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1. Hepatocellular carcinoma in Peru: A molecular description of an unconventional clinical presentation

Author: J. Contreras-Mancilla, J.P. Cerapio, E. Ruiz, R. Fernández, S. Casavilca-Zambrano, C. Machicado, J.J. Fournié, P. Pineau, S. Bertani, Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TOUCAN Laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), University of Zaragoza - Universidad de Zaragoza [Zaragoza], Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Los autores declaran que este trabajo fue apoyado por el ITMO Cáncer de la Alianza Nacional Francesa para las Ciencias de la Vida y la Salud (Aviesan) y del Instituto Nacional francés del Cáncer (INCa) sobre fondos administrados por el Instituto Nacional francés de Salud e Investigación Médica (Inserm) (subvención 21CD025-00), así como por el Programa de Laboratorios Mixtos Internationales (LMI) del Instituto francés de Investigación para el Desarrollo (IRD). JCM reconoce el apoyo financiero del Proyecto Concytec-Banco Mundial «Mejoramiento y Ampliación de los Servicios del Sistema Nacional de Ciencia Tecnología e Innovación Tecnológica» 8682-PE, a través de su unidad ejecutora ProCiencia [08-2018-FONDECYT/BM-Programas de Doctorados en Áreas Estratégicas y Generales]. JPC fue beneficiario de una beca posdoctoral de la Agencia Nacional de Investigación de Francia (ANR) en el marco del Programa de Laboratorios de Excelencia 11-LABX-0068., and ANR-11-LABX-0068,TOUCAN,Analyse intégrée de la résistance dans les cancers hématologiques(2011)
Subjects: DNA methylation, Hepatocellular carcinoma, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Integrative genomics, Peru, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, General Medicine, Transcriptome
Abstract: International audience; Background. Hepatocellular carcinoma (HCC) is the third most frequent cancer of digestive tract tumors in Peru, with a high mortality rate of 17.7 per 100,000 inhabitants. A significant number of HCC cases in Peru do not follow the classic clinical epidemiology of the disease described in other parts of the world. Those patients present with a distinct transcriptome profile and a singular tumor process, suggesting a particular type of hepatocarcinogenesis in a portion of the Peruvian population. Aim. Our aim was to understand the clinical and biologic involvement of the epigenetic profile (methylation) and gene expression (transcriptome) of HCC in Peruvian patients. Methods. HCC and liver transcriptome and DNA methylation profiles were evaluated in 74 Peruvian patients. Results. When grouped by age, there was greater DNA methylation in younger patients with HCC but no differences with respect to the transcriptomic profile. A high prevalence of the hepatitis B virus (HBV) (> 90%) was also observed in the younger patients with HCC. Enrichment analyses in both molecular profiles pinpointed PRC2 as an important molecular effector of that liver tumor process in Peruvian patients. Conclusion. HCC in Peruvian patients has a unique molecular profile, associated with the presence of HBV, as well as overall DNA hypermethylation related to undifferentiated liver cells or cellular reprogramming.; Introducción. En Perú, el carcinoma hepatocelular (CHC) ocupa el tercer lugar en incidencia entre los tumores del sistema digestivo, y tiene una alta tasa de mortalidad, 17.7 por 100,000 habitantes. La mayoría de los casos reportados no presentan la epidemiología clínica clásica del CHC observado en otras partes del mundo. Además, se ha identificado que estos pacientes presentan un perfil transcriptómico distinto y un proceso tumoral singular, sugiriendo un proceso particular de hepatocarcinogénesis en una fracción de la población peruana. Objetivo. El presente estudio busca comprender la implicancia clínica y biológica del perfil epigenético (metilación) y de expresión de los genes (transcriptómico) del CHC en los pacientes peruanos. Métodos. Se evaluó el perfil de transcriptómico y de metilación de ADN de hígado y CHC en 74 pacientes peruanos. Resultados. El agrupamiento por edades mostró una mayor metilación del ADN en los pacientes jóvenes con CHC, en contraste no se observaron diferencias en el perfil transcriptómico. Adicionalmente, también se evidenció una alta prevalencia del virus de hepatitis B (VHB) (> 90%) en los pacientes jóvenes con CHC. El análisis de enriquecimiento en ambos perfiles moleculares demostró que PRC2 es posiblemente uno de los principales actores moleculares en este proceso tumoral hepático en pacientes peruanos. Conclusión. El CHC peruano presenta un perfil molecular único, asociado a la presencia del VHB, y con una hipermetilación global del ADN asociado a células hepáticas indiferenciadas o a una reprogramación celular.
Published: 2023

2. Single-cell differentiation trajectories define early stages of a human cutaneous T-cell lymphoma

Author: Juan‐Pablo Cerapio, Marion Perrier, Fréderic Pont, Camille Laurent, Stéphane Bertani, Jean‐Jacques Fournie, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Lymphoma, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hemic and lymphatic diseases, Pseudotime, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, scRNAseq, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Gamma delta T cells, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]
Abstract: International audience; Aim: The aim of this article is to characterize in detail the γδ T lymphocytes from an adult patient with primary cutaneous T-cell lymphoma of γδ subtype (γδ CTCL). Methods: Here this article reports trajectory mapping on high-resolution differentiation trajectories of γδ T lymphocytes digitally extracted from a scRNAseq dataset. Results: In the patch-to-plaque progression of CTCL, the TCRVγnon9 subset of γδ T cells differentiated from naive T cells (Tn) and central memory T cells (Tcm) to abundant effector memory T cells (Tem) while other cutaneous γδ T and CD8 T cells remained unchanged. Conclusions: This transcriptomic switch underlies the emergence of a CTCL-like progression of the TCRVγnon9 γδ T subtype and suggests new routes for treating these diseases.
Published: 2022

3. Nontargeted Screening for Flavonoids in Salicornia Plant by Reversed-Phase Liquid Chromatography–Electrospray Orbitrap Data-Dependent MS2/MS3

Author: Maroussia Parailloux, Simon Godin, Ryszard Lobinski, Institut des sciences analytiques et de physico-chimie pour l'environnement et les materiaux (IPREM), Université de Pau et des Pays de l'Adour (UPPA)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and Conseil Régional Nouvelle Aquitaine
Subjects: fragment ion search, Organic Chemistry, Pharmaceutical Science, metabolomics, nontargeted screening, Analytical Chemistry, Chemistry (miscellaneous), [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Drug Discovery, flavonoids, Salicornia, high-resolution tandem mass spectrometry, Molecular Medicine, [CHIM]Chemical Sciences, Physical and Theoretical Chemistry
Abstract: International audience; The Salicornia genus has great potential in agrifood industries because of its nutritional benefits related to its high content of antioxidant compounds, including flavonoids. A nontargeted method based on reversed-phase liquid chromatography-electrospray orbitrap data-dependent MS 2 /MS 3 and the fragment ion search (FISh) strategy was developed to screen flavonoids in Salicornia plants. An extensive study of fragmentation of a set of flavonoid standards allowed for the definition of 15 characteristic fragment ions for flagging flavonoids in the plant matrix. The nontargeted analysis was applied to Salicornia europaea species and allowed for the annotation of 25 candidate flavonoids, including 14 that had not been reported previously. Structural prediction of two unreported flavonoids and their isomeric forms was based on an advanced data processing method using an in silico approach and in-house databases compiling flavonoid-specific chemical substitution. Finally, the method developed allowed for the optimization of extraction yields of flavonoids from the plant matrix.
Published: 2023

4. 6-Chloro-3-nitro-2-[(phenylsulfonyl)methyl]imidazo[1,2-b]pyridazine

Author: Romain Paoli-Lombardo, Nicolas Primas, Sébastien Hutter, Sandra Bourgeade-Delmas, Clotilde Boudot, Caroline Castera-Ducros, Inès Jacquet, Bertrand Courtioux, Nadine Azas, Pascal Rathelot, Patrice Vanelle, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Institut Hospitalier Universitaire Méditerranée Infection (IHU Marseille), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Univ Limoges, Inst Neuroepidemiol & Trop Neurol, Fac Pharm, Limoges (INSERM U1094), Neuroépidémiologie Tropicale et Comparée (NETEC), Université de Limoges (UNILIM)-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST FR CNRS 3503), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM), Chimie, biologie et radicaux libres - UMR 6517 (CBRL), and Université de la Méditerranée - Aix-Marseille 2-Université Paul Cézanne - Aix-Marseille 3-Université de Provence - Aix-Marseille 1-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: [SDV.MHEP.ME]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Emerging diseases, 020, 050, 052, Organic Chemistry, 2-b]pyridazine, structure-activity relationships, Leishmania spp, imidazo[1, Biochemistry, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, scaffold-hopping, nitroaromatic, [SDV.MHEP.CSC]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Cardiology and cardiovascular system, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.MP.PAR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Parasitology, Trypanosoma brucei, Physical and Theoretical Chemistry
Abstract: As part of our ongoing scaffold-hopping work on an antikinetoplastid 3-nitroimidazo[1,2-a]pyridine scaffold, we explored 3-nitroimidazo[1,2-b]pyridazine as a potential new antikinetoplastid series. Using conditions previously described by our lab, we obtained 6-chloro-3-nitro-2-[(phenylsulfonyl)methyl]imidazo[1,2-b]pyridazine with 54% yield. In vitro activity of this compound was evaluated against both the promastigote form of Leishmania donovani, the axenic amastigote form of Leishmania infantum and the trypomastigote blood stream form of Trypanosomabrucei brucei, and its influence on cell viability was assessed on the HepG2 cell line. However, despite good activity against the trypomastigote blood stream form of T. b. brucei (EC50 = 0.38 µM), it showed poor solubility in both HepG2 (CC50 > 7.8 µM) and L. infantum axenic amastigotes (EC50 > 1.6 µM) culture media, associated with a loss of activity against the promastigote form of L. infantum (EC50 > 15.6 µM).
Published: 2023

5. Abundance, perceptions and utilizations of termite mounds in Cambodia

Author: Ratha Muon, Chenda Lai, Vincent Hervé, Rainer Zaiss, François Chassagne, Eve Bureau‐Point, Sébastien Marchand, Martine Audibert, Jacques Berger, Frank Wieringa, Arnould Savouré, Kimchhin Sok, Jean‐Dominique Meunier, Vannak Ann, Pascal Jouquet, Institute of Technology of Cambodia [Cambodge] (KHM), Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Paris-Saclay Food and Bioproduct Engineering (SayFood), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Norbert Elias (CNELIAS), École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-Avignon Université (AU)-Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Études et de Recherches sur le Développement International (CERDI), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA), Université d'Auvergne - Clermont-Ferrand I (UdA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition et Alimentation des Populations aux Suds (NutriPass), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Démarche intégrée pour l'obtention d'aliments de qualité (UMR QualiSud), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de Recherche pour le Développement (IRD en Occitanie) (IRD (Occitanie)), AERD Center of Excellence, Royal University of Agriculture (RUA), Phnom Penh, (AERD), Centre européen de recherche et d'enseignement des géosciences de l'environnement (CEREGE), and Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Collège de France (CdF (institution))-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)
Subjects: paddy fields, termite mounds, [SDV]Life Sciences [q-bio], soil fertility, food diversity, [SDE]Environmental Sciences, utilization, Soil Science, ecosystem services, Pollution, Agronomy and Crop Science, medicinal plants, [SHS]Humanities and Social Sciences
Abstract: International audience; In the Lower Mekong Basin, paddy fields often appear as mosaics, with soil mounds covered by trees or other plants in a spotty distribution. These soil mounds are commonly named termite ‘lenticular mounds’ because termite bioturbation is considered to be at their origin. Termite mounds host a large diversity of animals and plants, increasing landscape patchiness. Because the preservation of these islands of biodiversity is threatened by modern agricultural practices, the aim of this study was to quantify their abundance and the services they provide to the local population. The abundance of mounds and their use by the population were quantified in a catchment in Cambodia. We found that mounds density reached ~2 mounds ha−1. Interviews carried out within the catchment showed that most of the interviewees used mounds for increasing the fertility of their field and for the cultivation of rice and other plants (e.g. sponge gourd and pumpkin). In addition to their potential to increase plant productivity, the survey revealed that animals (rats and snakes), mushrooms and 13 plant species found on or in mounds were consumed by the population. In addition to potentially contributing to an increase in food diversity, mounds also impacted farmers' health by allowing access to 20 medicinal plant species and indirectly via a reduction in pesticide use. In conclusion, this study is the first attempt to quantify the large number of services provided by termite mounds in Cambodia. This increase in the knowledge of the diversity of environmental and socioeconomic services provided by termite mounds is likely to contribute to their preservation and provide a basis for the sustainable management of biodiversity in paddy fields in the Lower Mekong Basin region
Published: 2023

6. Biophysical Dissection of Isolated GPCRs: The Adenosine A2A Receptor under the Bistouries

Author: Jean-Louis Banères, Thomas Botzanowski, Jean A. Boutin, Barbara Calamini, Jérôme Castel, Laurent J. Catoire, Sarah Cianférani, Claire Demesmay, Gavin Ferguson, Gilles Ferry, Julie Kniazeff, Isabelle Krimm, Thierry Langer, Guillaume Lebon, Marie Ley, Miklos Nyerges, Magali Schwob, Catherine Venien-Bryan, Renaud Wagner, Gabrielle Zeder-Lutz, Claudia Zilian-Stohrer, Institut des Biomolécules Max Mousseron [Pôle Chimie Balard] (IBMM), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Montpellier (ENSCM), Université de Montpellier (UM), Département Sciences Analytiques et Interactions Ioniques et Biomoléculaires (DSA-IPHC), Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Sanofi-Aventis R&D, SANOFI Recherche, Food and Agriculture Organization, Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Infrastructure Nationale de Protéomique, FR2048 ProFI, Separative Methods - Techniques séparatives (TechSep), Institut des Sciences Analytiques (ISA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherches SERVIER (IRS), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Vienna [Vienna], Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Spectrométrie de Masse BioOrganique [Strasbourg] (LSMBO), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Strasbourg (UNISTRA)-Université de Haute-Alsace (UHA) Mulhouse - Colmar (Université de Haute-Alsace (UHA))-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR206-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), Biotechnologie et signalisation cellulaire (BSC), and Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut de recherche de l'Ecole de biotechnologie de Strasbourg (IREBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: purification, ligands, adenosine receptor A 2A, [SDV]Life Sciences [q-bio], biophysical approach, expression, adenosine receptor A 2A biophysical approach NMR mass spectrometry molecular pharmacology expression purification reconstitution ligands techniques review, reconstitution, review, molecular pharmacology, techniques, NMR, mass spectrometry
Abstract: International audience; In an effort to provide an overview of the biophysical approaches used to study G-protein-coupled receptors, we chose to consider the adenosine A2A receptor as a model, as it is widely reported in the literature to explore the way GPCRs are studied nowadays. After a brief introduction of the receptor, we gathered descriptions of the various tools used to investigate the pharmacology and structure of the A2A receptor. We began by describing the key developments which have led to successful studies of GPCRs including the cloning, expression and purification of A2A, and the subsequent characterizations including quality control, binding and functional studies that have been necessary for the further understanding of the receptor. Then, we reviewed the reconstitution of A2A into nanodiscs as well as the use of this biological material in structural mass spectrometry, NMR, calorimetry and various other approaches to gain not only information about the structure and function of A2A, but also the dynamics of the receptor and the tools necessary to pursue such investigations. The body of techniques presented herein are applicable to all GPCRs amenable to purification.
Published: 2023

7. Powerful Antioxidant and Pro-Oxidant Properties of Cassia roxburghii DC. Leaves Cultivated in Egypt in Relation to Their Anti-Infectious Activities

