial non-traumatic coma. This study takes place in Benin, precisely in Cotonou for children with coma and in Sô-Ava district for children with uncomplicated malaria. We aim to include 300 children aged between 24 and 71 months and divided in three different clinical groups during 12 months (from December 2017 to November 2018) with a 21 to 28 days follow-up for coma. Study data, including clinical, biological and research results will be collected and managed using CSOnline-Ennov Clinical.Ethics and disseminationEthics approval for the NeuroCM study has been obtained fromComité National d’Ethique pour la Recherche en santéof Benin (n°67/MS/DC/SGM/DRFMT/CNERS/SA; 10/17/2017). NeuroCM study has also been approved byComité consultatif de déontologie et d’éthiqueof Institut de Recherche pour le Développement (IRD; 10/24/2017). The study results will be disseminated through the direct consultations with the WHO’s Multilateral Initiative on Malaria (TDR-MIM) and Roll Back Malaria programme, through scientific meetings and peer-reviewed publications in scientific or medical journals, and through guidelines and booklets.
Published: 2019

45. Polyunsaturated fatty acid metabolites: biosynthesis in Leishmania and role in parasite/host interaction

Author: Julien Pujo, Jean Marie François, Jessica Dalloux-Chioccioli, Pauline Le Faouder, Anne Abot, Lucie Paloque, Teresa Pérez-Berezo, Marie-Ange Teste, Gilles Dietrich, Malwina Mainka, Alexis Valentin, Nicolas Cenac, Justine Bertrand-Michel, Sandra Bourgeade-Delmas, Nils Helge Schebb, Céline Deraison, Corinne Rolland, Catherine Blanpied, Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche en Santé Digestive (IRSD ), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Faculty of Mathematics and Natural Sciences, Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MetaToul Lipidomics, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Wuppertal, Region Midi-Pyrenees, ANR-11-INBS-0010,METABOHUB,Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation(2011), European Project: 627487,EC:FP7:PEOPLE,FP7-PEOPLE-2013-IOF,EPIMACASE(2014), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Plateau MetaToul-LIPIDOMIQUE = MetaToul-Lipidomics, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Gulli, Marie-Hélène, Développement d'une infrastructure française distribuée pour la métabolomique dédiée à l'innovation - - METABOHUB2011 - ANR-11-INBS-0010 - INBS - VALID, THE ROLE OF ELASTASE/ELASTASE INHIBITOR IN DIALOG BETWEEN INTESTINAL EPITHELIAL CELLS AND MACROPHAGES IN INFLAMMATORY BOWEL DISEASES CONTEXT - EPIMACASE - - EC:FP7:PEOPLE2014-08-06 - 2016-08-05 - 627487 - VALID, Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-MetaboHUB-MetaToul, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Male, 0301 basic medicine, Cytochrome P450, 030204 cardiovascular system & hematology, Biochemistry, Mice, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Endocrinology, Macrophage, Research Articles, Leishmania, chemistry.chemical_classification, biology, Chemistry, M2 Macrophage, 3. Good health, macrophages, Phenotype, Arachidonic acid, Docosahexaenoic acid, Fatty Acids, Unsaturated, ω-3, infection, Omega-3 fatty acids, Fatty acid metabolism, arachidonic acid, eicosanoids, omega-3, Infection, Polyunsaturated fatty acid, cytochrome P450, Macrophage polarization, CHO Cells, QD415-436, Biotechnologies, Host-Parasite Interactions, 03 medical and health sciences, Cricetulus, Animals, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, Macrophages, Cell Biology, [CHIM.COOR] Chemical Sciences/Coordination chemistry, biology.organism_classification, Mice, Inbred C57BL, 030104 developmental biology, Metabolism, biology.protein, Eicosanoids, metabolism
Abstract: International audience; Inside the human host, Leishmania infection starts with phagocytosis of infective promastigotes by macrophages. In order to survive, Leishmania has developed several strategies to manipulate macrophage functions. Among these strategies, Leishmania as a source of bioactive lipids has been poorly explored. Herein, we assessed the biosynthesis of polyunsaturated fatty acid metabolites by infective and noninfective stages of Leishmania and further explored the role of these metabolites in macrophage polarization. The concentration of docosahexaenoic acid metabolites, precursors of proresolving lipid mediators, was increased in the infective stage of the parasite compared with the noninfective stage, and cytochrome P450-like proteins were shown to be implicated in the biosynthesis of these metabolites. The treatment of macrophages with lipids extracted from the infective forms of the parasite led to M2 macrophage polarization and blocked the differentiation into the M1 phenotype induced by IFN-γ. In conclusion, Leishmania polyunsaturated fatty acid metabolites, produced by cytochrome P450-like protein activity, are implicated in parasite/host interactions by promoting the polarization of macrophages into a proresolving M2 phenotype.