Author: Pierre Perio, Hany Ibrahim, Christine Roques, Sahar S. M. El Souda, Christel Henocq-Pigasse, Nehal Ibrahim, Françoise Nepveu, National Research Centre - NRC (EGYPT), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire de génie chimique [ancien site de Basso-Cambo] (LGC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut National Polytechnique de Toulouse - INPT (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), National Research Center - NRC (Egypt), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement - PHARMA-DEV (Toulouse, France), Institut National Polytechnique de Toulouse - Toulouse INP (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Laboratoire de Génie Chimique (LGC), and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP)
Subjects: food.ingredient, Antioxidant, DPPH, Radical scavenging, medicine.medical_treatment, Ethyl acetate, Cassia marginata Roxb, Antiplasmodial, chemistry.chemical_compound, food, [CHIM.GENI]Chemical Sciences/Chemical engineering, Enterococcus hirae, medicine, Génie chimique, Petroleum ether, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Génie des procédés, Pharmacology, biology, Traditional medicine, Chemistry, Aspergillus niger, biology.organism_classification, 6. Clean water, Complementary and alternative medicine, Biochemistry, Cassia roxburghii, Antimicrobial, Antibacterial activity
Abstract: International audience; Leaf extracts of Cassia roxburghii DC., prepared in petroleum ether, chloroform, ethyl acetate, butanol, and methanol/water (70:30, v/v), were evaluated as antioxidant, pro-oxidant, anti-infectious, and cytotoxic agents. The major metabolite of each extract was identified by chromatographic and spectroscopic means. The redox properties were assessed with a battery of assays, which revealed that the ethyl acetate extract demonstrated an interesting scavenging activity of DPPH and superoxide radicals and an ascorbic acid-like pro-oxidant activity. All the tested extracts showed moderate antiplasmodial activity against a chloroquine-resistant strain of Plasmodium falciparum, by possible disruption of parasite fine redox balance. Cytotoxicity was evaluated against a human breast cancer cell line. The antimicrobial activities of the extracts were estimated against representative bacterial strains (Staphylococcus aureus, Enterococcus hirae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli) and fungal species (Candida albicans, Aspergillus niger). The ethylacetate extract possessed the highest redox properties and exhibited the highest antiplasmodial activity; there was no correlation between antibacterial activity and the redox properties of the extracts.
Published: 2015

8. Star-like poly(peptoid)s with selective antibacterial activity

Author: Pedro Salas-Ambrosio, Antoine Tronnet, Mostafa Badreldin, Luzangel Reyes, Marc Since, Sandra Bourgeade-Delmas, Bruno Dupuy, Pierre Verhaeghe, Colin Bonduelle, Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques (LCPO), Université de Bordeaux (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Team 3 LCPO : Polymer Self-Assembly & Life Sciences, Université de Bordeaux (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogénèse des Bactéries Anaérobies / Pathogenesis of Bacterial Anaerobes (PBA (U-Pasteur_6)), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), CONACYT (scholar-ship holder no. 548662), and ANR-17-CE07-0039,Therapeptics,Analogues Polymériques de Peptides Antimicrobiens à Potentiel Thérapeutique anti-Clostridium difficile(2017)
Subjects: Polymers and Plastics, Organic Chemistry, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, Bioengineering, Biochemistry
Abstract: International audience; We developed new macromolecular engineering approaches enabling the preparation of star-like polypeptoids by ring-opening polymerization. Parallely to the evaluation of their cytotoxicity of the HepG2 human cell line, their screening toward a wide variety of Gram-positive and Gram-negative bacteria higlighted several compounds showing not only good but also selective antimicrobial activity.
Published: 2022

9. Analyse par LC-MS et RMN 1H de compléments alimentaires à base de Curcuma

Author: Sorng, Sothearath, Balayssac, Stéphane, Danoun, S., Assemat, Gaëtan, Julliand, Véronique, Gilard, Véronique, Martino, Roberto, Malet-Martino, Myriam, Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BIBAC - Chimie analytique et interactions biomolécules - matière molle biomimétique (BIBAC), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: [CHIM]Chemical Sciences
Abstract: International audience
Published: 2022

10. Alternative Ligands at Melatonin Receptors

Author: Céline, Legros, Said, Yous, Jean A, Boutin, Institut de Recherches SERVIER (IRS), Lille Neurosciences & Cognition - U 1172 (LilNCog), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: 5-Methoxytryptamine, Iodine Radioisotopes, Mammals, Iodination, [SDV]Life Sciences [q-bio], Receptors, Melatonin, Animals, Radioligands, Binding, Iodinated radioligand, Ligands, Tritiated ligand, Melatonin
Abstract: International audience; Melatonin (N-acetyl-5-methoxytryptamine) is a neurohormone that possesses a wide range of biological effects. Most of the main recognized effects of this hormone in mammals are due to its interaction with two G protein-coupled receptors, MT1 and MT2. Ligand-binding studies have been based on the use of its radioligand analog, 2[125I]-iodomelatonin, a super agonist discovered in the early 1990s. This compound has been used in most of the binding studies reported in the literature. Nevertheless, more recently other possibilities arose. This chapter is a brief summary of those alternative radioligands and of their benefits one can find in using them.
Published: 2022

11. Impact of Drug Pressure versus Limited Access to Drug in Malaria Control: The Dilemma

Author: Chinedu Ogbonnia Egwu, Nwogo Ajuka Obasi, Chinyere Aloke, Joseph Nwafor, Ioannis Tsamesidis, Jennifer Chukwu, Sunday Elom, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), University of the Witwatersrand [Johannesburg] (WITS), and Aristotle University of Thessaloniki
Subjects: treatment, [SDV]Life Sciences [q-bio], malaria drug-pressure limited-access antimalarials treatment, General Engineering, malaria, Review, limited-access, antimalarials, parasitic diseases, General Earth and Planetary Sciences, Medicine, drug-pressure, General Environmental Science
Abstract: Malaria burden has severe impact on the world. Several arsenals, including the use of antimalarials, are in place to curb the malaria burden. However, the application of these antimalarials has two extremes, limited access to drug and drug pressure, which may have similar impact on malaria control, leading to treatment failure through divergent mechanisms. Limited access to drugs ensures that patients do not get the right doses of the antimalarials in order to have an effective plasma concentration to kill the malaria parasites, which leads to treatment failure and overall reduction in malaria control via increased transmission rate. On the other hand, drug pressure can lead to the selection of drug resistance phenotypes in a subpopulation of the malaria parasites as they mutate in order to adapt. This also leads to a reduction in malaria control. Addressing these extremes in antimalarial application can be essential in maintaining the relevance of the conventional antimalarials in winning the war against malaria.
Published: 2022

12. Driving regeneration, instead of healing, in adult mammals: the decisive role of resident macrophages through efferocytosis

Author: Anne Lorsignol, Isabelle Raymond-Letron, Léa Da Costa-Fernandes, Lise Rabiller, Béatrice Cousin, Marine Silva, Adèle Arlat, Elodie Labit, Paul Monsarrat, Agnès Coste, Bruno Ségui, Gilles Mithieux, Marie-Laure Renoud, Mireille André, Cécile Dromard Berthézène, Marie Salon, Luc Pénicaud, Virginie Robert, Marielle Ousset, Christophe Guissard, Louis Casteilla, STROMALab, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Etablissement Français du Sang-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Geroscience and rejuvenation research center (RESTORE), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Calgary, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition, diabète et cerveau, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), and Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
Subjects: Cell biology, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Immunology, Biomedical Engineering, Medicine (miscellaneous), Granulocyte, Biology, Regenerative medicine, Article, Lesion, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, Efferocytosis, Tissue homeostasis, Loss function, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Regeneration (biology), 3. Good health, Haematopoiesis, medicine.anatomical_structure, Medicine, medicine.symptom, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology
Abstract: Tissue repair after lesion usually leads to scar healing and thus loss of function in adult mammals. In contrast, other adult vertebrates such as amphibians have the ability to regenerate and restore tissue homeostasis after lesion. Understanding the control of the repair outcome is thus a concerning challenge for regenerative medicine. We recently developed a model of induced tissue regeneration in adult mice allowing the comparison of the early steps of regenerative and scar healing processes. By using studies of gain and loss of function, specific cell depletion approaches, and hematopoietic chimeras we demonstrate here that tissue regeneration in adult mammals depends on an early and transient peak of granulocyte producing reactive oxygen species and an efficient efferocytosis specifically by tissue-resident macrophages. These findings highlight key and early cellular pathways able to drive tissue repair towards regeneration in adult mammals.
Published: 2021

13. Metallomic profile in non-cirrhotic hepatocellular carcinoma supports a phenomenon of metal metabolism adaptation in tumor cells

Author: Luis Cano, Stéphane Bertani, Marie-Laure Island, Juan Pablo Cerapio, Eloy Ruiz, Pascal Pineau, Valérie Monbet, Karim Boudjema, Luis Taxa, Sandro Casavilca-Zambrano, Martine Ropert, Bruno Turlin, Olivier Loréal, Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Recherche Mathématique de Rennes (IRMAR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Centre Hospitalier Universitaire [Rennes], This study was funded by the French National Alliance for Life Sciences and Health (ENV201408), LC was a recipient of a doctoral fellowship from French National Research Institute for Sustainable Development (IRD) (EMHE-ARTS-2016-878573B), JPC was a recipient of a doctoral fellowship from the Peruvian National Coun-cil for Science and Technology (212-2015-FONDECYT), SB has received funding from the European Union’s Horizon 2020 Framework program under the Marie Skłodowska-Curie Actions 823935 and from the Alliance pour les Sciences de la Vie et de la Santé (AVIESAN), ITMO Cancer ENV201408, and LC, ER, and SCZ have received funding from the World Bank Group and FONDECYT-CONCYTEC 016-2018-FONDECYT/BM., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-CHU Toulouse [Toulouse]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes 2 (UR2), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)
Subjects: Adult, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Science, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Article, Young Adult, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, parasitic diseases, Humans, neoplasms, Aged, Retrospective Studies, Liver Neoplasms, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Middle Aged, Cancer metabolism, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, 3. Good health, Liver, Metals, Medicine, Female, Liver cancer
Abstract: Our group has previously described a particular form of Hepatocellular carcinoma (HCC) developed in non-cirrhotic liver (HCC-NC) developed in Peruvian patients Our aim is to analyze the HCC-NC from clinical-biological findings in two different cohorts (Peruvian and French) and the link with metallomic profile. Clinical, histopathological and also tumoral (T) and non-tumoral liver (NTL) samples of 38 Peruvian and 45 French patients were studied. Twelve metals were assayed using ICP/MS: Mn, Fe, Cu, Co, Zn, As, Se, Rb, Mo, Cd, Pb, and Sn. Possible associations between metals and survival were also evaluated. Overall, results show clearly differences between both cohorts. Mean age were 41 ± 20 and 68 ± 9 years-old for Peruvians and French, respectively. 80% of Peruvian patients were positive for the HBsAg, versus 9% in French patients. Metals concentrations were higher in the NTL of Peruvians (p
Published: 2021

14. Gibberellin-regulated proteins: Emergent allergens

Author: Iizuka, T., Barre, A., Rougé, P., Charpin, D., Scala, E., Baudin, B., Aizawa, T., Sénéchal, H., Poncet, Pascal, Hokkaido University [Sapporo, Japan], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Association pour la Prévention de la Pollution Atmosphérique (APPA), Istituto dermopatico dell'immacolata (IDI-IRCCS), CHU Trousseau [APHP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Département d'Immunologie - Department of Immunology, and Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)
Subjects: food allergy, [SDV]Life Sciences [q-bio], pollen allergy, pollen food allergy syndrome, 3D structure, gibberellin-regulated protein, gibberellin-regulated protein pollen food allergy syndrome food allergy pollen allergy 3D structure
Abstract: International audience; About 10 years ago, a protein family was shown for the first time to contain allergenic members, gibberellin-regulated protein (GRP). The first reported member was from peach, Pru p 7. One can hypothesize that it was not detected before because its physicochemical characteristics overlap with those of lipid transfer protein (LTP), a well-known allergen, or because the exposure to GRP increased due to an increase in the gibberellin phythormone level in plant food, either exogenous or endogenous. Like LTPs, GRPs are small cationic proteins with disulfide bridges, are resistant to heat and proteolytic cleavage, and are involved in the defense of the plant. Besides peach, GRP allergens have been described in Japanese apricot (Pru m 7), sweet cherry (Pru av 7), orange (Cit s 7), pomegranate (Pun g 7), bell pepper (Cap a 7), strawberry (Fra a GRP), and also in pollen with a restriction to Cupressaceae tree family (Cup s 7, Cry j 7, and Jun a 7). IgE cross-reactivities were described between GRPs, and the reported peach/cypress and citrus/cypress syndromes may therefore be explained because of these GRP cross-reactivities. GRPs are clinically relevant, and severe adverse reactions may sometimes occur in association with cofactors. More than 60% and up to 95% sequence identities are calculated between various allergenic GRPs, and three-dimensional models show a cleft in the molecule and predict at least three epitopic regions. The structure of the protein and its properties and the matrix effect in the original allergenic source should be unraveled to understand why, despite the ubiquity of the protein family in plants, only a few members are able to sensitize patients.
Published: 2022

15. Exposure assessment of 170 pesticide ingredients and derivative metabolites in people from the Central Andes of Peru

Author: Jorge Honles, Claire Clisson, Claudia Monge, Pedro Vásquez-Ocmín, Juan Pablo Cerapio, Sysay Palamy, Sandro Casavilca-Zambrano, Javier Herrera, Pascal Pineau, Eric Deharo, Vincent Peynet, Stéphane Bertani, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Institut de Recherche et d'Expertise Scientifique [Europarc, Strasbourg], Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Health Sciences [Vientiane, Laos] (UHS), Laboratoire d'Economie de Dauphine (LEDa), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Dauphine-PSL, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), This research has received funding from the International Joint Laboratories programme of IRD and the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie Actions (grant agreement 823935), European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Adult, [SDV.EE.SANT]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, Multidisciplinary, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Peru, Humans, [SDV.EE.SANT] Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Health, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Environmental Exposure, Pesticides, Agrochemicals
Abstract: The Central Andes of Peru are a region of great concern regarding pesticide risk to the health of local communities. Therefore, we conducted an observational study to assess the level of pesticide contamination among Andean people. Analytical chemistry methods were used to measure the concentrations of 170 pesticide-related compounds in hair samples from 50 adult Andean subjects living in rural and urban areas. As part of the study, a questionnaire was administered to the subjects to collect information regarding factors that increase the risk of pesticide exposure. Our results indicate that Andean people are strongly exposed to agrochemicals, being contaminated with a wide array of pesticide-related compounds at high concentration levels. Multivariate analyses and geostatistical modeling identified sociodemographic factors associated with rurality and food origin that increase pesticide exposure risk. The present study represents the first comprehensive investigation of pesticide-related compounds detected in body samples collected from people living in the Central Andes of Peru. Our findings pinpoint an alarming environmental situation that threatens human health in the region and provide a rationale for improving public policies to protect local communities.
Published: 2022

16. PassStat, le potentiostat low cost hautes performances

Author: Maisonhaute, Emmanuel, Boitel-Aullen, Gabriel, Caux, Mélicia, Var, Kethsovann, Achit, Anis, Argentieri, Sylvail, Aubouy, Agnès, Campagnolo, Raymond, Laboratoire Interfaces et Systèmes Electrochimiques (LISE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Systèmes Intelligents et de Robotique (ISIR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), CEA- Saclay (CEA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), and Société Chimique de France (SCF) subdivision électrochimie
Subjects: [CHIM]Chemical Sciences
Abstract: International audience; L'électrochimie analytique est très sensible mais utilisée en dessous de son potentiel dans lespays moins avancés de par un manque de formation des acteurs et car les appareils restent coûteux etdifficilement réparables sur place. Lors du confinement, pour permettre aux étudiants de réaliser desexpériences@home, nous avons conçu un potentiostat à bas coût qui complète la gamme d'autresappareils déjà disponibles par ailleurs. Nous avons cherché, pour des raisons pratiques maiségalement par défi intellectuel à proposer les circuits les plus simples possible pour réaliser desexpériences de voltammétrie (cyclique et à vague carrée pour le moment). Cela nous a amené à créerle PassStat présenté en Figure 1. 4 montages, dont une version Android pilotable en bluetooth sontproposés. La version rapide (310 €) utilise un module de pilotage Analog Discovery 2 et permet d'allerjusqu'à 8000 Vs-1 tout en compensant la chute ohmique. Une version moins chère (50€, 70€ enbluetooth), utilise une carte Teensy et un pilotage via l'IDE Arduino et Python ou Android Studio. Enadaptant la résistance d'amplification du courant, il est néanmoins possible d'atteindre des résolutionsen courant de l'ordre du pA.Ce potentiostat est actuellement utilisé en Afrique pour détecter des faux médicaments etanalyser des concentrations en éléments traces métalliques. Nous présenterons le principe defonctionnement de l'appareil ainsi que les principaux résultats. Tous les schémas et programmes sontopen source comme indiqué dans la référence [1].
Published: 2022