Published: 2019

46. Non-virological factors are drivers of hepatocellular carcinoma in virosuppressed hepatitis B cirrhosis: Results of ANRS CO12 CirVir cohort

Author: Brichler, Ségolène, Nahon, Pierre, Zoulim, Fabien, Layese, Richard, Bourcier, Valérie, Audureau, Etienne, Sutton, Angela, Letouzé, Eric, Cagnot, Carole, Marcellin, Patrick, Guyader, Dominique, Roulot, Dominique, Pol, Stanislas, de Ledinghen, Victor, Zarski, Jean-Pierre, Calès, Paul, Tran, Albert, Peron, Jean-Marie, Mallat, Ariane, Riachi, Ghassan, Grangé, Jean-Didier, Blanc, Jean-Frederic, Bacq, Yannick, Ouzan, Denis, Bronowicki, Jean-Pierre, Mathurin, Philippe, Larrey, Dominique, Alric, Laurent, Attali, Pierre, Serfaty, Lawrence, Pilette, Christophe, Bourlière, Marc, Thabut, Dominique, Silvain, Christine, Wartelle, Claire, Zucman, David, Christidis, Christos, Roudot-Thoraval, Françoise, Ganne-Carrie, Nathalie, (anrs Co22 Hepather, Co12 Cirvir And Co23 Cupilt Cohorts), Anrs Collaborative Study Group On Hepatocellular Carcinoma, Molecular virology and immunology – Physiopathology and therapeutic of chronic viral hepatitis (Team 18) (Inserm U955), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service de Microbiologie Clinique [Hôpital Avicenne - APHP], Hôpital Avicenne [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'Hépato-gastroentérologie, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre de recherche biomédicale Bichat-Beaujon (CRB3), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Clinical Epidemiology and Ageing : Geriatrie Soins Primaires et Santé Publique (CEpiA), Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Service d'Hépatologie, Université Paris 13 (UP13)-Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Service de santé publique [Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle (LVTS (UMR_S_1148 / U1148)), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Pontchaillou [Rennes], Service de gastroenterologie, Physiopathologie du Système Immunitaire, Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Hépato-Gastro-Entérologie, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Hôpital Saint-André, Hôpital Michallon, Département d'hépato-gastroentérologie, CHU Grenoble-Université Grenoble Alpes (UGA), Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques (HIFIH), Université d'Angers (UA), Centre méditérannéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), CHU Toulouse [Toulouse], Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), CHU Rouen, Normandie Université (NU), CHU Tenon [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Physiopathologie du cancer du foie, Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Département d'hépato-gastro-entérologie [Hôpital Trousseau : CHRU Tours], CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Arnault Tzanck, Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Inflammation: mécanismes et régulation et interactions avec la nutrition et les candidoses, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Cellules Souches, Plasticité Cellulaire, Médecine Régénératrice et Immunothérapies (IRMB), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Hôpital Paul Brousse, Hôpital de Hautepierre [Strasbourg], Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Department of Hepatology and Gastroenterology, CHU de Poitiers, Centre Hospitalier d'Aix en Provence [Aix-en-Provence] (CHIAP ), Hôpital Foch [Suresnes], Institut Mutualiste de Montsouris (IMM), Assistance Publique Hôpitaux de Paris, Hôpitaux Universitaires Paris – Seine Saint-Denis, Site Jean Verdier, Pôle d’Activité Cancérologique