17. Comparison of the Phytochemical Variation of Non-Volatile Metabolites within Mother Tinctures of Arnica montana Prepared from Fresh and Dried Whole Plant Using UHPLC-HRMS Fingerprinting and Chemometric Analysis

Author: Duthen, Simon, Gadéa, Alice, Trempat, Pascal, Boujedaini, Naoual, Fabre, Nicolas, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Arnica montana, dried vs. fresh materials, [SDV]Life Sciences [q-bio], metabolomics, phytochemical differences, mother tinctures
Abstract: International audience; Arnica montana L. has been recognized for centuries as an herbal remedy to treat wounds and promote healing. It also has a long tradition of use in homeopathy. Depending on its medicinal utilization, standardization regulations allow different manufacturing processes, implying different raw materials, such as the whole arnica plant in its fresh or dried state. In this study, an untargeted metabolomics approach with UHPLC-HRMS/MS was used to cross-compare the phytochemical composition of mother tinctures of A. montana that were prepared from either fresh whole plant (fMT) matter or from oven-dried whole plant (dMT) matter. The multivariate data analysis showed significant differences between fMT and dMT. The dereplication of the HRMS and MS/MS spectra of the more discriminant compounds led to annotated quinic acid, dicaffeoyl quinic acids, ethyl caffeate, thymol derivatives and dehydrophytosphingosine, which were increased in fMT, while Amadori rearrangement products (ARP) and methoxyoxaloyl-dicaffeoyl quinic acid esters were enhanced in dMT. Neither sesquiterpene lactones nor flavonoids were affected by the drying process. This is the first time that a sphingosine, ethyl caffeate and ARP are described in A. montana. Moreover, putative new natural products were detected as 10-hydroxy-8,9-epoxy-thymolisobutyrate and an oxidized proline fructose conjugate, for which isolation and full structure elucidation will be necessary to verify this finding.
Published: 2022

18. The Ribosome Is the Ultimate Receptor for Trypsin Modulating Oostatic Factor (TMOF)

Author: Dov Borovsky, Pierre Rougé, Robert G. Shatters, University of Colorado Anschutz [Aurora], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and USDA-ARS : Agricultural Research Service
Subjects: [SDV]Life Sciences [q-bio], fungi, Molecular modeling, In vitro translation and inhibition, mosquito, ribosome binding, AeaTMOF, oncocin112 (1–13), molecular modeling, kinetic characterization, in vitro translation and inhibition, Biochemistry, Kinetic characterization, Oncocin112 (1–13), Mosquito, Aedes, Ribosome binding, Larva, Escherichia coli, Animals, Female, Trypsin, Amino Acid Sequence, Oligopeptides, Ribosomes, Molecular Biology
Abstract: Aedes aegypti Trypsin Modulating Oostatic Factor (AeaTMOF). a mosquito decapeptide that controls trypsin biosynthesis in female and larval mosquitoes. enters the gut epithelial cells of female mosquitoes using ABC-tmfA receptor/importer. To study the ultimate targeted receptor after AeaTMOF enters the cell, AeaTMOF was incubated in vitro with either Escherichia coli or Spodoptera frugiperda protein-expressing extracts containing 70S and 80S ribosomes, respectively. The effect of AeaTMOF on luciferase biosynthesis in vitro using 70S ribosomes was compared with that of oncocin112 (1–13), a ribosome-binding antibacterial peptide. The IC50 of 1 μM and 2 μM, respectively, for both peptides was determined. Incubation with a protein-expressing system and S. frugiperda 80S ribosomes determined an IC50 of 1.8 μM for Aedes aegypti larval late trypsin biosynthesis. Incubation of purified E. coli ribosome with increasing concentration of AeaTMOF shows that the binding of AeaTMOF to the bacterial ribosome exhibits a high affinity (KD = 23 ± 3.4 nM, Bmax = 0.553 ± 0.023 pmol/μg ribosome and Kassoc = 4.3 × 107 M−1). Molecular modeling and docking experiments show that AeaTMOF binds bacterial and Drosophila ribosome (50S and 60S, respectively) at the entrance of the ribosome exit tunnel, blocking the tRNA entrance and preventing protein biosynthesis. Recombinant E. coli cells that express only ABC-tmfA importer are inhibited by AeaTMOF but not by oncocin112 (1–13). These results suggest that the ribosome is the ultimate targeted receptor of AeaTMOF.
Published: 2022
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19. Patterns of Plumericin Concentration in Leaves of Himatanthus tarapotensis (Apocynaceae) and Its Interactions with Herbivory in the Peruvian Amazon

Author: Carlos A. Amasifuen Guerra, Kirti Patel, Piero G. Delprete, Andréa P. Spina, Juan Grados, Pedro Vásquez-Ocmín, Alice Gadea, Rosario Rojas, Jesús Guzmán, Michel Sauvain, Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Laboratorio Andino-Amazónico de Química de la Vida (LAVI), Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Botanique et Modélisation de l'Architecture des Plantes et des Végétations (UMR AMAP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université de Montpellier (UM), Herbier de Guyane - IRD, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Guyane]), Universidad Nacional Mayor de San Marcos (UNMSM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Ecology, fungi, Plumericin, Plant Science, Precipitation, Soil types, [SDV.BV.BOT]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Botanics, [SDV.BID.SPT]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Systematics, Phylogenetics and taxonomy, [SDV.EE.ECO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Ecosystems, plant-herbivore interactions, plumericin, soil types, precipitation, Peru, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, Plant-herbivore interactions, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.01.01 [https]
Abstract: 18 páginas We explored the concentration patterns of the bioactive metabolite plumericin produced by Himatanthus tarapotensis (Apocynaceae) under different edaphic conditions and variations in rainfall intensity, as well as its potential role in the chemical defense against insect herbivores. Values of plumericin concentration from leaves were obtained by High-Performance Liquid Chromatography, and evaluated as a function of differences in soil types, variation of precipitation, and variation of the abundance of insect herbivores, using first a Repeated Measures Correlation (rmcorr) and then a Generalized Linear Mixed Model (GLMM) analysis. Plumericin concentration is highly variable among plants, but with a significantly higher concentration in plants growing on clay soil compared to that of the white-sand soil habitat (p < 0.001). Plumericin concentration is not affected by precipitation. The caterpillar of Isognathus leachii (Lepidoptera: Sphingidae) is the most conspicuous herbivore of H. tarapotensis, and its presence is continuous but not related to plumericin concentration, probably because of its capacity to elude the chemical defense of this plant. Nevertheless, our multivariate model revealed that plumericin concentration is related to the abundance of Hymenoptera (Formicidae), and this relationship is significantly influenced by the soil parameters of carbon percentage, clay percentage, and phosphorous percentage (p < 0.001). Plumericin is a mediating agent in the interaction between H. tarapotensis and its natural environment. Variation in plumericin concentration would be induced by the abundance of Hymenoptera (Formicidae), probably as a chemical response against these insects, and by differences in soil nutrient availability. 1. Introduction. 2. Results. 3. Discussion. 4. Materials and methods. References.
Published: 2022

20. Cyclic Poly(α-peptoid)s by Lithium bis(trimethylsilyl)amide (LiHMDS)-Mediated Ring-Expansion Polymerization: Simple Access to Bioactive Backbones

Author: Pierre Verhaeghe, Sébastien Lecommandoux, Antoine Tronnet, Marc Since, Jean-Luc Stigliani, Pedro Salas-Ambrosio, Sandra Bourgeade-Delmas, Bruno Dupuy, Amelie Vax, Colin Bonduelle, Team 3 LCPO : Polymer Self-Assembly & Life Sciences, Laboratoire de Chimie des Polymères Organiques (LCPO), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Ecole Nationale Supérieure de Chimie, de Biologie et de Physique (ENSCBP)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Chimie du CNRS (INC), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pathogénèse des Bactéries Anaérobies / Pathogenesis of Bacterial Anaerobes (PBA (U-Pasteur_6)), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: Trimethylsilyl Compounds, Cell Survival, Polymers, Lithium bis(trimethylsilyl)amide, Microbial Sensitivity Tests, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry, 010402 general chemistry, Ring (chemistry), 01 natural sciences, Biochemistry, Catalysis, Cell Line, Polymerization, Macrocyclic polypeptoids, Peptoids, chemistry.chemical_compound, Colloid and Surface Chemistry, Biological property, Humans, Density Functional Theory, Ring expansion polymerization (REP), chemistry.chemical_classification, Clostridioides difficile, Peptoid, General Chemistry, Polymer, Combinatorial chemistry, 0104 chemical sciences, [CHIM.POLY]Chemical Sciences/Polymers, Monomer, chemistry, Cyclization
Abstract: International audience; Cyclic polymers display unique physicochemical and biological properties. However, their development is often limited by their challenging preparation. In this work, we present a simple route to cyclic poly(α-peptoids) from N-alkylated-N-carboxyanhydrides (NNCA) using LiHMDS promoted ring-expansion polymerization (REP) in DMF. This new method allows the unprecedented use of lysine-like monomers in REP to design bioactive macrocycles bearing pharmaceutical potential against Clostridioides difficile, a bacterium responsible for nosocomial infections.
Published: 2021

21. Global DNA hypermethylation pattern and unique gene expression signature in liver cancer from patients with Indigenous American ancestry

Author: Cerapio, Juan Pablo, Marchio, Agnès, Cano, Luis, López, Ignacio, Fournié, Jean-Jacques, Régnault, Béatrice, Casavilca-Zambrano, Sandro, Ruiz, Eloy, Dejean, Anne, Bertani, Stéphane, Pineau, Pascal, Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génotypage des Eucaryotes (Plate-Forme), Institut Pasteur [Paris] (IP), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Alliance pour les sciences de la vie et de la santé (Aviesan)., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre d'Innovation et Recherche Technologique / Center for Innovation and Technological Research, Institut Pasteur [Paris], Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)
Subjects: DNA methylation, MESH: Cancer, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SHS.ANTHRO-BIO]Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, indigenous people, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.BBM.BM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, digestive system diseases, [SHS.ANTHRO-BIO] Humanities and Social Sciences/Biological anthropology, MESH: Comparative Genomics, liver cancer, integrative genomics, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.BBM.GTP] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], hepatitis B virus, Research Paper
Abstract: International audience; Hepatocellular carcinoma (HCC) usually afflicts individuals in their maturity after a protracted liver disease. Contrasting with this pattern, the age structure of HCC in Andean people displays a bimodal distribution with half of the patients developing HCC in adolescence and early adulthood. To deepen our understanding of the molecular determinants of the disease in this population, we conducted an integrative analysis of gene expression and DNA methylation in HCC developed by 74 Peruvian patients, including 39 adolescents and young adults. While genome-wide hypomethylation is considered as a paradigm in human HCCs, our analysis revealed that Peruvian tumors are associated with a global DNA hypermethylation. Moreover, pathway enrichment analysis of transcriptome data characterized an original combination of signatures. Peruvian HCC forgoes canonical activations of IGF2, Notch, Ras/MAPK, and TGF-β signals to depend instead on Hippo/YAP1, MYC, and Wnt/β-catenin pathways. These signatures delineate a homogeneous subtype of liver tumors at the interface of the proliferative and non-proliferative classes of HCCs. Remarkably, the development of this HCC subtype occurs in patients with one of the four Native American mitochondrial haplogroups A-D. Finally, integrative characterization revealed that Peruvian HCC is apparently controlled by the PRC2 complex that mediates cell reprogramming with massive DNA methylation modulating gene expression and pinpointed retinoid signaling as a potential target for epigenetic therapy.
Published: 2021

22. On the risk of further excluding outcast patient populations in South America

Author: Eloy Ruiz, Ramiro Fernández, Francisco Berrospi, Sandro Casavilca-Zambrano, Juan Contreras-Mancilla, Juan Pablo Cerapio, Pascal Pineau, Stéphane Bertani, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and INCa
Subjects: South america, Hepatology, Peru, Hepatitis B Virus HBV, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, General Medicine, Liver cancer, Amerindian Populations
Abstract: International audience
Published: 2023

23. A non-radiolabeled heme–GSH interaction test for the screening of antimalarial compounds

Author: Alexis Valentin, Françoise Nepveu, Giovanny Garavito, Marie-Carmen Monje, Eric Deharo, Séverine Maurel, Universidad Nacional de Colombia [Bogotà] (UNAL), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Universidad Nacional de Colombia (COLOMBIA), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement - PHARMA-DEV (Toulouse, France), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Arthemether, Drug Evaluation, Preclinical, Pharmacology, O-Phthalaldehyde, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, [CHIM.GENI]Chemical Sciences/Chemical engineering, Parasitic Sensitivity Tests, Chloroquine, Reduced glutathione- O-phthalaldehyde, Heme, Chromatography, High Pressure Liquid, 0303 health sciences, Quinine, Hemozoin, General Medicine, Glutathione, Artemisinins, 3. Good health, Mefloquine, Infectious Diseases, Biochemistry, Screening, Artemether, medicine.drug, 030231 tropical medicine, Immunology, Plasmodium falciparum, Amodiaquine, Biology, 03 medical and health sciences, Antimalarials, medicine, Animals, Génie chimique, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Génie des procédés, Atovaquone, 030304 developmental biology, Methylene blue, biology.organism_classification, Spectrometry, Fluorescence, chemistry, Indicators and Reagents, Parasitology, o-Phthalaldehyde, High performance liquid chromatography
Abstract: International audience; Intraerythrocytic Plasmodium produces large amounts of toxic heme during the digestion of hemoglobin, a parasite specific pathway. Heme is then partially biocristallized into hemozoin and mostly detoxified by reduced glutathione. We proposed an in vitro micro assay to test the ability of drugs to inhibit heme-glutathione dependent degradation. As glutathione and o-phthalaldehyde form a fluorescent adduct, we followed the extinction of the fluorescent signal when heme was added with or without antimalarial compounds. In this assay, 50 microM of amodiaquine, arthemether, chloroquine, methylene blue, mefloquine and quinine inhibited the interaction between glutathione (50 microM) and heme (50 microM), while atovaquone did not. Consequently, this test could detect drugs that can inhibit heme-GSH degradation in a fast, simple and specific way, making it suitable for high throughput screening of potential antimalarials.
Published: 2007

24. Relationship between dietary fats and serum antioxidants with atheromatic index in regular blood donors

Author: Agathi Pritsa, Maria Parpori, Kyriaki S. Papadopoulou, Ioannis Tsamesidis, Diana Samara, Evgenia Lymperaki, Argyrios Gkinoudis, International Hellenic University, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), ΓΕΝΙΚΟ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟ ΝΑΟΥΣΑΣ = Naoussa General Hospital, Aristotle University of Thessaloniki, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: 0301 basic medicine, Index (economics), [SDV]Life Sciences [q-bio], Endocrinology, Diabetes and Metabolism, Saturated fat, Blood Donors, 030209 endocrinology & metabolism, Atheromatic index, Antioxidants, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, Nutrient, Negatively associated, Humans, Medicine, Food science, Sugar, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, 030109 nutrition & dietetics, Nutrition and Dietetics, Regular blood donors, Cholesterol, business.industry, Fatty Acids, Fatty acid, Dietary Fats, 3. Good health, chemistry, Dietary intakes, business, Serum antioxidant status, Polyunsaturated fatty acid
Abstract: International audience; Background & objectives: Nutritional choices, which include dietary fatty acids (FA), vitamins and sugars, have an important significant impact on the development of atheromatic index levels. Controversial opinions exist in the literature regarding the role of different fat types and their association with atheromatic index. We investigated the relationship between dietary intake with different atheromatic index groups of volunteer regular blood donors (rBDs) recognizing them as a healthy population excluding drug and supplements intake and we correlated their values with serum total antioxidant status (sTAS).Material & methods: 150 individuals used in this study were divided in 3 groups according to their atheromatic index (AI = Total cholesterol/HDL) (AI): Group 1 (AI < 3.5) comprised of 50 rBDs, Group 2 (AI 3.5-4.49) of 52 rBDs and Group 3 of 48 rBDs (AI > 4.5). Dietary intake was assessed using the 3 day food recall and the Food Processor, computer program for nutrient analysis. sTAS was measured in all samples and correlated with atheromatic index too.Results: Our study showed that rBDs with low dietary intake of all vitamins, Ω3 fatty acids, trans fatty acids and dietary cholesterol presented an increased atheromatic index. On the other hand rBDs with high dietary intake of saturated fat, total fats, monounsaturated and polyunsaturated fats and sugar showed increased atheromatic index. In addition, groups with the higher atheromatic index presented statistically significant higher total antioxidant status. Trans FA are also positively associated with sTAS and on the other hand dietary cholesterol is negatively associated with sTAS and positively in groups B and C.Conclusions: The results of the present study showed that dietary intake of different types of fatty acids should be used separately as atheromatic index predictors. Moreover, sTAS is correlated with dietary intake of SFA, MUFA, PUFA, Cholesterol, Trans FA and sugar. Finally, the measurement of each fatty acid would be of great value for the screening of lipid metabolism disorders in atheromatic index control.
Published: 2020

25. Potent Antiplasmodial Derivatives of Dextromethorphan Reveal the Ent-Morphinan Pharmacophore of Tazopsine-Type Alkaloids

Author: Keita, Antoinette, Franetich, Jean-François, Carraz, Maëlle, Valentin, Loïse, Bordessoules, Mallaury, Baron, Ludivine, Bigeard, Pierre, Dupuy, Florian, Geay, Valentine, Tefit, Maurel, Sarrasin, Véronique, Michel, Sylvie, Lavazec, Catherine, Houzé, Sandrine, Mazier, Dominique, Soulard, Valérie, Porée, François-Hugues, Duval, Romain, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Cochin (IC UM3 (UMR 8104 / U1016)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Cibles Thérapeutiques et conception de médicaments (CiTCoM - UMR 8038), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Institut des Sciences Chimiques de Rennes (ISCR), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes (ENSCR)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), We thank the Doctoral School of Paris University (ED 563, MTCI) for financial support (PhD fellowship to A.K.). L.V. was supported by the OrganoMal project funded by the French National Agency for Research (ANR) (ANR-[20 ? 21 ?]-CE17-0035-0011) and a CIFRE ANRT allocation N∘ 2019/0153. LB was supported by the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Program under grant agreement N∘ 733273., Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, and HAL UR1, Admin
Subjects: dextromethorphan, hepatic stages, Plasmodium berghei, [CHIM] Chemical Sciences, Plasmodium falciparum, hit compound, malaria, tazopsine, [CHIM]Chemical Sciences, blood stages, prophylaxis, N-alkylation
Abstract: International audience; The alkaloid tazopsine 1 was introduced in the late 2000s as a novel antiplasmodial hit compound active against Plasmodium falciparum hepatic stages, with the potential to develop prophylactic drugs based on this novel chemical scaffold. However, the structural determinants of tazopsine 1 bioactivity, together with the exact definition of the pharmacophore, remained elusive, impeding further development. We found that the antitussive drug dextromethorphan (DXM) 3, although lacking the complex pattern of stereospecific functionalization of the natural hit, was harboring significant antiplasmodial activity in vitro despite suboptimal prophylactic activity in a murine model of malaria, precluding its direct repurposing against the disease. The targeted N-alkylation of nor-DXM 15 produced a small library of analogues with greatly improved activity over DXM 3 against P. falciparum asexual stages. Amongst these, N-2’-pyrrolylmethyl-nor-DXM 16i showed a 2- to 36-fold superior inhibitory potency compared to tazopsine 1 and DXM 3 against P. falciparum liver and blood stages, with respectively 760 ± 130 nM and 2.1 ± 0.4 μM IC(50) values, as well as liver/blood phase selectivity of 2.8. Furthermore, cpd. 16i showed a 5- to 8-fold increase in activity relative to DXM 3 against P. falciparum stages I-II and V gametocytes, with 18.5 μM and 13.2 μM IC(50) values, respectively. Cpd. 16i can thus be considered a promising novel hit compound against malaria in the ent-morphinan series with putative pan cycle activity, paving the way for further therapeutic development (e.g., investigation of its prophylactic activity in vivo).
Published: 2022

26. Resistance to artemisinin in falciparum malaria parasites: A redox-mediated phenomenon

Author: Egwu, Chinedu, Pério, Pierre, Augereau, Jean-Michel, Tsamesidis, Ioannis, Benoit-Vical, Françoise, Reybier, Karine, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New Antimalarial Molecules and Pharmacological Approaches (ERL1289), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique, France), Université Paul Sabatier, Toulouse III (France), IRD (Institut de Recherche pour le Développement, France), ANR-16-CE35-0003,INMAR,Réseau intégré des mécanismes de quiescence & clairance impliqués dans la résistance à l'artémisinine chez Plasmodium(2016), ANR-17-CE18-0017,RADICAL,Stratégie thérapeutique par voie radicalaire pour combattre des maladies parasitaires(2017), Gulli, Marie-Hélène, Réseau intégré des mécanismes de quiescence & clairance impliqués dans la résistance à l'artémisinine chez Plasmodium - - INMAR2016 - ANR-16-CE35-0003 - AAPG2016 - VALID, Stratégie thérapeutique par voie radicalaire pour combattre des maladies parasitaires - - RADICAL2017 - ANR-17-CE18-0017 - AAPG2017 - VALID, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], and Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Subjects: Redox, GSH Resistance, parasitic diseases, Superoxide, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, Antioxidant, [CHIM.COOR] Chemical Sciences/Coordination chemistry, Artemisinin and Plasmodium
Abstract: International audience; Malaria remains a major public health disease due to its high yearly mortality and morbidity. Resistance to the gold standard drug, artemisinin, is worrisome and needs better understanding in order to be overcome. In this work, we sought to study whether redox processes are involved in artemisinin resistance. As artemisinin is known to act among others via production of reactive species, we first compared the production of reactive oxygen species and concomitant protein oxidation in artemisinin-sensitive and artemisinin-resistant parasites when treated with artemisinin. The results undoubtedly demonstrated, using different original methods, that the level of ROS, including superoxide production, and oxidized protein were lower in the resistant strain. Interestingly, the major in-between strain difference was reported at the earlier ring stages, which are the forms able to enter in a quiescence state according to the ART resistance phenomenon. Moreover, we demonstrated a better homeostasis regulation in relation with higher expression of antioxidants in the artemisinin-resistant parasites than their sensitive counterparts after artemisinin exposure, notably, superoxide dismutase and the glutathione (GSH) system. These findings enrich the body of knowledges about the multifaceted mechanism of artemisinin resistance and will help in the design and development of newer antimalarials strategies active against resistant parasites.
Published: 2022

27. A preoperative nomogram for predicting long-term survival after resection of large hepatocellular carcinoma (>10 cm)

Author: Benjamin Roche, R. Fernandez, Juan Pablo Cerapio, Stéphane Bertani, Ivan Chavez, Pascal Pineau, Sandro Casavilca-Zambrano, Francisco Berrospi, Eloy Ruiz, Luis Cano, Claudio Flores, Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Centre de Recherches Ecologiques et Evolutives sur le Cancer (MIVEGEC-CREEC), Processus Écologiques et Évolutifs au sein des Communautés (PEEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Universidad Nacional Autónoma de México = National Autonomous University of Mexico (UNAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), This work was supported by the European Union’s Horizon 2020 Framework Programme under the Marie Skłodowska-Curie Actions (Agreement N. 823935)., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Bertani, Stéphane, Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID, Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Subjects: medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Cirrhosis, [SDV.MHEP.CHI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, Concordance, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, [SDV.MHEP.CHI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Surgery, 030230 surgery, Resection, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, Long term survival, medicine, Hepatectomy, Humans, Internal validation, Retrospective Studies, Hepatology, business.industry, Liver Neoplasms, Gastroenterology, Cancer, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, Nomogram, medicine.disease, [SDV.MHEP.HEG] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, 3. Good health, Nomograms, 030220 oncology & carcinogenesis, Hepatocellular carcinoma, Radiology, business
Abstract: International audience; Background: It has previously been demonstrated that a fraction of patients with hepatocellular carcinoma (HCC) > 10 cm can benefit from liver resection. However, there is still a lack of effective decision-making tools to inform intervention in these patients.Methods: We analysed a comprehensive set of clinical data from 234 patients who underwent liver resection for HCC >10 cm at the National Cancer Institute of Peru between 1990 and 2015, monitored their survival, and constructed a nomogram to predict the surgical outcome based on preoperative variables.Results: We identified cirrhosis, multifocality, macroscopic vascular invasion, and spontaneous tumour rupture as independent predictors of survival and integrated them into a nomogram model. The nomogram's ability to forecast survival at 1, 3, and 5 years was subsequently confirmed with high concordance using an internal validation. Through applying this nomogram, we stratified three groups of patients with different survival probabilities.Conclusion: We constructed a preoperative nomogram to predict long-term survival in patients with HCC >10 cm. This nomogram is useful in determining whether a patient with large HCC might truly benefit from liver resection, which is paramount in low- and middle-income countries where HCC is often diagnosed at advanced stages.
Published: 2022

28. Clinical outcomes after treatment with direct antiviral agents: beyond the virological response in patients with previous HCV-related decompensated cirrhosis

Author: Pageaux, G. (Georges-Philippe), Nzinga, C. (Clovis Lusivika), Ganne, N. (Nathalie), Samuel, D. (Didier), Dorival, C. (Céline), Zoulim, F. (Fabien), Cagnot, C. (Carole), Decaens, T. (Thomas), Thabut, D. (Dominique), Asselah, T. (Tarik), Mathurin, P. (Philippe), Habersetzer, F. (Francois), Bronowicki, J. (Jean-Pierre), Guyader, D. (Dominique), Rosa, I. (Isabelle), Leroy, V. (Vincent), Chazouilleres, O. (Olivier), de Ledinghen, V. (Victor), Bourliere, M. (Marc), Causse, X. (Xavier), Cales, P. (Paul), Metivier, S. (Sophie), Loustaud-Ratti, V. (Véronique), Riachi, G. (Ghassan), Alric, L. (Laurent), Gelu-Simeon, M. (Moana), Minello, A. (Anne), Gournay, J. (Jérôme), Geist, C. (Claire), Tran, A. (Albert), Abergel, A. (Armand), Portal, I. (Isabelle), d'Alteroche, L. (Louis), Raffi, F. (François), Fontaine, H. (Hélène), Carrat, F. (Fabrice), Pol, S. (Stanislas), Baumert, Thomas F., Doffoel, M. (Michel), Mutter, C. (Catherine), Simo-Noumbissie, P. (Pauline), Razi, E. (Esma), Hôpital Saint Eloi (CHRU Montpellier), Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (CHRU Montpellier), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Génomique Fonctionnelle des Tumeurs Solides (U1162), Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Physiopathogénèse et Traitement des Maladies du Foie, Hôpital Paul Brousse-Université Paris-Saclay, Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les Hépatites Virales (ANRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Centre de recherche sur l'Inflammation (CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Physiopathologie des Maladies Inflammatoires de l'Intestin, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille, Droit et Santé, Interactions Virus-Hôte et Maladies Hépatiques, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Virologie, Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), CHU Pontchaillou [Rennes], Nutrition, Métabolismes et Cancer (NuMeCan), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CHI Créteil, Biomécanique cellulaire et respiratoire (BCR), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Saint-Joseph [Marseille], Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO), Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers), PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM), Université d'Angers (UA), CHU Toulouse [Toulouse], Ciblage individuel et prévention des risques de traitements immunosupresseurs et de la transplantation (IPPRITT), CHU Limoges-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] (LNC), Université de Bourgogne (UB)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut Agro Dijon, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut des Maladies de l'Appareil Digestif, Université de Nantes (UN), Centre hospitalier régional Metz-Thionville (CHR Metz-Thionville), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), CHU Estaing [Clermont-Ferrand], CHU Clermont-Ferrand, Institut Pascal (IP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Clermont Auvergne (UCA)-Institut national polytechnique Clermont Auvergne (INP Clermont Auvergne), Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE), CHU Trousseau [Tours], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (CHRU Tours), Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), French ANRS CO22 Hepather Cohort: Delphine Bonnet, Virginie Payssan-Sicart, Chloe Pomes, François Bailly, Marjolaine Beaudoin, Dominique Giboz, Kerstin Hartig-Lavie, Marianne Maynard, Eric Billaud, David Boutoille, Morane Cavellec, Caroline Chevalier, Isabelle Hubert, Pierre Goepfert, Adrien Lannes, Françoise Lunel, Jérôme Boursier, Nathalie Boyer, Nathalie Giuily, Corinne Castelnau, Giovanna Scoazec, Aziza Chibah, Sylvie Keser, Karim Bonardi, Anaïs Vallet-Pichard, Philippe Sogni, Juliette Foucher, Jean-Baptiste Hiriart, Amandine Legendre, Faiza Chermak, Marie Irlès-Depé, Si Nafa Si Ahmed, Christelle Ansaldi, Nisserine Ben Amara, Valérie Oules, Jacqueline Dunette, Rodolphe Anty, Eve Gelsi, Régine Truchi, Elena Luckina, Nadia Messaoudi, Joseph Moussali, Barbara De Dieuleveult, Héloïse Goin, Damien Labarrière, Pascal Potier, Si Nafa Si Ahmed, Véronique Grando-Lemaire, Pierre Nahon, Séverine Brulé, Rym Monard, Caroline Jezequel, Audrey Brener, Anne Laligant, Aline Rabot, Isabelle Renard, Thomas F Baumert, Michel Dofföel, Catherine Mutter, Pauline Simo-Noumbissie, Esma Razi, Hélène Barraud, Mouni Bensenane, Abdelbasset Nani, Sarah Hassani-Nani, Marie-Albertine Bernard, Georges-Philippe Pageaux, Michael Bismuth, Ludovic Caillo, Stéphanie Faure, Marie Pierre Ripault, Christophe Bureau, Sarah Launay, Jean Marie Peron, Marie Angèle Robic, Léa Tarallo, Marine Faure, Bruno Froissart, Marie-Noelle Hilleret, Jean-Pierre Zarski, Odile Goria, Victorien Grard, Hélène Montialoux, Muriel François, Christian Ouedraogo, Christelle Pauleau, Anne Varault, Tony Andreani, Bénédicte Angoulevant, Azeline Chevance, Lawrence Serfaty, Teresa Antonini, Audrey Coilly, Jean-Charles Duclos Vallée, Mariagrazia Tateo, Corinne Bonny, Chanteranne Brigitte, Géraldine Lamblin, Léon Muti, Abdenour Babouri, Virginie Filipe, Camille Barrault, Laurent Costes, Hervé Hagège, Soraya Merbah, Paul Carrier, Maryline Debette-Gratien, Jérémie Jacques, Guillaume Lassailly, Florent Artu, Valérie Canva, Sébastien Dharancy, Alexandre Louvet, Marianne Latournerie, Marc Bardou, Thomas Mouillot, Yannick Bacq, Didier Barbereau, Charlotte Nicolas, Caroline Chevalier, Isabelle Archambeaud, Sarah Habes, Nisserine Ben Amara, Danièle Botta-Fridlund, Eric Saillard, Marie-Josée Lafrance, Carole Cagnot, Alpha Diallo, Lena Wadouachi, Ventzi Petrov-Sanchez, Douae Ammour, Loubna Ayour, Jaouad Benhida, Fabrice Carrat, Frederic Chau, Céline Dorival, Audrey Gilibert, Isabelle Goderel, Warda Hadi, Clovis Luzivika Nzinga, Grégory Pannetier, François Pinot, Odile Stahl, François Téloulé, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique ), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), and Jonchère, Laurent
Subjects: Liver Cirrhosis, medicine.medical_specialty, Carcinoma, Hepatocellular, Survival, Hepatocellular carcinoma, [SDV]Life Sciences [q-bio], Decompensated cirrhosis, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, Hepacivirus, Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie, complications, drug therapy, Gastroenterology, Antiviral Agents, Virological response, Internal medicine, Medicine, Humans, In patient, business.industry, Hepatitis C virus, Research, Liver Neoplasms, Hepatitis C, [SDV] Life Sciences [q-bio], Sustained virological response, Infectious Diseases, Direst-acting antiviral agents, therapeutic use, business, After treatment
Abstract: Background In HCV-infected patients with advanced liver disease, the direct antiviral agents-associated clinical benefits remain debated. We compared the clinical outcome of patients with a previous history of decompensated cirrhosis following treatment or not with direct antiviral agents from the French ANRS CO22 HEPATHER cohort. Methods We identified HCV patients who had experienced an episode of decompensated cirrhosis. Study outcomes were all-cause mortality, liver-related or non-liver-related deaths, hepatocellular carcinoma, liver transplantation. Secondary study outcomes were sustained virological response and its clinical benefits. Results 559 patients met the identification criteria, of which 483 received direct antiviral agents and 76 remained untreated after inclusion in the cohort. The median follow-up time was 39.7 (IQR: 22.7–51) months. After adjustment for multivariate analysis, exposure to direct antiviral agents was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.45, 95% CI 0.24–0.84, p = 0.01) and non-liver-related death (HR 0.26, 95% CI 0.08–0.82, p = 0.02), and was not associated with liver-related death, decrease in hepatocellular carcinoma and need for liver transplantation. The sustained virological response was 88%. According to adjusted multivariable analysis, sustained virological response achievement was associated with a decrease in all-cause mortality (HR 0.29, 95% CI 0.15–0.54, p Conclusion Treatment with direct antiviral agents is associated with reduced risk for mortality. The sustained virological response was 88%. Thus, direct antiviral agents treatment should be considered for any patient with HCV-related decompensated cirrhosis. Trial registration: ClinicalTrials.gov registry number: NCT01953458.
Published: 2022