Spécialisée, Service d’Hépatologie, F-93143 Bondy, France, ANRS. Grant Number: 15275, Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Jean Verdier [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris 13 (UP13), Service d'hépatologie [CHU Pontchaillou], Université Grenoble Alpes (UGA)-CHU Grenoble, Université Nice Sophia Antipolis (... - 2019) (UNS), Hôpital Purpan [Toulouse], Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours)-CHU Trousseau [APHP], Université de Lille, Droit et Santé-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Service de Médecine Interne [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], École Pratique des Hautes Études (EPHE), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris 13 (UP13)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Pasteur [Paris], and Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU TOURS)-CHU Trousseau [APHP]
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, HBsAg, Sustained Virologic Response, [SDV]Life Sciences [q-bio], Kaplan-Meier Estimate, medicine.disease_cause, Gastroenterology, 0302 clinical medicine, Risk Factors, Surveys and Questionnaires, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, 2. Zero hunger, Liver Neoplasms, Hepatitis C, Middle Aged, Hepatitis B, 3. Good health, Infectious Diseases, Hepatocellular carcinoma, ANRS CO12 CirVir, Female, 030211 gastroenterology & hepatology, Viral hepatitis, carcinogenesis, Hepatitis B virus, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Genotype, risk score, Antiviral Agents, 03 medical and health sciences, Virology, Internal medicine, medicine, Humans, Proportional Hazards Models, Hepatitis, Hepatitis B Surface Antigens, Hepatology, business.industry, medicine.disease, digestive system diseases, prognosis, viral cirrhosis, business
Abstract: International audience; Worldwide, hepatocellular carcinoma (HCC) occurs mainly in Asian patients with hepatitis B virus (HBV) infection. This study aimed to decipher the environmental and virological factors associated with HCC occurrence and validate risk scoring systems in a French multicentre prospective cohort of HBV cirrhotic patients. Patients with biopsy‐proven Child‐Pugh A viral cirrhosis included in the ANRS CO12 CirVir cohort who were HBsAg(+) without hepatitis C coinfection were selected for: (a) interview through a standardized questionnaire reporting coffee consumption and HCC familial history; (b) HBsAg quantification using baseline and sequential 2‐year frozen sera; (c) baseline HBV genotype determination; and (d) assessment of risk factors and applicability of HCC risk scores (Kaplan‐Meier analysis, Cox models). Among 317 patients studied (261 men, median age 53 years, past or ongoing antiviral treatment 93.3% and baseline detectable HBV DNA in 88 patients), the baseline and 2‐year median HBsAg levels were 810 and 463 IU/mL, respectively. After a median follow‐up of 65.2 months, 27 HCC cases were diagnosed (annual incidence: 1.6%). Three factors were independently associated with HCC occurrence: age > 50 years, platelets ≤ 150 × 103/mm3 and body mass index ≥ 30 kg/m2. Two out of five risk scores were validated, and the most accurate was PAGE‐B at 1 year. Moreover, HCC in patients without maintained virological suppression seems more aggressive and less accessible to curative treatment. In conclusion, in French patients with HBV cirrhosis mostly virally suppressed, independent HCC risk factors were host‐related (age, obesity) or linked to the severity of cirrhosis (thrombopenia), and the European PAGE‐B score was the most accurate risk score.