29. Liver cancer: a new old threat for young people in developing countries?

Author: Cerapio, Juan, Contreras-Mancilla, Juan, Fernández, Ramiro, Fournié, Jean-Jacques, Deharo, Eric, Bertani, Stephane, Pineau, Pascal, Casavilca-Zambrano, Sandro, Ruiz, Eloy, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TOUCAN Laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Universidad de Huánuco [Huánuco, Pérou], Esta publicación fue apoyada por el programa de Laboratorios Mixtos Internacionales (LMI) del Instituto francés de Investigación para el Desarrollo (IRD) y por las acciones Marie Skłodowska-Curie (MSCA) del programa H2020 de la Unión Europea, bajo convenio de subvención N° 823935., and European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018)
Subjects: editorial, jóvenes, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, amenaza, países en vía de desarrollo, Cáncer de hígado
Abstract: International audience; Hepatocellular carcinoma (HCC), according to the canonical clinical epidemiology, is found predominantly in men over 40 in age. However, we have described in Peru an unusually younger HCC patient population harboring unique clinical and molecular features such as an explosive tumor growth in non-cirrhotic liver. To date, ethnoanthropological, biogeographical, or socioeconomic evidence that may explain such dramatic variation in the clinical presentation of the tumor affecting younger people remains unknown. Alarmingly, it appears that this phenomenon would not be restricted to Peru, but can be found in other low- and middle-income countries. Therefore, it is urgent to join efforts to prevent an increase in this divergent form of liver cancer.; El carcinoma hepatocelular (CHC), según la epidemiología clínica canónica, se encuentra predominantemente en hombres mayores de 40 años. Sin embargo, hemos descrito en el Perú una población de pacientes inusualmente más joven de pacientes con CHC, el mismo que presenta características clínicas y moleculares únicas, como un crecimiento tumoral explosivo en hígado no cirrótico. Hasta la fecha, se desconocen evidencias etno-antropológicas, bio-geográficas o socio-económicas que puedan explicar una discrepancia tan dramática en la presentación clínica de esta neoplasia en nuestro medio. Es alarmante el hecho que este fenómeno al parecer no estaría restringido al Perú, sino que se podría encontrarse en otros países de ingresos bajos y medianos. Por ello, es urgente sumar esfuerzos para evitar el aumento de esta forma divergente de cáncer de hígado.
Published: 2022

30. Liver cancer: a new old threat for young people in developing countries?

Author: Juan Pablo Cerapio, Juan Contreras-Mancilla, Ramiro Fernández, Fournié Jean-Jacques, Eric Deharo, Stéphane Bertani, Pascal Pineau, Sandro Casavilca-Zambrano, Eloy Ruiz, Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), TOUCAN Laboratoire d'Excellence Toulouse Cancer, Laboratoire Mixte International d'Oncologie Anthropologique Moléculaire = International Joint Laboratory of Molecular Anthropological Oncology (LOAM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Pérou]), Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Instituto Nacional de Enfermedades Neoplasicas [Lima, Pérou] (INEN), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Université de Montpellier (UM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Organisation Nucléaire et Oncogenèse / Nuclear Organization and Oncogenesis, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Universidad de Huánuco [Huánuco, Pérou], Esta publicación fue apoyada por el programa de Laboratorios Mixtos Internacionales (LMI) del Instituto francés de Investigación para el Desarrollo (IRD) y por las acciones Marie Skłodowska-Curie (MSCA) del programa H2020 de la Unión Europea, bajo convenio de subvención N° 823935., European Project: 823935,H2020-MSCA-RISE-2018,COCLICAN(2018), Bertani, Stéphane, and Collaborative Consortium for the early detection of Liver Cancer - COCLICAN - - H2020-MSCA-RISE-20182018-11-01 - 2022-10-31 - 823935 - VALID
Subjects: [SDV.CAN] Life Sciences [q-bio]/Cancer, editorial, jóvenes, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, General Medicine, amenaza, países en vía de desarrollo, Cáncer de hígado
Abstract: Hepatocellular carcinoma (HCC), according to the canonical clinical epidemiology, is found predominantly in men over 40 in age. However, we have described in Peru an unusually younger HCC patient population harboring unique clinical and molecular features such as an explosive tumor growth in non-cirrhotic liver. To date, ethnoanthropological, biogeographical, or socioeconomic evidence that may explain such dramatic variation in the clinical presentation of the tumor affecting younger people remains unknown. Alarmingly, it appears that this phenomenon would not be restricted to Peru, but can be found in other low- and middle-income countries. Therefore, it is urgent to join efforts to prevent an increase in this divergent form of liver cancer., El carcinoma hepatocelular (CHC), según la epidemiología clínica canónica, se encuentra predominantemente en hombres mayores de 40 años. Sin embargo, hemos descrito en el Perú una población de pacientes inusualmente más joven de pacientes con CHC, el mismo que presenta características clínicas y moleculares únicas, como un crecimiento tumoral explosivo en hígado no cirrótico. Hasta la fecha, se desconocen evidencias etno-antropológicas, bio-geográficas o socio-económicas que puedan explicar una discrepancia tan dramática en la presentación clínica de esta neoplasia en nuestro medio. Es alarmante el hecho que este fenómeno al parecer no estaría restringido al Perú, sino que se podría encontrarse en otros países de ingresos bajos y medianos. Por ello, es urgente sumar esfuerzos para evitar el aumento de esta forma divergente de cáncer de hígado.
Published: 2022

31. Non-traumatic coma in young children in Benin: are viral and bacterial infections gaining ground on cerebral malaria?

Author: Josselin, Brisset, Karl, Angendu Baki, Laurence, Watier, Elisée, Kinkpé, Justine, Bailly, Linda, Ayédadjou, Maroufou Jules, Alao, Ida, Dossou-Dagba, Gwladys I, Bertin, Michel, Cot, Farid, Boumédiène, Daniel, Ajzenberg, Agnès, Aubouy, Sandrine, Houzé, Jean-François, Faucher, Bertin, Vianou, Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], CHU Limoges, Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale (EpiMaCT), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-OmégaHealth (ΩHealth), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations (CESP), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Paul Brousse-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay, Epidémiologie et modélisation de la résistance aux antimicrobiens - Epidemiology and modelling of bacterial escape to antimicrobials (EMAE), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Centre Hospitalier Universitaire de Zone d'Abomey Calavi / Sô-Ava (CHUZ / AS), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre Hospitalier Universitaire de la Mère et de l'Enfant Lagune (CHU-MEL), Service de Parasitologie Mycologie [CHU Limoges], Institut de Recherche Clinique du Bénin [Abomey-Calavi, Bénin] (IRCB), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), This work was funded by the French National Research Agency (ANR-17-CE17-0001)., NeuroCM group: Dissou Affolabi (Pediatric Department, Calavi Hospital, Calavi, Benin), Nicolas Argy (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bibiane Biokou (Pediatric Department, Mother and Child University and Hospital Center (CHUMEL), Cotonou, Benin), Jean-Eudes Degbelo (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Calavi, Benin), Philippe Deloron (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Latifou Dramane (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Jérémy Fraering (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Emilie Guillochon (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Sayeh Jafari-Guemouri (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Ludivine Houzé (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Valentin Joste (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Claire Kamaliddin (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Anaïs Labrunie (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Yélé Ladipo (Pediatric Department, Mother and Child University and Hospital Center (CHUMEL), Cotonou, Benin), Thomas Lathiere (Ophtalmology department, Limoges University Hospital, Limoges, France), Achille Massougbodji (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Audrey Mowendabeka (Paediatric Department, Hopital de la Mère et de l'Enfant, Limoges, France), Jade Papin (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bernard Pipy (PHARMADEV, Université de Toulouse, IRD, UPS, France), Pierre-Marie Preux (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Marie Raymondeau (NET, INSERM, Université de Limoges, Limoges, France), Jade Royo (PHARMADEV, Université de Toulouse, IRD, UPS, France), Darius Sossou (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin), Brigitte Techer (MERIT UMR 261, IRD, Université de Paris, Paris, France), Bertin Vianou (Institut de Recherche Clinique du Bénin (IRCB), Abomey Calavi, Benin)., ANR-17-CE17-0001,NEUROCM,Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme(2017), Grelier, Elisabeth, Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme - - NEUROCM2017 - ANR-17-CE17-0001 - AAPG2017 - VALID, Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 216), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Subjects: MESH: Bacterial Infections, Malaria, Cerebral, Non-traumatic coma, MESH: Malaria, Cerebral, [SDV.MHEP.PED] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, MESH: Benin, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, MESH: Child, West Africa, Odds Ratio, Benin, Humans, Prospective Studies, [SDV.NEU] Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], Child, Cerebral malaria, [SDV.MHEP.PED]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Pediatrics, MESH: Humans, MESH: Child, Preschool, Public Health, Environmental and Occupational Health, Bacterial Infections, General Medicine, Central nervous system infection, MESH: Odds Ratio, MESH: Prospective Studies, Co-infection, Infectious Diseases, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Child, Preschool, [SDV.MHEP.MI] Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC], [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Abstract: Background While malaria morbidity and mortality have declined since 2000, viral central nervous system infections appear to be an important, underestimated cause of coma in malaria-endemic Eastern Africa. We aimed to describe the etiology of non-traumatic comas in young children in Benin, as well as their management and early outcomes, and to identify factors associated with death. Methods From March to November 2018, we enrolled all HIV-negative children aged between 2 and 6 years, with a Blantyre Coma Score ≤ 2, in this prospective observational study. Children were screened for malaria severity signs and assessed using a systematic diagnostic protocol, including blood cultures, malaria diagnostics, and cerebrospinal fluid analysis using multiplex PCR. To determine factors associated with death, univariate and multivariate analyses were performed. Results From 3244 admissions, 84 children were included: malaria was diagnosed in 78, eight of whom had a viral or bacterial co-infection. Six children had a non-malarial infection or no identified cause. The mortality rate was 29.8% (25/84), with 20 children dying in the first 24 h. Co-infected children appeared to have a poorer prognosis. Of the 76 children who consulted a healthcare professional before admission, only 5 were prescribed adequate antimalarial oral therapy. Predictors of early death were jaundice or increased bilirubin [odd ratio (OR)= 8.6; 95% confidential interval (CI): 2.03–36.1] and lactate > 5 mmol/L (OR = 5.1; 95% CI: 1.49–17.30). Antibiotic use before admission (OR = 0.1; 95% CI: 0.02–0.85) and vaccination against yellow fever (OR = 0.2, 95% CI: 0.05–0.79) protected against mortality. Conclusions Infections were found in all children who died, and cerebral malaria was by far the most common cause of non-traumatic coma. Missed opportunities to receive early effective antimalarial treatment were common. Other central nervous system infections must be considered in their management. Some factors that proved to be protective against early death were unexpected.
Published: 2022

32. Improving Aqueous Solubility and In Vitro Pharmacokinetic Properties of the 3-Nitroimidazo[1,2-a]pyridine Antileishmanial Pharmacophore

Author: Romain Paoli-Lombardo, Nicolas Primas, Sandra Bourgeade-Delmas, Sébastien Hutter, Alix Sournia-Saquet, Clotilde Boudot, Emilie Brenot, Caroline Castera-Ducros, Sophie Corvaisier, Marc Since, Aurélie Malzert-Fréon, Bertrand Courtioux, Alexis Valentin, Pierre Verhaeghe, Nadine Azas, Pascal Rathelot, Patrice Vanelle, Institut de Chimie Radicalaire (ICR), Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital de la Conception [CHU - APHM] (LA CONCEPTION), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale (EpiMaCT), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-OmégaHealth (ΩHealth), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Centre d'Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie (CERMN), Université de Caen Normandie (UNICAEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Centre Hospitalier Universitaire de Nîmes (CHU Nîmes), Aix-Marseille Université (AMU), Centre national de la recherche scientifique (CNRS), Assistance publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées (IRBA), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Gulli, Marie-Hélène
Subjects: [SDV.SP.MED] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Thermodynamic solubility, Imidazo[1,2-a]pyridine, nitroaromatic, nitroreductases, Leishmania spp, structure-activity relationships, thermodynamic solubility, microsomal stability, gastrointestinal permeability, Pharmaceutical Science, Structure-activity relationships, Nitroreductases, Imidazo[1 2-a]pyridine, Nitroaromatic, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Drug Discovery, Molecular Medicine, Microsomal stability, Gastrointestinal permeability
Abstract: An antileishmanial structure–activity relationship (SAR) study focused on positions 2 and 8 of the imidazo[1,2-a]pyridine ring was conducted through the synthesis of 22 new derivatives. After being screened on the promatigote and axenic amastigote stages of Leishmania donovani and L. infantum, the best compounds were tested against the intracellular amastigote stage of L. infantum and evaluated regarding their in vitro physicochemical and pharmacokinetic properties, leading to the discovery of a new antileishmanial6-chloro-3-nitro-8-(pyridin-4-yl)-2-[(3,3,3-trifluoropropylsulfonyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine hit. It displayed low cytotoxicities on both HepG2 and THP1 cell lines (CC50 > 100 µM) associated with a good activity against the intracellular amastigote stage of L. infantum (EC50 = 3.7 µM versus 0.4 and 15.9 µM for miltefosine and fexinidazole, used as antileishmanial drug references). Moreover, in comparison with previously reported derivatives in the studied series, this compound displayed greatly improved aqueous solubility, good mouse microsomal stability (T1/2 > 40 min) and high gastrointestinal permeability in a PAMPA model, making it an ideal candidate for further in vivo studies on an infectious mouse model.
Published: 2022

33. Melatonin: A short clarification for the over-enthusiasts

Author: Boutin, Jean A., Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: MESH: Reproducibility of Results, MESH: Melatonin / therapeutic use, MESH: Humans, MESH: Circadian Rhythm / drug effects, MESH: COVID-19 Drug Treatment, MESH: Melatonin / physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], MESH: Animals, MESH: Communication, MESH: Melatonin / pharmacology, MESH: Seasons
Abstract: International audience; Melatonin is a naturally occurring molecule derived from tryptophan. Melatonin is a key player in relaying the circadian rhythm between our environment and our body. It has also a key role in rhythming the seasons (more production during long nights and less during short ones) as well as in the reproduction cycles of the mammals. Melatonin is often and surprisingly presented as a molecule with multiple therapeutic properties that can fix (or help to fix) many health issues, such as diseases (cancer, ageing, virus-induced affections including COVID-19, etc…) or toxicological situations (metals, venoms, chemical such as adriamycin [doxorubicin], methotrexate or paclitaxel). The mechanistics behind those wonders is still missing and this is puzzling. In the present commentary, the main well-established biological properties are presented and briefly discussed with the aim of delineating the borders between facts and wishful thinking.; La mélatonine est une molécule naturelle dérivée du tryptophane. Son rôle est de servir de relai entre la rythmicité jour/nuit et notre corps. Elle sert donc de marqueur circadien : concentration haute pendant la nuit et basse pendant la journée. Elle sert aussi de marque saisonnière : plus les nuits sont longues et plus longuement elle est produite (et vice-versa), ce qui a un rôle primordial dans les cycles reproductifs des animaux. Mais elle est aussi affublée de multiples propriétés thérapeutiques concernant la plupart des maladies humaines, du cancer à la COVID-19 en passant par l’infection par le virus Ebola, ainsi que de capacités thérapeutiques vis-à-vis de multiples toxicités (métaux, venins, produits chimiques comme l’adriamycine [doxorubicine], le méthotrexate ou le paclitaxel). Alors que l’enthousiasme à propos de cette molécule est troublant, l’assise scientifique de ces descriptions est dans le meilleur des cas faible et dans la plupart des cas, inexistante. Dans ce commentaire, les données scientifiques bien établies liées à la mélatonine sont résumées et brièvement discutées, en tâchant de redessiner les limites entre ce qui est connu et bien établi et ce qui reste du domaine du fantasme.
Published: 2022

34. The Potential Impact of Blood System on Dietary Habits and Smoking

Author: Ioannis Tsamesidis, Evangelia Stalika, Chinedu O. Egwu, Agathi Pritsa, Maria Parpori, Argyrios Gkinoudis, Diana Samara, Evgenia Lymperaki, International Hellenic University, Aristotle University of Thessaloniki, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and ΓΕΝΙΚΟ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΟ ΝΑΟΥΣΑΣ = Naoussa General Hospital
Subjects: alcohol, [SDV]Life Sciences [q-bio], General Engineering, ABO blood groups, Article, smoking, Medicine, rhesus types, caffeine, dietary habits, General Earth and Planetary Sciences, General Environmental Science
Abstract: The ‘Blood-Type’ diet advises individuals to eat according to their ABO blood group to improve their health and decrease the risk of chronic diseases. However, the food preferences of individuals with different blood groups have not been examined. The aim of our study was to investigate, in healthy regular blood donors (rBDs), the associations of smoke, alcohol, caffeine, vitamin and fat intake with their different blood groups and if ABO groups could be a potential predictor tool for disease prevention. A total of 329 volunteers were divided into four groups according to their ABO types: Group 1 (A) comprised 141 rBDs; Group 2 (B), 65 rBDs; Group 3 (O), 96 rBDs; and Group 4, 27 rBDs. Additionally, they were divided into two groups according to their rhesus types and their preferences for smoke, too. Dietary intake was assessed using 3-day food recall and the Food Processor computer program for nutrient analysis. Alcohol, caffeine, sugar and Vitamin D consumption were significantly (p < 0.05) higher in the O group. The A group presented statistically significantly (p < 0.05) greater preferences for cholesterol intake and a higher trend for smoking (25%) habits compared with all the other groups, whereas Group B preferred more fatty foods. The blood group AB appeared to be the most controlled food intake group. Regarding the rhesus comparisons, alcohol; caffeine; and Vitamin C, D, E and K consumptions were significantly (p < 0.05) higher in rhesus-positive individuals than their rhesus-negative counterparts. For the non-smoker group, compared with the smokers, a higher consumption of Vitamin D and fibers was found. In conclusion, in the present study, statistically significant correlations of the ABO and rhesus system with some dietary parameters were found, indicating a consequent influence of these preferences on the progression of different diseases.
Published: 2022

35. Prediction of hepatocellular carcinoma in Hepatitis C patients with advanced fibrosis after sustained virologic response

Author: Azzi, Jessica, Dorival, Céline, Cagnot, Carole, Fontaine, Hélène, Lusivika-Nzinga, Clovis, Leroy, Vincent, de Ledinghen, Victor, Tran, Albert, Zoulim, Fabien, Alric, Laurent, Gournay, Jérôme, Bronowicki, Jean-Pierre, Decaens, Thomas, Riachi, Ghassan, Mikhail, Nabiel, Soliman, Reham, Shiha, Gamal, Pol, Stanislas, Carrat, Fabrice, Ganne-Carrié, Nathalie, Hepather, Anrs-Afef, Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), ANRS France Recherche Nord & sud Sida-hiv hépatites, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Service d'hépato-gastro-entérologie [APHP Henri Mondor], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Institut Mondor de Recherche Biomédicale (IMRB), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-IFR10-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] (BaRITOn), Université de Bordeaux (UB)-CHU Bordeaux [Bordeaux]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Centre méditerranéen de médecine moléculaire (C3M), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Côte d'Azur (UCA), Hospices Civils de Lyon, Departement de Neurologie (HCL), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Imagerie Adaptative Diagnostique et Interventionnelle (IADI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Service d'Hépato-gastro-entérologie [CHRU Nancy], Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire [Grenoble] (CHU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Hôpital Charles Nicolle [Rouen], CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU), Assiut University, Port Said University, Mansoura University [Egypt], Physiopathologie du système immunitaire (Inserm U1223), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpitaux Universitaires Paris Seine-Saint-Denis (GHU 93), INSERM U1053, Université Bordeaux, Bordeaux, France., Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Centre Hospitalier Universitaire de Purpan (CHU Purpan), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Inserm U1254, Centre Hospitalier Universitaire de Nancy (CHU Nancy), Nutrition, Inflammation et axe Microbiote-Intestin-Cerveau (ADEN), Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institute for Research and Innovation in Biomedicine (IRIB), Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), UNIROUEN - UFR Santé (UNIROUEN UFR Santé), Service d'Hépato-Gastroentérologie [CHU Rouen], Hôpital Charles Nicolle [Rouen]-CHU Rouen, Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN), Normandie Université (NU), Egyptian Liver Research Institute and Hospital (ELRIAH), Mansoura, Egypt, Biostatistics and Cancer Epidemiology Department, South Egypt Cancer Institute, Assiut University, Assuit, Egypt., Tropical Medicine Department, Faculty of Medicine, Port Said University, Port Said, Egypt., Hepatology and Gastroenterology Unit, Internal Medicine Department, Faculty of Medicine, Mansoura University, Mansoura, Egypt., Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), École pratique des hautes études (EPHE), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPC), and Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPC)
Subjects: Liver Cirrhosis, Male, Carcinoma, Hepatocellular, Hepatology, Sustained Virologic Response, Hepatitis C virus, Liver Neoplasms, Gastroenterology, [SDV.MHEP.HEG]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Hépatology and Gastroenterology, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, Hepacivirus, Hepatitis C, Chronic, Middle Aged, Antiviral Agents, Hepatitis C, Risk factors, [SDV.MHEP.MI]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Infectious diseases, Humans, Risk score, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, HCC, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS
Abstract: International audience; Background & Aims: Prediction of hepatocellular carcinoma (HCC) occurrence in patients with chronic hepatitis C (HCV) who achieved a sustained virological response (SVR) after direct acting antivirals (DAAs) remains challenging.Methods: Among HCC-free HCV patients with advanced fibrosis enrolled in the ANRS CO22 HEPATHER cohort who achieved SVR 12 weeks after treatment with DAAs, HCC predictive models were developed using Cox multivariable regression. The derived score was externally validated in a large Egyptian cohort. Our main outcome was the HCC-free survival.Results: During follow-up (median 3.05 years), 153 out of 3531 patients developed a HCC. Main variables associated with HCC occurrence were: male gender, HCV genotype 3, esophageal varices, albumin < 40 g/L, total bilirubin >11 µmol/L and hypercholesterolemia before DAA initiation, together with age > 58 years, FIB-4 index ≥3.25 evaluated at SVR. A score was established allowing the stratification of patients by high (score ≥ 12/22), intermediate (7 ≤ score
Published: 2022

36. In Vitro and In Silico Antimalarial Evaluation of FM-AZ, a New Artemisinin Derivative

Author: Ioannis Tsamesidis, Farnoush Mousavizadeh, Chinedu O. Egwu, Dionysia Amanatidou, Antonella Pantaleo, Françoise Benoit-Vical, Karine Reybier, Athanassios Giannis, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), International Hellenic University, Leipzig University, Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Università degli Studi di Sassari = University of Sassari [Sassari] (UNISS)
Subjects: Novel artemisinin derivatives, novel artemisinin derivatives, in silico study, artemisinin resistance, ROS, LC-MS, Artemisinin resistance, parasitic diseases, General Engineering, General Earth and Planetary Sciences, [CHIM.COOR]Chemical Sciences/Coordination chemistry, ddc:610, General Environmental Science
Abstract: International audience; Artemisinin-based Combination Therapies (ACTs) are currently the frontline treatment against Plasmodium falciparum malaria, but parasite resistance to artemisinin (ART) and its derivatives, core components of ACTs, is spreading in the Mekong countries. In this study, we report the synthesis of several novel artemisinin derivatives and evaluate their in vitro and in silico capacity to counteract Plasmodium falciparum artemisinin resistance. Furthermore, recognizing that the malaria parasite devotes considerable resources to minimizing the oxidative stress that it creates during its rapid consumption of hemoglobin and the release of heme, we sought to explore whether further augmentation of this oxidative toxicity might constitute an important addition to artemisinins. The present report demonstrates, in vitro, that FM-AZ, a newly synthesized artemisinin derivative, has a lower IC50 than artemisinin in P. falciparum and a rapid action in killing the parasites. The docking studies for important parasite protein targets, PfATP6 and PfHDP, complemented the in vitro results, explaining the superior IC50 values of FM-AZ in comparison with ART obtained for the ART-resistant strain. However, cross-resistance between FM-AZ and artemisinins was evidenced in vitro.
Published: 2022

37. Effect of prolonged treatment with tyramine on glucose tolerance in streptozotocin-induced diabetic rats

Author: Nicolas Morin, P Marq, Caroline Subra, Christian Carpéné, Françoise Nepveu, V. Visentin, D. Prévot, Philippe Valet, Sandy Bour, Marie-Carmen Monje, Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS (FRANCE), Institut de Recherche pour le Développement - IRD (FRANCE), Université Toulouse III - Paul Sabatier - UT3 (FRANCE), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse - CHU Toulouse (FRANCE), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement - PHARMA-DEV (Toulouse, France), Unité de recherche sur les obésités, IFR 31 Louis Bugnard (IFR 31), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Toulouse [Toulouse]-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Blood Glucose, Male, medicine.medical_specialty, Semicarbazide-sensitive amine oxidase, Physiology, Monoamine oxidase, Glucose uptake, medicine.medical_treatment, Tyramine, Biochemistry, Diabetes Mellitus, Experimental, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, 0302 clinical medicine, [SDV.SP.MED]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences/Medication, Internal medicine, Diabetes mellitus, Biogenic amine, Adipocytes, medicine, Animals, Génie chimique, Insulin, Rats, Wistar, Génie des procédés, Infusion Pumps, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, Chemistry, Diabetes, Glucose transporter, General Medicine, Glucose Tolerance Test, [SDV.MHEP.EM]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology/Endocrinology and metabolism, medicine.disease, Streptozotocin, 3. Good health, Rats, Glucose, Endocrinology, 030220 oncology & carcinogenesis, Vanadates, Injections, Intraperitoneal, medicine.drug
Abstract: International audience; The biogenic amine tyramine has been reported to stimulatein vitro glucose transport in adipocytes, cardiomyocytes and skeletal muscle, and to improvein vivo glucose utilization in rats. These effects were dependent on amine oxidation, since they were blocked by inhibitors of monoamine oxidase (MAO) and semicarbazide-sensitive amine oxidase (SSAO). We thus tested in this work whether a prolonged treatment with tyramine could improve glucose tolerance in streptozotocin-induced diabetic rats. First, tyramine content of standard rodent chow was determined by HPLC and daily tyramine intake of control rats was estimated to be around 26 μmol/kg body weight. Then, tyramine was administred during 3 weeks in streptozotocin-induced diabetic rats at 29 μmol/kg by daily i.p. injection alone or together with vanadate 0.02 μmol/kg. In another group of diabetic rats, tyramine was subcutaneously delivered at 116 μmol/kg/day by osmotic minipumps. All tyramine treatments resulted in a decrease of the hyperglycemic responses to an i.p. glucose load. Adipocytes isolated from either untreated or treated diabetic rats were sensitive to the stimulation of glucose uptake by tyramine. However, diabetic animals receiving tyramine for three weeks did not recover from their hyperglycemia, hypoinsulinemia and glucosuria. These results show that the improvement of glucose tolerance induced by prolonged tyramine administration occurs in an insulin-depleted model and probably results from peripheral insulin-like actions of the oxidation of MAO/SSAO substrates, such as the stimulation of glucose uptake into adipocytes.
Published: 2003

38. Cordiasecosides G-J, 9,10-Seco-29-norcycloartane glycosides isolated from Cordia lutea and their antibacterial activities

Author: Inés Castro, Christiane André-Barrès, Nicolas Fabre, Stéphane Massou, Michel Sauvain, Denis Castillo Pareja, Valérie Jullian, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Laboratorios de Investigación y Desarrollo (LID), Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH), Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Financement récurrent des institutions d'affiliation des auteurs,IRD : Bourse de thèse ARTSIRD : Laboratoire Mixte International LAVI
Subjects: Pharmacology, Cordia, Helicobacter pylori, Cordia lutea, Molecular Structure, Secocycloartane, Plant Extracts, [SDV]Life Sciences [q-bio], Traditional medicine, General Medicine, Microbial Sensitivity Tests, traditional medicine, Boraginaceae, Anti-Bacterial Agents, Antibacterial, antibacterial, Drug Discovery, [CHIM]Chemical Sciences, secocycloartane, Glycosides, [SDV.MHEP]Life Sciences [q-bio]/Human health and pathology
Abstract: International audience; Four undescribed secocycloartane monoglycosides (1-4) were isolated from an ethanolic extract of the dry flowers of Cordia lutea Lam. Their structural assignment is based on NMR and MS analysis. Their stereochemistry is confirmed by molecular modelling studies using DFT-NMR calculations done for compound 3. In vitro antibacterial activity of the four compounds was moderate on Helicobacter pylori (MIC = 15.6 µg/mL), and much weaker on Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa or Escherichia coli (MIC > 125 µg/mL). Toxicity evaluated against RAW 264.7 cells was weak (IC50 values ranging from 24 to 41 µM i.e 15 to 24 µg/mL), but in the same range as anti-Helicobacter activity.
Published: 2021