Published: 2019

47. S29434, a Quinone Reductase 2 Inhibitor: Main Biochemical and Cellular Characterization

Author: Aakash Patel, Hala Guedouari, Elzbieta Janda, Karine Reybier, Istvan Gacsalyi, Vishalgiri Goswami, Jean A. Boutin, Adeline Giganti, Mathias Antoine, Monivan Chhour, Marie-Claude Viaud-Massuard, Hervé Da Costa, Marc Bertrand, Pierre Ducrot, Jérôme Paysant, Patrick P. Michel, Gilles Ferry, Thierry Le Diguarher, Daniel A. Kane, Françoise Nepveu, Frédéric Bouillaud, Karen Brebner, Gérald Guillaumet, Etienne C. Hirsch, Philippe Dupuis, Johann Stojko, Institut de Recherches SERVIER (IRS), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Università degli Studi 'Magna Graecia' di Catanzaro [Catanzaro, Italie] (UMG), Egis Pharmaceuticals, Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA), Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut du Cerveau et de la Moëlle Epinière = Brain and Spine Institute (ICM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), St. Francis Xavier University (StFX), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Eurofins-Cerep, Technologie Servier, GICC UMR 7292 CNRS, IMT (Innovation moléculaire et thérapeutique) (IMT), Génétique, immunothérapie, chimie et cancer (GICC), UMR 7292 CNRS [2012-2017] (GICC UMR 7292 CNRS), Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Oxygen Healthcare Pvt Ltd, Institut de Recherches Internationales Servier [Suresnes] (IRIS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Università degli Studi 'Magna Graecia' di Catanzaro = University of Catanzaro (UMG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Orléans (UO)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), GICC EA 7501, IMT (Innovation moléculaire et thérapeutique) (IMT), Groupe innovation et ciblage cellulaire (GICC), EA 7501 [2018-...] (GICC EA 7501), Université de Tours (UT)-Université de Tours (UT), Hirsch, Etienne, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), and Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Tours (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: 0301 basic medicine, Male, Rats Wistar, Pyridines, [SDV]Life Sciences [q-bio], Quinone Reductases / antagonists & inhibitors, Reductase, Cell Membrane / drug effects, 03 medical and health sciences, Mice, 0302 clinical medicine, Pyrrolizidine Alkaloids / pharmacology, In vivo, Cell Line, Tumor, NAD(P)H Dehydrogenase (Quinone), [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, medicine, Animals, Humans, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Quinone Reductases, Rats, Wistar, NAD(P)H Dehydrogenase (Quinone) / metabolism, Pyrrolizidine Alkaloids, Pharmacology, chemistry.chemical_classification, Reactive oxygen species, Chemistry, Cell Membrane, Autophagy, Neurodegeneration, Reactive Oxygen Species / metabolism, Hep G2 Cells, Cell Membrane / metabolism, medicine.disease, Quinone, Cell Line / Tumor, Rats, [SDV] Life Sciences [q-bio], 030104 developmental biology, Enzyme, Biochemistry, Molecular Medicine, NAD+ kinase, Reactive Oxygen Species, 030217 neurology & neurosurgery, Pyridines / pharmacology
Abstract: International audience; Quinone reductase 2 (QR2, E.C. 1.10.5.1) is an enzyme with a feature that has attracted attention for several decades: in standard conditions, instead of recognizing NAD(P)H as an electron donor, it recognizes putative metabolites of NADH, such as N-methyl- and N-ribosyl-dihydronicotinamide. QR2 has been particularly associated with reactive oxygen species and memory, strongly suggesting a link among QR2 (as a possible key element in pro-oxidation), autophagy, and neurodegeneration. In molecular and cellular pharmacology, understanding physiopathological associations can be difficult because of a lack of specific and powerful tools. Here, we present a thorough description of the potent, nanomolar inhibitor [2-(2-methoxy-5H-1,4b,9-triaza(indeno[2,1-a]inden-10-yl)ethyl]-2-furamide (S29434 or NMDPEF; IC50 = 5-16 nM) of QR2 at different organizational levels. We provide full detailed syntheses, describe its cocrystallization with and behavior at QR2 on a millisecond timeline, show that it penetrates cell membranes and inhibits QR2-mediated reactive oxygen species (ROS) production within the 100 nM range, and describe its actions in several in vivo models and lack of actions in various ROS-producing systems. The inhibitor is fairly stable in vivo, penetrates cells, specifically inhibits QR2, and shows activities that suggest a key role for this enzyme in different pathologic conditions, including neurodegenerative diseases.