39. PassStat, a simple but fast, precise and versatile open source potentiostat

Author: Mélicia Caux, Anis Achit, Kethsovann Var, Gabriel Boitel-Aullen, Daniel Rose, Agnès Aubouy, Sylvain Argentieri, Raymond Campagnolo, Emmanuel Maisonhaute, Laboratoire Interfaces et Systèmes Electrochimiques (LISE), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Institut des Systèmes Intelligents et de Robotique (ISIR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and ANR-17-CE07-0012,FastGiant,Mécanismes de transferts d'électrons ultrarapides dans les polyrotaxanes géants(2017)
Subjects: Potentiostat, open hardware, [CHIM.ANAL]Chemical Sciences/Analytical chemistry, Mechanical Engineering, ultramicroelectrodes, analytical chemistry, Biomedical Engineering, square wave voltammetry, Instrumentation, Industrial and Manufacturing Engineering, cyclic voltammetry, Civil and Structural Engineering
Abstract: International audience; This work presents 4 open source potentiostat solutions for performing accurate measurements in cyclic voltammetry and square wave voltammetry at a low price. A very simple and easy to reproduce analogic board (c.a. 10 €) was driven either by a Teensy card from the company PJRC under an Arduino/Python software solution (39 €) or by an Analog Discovery 2 device from Digilent (less than 300 €). A smartphone Bluetooth Android interface was also created to circumvent the use of a computer. We demonstrated that our scheme is suitable for measurements in classical electrochemical conditions but also to carry out experiments with ultramicroelectrodes. We could thus reach a noise resolution of less than 1 pA. Scan rates of 8000 Vs-1 with ohmic drop compensation were also achieved. The device is suitable for teaching purposes but also for experiments in a participative science context on the ground, or countries with lower financial possibilities.
Published: 2021

40. Culex quinquefasciatus Late Trypsin Biosynthesis Is Translationally Regulated by Trypsin Modulating Oostatic Factor

Author: Dov Borovsky, Charles A. Powell, Peter Verhaert, Pierre Rougé, Arnold De Loof, University of Colorado Anschutz [Aurora], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Zoological Institute - Instituut voor Dierkunde [KU Leuven, Belgium] (ZI), and Catholic University of Leuven - Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Subjects: blood digestion, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], three-dimensional modeling, GENE FAMILY, FACTOR TMOF, SEQUENCE, chemistry.chemical_compound, Biosynthesis, Physiology (medical), medicine, QP1-981, GUT, MESSENGER-RNAS, cloning and sequencing, Original Research, Science & Technology, biology, MIDGUT, late trypsin biosynthesis, Culex quinquefasciatus, biology.organism_classification, Trypsin, CDNA, MOSQUITO, Biochemistry, chemistry, Life Sciences & Biomedicine, AEDES-AEGYPTI, ENZYMES, medicine.drug
Abstract: Trypsin is a serine protease that is synthesized by the gut epithelial cells of female mosquitoes; it is the enzyme that digests the blood meal. To study its molecular regulation, Culex quinquefasciatus late trypsin was purified by diethylaminoethyl (DEAE), affinity, and C18 reverse-phase high performance liquid chromatography (HPLC) steps, and the N-terminal amino acid sequence was determined for molecular cloning. Five overlapping segments of the late trypsin cDNA were amplified by PCR, cloned, and the full sequence (855 bp) was characterized. Three-dimensional models of the pro-trypsin and activated trypsin were built and compared with other trypsin models. Trypsin modulating oostatic factor (TMOF) concentrations in the hemolymph were determined by ELISA and compared with trypsin activity in the gut after the blood meal. The results showed that there was an increase in TMOF concentrations circulating in the hemolymph which has correlated to the reduction of trypsin activity in the mosquito gut. Northern blot analysis of the trypsin transcripts after the blood meal indicated that trypsin activity also followed the increase and decrease of the trypsin transcript. Injections of different amounts of TMOF (0.025 to 50 μg) decreased the amounts of trypsin in the gut. However, Northern blot analysis showed that TMOF injections did not cause a decrease in trypsin transcript abundance, indicating that TMOF probably affected trypsin translation. ispartof: FRONTIERS IN PHYSIOLOGY vol:12 ispartof: location:Switzerland status: published
Published: 2021
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41. Effect of Silica Based Nanoparticles against Plasmodium falciparum and Leishmania infantum parasites

Author: Karine Reybier, Ioannis Tsamesidis, Sandra Bourgeade-Delmas, Chinedu O. Egwu, Konstantina Kazeli, Georgia K. Pouroutzidou, Eleana Kontonasaki, Alexis Valentin, Evgenia Lymperaki, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), International Hellenic University, Aristotle University of Thessaloniki, and Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI)
Subjects: Drug, media_common.quotation_subject, [SDV]Life Sciences [q-bio], malaria, Drug resistance, RM1-950, Biology, Toxicology, Article, Microbiology, leishmanisis, RA1190-1270, parasitic diseases, medicine, Artemisinin, media_common, Pharmacology, anti-parasitic properties, Leishmaniasis, Plasmodium falciparum, medicine.disease, Leishmania, biology.organism_classification, Pollution, artemisinin, Toxicology. Poisons, Therapeutics. Pharmacology, Leishmania infantum, Malaria, medicine.drug, silica-based nanoparticles
Abstract: International audience; Malaria and Leishmaniasis are two major parasitic diseases, endemic in large areas of tropical countries with high morbidity and mortality across the world. Nanoparticles in small sizes are specifically considered in medicine due to their ability to enter the cells, control the distribution of the administered drug and carry the drug specifically to the place of action. The present study aims to introduce the application of silica nanoparticles as new promising nanotools in malaria and leishmaniasis treatment. Ion doped silica nanomaterials revealed antileishmanial activities indicating the positive role of calcium, magnesium and copper to the surface of the particles against Leishmania parasites. Artemisinin-loaded nanoparticles presented the most promising antiparasitic properties with a sustained release able to overcome the parasite invasion. The sustainable release of artemisinin guarantee both the maintenance of its potential efficacy and also introduce an administration of drug to avoid subsequent drug resistance.
Published: 2021
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42. Transcriptome analysis of Plasmodium falciparum isolates from Benin reveals specific gene expression associated with cerebral malaria

Author: E, Guillochon, J, Fraering, V, Joste, C, Kamaliddin, B, Vianou, L, Houzé, L G, Baudrin, J F, Faucher, A, Aubouy, S, Houzé, M, Cot, N, Argy, O, Taboureau, G I, Bertin, Brigitte, Techer, Unité de Biologie Fonctionnelle et Adaptative (BFA (UMR_8251 / U1133)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Mère et enfant en milieu tropical : pathogènes, système de santé et transition épidémiologique (MERIT - UMR_D 261), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Paris Cité (UPCité), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), University of Calgary, Institut de Recherche Clinique du Bénin [Abomey-Calavi, Bénin] (IRCB), Institut Curie [Paris], Université Paris sciences et lettres (PSL), Epidémiologie des Maladies Chroniques en zone tropicale (EpiMaCT), CHU Limoges-Institut d'Epidémiologie Neurologique et de Neurologie Tropicale-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-OmégaHealth (ΩHealth), Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM), Service des Maladies infectieuses et tropicales [CHU Limoges], CHU Limoges, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and ANR-17-CE17-0001,NEUROCM,Identification des facteurs parasitaires et de l'hôte à l'origine de la neuroinflammation et de sa résolution dans un contexte de neuropaludisme(2017)
Subjects: Erythrocytes, Plasmodium falciparum, Malaria, Cerebral, Protozoan Proteins, Biology, Microbiology, Transcriptome, transcriptomics, var genes, Antigen, parasitic diseases, Gene expression, Benin, Humans, Immunology and Allergy, Malaria, Falciparum, Child, Receptor, Gene, Gene Expression Profiling, biology.organism_classification, Entry into host, Infectious Diseases, Cerebral Malaria, Child, Preschool, cytoadherence, cerebral malaria, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, RNA-seq
Abstract: The host and parasitic factors leading to cerebral malaria (CM) are not yet fully elucidated and CM Plasmodium falciparum isolates transcriptome profile remains largely unknown. Based on RNA-seq data from 15 CM and 15 uncomplicated malaria (UM) children from Benin, we identified an increased ring stage signature in CM parasites. Reduced circulating time may result from a higher adherence ability of CM isolates and consistent with this hypothesis, we measured an overexpression of var genes in CM. var genes domains expression was more restricted in CM isolates compared to UM, reflecting the specific binding to receptors in host brain endothelium capillaries. However, ICAM-1 binding motif was found expressed in both CM and UM, questioning its role in PfEMP1 adhesion to ICAM-1 receptor. UM isolates increased circulation time may also be modulated by a more efficient immune response against infected erythrocytes surface proteins, which we could not demonstrate on our cohort. Identification of deregulated genes involved in adhesion, excluding variant surface antigens, also supports the hypothesis of an increased CM adhesion capacity. Finally, numerous upregulated genes involved in entry into host pathway were found, reflecting a greater erythrocytes invasion capacity of CM parasites.
Published: 2021

43. Single-Cell RNAseq Profiling of Human γδ T Lymphocytes in Virus-Related Cancers and COVID-19 Disease

Author: Cerapio, Juan Pablo, Perrier, Marion, Pont, Fréderic, Tosolini, Marie, Laurent, Camille, Bertani, Stéphane, Fournie, Jean-Jacques, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut Carnot Lymphome (CALYM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), and Université de Toulouse (UT)
Subjects: Adult, Herpesvirus 4, Human, tumor, Trajectory inference, γδ T lymphocytes, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer, lymphocyte, Lymphocyte Activation, Severity of Illness Index, Microbiology, Article, Tumor-infiltrating lymphocytes, Lymphocytes, Tumor-Infiltrating, T-Lymphocyte Subsets, Neoplasms, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Humans, Lymphocyte Count, RNA-Seq, human, Immune response, Child, Lung, Papillomaviridae, Cancer, COVID-19, Cell Differentiation, Receptors, Antigen, T-Cell, gamma-delta, differentiation, [SDV.IMM.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Immunotherapy, Hodgkin Disease, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Systemic Inflammatory Response Syndrome, QR1-502, gammadelta, single cell, [SDV.IMM.IA]Life Sciences [q-bio]/Immunology/Adaptive immunology, Head and Neck Neoplasms, trajectory, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, Single-Cell Analysis, Bronchoalveolar Lavage Fluid, transcriptome, Single-cell transcriptomics
Abstract: The detailed characterization of human γδ T lymphocyte differentiation at the single-cell transcriptomic (scRNAseq) level in tumors and patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) requires both a reference differentiation trajectory of γδ T cells and a robust mapping method for additional γδ T lymphocytes. Here, we incepted such a method to characterize thousands of γδ T lymphocytes from (n = 95) patients with cancer or adult and pediatric COVID-19 disease. We found that cancer patients with human papillomavirus-positive head and neck squamous cell carcinoma and Epstein–Barr virus-positive Hodgkin’s lymphoma have γδ tumor-infiltrating T lymphocytes that are more prone to recirculate from the tumor and avoid exhaustion. In COVID-19, both TCRVγ9 and TCRVγnon9 subsets of γδ T lymphocytes relocalize from peripheral blood mononuclear cells (PBMC) to the infected lung tissue, where their advanced differentiation, tissue residency, and exhaustion reflect T cell activation. Although severe COVID-19 disease increases both recruitment and exhaustion of γδ T lymphocytes in infected lung lesions but not blood, the anti-IL6R therapy with Tocilizumab promotes γδ T lymphocyte differentiation in patients with COVID-19. PBMC from pediatric patients with acute COVID-19 disease display similar γδ T cell lymphopenia to that seen in adult patients. However, blood γδ T cells from children with the COVID-19-related multisystem inflammatory syndrome are not lymphodepleted, but they are differentiated as in healthy PBMC. These findings suggest that some virus-induced memory γδ T lymphocytes durably persist in the blood of adults and could subsequently infiltrate and recirculate in tumors.
Published: 2021

44. Lipid Interactions Between Flaviviruses and Mosquito Vectors

Author: Vial, Thomas, Marti, Guillaume, Missé, Dorothée, Pompon, Julien, Duke-NUS Medical School [Singapore], Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), MetaToul Agromix, MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud]), and ANR-20-CE15-0006,VirSalivaEnhancer,Amplificateur de transmission d'origine flavivirale dans la salive de moustique(2020)
Subjects: flavivirus, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Physiology (medical), viruses, parasitic diseases, transmission, virus diseases, lipids (amino acids, peptides, and proteins), mosquito, Review, metabolomics, phospholipids
Abstract: International audience; Mosquito-borne flaviviruses, such as dengue (DENV), Zika (ZIKV), yellow fever (YFV), West Nile (WNV), and Japanese encephalitis (JEV) viruses, threaten a large part of the human populations. In absence of therapeutics and effective vaccines against each flaviviruses, targeting viral metabolic requirements in mosquitoes may hold the key to new intervention strategies. Development of metabolomics in the last decade opened a new field of research: mosquito metabolomics. It is now clear that flaviviruses rely on mosquito lipids, especially phospholipids, for their cellular cycle and propagation. Here, we review the biosyntheses of, biochemical properties of and flaviviral interactions with mosquito phospholipids. Phospholipids are structural lipids with a polar headgroup and apolar acyl chains, enabling the formation of lipid bilayer that form plasma- and endomembranes. Phospholipids are mostly synthesized through the de novo pathway and remodeling cycle. Variations in headgroup and acyl chains influence phospholipid physicochemical properties and consequently the membrane behavior. Flaviviruses interact with cellular membranes at every step of their cellular cycle. Recent evidence demonstrates that flaviviruses reconfigure the phospholipidome in mosquitoes by regulating phospholipid syntheses to increase virus multiplication. Identifying the phospholipids involved and understanding how flaviviruses regulate these in mosquitoes is required to design new interventions.
Published: 2021

45. Cannabinoids vs. whole metabolome: Relevance of cannabinomics in analyzing Cannabis varieties

Author: Maxime Bonhomme, Pedro Vásquez-Ocmín, Sylvie Fournier, Alexandre Maciuk, Stéphane Bertani, Guillaume Marti, Fabienne Mathis, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Biomolécules : Conception, Isolement, Synthèse (BioCIS), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY), HEMP-it ADN, Fédération Nationale des Producteurs de Chanvre (FNPC), Metatoul - Agromix, MetaToul-MetaboHUB, Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Evolution des Interactions Plantes-Microorganismes, Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), MetaToul Agromix, MetaboHUB-MetaToul, MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-MetaboHUB-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Laboratoire de Recherche en Sciences Végétales (LRSV), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC), Bertani, Stéphane, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), and Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
Subjects: Chemotypes, Computational biology, Cannabis sativa, 01 natural sciences, Biochemistry, Cannabinomics, Analytical Chemistry, 03 medical and health sciences, [CHIM] Chemical Sciences, Metabolome, Environmental Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, [SDV.BV]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology, Statistical analysis, Genotyping, [SDV.BV.PEP] Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, Spectroscopy, 030304 developmental biology, Cannabis, 0303 health sciences, Chemotype, biology, Cannabinoids, Chemistry, 010401 analytical chemistry, biology.organism_classification, MESH: Cannabis, 0104 chemical sciences, [SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, MESH: Cannabinoids, Identification (biology), MESH: Metabolome, Phytocannabinoids
Abstract: International audience; Cannabis sativa has a long history of domestication both for its bioactive compounds and its fibers. This has produced hundreds of varieties, usually characterized in the literature by chemotypes, with Δ9-THC and CBD content as the main markers. However, chemotyping could also be done based on minor compounds (phytocannabinoids and others). In this work, a workflow, which we propose to name cannabinomics, combines mass spectrometry of the whole metabolome and statistical analysis to help differentiate C. sativa varieties and deciphering their characteristic markers. By applying this cannabinomics approach to the data obtained from 20 varieties of C. sativa (classically classified as chemotype I, II, or III), we compared the results with those obtained by a targeted quantification of 11 phytocannabinoids. Cannabinomics can be considered as a complementary tool for phenotyping and genotyping, allowing the identification of minor compounds playing a key role as markers of differentiation.
Published: 2021