Published: 2019

48. Multicenter Evaluation of a Novel Immunochromatographic Test for Anti-aspergillus IgG Detection

Author: Raphaël P. Piarroux, Thomas Romain, Aurélie Martin, Damien Vainqueur, Joana Vitte, Laurence Lachaud, Jean-Pierre Gangneux, Frédéric Gabriel, Judith Fillaux, Stéphane Ranque, Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), LDBIO Diagnostics, Service de Parasitologie et Mycologie, CHU Toulouse [Toulouse]-Institut Fédératif de Biologie (IFB) - Hôpital Purpan, Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Microbes évolution phylogénie et infections (MEPHI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), LDBIO, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Service de Parasitologie et Mycologie [CHU Toulouse], Institut Fédératif de Biologie (IFB), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Chard-Hutchinson, Xavier
Subjects: lcsh:QR1-502, specificity, Disease, Aspergillosis, lcsh:Microbiology, Serology, Cellular and Infection Microbiology, 0302 clinical medicine, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Prospective Studies, 030212 general & internal medicine, Prospective cohort study, [SDV.MP.MYC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, Original Research, Immunoassay, 0303 health sciences, biology, Chronic pulmonary aspergillosis, Aspergillus serology, 3. Good health, Aspergillus, Infectious Diseases, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, France, Allergic bronchopulmonary aspergillosis, Microbiology (medical), medicine.medical_specialty, Immunology, Sensitivity and Specificity, Microbiology, 03 medical and health sciences, chronic pulmonary aspergillosis, Internal medicine, immunochromatography, medicine, Humans, Serologic Tests, Antibodies, Fungal, Retrospective Studies, 030306 microbiology, business.industry, Retrospective cohort study, medicine.disease, biology.organism_classification, sensitivity, [SDV.MP.MYC] Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Mycology, point-of-care, Immunoglobulin G, business, allergic broncho-pulmonary aspergillosis
Abstract: International audience; Aspergillus sp. fungi cause various diseases in both immunocompetent and immunocompromised patients. The most frequent Aspergillus disorders include chronic pulmonary aspergillosis (CPA), a life-threatening disease that affects at least 3 million people worldwide, and allergic bronchopulmonary aspergillosis (ABPA), which affects approximately 4.8 million severe asthmatic patients globally. Diagnosis of such diseases involves IgG serological testing; however, the currently available anti-Aspergillus IgG detection assays are inappropriate for resource-poor laboratory settings, as they are expensive, rely on automated procedures, and require stable electrical power. Therefore, accurate CPA or ABPA diagnosis facilities are lacking in most low- and middle-income countries. We evaluated a novel anti-Aspergillus antibody immunochromatographic test (ICT) that requires minimal laboratory equipment. Two evaluations were performed a single-center 4-month prospective study in a French reference laboratory (44 cases/257 patients) and a retrospective study in five French reference laboratories (262 cases and 188 controls). We estimated the ICT indices for the diagnosis of chronic aspergillosis, and the test results were compared to those of anti-Aspergillus IgG immunoblot (IB) assay. Of the 713 patients included in the study, 306 had chronic aspergillosis. Test sensitivity and specificity were 88.9%(95% CI[85-92]) and 96.3%(95% CI[94-98]) for the ICT and 93.1% (95% CI[90-96]) and 94.3% (95% CI[92-96]) for the IB, respectively. Agreement between the two assays was almost perfect (kappa = 0.86). As this ICT displays good diagnostic performance and complies with the ASSURED (Affordable, Sensitive, Specific, User-friendly, Equipment-free, and Delivered) criteria, we concluded that this anti-Aspergillus antibody ICT can be used to diagnose Aspergillus diseases in resource-poor settings.