46. Reactive Oxygen Species as the Brainbox in Malaria Treatment

Author: Françoise Benoit-Vical, Jean-Michel Augereau, Karine Reybier, Chinedu O. Egwu, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Alex Ekwueme Federal University Ndufu-Alike, Ikwo (AE-FUNAI), Institut de pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), New Antimalarial Molecules and Pharmacological Approaches (ERL1289), Centre d'investigation clinique de Toulouse (CIC 1436), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique, France), Université Paul Sabatier, Toulouse III (France), IRD (Institut de Recherche pour le Développement, France), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Pôle Santé publique et médecine publique [CHU Toulouse], Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), and Pagès, Nathalie
Subjects: malaria and oxidative stress, Physiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Clinical Biochemistry, Plasmodium falciparum, RM1-950, Review, medicine.disease_cause, Biochemistry, antimalarials, parasitic diseases, medicine, Artemisinin, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, Reactive oxygen species, biology, ROS, Cell Biology, biology.organism_classification, medicine.disease, [SDV] Life Sciences [q-bio], chemistry, Immunology, Therapeutics. Pharmacology, Malaria control, Malaria, Oxidative stress, medicine.drug
Abstract: International audience; Several measures are in place to combat the worldwide spread of malaria, especially in regions of high endemicity. In part, most common antimalarials, such as quinolines and artemisinin and its derivatives, deploy an ROS-mediated approach to kill malaria parasites. Although some antimalarials may share similar targets and mechanisms of action, varying levels of reactive oxygen species (ROS) generation may account for their varying pharmacological activities. Regardless of the numerous approaches employed currently and in development to treat malaria, concerningly, there has been increasing development of resistance by Plasmodium falciparum, which can be connected to the ability of the parasites to manage the oxidative stress from ROS produced under steady or treatment states. ROS generation has remained the mainstay in enforcing the antiparasitic activity of most conventional antimalarials. However, a combination of conventional drugs with ROS-generating ability and newer drugs that exploit vital metabolic pathways, such antioxidant machinery, could be the way forward in effective malaria control.
Published: 2021

47. Atherosclerotic Cardiovascular Events in Patients Infected With Human Immunodeficiency Virus and Hepatitis C Virus

Author: Didier Neau, Camille Gilbert, Anne Gervais, Laure Esterle, Linda Wittkop, Laurent Alric, Lionel Piroth, Eric Rosenthal, Alissa Naqvi, François Dabis, Jose-Luis Lopez-Zaragoza, Dominique Salmon Ceron, Philippe Sogni, Julie Chas, Alexandre Cinaud, Christine Katlama, Anne Simon, Patrick Miailhes, Daniel Garipuy, Isabelle Poizot-Martin, Olivier Bouchaud, Karine Lacombe, Mathieu Chalouni, Marc Arthur Loko, Karl Barange, Franck Boccara, Firouzé Bani-Sadr, François Boué, François Raffi, Caroline Lascoux-Combe, David Zucman, Philippe Morlat, Claudine Duvivier, Hugues Aumaitre, Cécile Goujard, Estibaliz Lazaro, Boun Kim Tan, David Rey, Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpitaux Universitaires Paris Centre (CHU Paris Centre), Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5), Team MORPH3EUS (INSERM U1219 - UB - ISPED), Bordeaux population health (BPH), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Bordeaux (UB)-Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Université de Bordeaux (UB), Hôtel-Dieu, CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (iPLESP), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (Hôpitaux Sud ), Sciences Economiques et Sociales de la Santé & Traitement de l'Information Médicale (SESSTIM - U1252 INSERM - Aix Marseille Univ - UMR 259 IRD), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Hôpital Pellegrin, CHU Bordeaux [Bordeaux]-Groupe hospitalier Pellegrin, CHU Tenon [AP-HP], Hôpital Saint-André, Hôpital l'Archet, Université de Nice Sophia-Antipolis (UNSA), CHU Saint-Antoine [AP-HP], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Avicenne [AP-HP], Université Sorbonne Paris Nord, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris], Hopital Saint-Louis [AP-HP] (AP-HP), Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre), Université Paris-Saclay, Hôpital de la Croix-Rousse [CHU - HCL], Hospices Civils de Lyon (HCL), Centre Hospitalier Saint Jean de Perpignan, Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU) (Imagine - U1163), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Hôpital Henri Mondor, Hôpital Foch [Suresnes], Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes), Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes), Hôpital Haut-Lévêque [CHU Bordeaux], CHU Bordeaux [Bordeaux], Le Trait d'Union, centre de soins de l'infection par le VIH [CHU Strasbourg], CHU Strasbourg, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Université de Bourgogne (UB), AP-HP - Hôpital Antoine Béclère [Clamart], Hôpital universitaire Robert Debré [Reims], Laboratoire de Virologie Médicale et Moléculaire - EA 4684 (CardioVir), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Université Sorbonne Paris Cité (USPC), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CRSA], Centre de Recherche Saint-Antoine (CRSA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU), Malbec, Odile, Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hôpital Purpan [Toulouse], CHU Toulouse [Toulouse], Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Paris (UP), Institut Pasteur [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Pathologies biliaires, fibrose et cancer du foie [CHU Saint-Antoine], Centre de Recherche Saint-Antoine (CR Saint-Antoine), Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Saint-Antoine [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA), Statistics In System biology and Translational Medicine (SISTM), Inria Bordeaux - Sud-Ouest, and Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)- Bordeaux population health (BPH)
Subjects: Microbiology (medical), Adult, Male, hepatitis C virus, medicine.medical_specialty, [SDV]Life Sciences [q-bio], HIV Infections, Hepacivirus, 030204 cardiovascular system & hematology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Interquartile range, Risk Factors, Internal medicine, medicine, Humans, 030212 general & internal medicine, Sida, biology, business.industry, Proportional hazards model, Incidence (epidemiology), cardiovascular, Hazard ratio, HIV, Middle Aged, medicine.disease, biology.organism_classification, Hepatitis C, coinfection, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Infectious Diseases, Cardiovascular Diseases, Cohort, Coinfection, Female, atherosclerosis, business, Viral load
Abstract: Background An increased risk of cardiovascular disease (CVD) was reported in patients coinfected with human immunodeficiency virus (HIV) and hepatitis C virus (HCV), without identifying factors associated with atherosclerotic CVD (ASCVD) events. Methods HIV-HCV coinfected patients were enrolled in the Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les hépatites virales (ANRS) CO13 HEPAVIH nationwide cohort. Primary outcome was total ASCVD events. Secondary outcomes were coronary and/or cerebral ASCVD events, and peripheral artery disease (PAD) ASCVD events. Incidences were estimated using the Aalen-Johansen method. Factors associated with ASCVD were identified using cause-specific Cox proportional hazards models. Results At baseline, median age of the study population (N = 1213) was 45.4 (interquartile range [IQR] 42.1−49.0) years and 70.3% were men. After a median follow-up of 5.1 (IQR 3.9−7.0) years, the incidence was 6.98 (95% confidence interval [CI], 5.19−9.38) per 1000 person-years for total ASCVD events, 4.01 (2.78−6.00) for coronary and/or cerebral events, and 3.17 (2.05−4.92) for PAD ASCVD events. Aging (hazard ratio [HR] 1.06; 95% CI, 1.01−1.12), prior CVD (HR 8.48; 95% CI, 3.14−22.91), high total cholesterol (HR 1.43; 95% CI, 1.11−1.83), high-density lipoprotein cholesterol (HR 0.22; 95% CI, 0.08−0.63), statin use (HR 3.31; 95% CI, 1.31−8.38), and high alcohol intake (HR 3.18; 95% CI, 1.35−7.52) were independently associated with total ASCVD events, whereas undetectable baseline viral load (HR 0.41, 95% CI, 0.18−0.96) was associated with coronary and/or cerebral events. Conclusions HIV-HCV coinfected patients experienced a high incidence of ASCVD events. Some traditional cardiovascular risk factors were the main determinants of ASCVD. Controlling cholesterol abnormalities and maintaining undetectable HIV RNA are essential to control cardiovascular risk.
Published: 2021

48. Electrocarboxylation of chloroacetonitrile mediated by a Ni(I) terpyridine complex: Voltammetric and spectroscopic studies

Author: Paul-Louis Fabre, Dancheng Chen, Nadia Chouini-Lalanne, Valérie Sartor, Olivier Reynes, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire de génie chimique [ancien site de Basso-Cambo] (LGC), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Interactions moléculaires et réactivité chimique et photochimique (IMRCP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire de Génie Chimique (LGC), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Fédération de Recherche Fluides, Energie, Réacteurs, Matériaux et Transferts (FERMAT), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SMODD - Systèmes Moléculaires Organisés et Développement Durable (SMODD), and Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT)
Subjects: 010402 general chemistry, 01 natural sciences, Medicinal chemistry, Adduct, Inorganic Chemistry, chemistry.chemical_compound, Materials Chemistry, [CHIM]Chemical Sciences, Carboxylate, Physical and Theoretical Chemistry, Spectroelectrochemistry, Bond cleavage, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 010405 organic chemistry, Chloroacetonitrile, Oxidative addition, 0104 chemical sciences, 3. Good health, Homolysis, chemistry, Carbon dioxide, Cyanoacetic acid, Nickel bis(terpyridine) complex, Terpyridine, Cyclic voltammetry, Electrocatalysis
Abstract: International audience; Cyclic voltammetry and spectroelectrochemistry (e.p.r.) were used to investigate the mechanisms implied in the electrocarboxylation of chloroacetonitrile (Cl-CH2-CN, noted RCl) mediated by [Ni(II)(terpy)2]2+. The oxidative addition of chloroacetonitrile on the electrogenerated [Ni(I)(terpy)]+ yields an alkyl-nickel R-Ni(III) complex which is reduced into an alkyl-nickel(II). E.p.r study shows that the homolytic nickel-carbon bond cleavage seems to be the more probable pathway to form the organic radical R-which is reduced to R−. Under carbon dioxide atmosphere, cyclic voltammetry studies show that CO2 was added on the alkyl-Ni(III) complex giving probably a CO2 adduct which is reduced to RCO2-Ni(II) complex allowing to release the carboxylate RCO2− and the active [Ni(I)(terpy)]+ complex. Controlled potential electrolyses showed that good carboxylated and faradic yields were obtained.
Published: 2021

49. Driving regeneration, instead of healing, in adult mammals: the decisive role of resident macrophages through efferocytosis

Author: Rabiller, Lise, Robert, Virginie, Arlat, Adèle, Labit, Elodie, Ousset, Marielle, Salon, Marie, Coste, Agnès, da Costa-Fernandes, Léa, Monsarrat, Paul, Ségui, Bruno, André, Mireille, Guissard, Christophe, Renoud, Marie-Laure, Silva, Marine, Mithieux, Gilles, Raymond-Letron, Isabelle, Pénicaud, Luc, Lorsignol, Anne, Casteilla, Louis, Dromard Berthézène, Cécile, Cousin, Béatrice, STROMALab, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement Français du Sang-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), McGill University = Université McGill [Montréal, Canada], Geroscience and rejuvenation research center (RESTORE), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-EFS-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), University of Calgary, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre de Recherches en Cancérologie de Toulouse (CRCT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Nutrition, diabète et cerveau (NUDICE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), and ANR-16-CE14-0006,WAT-HEART,Pathologies ischémiques cardiaques et diabète : Rôle de l'hématopoïèse du tissu adipeux(2016)
Subjects: resident macrophages, efferocytosis, [SDV]Life Sciences [q-bio]
Abstract: International audience; Tissue repair after lesion usually leads to scar healing and thus loss of function in adult mammals. In contrast, other adult vertebrates such as amphibians have the ability to regenerate and restore tissue homeostasis after lesion. Understanding the control of the repair outcome is thus a concerning challenge for regenerative medicine. We recently developed a model of induced tissue regeneration in adult mice allowing the comparison of the early steps of regenerative and scar healing processes. By using studies of gain and loss of function, specific cell depletion approaches, and hematopoietic chimeras we demonstrate here that tissue regeneration in adult mammals depends on an early and transient peak of granulocyte producing reactive oxygen species and an efficient efferocytosis specifically by tissue-resident macrophages. These findings highlight key and early cellular pathways able to drive tissue repair towards regeneration in adult mammals.
Published: 2021

50. The T/Tn-Specific Helix pomatia Lectin Induces Cell Death in Lymphoma Cells Negative for T/Tn Antigens

Author: Simplicien, Mathias, Barre, Annick, Benkerrou, Yamina, van Damme, Els, Rougé, Pierre, Benoist, Hervé, Pharmacochimie et Biologie pour le Développement (PHARMA-DEV), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), and Universiteit Gent = Ghent University (UGENT)
Subjects: STRUCTURAL BASIS, EXPRESSION, biomedical applications, [SDV]Life Sciences [q-bio], AGGLUTININ, cancer cell death, BREAST, T/Tn antigens, Article, O-GLYCOSYLATION, ACTIVATION, hemic and lymphatic diseases, BINDING, Medicine and Health Sciences, Morniga G, RC254-282, truncated O-glycans, SIALYL-TN, Tn antigens, Helix pomatia agglutinin, leukemia, Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, Biology and Life Sciences, lectins, T lymphoma, VISUALIZATION, HISTOCHEMISTRY
Abstract: Simple Summary Changes in glycosylation, such as incomplete synthesis and higher density of O-glycans on the cell surface, are frequently observed in cancer cells. Several types of truncated O-glycan structures, e.g., T/Tn antigens, are suspected to disrupt molecular interactions between tumor microenvironment and immune cells, for instance, facilitating cancer immune-escape. Therefore, numerous exogenous lectins targeting aberrant O-glycans are interesting tools for cancer diagnosis, prognosis, and therapy. However, the ability of exolectins to detect subtle alterations in the glycome of tumor cells and to interfere in tumor/healthy cell interactions remains largely unknown. The present article reports for the first time that the Helix pomatia (HPA) lectin, a well-known T/Tn-specific lectin, currently used as a tool in cancer diagnostics, kills Tn-positive leukemia cells and Tn-negative lymphoma cells but does not affect healthy lymphocytes. Thus, HPA could be used to discriminate between tumor and healthy cells, and detect subtle alterations in the glycosylation profile. Abstract Morniga G is a T/Tn-specific lectin, inducing cell death in Tn-positive leukemias but not in healthy lymphocytes. Helix pomatia lectin (HPA) is another T/Tn-specific lectin, currently used as tool for cancer diagnostics. The HPA-mediated tumor cell death was evaluated on human leukemia and mouse lymphoma cells, and compared to the effect of Morniga G. Both lectins induced an equivalent percentage of cell death in Tn-positive Jurkat human leukemia. In contrast, EL4 mouse lymphoma resisted Morniga G-mediated cytotoxicity but were killed by HPA at concentrations of 2.5 μg/mL (0.032 nM) and higher. In both malignant cells, HPA-mediated cell death showed features compatible with apoptosis (annexin-externalization, caspase-activation, mitochondrial membrane depolarization, and ROS production). Cytometry analysis indicated that EL4 cells are T/Tn-negative. Because previous results showed a high amount of N-acetylgalactosamine (GalNAc, sugar present in Tn antigen) on EL4 cell surface, this GalNAc could be involved in the formation of truncated O-glycans other than the T/Tn residues. When compared to Morniga G, bioinformatic analysis suggested that HPA benefits from an extended carbohydrate-binding site, better adapted than Morniga G to the accommodation of more complex branched and truncated O-glycans (such as core 2). Finally, HPA killed EL4 cells but not healthy lymphocytes in a mixture of lymphoma cells + lymphocytes, suggesting that HPA selectively triggers tumor cell death.
Published: 2021

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