Published: 2019

49. Nadir CD4 Is Negatively Associated With Antinuclear Antibody Detection in HCV/HIV-Coinfected Patients

Author: Eric Rosenthal, Dominique Salmon, Laure Esterle, Didier Neau, Anne Simon, Linda Wittkop, Isabelle Poizot-Martin, Carla E. Cano, Laurent Alric, Caroline Lascoux-Combe, Camille Gilbert, Anne Gervais, Philippe Sogni, HAL AMU, Administrateur, Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Immuno-hématologie clinique [Hôpital Sainte Marguerite - APHM], Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)-Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Hôpital l'Archet, Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), Institut de Santé Publique, d'Epidémiologie et de Développement (ISPED), Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service de médecine interne [CHU Pitié-Salpétrière], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU), Service de maladies infectieuses et tropicales [Saint-Louis], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupe Hospitalier Saint Louis - Lariboisière - Fernand Widal [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Services de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bichat], AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux], Hôpital Hôtel-Dieu [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Département d'hépatologie [CHU Cochin], Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Lymphopoïèse (Lymphopoïèse (UMR_1223 / U1223 / U-Pasteur_4)), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Bordeaux [Bordeaux], The authors thank all members of the ANRS CO13-HEPAVIH Study Group and all patients who took part in this study., Scientific Committee of the ANRS CO13 HEPAVIH Study Group: D. Salmon (co-Principal investigator), L. Wittkop (co-Principal Investigator), P. Sogni (co-Principal Investigator), L. Esterle (project manager), P. Trimoulet, J. Izopet, L. Serfaty, V. Paradis, B. Spire, P. Carrieri, M.A. Valantin, G. Pialoux, J. Chas, I. Poizot-Martin, K. Barangue, A. Naqvi, E. Rosenthal, A. Bicart-See, O. Bouchaud, A. Gervais, C. Lascoux-Combe, C. Goujard, K. Lacombe, C. Duvivier, D. Vittecoq, D. Neau, P. Morlat, F. Bani-Sadr, L. Meyer, F. Boufassa, S. Dominguez, B. Autran, A.M. Roque, C. Solas, H. Fontaine, D. Costagliola, L. Piroth, A. Simon, D. Zucman, F. Boué, P. Miailhes, E. Billaud, H. Aumaître, D. Rey, G. Peytavin, V. Petrov-Sanchez, and A. Pailhe., Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université de Paris (UP), Service de Médecine Interne [Purpan], CHU Toulouse [Toulouse]-Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pôle Digestif [purpan], Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse]-CHU Toulouse [Toulouse], Service des maladies infectieuses et tropicales, hôpital Pellegrin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Hôpital Cochin [AP-HP], Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Service d'Information médicale [Bordeaux], Pôle de Santé publique [Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux]-CHU Bordeaux [Bordeaux], CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Male, medicine.medical_specialty, Anti-nuclear antibody, Cross-sectional study, Hepatitis C virus, T-Lymphocytes, HIV Infections, Hepacivirus, 030312 virology, Logistic regression, medicine.disease_cause, Autoimmune Diseases, 03 medical and health sciences, Immunophenotyping, Internal medicine, medicine, Humans, Pharmacology (medical), anti–liver kidney microsome antibodies, non–organ-specific autoantibodies, 0303 health sciences, biology, business.industry, Coinfection, anti–smooth muscle actin antibodies, Middle Aged, Hepatitis C, Actins, 3. Good health, CD4 Lymphocyte Count, Infectious Diseases, Cross-Sectional Studies, autoimmune antinuclear, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Antibodies, Antinuclear, Cohort, biology.protein, HIV-1, Microsomes, Liver, Female, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, HCV–HIV coinfection, Antibody, nadir CD4, business, Nadir (topography)
Abstract: Background: Hepatitis C virus (HCV) and HIV infections are associated with higher risk of autoimmune diseases and T-cell dysfunction. Setting: We evaluate prevalence and factors associated with the presence of autoimmune antinuclear (ANA), anti–smooth muscle actin (aSMA), and anti–liver kidney microsome (aLKM1) antibodies (Ab) in HCV/HIV-coinfected patients during the post–combined antiretroviral therapy era. Methods: A cross-sectional observational study nested in the ANRS CO13 HEPAVIH cohort (NCT number: NCT03324633). We selected patients with both ANA testing and T-cell immunophenotyping determination during the cohort follow-up and collected aLKM1 and aSMA data when available. Logistic regression models were built to determine factors associated with the presence of auto-Ab. Results: Two hundred twenty-three HCV/HIV-coinfected patients fulfilled selection criteria. Prevalence of ANA and aSMA was 43.5% and 23.2%, respectively, and both were detected in 13.3% of patients. Isolated aSMA were detected in 9.9% and aLKM1 in 2 patients. In multivariable analysis, only a low nadir CD4 T-cell count was significantly associated with ANA detection. Conclusions: ANA and aSMA detection remain frequent in HCV/HIV-coinfected patients during the post–combined antiretroviral therapy era, despite fair immune restoration. These results advocate for a close monitoring of ANA before immune checkpoint inhibitor therapy in these patients with greater caution for those with a low nadir CD4 T-cell count.
Published: 2019

50. Cartographier les ressources pour gérer les priorités

Author: Isabelle Guérin, François Roubaud, Christophe Guilmoto, Mireille Razafindrakoto, Marc Pilon, Isabelle Léglise, Pierre-Yves Le Meur, Fatoumata Ouattara, Christian Seignobos, Pierre Chauveau, Eric Léonard, Dominique Guillaud, Alain Froment, Nelly Robin, Michel Agier, Sophie Bava, Annabel Desgrées Du Loû, Flore Gubert, Eric Delaporte, Gonzague Jourdain, Alexandre Dumont, Serge Trèche, Jacques Berger, Pierre Traissac, Valérie Delaunay, Vincent Robert, Frédéric Darriet, Cheikh Sokhna, Michel Cot, Martine Peeters, Eric Leroy, Alice Desclaux, Marc Hougard, Didier Paugy, Michel Boussinesq, Philippe Solano, Dorothée Missé, Louis-Clément Gouagna, Jean Lemesre, Anne-Laure Bañuls, Menkès, Christophe E., Morgan Mangeas, Benjamin Sultan, Thomas Condom, Marie Gosset, Serge Janicot, Jean Nocquet, Luc Le Pennec, Sébastien Hardy, Philippe Charvis, Yann Hello, Emmanuel Bonnet, Emilie Strady, David Point, Bernard Ollivier, Biegala, Isabelle C., Christian Feller, Christian Valentin, Eric Giraud, Eric Blanchart, Pierre Montoroi, Philippe Cecchi, Jean Albergel, Jean-Michel Vouillamoz, Vincent Simonneaux, Gil Boulet, Thierry Ruf, Geneviève Michon, Jean-Baptiste Boutrais, Laure Emperaire, Robin Duponnois, Philippe Boulanger, Eugénie Hébrard, Valerie Verdier, Boris Szurek, Bruno Le Ru, Paul-André Calatayud, Olivier Dangles, Frédérique Aberlenc, Sevastianos Roussos, Gauthier Dobigny, Marc Legendre, Daniel Gaertner, Pierre Chavance, Pascal Bach, Arnaud Bertrand, Jérôme Vialard, Jacques Merle, Bruno Voituriez, Bernard Bourlès, Pierrick Penven, Gil Mahe, Thierry Lebel, Luc Descroix, Pierre Chevallier, Stéphane Calmant, Bruno Turcq, Adrien Favreau, Jean-Louis Rajot, Raphaël Pélissier, Philippe Cury, Riccardo Rodolfo-Metalpa, Hervé De Tricornot, Frédéric Simard, Jean-François Etard, Bernard Taverne, Florence Fournet, Alexis Drogoul, Marc Souris, Monique Simier, Marie Bonnin, Alain Ghesquière, Serge Hamon, Yves Vigouroux, Sophie Gonzalez, Jean-François Molino, Geneviève Bourdy, Christian Moretti, Pierre Ottino Garanger, Francisco Valdez, Benoît Antheaume, Nicolas Gratiot, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire d'Economie de Dauphine (LEDa), Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL), Laboratoire Population-Environnement-Développement (LPED), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Structure et Dynamique des Langues (SeDyL), Institut National des Langues et Civilisations Orientales (Inalco)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR135-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Etudes des Mondes Africains (CEMAf), Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (UP1)-Université de Provence - 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Paris 5 (UPD5), Développement, institutions et analyses de long terme (DIAL), Recherches Translationnelles sur le VIH et les maladies infectieuses endémiques et émergentes (TransVIHMI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Prévention des malnutritions er des pathologies associées, Nutrition et Alimentation des Populations aux Suds (NutriPass), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Diversity, ecology, evolution & Adaptation of arthropod vectors (MIVEGEC-DEEVA), Evolution des Systèmes Vectoriels (ESV), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Vector Control Group (MIVEGEC-VCG), Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (URMITE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR48, Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Institut des sciences biologiques (INSB-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), PRES Sorbonne Paris Cité, VIH/SIDA et maladies associées, Université Montpellier 1 (UM1), Département Milieux et Peuplements Aquatiques, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN), Centre IRD de Montpellier (IRD), Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), Du gène à l'écosystème (MIVEGEC-GeneSys), Pathogènes, Environnement, Santé Humaine (EPATH), Ecologie marine tropicale des océans Pacifique et Indien (ENTROPIE [Nouvelle-Calédonie]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA), Environnement, Géo-ingénierie et Développement (EGID), Géosciences Environnement Toulouse (GET), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Météo-France -Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)-Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Géoazur (GEOAZUR 7329), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP )-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes [2016-2019] (UGA [2016-2019]), Institut méditerranéen d'océanologie (MIO), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Toulon (UTLN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Directeur de recherche émérite (Science du Sol) de l'Institut de Recherche pour le Développement, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Ouest]), Sols, usages des terres, dégradation, réhabilitation (SOLUTIONS), Centre de recherche rétrospective de Marseille (CRRM), Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3, Ecologie fonctionnelle et biogéochimie des sols et des agro-écosystèmes (UMR Eco&Sols), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Gestion de l'Eau, Acteurs, Usages (UMR G-EAU), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-AgroParisTech-Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Laboratoire d'étude des Interactions Sol - 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Paris 11 (UP11)-IRD-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), INRA - Mathématiques et Informatique Appliquées (Unité MIAJ), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Diversité, adaptation, développement des plantes (UMR DIADE), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut méditerranéen de biodiversité et d'écologie marine et continentale (IMBE), Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Caractérisation et valorisation de la diversité ichtyologique pour une aquaculture raisonnée (CAVIAR), UMR 212 EME 'écosystèmes marins exploités' (EME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Montpellier (UM), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - 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Sciences et Techniques (UM2)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), INSB-INSB-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut Pierre-Simon-Laplace (IPSL (FR_636)), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-École polytechnique (X)-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP)-École normale supérieure - 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Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Observatoire Midi-Pyrénées (OMP), Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Météo France-Centre National d'Études Spatiales [Toulouse] (CNES)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IRD-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UMR237-Aix Marseille Université (AMU)-Avignon Université (AU), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Brest (UBO), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Cheikh Anta Diop [Dakar, Sénégal] (UCAD)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Yaoundé I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Université Montpellier 1 (UM1), Ifremer - Nouvelle-Calédonie, Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Nouvelle-Calédonie])-Université de la Nouvelle-Calédonie (UNC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (UJM)-Institut de Recherche pour le Développement et la société-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Observatoire de Physique du Globe de Clermont-Ferrand (OPGC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne [2017-2020] (UCA [2017-2020])-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM), Université Côte d'Azur (UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire de la Côte d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA), Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Université Côte d'Azur (UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - 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Subjects: Cartographie, MONDE, [SHS.GEO]Humanities and Social Sciences/Geography
Abstract: International audience; Comment, depuis plusieurs décennies, la recherche scientifique contribue-t-elle au développement des pays du Sud ? À travers plus de 100 succès emblématiques de la recherche en partenariat, cet ouvrage nous plonge au coeur des grandes questions de développement : oeuvrer pour des sociétés plus justes, lutter contre les maladies, faire face aux risques naturels, mettre en place une agriculture durable garantissant la sécurité alimentaire, préserver la biodiversité, partager les savoirs... Il montre ainsi comment la recherche contribue à l'amélioration des conditions de vie et à la préservation de l'environnement dans les pays en développement, en soulignant le rôle de la science pour répondre aux défis du monde actuel et à venir. Composé de textes courts, didactiques et richement illustrés, il s'adresse à tous les publics.
Published: 2019

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